BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G34680.1
Length=5739
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg321185 jgi|Araly1|321185|fgenesh1_pm.C_scaffold_4001242 8218 0.0
> Ahg321185 jgi|Araly1|321185|fgenesh1_pm.C_scaffold_4001242
Length=5106
Score = 8218 bits (4450), Expect = 0.0
Identities = 4914/5136 (96%), Gaps = 39/5136 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 288 ATGGAGGAAGTAGCAGCTAAGGTTGAGGAAGAAACTGTGGAAACCAATGTAGATGCAGTG 347
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||
Sbjct 1 ATGGAGGAAGTAGCAGCTAAGGTCGATGAAGAAACTGTGGAAACC-------A--C--TG 49
Query 348 AAAGAGGACAATGCAACTATAGCTAATGAAAGCAGAAGCCCAGAGAGTGTTTCTGCAGTG 407
||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || || | | ||
Sbjct 50 -TAGAGGACAATGTAACTACAGCTAATGAAAGTAGAAGTCCAGAAAATG-TT-T-C--TG 103
Query 408 TCTGTGGTGTCAAATCGAGCTGCTTCTACTAAAAAGAAACCAGTTATTAGTTCGAATTTA 467
| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104 -C---GGTGTCAAGTCGAGCTGCTGCTACTAAGAAGAAACCAGTTATTAGTTCGAATTTA 159
Query 468 ATAAAGCCAACTGCGTCTTCTTCATTACGGGTCTCGGGTACTACGCCTGTGACTATCAGG 527
|| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 160 ATTAAGCCAACAGCGTCTTCTTCTTTACGGGTCTCAGGTACTACACCTGTGACAATCAGG 219
Query 528 AGAAATAGTACTGGAGGAGTAACAGAGAATTTAGCTGGTACCTCTAAGGTTCTGCCTAAG 587
||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 220 AGAAATAGTACTGGAGGAGTAACAGAGAAGTTAGTTGGTGCCTCTAAGGTTCTGCCTAAA 279
Query 588 CAAGTGAGTACTACTGCCTCACGTACTGATCCGGTAAGACGATCACTTCCAGAATTGAGG 647
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 280 CAAATGAGTACTACTGCCTCACGTACTGATCCGGTAAGGCGATCACTTCCAGAATTGAGG 339
Query 648 AAGAGCTCTGTGTCTTCTCTTTCTGCTAAGACTGTATCCAAACCAAGCCTTTCCGAGAGT 707
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 340 AAGAGCTCAATGTCTTCTCTTTCTGCCAAGACTGTATCCAAACCAAGTCTTTCCGAGAGT 399
Query 708 AAAAAGTCTGTCCCCGTATCACCAGGTAGTCGGAGTTTGACAAAGTCAACTGGGTTTAGT 767
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 400 AAAAAGTCTGTCCCTGTATCACCAGGGAGTCGGAGTTCGACAAAGTCACCTGGGTTTAGT 459
Query 768 TTAAGTAAGCCTGAGTCTTCTGCTAGACC-AGCCATGAGTGTTTCTGTGTCTTCGAA-AA 825
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 460 TTAAGTAAGCCTGAGTCTTCTGCTAGACCAAG-CATGAGTGCCTCTGTGTCTTC-AACAA 517
Query 826 GAGCTCCATCTTCATCAGTTGACAGTAGTGGCAGCAGGACTAGTAGTGGAAGACTACACT 885
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
Sbjct 518 GAGCTCCATCTTCATCGGTTGACAGTAGTGGCAGCAGGACCAGTAGTGGAAGACCACATT 577
Query 886 CTACTCTCACA-AGTGGGAGGACAGTTTCTAAAGTTTCTTCTCCCTCTGCGGGATCATCA 944
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 578 CTACTCTCA-ATAGTGGGAGGACAGTTTCTAAAGTTTCTTCTCCCTCTGCTGGATCATCA 636
Query 945 CCTTCTGTTTCTAGCAGTATAAGATCAAAGTCATTTTCGTCACCTCTAGACCGGACTTCC 1004
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 637 CCTTCTGTTTCTAGCGGTATAAGATCAAAGTCATTGTCGACACCTCTAGACCGGAGTTCC 696
Query 1005 AACTTCTCTGGACGGAAGAAAACATCTACCCCTGAAAGCCGTGATTCACGACTCATTATT 1064
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 697 AACTTCTCTGGACGGAAGAAAACAGCTACCCCTGAAAGCCGCGATTCACGACTCATTATT 756
