BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT2G34680.1

Length=5739
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg321185 jgi|Araly1|321185|fgenesh1_pm.C_scaffold_4001242          8218    0.0  


> Ahg321185 jgi|Araly1|321185|fgenesh1_pm.C_scaffold_4001242
Length=5106

 Score = 8218 bits (4450),  Expect = 0.0
 Identities = 4914/5136 (96%), Gaps = 39/5136 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  288   ATGGAGGAAGTAGCAGCTAAGGTTGAGGAAGAAACTGTGGAAACCAATGTAGATGCAGTG  347
             ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||       |  |  ||
Sbjct  1     ATGGAGGAAGTAGCAGCTAAGGTCGATGAAGAAACTGTGGAAACC-------A--C--TG  49

Query  348   AAAGAGGACAATGCAACTATAGCTAATGAAAGCAGAAGCCCAGAGAGTGTTTCTGCAGTG  407
               ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || || | |  ||
Sbjct  50    -TAGAGGACAATGTAACTACAGCTAATGAAAGTAGAAGTCCAGAAAATG-TT-T-C--TG  103

Query  408   TCTGTGGTGTCAAATCGAGCTGCTTCTACTAAAAAGAAACCAGTTATTAGTTCGAATTTA  467
              |   |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  104   -C---GGTGTCAAGTCGAGCTGCTGCTACTAAGAAGAAACCAGTTATTAGTTCGAATTTA  159

Query  468   ATAAAGCCAACTGCGTCTTCTTCATTACGGGTCTCGGGTACTACGCCTGTGACTATCAGG  527
             || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct  160   ATTAAGCCAACAGCGTCTTCTTCTTTACGGGTCTCAGGTACTACACCTGTGACAATCAGG  219

Query  528   AGAAATAGTACTGGAGGAGTAACAGAGAATTTAGCTGGTACCTCTAAGGTTCTGCCTAAG  587
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| 
Sbjct  220   AGAAATAGTACTGGAGGAGTAACAGAGAAGTTAGTTGGTGCCTCTAAGGTTCTGCCTAAA  279

Query  588   CAAGTGAGTACTACTGCCTCACGTACTGATCCGGTAAGACGATCACTTCCAGAATTGAGG  647
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  280   CAAATGAGTACTACTGCCTCACGTACTGATCCGGTAAGGCGATCACTTCCAGAATTGAGG  339

Query  648   AAGAGCTCTGTGTCTTCTCTTTCTGCTAAGACTGTATCCAAACCAAGCCTTTCCGAGAGT  707
             ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  340   AAGAGCTCAATGTCTTCTCTTTCTGCCAAGACTGTATCCAAACCAAGTCTTTCCGAGAGT  399

Query  708   AAAAAGTCTGTCCCCGTATCACCAGGTAGTCGGAGTTTGACAAAGTCAACTGGGTTTAGT  767
             |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct  400   AAAAAGTCTGTCCCTGTATCACCAGGGAGTCGGAGTTCGACAAAGTCACCTGGGTTTAGT  459

Query  768   TTAAGTAAGCCTGAGTCTTCTGCTAGACC-AGCCATGAGTGTTTCTGTGTCTTCGAA-AA  825
             ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| || ||
Sbjct  460   TTAAGTAAGCCTGAGTCTTCTGCTAGACCAAG-CATGAGTGCCTCTGTGTCTTC-AACAA  517

Query  826   GAGCTCCATCTTCATCAGTTGACAGTAGTGGCAGCAGGACTAGTAGTGGAAGACTACACT  885
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
Sbjct  518   GAGCTCCATCTTCATCGGTTGACAGTAGTGGCAGCAGGACCAGTAGTGGAAGACCACATT  577

Query  886   CTACTCTCACA-AGTGGGAGGACAGTTTCTAAAGTTTCTTCTCCCTCTGCGGGATCATCA  944
             ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  578   CTACTCTCA-ATAGTGGGAGGACAGTTTCTAAAGTTTCTTCTCCCTCTGCTGGATCATCA  636

Query  945   CCTTCTGTTTCTAGCAGTATAAGATCAAAGTCATTTTCGTCACCTCTAGACCGGACTTCC  1004
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct  637   CCTTCTGTTTCTAGCGGTATAAGATCAAAGTCATTGTCGACACCTCTAGACCGGAGTTCC  696

Query  1005  AACTTCTCTGGACGGAAGAAAACATCTACCCCTGAAAGCCGTGATTCACGACTCATTATT  1064
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  697   AACTTCTCTGGACGGAAGAAAACAGCTACCCCTGAAAGCCGCGATTCACGACTCATTATT  756

