BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G35110.1
Length=4643
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg934119 jgi|Araly1|934119|scaffold_402107.1 7160 0.0
> Ahg934119 jgi|Araly1|934119|scaffold_402107.1
Length=4324
Score = 7160 bits (3877), Expect = 0.0
Identities = 4166/4305 (97%), Gaps = 21/4305 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 105 GAATTAATGGCGAATTCTCGTCAATATTATCCATCTCAAGATGAATCAATGTCCCCGACT 164
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18 GAATTAATGGCGAAATCCCGTCAATATTATCCATCTCAAGATGAATCAATGTCCCCGACT 77
Query 165 TCTGTGAGATCAAGGGAATGGGAAGGTCCTTCCAGATGGACTGAGTACTTGGGACCTGAA 224
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 TCTGTGAGATCGAGGGAATGGGAAGGTCCTTCCAGATGGACTGAGTACTTGGGACCTGAA 137
Query 225 ATGGCTGCATCAGTGTCTTCTACTAGGAGCTCTAAGCAAATTGATGG--A----CA-TG- 276
|||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| | || |
Sbjct 138 ATGGCTGCATCA--GT-TTCTTCTAGGAGCTCAAAGCAAATTGATGGAAATCTTCAGAGT 194
Query 277 T-TGGTGGTTCCACAAAGGCTTTGAACATACAATGGGTAGTTCAAATGATTGAGGTTGCT 335
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 TCTGGTGGTTCCACAAAGGCTTTGAACATACAATGGGTAGTTCAAATGATTGAGGTTGCA 254
Query 336 GACGGTCTCATGGCTAAAATGTATAGACTGAATCAAATCTTGGAGTATCCTGATCCTGTT 395
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 255 GAAGGTCTCATGGCTAAAATGTATAGACTGAATCAAATCTTGGAGTACCCTGATCCTGTT 314
Query 396 GGCCATGTATTCTCTGAAGCATTTTGGAAAGCGGGTGTCTTCCCTAACCATCCACGGATA 455
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 GGCCATGTTTTCTCTGAAGCATTTTGGAAAGCGGGTGTCTTCCCTAACCATCCACGGATA 374
Query 456 TGCACTTTGCTCTCTAAAAAGTTCCCTGAGCATTTCAGCAAATTGCAACTTGAACGTATT 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 TGCACTTTGCTCTCTAAAAAGTTCCCTGAGCATTTCAGCAAATTGCAACTTGAACGTATT 434
Query 516 GATAAGTTTTCACTGGATAGCTTGCATGATGGTGCTGAACTTCACTTACAGAGCTTAGAG 575
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 GACAAGTTTTCACTGGATAGCTTGCACGATGGTGCTGAACTTCACTTACAGAGCTTAGAG 494
Query 576 CCATGGATACAGCTGCTGCTCGACTTGATGGCATTTCGAGAACAGGCACTGCGGCTTATA 635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 CCATGGATACAGCTGCTGCTCGACTTGATGGCATTTCGAGAACAGGCACTGCGGCTTATA 554
Query 636 TTGGACCTAAGCAGCACTGTAATTACCTTGCTGCCTCATCAGAACTCACTTATTCTGCAT 695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 TTGGACCTAAGCAGCACTGTAATTACCTTGCTGCCTCATCAGAACTCACTTATTCTGCAT 614
Query 696 GCATTCATGGATCTCTTTTGTGCATTTGTCCGAGTCAATCTCTTCGCAGAGAAGATTCCT 755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 615 GCATTCATGGATCTCTTTTGTGCATTTGTCCGAGTCAATCTTTTCGCAGAGAAGATTCCT 674
Query 756 AGGAAAATGTTGTTGCAAGTCTACAACCTTCTGCATGCGCTATCAAGAAATGATCGAGAC 815
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 AGGAAAATGTTGCTGCAAGTGTACAACCTTCTGCATGCGCTATCAAGAAATGATCGAGAC 734
Query 816 TGTGACTTTTATCACCGCTTGGTGCAATTCATAGACTCTTATGATCCCCCATTGAAAGGC 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 735 TGTGACTTTTATCACCGCTTGGTGCAATTCATAGACTCTTATGATCCCCCATTAAAAGGC 794
Query 876 TTACAAGAAGATTTGAATTTTGTCAGCCCAAGGATTGGAGAGGTCCTGGAGGCTGTAGGA 935
