BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G35630.1
Length=6332
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg482523 jgi|Araly1|482523|fgenesh2_kg.4__1583__AT2G35630.1 1.054e+04 0.0
Ahg949200 jgi|Araly1|949200|scaffold_801087.1 254 8e-66
Ahg949134 jgi|Araly1|949134|scaffold_801021.1 95.3 5e-18
Ahg933703 jgi|Araly1|933703|scaffold_401691.1 91.6 6e-17
Ahg339096 jgi|Araly1|339096|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001195 86.1 3e-15
> Ahg482523 jgi|Araly1|482523|fgenesh2_kg.4__1583__AT2G35630.1
Length=6294
Score = 1.054e+04 bits (5708), Expect = 0.0
Identities = 6032/6188 (97%), Gaps = 24/6188 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 tctctctctctctctTGCCGGCACT---AACAACACGAAGAAAtttttttGAAAAGAGAG 60
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCTCTCTCTCTCTCTTGCCGGCACTAACAACAACACGAAGAAATTTTTTTGAAAAGAGAG 60
Query 61 AGAAAGTTTCCAAGAGA-CCGTAC---G--AAGaaaaaaaaaaCTTGGTATAGATCGATA 114
||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AGAAAGTTTCCAAGAGACCCGTACGAAGAAAAGAAAAAAAAAACTTGGTATAGATCGATA 120
Query 115 AGATCGATACCGTCGGAGAGATAATTTCGTGGAGTAATGTCGACGGAGGATGAGAAGTTA 174
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 121 AGATCGATAACGTCGGAGAGATAATTTCGTGGCGTAATGTCGGCGGAGGACGAGAAGTTA 180
Query 175 TTGAAGGAGGCGAAAAAACTTCCTTGGGAGGATCGGCTTGGGCATAAGAATTGGAAAGTT 234
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTGAAGGAGGCGAAGAAACTTCCTTGGGAGGATCGGCTTGGGCATAAGAATTGGAAAGTT 240
Query 235 AGGAACGAAGCTAACGTCGATTTAGCTTCTGTTTTTGATTCGATTACTGATCCTAAGGAC 294
|||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AGGAACGAGGCTAACGTCGATTTAGCTTCTCTTTTTGATTCGATTACTGATCCTAAGGAC 300
Query 295 CCTCGTCTTCGCGATTTTGGTCACTTGTTTAGGAAGACGGTGGCAGATTCTAATGCGCCG 354
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 301 CCTCGTCTTCGCGATTTTGGTCACTTGTTTAGGAAGACGGTGGCGGATTCTAATGCGCCG 360
Query 355 GTGCAAGAGAAAGCGCTTGATGCATTGATTGCGTTTTTGCGAGCAGCCGATTCAGATGCT 414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 361 GTGCAAGAGAAAGCGCTTGATGCATTGATTGCGTTTTTGCGAGCAGCTGACTCAGATGCT 420
Query 415 GGAAGGTATGCAAAGGAAGTTTGCGATGCTATTGC-GCTCAAATGCCTTACGGGTCGGAA 473
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||
Sbjct 421 GGAAGGTATGCAAAGGAAGTTTGCGATGCTATTTCTGCT-AAATGTCTCACGGGTCGGAA 479
Query 474 GAATACTGTGGACAAGGCGCAGGCTGCTTTCTTGCTTTGGGTAGAATTAGAGGCCGTCGA 533
||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 480 GAATACTGTCGATAAGGCGCAAGCTGCTTTCTTACTTTGGGTAGAATTAGAGGCGGTCGA 539
Query 534 TGTTTTTCTGGATACGATGGAGAAAGCTATAAAGAATAAAGTTGCAAAGGCTGTGGTACC 593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TGTTTTTCTGGATACGATGGAGAAAGCTATAAAGAATAAAGTTGCAAAGGCTGTGGTACC 599
Query 594 TGCAGTAGACGTTATGTTTCAAGCTCTAAGTGAATTTGGATCAAAAGTTATTCCACCTAA 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 600 TGCAGTAGACGTTATGTTTCAAGCTCTAAGTGAATTTGGATCAAAGGTTATTCCACCCAA 659
Query 654 AAGGATTTTAAAGATGCTTCCTGAACTTTTCGACCATCAAGATCAGAATGTCCGTGCATC 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 AAGGATTTTAAAGATGCTTCCTGAACTTTTCGACCATCAAGATCAGAATGTCCGTGCATC 719