Query  1065  CTTCCAAAGGTGGAGGTTAAAGCTGGCGATGACATGAGATTGGATCTTAGAGGCCACAGG  1124
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  757   CTTCCAAAGGTGGAGGTTAAAGCTGGCGATGATATGAGATTGGATCTTAGAGGCCACAGG  816

Query  1125  ATTCGCAGTCTAACCTCT-GGTGGCTTACACTTATCACCAAACTTAGAGTTTGTCTATCT  1183
             |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817   ATTCGCAGTCTAACCTCTGGGGGGC-TACACTTGTCACCAAACTTAGAGTTTGTCTATCT  875

Query  1184  TAGAGACAATCTCCTATCTACGCTGGAAGGTATTGAGATATTGAATCGAGTCAAGGTTCT  1243
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876   TAGAGACAATCTCCTATCTACGCTGGAAGGTATTGAGATATTGAATCGAGTCAAGGTTCT  935

Query  1244  GGATTTGAGTTTTAATGATTTCAAAGGGCCTGGATTTGAACCACTTGAGAATTGCAAAAT  1303
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936   GGATTTGAGTTTTAATGATTTCAAAGGGCCTGGATTTGAACCACTTGAGAATTGCAAAAT  995

Query  1304  GCTGCAGCAACTTTATCTTGCTGGAAATCAGATAACTTCACTTGCTAGTCTGCCTCAACT  1363
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  996   GCTGCAGCAACTTTATCTTGCTGGAAATCAGATAACTTCACTTGCTAGTCTGCCTCAACT  1055

Query  1364  TCCAAACTTAGAGTTTCTCTCGGTTGCTCAAAATAAATTAAAGTCACTTGCAATGGCAAG  1423
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1056  TCCAAACTTAGAGTTTCTCTCGGTAGCTCAAAATAAATTAAAATCACTTGCAATGGCAAG  1115

Query  1424  CCAGCCCCGGCTTCAGGTACTAGCAGCAAGTAAGAACAAGATAACAACTCTGAAGGACTT  1483
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1116  CCAGCCCCGGCTTCAGGTACTAGCAGCAAGTAAGAACAAGATAACAACTCTGAAGGACTT  1175

Query  1484  TCCGTATCTACCAGTTCTTGAGCATCTGCGGGTTGAGGAAAATCCATTGCTGAAGATTTC  1543
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1176  TCCATATCTACCAGTTCTTGAGCATCTGCGGGTTGAGGAAAATCCATTGCTGAAAATTTC  1235

Query  1544  TCACTTGGAAGCGGCATCCATACTACTCGTAGGTCCTACCTTGAAGAAATTCAATGACAG  1603
             ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1236  TCATTTGGAAGCGGCATCCATACTACTCATAGGTCCTACCTTGAAGAAATTCAATGACAG  1295

Query  1604  AGATCTCTCTCGTGAGGAAGTGGCAATTGCCAAGCGTTATCCTCCACAAACAGCTCTCTG  1663
             |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1296  AGATCTCTCTCGTGAGGAAGTGACAATTGCAAAGCGTTATCCTCCACAAACAGCCCTCTG  1355

Query  1664  CCTCAGAGAAGGTTGGGAGTTTTGCAAGTCTGATCTTGCAGCAGAATCGACATTCCGCTT  1723
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1356  CCTCAGAGAAGGTTGGGAGTTCTGCAAGTCTGATCTTGCAGCAGAATCGACATTCCGCTT  1415

Query  1724  CTTAGTTGAGAGGTGGAAGGACACATTACCTTCTGGTTATCTTATTAAAGAAGCACATGT  1783
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1416  CTTAGTTGAGAGGTGGAAGGACACATTACCTTCTGGTTATCTTATTAAAGAAGCACATGT  1475

Query  1784  TGACCGACCTTCTGAAGAAGCTCCCTGTCAATGCCACTTTGGTCTTTTTCAGGAAAGTCC  1843
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||
Sbjct  1476  TGACCGACCTTCTGAAGAAGCTCCCTGTCAATGTCACTTTGGTCTTGTTCAGGAACTTCC  1535

Query  1844  TACTGCTACAGATCAAGAATTAGCCCTGAAATTTCAATGGTCTGTGGCGGACAGATCTCT  1903
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1536  TACTGCTACAGATCAAGAATTAGCCCTGAAATTTCAATGGTCTGTGGCGGACAGATCTCT  1595

