BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G34680.1 Length=5739 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg321185 jgi|Araly1|321185|fgenesh1_pm.C_scaffold_4001242 8218 0.0 > Ahg321185 jgi|Araly1|321185|fgenesh1_pm.C_scaffold_4001242 Length=5106 Score = 8218 bits (4450), Expect = 0.0 Identities = 4914/5136 (96%), Gaps = 39/5136 (1%) Strand=Plus/Plus Query 288 ATGGAGGAAGTAGCAGCTAAGGTTGAGGAAGAAACTGTGGAAACCAATGTAGATGCAGTG 347 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | | || Sbjct 1 ATGGAGGAAGTAGCAGCTAAGGTCGATGAAGAAACTGTGGAAACC-------A--C--TG 49 Query 348 AAAGAGGACAATGCAACTATAGCTAATGAAAGCAGAAGCCCAGAGAGTGTTTCTGCAGTG 407 ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || || | | || Sbjct 50 -TAGAGGACAATGTAACTACAGCTAATGAAAGTAGAAGTCCAGAAAATG-TT-T-C--TG 103 Query 408 TCTGTGGTGTCAAATCGAGCTGCTTCTACTAAAAAGAAACCAGTTATTAGTTCGAATTTA 467 | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 104 -C---GGTGTCAAGTCGAGCTGCTGCTACTAAGAAGAAACCAGTTATTAGTTCGAATTTA 159 Query 468 ATAAAGCCAACTGCGTCTTCTTCATTACGGGTCTCGGGTACTACGCCTGTGACTATCAGG 527 || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| Sbjct 160 ATTAAGCCAACAGCGTCTTCTTCTTTACGGGTCTCAGGTACTACACCTGTGACAATCAGG 219 Query 528 AGAAATAGTACTGGAGGAGTAACAGAGAATTTAGCTGGTACCTCTAAGGTTCTGCCTAAG 587 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct 220 AGAAATAGTACTGGAGGAGTAACAGAGAAGTTAGTTGGTGCCTCTAAGGTTCTGCCTAAA 279 Query 588 CAAGTGAGTACTACTGCCTCACGTACTGATCCGGTAAGACGATCACTTCCAGAATTGAGG 647 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 280 CAAATGAGTACTACTGCCTCACGTACTGATCCGGTAAGGCGATCACTTCCAGAATTGAGG 339 Query 648 AAGAGCTCTGTGTCTTCTCTTTCTGCTAAGACTGTATCCAAACCAAGCCTTTCCGAGAGT 707 |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 340 AAGAGCTCAATGTCTTCTCTTTCTGCCAAGACTGTATCCAAACCAAGTCTTTCCGAGAGT 399 Query 708 AAAAAGTCTGTCCCCGTATCACCAGGTAGTCGGAGTTTGACAAAGTCAACTGGGTTTAGT 767 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct 400 AAAAAGTCTGTCCCTGTATCACCAGGGAGTCGGAGTTCGACAAAGTCACCTGGGTTTAGT 459 Query 768 TTAAGTAAGCCTGAGTCTTCTGCTAGACC-AGCCATGAGTGTTTCTGTGTCTTCGAA-AA 825 ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || Sbjct 460 TTAAGTAAGCCTGAGTCTTCTGCTAGACCAAG-CATGAGTGCCTCTGTGTCTTC-AACAA 517 Query 826 GAGCTCCATCTTCATCAGTTGACAGTAGTGGCAGCAGGACTAGTAGTGGAAGACTACACT 885 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | Sbjct 518 GAGCTCCATCTTCATCGGTTGACAGTAGTGGCAGCAGGACCAGTAGTGGAAGACCACATT 577 Query 886 CTACTCTCACA-AGTGGGAGGACAGTTTCTAAAGTTTCTTCTCCCTCTGCGGGATCATCA 944 ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 578 CTACTCTCA-ATAGTGGGAGGACAGTTTCTAAAGTTTCTTCTCCCTCTGCTGGATCATCA 636 Query 945 CCTTCTGTTTCTAGCAGTATAAGATCAAAGTCATTTTCGTCACCTCTAGACCGGACTTCC 1004 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| Sbjct 637 CCTTCTGTTTCTAGCGGTATAAGATCAAAGTCATTGTCGACACCTCTAGACCGGAGTTCC 696 Query 1005 AACTTCTCTGGACGGAAGAAAACATCTACCCCTGAAAGCCGTGATTCACGACTCATTATT 1064 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 697 AACTTCTCTGGACGGAAGAAAACAGCTACCCCTGAAAGCCGCGATTCACGACTCATTATT 