BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G36730.1
Length=1506
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg934309 jgi|Araly1|934309|scaffold_402297.1 2342 0.0
Ahg478816 jgi|Araly1|478816|fgenesh2_kg.3__1517__AT2G36730.1 1640 0.0
Ahg919817 jgi|Araly1|919817|scaffold_101098.1 1262 0.0
Ahg939238 jgi|Araly1|939238|scaffold_503429.1 346 3e-94
Ahg474242 jgi|Araly1|474242|fgenesh2_kg.1__4196__AT2G36730.1 335 6e-91
> Ahg934309 jgi|Araly1|934309|scaffold_402297.1
Length=1565
Score = 2342 bits (1268), Expect = 0.0
Identities = 1422/1499 (95%), Gaps = 0/1499 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATTTGGAGTTCAGATTCATGCTTCAAATCCAGGAAACACCAATGTCTTATCTTCCTC 60
|||||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 21 ATGATTCGCAGTTTAGATTCAAGCTTCAAATCCAAGAAACACCAATGTCTTATCTTCCTC 80
Query 61 AAGCTATGTTCCTCAATTAAACACCTTCTACAGATCCATGGTCAAATCCATCTCTCCTCT 120
||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 81 AAGCTCTGTTCCTCCATTAAACATCTTTTACAGATCCATGGTCAAATCCATGTCTCCTCT 140
Query 121 CTCCAAAATGACAGCTTTATCATCAGCGAGCTTGTACGGGTTTCATCACTATCCCTCGCC 180
|||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||
Sbjct 141 CTCCAACATGATAGCTTTATCATCAGCGAGCTTATACGGGTTTCTTCACTATCTCACACC 200
Query 181 AAAGACCTTGCCTTTGCGCGAACCCTTCTGCTTCACTCTTCAGATTCGACTCCTTCTACT 240
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 AAAGACCTTGCCTTTGCACGAACCCTCCTGCTTCACTCTTCAGATTCGACTCCTTCTACT 260
Query 241 TGGAATATGCTCAGTAGAGGCTATTCTTCAAGTGATTCTCCTGTGGAATCGATTTGGGTT 300
||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 261 TGGAATATGCTCACCAGAGGCTATTCTTCGAGTGATACTCCTGTAGAATCGATTTGGGTT 320
Query 301 TACTCTGAGATGAAGAGACGAGGAATCAAACCTAATAAGCTCACTTTTCCTTTTCTTCTC 360
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 TACTCTGAGATGAAGAGACGACGAATCAAACCTAATAAGCTCACTTTTCCTTTTCTTCTT 380
Query 361 AAGGCTTGTGCTTCGTTTTTAGGTCTCACTGCTGGGAGACAGATTCAAGTTGAGGTTTTG 420
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 AAAGCTTGTGCTTCGTTTTTAGGTCTCACGGCTGGGAGACAGATTCAAGTTGAGGTTTTG 440
Query 421 AAACATGGGTTTGATTTTGATGTATATGTTGGGAACAATTTGATCCATCTTTATGGTACT 480
|| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||
Sbjct 441 AAGCATGGGTTTGATTCTGATGTGTATGTTGGGAACAATTTGATTCATCTCTATGGTTCT 500
Query 481 TGTAAGAAAACTTCTGATGCCAGGAAGGTGTTCGACGAAATGACTGAGAGAAATGTTGTT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 501 TGTAAGAAAACTTCTGATGCCAGGAAGGTGTTCGACGAAATGACTGAGAGAAATGTTGTT 560
Query 541 TCTTGGAACTCGATTATGACTGCTCTTGTTGAGAATGGTAAGTTAAATTTGGTGTTTGAG 600
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 561 TCTTGGAACTCGATTATGACAGCTCTCGTTGAGAATGGTAAGTTCAATTTGGTGGTTGAG 620
Query 601 TGTTTTTGTGAGATGATTGGTAAGCGGTTTTGTCCAGATGAGACGACAATGGTGGTTTTG 660
||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 TGTTTTTTTGAGATGATTGGTAGGCGGTTTTGTCCGGATGAGACGACAATGGTGGTTTTG 680
Query 661 CTTTCGGCTTGTGGCGGTAACTTGAGCTTGGGGAAATTGGTGCATTCACAGGTGATGGTA 720