Query 1065 CTTCCAAAGGTGGAGGTTAAAGCTGGCGATGACATGAGATTGGATCTTAGAGGCCACAGG 1124
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 CTTCCAAAGGTGGAGGTTAAAGCTGGCGATGATATGAGATTGGATCTTAGAGGCCACAGG 816
Query 1125 ATTCGCAGTCTAACCTCT-GGTGGCTTACACTTATCACCAAACTTAGAGTTTGTCTATCT 1183
|||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 ATTCGCAGTCTAACCTCTGGGGGGC-TACACTTGTCACCAAACTTAGAGTTTGTCTATCT 875
Query 1184 TAGAGACAATCTCCTATCTACGCTGGAAGGTATTGAGATATTGAATCGAGTCAAGGTTCT 1243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 876 TAGAGACAATCTCCTATCTACGCTGGAAGGTATTGAGATATTGAATCGAGTCAAGGTTCT 935
Query 1244 GGATTTGAGTTTTAATGATTTCAAAGGGCCTGGATTTGAACCACTTGAGAATTGCAAAAT 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 936 GGATTTGAGTTTTAATGATTTCAAAGGGCCTGGATTTGAACCACTTGAGAATTGCAAAAT 995
Query 1304 GCTGCAGCAACTTTATCTTGCTGGAAATCAGATAACTTCACTTGCTAGTCTGCCTCAACT 1363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 996 GCTGCAGCAACTTTATCTTGCTGGAAATCAGATAACTTCACTTGCTAGTCTGCCTCAACT 1055
Query 1364 TCCAAACTTAGAGTTTCTCTCGGTTGCTCAAAATAAATTAAAGTCACTTGCAATGGCAAG 1423
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1056 TCCAAACTTAGAGTTTCTCTCGGTAGCTCAAAATAAATTAAAATCACTTGCAATGGCAAG 1115
Query 1424 CCAGCCCCGGCTTCAGGTACTAGCAGCAAGTAAGAACAAGATAACAACTCTGAAGGACTT 1483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 CCAGCCCCGGCTTCAGGTACTAGCAGCAAGTAAGAACAAGATAACAACTCTGAAGGACTT 1175
Query 1484 TCCGTATCTACCAGTTCTTGAGCATCTGCGGGTTGAGGAAAATCCATTGCTGAAGATTTC 1543
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1176 TCCATATCTACCAGTTCTTGAGCATCTGCGGGTTGAGGAAAATCCATTGCTGAAAATTTC 1235
Query 1544 TCACTTGGAAGCGGCATCCATACTACTCGTAGGTCCTACCTTGAAGAAATTCAATGACAG 1603
||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 TCATTTGGAAGCGGCATCCATACTACTCATAGGTCCTACCTTGAAGAAATTCAATGACAG 1295
Query 1604 AGATCTCTCTCGTGAGGAAGTGGCAATTGCCAAGCGTTATCCTCCACAAACAGCTCTCTG 1663
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1296 AGATCTCTCTCGTGAGGAAGTGACAATTGCAAAGCGTTATCCTCCACAAACAGCCCTCTG 1355
Query 1664 CCTCAGAGAAGGTTGGGAGTTTTGCAAGTCTGATCTTGCAGCAGAATCGACATTCCGCTT 1723
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1356 CCTCAGAGAAGGTTGGGAGTTCTGCAAGTCTGATCTTGCAGCAGAATCGACATTCCGCTT 1415
Query 1724 CTTAGTTGAGAGGTGGAAGGACACATTACCTTCTGGTTATCTTATTAAAGAAGCACATGT 1783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1416 CTTAGTTGAGAGGTGGAAGGACACATTACCTTCTGGTTATCTTATTAAAGAAGCACATGT 1475
Query 1784 TGACCGACCTTCTGAAGAAGCTCCCTGTCAATGCCACTTTGGTCTTTTTCAGGAAAGTCC 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1476 TGACCGACCTTCTGAAGAAGCTCCCTGTCAATGTCACTTTGGTCTTGTTCAGGAACTTCC 1535
Query 1844 TACTGCTACAGATCAAGAATTAGCCCTGAAATTTCAATGGTCTGTGGCGGACAGATCTCT 1903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1536 TACTGCTACAGATCAAGAATTAGCCCTGAAATTTCAATGGTCTGTGGCGGACAGATCTCT 1595
Query 1904 TTCTAATTTCGTTCCTATTCTTAATGCAACCAAGGAGGTCTATTGGCCCAAACGTGAAGA 1963
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1596 TTCTAATTTTGTTCCTATTCTTGATGCAACCAAGGAGGTCTATTGGCCAAAACGTGAAGA 1655