756 Query 1065 CTTCCAAAGGTGGAGGTTAAAGCTGGCGATGACATGAGATTGGATCTTAGAGGCCACAGG 1124 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 757 CTTCCAAAGGTGGAGGTTAAAGCTGGCGATGATATGAGATTGGATCTTAGAGGCCACAGG 816 Query 1125 ATTCGCAGTCTAACCTCT-GGTGGCTTACACTTATCACCAAACTTAGAGTTTGTCTATCT 1183 |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 817 ATTCGCAGTCTAACCTCTGGGGGGC-TACACTTGTCACCAAACTTAGAGTTTGTCTATCT 875 Query 1184 TAGAGACAATCTCCTATCTACGCTGGAAGGTATTGAGATATTGAATCGAGTCAAGGTTCT 1243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 876 TAGAGACAATCTCCTATCTACGCTGGAAGGTATTGAGATATTGAATCGAGTCAAGGTTCT 935 Query 1244 GGATTTGAGTTTTAATGATTTCAAAGGGCCTGGATTTGAACCACTTGAGAATTGCAAAAT 1303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 936 GGATTTGAGTTTTAATGATTTCAAAGGGCCTGGATTTGAACCACTTGAGAATTGCAAAAT 995 Query 1304 GCTGCAGCAACTTTATCTTGCTGGAAATCAGATAACTTCACTTGCTAGTCTGCCTCAACT 1363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 996 GCTGCAGCAACTTTATCTTGCTGGAAATCAGATAACTTCACTTGCTAGTCTGCCTCAACT 1055 Query 1364 TCCAAACTTAGAGTTTCTCTCGGTTGCTCAAAATAAATTAAAGTCACTTGCAATGGCAAG 1423 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1056 TCCAAACTTAGAGTTTCTCTCGGTAGCTCAAAATAAATTAAAATCACTTGCAATGGCAAG 1115 Query 1424 CCAGCCCCGGCTTCAGGTACTAGCAGCAAGTAAGAACAAGATAACAACTCTGAAGGACTT 1483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1116 CCAGCCCCGGCTTCAGGTACTAGCAGCAAGTAAGAACAAGATAACAACTCTGAAGGACTT 1175 Query 1484 TCCGTATCTACCAGTTCTTGAGCATCTGCGGGTTGAGGAAAATCCATTGCTGAAGATTTC 1543 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1176 TCCATATCTACCAGTTCTTGAGCATCTGCGGGTTGAGGAAAATCCATTGCTGAAAATTTC 1235 Query 1544 TCACTTGGAAGCGGCATCCATACTACTCGTAGGTCCTACCTTGAAGAAATTCAATGACAG 1603 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1236 TCATTTGGAAGCGGCATCCATACTACTCATAGGTCCTACCTTGAAGAAATTCAATGACAG 1295 Query 1604 AGATCTCTCTCGTGAGGAAGTGGCAATTGCCAAGCGTTATCCTCCACAAACAGCTCTCTG 1663 |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1296 AGATCTCTCTCGTGAGGAAGTGACAATTGCAAAGCGTTATCCTCCACAAACAGCCCTCTG 1355 Query 1664 CCTCAGAGAAGGTTGGGAGTTTTGCAAGTCTGATCTTGCAGCAGAATCGACATTCCGCTT 1723 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1356 CCTCAGAGAAGGTTGGGAGTTCTGCAAGTCTGATCTTGCAGCAGAATCGACATTCCGCTT 1415 Query 1724 CTTAGTTGAGAGGTGGAAGGACACATTACCTTCTGGTTATCTTATTAAAGAAGCACATGT 1783 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1416 CTTAGTTGAGAGGTGGAAGGACACATTACCTTCTGGTTATCTTATTAAAGAAGCACATGT 1475 Query 1784 TGACCGACCTTCTGAAGAAGCTCCCTGTCAATGCCACTTTGGTCTTTTTCAGGAAAGTCC 1843 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 1476 TGACCGACCTTCTGAAGAAGCTCCCTGTCAATGTCACTTTGGTCTTGTTCAGGAACTTCC 1535 Query 1844 TACTGCTACAGATCAAGAATTAGCCCTGAAATTTCAATGGTCTGTGGCGGACAGATCTCT 1903 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1536 TACTGCTACAGATCAAGAATTAGCCCTGAAATTTCAATGGTCTGTGGCGGACAGATCTCT 1595 Query 1904 TTCTAATTTCGTTCCTATTCTTAATGCAACCAAGGAGGTCTATTGGCCCAAACGTGAAGA 1963 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1596 TTCTAATTTTGTTCCTATTCTTGATGCAACCAAGGAGGTCTATTGGCCAAAACGTGAAGA 