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 681 CTTTCGGCATGTGGTGGTAACTTGAGCTTGGGGAAATTGGTGCATTCACAGGTGATGGTA 740
Query 721 AGAGAGTTAGAGTTAAACTGTAGACTAGGTACTGCACTTGTAGACATGTATGCAAAATCA 780
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAGAGTTAGAGTTGAACTGTAGACTAGGTACTGCACTTGTTGACATGTATGCAAAATCT 800
Query 781 GGTGGATTAGAGTATGCTAGGTTAGTTTTCGAAAGAATGGTTGACAAAAATGTTTGGACT 840
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 801 GGTGGATTAAAGTATGCTCGGTTAGTTTTCGAAAGAATGGCTGACAAAAATGTTTGGACT 860
Query 841 TGGAGTGCCATGATTGTAGGATTAGCACAATATGGATTTGCAGAAGAAGCCCTTCAACTA 900
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 TGGAGCGCCATGATTGTAGGATTAGCACAATATGGGTTTGCAGAAGAAGCCCTTCAACTA 920
Query 901 TTCTCGAAGATGATGAAAGAATCATCGGTGAGACCAAACTACGTAACATTTCTCGGTGTT 960
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 921 TTCTCGAAGATGATGAAAGAATCATCAGTTAGACCAAACTACGTGACATTTCTTGGTGTT 980
Query 961 TTATGCGCTTGTAGCCACACGGGATTGGTGGATGACGGGTACAAATATTTCCACGAAATG 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 981 TTATGCGCTTGTAGCCACACGGGATTGGTGGATGACGGGTACAAATACTTCCACGAAATG 1040
Query 1021 GAGAAAATACACAAGATCAAACCAATGATGATTCACTACGGAGCAATGGTAGATATCTTG 1080
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||
Sbjct 1041 GAGAAAACACACAAGATCAAACCAATGATGATTCACTACGGGGCAATGATCGATATCTTG 1100
Query 1081 GGACGTGCAGGTCGACTAAACGAGGCGTATGACTTCATAAAGAAAATGCCTTTTGAGCCT 1140
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 GGACGTGCAGGTCGACTAAACGAGGCATATGACTTCATACAGAAAATGCCTTTTGAGCCT 1160
Query 1141 GATGCGGTTGTTTGGAGGACTCTACTCTCCGCTTGTAGTATCCATCACGATGAAGATGAT 1200
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161 GATGCGGTTGTTTGGAGAACTCTACTCTCTGCTTGTAGTATCCATCACGATGAAGATGAT 1220
Query 1201 GAGGGAATTGGTGAGAAAGTAAAGAAGAGATTGATTGAGTTAGAACCAAAGAGGAGTGGG 1260
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1221 AAGGGAATTGGAGAGAAAGTAAAGAAGAGATTGATTGAGTTAGAGCCAAAGAGGAGTGGT 1280
Query 1261 AATTTGGTGATTGTGGCGAATAGGTTTGCGGAAGCGAGGATGTGGGCTGAGGCAGCAGAA 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1281 AATTTGGTGATTGTGGCGAATAGGTTTGCGGAAGCGAGGATGTGGGATGAGGCAGCAGAA 1340
Query 1321 GTTAGGAGAGTAATGAAGGAAACTAAGATGAAGAAGATCGCCGGAGAGAGTTGTCTAGAG 1380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1341 GTTAGGAGAGTAATGAAGGAAACTAAGATGAAGAAGATAGCTGGAGAGAGTTGTCTAGAG 1400
Query 1381 CTAGGAGGGTCGTTTCATAGATTCTTCTCAGGGTATGATCCTCGTTCTGAATATGTATCC 1440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1401 CTAGGAGGGTCGTTTCATAGATTCTTCTCAGGGTATGATCCTCGTTCTGAGTATGTATCC 1460
Query 1441 ATCTATGAATTATTAGATTTGTTCAAGTTTCAGTTGACATGTGACTATCGTTTGGTGTC 1499
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 1461 ATCTATGTGTTATTAGATTTGTTCAAGTTTCAATTGACATGTGACAATCATTTGGTGTC 1519
> Ahg478816 jgi|Araly1|478816|fgenesh2_kg.3__1517__AT2G36730.1
Length=1110
Score = 1640 bits (888), Expect = 0.0
Identities = 1037/1109 (94%), Gaps = 10/1109 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 19 TCATGCTTCAAATCCAGGAAACACCAATGTCTTATCTTCCTCAAGCTATGTTCCTCAATT 78
