BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G34710.1
Length=3064
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg934072 jgi|Araly1|934072|scaffold_402060.1 4311 0.0
Ahg473277 jgi|Araly1|473277|fgenesh2_kg.1__3231__AT1G30490.1 2446 0.0
> Ahg934072 jgi|Araly1|934072|scaffold_402060.1
Length=2624
Score = 4311 bits (2334), Expect = 0.0
Identities = 2474/2544 (97%), Gaps = 0/2544 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 309 ATATGATGAACAGAGAGTCGCCGGATAAAGGGTTAGATTCCGGCAAGTATGTGAGGTACA 368
||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 ATACGATGAACAGAGAGTCGCCGGATAAAGGGTTGGATTCCGGCAAGTATGTGAGGTACA 132
Query 369 CGCCGGAGCAAGTGGAAGCTCTCGAGAGAGTTTACACTGAGTGTCCTAAGCCAAGTTCTC 428
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 133 CACCGGAGCAAGTGGAAGCTCTCGAGAGAGTTTACACTGAGTGTCCTAAGCCCAGCTCTC 192
Query 429 TAAGAAGACAACAACTCATACGTGAATGTCCGATTCTCTCTAACATCGAGCCTAAGCAGA 488
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 193 TGAGAAGACAACAACTCATACGTGAATGTCCGATTCTCTCCAATATCGAGCCTAAGCAGA 252
Query 489 TCAAAGTTTGGTTTCAGAACCGCAGATGTCGTGAGAAGCAGAGGAAAGAAGCTGCTCGTC 548
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 253 TCAAAGTTTGGTTCCAGAACCGCAGATGTCGAGAGAAGCAGAGGAAAGAAGCTGCTCGCC 312
Query 549 TTCAAACAGTGAACAGAAAACTCAATGCCATGAACAAACTCTTGATGGAAGAGAATGATC 608
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313 TTCAAACAGTGAACAGAAAGCTCAATGCCATGAACAAACTCTTGATGGAAGAGAATGATC 372
Query 609 GTTTGCAGAAGCAAGTTTCTAACTTGGTCTATGAGAATGGCCACATGAAACATCAACTTC 668
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 373 GTTTGCAGAAGCAAGTTTCTCACTTGGTCTATGAGAATGGCCACATGAAACAGCAACTTC 432
Query 669 ACACTGCTTCTGGGACGACCACAGACAACAGCTGTGAGTCTGTGGTCGTGAGTGGTCAGC 728
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 ACACTTCTTCTGGGACGACCACAGACAACAGCTGTGAGTCTGTGGTCGTGAGTGGTCAGC 492
Query 729 AACATCAACAGCAAAACCCAAATCCTCAGCATCAGCAACGTGATGCTAACAACCCAGCAG 788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 493 AACATCAACAGCAAAACCCAAATCCTCAGCATCAGCAACGTGATGCTAACAACCCAGCTG 552
Query 789 GACTCCTTTCTATAGCAGAGGAGGCCCTAGCAGAGTTCCTTTCCAAGGCTACAGGAACTG 848
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 GACTCCTTTCGATAGCAGAGGAGGCCCTAGCAGAGTTCCTTTCCAAGGCTACAGGAACTG 612
Query 849 CTGTTGACTGGGTTCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCCGGATTCTATTGGCATAGTCG 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 613 CTGTTGACTGGGTTCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCCGGATTCTATTGGCATCGTCG 672
Query 909 CTATTTCGCGCAACTGCAGCGGAATTGCAGCACGTGCCTGCGGCCTCGTGAGTTTAGAAC 968
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 673 CTATTTCGCGCAACTGCAGCGGAATTGCAGCACGTGCCTGCGGCTTCGTGAGTTTAGAAC 732
