BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G35690.1
Length=2377
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg934192 jgi|Araly1|934192|scaffold_402180.1 3278 0.0
Ahg493199 jgi|Araly1|493199|fgenesh2_kg.7__2632__AT4G16760.1 1869 0.0
Ahg918666 jgi|Araly1|918666|Al_scaffold_0575_1 1712 0.0
> Ahg934192 jgi|Araly1|934192|scaffold_402180.1
Length=2036
Score = 3278 bits (1775), Expect = 0.0
Identities = 1953/2040 (96%), Gaps = 8/2040 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 188 TCTGAGACAATAGAGAGAACAATGGAGAGAGTTGATCACCTTGCCGATGAGAGGAACAAA 247
||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1 TCTGAAACAATAGAGGGAATAATGGAGAGAGTTGATCACCTTGCTGATGAGAGGAACAAA 60
Query 248 GCAGAGTTCAACGTCGACGATATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCCCGCCACGCTTTCGAT 307
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GCTGAGTTCAACGTCGACGATATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCCCGCCACGCTTTCGAC 120
Query 308 GTTTCAAATCGTATGTCTCGCCTCGTCGCTAATGATCCGGTCTTTGAGAAAAGCAAAAGA 367
||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTTTCAAATCGCATTTCTCGCCTCGTCGCCAATGATCCGATCTTTGAGAAAAGCAAAAGA 180
Query 368 GCTGTGATGAGTAGGAAAGAGTTGTTCAAGAACACGTTGAGGAAAAGTGTTCACGCTTGG 427
|| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCAGTAATGAGAAGGAAAGAGTTATTCAAGAACACGTTGAGAAAAAGTGTTCACGCTTGG 240
Query 428 AAGTTGATTAACGAGCTTCGTCTCTCAGATGAGGAAGGACTCAAATTGAGATCTTTCATG 487
||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 241 AAGATGATTAACGAGCTTCGTCTCTCTGATGAGGAAGGAATCAAATTAAGATCTTTCATG 300
Query 488 GATCAACCAGGCTTCTTGGATCTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCAATTAAAGGACAA 547
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 301 GATCAACCAGGCTTCTTGGATCTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCACTTAAAGGACAA 360
Query 548 GGCACAG-AGCAACAACAACAAAAGTGGTTGTCTTTAGCTACTAAGATGCAGATAATTGG 606
||||||| || |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGCACAGAAG-AACAGCAACACAAGTGGTTGTCTCTAGCTAATAAGATGCAGATAATTGG 419
Query 607 ATGTTATGCTCAAACTGAGCTTGGTCATGGCTCTAATGTTCAAGGCCTTGAGACAACCGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 420 ATGTTATGCTCAAACTGAGCTTGGTCATGGCTCTAATGTTCAAGGACTTGAGACAACCGC 479
Query 667 TACTTTTGATCCAAAGACAGATCAGTTTATCATTCACAGTCCAACTCAGACATCATCCAA 726
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 480 CACTTTCGATCCAAAGACAGACCAGTTTATCATTCACAGTCCAACTCAGACATCATCTAA 539
Query 727 ATGGTGGCCTGGTGGGTTAGGAAAAGTTTCTACTCATGCTGTTATTTATGCTCGTCTAAT 786
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 540 ATGGTGGCCTGGTGGACTAGGAAAAGTTTCTACTCATGCTGTTGTTTATGCTCGTCTAAT 599
Query 787 AACCAATGGCAAAGACCATGGTGTACATGGATTCATCGTGCAGCTGCGTAGTTTGGATGA 846