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1 TCAAGCTTCAAATCCAGGAAACACCAATGTCTTATCTTCCTCAAGCTATGTTCCTCATTT 60
Query 79 AAACACCTTCTACAGATCCATGGTCAAATCCATCTCTCCTCTCTCCAAAATGACAGCTTT 138
||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAACATCTTCTACAGATCCATGGTAAAATCCATGTCTCCTCACTCCAAAATGACAGCTTT 120
Query 139 ATCATCAGCGAGCTTGTACGGGTTTCATCACTATCCCTCGCCAAAGACCTTGCCTTTGCG 198
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 121 ATCATCATCGAGCTTGTACGGGTTTCATCACTATCCCTCGTCAAAGACCTTACCTTTGCG 180
Query 199 CGAACCCTTCTGCTTCACTCTTCAGATTCGACTCCTTCTACTTGGAATATGCTCAGTAGA 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 181 CGAACCCTTCTGCTTCACTCTTCAGATTCGACTCCTTCTACTTGGAATATGCTCAATAGA 240
Query 259 GGCTATTCTTCAAGTGATTCTCCTGTGGAATCGATTTGGGTTTACTCTGAGATGAAGAGA 318
||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||||||| |||||
Sbjct 241 GGCTATTCTTCGAGTGATACTCCAGTAGAATCGATTTGGTTTTATTCTGAGATGGAGAGA 300
Query 319 CGAGGAATCAAACCTAATAAGCTCACTTTTCCTTTTCTTCTCAAGGCTTGTGCTTCGTTT 378
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CGAGGAATCAATCCTAATAAGCTTACTTTTCCTTTTCTTCTCAAGGCTTGTGCTTCGTTT 360
Query 379 TTAGGTCTCACTGCTGGG-AGACAGATTCAAGTTGAGGTTTTGAAACATGGGTTTGATTT 437
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTAGGTCTCACTGC-GGGTAGACAGATTCAAGTTGAGGTTTTGAAACATGGGTTTGATTC 419
Query 438 TGATGTATATGTTGGGAACAATTTGATCCATCTTTATGGTACTTGTAAGAAAACTTCTGA 497
|||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 420 TGATGTGTATGTTGGGAATAATTTGATTCATCTATATGGTTCTTGTAAGAAAACTTATGA 479
Query 498 TGCCAGGAAGGTGTTCGACGAAATGACTGAGAGAAATGTTGTTTCTTGGAACTCGATTAT 557
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TGCCAGGAAGATGTTCGACGAAATGACTGACAGAAATTTTGTTTCTTGGAACTCGATTAT 539
Query 558 GACTGCTCTTGTTGAGAATGGTAAGTTAAATTTGGTGTTTGAGTGTTTTTGTGAGATGAT 617
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 540 GACTGCTCTTGTTGAGAATGGTAAGTTCAATTTGGTGTTTGAGTGTTTTTGTGAGATTAT 599
Query 618 TGGTAAGCGGTTTTGTCCAGATGAGACGACAATGGTGGTTTTGCTTTCGGCTTGTGGCGG 677
||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||| | ||
Sbjct 600 TGGTAGGAGGTTTTGTCCGGATGAGACGACAATGGTTGTTTTGCTCTCTGCGTGTTGTGG 659
Query 678 TAACTTGAGCTTGGGGAAATTGG-TGC--AT--TCAC-AG-GTGATGGTAAGAGAGTTAG 730
||||||||||||||||||||| | | | | | || ||| |||||||||||||||
Sbjct 660 TAACTTGAGCTTGGGGAAATTCCATTCCCAAAGT-AGGAGAGTGGTGGTAAGAGAGTTAG 718
Query 731 AGTTAAACTGTAGACTAGGTACTGCACTTGTAGACATGTATGCAAAATCAGGTGGATTAG 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 719 AGTTAAACTGTAGACTAGGTACTGCACTTGTAGACATGTATGCAAAATCTGGTGGATTAG 778
Query 791 AGTATGCTAGGTTAGTTTTCGAAAGAATGGTTGACAAAAATGTTTGGACTTGGAGTGCCA 850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 779 AGTATGCTAGGTTAGTTTTCGAAAGAATGGTTGACAAAAATGTTTGGACTTGGAATGCCA 838
Query 851 TGATTGTAGGATTAGCACAATATGGATTTGCAGAAGAAGCCCTTCAACTATTCTCGAAGA 910
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 839 TGATTGTAGGTTTAGCACAATATGGATTTGTAGAAGAAGCCCTTCAACTATTCGCGAAGA 898