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 TTGCAAGAAGATTTGAATTTTGTCAGCCCAAGGATTGGAGAGGTCCTGGAGGCTGTAGGA 854
Query 936 CCCAGTATTTTTCTATCTGCAGATACGAGGAAGTTGAGAAATGAGGGATTTTTAAGCCCA 995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 CCCAGTATTTTTCTATCTGCAGATACGAGGAAGTTGAGAAATGAGGGATTTTTAAGCCCA 914
Query 996 TATCATCCTAGATTCCCAGATATACTTACAAATTCTGCTCATCCCATGAGAGCGCAAGAT 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 TATCATCCTAGATTCCCAGATATACTTACAAATTCTGCTCATCCCATGAGAGCGCAAGAT 974
Query 1056 CTTGCAAATGTTACTTCGTACCGAGAGTGGGTGCTTCTTGGATATCTCGTTTGCCCCGAC 1115
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 975 CTTGCGAATGTTACTTCGTACCGAGAATGGGTGCTTCTTGGATATCTCGTTTGCCCGGAC 1034
Query 1116 GAGCTTCTTCGTGTTACTAGCATTGATATCGCCCTGGTCGTGCTAAAGGAAAACTTAGTC 1175
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GAGCTTCTTCGTGTTACTAGCATTGATATCGCCCTGGTTGTGCTAAAGGAAAACTTAGTC 1094
Query 1176 GTGACGTTATTCCGGGATGAGGTGAGTTTATATCAAATGGTCTGCGAAAAAGAGTTTGGT 1235
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||
Sbjct 1095 GTGACGTTATTCCGGGATGAGGTGAGTTCATATCAAATTGTCAACGACAAAGAGTTTTGT 1154
Query 1236 ATTGGAATTAGTTTTGCATCAGCTGACTCTATTAATC-TAACTATGCAGTACATTCTGTT 1294
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||
Sbjct 1155 ATTGGAATTTGTTTTGCATCAGCTGACTCTATTAA-CTTGGCCATGCAGTACATTCTGTT 1213
Query 1295 GCACGAAGACTACCAGTTGTATGTTTTACCCCGAGTGTTAGAATCAAAGAAGATGGCTAA 1354
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1214 GCACGAAGACTACCAGTTGTATGTTTTACCCCGTGTGTTAGAATCAAAGAAGATGGCAAA 1273
Query 1355 GTCTGGACGGACTAAACAAAAGGAAGCTGATCTAGAATATAGTGTAGCAAAACAAGTTGA 1414
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1274 GTCTGGTCGGACTAAACAAAAGGAAGCTGATCTAGAATATAGTGTAGCAAAACAAGTTGA 1333
Query 1415 GAAAATGATCAGTGAGGTGCATGAGCAAGCATTGCAATTATGTGATACCATACACCGAGA 1474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334 GAAAATGATCAGTGAGGTGCATGAGCAAGCATTGCAATTATGTGATACCATACACCGAGA 1393
Query 1475 AAGGAGAATATTGCTGAAGCAGGAAATAGGGCGGATGGTTTTATTTTTCACTGATCAACC 1534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 AAGGAGAATATTGCTGAAGCAGGAAATAGGGCGGATGGTTTTATTTTTCACTGATCAACC 1453
Query 1535 AAGTTTGCTGGCTCCAAACATTCAGATGGTATTCTCTGCGTTGGCTTTGGCCCAATCTGA 1594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1454 AAGTTTGCTGGCTCCAAACATTCAGATGGTATTCTCTGCATTGGCTTTGGCCCAGTCTGA 1513
Query 1595 GGTTCTCTGGTATTTTCAACATGCTGGTATTGCATCCTCAAGATCCAAAGCTGCTCGAGT 1654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1514 GGTTCTCTGGTATTTTCAACATGCTGGTATTGCATCCTCAAGATCTAAAGCTGCTCGAGT 1573
Query 1655 GATACCAGTAGACATAGATCCAAATGATCCTACCATTGGCTTCCTGCTCGATGGAATGGA 1714
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574 GATACCAGTTGACATAGATCCAAATGATCCTACCATTGGCTTCCTGCTCGATGGAATGGA 1633
Query 1715 CCGTCTCTGCTGTTTAGTGCGCAAGTACATCTCAGCTGCTCGAGGTTATGCACTATCATA 1774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634 CCGTCTCTGCTGTTTAGTGCGCAAGTACATCTCAGCTGCTCGAGGTTATGCACTATCATA 1693