Query 969 CCATGAAGGTTGCTGAAATTCTCAAAGATCGTCCATCTTGGCTCCGAGATTGTCGAAGTG 1028
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 733 CCATGAAGGTTGCTGAAATCCTCAAAGATCGTCCATCTTGGCTCCGTGATTGTCGATGTG 792
Query 1029 TGGATACTCTGAGTGTGATACCTGCTGGAAACGGTGGGACGATCGAGCTTATTTACACGC 1088
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 793 TGGATACTCTGAGTGTGATTCCTGCTGGAAATGGTGGGACTATTGAGCTTATTTACACGC 852
Query 1089 AGATGTATGCTCCTACGACTTTAGCAGCAGCTCGTGACTTTTGGACGCTGAGATATAGCA 1148
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 853 AGATGTATGCCCCTACGACTTTAGCAGCAGCTCGTGACTTTTGGACACTGAGATATAGTA 912
Query 1149 CATGTTTGGAAGATGGAAGCTATGTGGTTTGTGAAAGGTCGCTTACTTCTGCAACTGGTG 1208
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 913 CATGTTTGGAAGATGGAAGCTATGTGGTTTGTGAGAGGTCGCTTACTTCTGCAACTGGTG 972
Query 1209 GCCCCACTGGGCCACCTTCTTCAAACTTTGTGAGAGCTGAAATGAAACCAAGCGGGTTTC 1268
|||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 973 GCCCCAGTGGGCCACCTTCTTCTAGCTTTGTGAGAGCTGAAATGCGACCAAGCGGGTTTC 1032
Query 1269 TCATCCGTCCTTGCGATGGTGGTGGTTCCATTCTCCACATTGTTGATCATGTTGATCTGG 1328
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 TTATCCGTCCTTGCGAGGGTGGTGGTTCCATTCTCCACATTGTTGATCATGTTGATCTGG 1092
Query 1329 ATGCCTGGAGTGTCCCTGAAGTCATGAGGCCTCTCTATGAATCATCGAAGATTCTTGCTC 1388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093 ATGCCTGGAGTGTCCCTGAAGTCATGAGGCCTCTCTATGAATCATCGAAGATTCTTGCTC 1152
Query 1389 AGAAAATGACTGTTGCTGCTTTGAGACATGTAAGACAAATTGCACAAGAAACAAGTGGAG 1448
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 AGAAAATGACTGTTGCTGCTCTGAGACATGTAAGACAAATTGCACAAGAAACAAGTGGAG 1212
Query 1449 AAGTTCAGTATGGTGGAGGGCGCCAACCTGCGGTTTTAAGAACCTTCAGTCAAAGACTCT 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 AAGTTCAGTATGGTGGAGGGCGCCAACCTGCGGTTTTAAGAACCTTCAGTCAAAGACTCT 1272
Query 1509 GTCGGGGTTTCAATGATGCTGTTAATGGTTTTGTGGATGATGGATGGTCACCAATGGGTA 1568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273 GTCGGGGTTTCAATGATGCTGTTAATGGTTTTGTGGACGATGGATGGTCACCAATGGGTA 1332
Query 1569 GCGATGGTGCAGAGGATGTTACTGTAATGATAAACTTGTCCCCTGGGAAGTTTGGTGGGT 1628
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1333 GCGATGGTGCAGAGGATATTACTGTTATGATAAACTTGTCCCCTGGGAAGTTTTGTGGGT 1392
Query 1629 CTCAGTACGGTAATTCATTCCTTCCAAGCTTTGGTAGTGGCGTGCTTTGTGCCAAGGCAT 1688
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 CTCAGTACGGTAATTCATTCCTTCCGAGCTTTGGTAGTGGCGTGCTTTGTGCCAAGGCAT 1452
Query 1689 CTATGTTGCTTCAGAACGTTCCACCCGCTGTGCTGGTTCGATTCCTTAGAGAACACCGAT 1748
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 1453 CGATGTTGCTTCAGAACGTTCCACCCGCTGTGCTGGTGCGATTCCTTAGAGAACACCGCT 1512
Query 1749 CTGAATGGGCTGATTATGGCGTGGATGCTTATGCTGCTGCATCGCTCAGAGCAAGTCCTT 1808