Query  1904  TTCTAATTTCGTTCCTATTCTTAATGCAACCAAGGAGGTCTATTGGCCCAAACGTGAAGA  1963
             ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1596  TTCTAATTTTGTTCCTATTCTTGATGCAACCAAGGAGGTCTATTGGCCAAAACGTGAAGA  1655

Query  1964  CATTGGTAAAATTCTAAAGATAGAATGTACACCTGTTATGGCTGAGACTGAATATCCATC  2023
             |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||
Sbjct  1656  CATTGGTAAAATGCTAAAGATAGAATGTACTCCTGTTATGGGAGAGACTGAATATCCATC  1715

Query  2024  CATATTTGCCATATCTTCCCCAGTTCAACGAGGAAAGGGAATACCAAAAGTTGTGAGCCT  2083
             |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1716  CATATTTGCCATATCTTCACCAGTTCAGCGAGGAAAGGGAATACCAAAAGTTGTGAGCCT  1775

Query  2084  TGAATTAAATGGGGAACTAGTTGAGGGGAATATTATCAAGGGTCAAGCAGTGGTTGCATG  2143
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1776  TGAATTAAATGGGGAACTAGTTGAGGGAAATATTATCAAGGGTCAAGCAGTGGTTGCATG  1835

Query  2144  GTGTGGTGGGACACCAGGAAAGTGTATTACCAGTTGGTTGAGGAGAAAGTGGAATGGGAG  2203
             ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1836  GTGTGGTGGGACACCGGGAAAATGTATTACCAGTTGGTTGAGGAGAAAGTGGAACGGGAG  1895

Query  2204  CCCTGTGGTGATCGATGGAGCTGAAGATGAGGAATATATGTTATCTTTAGATGATGTGGG  2263
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1896  CCCTGTGGTGATTGATGGAGCTGAAGATGAGGAATATATGTTATCTTTAGATGATGTGGG  1955

Query  2264  ATCAAGTATGGTTTTCATGTACACACCAGTCACAGAAGGAGGTGCAAGAGGAGAGCCTCA  2323
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1956  ATCAAGTATGGTTTTCATGTACACACCAGTCACAGAAGGAGGTGCAAGAGGAGAGCCTCA  2015

Query  2324  GTATAAGTACACAGAGTTCGTAAAAGCAGCGCCTCCATCTGTAAGTAATGTTCGAATTAC  2383
             ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2016  GTACAAGTACACAGAGTTCGTAAAAGCAGCTCCTCCATCTGTAAGTAATGTTCGAATTAC  2075

Query  2384  TGGAGATGCTGTTGAAGGCTGCGTTCTCAAGGGGGTTGGAGATTATTTTGGAGGCAAGGA  2443
             ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2076  TGGAGATGCTGTTGAAGGCTGCGTTTTAAAGGGGGTTGGAGATTATTTTGGAGGCAAGGA  2135

Query  2444  AGGTCCTAGCAAGTTCGAATGGTTACGGAAGAACAAGGAAACAGGAGAACTCTCGTTGAT  2503
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2136  AGGTCCTAGCAAGTTCAAATGGTTACGGAAGAACAAGGAAACAGGAGAACTCTCCTTGAT  2195

Query  2504  ATCGGCTGGAACCTCCGAGTATACATTGACCCAGGAAGATGTTGGCACACATGTAACTTT  2563
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2196  ATCGGCTGGAACATCCGAGTATACATTGACCCAGGAAGATGTTGGCACACATGTCACTTT  2255

Query  2564  TGTGTACATACCTGCAAATTTTGAGGGGCTAGAGGGGGAACCAGTGTCAACTTCATCCAG  2623
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2256  TGTGTACATACCTGCAAATTTTGAGGGGCTAGAGGGGGAACCAGTGTCAACTTCATCCAG  2315

Query  2624  TGTAGTCAAGCCAGCACCCCCGAAAGTAACAGATGCTAAGATAGTTGGTGACTTGAGGGA  2683
             |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct  2316  TGTAATCAACCCAGCACCTCCGAAAGTAACAGATGCTAAGATAGTTGGTGATTTAAGGGA  2375

Query  2684  GAATAGTAAGGTCACTGTAACAGGTACTGTTACTGGAGGAACTGAAGGTTCAAGCAGAGT  2743
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2376  GAATAGTAAGGTCACTGTAACAGGTACTGTTACTGGAGGAACTGAAGGTTCAAGCAGAGT  2435