Query 714 TGCCAAAGGAGTGACTCTTGAGCTATGCCGTTGGATTGGAAAAGACCCTGTAAAGTCTAT 773
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TGCTAAAGGGGTGACTCTTGAGCTATGCCGTTGGATTGGAAAAGACCCTGTAAAGTCTAT 779
Query 774 ATTGTTTGAAAAAATGAGGGATACGATGAAAAAAGAGCTGGAGGCTGAGCTTGCCAATGT 833
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 ATTGTTTGAGAAAATGAGGGATACGATGAAAAAAGAGCTGGAGGCTGAGCTTGCCAATGT 839
Query 834 TACAGCGGGTGCCAAGCCTACTCGAAAGATAAGATCTGAGCAAGACAAGGAACCAGAGGC 893
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 840 TTCAGGGGGTGCCAAGCCTACTCGAAAGATAAGATCTGAGCAAGACAAGGAGCCAGAGGC 899
Query 894 AGAAGCTAGTTCTGATGTTGTGGGTGATGGGCCCAGTGAAGAAGCTGTTGCTGACGCGCC 953
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 900 AGAAGCTAGTTCTGATGTTGTGGGTGATGGGCCCAGTGAAGAAGCTGTTGCTGATGCGCC 959
Query 954 TCAAGAAATAGATGAGTATGATCTTATGGATCCTGTGGACATTTTGACACCTTTGGAGAA 1013
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 960 TCAGGAAATAGATGAGTATGATCTTATGGATCCTGTGGACATTTTGACTCCTTTGGAGAA 1019
Query 1014 GTCTGGGTTCTGGGACGGAGTGAAAGCTACAAAGTGGTCCGAACGTAAAGAAGCTGTTGC 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1020 GTCTGGGTTCTGGGACGGAGTGAAAGCTACAAAGTGGTCAGAGCGTAAAGAAGCTGTTGC 1079
Query 1074 AGAGCTAACAAAGCTTGCTTCGACTAAAAAGATAGCTCCTGGTGATTTTTCAGAAATTTG 1133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AGAGCTAACAAAGCTTGCTTCGACTAAAAAGATAGCTCCTGGTGATTTTTCAGAAATTTG 1139
Query 1134 TCGGACTTTAAAGAAGCTTATCACGGATGTGAACTTGGCCGTTGCAGTTGAAGCTATTCA 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 TCGGACTTTAAAGAAGCTTATCACGGATGTGAACTTGGCCGTTGCAGTTGAAGCTATTCA 1199
Query 1194 AGCCATTGGAAATCTTGCATGTGGTTTAAGAACACATTTCTCTGCTAGTTCACGGTTTAT 1253
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 AGCTATTGGAAATCTTGCATGTGGTTTAAGAACACATTTCTCTGCTAGTTCACGGTTTAT 1259
Query 1254 GCTGCCTGTTTTACTTGAAAAATTGAAAGAGAAAAAGCAATCAGTCACAGACCCACTTAC 1313
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 1260 GCTGCCTGTTTTACTTGAAAAATTGAAAGAGAAAAAGCCATCAGTCACAGAACCACTTAC 1319
Query 1314 ACAAACGCTACAAACAATGTACAAAGCCGGGTGTTTGAATCTTGTTGACGTTATAGAAGA 1373
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 ACAAACGCTACAAACTATGTACAAAGCTGGGTGTTTGAATCTTGTTGACGTTATAGAAGA 1379
Query 1374 TGTGAAGACAGCAGTGAAAAACAAAGTTCCACTTGTGCGTTCTTCAACTTTGACCTGGTT 1433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TGTGAAGACAGCAGTGAAAAACAAAGTTCCACTTGTGCGTTCTTCAACTTTGACCTGGTT 1439
Query 1434 GACATTCTGCCTTGAAACAAGTAACAAAGCTCTTATTCTAAAGGCTCACAAAGAATATGT 1493
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1440 GACATTCTGCCTTGAAACAAGTAACAAGGCTCTTATTCTAAAGGCGCACAAAGAATATGT 1499
Query 1494 CCCTTTATGTATGGAGTGTCTCAACGATGGAACTCCTGATGTGAGGGATGCAGCATTTTC 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 CCCTTTATGTATGGAGTGTCTCAACGATGGAACTCCTGATGTGAGGGATGCAGCATTTTC 1559
Query 1554 GGCTTTGGCTGCAATAGCTAAGTCTGTAGGTATGAGACCTTTGGAAAGGTCGTTGGAAAA 1613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 GGCTTTGGCTGCAATAGCTAAGTCTGTAGGTATGAGACCTTTGGAAAGGTCGTTGGAAAA 1619