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1513 CTGAATGGGCTGATTATGGTGTGGATGCTTATGCTGCTGCATCGCTCAGAGCAAGTCCTT 1572
Query 1809 TTGCTGTTCCTTGTGCTAGAGCTGGGGGGTTCCCAAGTAACCAAGTCATTCTTCCTCTTG 1868
||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1573 TTGCTGTTCCTTGCGCTAGAGCTGGTGGGTTCCCGAGTAACCAAGTCATTCTTCCCCTTG 1632
Query 1869 CGCAGACAGTTGAACATGAAGAGTCACTTGAGGTGGTTAGACTTGAAGGTCACGCTTACT 1928
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633 CGCAGACAGTTGAACATGAAGAGTCTCTTGAGGTGGTTAGACTTGAAGGTCACGCTTACT 1692
Query 1929 CACCCGAAGACATGGGTTTAGCTCGGGATATGTATTTGCTACAGCTTTGTAGCGGTGTTG 1988
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693 CACCCGAAGACATGGGTTTAGCTCGGGATATGTATCTGCTACAGCTTTGTAGCGGTGTTG 1752
Query 1989 ATGAAAATGTGGTTGGAGGTTGTGCACAGCTTGTATTTGCCCCTATCGATGAATCATTTG 2048
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1753 ATGAAAATGTGGTTGGAGGTTGTGCACAGCTTGTCTTTGCGCCTATCGATGAATCATTTG 1812
Query 2049 CTGATGATGCACCTTTGCTTCCTTCCGGTTTCCGCATCATACCTCTTGAACAGAAATCTA 2108
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1813 CTGATGATGCACCTTTGCTTCCTTCTGGTTTCCGCATCATACCTCTTGAACAGAAATCAA 1872
Query 2109 CTCCGAACGGTGCATCTGCAAACCGTACCCTGGATTTAGCCTCAGCTTTAGAAGGATCCA 2168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 CTCCGAACGGTGCATCTGCAAACCGTACCCTGGATTTAGCCTCAGCTTTAGAAGGATCCA 1932
Query 2169 CACGTCAAGCTGGTGAAGCCGACCCAAATGGCTGTAACTTTAGGTCGGTACTAACCATAG 2228
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933 CACGTCAAGCAGGTGAAGCCGACCCAAATGGCTGTAACTTTAGGTCGGTACTAACCATAG 1992
Query 2229 CATTCCAGTTCACATTTGATAACCATTCAAGAGACAGTGTTGCTTCAATGGCACGTCAGT 2288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993 CATTCCAGTTCACATTTGATAACCATTCAAGAGACAGTGTTGCTTCAATGGCACGTCAGT 2052
Query 2289 ACGTGCGAAGCATAGTAGGATCGATTCAGAGGGTTGCTCTAGCCATTGCTCCTCGTCCTG 2348
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053 ACGTTAGAAGCATAGTAGGATCGATTCAGAGGGTTGCTCTAGCCATTGCTCCTCGTCCTG 2112
Query 2349 GCTCCAATATCAGTCCAATATCTGTTCCCACTTCCCCTGAAGCTCTCACTCTGGTCCGTT 2408
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 GCTCCACTATCAGTCCAATCTCTGTTCCCACTTCCCCTGAAGCTCTCACTCTGGTCCGTT 2172
Query 2409 GGATCTCCCGGAGTTACAGCCTTCACACTGGTGCAGATCTCTTTGGATCTGATTCTCAAA 2468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2173 GGATCTCCCGGAGTTACAGCCTTCACACTGGTGCAGATCTCTTTGGATCTGATTCTCAAA 2232
Query 2469 CCAGTGGTGACACGTTGCTGCATCAACTCTGGAATCACTCTGATGCAATCTTGTGCTGCT 2528
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2233 CCAGTGGGGACACATTGCTGCATCAACTCTGGAATCACACTGATGCAATCTTGTGCTGCT 2292
Query 2529 CCCTCAAAACAAACGCTTCACCGGTTTTCACATTCGCAAACCAAACCGGTTTAGACATGC 2588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2293 CCCTCAAAACAAACGCTTCACCGGTTTTCACATTCGCAAACCAAACCGGTTTAGACATGC 2352