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 AACCAATGGCAAAGACCATGGTGTCCATGGATTCATCGTGCAGCTGCGTAGTTTGGATGA 659
Query 847 TCATTCTCCTCTTCCGGGTATAACCGTTGGTGATATCGGAATGAAGTTTGGAAACGGGGC 906
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TCATTCTCCGCTTCCAGGTATAACCGTTGGTGATATCGGAATGAAGTTTGGAAACGGGGC 719
Query 907 ATATAACTCAATGGACAATGGTTTTCTTATGTTTGATCATTTTCGCATTCCTAGAGATCA 966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 720 ATATAACTCAATGGACAATGGTTTTCTTATGTTTGATCATTTTCGTATTCCTAGAGATCA 779
Query 967 AATGCTCATGAGACTGTCAAAAGTTACAAGAGAAGGAAAATATGTAGCATCAGATGTTCC 1026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATGCTCATGAGACTGTCAAAAGTTACAAGAGAAGGAAAATATGTAGCATCAGATGTTCC 839
Query 1027 AAGGCAATTGGTGTATGGTACTATGGTGTATGTGAGACAGTCTATTGTGTCAAATGCTTC 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 AAGGCAATTGGTGTATGGTACTATGGTGTATGTGAGACAGTCTATTGTGTCAAATGCTTC 899
Query 1087 CACCGCGCTGGCTCGGGCAGTTTGCATTGCTACTAGGTACAGTGCTGTTCGAAGGCAGTT 1146
|||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 CACCGCGCTGGCTCGGGCGGTCTGCATTGCTACAAGGTACAGTGCTGTTCGAAGGCAGTT 959
Query 1147 TGGCTCACATGATGGTGGCATTGAGACACAGGTGATTAATTATAAAACTCAGCAGAACAG 1206
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 960 TGGCTCACAGGATGGTGGAATTGAGACACAGGTGATTGATTATAAAACACAGCAGAACAG 1019
Query 1207 GTTGTTTCCTCTGCTGGCATCTGCATATGCATTTCGGTTTGTAGGGGAATGGCTGAAGTG 1266
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1020 ATTGTTTCCTCTGCTAGCATCTGCATATGCATTTCGATTTGTAGGGGAGTGGCTGAAATG 1079
Query 1267 GCTCTACACTGATGTAACAAAAAGACTAGAGGCCAGTGATTTCGCAACATTGCCTGAAGC 1326
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 GCTCTACACTGATGTAACAAAAAGACTAGACACCAGTGATTTCGCAACATTGCCTGAAGC 1139
Query 1327 TCATGCATGCACTGCTGGATTGAAGTCTATGACTACCTCAGCCACCTCTGATGGGATTGA 1386
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1140 TCATGCTTGCACTGCAGGATTGAAGTCTATGACTACCTCAGCCACCTCTGATGGTATTGA 1199
Query 1387 AGAATGTCGTAAGTTATGTGGTGGACATGGATACTTGTGGTGTAGTGGGCTTCCTGAATT 1446
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1200 AGAATGTCGTAAGTTATGTGGTGGACATGGATACTTGTGGTGTAGTGGCCTTCCTGAGTT 1259
Query 1447 GTTTGCTGTATATGTTCCTGCTTGCACATACGAGGGAGACAATGTTGTGTTGCAGTTACA 1506
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1260 GTTTGCTGTATATGTTCCTGCTTGCACATATGAGGGAGACAATGTTGTGTTGCAATTACA 1319
Query 1507 GGTTGCTAGATTTCTGATGAAGACAGTTTCACAGTTGGGTTCTGGAAAGGCTCCTTCTGG 1566
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GGTTGCTAGATTTCTGATGAAGACAGTTTCACAATTGGGTTCTGGAAAGGCTCCTTCTGG 1379
Query 1567 GACAACTGCTTATATGGGCAGAGCAAAACACCTTTTGCAATGCAGTTCCGGAGTTCGAAA 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 1380 GACAACTGCTTATATGGGCAGAGCAAAACACCTTTTGCAATGCCGTTCCGGTGTTCGAAA 1439