Query 1775 CCTTTCTTCATCTGCTGGAAGGATTCGTTACTTGATGGGTACTCCTGGAATTGTGGCTCT 1834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 CCTTTCTTCATCTGCTGGAAGGATTCGTTACTTGATGGGTACTCCTGGAATTGTGGCTCT 1753
Query 1835 GGACCTTGATCCTACCTTGAAAGGCCTTTTTCAGCGTATTGTGCAACATCTCGAAAGTAT 1894
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 1754 GGACCTTGATCCTACCTTGAAAGGCCTATTTCAGCGTATTGTTCAACATCTCGAAAATAT 1813
Query 1895 ACCCAAGGCGCAGGGAGAAAATGTTTCTGCAATCACATGTGACCTATCTGATTTCCGGAA 1954
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814 ACCCAAAGCGCAGGGAGAAAATGTTTCTGCAATCACATGTGACCTATCTGATTTCCGGAA 1873
Query 1955 AGATTGGTTGTCCATTTTGATGATTGTCACTTCTTCTCGATCATCGATAAACATCAGGCA 2014
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1874 AGATTGGTTGTCCATTTTAATGATTGTCACTTCTTCTCGATCATCGATAAACATCAGGCA 1933
Query 2015 TTTGGAAAAAGCCACTGTCTCTACTGGGAAGGAGGGCTTGCTATCGGAAGGAAATGCTGC 2074
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1934 TCTGGAAAAAGCCACTGTCTCTACTGGGAAGGAGGGCTTGCTATCGGAAGGAAATGCTGC 1993
Query 2075 ATATAACTGGTCCAGATGTGTTGATGAGTTAGAGTCTCAATTGTCAAAGCATGGAAGTCT 2134
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1994 ATATAACTGGTCCAGATGTGTTGATGAGTTAGAGTCTCAATTATCAAAGCATGGAAGTCT 2053
Query 2135 GAAGAAATTATATTTCTACCATCAACACCTCACAACTGTTTTCAGAAATACAATGTTTGG 2194
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054 GAAGAAATTATATTTCTATCATCAACACCTCACAACTGTTTTCAGAAATACAATGTTTGG 2113
Query 2195 ACCAGAAGGACGTCCTCAGCATTGTTGTGCATGGCTCAGTGTGGCTAGTAGTTTCCCGGA 2254
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2114 ACCAGAAGGACGTCCTCAACATTGTTGTGCATGGCTCAGTGTGGCTAGTAGTTTCCCGGA 2173
Query 2255 ATGTGCTTCACTAATAATTCCTGAGGAGGTTACCAAATTTGGGCGAGATGCTGTGCTTTA 2314
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2174 ATGTGCTTCACTTATAATTCCTGAGGAGGTTACCAAATTCGGGCGAGATGCAGTGCTTTA 2233
Query 2315 CGTCGAGTCTCTTATTGAATCAATAATGGGGGGACTGGAGGGCCTAATTAATATTCTTGA 2374
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2234 CGTCGAGTCTCTTATTGAATCAATAATGGGGGGACTGGAGGGCCTAATAAATATTCTTGA 2293
Query 2375 TTCAGAAGGCGGGTTTGGCGCTCTAGAATCTCAGCTTCTTCCAGAACAAGCTGCAGCGTA 2434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 TTCAGAAGGCGGGTTTGGCGCTCTAGAATCTCAGCTTCTTCCAGAACAAGCTGCAGCGTA 2353
Query 2435 TCTGAATAATGCATCAAGAATTTCTGC-TCCTTCAGTGAAATCCCCCAGGGTTGTAGGCG 2493
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 TCTGAATAATGCATCAAGAATTTCTGCCTC-TTCAGTGAAATCCCCCAGGGTTGTAGGCG 2412
Query 2494 GGTTTACTTTGCCTGGCCATGAGAGCTATCCTGAGAATAATAAGTCTATAAAGATGTTGG 2553
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2413 GGTTTACTTTGCCCGGCCATGAGAGCTATCCTGAGAATAATAAGTCTATTAAGATGTTGG 2472
Query 2554 AAGCTGCAATTCAAAGGTTGACTAATTTGTGTTCAATTCTGAACGACATGGAGCCTATTT 2613
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2473 AAGCTGCAATCCAAAGGTTGACTAATTTGTGTTCAATTCTGAACGACATGGAGCCTATCT 2532
Query 2614 GTGTTATAAACCACGTATTTGTTCTAAGAGAGTACATGAGAGAATGCATCCTTGGGAACT 2673
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2533 GTGTTATAAACCACGTATTTGTGCTAAGAGAGTACATGAGAGAATGCATCCTTGGGAATT 2592