Query 2589 TGGAAACGACTCTTGTAGCCCTTCAAGACATAATGCTAGACAAGACCCTTGACGAACCTG 2648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2353 TGGAAACGACTCTTGTAGCCCTTCAAGACATAATGCTAGACAAGACCCTTGACGAACCTG 2412
Query 2649 GTCGTAAAGCTCTTTGCTCTGAGTTCCCCAAGATCATGCAACAGGGCTATGCTCATCTGC 2708
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2413 GTCGTAAAGCTCTTTGCTCTGAGTTCCCCAAGATCATGCAACAGGGCTATGCTCATCTTC 2472
Query 2709 CGGCAGGAGTATGTGCGTCAAGCATGGGAAGGATGGTATCTTACGAGCAGGCAACGGTGT 2768
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2473 CGGCGGGAGTATGTGCGTCAAGCATGGGGAGGATGGTGTCTTACGAGCAGGCAACGGTGT 2532
Query 2769 GGAAAGTTCTTGAAGACGATGAATCAAACCACTGCTTAGCTTTCATGTTCGTGAATTGGT 2828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2533 GGAAAGTTCTTGAAGACGATGAATCAAACCACTGCTTAGCTTTCATGTTCGTGAATTGGT 2592
Query 2829 CGTTCGTTTGAAGAATAATAAGAA 2852
|||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2593 CGTTCGTTTGAAGAATAAGAAGAA 2616
Score = 86.1 bits (46), Expect = 1e-15
Identities = 46/46 (100%), Gaps = 0/46 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 130 CttttttttCTCACCATTATCTCATGAACGTGAGTGGAGGCTCTCT 175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTTTTTTTTCTCACCATTATCTCATGAACGTGAGTGGAGGCTCTCT 46
> Ahg473277 jgi|Araly1|473277|fgenesh2_kg.1__3231__AT1G30490.1
Length=2838
Score = 2446 bits (1324), Expect = 0.0
Identities = 2152/2549 (84%), Gaps = 67/2549 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 318 ACAGAGAGTCGCCGGATAAAGGGTTAGATTCCGGCAAGTATGTGAGGTACACGCCGGAGC 377
||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |
Sbjct 213 ACAGAGACTCTCCTGACAAAGGATTTGATTCCGGCAAGTACGTTAGATACACGCCGGAAC 272
Query 378 AAGTGGAAGCTCTCGAGAGAGTTTACACTGAGTGTCCTAAGCCAAGTTCTCTAAGAAGAC 437
|||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||
Sbjct 273 AAGTTGAAGCTCTTGAGAGAGTTTATGCTGAGTGTCCTAAACCTAGCTCTCTCAGAAGAC 332
Query 438 AACAACTCATACGTGAATGTCCGATTCTCTCTAACATCGAGCCTAAG-CAGATCAAAGTT 496
|||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 333 AACAGCTTATTCGTGAATGTCCGATTCTCTGTAACATCGAGCCT-CGACAGATCAAAGTT 391
Query 497 TGGTTTCAGAACCGCAGATGTCGTGAGAAGCAGAGGAAAGAAG-CTGCTCGTCTTCAAAC 555
||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||
Sbjct 392 TGGTTCCAGAATCGCAGATGTCGAGAGAAGCAGAGGAAAG-AGTCAGCTCGTCTTCAGAC 450
Query 556 AGTGAACAGAAAACTCAATGCCATGAACAAACTCTTGATGGAAGAGAATGATCGTTTGCA 615
||||||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451 AGTGAACAGGAAGCTGAGTGCCATGAACAAGCTTTTGATGGAAGAGAATGATCGTTTGCA 510
Query 616 GAAGCAAGTTTCTAACTTGGTCTATGAGAATGGCCACATGAAACATC-AACTTCACACTG 674
||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||
Sbjct 511 GAAGCAAGTCTCCAACTTGGTTTATGAGAATGGGTTCATGAAACATCGAA-TCCACACTG 569