Query 1964 CATTGGTAAAATTCTAAAGATAGAATGTACACCTGTTATGGCTGAGACTGAATATCCATC 2023
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1656 CATTGGTAAAATGCTAAAGATAGAATGTACTCCTGTTATGGGAGAGACTGAATATCCATC 1715
Query 2024 CATATTTGCCATATCTTCCCCAGTTCAACGAGGAAAGGGAATACCAAAAGTTGTGAGCCT 2083
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716 CATATTTGCCATATCTTCACCAGTTCAGCGAGGAAAGGGAATACCAAAAGTTGTGAGCCT 1775
Query 2084 TGAATTAAATGGGGAACTAGTTGAGGGGAATATTATCAAGGGTCAAGCAGTGGTTGCATG 2143
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 TGAATTAAATGGGGAACTAGTTGAGGGAAATATTATCAAGGGTCAAGCAGTGGTTGCATG 1835
Query 2144 GTGTGGTGGGACACCAGGAAAGTGTATTACCAGTTGGTTGAGGAGAAAGTGGAATGGGAG 2203
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1836 GTGTGGTGGGACACCGGGAAAATGTATTACCAGTTGGTTGAGGAGAAAGTGGAACGGGAG 1895
Query 2204 CCCTGTGGTGATCGATGGAGCTGAAGATGAGGAATATATGTTATCTTTAGATGATGTGGG 2263
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 CCCTGTGGTGATTGATGGAGCTGAAGATGAGGAATATATGTTATCTTTAGATGATGTGGG 1955
Query 2264 ATCAAGTATGGTTTTCATGTACACACCAGTCACAGAAGGAGGTGCAAGAGGAGAGCCTCA 2323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1956 ATCAAGTATGGTTTTCATGTACACACCAGTCACAGAAGGAGGTGCAAGAGGAGAGCCTCA 2015
Query 2324 GTATAAGTACACAGAGTTCGTAAAAGCAGCGCCTCCATCTGTAAGTAATGTTCGAATTAC 2383
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2016 GTACAAGTACACAGAGTTCGTAAAAGCAGCTCCTCCATCTGTAAGTAATGTTCGAATTAC 2075
Query 2384 TGGAGATGCTGTTGAAGGCTGCGTTCTCAAGGGGGTTGGAGATTATTTTGGAGGCAAGGA 2443
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2076 TGGAGATGCTGTTGAAGGCTGCGTTTTAAAGGGGGTTGGAGATTATTTTGGAGGCAAGGA 2135
Query 2444 AGGTCCTAGCAAGTTCGAATGGTTACGGAAGAACAAGGAAACAGGAGAACTCTCGTTGAT 2503
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2136 AGGTCCTAGCAAGTTCAAATGGTTACGGAAGAACAAGGAAACAGGAGAACTCTCCTTGAT 2195
Query 2504 ATCGGCTGGAACCTCCGAGTATACATTGACCCAGGAAGATGTTGGCACACATGTAACTTT 2563
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2196 ATCGGCTGGAACATCCGAGTATACATTGACCCAGGAAGATGTTGGCACACATGTCACTTT 2255
Query 2564 TGTGTACATACCTGCAAATTTTGAGGGGCTAGAGGGGGAACCAGTGTCAACTTCATCCAG 2623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2256 TGTGTACATACCTGCAAATTTTGAGGGGCTAGAGGGGGAACCAGTGTCAACTTCATCCAG 2315
Query 2624 TGTAGTCAAGCCAGCACCCCCGAAAGTAACAGATGCTAAGATAGTTGGTGACTTGAGGGA 2683
|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2316 TGTAATCAACCCAGCACCTCCGAAAGTAACAGATGCTAAGATAGTTGGTGATTTAAGGGA 2375
Query 2684 GAATAGTAAGGTCACTGTAACAGGTACTGTTACTGGAGGAACTGAAGGTTCAAGCAGAGT 2743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2376 GAATAGTAAGGTCACTGTAACAGGTACTGTTACTGGAGGAACTGAAGGTTCAAGCAGAGT 2435
Query 2744 GCAATGGTTCAAATCAAGTTGTTCTATCCTGGAAGGAGACAATTCTCTTGAAGAATTGAG 2803
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2436 GCAATGGTTCAAATCAAGTTGTTCTATTCTAGAAGGAGGCAATTCTCTTGAAGAATTGAG 2495
Query 2804 CACATCAAAAGTGGCAAAGTCATTCCGTATACCCTTGGGGGCAGTGGGCTATTACATAGT 2863
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 2496 CACATCAAAAGTGGCAAAGTCATTCCGTATACCATTGGGGGCGGTGGGCTATTTCATAGT 2555