1655 Query 1964 CATTGGTAAAATTCTAAAGATAGAATGTACACCTGTTATGGCTGAGACTGAATATCCATC 2023 |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1656 CATTGGTAAAATGCTAAAGATAGAATGTACTCCTGTTATGGGAGAGACTGAATATCCATC 1715 Query 2024 CATATTTGCCATATCTTCCCCAGTTCAACGAGGAAAGGGAATACCAAAAGTTGTGAGCCT 2083 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1716 CATATTTGCCATATCTTCACCAGTTCAGCGAGGAAAGGGAATACCAAAAGTTGTGAGCCT 1775 Query 2084 TGAATTAAATGGGGAACTAGTTGAGGGGAATATTATCAAGGGTCAAGCAGTGGTTGCATG 2143 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1776 TGAATTAAATGGGGAACTAGTTGAGGGAAATATTATCAAGGGTCAAGCAGTGGTTGCATG 1835 Query 2144 GTGTGGTGGGACACCAGGAAAGTGTATTACCAGTTGGTTGAGGAGAAAGTGGAATGGGAG 2203 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1836 GTGTGGTGGGACACCGGGAAAATGTATTACCAGTTGGTTGAGGAGAAAGTGGAACGGGAG 1895 Query 2204 CCCTGTGGTGATCGATGGAGCTGAAGATGAGGAATATATGTTATCTTTAGATGATGTGGG 2263 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1896 CCCTGTGGTGATTGATGGAGCTGAAGATGAGGAATATATGTTATCTTTAGATGATGTGGG 1955 Query 2264 ATCAAGTATGGTTTTCATGTACACACCAGTCACAGAAGGAGGTGCAAGAGGAGAGCCTCA 2323 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1956 ATCAAGTATGGTTTTCATGTACACACCAGTCACAGAAGGAGGTGCAAGAGGAGAGCCTCA 2015 Query 2324 GTATAAGTACACAGAGTTCGTAAAAGCAGCGCCTCCATCTGTAAGTAATGTTCGAATTAC 2383 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2016 GTACAAGTACACAGAGTTCGTAAAAGCAGCTCCTCCATCTGTAAGTAATGTTCGAATTAC 2075 Query 2384 TGGAGATGCTGTTGAAGGCTGCGTTCTCAAGGGGGTTGGAGATTATTTTGGAGGCAAGGA 2443 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2076 TGGAGATGCTGTTGAAGGCTGCGTTTTAAAGGGGGTTGGAGATTATTTTGGAGGCAAGGA 2135 Query 2444 AGGTCCTAGCAAGTTCGAATGGTTACGGAAGAACAAGGAAACAGGAGAACTCTCGTTGAT 2503 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2136 AGGTCCTAGCAAGTTCAAATGGTTACGGAAGAACAAGGAAACAGGAGAACTCTCCTTGAT 2195 Query 2504 ATCGGCTGGAACCTCCGAGTATACATTGACCCAGGAAGATGTTGGCACACATGTAACTTT 2563 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2196 ATCGGCTGGAACATCCGAGTATACATTGACCCAGGAAGATGTTGGCACACATGTCACTTT 2255 Query 2564 TGTGTACATACCTGCAAATTTTGAGGGGCTAGAGGGGGAACCAGTGTCAACTTCATCCAG 2623 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2256 TGTGTACATACCTGCAAATTTTGAGGGGCTAGAGGGGGAACCAGTGTCAACTTCATCCAG 2315 Query 2624 TGTAGTCAAGCCAGCACCCCCGAAAGTAACAGATGCTAAGATAGTTGGTGACTTGAGGGA 2683 |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 2316 TGTAATCAACCCAGCACCTCCGAAAGTAACAGATGCTAAGATAGTTGGTGATTTAAGGGA 2375 Query 2684 GAATAGTAAGGTCACTGTAACAGGTACTGTTACTGGAGGAACTGAAGGTTCAAGCAGAGT 2743 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2376 GAATAGTAAGGTCACTGTAACAGGTACTGTTACTGGAGGAACTGAAGGTTCAAGCAGAGT 2435 Query 2744 GCAATGGTTCAAATCAAGTTGTTCTATCCTGGAAGGAGACAATTCTCTTGAAGAATTGAG 2803 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2436 GCAATGGTTCAAATCAAGTTGTTCTATTCTAGAAGGAGGCAATTCTCTTGAAGAATTGAG 2495 Query 2804 CACATCAAAAGTGGCAAAGTCATTCCGTATACCCTTGGGGGCAGTGGGCTATTACATAGT 2863 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| Sbjct 2496 