Query 675 CTTCTGGGACGACCACAGACAACAGCTGTGAGTCTGTGGTCGTGAGTGGTCAGCAACATC 734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 570 CTTCTGGGACGACCACAGACAACAGCTGTGAGTCTGTGGTCGTGATTGGTCAGCAACGTC 629
Query 735 AACAGCAAAACCCAA-ATCCTCAGCATC-AGCAACGTGATGCTAACAACCCAGC-AGGAC 791
| ||||||||||||| | | |||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
Sbjct 630 AGCAGCAAAACCCAACA-CATCAGCATCCA-CAGCGTGATGCTAACAACCCAGCTAAT-C 686
Query 792 TCCTTTCTATAGCAGAGGAGGCCCTAGCAGAGTTCCTTTCCAAGGCTACAGGAACTGCTG 851
| || || || || |||||| || | || |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 687 TTCTCTCGATTGCGGAGGAGACCTTGGCGGAGTTCCTTTGCAAGGCTACAGGAACTGCTG 746
Query 852 TTGACTGGGTTCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCCGGATTCTATTGGCATAGTCGCTA 911
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 747 TCGACTGGGTTCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCCGGATTCTATTGGCATCGTAGCTG 806
Query 912 TTTCGCGCAACTGCAGCGGAATTGCAGCACGTGCCTGCGGCCTCGTGAGTTTAGAACCCA 971
|||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 TTTCACGCAACTGCAGTGGAATAGCAGCACGTGCCTGCGGCCTCGTGAGTTTAGAACCCA 866
Query 972 TGAAGGTTGCTGAAATTCTCAAAGATCGTCCATCTTGGCTCCGAGATTGTCGAAGTGTGG 1031
||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |
Sbjct 867 TGAAGGTCGTTGAAATCCTCAAAGATCGTCCATCTTGGTTCCGTGACTGTCGATGTGTCG 926
Query 1032 ATACTCTGAGTGTGATACCTGCTGGAAACGGTGGGACGATCGAGCTTATTTACACGCAGA 1091
| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||| | |||| ||||
Sbjct 927 AGACTCTGAATGTTATACCTACTGGAAATGGTGGTACTATTGAGCTTGTCAACACTCAGA 986
Query 1092 TGTATGCTCCTACGACTTTAGCAGCAGCTCGTGACTTTTGGACGCTGAGATATAGCACAT 1151
| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 987 TTTATGCTCCTACAACATTAGCAGCAGCTCGTGACTTTTGGACGCTGAGATATAGTACAA 1046
Query 1152 GTTTGGAAGATGGAAGCTATGTGGTTTGTGAAAGGTCGCTTACTTCTGCAACTGGTGGCC 1211
|| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 1047 GTCTAGAAGATGGAAGCTATGTGGTTTGTGAGAGGTCACTCACTTCTGCAACTGGTGGCC 1106
Query 1212 CCACTGGGCCACCTTCTTCAAACTTTGTGAGAGCTGAAATGAAACCAAGCGGGTTTCTCA 1271
||| ||| || | |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
Sbjct 1107 CCAATGGTCCGCTTTCTTCAAGCTTCGTGAGAGCCAAAATGCTGTCAAGCGGGTTTCTTA 1166
Query 1272 TCCGTCCTTGCGATGGTGGTGGTTCCATTCTCCACATTGTTGATCATGTTGATCTGGATG 1331
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1167 TCCGTCCTTGTGATGGTGGTGGTTCCATTATCCACATCGTTGATCATGTTGACCTGGATG 1226
Query 1332 CCTGGAGTGTCCCTGAAGTCATGAGGCCTCTCTATGAATCATCGAAGATTCTTGCTCAGA 1391
|| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||
Sbjct 1227 TCTCAAGTGTTCCTGAAGTCCTGAGGCCTCTTTATGAGTCTTCCAAAATTCTTGCTCAGA 1286
Query 1392 AAATGACTGTTGCTGCTTTGAGACATGTAAGACAAATTGCACAAGAAACAAGTGGAGAAG 1451
