BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G38020.1
Length=2875
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg321506 jgi|Araly1|321506|fgenesh1_pm.C_scaffold_4001563 4361 0.0
Ahg905901 jgi|Araly1|905901|Al_scaffold_0003_3029 2988 0.0
> Ahg321506 jgi|Araly1|321506|fgenesh1_pm.C_scaffold_4001563
Length=2577
Score = 4361 bits (2361), Expect = 0.0
Identities = 2506/2578 (97%), Gaps = 2/2578 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 109 ATGGCAAACGTGTCTGTTGCTGCGGAATGGCAGCTTCTCTATGATCGATATTATAGGAAG 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATGGCAAACGTGTCTGTTGCTGCGGAATGGCAGCTTCTCTATGATCGATATTACAGGAAG 60
Query 169 CCTGAGATATACCAAATGAAATGGAAACATGTAGATTTGAGTCGTAACAAGGTGGCGTGT 228
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CCTGAGATATACCAGATGAAATGGAAACATGTAGATTTGAGTCGTAACAAGGTGGCGTGT 120
Query 229 GCTTCGTTTGGTGGGCCAATTGCAGTTATTCGAGATGACTCGAAGATTGTCCAACTATAT 288
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 121 GCTTCATTTGGTGGGCCAATTGCAGTCATTCGAGATGACTCGAAGATTGTCCAATTATAT 180
Query 289 GCTGAATCTGCTCTAAGAAAGCTCCGCATCTTTAACTCAGCAGGTATACTTCTCTCTGAG 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCTGAATCTGCTCTAAGAAAGCTCCGCATCTTTAACTCAGCAGGTATACTTCTCTCTGAG 240
Query 349 ACGGTTTGGAAGCATCCCGGGGGACGTCTGATCGGAATGTCCTGGTCAGATGATCAGACA 408
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ACGGTCTGGAAGCATCCCGGGGGACGCCTGATCGGAATGTCCTGGTCAGATGATCAGACA 300
Query 409 CTAATTTGCATTGTCCAAGATGGAACCATTTATCGTTACAACATCCACGCTGAGCTCATT 468
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CTAATTTGTATTGTCCAAGATGGCACTATTTATCGTTATAACATCCACGCTGAGCTCATT 360
Query 469 GAGCCCAATATGTCTATGGGCCAGGAGTGCTTTGAGCAGAATGTGGTGGAGTGTGTCTTC 528
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGCCCAATATGTCAATGGGCAAGGAGTGCTTTGAGCAGAATGTGGTGGAGTGTGTCTTC 420
Query 529 TGGGGAAATGGTGTTGTCTGCTTGACAGAAGGAGGGCAGTTGATCTGTATTTTCGATTTC 588
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TGGGGAAATGGTGTTGTCTGCTTAACAGAAGGAGGGCAGTTGATCTGTATTTTCGATTTC 480
Query 589 AAGACAATGAAGCCTTCTAAGTTGCCTGATGTGCCGGGGTTAGCAGAAGATGATCTGCTT 648
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AAGACAATGAAGCCTTCTAAGTTGCCTGATGTACCGGGGTTAGCAGAAGATGATCTGCTT 540
Query 649 CAGCCAATCTGCTTGACTGTGAGGGAACCTAAGTACACGATGTCTGGGATTGCTGAGGTG 708
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CAGCCAATTTGCTTGACTGTGAGGGAACCTAAGTACACGATGTCTGGGATTGCTGAGGTG 600
Query 709 TTGGTAGCAGTTGGCGATGATATTTTTGTTGTGGAGGAGGACATGGTTCAAACTATTAGG 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TTGGTAGCAGTTGGCGATGATATTTTTGTTGTGGAGGAGGACATGGTTCAAACTATTAGG 660
Query 769 TTTGATGAGCCTAGTGTTGATGACTCTGAGATGCAGAATGATGATTCTGGGAATTTGATT 828
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TTTGATGAGCCTAGTATTGAAGACTCTGAGATGCAGAATGATGATTCTGGGAATTTGATT 720
Query 829 GGAGTGGTCCAGAAGATGATTGTATCACCTAATGGAAAATTTCTAACACTCTTCACTCAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GGAGTGGTCCAGAAGATGATTGTATCACCTAATGGAAAATTTCTAACACTCTTCACTCAT 780
Query 889 GATGGCCGGATTGTTGTTGTTGACATGGAAACAAAACAAATTGCTATTGACTACTCTTGT 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 781 GATGGCCGGATTGTTGTTGTTGACATGGAAACAAAACAAATTGCTATTGACTACTGTTGT 840
Query 949 GAGTCAGCCCTTCCTCCGCAGCAAATGGCTTGGTGTGGAATGGATAGTGTGCTGCTATAT 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||
Sbjct 841 GAGTCAGCCCTTCCTCCGCAGCAAATGGCTTGGTGTGGAATGGATAGCGTTCTTCTCTAT 900