Query 911 TGATGAAAGAATCATCGGTGAGACCAAACTACGTAACATTTCTCGGTGTTTTATGCGCTT 970
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 TGATGAAAGAATCAACGGTGAGACCAAAATACGTGACATTTCTCGGTGTTTTATGCGCTT 958
Query 971 GTAGCCACACGGGATTGGTGGATGACGGGTACAAATATTTCCACGAAATGGAGAAAATAC 1030
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||
Sbjct 959 GTAGCCACACGGCATTGGTGGATGACGGGTACAAATACTTCCACGAGATGGAGAAAGCAC 1018
Query 1031 ACAAGATCAAACCAATGATGATTCACTACGGAGCAATGGTAGATATCTTGGGACGTGCAG 1090
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 ACAAGATCAAACCAATGATTATTCACTACAGAGCAATGGTAGATATCTTGGGACGTGCAT 1078
Query 1091 GTCGACTAAACGAGGCGTATGACTTCATA 1119
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 GTCGACTAAACGAGGCGTATGACTTCATA 1107
> Ahg919817 jgi|Araly1|919817|scaffold_101098.1
Length=994
Score = 1262 bits (683), Expect = 0.0
Identities = 754/789 (96%), Gaps = 2/789 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 401 AGATTCAAGTTGAGGTTTTGAAACATGGGTTTGATTTTGATGTATATGTTGGGAACAATT 460
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 136 AGATTCAAGTTGAGGTTTTGAAACATGGGTTTGATTCTGATGTGTATGTTGGGAATAATT 195
Query 461 TGATCCATCTTTATGGTACTTGTAAGAAAACTTCTGATGCCAGGAAGGTGTTCGACGAAA 520
|||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 196 TGATTCATCTATATGGTTCTTGTAAGAAAACTTCTGATGCCAGGAAGGTGTTCGATGAAA 255
Query 521 TGACTGAGAGAAATGTTGTTTCTTGGAACTCGATTATGACTGCTCTTGTTGAGAATGGTA 580
||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256 TGACTGACAGAAATTTTGTTTCTTGGAACTCGATTATGACTGCTCTTGTTGAGAATGGTA 315
Query 581 AGTTAAATTTGGTGTTTGAGTGTTTTTGTGAGATGATTGGTAAGCGGTTTTGTCCAGATG 640
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 316 AGTTCAATTTGGTGTTTGAGTGTTTTTGTGAGATGATTGGTAAGAGGTTTTGTCCGGATG 375
Query 641 AGACGACAATGGTGGTTTTGCTTTCGGCTTGTGGCGGTAACTTGAGCTTGGGGAAATTGG 700
||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 AGACGACAATGGTTGTTTTGCTCTCTGCGTGTGGTGGTAACTTGAGCTTGGGGAAATTGG 435
Query 701 TGCATTCACAGGTGATGGTAAGAGAGTTAGAGTTAAACTGTAGACTAGGTACTGCACTTG 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 TGCATTCACAGGTGATGGTAAGAGAGTTAGAGTTAAACTGTAGACTAGGTACTGCACTTG 495
Query 761 TAGACATGTATGCAAAATCAGGTGGATTAGAGTATGCTAGGTTAGTTTTCGAAAGAATGG 820
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 TAGACATGTATGCAAAATCTGGTGGATTAGAGTATGCTAGGTTAGTTTTCGAAAGAATGG 555
Query 821 TTGACAAAAATGTTTGGACTTGGAGTGCCATGATTGTAGGATTAGCACAATATGGATTTG 880
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 556 TTGACAAAAATGTTTGGACTTGGAGTGCCATGATTGTAGGTTTAGCACAATATGGATTTG 615
Query 881 CAGAAGAAGCCCTTCAACTATTCTCGAAGATGATGAAAGAATCATCGGTGAGACCAAACT 940
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 616 CAGAAGAAGCCCTTCAACTATTCGCGAAGATGATGAATGAATCAACGGTGAGACCAAACT 675
Query 941 ACGTAACATTTCTCGGTGTTTTATGCGCTTGTAGCCACACGGGATTGGTGGATGACGGGT 1000
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 676 ACGTGACATTTCTCAGTGTTTTATGCGCTTGTAGCCACACATCATTGGTGGATGACGGGT 735
Query 1001 ACAAATATTTCCACGAA-ATGGAGAAAATACACAAGATCAAACCAATGATGATTCACTAC 1059