Query  2744  GCAATGGTTCAAATCAAGTTGTTCTATCCTGGAAGGAGACAATTCTCTTGAAGAATTGAG  2803
             ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2436  GCAATGGTTCAAATCAAGTTGTTCTATTCTAGAAGGAGGCAATTCTCTTGAAGAATTGAG  2495

Query  2804  CACATCAAAAGTGGCAAAGTCATTCCGTATACCCTTGGGGGCAGTGGGCTATTACATAGT  2863
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct  2496  CACATCAAAAGTGGCAAAGTCATTCCGTATACCATTGGGGGCGGTGGGCTATTTCATAGT  2555

Query  2864  TGCAAAGTATACTCCAATGACACCTGATGGGGAATGCGGTGAACCAGTATATGTACTCTC  2923
             ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  2556  TGCGAAGTATACTCCAATGACACCTGATGGTGAATGCGGTGAACCAGTATATGTACTATC  2615

Query  2924  GGAAAGAGCAGTTGAGACCCTTCCCCCCAGCTTAAATTTCTTGTCAATTACGGGAGACAA  2983
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct  2616  GGAAAGAGCAGTTGAGACCCTTCCCCCCAGCTTAAATTTCCTGTCAATTACTGGAGACAA  2675

Query  2984  TATCGAGGGTGGAATATTGACAGCATCCTACGGATACATAGGAGGGCATGAAGGTAAAAG  3043
             |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  2676  TATCGAGGGTGGAATATTGACAGCATCCTATGGATACATAGGGGGGCATGAAGGTAAAAG  2735

Query  3044  CAAATACGAATGGCATTATCATAAGGCTGAAAATGATCTCCCTGGTGCATTGATACCTGA  3103
             || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||
Sbjct  2736  CATATACGAATGGCATTATCATAAGGCAGAAAATGATCTCCCTGGCACATTGATACCTGA  2795

Query  3104  AGCCTCTGGGCTTCTTCAGTATACGATTACTAAAGAAGCTATAGGTAAATTCATTTCATT  3163
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  2796  AGCCTCTGGGCTTCTTCAGTATACGATTACTAAAGAAGCTATTGGTAAATTCATTTCATT  2855

Query  3164  TCAATGTATTCCTGTGAGGGATGATGGGATTGTGGGTGAGCCAAGAAGTTGCATGTCCCA  3223
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2856  TCAATGTATTCCTATGAGGGATGATGGGATTGTGGGTGAGCCAAGAAATTGCATGTCCCA  2915

Query  3224  GGAACGTGTTCGTCCAGGAAACCCAAGCACGGTATCTCTTCATGTTGTTGGAGCTCTTGT  3283
             |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct  2916  GGAACGTGCTCGTCCAGGAAACCCAAGCGCGGTATCTCTTCAAGTTGTTGGAGCTCCTGT  2975

Query  3284  TGAAGGAACCATGCTATCTGCAGAGAAAGAATATTGGGGTGGTGAAGAAGGAGCATCAGT  3343
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2976  TGAAGGAACCATGCTATATGCAGAGAAAGAATATTGGGGTGGTGAAGAAGGAGCATCAGT  3035

Query  3344  TTTCCGGTGGTTCCGGACTAATTCAGATGGTACTCCATGCGAAATAAAGGGTGCAACTAC  3403
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3036  TTTCCGGTGGTTCCGGACTAATTCAGATGGTACTCCATGCGAAATAAAGGGTGCAACTAC  3095

Query  3404  TTCGTCATATCTACTGTCAGTCGGTGATATCGGTTACTTCATTTCGGTTTCTTATGAACC  3463
             |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3096  TTCGTCATATCTGCTGTCAGTCGATGATATCGGTTTCTTCATTTCGGTTTCTTATGAACC  3155

Query  3464  TGTGAGAAATGACA-GAGCCCGTGGACCCACAGCCATTTCTGAAATAGCTGGACCAATTG  3522
               |||||||||||| | || ||||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||
Sbjct  3156  CATGAGAAATGACATG-GCTCGTGGACCCACGGTTATTTCTGAACTATCTGGACCAATTG  3214

Query  3523  TAGCTGGCCATCCAAATTGTCAGTCACTGGAGTTTCTTGGATCAATGATTGAAGGGCAAC  3582
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3215  TAGCTGGCCATCCAAATTGTCAGTCACTGGAGTTTCTTGGATCAATGATTGAAGGGCAAC  3274