Query 1614 ACTTGATGATGTTAGAAAAAAGAAACTTTCAGAAATGATTGCAGGCTCTGGTGGTGGTGA 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 ACTTGATGATGTTAGAAAAAAGAAACTTTCAGAAATGATTGCAGGCTCTGGTGGTGGTGA 1679
Query 1674 CCAAGCTGGTACAAGCTCAGTGACAGTTCAGTCTTCAGTTGGGAGCACAGCCACAGGGAA 1733
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1680 CCAAGCTGGTACAAGCTCAGTGACAGTTCAGTCTTCAGTTGGGAGCACGGCCACAGGGAA 1739
Query 1734 CTCAGACGCTTCCTTTGTAAGGAAATCAGCTGCAAGCATGTTGAGCGGCAAAAGACCCGC 1793
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 CTCAGAAGCTTCCTTTGTAAGGAAATCAGCAGCAAGCATGTTGAGCGGCAAAAGACCCGC 1799
Query 1794 TCCTTCGGCTCAGGCGAGCAAGAAGGTTGGGACTGGCAAACCGGGTGGAGGCAAAAAAGA 1853
|||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 TCCTTCTGCTCCTGCGAGCAAGAAGGTGGGGACTGGAAAACCGGGTGGAGGCAAAAAAGA 1859
Query 1854 TGGATCTGTAAGGAATGAAGGTTCAAAATCTGTTGAACCACCTGAAGATGTCGAGCCTGC 1913
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 TGGATCTGTAAGGAATGAAGGTCCAAAATCTGTTGAACCACCTGAAGATGTCGAGCCTGC 1919
Query 1914 CGAGATGGGTCTTGAAGAGATTGAAAACAGATTAGGTTCTCTTGTGAAACCAGAAACTGT 1973
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1920 CGAGATGGGTCTTGAAGAGATTGAAAACAGATTAGGTTCTCTTGTGAAACCAGAAACTAT 1979
Query 1974 ATCTCAGTTAAAGAGCTCTGTTTGGAAAGAAAGACTTGAAGCAACTTTGGCTTTGAAAGA 2033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 ATCTCAGTTAAAGAGCTCTGTTTGGAAAGAAAGACTTGAAGCAACTTTGGCTTTGAAAGA 2039
Query 2034 AGAGATAGAAGGTCTACAAGAACTAGACAAGTCGGTGGAAATCTTGGTCCGGTTGCTGTG 2093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2040 AGAGATAGAAGGTCTACAAGAACTAGACAAGTCGGTGGAAATCTTGGTCCGGTTGTTGTG 2099
Query 2094 TGCTGTTCCTGGTTGGAATGAGAAAAATGTGCAGGTTCAGCAACAGGTCATTGAAATCAT 2153
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 TGCAGTTCCTGGTTGGAATGAGAAAAATGTGCAGGTTCAGCAACAGGTCATTGAAATCAT 2159
Query 2154 CACTTATATATCTTCGACTGCAGCGAAGTTTCCTAAGAAATGTGTCGTACTTTGTATTAC 2213
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 CACTTACATATCTTCGACTGCAGCGAAGTTTCCTAAGAAATGTGTCGTACTTTGTATTAC 2219
Query 2214 CGGCACTAGTGAACGAGTTGCAGATATAAAAACAAGAGCCTCTGCTATGAAGTGCCTTAC 2273
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GGGCACTAGTGAACGAGTTGCAGATATAAAAACAAGAGCCTCTGCTATGAAGTGCCTTAC 2279
Query 2274 TGCTTTCTGTGAAGCAGTTGGTCCTGGATTTGTTTTCGAGAGGCTTTTCAAAATCATGAA 2333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TGCTTTCTGTGAAGCAGTTGGTCCTGGATTTGTTTTCGAGAGGCTTTTCAAAATCATGAA 2339
Query 2334 AGAGCACAAGAATCCCAAGGTTCTTAGTGAAGGCTTGTTATGGATGGTTTCGGCAGTTGA 2393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 AGAGCACAAGAATCCCAAGGTTCTTAGTGAAGGCTTGTTATGGATGGTTTCGGCAGTTGA 2399
Query 2394 TGACTTTGGTGTCTCACTTTTGAAACTTAAGGATTTGATAGATTTTTGTAAGGATGTTGG 2453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 TGACTTTGGTGTCTCACTTTTGAAACTTAAGGATTTGATAGATTTTTGTAAGGATGTTGG 2459
Query 2454 GCTGCAATCTAGTACAGCTGCCACCAGAAATGCTACAATTAAACTCTTGGGTGCTTTACA 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 GCTGCAATCTAGTACAGCTGCCACCAGAAATGCTACAATTAAACTCTTGGGTGCTTTACA 2519
Query 2514 CAAGTTTGTTGGTCCAGACATTAAAGGGTTTCTTAATGATGTCAAACCTGCACTACTAAG 2573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2520 CAAGTTTGTTGGTCCAGACATTAAAGGGTTTCTTAATGATGTCAAACCTGCGCTACTAAG 2579