Query 1627 TGCT-AGGGACTGGTTAAACCCTGGTATGGTGTTGGAAGCTTTTGAAGCAAGAGCTTTGA 1685
|||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1440 TGCTGAGG-ATTGGTTAAACCCTGGTATGGTGTTGGAAGCTTTTGAAGCAAGGGCTTTGA 1498
Query 1686 GAATGGCTGTTACTTGTGCTAACAATCTAAGCAAGTTTGAGAATCAAGAACAAGGATTCT 1745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 GAATGGCTGTTACTTGTGCTAACAATCTAAGCAAGTTTGAGAATCAAGAACAAGGATTCT 1558
Query 1746 CAGAACTCTTGGCTGATCTTGTTGAGGCTGCTACTGCTCATTGCCAGTTAATTGTTGTTT 1805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 CAGAACTCTTGGCTGATCTTGTTGAGGCTGCTACTGCTCATTGCCAGTTAATTGTTGTTT 1618
Query 1806 CTAAGTTTATAGCCAAAGTAGAGGGAGATATTGAAGGAAAAGGAGTGAAGAAACAGCTCA 1865
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 CTAAGTTTATAGCCAAAGTAGAGGGAAATATTGAAGGAAAAGGAGTGAAGAAACAGCTCA 1678
Query 1866 AGAATCTATGCTACATCTACGCACTCTATCTCCTTCACAAACACCTTGGTGATTTCCTCA 1925
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 AGAATCTATGCTACATCTATGCACTCTATCTCCTTCACAAACACCTTGGTGATTTCCTCA 1738
Query 1926 GTACAAACTCTGTTACTCCTGAACAAGCCTCACTTGCGAACCAGC-AGCTTCGATCACTC 1984
||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||| ||||||
Sbjct 1739 GTACAAACTCTGTCACTCCTGAACAAGGCTCCCTCGCGAACC-GCCAGCTTCGGTCACTC 1797
Query 1985 TACTCTCAGGTTCGACCAAACGCAGTGGCCCTAGTGGACGCCTTCGACTACACGGACCAG 2044
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 1798 TACTCTCAGGTTCGACCAAACGCAGTGGCCCTAGTGGATGCCTTTGACTACACTGACCAC 1857
Query 2045 TATCTTGGCTCTGT-CTTAGGCCGCTATGACGGAAACGTTTATCCAAAGCTTTTCGAGGA 2103
|||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 TATCTTGGCTCTGTGCTG-GGCCGCTATGATGGAAACGTTTATCCAAAGCTTTTCGAGGA 1916
Query 2104 AGCGTTGAAGGATCCACTCAATGACTCGGTGGTTCCTGACGGCTACCGTGAGTACATCCG 2163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||
Sbjct 1917 AGCGTTGAAGGATCCACTCAATGACTCGGTGGTTCCTGACGGCTACCATGAATACATTCG 1976
Query 2164 ACCGTTGATTAAGCAACGCTTCCGCTCTGCCAAACTCTAACTCTTTCTTTGTGCGGCTAA 2223
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1977 ACCGTTGATTAAGCAACGCTTCCGCTCTGCCAAACTCTAACTCTTTCTTTGTTCGGCTAA 2036
> Ahg493199 jgi|Araly1|493199|fgenesh2_kg.7__2632__AT4G16760.1
Length=2415
Score = 1869 bits (1012), Expect = 0.0
Identities = 1680/2001 (84%), Gaps = 51/2001 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 204 GAA-CAATGG-AGAGAGTTGATCACCTTGCCGATGAGAGGAACAAAGCAGAGTTCAACGT 261
||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||
Sbjct 164 GAATCAATGGAAG-GAGTTGATCACCTTGCTGATGAGAGGAACAAGGCGGAGTTCGACGT 222
Query 262 CGACGATATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCCCGCCACGCTTTCGATGTTTCAAATCGTA- 320
||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| |
Sbjct 223 CGAGGAGATGAAGATCGTCTGGGCTGGTTCCCGCCACGCTTTTGAGGTTTCCGATCGAAT 282