||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 1287 AAATGACCGTGGCTGCTTTGAGACATGTGAGGCAAATTGCTCAAGAGACTAGTGGAGAAG 1346
Query 1452 TTCAGTATGGTGGAGGGCGCCAACCTGCGGTTTTAAGAACCTTCAGTCAAAGACTCTGTC 1511
| |||||| |||| || | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |
Sbjct 1347 TCCAGTATAGTGGTGGAAGACAGCCTGCAGTTTTAAGAACTTTCAGCCAAAGACTCTGCC 1406
Query 1512 GGGGTTTCAATGATGCTGTTAATGGTTTTGTGGATGATGGATGGTCACCAATGGGTAGCG 1571
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |
Sbjct 1407 GGGGTTTCAATGATGCTGTTAATGGTTTTGTTGATGATGGGTGGTCTCCAATGAGTAGTG 1466
Query 1572 ATGGTGCAGAGGATGTTACTGTAATGATAAACT-TGTCCCCTGGGAAGTTTGGTGGGTCT 1630
|||| ||||||||| |||| | ||||| |||| | ||| ||| || || | ||| ||
Sbjct 1467 ATGGAGCAGAGGATATTACAATCATGATTAACTCT-TCCTCTGCTAAATTCGCTGGCTCC 1525
Query 1631 CAGTACGGTAATTCATTCCTTCCAAGCTTTGGTAGTGGCGTGCTTTGTGCCAAGGCATCT 1690
|| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||
Sbjct 1526 CAATACGGTAGCTCATTTCTTCCAAGTTTTGGAAGTGGTGTCCTGTGTGCCAAAGCTTCT 1585
Query 1691 ATGTTGCTT-CAGAACGTTCCACCCGCT-GTGCTGGTTCGATTCCTTAGAGAACACCGAT 1748
||| || || ||||| ||||||||| || || || |||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1586 ATGCTG-TTGCAGAATGTTCCACCC-CTTGTACTAATTCGTTTCCTGAGAGAACACCGAG 1643
Query 1749 CTGAATGGGCTGATTATGGCGTGGATGCTTATGCTGCTGCATCGCTCAGAGCAAGTCCTT 1808
|||||||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||| |
Sbjct 1644 CTGAATGGGCAGACTATGGTGTTGATGCCTATTCTGCTGCATCTCTCAGGGCAACTCCAT 1703
Query 1809 TTGCTGTTCCTTGTGCTAGAGCTGGGGGGTTCCCAAGTAACCAAGTCATTCTTCCTCTTG 1868
| ||||||| || | |||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1704 TCACTGTTCCATGCGTTAGAACCGGTGGGTTCCCGAGTAACCAAGTCATTCTTCCTCTCG 1763
Query 1869 CGCAGACAGTTGAACATGAAGAGTCACTTGAGGTGGTTAGACTTGAAGGTCACGCTTACT 1928
| |||||| ||||||||||||||| || || ||||| ||||| | |||||| |||||||
Sbjct 1764 CACAGACACTTGAACATGAAGAGTTTCTCGAAGTGGTCAGACTCGGAGGTCATGCTTACT 1823
Query 1929 CACCCGAAGACATGGGTTTAGCTCGGGATATGTATTTGCTACAGCTTTGTAGCGGTGTTG 1988
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||
Sbjct 1824 CACCCGAAGACATGGGTTTATCCCGGGATATGTATTTACTGCAGCTTTGCAGCGGCGTTG 1883
Query 1989 ATGAAAATGTGGTTGGAGGTTGTGCACAGCTTGTATTTGCCCCTATCGATGAATCATTTG 2048
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1884 ATGAAAATGTGGTTGGAGGTTGTGCTCAGCTTGTCTTTGCCCCAATCGATGAATCATTTG 1943
Query 2049 CTGATGATGCACCTTTGCTTCCTTCCGGTTTCCGCATCATACCTCTTGAACAGAAATCTA 2108
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || || |||||| | |
Sbjct 1944 CTGATGATGCACCTTTGCTTCCTTCTGGTTTCCGTGTCATACCGCTCGACCAGAAAACAA 2003
Query 2109 CTCCGAACGGTG--CA-TCTGCAAACCGTACCCTGGATTTAGCCTCAGCTTTAGAAGGAT 2165
|||||| | | || ||||||| || || | |||| |||| ||| || |||| || |
Sbjct 2004 ATCCGAATGATCATCAGTCTGCAAGTCGAACACGGGATCTAGCATCATCTCTAGATGGTT 2063