Query  3583  GCTTGAGCTTTGTTGCTTCATATACTGGAGGGATGAAGGGAAATTGCTATCTTGAATGGG  3642
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||
Sbjct  3275  GCTTGAGCTTTGTTGCTTCATATACTGGAGGGATAAAAGGAAATTGCTACCTTGAATGGG  3334

Query  3643  TTAGGGTGAAAAATAATGGTGTTAAGGAAATATTGAGTAGTGATGAGTTTTTGGATTTAT  3702
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3335  TTAGGGTGAAAAGTAATGGTGTTAAGGAAATATTGAGTAATGATGAGTTTTTGGATTTAT  3394

Query  3703  CACTGGACGATGTCGGGGAAAGCATTGAACTTATTTACACTCCTGTTCGTGAAGATGGAA  3762
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3395  CACTGGACGATGTTGGGGAAAGCATTGAACTTATTTACACTCCTGTTCGTGAAGATGGAA  3454

Query  3763  TAGAAGGGAGTCCAAGGAGTATCAGGACTGATGGTATTGCTCCAGCAAATCCTATGGGGT  3822
             |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  3455  TAGAAGGGAGTCCAAGGAGTATCAGGTCTGATGGCATTGCTCCAGCAAATCCGATGGGGT  3514

Query  3823  TGGAGCTTTTAATTCCTGACTGCTGTGAGAAACAAGAGGTTGTGCCTCATAAAACTTATT  3882
             ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3515  TGGAGCTTAAAATTCCTGACTGCCGTGAGAAACAAGAGGTTGTGCCTCATAAAACTTATT  3574

Query  3883  TTGGGGGCCATGAAGGTGTTGGAGAGTACATCTGGTATCGAACTAAGGTCAAGTTGCATG  3942
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  3575  TTGGAGGCCATGAAGGTGTTGGAGAGTACATCTGGTATAGAACTAAGGTCAAGTTGCATG  3634

Query  3943  GATCTGCACTTACGGAAATATCCTATGCCGGTGAAGAGGTTGTTGTTTGTTGTAGAACAT  4002
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct  3635  GATCTGCACTCACGGAAATATCCTATGCCGGTGAAGAGGTTGTTGCTTGTAGTAGAACAT  3694

Query  4003  TAAAATATACTCCATCGCTTGAAGATGTGGGGGCTTATCTAGTCTTGTATTGGATTCCTA  4062
             |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  3695  TAAAATATACTCCATCACTTGAAGATGTGGGCGCTTATCTAGTCTTGTACTGGATTCCTA  3754

Query  4063  CTCGCGTAGATGGGAGAAGTGGGAAGCCAGTTGTTGT-GATAACAAACTCTCCTGTTGCC  4121
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||
Sbjct  3755  CTCGCGTAGATGGGAGAAGTGGGAAGCCAGTTGTT-TCGATAACAAACTCTCTTGTTGCC  3813

Query  4122  CCAGCTGATCCAGAAGTATCTAATGTTCGTGTGAAGAAACTTTTTTCGGATGCTTATTCT  4181
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3814  CCAGCTGATCCAGAAGTATCTAATGTTCGTGTGAAGAAACTTTTTTCGGATGCTTATTCT  3873

Query  4182  GGAGAAGGAGAGTACTTTGGTGGACATGAAGGTCCAAGTCTCTTCAGTTGGTACAGAGAG  4241
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| 
Sbjct  3874  GGAGAAGGAGAGTACTTTGGTGGCCATGAAGGTGCTAGTATCTTCAGTTGGTACAGAGAT  3933

Query  4242  AATGATGGAACCATTGATCTTATTGATGGGGCTAACTCCAAAACGTATGAGGTGACTGAG  4301
             |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3934  AATGATGGAAACATTGATCTTATTGCTGGGGCTAACTCCAAAACGTATGAGGTGACTGAG  3993

Query  4302  TCAGATTACAATTGCCGGATATTGTTCGGGTACACACCAGTTCGTTCAGATTCTGTTGTG  4361
             || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  3994  TCGGATTACAATTGCCGAATATTGTTTGGGTACACACCTGTTCGTTCAGATTCTGTTGTG  4053

Query  4362  GGAGAGCTAAAGATGTCTGAGCCAACTGAAATTATCCTCCCAGAGGTTCCAAAAGTAGAC  4421
             |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4054  GGAGAGTTAAAGATGTCCGAGCCAACTGAAATTATCCTCCCAGAGGTTCCAAAAGTAGAC  4113