||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 ACAAATACTTCCAC-AAGATGGAGAAAGCACACAAGATCAAACCAATGATGATTCACTAC 794
Query 1060 GGAGCAATGGTAGATATCTTGGGACGTGCAGGTCGACTAAACGAGGCGTATGACTTCATA 1119
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 AGAGCAATGGTAGATATCTTGGGACGTGCAGGTCGACTAAACGAGGCGTATGACTTCATA 854
Query 1120 AAGAAAATGCCTTTTGAGCCTGATGCGGTTGTTTGGAGGACTCTACTCTCCGCTTGTAGT 1179
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 AAGAAAAAGCCTTTTGAGCCTGATGCGGTTGTTTGGAGGACTCTACTCTCCGCTTGTAGT 914
Query 1180 ATCCATCAC 1188
||| |||||
Sbjct 915 ATCTATCAC 923
Score = 198 bits (107), Expect = 9e-50
Identities = 128/138 (93%), Gaps = 2/138 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 227 CGACTCCTTCTACTTGGAATATGCTCAGTAGAGGCTATTCTTCAAGTGATTCTCCT-GTG 285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||
Sbjct 1 CGACTCCTTCTACTTGGAATATGCTCAGTAGAGGCTATTCTTCGAGTGATACTC-TAGTA 59
Query 286 GAATCGATTTGGGTTTACTCTGAGATGAAGAGACGAGGAATCAAACCTAATAAGCTCACT 345
|||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 60 GAATCGATTTGGTTTTATTCTGAGATGGGGAGACGAGGAATCAAACCTAATAAGCTTACT 119
Query 346 TTTCCTTTTCTTCTCAAG 363
||||||||||||||||||
Sbjct 120 TTTCCTTTTCTTCTCAAG 137
> Ahg939238 jgi|Araly1|939238|scaffold_503429.1
Length=258
Score = 346 bits (187), Expect = 3e-94
Identities = 237/260 (91%), Gaps = 7/260 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 230 CTCCTTCTACTTGG----AATATGCTCAGTAGAGGCTATTCTTCAAGTGATTCTCCTGTG 285
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||
Sbjct 1 CTCCTTCTACTTGGAATTAATATGCTCAGTAGAGGCTATTCTTCGAGTGATACTCCAGTA 60
Query 286 GAATCGATTTGGGTTTACTCTGAGATGAAGAGACGAGGAATCAAACCTAATAAGCTCACT 345
|||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 61 GAATCGATTTGGTTTTATTCTGAGATGGAGAGACGAGGAATCAAACCTAATAAGCTTACT 120
Query 346 TTTCCTTTTCTTCTCAAGGCTTGTGCTTCGTTTTTAGGTCTCACTGCTGGG-AGACAGAT 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||
Sbjct 121 TTTCCTTTTCTTCTCAAGGCTTGTGCTTCGTTTTTAGGTCTCACTGC-GAGTAGACAGAT 179
Query 405 TCAAGTTGAGGTTTTGAAACATGGGTTTGATTTTGATGTATATGTTGGGAACAATTTGAT 464
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 180 TCAAGTTGAGGTTTTGAAA-ATGGGTTTGATTCTGATGTGTATGTTGGGAATTATTTGAT 238
Query 465 CCATCTTTATGGTACTTGTA 484
||||| |||||| ||||||
Sbjct 239 TCATCTATATGGTTCTTGTA 258
> Ahg474242 jgi|Araly1|474242|fgenesh2_kg.1__4196__AT2G36730.1
Length=784
Score = 335 bits (181), Expect = 6e-91
Identities = 244/271 (90%), Gaps = 18/271 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 17 ATTCATGCTTCAAATCCAGGAAACACCAATGTCTTATCTTCCTCAAGCTATGTTCCTCAA 76
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATTCAAGCTTCAAATCCAGGAAACACCAATGTCTTATCTTTCTCAAGCTATGTTCCTCAT 60
Query 77 TTAAACACCTTCTACAGATCCATGGTCAAATCCATCTCTCCTCTCTCCAAAATGACAGCT 136
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 61 TTAAACATCTTCTACAGATCCATGGTCAAATCCATGTCTCCTCACTCCAAAATGACAGCT 120
Query 137 TTATCATCAGCGAGCTTGTACGGGTTTCATCACTATCCCTCG-C-----C----A---AA 183