Query 2574 TGCACTTGACACCGAATATGAGAAAAACCCTTTCGAGGGGACTGCGGCTCCAAAGAGAGT 2633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 TGCACTTGACACCGAATATGAGAAAAACCCTTTCGAGGGGACTGCGGCTCCAAAGAGAGT 2639
Query 2634 TGTTAAGACGTCAGTTTCAACATCAACATCTTCTGGAGGGTTGGATAGCTTACCTAGAGA 2693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 TGTTAAGACGTCAGTTTCAACATCAACATCTTCTGGAGGGTTGGATAGCTTACCTAGAGA 2699
Query 2694 AGATATCAGTACCAAGATTACACCTAATCTCCTTAAGGGCTTTGAGAGTCCTGATTGGAA 2753
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 AGATATCAGTAGCAAGATTACACCGAATCTCCTTAAGGGCTTTGAGAGTCCTGATTGGAA 2759
Query 2754 GATGCGTTTGGAGTCAATTGAAGCTGTCAATAAAATTCTGGAAGAGGCTAATAAACGTAT 2813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2760 GATGCGTTTGGAGTCAATTGAAGCTGTCAATAAAATTCTGGAAGAAGCTAATAAACGTAT 2819
Query 2814 CCAACCAACTGGAACTGGAGAATTATTTGGTGGTCTTCGAGGACGTCTGTTGGATAGTAA 2873
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 CCAACCAACTGGAACTGGAGAATTATTTGGTGGTCTACGAGGACGTCTGTTGGATAGTAA 2879
Query 2874 CAAAAATCTTGTTATGCAAACATTGACTACTATTGGAGGTGTTGCAGCAGCTATGGGACC 2933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 CAAAAATCTTGTTATGCAAACATTGACTACTATTGGAGGTGTTGCAGCAGCTATGGGACC 2939
Query 2934 AGCTGTCGAGAAGGCGAGCAAGGGAATTCTGTCTGATGTTCTGAAATGCCTCGGTGACAA 2993
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2940 AGCTGTCGAGAAGGCGAGCAAGGGAATTCTATCTGATGTTCTGAAATGTCTCGGTGACAA 2999
Query 2994 CAAGAAGCACATGAGAGAGTGTACCTTGGCTGCTCTTGACTTGTGGCTTGGTGCTGTGCA 3053
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 CAAGAAGCACATGAGAGAATGCACCTTGGCTGCTCTTGATTTGTGGCTTGGTGCTGTGCA 3059
Query 3054 TCTTGACAAAATGATTCCTTACATTATAATAGCCCTAACAGATGGGAAAATGGGAGCAGA 3113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3060 TCTTGACAAAATGATTCCTTACATTATAATAGCCCTAACAGATGGGAAAATGGGAGCAGA 3119
Query 3114 AGGTCGTAAAGATCTTTTTGATTGGTTGACAAAACAACTTACTGGATTAAGTGACTTTGT 3173
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 AGGGCGTAAAGATCTTTTTGATTGGTTGACAAAACAGCTTACTGGATTAAGTGACTTTGT 3179
Query 3174 GGATGCCATACATTTACTAAAACCTGCGAGCACTGCAATGACGGACAAATCAGCAGATGT 3233
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 GGATGCCATACATTTACTAAAACCTGCAAGCACTGCAATGACGGACAAATCAGCAGATGT 3239
Query 3234 GAGAAAAGCAGCCGAAGGATGCATTTCTGAGATCTTGAGAGTCAGTGGACAAGAAATGAT 3293
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3240 GCGAAAAGCAGCCGAAGGATGCATTTCTGAGATCTTGAGAGTCAGTGGACAAGAAACGAT 3299
Query 3294 TGAAAAGAATCTTAAAGATATCCAAGGCCCAGCATTAGCTCTTGTGCTTGAAAAAGTAAG 3353
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3300 TGAAAAGAATCTTAAAGATATCCACGGCCCAGCATTAGCTCTTGTGCTTGAAAAAGTAAG 3359
Query 3354 ACCAGGATTCGTTCAAGAACCATTTGAATCATCAAAAGCTATGGCGGGGCCAGTGTCAAA 3413
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 ACCAGGATTTGTTCAAGAACCATTTGAATCATCAAAAGCTATGGCGGGGCCAGTGTCAAA 3419
Query 3414 AGGTGTTACAAAGATTTCAAAATCAACTTCTAATGGTACCTTAAAGCAAGGAAACAGATC 3473
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 AGGTGTTTCAAAGATTTCAAAATCAACTTCTAATGGTACCTTAAAGCAAGGAAACAGATC 3479