CACATCAAAAGTGGCAAAGTCATTCCGTATACCATTGGGGGCGGTGGGCTATTTCATAGT 2555 Query 2864 TGCAAAGTATACTCCAATGACACCTGATGGGGAATGCGGTGAACCAGTATATGTACTCTC 2923 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2556 TGCGAAGTATACTCCAATGACACCTGATGGTGAATGCGGTGAACCAGTATATGTACTATC 2615 Query 2924 GGAAAGAGCAGTTGAGACCCTTCCCCCCAGCTTAAATTTCTTGTCAATTACGGGAGACAA 2983 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct 2616 GGAAAGAGCAGTTGAGACCCTTCCCCCCAGCTTAAATTTCCTGTCAATTACTGGAGACAA 2675 Query 2984 TATCGAGGGTGGAATATTGACAGCATCCTACGGATACATAGGAGGGCATGAAGGTAAAAG 3043 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2676 TATCGAGGGTGGAATATTGACAGCATCCTATGGATACATAGGGGGGCATGAAGGTAAAAG 2735 Query 3044 CAAATACGAATGGCATTATCATAAGGCTGAAAATGATCTCCCTGGTGCATTGATACCTGA 3103 || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2736 CATATACGAATGGCATTATCATAAGGCAGAAAATGATCTCCCTGGCACATTGATACCTGA 2795 Query 3104 AGCCTCTGGGCTTCTTCAGTATACGATTACTAAAGAAGCTATAGGTAAATTCATTTCATT 3163 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2796 AGCCTCTGGGCTTCTTCAGTATACGATTACTAAAGAAGCTATTGGTAAATTCATTTCATT 2855 Query 3164 TCAATGTATTCCTGTGAGGGATGATGGGATTGTGGGTGAGCCAAGAAGTTGCATGTCCCA 3223 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2856 TCAATGTATTCCTATGAGGGATGATGGGATTGTGGGTGAGCCAAGAAATTGCATGTCCCA 2915 Query 3224 GGAACGTGTTCGTCCAGGAAACCCAAGCACGGTATCTCTTCATGTTGTTGGAGCTCTTGT 3283 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct 2916 GGAACGTGCTCGTCCAGGAAACCCAAGCGCGGTATCTCTTCAAGTTGTTGGAGCTCCTGT 2975 Query 3284 TGAAGGAACCATGCTATCTGCAGAGAAAGAATATTGGGGTGGTGAAGAAGGAGCATCAGT 3343 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2976 TGAAGGAACCATGCTATATGCAGAGAAAGAATATTGGGGTGGTGAAGAAGGAGCATCAGT 3035 Query 3344 TTTCCGGTGGTTCCGGACTAATTCAGATGGTACTCCATGCGAAATAAAGGGTGCAACTAC 3403 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3036 TTTCCGGTGGTTCCGGACTAATTCAGATGGTACTCCATGCGAAATAAAGGGTGCAACTAC 3095 Query 3404 TTCGTCATATCTACTGTCAGTCGGTGATATCGGTTACTTCATTTCGGTTTCTTATGAACC 3463 |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3096 TTCGTCATATCTGCTGTCAGTCGATGATATCGGTTTCTTCATTTCGGTTTCTTATGAACC 3155 Query 3464 TGTGAGAAATGACA-GAGCCCGTGGACCCACAGCCATTTCTGAAATAGCTGGACCAATTG 3522 |||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||| Sbjct 3156 CATGAGAAATGACATG-GCTCGTGGACCCACGGTTATTTCTGAACTATCTGGACCAATTG 3214 Query 3523 TAGCTGGCCATCCAAATTGTCAGTCACTGGAGTTTCTTGGATCAATGATTGAAGGGCAAC 3582 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3215 TAGCTGGCCATCCAAATTGTCAGTCACTGGAGTTTCTTGGATCAATGATTGAAGGGCAAC 3274 Query 3583 GCTTGAGCTTTGTTGCTTCATATACTGGAGGGATGAAGGGAAATTGCTATCTTGAATGGG 3642 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| Sbjct 3275 GCTTGAGCTTTGTTGCTTCATATACTGGAGGGATAAAAGGAAATTGCTACCTTGAATGGG 3334 Query 3643 TTAGGGTGAAAAATAATGGTGTTAAGGAAATATTGAGTAGTGATGAGTTTTTGGATTTAT 3702 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3335 TTAGGGTGAAAAGTAATGGTGTTAAGGAAATATTGAGTAATGATGAGTTTTTGGATTTAT 3394 Query 3703 CACTGGACGATGTCGGGGAAAGCATTGAACTTATTTACACTCCTGTTCGTGAAGATGGAA 3762 