Query 2864 TGCAAAGTATACTCCAATGACACCTGATGGGGAATGCGGTGAACCAGTATATGTACTCTC 2923
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2556 TGCGAAGTATACTCCAATGACACCTGATGGTGAATGCGGTGAACCAGTATATGTACTATC 2615
Query 2924 GGAAAGAGCAGTTGAGACCCTTCCCCCCAGCTTAAATTTCTTGTCAATTACGGGAGACAA 2983
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 2616 GGAAAGAGCAGTTGAGACCCTTCCCCCCAGCTTAAATTTCCTGTCAATTACTGGAGACAA 2675
Query 2984 TATCGAGGGTGGAATATTGACAGCATCCTACGGATACATAGGAGGGCATGAAGGTAAAAG 3043
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2676 TATCGAGGGTGGAATATTGACAGCATCCTATGGATACATAGGGGGGCATGAAGGTAAAAG 2735
Query 3044 CAAATACGAATGGCATTATCATAAGGCTGAAAATGATCTCCCTGGTGCATTGATACCTGA 3103
|| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2736 CATATACGAATGGCATTATCATAAGGCAGAAAATGATCTCCCTGGCACATTGATACCTGA 2795
Query 3104 AGCCTCTGGGCTTCTTCAGTATACGATTACTAAAGAAGCTATAGGTAAATTCATTTCATT 3163
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2796 AGCCTCTGGGCTTCTTCAGTATACGATTACTAAAGAAGCTATTGGTAAATTCATTTCATT 2855
Query 3164 TCAATGTATTCCTGTGAGGGATGATGGGATTGTGGGTGAGCCAAGAAGTTGCATGTCCCA 3223
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2856 TCAATGTATTCCTATGAGGGATGATGGGATTGTGGGTGAGCCAAGAAATTGCATGTCCCA 2915
Query 3224 GGAACGTGTTCGTCCAGGAAACCCAAGCACGGTATCTCTTCATGTTGTTGGAGCTCTTGT 3283
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 2916 GGAACGTGCTCGTCCAGGAAACCCAAGCGCGGTATCTCTTCAAGTTGTTGGAGCTCCTGT 2975
Query 3284 TGAAGGAACCATGCTATCTGCAGAGAAAGAATATTGGGGTGGTGAAGAAGGAGCATCAGT 3343
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2976 TGAAGGAACCATGCTATATGCAGAGAAAGAATATTGGGGTGGTGAAGAAGGAGCATCAGT 3035
Query 3344 TTTCCGGTGGTTCCGGACTAATTCAGATGGTACTCCATGCGAAATAAAGGGTGCAACTAC 3403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3036 TTTCCGGTGGTTCCGGACTAATTCAGATGGTACTCCATGCGAAATAAAGGGTGCAACTAC 3095
Query 3404 TTCGTCATATCTACTGTCAGTCGGTGATATCGGTTACTTCATTTCGGTTTCTTATGAACC 3463
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3096 TTCGTCATATCTGCTGTCAGTCGATGATATCGGTTTCTTCATTTCGGTTTCTTATGAACC 3155
Query 3464 TGTGAGAAATGACA-GAGCCCGTGGACCCACAGCCATTTCTGAAATAGCTGGACCAATTG 3522
|||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 3156 CATGAGAAATGACATG-GCTCGTGGACCCACGGTTATTTCTGAACTATCTGGACCAATTG 3214
Query 3523 TAGCTGGCCATCCAAATTGTCAGTCACTGGAGTTTCTTGGATCAATGATTGAAGGGCAAC 3582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3215 TAGCTGGCCATCCAAATTGTCAGTCACTGGAGTTTCTTGGATCAATGATTGAAGGGCAAC 3274
Query 3583 GCTTGAGCTTTGTTGCTTCATATACTGGAGGGATGAAGGGAAATTGCTATCTTGAATGGG 3642
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3275 GCTTGAGCTTTGTTGCTTCATATACTGGAGGGATAAAAGGAAATTGCTACCTTGAATGGG 3334
Query 3643 TTAGGGTGAAAAATAATGGTGTTAAGGAAATATTGAGTAGTGATGAGTTTTTGGATTTAT 3702
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3335 TTAGGGTGAAAAGTAATGGTGTTAAGGAAATATTGAGTAATGATGAGTTTTTGGATTTAT 3394
Query 3703 CACTGGACGATGTCGGGGAAAGCATTGAACTTATTTACACTCCTGTTCGTGAAGATGGAA 3762