Query 3474 AAGAGCCGTACCAACAAAGGGCTCAAGTCAAATTACGTCTGTCCATGATATAGCTATCCA 3533
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 AAGAGCCGTACCAACAAAGGGC--A-GTCAAATTACGTCTGTCCATGATATAGCTATCCA 3536
Query 3534 GTCACAGGCTTTGCTAAATACTAAGGACTCCAATAAGGAGGACAGGGAGAGGGTGGTGGT 3593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3537 GTCACAGGCTTTGCTAAATACTAAGGACTCCAATAAGGAGGACAGGGAGAGGGTGGTGGT 3596
Query 3594 TCGTAGAATTAAATTTGAGGAGCTGCGACCAGAACAGATTCAGGATCTTGAGAATGATAT 3653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3597 TCGTAGAATTAAATTTGAGGAGCTGCGACCAGAACAGATTCAGGATCTTGAGAATGATAT 3656
Query 3654 GATGAAATTTTTTAGGGAAGACTTGCAAAAACGGTTGTTGAGTCCCGACTTCAAGAAACA 3713
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3657 GATGAAATTTTTTAGGGAAGACTTGCAAAAACGATTGTTGAGTCCCGACTTCAAGAAACA 3716
Query 3714 AGTAGATGGGCTGGAAATCCTACAGAAGGCACTTCCATCTGTTTCGAAGGAAATTATAGA 3773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3717 AGTAGATGGGCTGGAAATCCTACAGAAGGCACTTCCATCTGTTTCGAAGGATATTATAGA 3776
Query 3774 AGTATTAGATGTACTTCTCAGGTGGTTTGTGTTGCAATTCTGTAAATCCAACACAACCTG 3833
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3777 AGTATTAGATATACTTCTCAGGTGGTTTGTGTTACAATTCTGTAAATCCAACACAACCTG 3836
Query 3834 TCTGCTAAAGGTGCTTGAGTTTCTTCCAGAACTTTTCAACACATTGAGGGATGAGGAATA 3893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3837 TCTGCTAAAGGTGCTTGAGTTTCTTCCAGAACTTTTCAACACATTGAGGGATGAGGAATA 3896
Query 3894 CTGCATGACGGAAGCAGAAGCTGCAATATTTCTGCCTTGTTTAGCGGAGAAGTTGGGGCA 3953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3897 CTGCATGACGGAAGCAGAAGCTGCAATATTTCTGCCTTGTTTAGCGGAGAAGTTGGGGCA 3956
Query 3954 TAACATTGAAAAAGTAAGAGAAAAAATGCGGGAGCTGATGAAGCAGATCATTCAGGCATA 4013
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||
Sbjct 3957 TAACATTGAAAAAGTAAGAGAAAAAATGCGGGAGCTGATGAAGCAGATTATCCAAGCTTA 4016
Query 4014 TTCTGTAGGAAAGACGTATCCCTATATTTTGGAAGGTTTACGTTCCAAAAACAACCGGAC 4073
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4017 TTCTGTAGCAAAGACGTATCCCTATATTTTGGAAGGTTTACGTTCCAAAAACAACCGGAC 4076
Query 4074 GAGGATAGAGTGTACTGATCTCATAGGATATCTACTCGAGACTTGTGGAACTGAGATAGG 4133
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4077 AAGGATAGAGTGTACTGATCTCATAGGATATCTACTCGAGACTTGTGGAACTGAGATAGG 4136
Query 4134 TGGACTACTTAAATACTTAAATATCGTTGCAAGCTTGACAGCAGAAAGAGATGGTGAACT 4193
||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4137 TGGACTACTGAAATACTTGAATATGGTTGCAAGCTTGACGGCAGAAAGAGATGGTGAACT 4196
Query 4194 CAGGAAAGCTGCTTTGAACACCATGGCTACTGGTTATCAGATTCTTGGTGCTGACATCTG 4253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 4197 CAGGAAAGCTGCTTTGAACACCATGGCTACTGGTTATAAGATTCTTGGTGATGACATCTG 4256
Query 4254 GAAATATGTTGGGAAGCTTACAGATGCTCAAAAGAGTATGATTGATGATAGATTTAAGTG 4313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4257 GAAATATGTTGGGAAGCTTACAGATGCTCAAAAGAGTATGATTGATGATAGATTTAAGTG 4316
Query 4314 GAAAGCCAAGGATATGGAGAAAAGAAGAGAAGGGAAACCTGGGGAGGCACGAGCAGCATT 4373
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4317 GAAAGTCAAGGAAATGGAGAAAAGAAGAGAAGGGAAACCTGGGGAGGCACGAGCAGCATT 4376