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3395 CACTGGACGATGTTGGGGAAAGCATTGAACTTATTTACACTCCTGTTCGTGAAGATGGAA 3454 Query 3763 TAGAAGGGAGTCCAAGGAGTATCAGGACTGATGGTATTGCTCCAGCAAATCCTATGGGGT 3822 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3455 TAGAAGGGAGTCCAAGGAGTATCAGGTCTGATGGCATTGCTCCAGCAAATCCGATGGGGT 3514 Query 3823 TGGAGCTTTTAATTCCTGACTGCTGTGAGAAACAAGAGGTTGTGCCTCATAAAACTTATT 3882 |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3515 TGGAGCTTAAAATTCCTGACTGCCGTGAGAAACAAGAGGTTGTGCCTCATAAAACTTATT 3574 Query 3883 TTGGGGGCCATGAAGGTGTTGGAGAGTACATCTGGTATCGAACTAAGGTCAAGTTGCATG 3942 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3575 TTGGAGGCCATGAAGGTGTTGGAGAGTACATCTGGTATAGAACTAAGGTCAAGTTGCATG 3634 Query 3943 GATCTGCACTTACGGAAATATCCTATGCCGGTGAAGAGGTTGTTGTTTGTTGTAGAACAT 4002 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct 3635 GATCTGCACTCACGGAAATATCCTATGCCGGTGAAGAGGTTGTTGCTTGTAGTAGAACAT 3694 Query 4003 TAAAATATACTCCATCGCTTGAAGATGTGGGGGCTTATCTAGTCTTGTATTGGATTCCTA 4062 |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3695 TAAAATATACTCCATCACTTGAAGATGTGGGCGCTTATCTAGTCTTGTACTGGATTCCTA 3754 Query 4063 CTCGCGTAGATGGGAGAAGTGGGAAGCCAGTTGTTGT-GATAACAAACTCTCCTGTTGCC 4121 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| Sbjct 3755 CTCGCGTAGATGGGAGAAGTGGGAAGCCAGTTGTT-TCGATAACAAACTCTCTTGTTGCC 3813 Query 4122 CCAGCTGATCCAGAAGTATCTAATGTTCGTGTGAAGAAACTTTTTTCGGATGCTTATTCT 4181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3814 CCAGCTGATCCAGAAGTATCTAATGTTCGTGTGAAGAAACTTTTTTCGGATGCTTATTCT 3873 Query 4182 GGAGAAGGAGAGTACTTTGGTGGACATGAAGGTCCAAGTCTCTTCAGTTGGTACAGAGAG 4241 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3874 GGAGAAGGAGAGTACTTTGGTGGCCATGAAGGTGCTAGTATCTTCAGTTGGTACAGAGAT 3933 Query 4242 AATGATGGAACCATTGATCTTATTGATGGGGCTAACTCCAAAACGTATGAGGTGACTGAG 4301 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3934 AATGATGGAAACATTGATCTTATTGCTGGGGCTAACTCCAAAACGTATGAGGTGACTGAG 3993 Query 4302 TCAGATTACAATTGCCGGATATTGTTCGGGTACACACCAGTTCGTTCAGATTCTGTTGTG 4361 || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3994 TCGGATTACAATTGCCGAATATTGTTTGGGTACACACCTGTTCGTTCAGATTCTGTTGTG 4053 Query 4362 GGAGAGCTAAAGATGTCTGAGCCAACTGAAATTATCCTCCCAGAGGTTCCAAAAGTAGAC 4421 |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4054 GGAGAGTTAAAGATGTCCGAGCCAACTGAAATTATCCTCCCAGAGGTTCCAAAAGTAGAC 4113 Query 4422 ATGCTTGCTTTCACCGGAAAGGCTGTACAAGGTGATGTTCTCACAGCCGTCCAAGTGATC 4481 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4114 ATGCTTGCTTTCACCGGAAAGGCGGTACAGGGTGATGTTCTCACAGCCGTCCAAGTGATC 4173 Query 4482 CCAAAGACTGAAATTCAACAACTTGTTTGGAGCAAGTACAAAGGAGATATTCAATACCAA 4541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4174 CCAAAGACTGAAATTCAACAACTTGTTTGGAGCAAGTACAAAGGAGAAATTCAATACCAA 4233 Query 4542 TGGTTCCGCTCACCGGAATCAGGGGATAAGATATCGTATGAGGCTCTCTCTTCAGAAATT 4601 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4234 TGGTTCCGCTCACCGGAATCAGGGGATAAGATTTCGTATGAGGCTCTCTCTTCAGAAACT 4293 Query 4602 TCGTGTTCATACAAGGTGCGGTTTGAGGATATTGGCAGATGTCTCAAATGTGAATGTGTA 