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3395 CACTGGACGATGTTGGGGAAAGCATTGAACTTATTTACACTCCTGTTCGTGAAGATGGAA 3454
Query 3763 TAGAAGGGAGTCCAAGGAGTATCAGGACTGATGGTATTGCTCCAGCAAATCCTATGGGGT 3822
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3455 TAGAAGGGAGTCCAAGGAGTATCAGGTCTGATGGCATTGCTCCAGCAAATCCGATGGGGT 3514
Query 3823 TGGAGCTTTTAATTCCTGACTGCTGTGAGAAACAAGAGGTTGTGCCTCATAAAACTTATT 3882
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3515 TGGAGCTTAAAATTCCTGACTGCCGTGAGAAACAAGAGGTTGTGCCTCATAAAACTTATT 3574
Query 3883 TTGGGGGCCATGAAGGTGTTGGAGAGTACATCTGGTATCGAACTAAGGTCAAGTTGCATG 3942
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3575 TTGGAGGCCATGAAGGTGTTGGAGAGTACATCTGGTATAGAACTAAGGTCAAGTTGCATG 3634
Query 3943 GATCTGCACTTACGGAAATATCCTATGCCGGTGAAGAGGTTGTTGTTTGTTGTAGAACAT 4002
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 3635 GATCTGCACTCACGGAAATATCCTATGCCGGTGAAGAGGTTGTTGCTTGTAGTAGAACAT 3694
Query 4003 TAAAATATACTCCATCGCTTGAAGATGTGGGGGCTTATCTAGTCTTGTATTGGATTCCTA 4062
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3695 TAAAATATACTCCATCACTTGAAGATGTGGGCGCTTATCTAGTCTTGTACTGGATTCCTA 3754
Query 4063 CTCGCGTAGATGGGAGAAGTGGGAAGCCAGTTGTTGT-GATAACAAACTCTCCTGTTGCC 4121
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3755 CTCGCGTAGATGGGAGAAGTGGGAAGCCAGTTGTT-TCGATAACAAACTCTCTTGTTGCC 3813
Query 4122 CCAGCTGATCCAGAAGTATCTAATGTTCGTGTGAAGAAACTTTTTTCGGATGCTTATTCT 4181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3814 CCAGCTGATCCAGAAGTATCTAATGTTCGTGTGAAGAAACTTTTTTCGGATGCTTATTCT 3873
Query 4182 GGAGAAGGAGAGTACTTTGGTGGACATGAAGGTCCAAGTCTCTTCAGTTGGTACAGAGAG 4241
||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3874 GGAGAAGGAGAGTACTTTGGTGGCCATGAAGGTGCTAGTATCTTCAGTTGGTACAGAGAT 3933
Query 4242 AATGATGGAACCATTGATCTTATTGATGGGGCTAACTCCAAAACGTATGAGGTGACTGAG 4301
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3934 AATGATGGAAACATTGATCTTATTGCTGGGGCTAACTCCAAAACGTATGAGGTGACTGAG 3993
Query 4302 TCAGATTACAATTGCCGGATATTGTTCGGGTACACACCAGTTCGTTCAGATTCTGTTGTG 4361
|| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3994 TCGGATTACAATTGCCGAATATTGTTTGGGTACACACCTGTTCGTTCAGATTCTGTTGTG 4053
Query 4362 GGAGAGCTAAAGATGTCTGAGCCAACTGAAATTATCCTCCCAGAGGTTCCAAAAGTAGAC 4421
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4054 GGAGAGTTAAAGATGTCCGAGCCAACTGAAATTATCCTCCCAGAGGTTCCAAAAGTAGAC 4113
Query 4422 ATGCTTGCTTTCACCGGAAAGGCTGTACAAGGTGATGTTCTCACAGCCGTCCAAGTGATC 4481
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4114 ATGCTTGCTTTCACCGGAAAGGCGGTACAGGGTGATGTTCTCACAGCCGTCCAAGTGATC 4173
Query 4482 CCAAAGACTGAAATTCAACAACTTGTTTGGAGCAAGTACAAAGGAGATATTCAATACCAA 4541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4174 CCAAAGACTGAAATTCAACAACTTGTTTGGAGCAAGTACAAAGGAGAAATTCAATACCAA 4233
Query 4542 TGGTTCCGCTCACCGGAATCAGGGGATAAGATATCGTATGAGGCTCTCTCTTCAGAAATT 4601
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4234 TGGTTCCGCTCACCGGAATCAGGGGATAAGATTTCGTATGAGGCTCTCTCTTCAGAAACT 4293
Query 4602 TCGTGTTCATACAAGGTGCGGTTTGAGGATATTGGCAGATGTCTCAAATGTGAATGTGTA 4661