Query 4374 AAGGCGTTCTGTTAGAGATAGCGGACCTGAGGTGGCAGAGCAAAGTGGTGACATTTCTCA 4433
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4377 AAGGCGTTCTGTTAGAGATAATGGACCTGAAGTGGCAGAGCAAAGTGGTGACCTTTCTCA 4436
Query 4434 AACAGTCCCTGGTCCTTTATTTCCAAGGCAAAGCTATGGTATTTCCGAACAAATGCTGGA 4493
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4437 AATAGTCCCTGGTCCTTTATTTCCAAGGCAAAGCTATGGTATTTCCGAACAAATTCTGGA 4496
Query 4494 GAGGACCCCGGTACCTCGGACAATTGCTGGAGTTAATGGCCCTACAGACTGGAATGAGGC 4553
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4497 GAGGAACCCGGTACCTCGGACAATTGCTGGAGTTAATGGCCCTACAGACTGGAATGAGGC 4556
Query 4554 TTTAGACATCATTATGTTTGGTTCTCCAGAGCAGTCCGTTGAAGGGATGAAAGTTGTGTG 4613
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4557 TTTGGACATCATTATGTTTGGTTCTCCAGAGCAGTCGGTTGAAGGGATGAAAGTTGTGTG 4616
Query 4614 TCATGAGTTGGCACAGGCTTCTAATGATCCTGAAGAGAGTGCAATTGATGAACTTGTGAA 4673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4617 TCATGAGTTGGCACAGGCTTCTAATGATCCTGAAGAGAGTGCAATTGATGAACTTGTGAA 4676
Query 4674 GGATGCAGATGGGCTTGTTTCATGCTTAGCAAATAAGGTTGCCAAAACATTTGATGTTAG 4733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4677 GGATGCAGATGGGCTTGTTTCATGCTTAGCAAATAAGGTTGCCAAAACATTTGATGTTAG 4736
Query 4734 CTTGATGGGAGCTTCATCGAGGTCGTGTAAATATGTTTTGAACACACTTATGCAGACATT 4793
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4737 CTTAATGGGAGCTTCATCGAGGTCGTGTAAATATGTTTTGAACACACTTATGCAGACATT 4796
Query 4794 CCAAAATAAAAAGCTTGCCCATGCAGTCAAAGAAGGGACTCTTGAAAGCCTTATAACAGA 4853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4797 CCAAAATAAAAAGCTTGCCCATGCAGTCAAAGAAGGGACTCTTGAAAGCCTTATAACTGA 4856
Query 4854 GCTCTTGCTTTGGCTTCTGGATGAAAGAGTTCCACGCATGGAAGATGGGAGTCAACTTCT 4913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 4857 GCTCTTGCTTTGGCTTCTGGATGAAAGAGTTCCACGCATGGAAGATGGGAGCCAACTGCT 4916
Query 4914 TAAAGCTCTGAATGTTTTGATGCTTAAGATCCTGGATAATGCAGATCGGACATCTTCGTT 4973
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4917 AAAAGCTCTGAATGTTTTGATGCTTAAGATCCTGGATAATGCAGATCGGACATCTTCGTT 4976
Query 4974 TGTGGTGCTTATTAGCTTGCTACGTCCTCTAGATCCATCTAGATGGCCTTCACCTGCTAC 5033
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4977 TGTGGTCCTTATTAGCTTGCTACGTCCTCTAGATCCATCTAGATGGCCTTCACCTGCTAC 5036
Query 5034 GGCTGAAGTTTATGCTGTCCGGAATCAGAAATTCTCTGATTTGGTAGTTAAATGCCTTAT 5093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5037 GGCTGAAGTTTATGCTGTCCGGAATCAGAAATTCTCTGATTTGGTAGTTAAATGCCTTAT 5096
Query 5094 TAAACTTACAAAGCTCCTCCAAAGCACCATATATGAAGTTGATCTTGATAGACTTCTTCA 5153
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5097 TAAGCTTACAAAGCTCCTCCAAAGCACCATATATGAAGTTGATCTTGATAGACTTCTTCA 5156
Query 5154 GAGTATCCATGTATATCTGCAAGATCTGGGAATGGAAGAGATACGTAGGAGAGCTGGGGC 5213
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5157 GAGTATCCATGTATATCTGCAAGAGCTGGGAATGGAAGAGATACGTAGGAGAGCTGGGGC 5216
Query 5214 AGATGATAAACCTCTGAGGATGGTGAAAACTGTTCTACATGAACTTGTTAAGCTCCGCGG 5273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5217 AGATGATAAACCTCTGAGGATGGTGAAAACTGTTCTACATGAACTTGTTAAGCTCCGGGG 5276