4661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4294 TCGTGTTCATACAGGGTGCGGTTTGAGGATATTGGCAGATGTCTCAAATGTGAATGTGTA 4353 Query 4662 GTGCATGATGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACTAGCATACGCCGAGACTGATCCAATATCA 4721 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4354 GTACATGATGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACTAGCATACGCCGAGACTGATCCAATATTA 4413 Query 4722 CCAGGTTTTCCTAGGATAGAGAAGCTAGAGATTGAAGGACAAGGTTTCCATACTAACTTA 4781 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4414 CCAGGTTTTCCTAGGATAGAGAAGCTAGAGATTGAAGGACAAGGTTTTCATACTAACTTA 4473 Query 4782 TAT-GCTGTGCGGGGAAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAATGGCT 4840 ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4474 TATAG-TGTGCGGGGAAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAATGGCT 4532 Query 4841 TAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTA 4900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4533 TAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTA 4592 Query 4901 TGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATACGTGA 4960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4593 TGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATCCGTGA 4652 Query 4961 GGATGGTGTCCAAGGCCACCCAGTTTCTGCATCAACTGAGCCTGTTGCTGTTGAACCTGA 5020 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4653 GGATGGTGTTCAAGGCCACCCAGTTTCTGCATCAACAGAGCCTGTTGCTGTTGAACCTGA 4712 Query 5021 TATTCT-TAAGGAAGTGA-GACAGAAATTAGAAACTGGGTTAGTGAAGTTTGAGGTGTTG 5078 || | ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 4713 CCTT-TATAAGGAAGTGAAG-CAGAAACTAGAAACCGGGTTAGTGAAGTTTGAGGTGTTG 4770 Query 5079 TGTGACAAGGACCCTTATCCCAAAAAGATTGTGGGAGAGGGAAATCTCGAGAGACGAATG 5138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4771 TGTGACAAGGACCCTTATCCCAAAAAGATTGTGGGAGAGGGAAATCTCGAGAGACGAATG 4830 Query 5139 CTAGAAATGAACAGGAAGAGAATAAAGGTTGTGAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCGCA 5198 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4831 CTGGAAATGAACAGGAAGAGAATAAAGGTTGTAAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCGCA 4890 Query 5199 ACTACTGAAGTCCGTGGAAGCTATGGTCCTCCTTTCCACGTGGAGACATTTCGTAACGAC 5258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4891 ACTACTGAAGTCCGTGGAAGCTATGGTCCTCCTTTCCACGTGGAGACATTTCGTAATGAC 4950 Query 5259 CAAAGAAGGCTAAGGATAGTTGTGGATAGTGAGAATGAAGTAGACATAGTGGTGCAGTCG 5318 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4951 CAGAGAAGGCTAAGGATAGTTGTGGATAGTGAGAATGAAGTAGACATAGTGGTGCATTCG 5010 Query 5319 CGCCATCTCCGCGATGTTATAGTACTTGTCATTCGCGGCTTTGCTCAGCGGTTCAACAGC 5378 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 5011 CGCCATCTCCGCGATGTTATAGTGCTTGTCATTCGCGGGTTTGCTCAGCGATTCAACAGC 5070 Query 5379 ACTTCACTCAATTCTCTACTTAAGATCGATACATGA 5414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5071 ACTTCACTCAATTCTCTACTTAAGATCGATACATGA 5106 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 217384856976 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5