Query 321 TGTCTCGCCTCGTCGCTAATGATCCGGTCTTTGAGAAAAGCAAAAGAGCT-GTGATGAGT 379
|| | || |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| | | |||||
Sbjct 283 TG-CCCGTCTCGTCGCCAGCGATCCGGTATTTGAGAAAAGCAATAGAGCTCG-GTTGAGT 340
Query 380 AGGAAAGAGTTGTTCAAGAACACGTTGAGGAAAA-GTGTTCACG-CTTGGAAGTTGATTA 437
||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||| ||| ||| | ||| ||| |||||
Sbjct 341 AGGAAGGAGCTGTTTAAGAGTACGTTGA-GAAAATGTGCTCATGCCTT-TAAGAGGATTA 398
Query 438 ACGAGCTTCGTCTCTCAGATGAGGAAGGACTCAA-ATTGA-G-ATCTTTCATGGATCAAC 494
||||||||||||| | || || |||| | || ||||| | | |||| || ||||| |
Sbjct 399 TCGAGCTTCGTCTCACTGAGGAAGAAGCA-GGAAGATTGAGGCA-CTTT-ATCGATCAGC 455
Query 495 CAGGCTTCT-TGGATCTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCAATTAAAGGACAAGGCACA 553
| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||
Sbjct 456 C-TGCCTATGTGGATCTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCTATTAAGGGGCAGGGCACA 514
Query 554 GAGCAACAACAACAA-AAGTGGTTGTCTTTAGCTACTAAGATGCAGATAATTGGATGTTA 612
||| | || | | || ||||||||||| | || | |||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 515 GAGGAGCAGC-AGAAGAAGTGGTTGTCGCTGGCGAATAAGATGCAGATTATTGGGTGTTA 573
Query 613 TGCTCAAACTGAGCTTGGTCATGGCTCTAATGTTCAAGGCCTTGAGACAACCGCTACTTT 672
||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||
Sbjct 574 TGCACAGACTGAGCTTGGTCATGGCTCAAATGTTCAAGGACTTGAGACAACTGCCACATT 633
Query 673 TGATCCAAAGACAGATCAGTTTATCATTCACAGTCCAACTCAGACAT-CATCCAAATGGT 731
|||||| ||||| ||| ||||| | ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 634 TGATCCCAAGACTGATGAGTTTGTAATTCATACTCCAACTCAGAC-TGCATCCAAATGGT 692
Query 732 GGCCTGGTGGGTTAGGAAAAGTTTCTACTCATGCTGTTATTTATGCTCGTCTAATAACCA 791
|||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |
Sbjct 693 GGCCTGGTGGTTTGGGAAAAGTTTCTACCCATGCTGTTGTTTACGCTCGTCTCATAACTA 752
Query 792 ATGGCAAAGACCATGGTGTACATGGATTCATCGTGCAGCTGCGTAGTTTGGATGATCATT 851
| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||
Sbjct 753 ACGGAAAAGACTATGGTATCCATGGATTCATCGTGCAACTGCGCAGCTTAGAAGACCATT 812
Query 852 CTCCTCTTCCGGGTATAACCGTTGGTGATATCGGAATGAAGTTTGGAAACGGGGCATATA 911
||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||| | ||||| || |||||||
Sbjct 813 CTCCTCTTCCGAATATAACTGTTGGTGATATCGGGACGAAGATGGGAAATGGAGCATATA 872
Query 912 ACTCAATGGACAATGGTTTTCTTATGTTTGATCATTTTCGCATTCCTAGAGATCAAATGC 971
| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 ATTCAATGGACAACGGGTTTCTTATGTTTGATCATGTTCGCATTCCTAGAGATCAAATGC 932
Query 972 TCATGAGACTGTCAAAAGTTACAAGAGAAGGAAAATATGTAGCATCAGATGTTCCAAGGC 1031
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||
Sbjct 933 TCATGAGGCTGTCAAAAGTTACAAGGGAAGGAAAATATGTTCCATCGGATGTTCCAAAGC 992
Query 1032 AATTGGTGTATGGTACTATGGTGTATGTGAGAC-AGTCTATTGTGTCAAATGCTTCCACC 1090
| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||
Sbjct 993 AGCTGGTATATGGTACTATGGTGTATGTGAGACAAG-CAATTGTGGCAGATGCTTCCATT 1051
Query 1091 GCGCTGGCTCGGGCAGTTTGCATTGCTACTAGGTACAGTGCTGTTCGAAGGCAGTTTGGC 1150
|| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||||
Sbjct 1052 GCACTATCTCGAGCAGTTTGCATAGCTACAAGGTACAGCGCAGTGCGGAGGCAGTTTGGC 1111
Query 1151 TCACATGATGGTGGCATTGAGACACAGGTGATTAATTATAAAACTCAGCAGAACAGGTTG 1210
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1112 GCACATAATGGTGGCATTGAGACACAGGTGATTGATTATAAAACTCAGCAGAACAGGCTA 1171
Query 1211 TTTCCTCTGCTGGCATCTGCATATGCATTTCGGTTTGTAGGGGAATGGCTGAAGTGGCTC 1270
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||
Sbjct 1172 TTTCCTCTGCTAGCATCTGCATATGCATTTCGATTTGTTGGAGAGTGGCTAAAATGGCTG 1231
Query 1271 TACACTGATGTAACAAAAAGACTAGAGGCCAGTGATTTCGCAACATTGCCTGAAGCTCAT 1330
||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1232 TACACGGATGTAACTGAAAGACTGGCGGCTAGTGATTTCGCAACTTTGCCTGAGGCTCAT 1291
Query 1331 GCATGCACTGCTGGATTGAAGTCTATGACTACCTCAGCCACCT-CTGATGGGATTGAAGA 1389
||||||||||| || ||||||||| | || ||| |||||| || | |||| ||||||||
Sbjct 1292 GCATGCACTGCAGGGTTGAAGTCTCTCACCACCACAGCCA-CTGCGGATGCCATTGAAGA 1350
Query 1390 ATGTCGTAAGTTATGTGGTGGACATGGATACTTGTGGTGTAGTGGGCTTCCTGAATTGTT 1449
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||
Sbjct 1351 ATGTCGTAAGTTATGTGGTGGACACGGCTACTTGTGGTGCAGTGGGCTCCCCGAGCTGTT 1410
Query 1450 TGCTGTATATGTTCCTGCTTGCACATACGAGGGAGACAATGTTGTGTTGCAGTTACAGGT 1509
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 1411 TGCTGTATATGTTCCTGCCTGCACATACGAAGGAGACAATGTTGTGCTGCAATTACAGGT 1470
Query 1510 TGCTAGATTTCTGATGAAGACAGTTTCACAGTTGGGTTCTGGAAAGGCTCCT-TCTGGGA 1568
|||| |||| || ||||||||||| | ||| |||| |||||||||| |||| | ||| |
Sbjct 1471 TGCTCGATTCCTCATGAAGACAGTCGCCCAGCTGGGATCTGGAAAGGTTCCTGT-TGGCA 1529
Query 1569 CAACTGCTTATATGGGCAGAGCAAAACACCTTTTGCAATG-CAGTTCCGGAGTTCGAAAT 1627
||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| | |||| || |||| |||
Sbjct 1530 CAACTGCTTATATGGGCCGGGCCGCACATCTTTTGCAATGTC-GTTCTGGTGTTCAAAAG 1588
Query 1628 GCT-AGGGACTGGTTAAACCCTGGTATGGTGTTGGAAGCTTTTGAAGCAAGAGCTTTGAG 1686
||| ||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| || ||| ||||
Sbjct 1589 GCTGAGG-ATTGGTTAAACCCTGATGCGGTACTGGAAGCTTTCGAAGCTAGGGCTCTGAG 1647
Query 1687 AATGGCTGTTACTTGTGCTAACAATCTAAGCAAGTTTGAGAATCAAGAACAAGGATTCTC 1746
|||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 1648 AATGGCTGTTACTTGTGCCAAAAATCTCAGCAAGTTTGAGAATCAGGAACAAGGATTC-C 1706
Query 1747 A-GAACTCTTGGCTGATCTTG-TTGAGGCTGCTACTGCTCATTGCCAGTTAATTGTTGTT 1804
| || |||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1707 AAGAGCTCTTGGCTGAT-TTGGTTGAGGCCGCTATTGCTCATTGCCAATTGATTGTTGTT 1765