Query 2166 CCACACGTCAAGCTGGTGAAGCCGACCCA-AATGGCTGTAACTTTAGGTCGGTACT-AAC 2223
|||| | || || |||| || || | |||| || | ||| || |||
Sbjct 2064 CCAC--G--AA-------AA-CCGATTCAGAAA--CA--AACTCCAGATTGGT-CTTAAC 2106
Query 2224 CATAGCATTCCAGTTCACATTTGATAACCATTCAAGAGACAGTGTTGCTTCAATGGC-AC 2282
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |
Sbjct 2107 AATAGCCTTCCAGTTCACATTTGATAATCATTCAAGAGACAATGTTGCTACAATGGCGA- 2165
Query 2283 GTCAGTACGTGCG-AA-GCATAGTAGGATCGATTCAGAGGGTTGCTCTAGCCATTGCTCC 2340
| ||||| ||| | || | | || || ||||||||||| || ||| |||||||| | ||
Sbjct 2166 GACAGTATGTGAGGAATGT-T-GTTGGTTCGATTCAGAGAGTGGCTTTAGCCATTACGCC 2223
Query 2341 TCGTCCTGGCTCCAATATCAGTCCAATATCTGTTCCCACTTCCCCTGAAGCTCTCACTCT 2400
|||||||||||| ||| | | || || | ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2224 TCGTCCTGGCTC-AAT----G-C-AA---CT-T-CCCACTTCCCCTGAAGCTCTCACCCT 2271
Query 2401 GGTCCGTTGGATCTCCCGGAGTTACAGCCTTCACACTGGTGCAGATCTCTTTGGATCTGA 2460
|||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| || || |||||| ||||
Sbjct 2272 TGTCCGTTGGATCACCCGTAGTTACAGCATTCACACAGGTGCTGACCTGTTTGGAGCTGA 2331
Query 2461 TTCTCAAACCAGTGGTG-A--CACGTTGCTGCATCAACTCTGGAATCACTCTGATGCAAT 2517
|||||| || |||| | | ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct 2332 TTCTCAGTCCTGTGGAGGAGACACGTTGCTTAAGCAACTCTGGAACCATTCTGATGCCAT 2391
Query 2518 CTTGTGCTGCTCCCTCAAAACAAACGCTTCACCGGTTTTCACATTCGCAAACCAAACCGG 2577
|||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 2392 ATTGTGCTGCTCCCTCAAAACTAATGGATCACCGGTATTCACATTTGCAAACCAAGCCGG 2451
Query 2578 TTTAGACATGCTGGAAACGACTCTTGTAGCCCTTCAAGACATAATGCTAGACAAGACCCT 2637
|||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||||| ||||| || ||
Sbjct 2452 TTTAGACATGCTTGAAACAACGCTCGTGGCACTTCAGGATATAATGCTCGACAAAACGCT 2511
Query 2638 TGACGAAC-CTGGTCGTAAAGCTCTTTGCTCTGAGTTCCCCAAGATCATGCAACAGGGCT 2696
||| || | |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 2512 TGATGA-CTCTGGTCGTAAAGCTCTTTGCTCCGAATTCGCCAAGATCATGCAGCAGGGCT 2570
Query 2697 ATGCTCATCTGCCGGCAGGAGTATGTGCGTCAAGCATGGGAAGGAT-GGTATCTTACGAG 2755
|||| |||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||| || | ||| || || |||
Sbjct 2571 ATGCGAATCTTCCGGCGGGAATATGTGTGTCGAGCATGGGCAG-ACCGGTTTCGTATGAG 2629
Query 2756 CAGGCAACGGTGTGGAAAGTTCTTGAAGACGATGAATCAAACCACTGCTTAGCTTTCATG 2815
|| || ||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2630 CAAGCGACGGTGTGGAAAGTTGTCGACGACAACGAATCAAACCACTGCTTGGCTTTTAT- 2688
Query 2816 T-TCGTGAATTGGTCGTTCGTTTGAAGAA 2843
| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2689 TCTCGTGAATTGGTCGTTCGTTTGATGAA 2717
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 115718164310
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5