Query 2674 TCAAGAGAAGATTTCTTACTGCTCTACAAACCGATAACGATCTCCAGCGGCCTTCTGTTT 2733
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2593 TCAAGAGAAGATTTCTTACTGCACTACAAACAGATAATGATCTTCAGCGGCCTTCTGTCT 2652
Query 2734 TGGAATCTCTTATCAGGCGGCATATGGGCATAGTTCACTTGGCAGAGCAGCACGTTAGCA 2793
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2653 TGGAATCTCTTATCAGGCGGCATATGAGCATAGTTCACTTGGCAGAGCAGCACGTTAGCA 2712
Query 2794 TGGACCTAACCCAAGGCATCAGAGAAATTTTACTCACAGAAGCCTTTTCAGGGCCTGTGT 2853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713 TGGACCTAACCCAAGGCATCAGAGAAATTTTACTCACAGAAGCCTTTTCAGGGCCTGTGT 2772
Query 2854 CATCTTTGCATACATTCGAAAAACCTGCTGAACAACAGCAAACCACTGGATCTGCAGTTG 2913
| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2773 CGTCTTTGCATACATTCGAAAAGCCTGGTGAACAACAGCAAAACACTGGATCTGCAGTTG 2832
Query 2914 AAGTTGTATGCAACTGGTACATGGACAATATCATCAAGGATGTGTCTGGCGCAGGAATCC 2973
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2833 AAGTTGTGTGCAACTGGTACATGGACAATATCATCAAGGATGTGTCTGGCGCAGGAATCC 2892
Query 2974 TCTTCGCTCCGAGGCACAAATACTTCAAAAGCACTAGACCAGTTGGAGGGTATTTTGCAG 3033
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2893 TCTTCGCTCCAAGGCACAAATACTTCAAAAGCACTAGACCAGTTGGAGGGTATTTTGCAG 2952
Query 3034 AGTCAGTCACCGACCTCAAGGAATTACAGGCGTTTGTTCGTATCTTCGGCGGCTATGGAG 3093
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2953 AGTCAGTCACCGACCTCAAGGAATTACAGGGGTTTGTTCGTATCTTCGGCGGCTATGGAG 3012
Query 3094 TTGACCGGCTGGATAGGATGATGAAAGTACATACAGCTGCCCTGGTAAACTGCATAGAAA 3153
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3013 TAGACCGGCTGGATAGGATGATGAAAGTACATACAGCTGCCCTGGTAAACTGCATAGAAA 3072
Query 3154 CTTCTCTGAGATCAAACCGGGAATTGATTGAAGCAGCTGCTGCAAGTATGCATTCTGGTG 3213
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3073 CATCTCTGAGATCAAACCGGGAATTGATTGAGGCAGCTGCTGCAAGTATGCATTCTGGTG 3132
Query 3214 ACAGAGTGGAGAGAGACGCATCTGTTAGGCAGATAGTTGATTTGGATACCGTAATAGGAT 3273
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3133 ACAGAGTAGAGAGAGACGCATCTGTTAGGCAGATAGTGGATTTGGATACCGTAATAGGAT 3192
Query 3274 TTTGTATTGAAGCTGGTCAAGCGTTGGCTTTTGATGACCTCCTCGCTGAAGCCTCTGGTG 3333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 3193 TTTGTATTGAAGCTGGTCAAGCGTTGGCTTTTGATGAGCTCCTCGCCGAAGCCTCTGGTG 3252
Query 3334 CTGTTCTTGAAGACAATGCATCCTTGATACACTCGATGATCTCTGGCATCGTTGAGCACA 3393
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3253 CTGTTCTTGAAGACAATGCATCCTTGATACACTCGATGATCTCTGGCATCGTTGAGCATA 3312
Query 3394 TACCTGAAGAAATACCTGAAAAGAAAGAAATCAGAAGGATCAAAGGCGTGGCAAATGGTG 3453
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3313 TACCTGAAGAAATACCTGAAAAGAAAGAAATCAGAAGGATCAAAGGCGTGGCAAATGGCG 3372
Query 3454 TTGGCGTAGCAGGTGATCACGACTCTGAATGGGTTAGATTAATCCTAGAAGAGGTAGGAG 3513
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3373 TTGGCGTAGCAGGAGATCACGACTCTGAATGGGTTAGATTAATCCTCGAAGAGGTAGGAG 3432
Query 3514 GTGCAAATGACAACTCATGGAGTTTGTTACCTTACTTTTTTGCCTCTTTCATGACCTCAA 3573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3433 GTGCAAATGACAACTCATGGAGTTTGTTACCTTACTTTTTTGCCTCTTTCATGACCTCAA 3492