Query 1009 TGGGATGAGGATTTAATGATGGTGGGTCCTGTAGGAGACCCAGTTCACTATTTCTATGAT 1068
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 901 TGGGATGAGGATTTAATGATGGTGGGTCCTGTAGGAGACCCAGTTCACTATTTCTACGAT 960
Query 1069 GAACCTATAATTCTTATCCCAGAATGCGATGGAGTGAGAATATTATCTAACACGAATCTT 1128
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 961 GAACCTGTAATTCTTATCCCAGAATGCGATGGAGTGAGAATATTATCTAACACGAGCCTT 1020
Query 1129 GAATTTCTGCAAAGAGTACCTGATTCTACTGAGTCAATCTTTAAGATTGGAAGCACATCA 1188
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1021 GAATTTCTGCAAAGAGTACCTGATTCTACCGAGTCAATCTTTAAGATTGGAAGCACCTCA 1080
Query 1189 CCTGCAGCTTTGCTATATGATGCTTTGGATCATTTTGACAGGCGAAGTGCTAAGGCAGAT 1248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CCTGCAGCTTTGCTATATGATGCTTTGGATCATTTTGACAGGCGAAGTGCTAAGGCAGAT 1140
Query 1249 GAAAATTTGAGATTAATTCGTTCATCACTGTCGGAGGCTGTTGAATCCTGTATTGATGCC 1308
|| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GAGAATTTGAGATTAATTCGTTCATCACTGTCTGAAGCTGTTGAATCCTGTATTGATGCC 1200
Query 1309 GCTGGACATGAATTTGATGTAACTCGTCAGAGGGCTCTGTTACGAGCGGCAAGTTATGGA 1368
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1201 GCTGGCCATGAGTTTGATGTAACTCGTCAGAGGGCACTGTTACGAGCGGCAAGCTATGGA 1260
Query 1369 CAAGCTTTCTGCAGCAATTTTCAGCGTGAACGTGTCCAAGAGACTTGTAGAACGTTACGG 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CAAGCTTTCTGCAGCAATTTTCAGCGTGAACGTGTCCAAGAGACTTGTAGAACGTTACGG 1320
Query 1429 GTTTTAAATGCGGTTCGTGATCCTGCTATTGGCATACCTCTTAGCATTCAGCAGTACAAG 1488
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GTTCTAAATGCGGTTCGAGATCCTGCTATTGGCATACCTCTTAGCATTCAGCAGTACAAG 1380
Query 1489 TTACTGACACCAGTGGTTTTGATTAGTCGCCTTATTAATGCTAATTGTCACCTTCTTGCT 1548
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 1381 TTACTGACACCAATGGTTTTGATTAGTCGCCTTATTAATGCTCATTGCCACCTTCTTGCT 1440
Query 1549 CTGCGGATATCTGAGTACTTAGATATGAATAAAGAAGTGGTGATAATGCATTGGGCATGT 1608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CTGCGGATATCTGAGTACTTAGATATGAATAAAGAAGTGGTGATAATGCATTGGGCATGT 1500
Query 1609 GCAAAGATAACTGCTTCACCATCAACTCCAGATTCTCATCTTCTTGAAATTTTACTTGAT 1668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GCAAAGATAACTGCTTCACCATCAACTCCAGATTCTCATCTTCTTGAAATTTTACTTGAT 1560
Query 1669 AAGCTCCAACTATGCAAAGGAATATCGTATGCTGCAGTGGCCACTCATGCTGATAACTGT 1728
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 AAGCTCCAACTATGCAAAGGAATATCTTATGCTGCAGTGGCCACTCATGCTGATAACTGT 1620
Query 1729 GGCCGTCGAAAGTTAGCTGCAATGCTAGTTGAACATGAACCACGCTCCACGAAACAGGTA 1788
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 GGCCGTCGAAAGTTAGCTGCAATGCTAGTTGAACACGAACCACGCTCCACGAAACAGGTA 1680
Query 1789 CCTCTTTTATTAAGCATTGGGGAGGAAGACACTGCTTTAGTGAAAGCAACTGAGAGTGGT 1848
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1681 CCTCTTTTATTAAGCATTGGGGAGGAAGACACTGCTTTAGTGAAAGCAACTGAGAGCGGT 1740
Query 1849 GACACTGACCTGGTTTATCTGGTCATATTTCATATATGGCAAAAGAGGCCTCCTTTGGAA 1908
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GACACCGACCTGGTTTATCTGGTCATATTTCATATATGGCAAAAGAGGCCTCCTTTGGAA 1800
Query 1909 TTCTTTGCGATGATCCAAGGAAGAGTTTTGGCACGTGATCTATTTGTAGCTTATGCACGG 1968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 TTCTTTGCGATGATCCAAGGAAGAGTTTTGGCACGTGATCTATTTGTAGCTTATGCACGG 1860
Query 1969 TGTCATAAGCATGAATTTCTGAAGGATTTCTTCTTATCTACGGGCCAGATTCATGAGGTA 2028
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 TGTCATAAACATGAATTTCTGAAGGATTTTTTCTTATCTACGGGCCAGATTCATGAGGTA 1920
Query 2029 GCTTTTCTTTTATGGAAAGAATCATGGGATATGGGGAAAAACCCAATGGCTAGCAAAGGA 2088