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4294 TCGTGTTCATACAGGGTGCGGTTTGAGGATATTGGCAGATGTCTCAAATGTGAATGTGTA 4353
Query 4662 GTGCATGATGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACTAGCATACGCCGAGACTGATCCAATATCA 4721
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4354 GTACATGATGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACTAGCATACGCCGAGACTGATCCAATATTA 4413
Query 4722 CCAGGTTTTCCTAGGATAGAGAAGCTAGAGATTGAAGGACAAGGTTTCCATACTAACTTA 4781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4414 CCAGGTTTTCCTAGGATAGAGAAGCTAGAGATTGAAGGACAAGGTTTTCATACTAACTTA 4473
Query 4782 TAT-GCTGTGCGGGGAAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAATGGCT 4840
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4474 TATAG-TGTGCGGGGAAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAATGGCT 4532
Query 4841 TAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTA 4900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4533 TAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTA 4592
Query 4901 TGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATACGTGA 4960
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4593 TGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATCCGTGA 4652
Query 4961 GGATGGTGTCCAAGGCCACCCAGTTTCTGCATCAACTGAGCCTGTTGCTGTTGAACCTGA 5020
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4653 GGATGGTGTTCAAGGCCACCCAGTTTCTGCATCAACAGAGCCTGTTGCTGTTGAACCTGA 4712
Query 5021 TATTCT-TAAGGAAGTGA-GACAGAAATTAGAAACTGGGTTAGTGAAGTTTGAGGTGTTG 5078
|| | ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4713 CCTT-TATAAGGAAGTGAAG-CAGAAACTAGAAACCGGGTTAGTGAAGTTTGAGGTGTTG 4770
Query 5079 TGTGACAAGGACCCTTATCCCAAAAAGATTGTGGGAGAGGGAAATCTCGAGAGACGAATG 5138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4771 TGTGACAAGGACCCTTATCCCAAAAAGATTGTGGGAGAGGGAAATCTCGAGAGACGAATG 4830
Query 5139 CTAGAAATGAACAGGAAGAGAATAAAGGTTGTGAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCGCA 5198
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4831 CTGGAAATGAACAGGAAGAGAATAAAGGTTGTAAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCGCA 4890
Query 5199 ACTACTGAAGTCCGTGGAAGCTATGGTCCTCCTTTCCACGTGGAGACATTTCGTAACGAC 5258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4891 ACTACTGAAGTCCGTGGAAGCTATGGTCCTCCTTTCCACGTGGAGACATTTCGTAATGAC 4950
Query 5259 CAAAGAAGGCTAAGGATAGTTGTGGATAGTGAGAATGAAGTAGACATAGTGGTGCAGTCG 5318
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4951 CAGAGAAGGCTAAGGATAGTTGTGGATAGTGAGAATGAAGTAGACATAGTGGTGCATTCG 5010
Query 5319 CGCCATCTCCGCGATGTTATAGTACTTGTCATTCGCGGCTTTGCTCAGCGGTTCAACAGC 5378
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 5011 CGCCATCTCCGCGATGTTATAGTGCTTGTCATTCGCGGGTTTGCTCAGCGATTCAACAGC 5070
Query 5379 ACTTCACTCAATTCTCTACTTAAGATCGATACATGA 5414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5071 ACTTCACTCAATTCTCTACTTAAGATCGATACATGA 5106
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 217384856976
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5