Query 3574 ACGCCTGGAACACTACTGGCTTCAACATCGAGACTGGCGGATTCAGCAACAATATTCATT 3633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||
Sbjct 3493 ACGCCTGGAACACTACTGGCTTCAACATCGAGACTGGCGGATTCAGCAATAACATCCATT 3552
Query 3634 GCTTGGCTCGGTGTATTAGTGCTGTCATCGCTGGAAGTGAGTACGTAAGGTTACAACGTG 3693
||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 3553 GCTTGGCTCGGTGTATTAGCGCTGTCATTGCAGGAAGTGAGTACGTTAGGTTACAGCGTG 3612
Query 3694 AATACCAGCAGCAGCATCAGTCCCTCTCGAATGGTCATCACTCTAGTGAAAATCTCGACT 3753
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3613 AATACCAGCAGCAGCATCAATCCCTCTCCAATGGTCATCACTCTAGTGAAAATCTAGACT 3672
Query 3754 CAGAGTTTCCACCCCGTGTAACTGCTGAAGCAAGCATTAAATCCT-CAATGTTACTCTTT 3812
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3673 CAGAGTTTCAACCCCGTGTAACTGCTGAAGCAAGCATTAAATC-TGCAATGTTACTCTTT 3731
Query 3813 GTAAAATTCGCTGCATCGATCGTGCTAGATTCATGGAGCGAAGCCAACAGATCGCATCTC 3872
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 3732 GTAAAATTCGCTGCATCGATCGTGCTAGATTCATGGAGTGAAGCCAACAGATCTCATCTT 3791
Query 3873 GTGGCTAAGCTTATCTTCCTGGACCAACTCTGTGAGATCTCACCATACCTCCCTAGAAGC 3932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3792 GTGGCTAAGCTTATCTTCCTGGACCAACTCTGTGAGATCTCACCATACCTCCCAAGAAGC 3851
Query 3933 TCCCTCGAATCACATGTCCCGTACACCATCCTCAGGTCAATCTACACCCAATACTACTCC 3992
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3852 TCCCTTGAATCACATGTCCCGTACACCATCCTCAGGTCAATCTACACCCAATACTACTCC 3911
Query 3993 AACACACCTTCCACACCGCTCTCAACAGCATCCCCGTACCACTCCCCATCCGTATCGCTC 4052
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 3912 AACACACCGTCCACACCGCTCTCAACAGCATCCCCGTACCACTCTCCATCCGTATCACTC 3971
Query 4053 ATCCACGCTTCTCCCTCCATGAAAAACTCCACCACTCCCCAGCGTGGTAGTGGTAGCGGC 4112
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3972 ATCCACGCTTCTCCATCCATGAAAAACTCCACCACTCCCCAGCGTGGTAGTGGTAGCGGC 4031
Query 4113 AGTAGCTCTACAGCTGCCCCTGATTCAGGCTACTTCAAAGGCTCATCATCTTCACTATAC 4172
|||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4032 AGTAGCTCCGCAGCTGCCCCAGATTCAGGGTACTTCAAAGGCTCATCATCTTCACTCTAC 4091
Query 4173 GGTCAGGAACACTACACCGAATCCGAAACTGGAAACTCAAGAAACAATGAGaacaacaac 4232
||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4092 AGTCAGGAACACTACAACGAACCCGAAACTGGAATCTCAAGAAACAATGAGAACAACAAC 4151
Query 4233 aacaacaaacaaAGGGGAAGTTCTCGTCGTTCCGGACCATTGGATTACAGCTCGAGCCAT 4292
||||| | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4152 AACAA-A--CAAAGGGGGAGCTCCCGTCGTTCTGGACCATTGGATTACAGCTCGAGCCAT 4208
Query 4293 AAAGGAGGGTCAGGATCAAACAGCACAGGTCCTAGTCCTCTTCCTAGGTTTGCTGTCTCA 4352
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 4209 AAAGGAGGGTCAGGATCAAACAGCACAGGTCCTAGTCCACTTCCCAGGTTTGCTGTCTCA 4268
Query 4353 AGATCTGGTCCCATCTCATATAAACAGCATAACTAAGTAACAACA 4397
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4269 AGATCTGGTCCCATCTCATATAAGCAGCATAACTAAGTAACAACA 4313
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 175673756968
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5