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||
Sbjct 121 TTATCATCAGCGAGCTTGTACGGGGTTCATCACTATCCCTCGTCAAAGTCTTTGACTCAA 180
Query 184 -GACCTTGCCTTTGCGCGAACCCTTCTGCTTCACTCTTCAGATTCGACTCCTTCTACTTG 242
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 181 AGACCTTACCTTTGCGCGAACCCTTCTGCTTCACTCTTCAGATTTGACTCCTTCTACTTG 240
Query 243 GAAT-A-T--GCTCAGTAGAGGCTATTCTTC 269
|||| | | |||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GAATTAATATGCTCAGTAGAGGCTATTCTTC 271
Score = 320 bits (173), Expect = 2e-86
Identities = 193/203 (95%), Gaps = 0/203 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 975 CCACACGGGATTGGTGGATGACGGGTACAAATATTTCCACGAAATGGAGAAAATACACAA 1034
||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 582 CCACACGACATTGGTGGATGACAGGTACAAATACTTCCACGATATGGAGAAAGCACACAA 641
Query 1035 GATCAAACCAATGATGATTCACTACGGAGCAATGGTAGATATCTTGGGACGTGCAGGTCG 1094
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 642 GATCAAACCAATGATGATTCACTACAGAGCAATGGTAGATATCTTGGGACGTGCAAGTCG 701
Query 1095 ACTAAACGAGGCGTATGACTTCATAAAGAAAATGCCTTTTGAGCCTGATGCGGTTGTTTG 1154
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 ACTAAACGAGGCGTATGACTTCATAAATAAAATGCCTTTTGAGCCTGATGCGGTTGTTTG 761
Query 1155 GAGGACTCTACTCTCCGCTTGTA 1177
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 GAGGACTCTACTCTCCGCTTGTA 784
Score = 231 bits (125), Expect = 8e-60
Identities = 143/152 (94%), Gaps = 0/152 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 500 CCAGGAAGGTGTTCGACGAAATGACTGAGAGAAATGTTGTTTCTTGGAACTCGATTATGA 559
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 362 CCAGGAAGGTGTTCGACGAAATGACTGACAGAAATTTTGTTTCTTGGAACTCGACTATGA 421
Query 560 CTGCTCTTGTTGAGAATGGTAAGTTAAATTTGGTGTTTGAGTGTTTTTGTGAGATGATTG 619
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 422 CAGCTCTTGTTGAGAATGGTAAGTTCAATTTGGTGTTTAAGTGTTTTTGTGAGATGATTG 481
Query 620 GTAAGCGGTTTTGTCCAGATGAGACGACAATG 651
||| | |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 482 GTAGGAGGTTTTGTCCGGATGAGACGACAATG 513
Score = 145 bits (78), Expect = 1e-33
Identities = 85/88 (97%), Gaps = 1/88 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 310 ATGAAGAGACGAGGAATCAAACCTAATAAGCTCACTTTTCCTTTTCTTCTCAAGGCTTGT 369
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 ATGGAGAGACGAGGAATCAAACCTAATAAGCTTACTTTTCCTTTTCTTCTCAAGGCTTGT 333
Query 370 GCTTCGTTTTTAGGTCTCACTGCTGGGA 397
||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 334 GCTTCGTTTTTAGGTCTCACTGC-GGGA 360
Score = 119 bits (64), Expect = 7e-26
Identities = 64/64 (100%), Gaps = 0/64 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 792 GTATGCTAGGTTAGTTTTCGAAAGAATGGTTGACAAAAATGTTTGGACTTGGAGTGCCAT 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 GTATGCTAGGTTAGTTTTCGAAAGAATGGTTGACAAAAATGTTTGGACTTGGAGTGCCAT 572
Query 852 GATT 855
||||
Sbjct 573 GATT 576
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 56373562600
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5