Query  4422  ATGCTTGCTTTCACCGGAAAGGCTGTACAAGGTGATGTTCTCACAGCCGTCCAAGTGATC  4481
             ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4114  ATGCTTGCTTTCACCGGAAAGGCGGTACAGGGTGATGTTCTCACAGCCGTCCAAGTGATC  4173

Query  4482  CCAAAGACTGAAATTCAACAACTTGTTTGGAGCAAGTACAAAGGAGATATTCAATACCAA  4541
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  4174  CCAAAGACTGAAATTCAACAACTTGTTTGGAGCAAGTACAAAGGAGAAATTCAATACCAA  4233

Query  4542  TGGTTCCGCTCACCGGAATCAGGGGATAAGATATCGTATGAGGCTCTCTCTTCAGAAATT  4601
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  4234  TGGTTCCGCTCACCGGAATCAGGGGATAAGATTTCGTATGAGGCTCTCTCTTCAGAAACT  4293

Query  4602  TCGTGTTCATACAAGGTGCGGTTTGAGGATATTGGCAGATGTCTCAAATGTGAATGTGTA  4661
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4294  TCGTGTTCATACAGGGTGCGGTTTGAGGATATTGGCAGATGTCTCAAATGTGAATGTGTA  4353

Query  4662  GTGCATGATGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACTAGCATACGCCGAGACTGATCCAATATCA  4721
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  4354  GTACATGATGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACTAGCATACGCCGAGACTGATCCAATATTA  4413

Query  4722  CCAGGTTTTCCTAGGATAGAGAAGCTAGAGATTGAAGGACAAGGTTTCCATACTAACTTA  4781
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  4414  CCAGGTTTTCCTAGGATAGAGAAGCTAGAGATTGAAGGACAAGGTTTTCATACTAACTTA  4473

Query  4782  TAT-GCTGTGCGGGGAAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAATGGCT  4840
             ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4474  TATAG-TGTGCGGGGAAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAATGGCT  4532

Query  4841  TAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTA  4900
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4533  TAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTA  4592

Query  4901  TGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATACGTGA  4960
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  4593  TGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATCCGTGA  4652

Query  4961  GGATGGTGTCCAAGGCCACCCAGTTTCTGCATCAACTGAGCCTGTTGCTGTTGAACCTGA  5020
             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  4653  GGATGGTGTTCAAGGCCACCCAGTTTCTGCATCAACAGAGCCTGTTGCTGTTGAACCTGA  4712

Query  5021  TATTCT-TAAGGAAGTGA-GACAGAAATTAGAAACTGGGTTAGTGAAGTTTGAGGTGTTG  5078
               || | ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4713  CCTT-TATAAGGAAGTGAAG-CAGAAACTAGAAACCGGGTTAGTGAAGTTTGAGGTGTTG  4770

Query  5079  TGTGACAAGGACCCTTATCCCAAAAAGATTGTGGGAGAGGGAAATCTCGAGAGACGAATG  5138
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4771  TGTGACAAGGACCCTTATCCCAAAAAGATTGTGGGAGAGGGAAATCTCGAGAGACGAATG  4830

Query  5139  CTAGAAATGAACAGGAAGAGAATAAAGGTTGTGAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCGCA  5198
             || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4831  CTGGAAATGAACAGGAAGAGAATAAAGGTTGTAAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCGCA  4890

Query  5199  ACTACTGAAGTCCGTGGAAGCTATGGTCCTCCTTTCCACGTGGAGACATTTCGTAACGAC  5258
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  4891  ACTACTGAAGTCCGTGGAAGCTATGGTCCTCCTTTCCACGTGGAGACATTTCGTAATGAC  4950

Query  5259  CAAAGAAGGCTAAGGATAGTTGTGGATAGTGAGAATGAAGTAGACATAGTGGTGCAGTCG  5318
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  4951  CAGAGAAGGCTAAGGATAGTTGTGGATAGTGAGAATGAAGTAGACATAGTGGTGCATTCG  5010

Query  5319  CGCCATCTCCGCGATGTTATAGTACTTGTCATTCGCGGCTTTGCTCAGCGGTTCAACAGC  5378
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct  5011  CGCCATCTCCGCGATGTTATAGTGCTTGTCATTCGCGGGTTTGCTCAGCGATTCAACAGC  5070

Query  5379  ACTTCACTCAATTCTCTACTTAAGATCGATACATGA  5414
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5071  ACTTCACTCAATTCTCTACTTAAGATCGATACATGA  5106



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 217384856976


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5