Query 5274 AGCCGCAATTAAGGGCCACTTGTCTCTTGTCCCTATTGACATGAGGCCACAACCCATCAT 5333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5277 AGCCGCAATTAAGGGCCACTTGTCTCTTGTCCCTATTGACATGAGGCCACAACCCATCAT 5336
Query 5334 TCTCGCTTACATCGATCTAAACCTTGAGACTTTAGCTGCAGCAAGAATGTTAACTGCAAC 5393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5337 TCTCGCTTACATCGATCTAAACCTTGAGACTTTAGCTGCAGCAAGAATGTTAACTGCAAC 5396
Query 5394 AGGTCCTGTGGGCCAAACCCATTGGACAGATTCAACAGCCAACAATCCTTCACCTCCTGC 5453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5397 AGGTCCTGTGGGCCAAACCCATTGGACAGATTCAACAGCCAACAATCCTTCACCTCCCGC 5456
Query 5454 AAATTCTGCCGATGTTCAGTTGAAGCAAGAGCTTGGGGCTATTTTTAAGAAAATAGGTGA 5513
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 5457 AAATTCTGCTGATGTTCAGTTGAAGCAAGAGCTTGGGGCAATATTTAAGAAAATAGGTGA 5516
Query 5514 CAAACAAACTTCCACAATTGGTCTTTACGACCTCTACCACATCACAAAGTCATATCCAAA 5573
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 5517 CAAACAAACTTCCACAATAGGTCTTTACGACCTCTACCACATCACTAAGTCCTATCCAAA 5576
Query 5574 GGTTGATATATTTTCCCAACTTCAAAATGCTAGTGAAGCGTTTCGTACTTACATCAGAGA 5633
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5577 GGTTGATATTTTTTCCCAACTTCAAAATGCTAGCGAAGCGTTTCGTACTTACATCAGAGA 5636
Query 5634 TGGTCTGGCACAGGTTGAGAAGAATGCAGCTGCGGGAAGAACACCTTCAAGCCTACCGTT 5693
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5637 CGGTCTGGCCCAGGTTGAGAAGAATGCAGCTGCGGGAAGAACGCCTTCAAGCCTACCGTT 5696
Query 5694 GTCAACTCCTCCCCCTTCGTCCTTAGCTCTTCCATCTCCTGATATTCCTTCCTTGTCCTC 5753
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5697 GTCAACTCCTCCCCCTTCTTCCTTAGCTCTTCCATCTCCTGATATTCCTTCCTTGTCCTA 5756
Query 5754 TTTAGATGTGAAGCCTTTGATGAACCCTAGATCTGATTTATACACAGACGACATCCGAGC 5813
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||
Sbjct 5757 TTTAGATGTGAAGCCTCTGATGAACCCTAGATCTGATTTATATACCGATGACATCCGAGC 5816
Query 5814 CAGTAACATGAATCCTGGAGTGATGACAGGGACGCTAGATGCAATCAGAGAAAGGATGAA 5873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5817 CAGTAACATGAATCCTGGAGTGATGACAGGGACGCTAGATGCAATCAGAGAAAGGATGAA 5876
Query 5874 GAACATGCAACTGGCTTCATCAG-A------G--CCAGTAAGCAAACCGCTGATGCCAAC 5924
||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5877 GAACATGCAACTGGCTTCATCAGGAACCCTAGAACCAGTAAGCAAACAGCTGATGCCAAC 5936
Query 5925 AAACGATAACTTATCAATGAACCAACAGAGCGTTCCCCCGAGCCAAATGGGACAAGAGAC 5984
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5937 AAACGATAACTTATCAATGAACCAACAGAGCGTTCCCCAGAGCCAAATGGGACAAGAGAC 5996
Query 5985 AGTCCACACACACCCAGTGGTTCTCCCAATGGATGAGAAAGCATTGTCCGGTCTTCAAGC 6044
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5997 ACCCCACACACACCCGGTGGTTCTCCCAATGGATGAGAAAGCATTGTCTGGTCTTCAAGC 6056
Query 6045 CCGAATGGAGAGGCTCAAAGGTGGATCACTGGAACATATGTAGAACTAGAGACCCCAAGC 6104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6057 CCGAATGGAGAGGCTCAAAGGTGGATCACTGGAACATATGTAGAACTAGAGACCCCAAGC 6116
Query 6105 TTTGGAGTCTGAAGTTACATAAGCAAATTCGCCATTTTTGTTACTTCTCTCCAATTAATG 6164
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6117 TTTGGAGTCTAAAGTTACATA-GCAAATTCGCCATTTTTGTTACTTCTCTCCAATTAATG 6175
Query 6165 TAGTAGTA 6172
|||| |||