Query 1805 TCTAAGTTTATAGCCAAAGTAGAG--GGAGATATTGAAGGAAAAGGAGTGAAGAAACAGC 1862
|| ||||| ||||| ||| ||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||
Sbjct 1766 TCCAAGTTCATAGCGAAACTAGAGCAGGACATAG-GA-GGCAAAGGAGTGAAGAAACAGC 1823
Query 1863 TCAAGAATCTATGCTACATCTACGCACTCTATCTCCTTCACAAACACCTTGGTGATTTCC 1922
| || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1824 TGAATAATCTGTGTTACATTTACGCGCTTTATCTCCTTCACAAACATCTCGGTGATTTCC 1883
Query 1923 TCAGTACAAACTCTGTTACTCCTGAACAAGCCTCACTTGCGAACCAGCAGCTTCGATCAC 1982
|| || ||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||| || || |
Sbjct 1884 TCTCCACTAACTCCATCACTCCCAAACAAGCCTCTCTTGCTAACGACCAGCTCCGTTC-C 1942
Query 1983 TC-TACTCTCAGGTTCGACCAAACGCAGTGGCCCTAGTGGACGCCTTCGACTACACGGAC 2041
| ||||||||||| || || || || || || || |||||||||||| | ||||| |||
Sbjct 1943 TTATACTCTCAGGTCCGTCCTAATGCGGTTGCACTTGTGGACGCCTTCAATTACACAGAC 2002
Query 2042 CAGTATCTTGG-CTCTGT-CTTAGGCCGCTATGACGGAAACGTTTATCCAAAGCT-TTTC 2098
|| || |||| ||| || || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||
Sbjct 2003 CATTA-CTTGAACTCGGTGCTG-GGCCGTTATGACGGTAATGTGTACCCAAAGCTCTTT- 2059
Query 2099 GAGGAAGCGTTGAAGGATCCACTCAATGACTCGGTGGTTCCTGACGGCTACCGTGAGTAC 2158
|||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||| ||| |||
Sbjct 2060 GAGGAAGCGTGGAAGGATCCATTGAACGACTCGGTGGTTCCTGATGGGTACCATGAATAC 2119
Query 2159 ATCCGACC-GTTGATTAAGCA 2178
| ||||| || | |||||||
Sbjct 2120 CTTCGACCTGT-GCTTAAGCA 2139
> Ahg918666 jgi|Araly1|918666|Al_scaffold_0575_1
Length=1071
Score = 1712 bits (927), Expect = 0.0
Identities = 1024/1072 (96%), Gaps = 2/1072 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 209 ATGGAGAGAGTTGATCACCTTGCCGATGAGAGGAACAAAGCAGAGTTCAACGTCGACGAT 268
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAGAGTTGATCACCTTGCTGATGAGAGGAACAAAGCTGAGTTCAACGTCGACGAT 60
Query 269 ATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCCCGCCACGCTTTCGATGTTTCAAATCGTATGTCTCGC 328
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||
Sbjct 61 ATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCCCGCCACGCTTTCGACGTTTCAAATCGCATTTCTCGC 120
Query 329 CTCGTCGCTAATGATCCGGTCTTTGAGAAAAGCAAAAGAGCTGTGATGAGTAGGAAAGAG 388
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 121 CTCGTCGCCAATGATCCGATCTTTGAGAAAAGCAAAAGAGCAGTAATGAGAAGGAAAGAG 180
Query 389 TTGTTCAAGAACACGTTGAGGAAAAGTGTTCACGCTTGGAAGTTGATTAACGAGCTTCGT 448
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 181 TTATTCAAGAACACGTTGAGAAAAAGTGTTCACGCTTGGAAGATGATTAACGAGCTTCGT 240
Query 449 CTCTCAGATGAGGAAGGACTCAAATTGAGATCTTTCATGGATCAACCAGGCTTCTTGGAT 508
||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTCTCTGATGAGGAAGGAATCAAATTAAGATCTTTCATGGATCAACCAGGCTTCTTGGAT 300