Sbjct 6176 TAGTGGTA 6183
Score = 75.0 bits (40), Expect = 6e-12
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6229 GCGGCTAGATTTCAATGGAGTTAGTGTGTATAGTGGTGGGAGA 6271
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6225 GCGGCTAGATTTCCATGGAGTTAGTGTGTATAGTGGTGGGAGA 6267
> Ahg949200 jgi|Araly1|949200|scaffold_801087.1
Length=1425
Score = 254 bits (137), Expect = 8e-66
Identities = 261/318 (82%), Gaps = 20/318 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 2140 GTCATTGAAATCATCACTTATATATCTTCGACTGCAGCGAAGTTTCCTAAGAAATGTG-T 2198
||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| |
Sbjct 654 GTCATTGGAATCATTACTCACATATCTTGGACTGCGGCTAAGTTTCCTATGAAATGTGAT 713
Query 2199 CGTACTTTGTATTACCGGCACTAGTGAACGAGTTGCAGATATAAAAACAAGAGCCTCTGC 2258
||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||
Sbjct 714 -GTACTTTCCATTACAGGCACTAATGAACAAGTTGTAGATATAAAGACACGATCCTCTGC 772
Query 2259 TATGAAGT-GCCTTACTGCTTTCTGTGAAGCAGTTGGTCCTGGATTTG-T-T-------T 2308
|||||||| ||| |||||| |||| ||| || |||||||| ||||| | | |
Sbjct 773 TATGAAGTGGCC-TACTGCATTCTACGAATCATTTGGTCCTAAATTTGATATCAAGAAGT 831
Query 2309 T-CGAG--AG---GCTTTTCAAAATCATGAAAGAGCACAAGAATCCCAAGGTTCTTAGTG 2362
| || | | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 TCCGTGTTGGTTCGCTTTTAAAAAACATGAAGGAGCACAAGAATCCCAAGGTTCTTAGTG 891
Query 2363 AAGGCTTGTTATGGATGGTTTCGGCAGTTGATGACTTTGGTGTCTCACTTTTGAAACTTA 2422
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||
Sbjct 892 AAGGCTTGTTATGGATGGTTTCAGCAGTTGATGACTGTGGTGCCTCACTTTTGAATTTTA 951
Query 2423 AGGATTTGATAGATTTTT 2440
| | ||||| || |||||
Sbjct 952 AAGTTTTGA-AGTTTTTT 968
> Ahg949134 jgi|Araly1|949134|scaffold_801021.1
Length=897
Score = 95.3 bits (51), Expect = 5e-18
Identities = 69/78 (88%), Gaps = 0/78 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2754 GATGCGTTTGGAGTCAATTGAAGCTGTCAATAAAATTCTGGAAGAGGCTAATAAACGTAT 2813
||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 376 GATGCATTTGGAGTCAACGGAAGCTCTAAAAAAAATTCTAGTAGAGGCTAATAAACGTAT 435
Query 2814 CCAACCAACTGGAACTGG 2831
|||||||||||||| |||
Sbjct 436 CCAACCAACTGGAATTGG 453
> Ahg933703 jgi|Araly1|933703|scaffold_401691.1
Length=402
Score = 91.6 bits (49), Expect = 6e-17
Identities = 51/52 (98%), Gaps = 0/52 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2609 AGGGGACTGCGGCTCCAAAGAGAGTTGTTAAGACGTCAGTTTCAACATCAAC 2660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 99 AGGGGACTGCGGCTCCAAAGAGAGTTGTTAAGACGTCTGTTTCAACATCAAC 150
> Ahg339096 jgi|Araly1|339096|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001195
Length=1329
Score = 86.1 bits (46), Expect = 3e-15
Identities = 61/68 (90%), Gaps = 2/68 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 3405 AGTGTCAAAAGGTGTTACAAAGATTTCAAAATCAACTTCTAATGGTAC-CTTAAAGCAAG 3463
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1020 AGTGTTAAAAGGTGTTTCAAAGATTTCAAAATCAACTTCTAATGGTAAACTGAA-GCAAG 1078
Query 3464 GAAACAGA 3471
|||| |||
Sbjct 1079 GAAATAGA 1086
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 239952997765
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5