Query 509 CTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCAATTAAAGGACAAGGCACAG-AGCAACAACAACA 567
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||
Sbjct 301 CTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCACTTAAAGGACAAGGCACAGAAG-AACAGCAACA 359
Query 568 AAAGTGGTTGTCTTTAGCTACTAAGATGCAGATAATTGGATGTTATGCTCAAACTGAGCT 627
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CAAGTGGTTGTCTCTAGCTAATAAGATGCAGATAATTGGATGTTATGCTCAAACTGAGCT 419
Query 628 TGGTCATGGCTCTAATGTTCAAGGCCTTGAGACAACCGCTACTTTTGATCCAAAGACAGA 687
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 420 TGGTCATGGCTCTAATGTTCAAGGACTTGAGACAACCGCCACTTTCGATCCAAAGACAGA 479
Query 688 TCAGTTTATCATTCACAGTCCAACTCAGACATCATCCAAATGGTGGCCTGGTGGGTTAGG 747
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 480 CCAGTTTATCATTCACAGTCCAACTCAGACATCATCTAAATGGTGGCCTGGTGGACTAGG 539
Query 748 AAAAGTTTCTACTCATGCTGTTATTTATGCTCGTCTAATAACCAATGGCAAAGACCATGG 807
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 AAAAGTTTCTACTCATGCTGTTGTTTATGCTCGTCTAATAACCAATGGCAAAGACCATGG 599
Query 808 TGTACATGGATTCATCGTGCAGCTGCGTAGTTTGGATGATCATTCTCCTCTTCCGGGTAT 867
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 600 TGTCCATGGATTCATCGTGCAGCTGCGTAGTTTGGATGATCATTCTCCGCTTCCAGGTAT 659
Query 868 AACCGTTGGTGATATCGGAATGAAGTTTGGAAACGGGGCATATAACTCAATGGACAATGG 927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 AACCGTTGGTGATATCGGAATGAAGTTTGGAAACGGGGCATATAACTCAATGGACAATGG 719
Query 928 TTTTCTTATGTTTGATCATTTTCGCATTCCTAGAGATCAAATGCTCATGAGACTGTCAAA 987
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TTTTCTTATGTTTGATCATTTTCGTATTCCTAGAGATCAAATGCTCATGAGACTGTCAAA 779
Query 988 AGTTACAAGAGAAGGAAAATATGTAGCATCAGATGTTCCAAGGCAATTGGTGTATGGTAC 1047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AGTTACAAGAGAAGGAAAATATGTAGCATCAGATGTTCCAAGGCAATTGGTGTATGGTAC 839
Query 1048 TATGGTGTATGTGAGACAGTCTATTGTGTCAAATGCTTCCACCGCGCTGGCTCGGGCAGT 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 840 TATGGTGTATGTGAGACAGTCTATTGTGTCAAATGCTTCCACCGCGCTGGCTCGGGCGGT 899
Query 1108 TTGCATTGCTACTAGGTACAGTGCTGTTCGAAGGCAGTTTGGCTCACATGATGGTGGCAT 1167
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 900 CTGCATTGCTACAAGGTACAGTGCTGTTCGAAGGCAGTTTGGCTCACAGGATGGTGGAAT 959
Query 1168 TGAGACACAGGTGATTAATTATAAAACTCAGCAGAACAGGTTGTTTCCTCTGCTGGCATC 1227
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 960 TGAGACACAGGTGATTGATTATAAAACACAGCAGAACAGATTGTTTCCTCTGCTAGCATC 1019
Query 1228 TGCATATGCATTTCGGTTTGTAGGGGAATGGCTGAAGTGGCTCTACACTGAT 1279
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1020 TGCATATGCATTTCGATTTGTAGGGGAGTGGCTGAAATGGCTCTACACCGAT 1071
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 89550165995
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5