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 GCTTTTCTTTTATGGAAAGAATCATGGGATATGGGTAAAAACCCAATGGCTAGCAAAGGA 1980
Query 2089 TCTCCATTGCACGGTCCGCGCATAAAACTAATAGAGAAGGCTAGAAACCTTTTCTCCCAA 2148
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1981 TCCCCGCTGCACGGTCCGCGCATAAAACTAATAGAGAAGGCCAGAAACCTTTTCTCCCAG 2040
Query 2149 ACAAAGGAACACACTTTCGAGTCTAAGGCTGCTGAGGAACATGCAAAACTCCTGAAGATA 2208
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 ACAAAGGAACACACTTTCGAGTCTAAGGCTGCTGAGGAGCATGCAAAACTCCTGAAGATA 2100
Query 2209 CAACATGAGCTAGAAGCTAGTACGAAGCAGGCTATCTTTGTTGATTCAAGCATCAATGAT 2268
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 CAACATGAGCTAGAAGCTAGTACAAAGCAGGCTATCTTTGTTGATTCAAGCATCAATGAT 2160
Query 2269 ACTATACGCACATGTATTGTCCTGGGTAATAACCGTGCTGCAATAAAAGTGAAGACAGAA 2328
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 ACTATACGCACATGTATTGTACTGGGTAATAATCGTGCTGCAATAAAAGTGAAGACAGAA 2220
Query 2329 TTCAAGGTCAGTGATAAAAGATGGTATTGGCTTAAAGCATTTGCTCTCGCTACAATCAAA 2388
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2221 TTCAAGGTCAGTGATAAAAGATGGTATTGGCTGAAAGCATTTGCTCTGGCTACAATCAAA 2280
Query 2389 GACTGGGCAGCGCTTGAAAAGTTTTCGAAGGAAAAGAGACCACCAATGGGGTTTCGTCCA 2448
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2281 GACTGGGCTGCGCTTGAAAAGTTTTCAAAGGAAAAGAGACCACCAATGGGGTTCCGTCCA 2340
Query 2449 TTTGTGGAGGCATGCATTGATGCAGATGAGAAAGCGGAAGCTCTAAAATACATCCCCAAA 2508
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2341 TTTGTGGAGGCATGCATTGACGCAGATGAGAAAGCGGAAGCTCTAAAATACATCCCTAAA 2400
Query 2509 CTGTCTGATCTTGTGGAAAGAGGCGAGGCTTATGCTCGTATTGGAATGGCAAAGGAAGCG 2568
|| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 CTATCAGATCTTGTCGAAAGAGGCGAGGCTTATGCTCGTATTGGAATGGCAAAGGAAGCA 2460
Query 2569 GCTGATTGC-GCAGCTCAGGCAAATGATGGAGGAGAATTGCTTGAGAGATTCAGGAAGAC 2627
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 GCTGAT-GCAGCAGCTCAGGCAAATGATGGAGGAGAATTGCTTGAGAGATTCAGGAAGAC 2519
Query 2628 GTTTGTACAGAATGCTATTTTCGATACCTTGTTAATGCCTTTCCAAGGAGCCTCCTAG 2685
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 GTTTGTACAGAATGCTATTTTCGATACCTTGAAAATGCCTTTCCAAGGAGCCTCCTAG 2577
> Ahg905901 jgi|Araly1|905901|Al_scaffold_0003_3029
Length=1911
Score = 2988 bits (1618), Expect = 0.0
Identities = 1724/1774 (97%), Gaps = 11/1774 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 913 ATGGAAACAAAACAAATTGCTATTGACTACTCTTGTGAGTCAGCCCTTCCTCCGCAGCAA 972
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 ATGGAAACAAAACAAATTGCTATTAACTACTCTTGTGAGTCAGCCCTTCCTCCGCAGCAA 207
Query 973 ATGGCTTGGTGTGGAATGGATAGTGTGCTGCTATATTGGGATGAGGATTTAATGATGGTG 1032
||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 208 ATGGCTTGGTGTGGAATGGATAGCGTTCTTCTCTATTGGGATGAGGATTTAATGA---T- 263
Query 1033 GGTCCTGTAGGAGACCCAGTTCACTATTTCTATGATGAACCTATAATTCTTATCCCAGAA 1092
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 264 GG---TG--GGAGACCCAGTTCACTATTTCTATGATGAACCTGTAATTCTTATCCCAGAA 318
Query 1093 TGCGATGGAGTGAGAATATTATCTAACACGAATCTTGAATTTCTGCAAAGAGTACCTGAT 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 TGCGATGGAGTGAGAATATTATCTAACACGAATCTTGAATTTCTGCAAAGAGTACCTGAT 378
Query 1153 TCTACTGAGTCAATCTTTAAGATTGGAAGCACATCACCTGCAGCTTTGCTATATGATGCT 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 TCTACTGAGTCAATCTTTAAGATTGGAAGCACATCACCTGCAGCTTTGCTATATGATGCT 438
Query 1213 TTGGATCATTTTGACAGGCGAAGTGCTAAGGCAGATGAAAATTTGAGATTAATTCGTTCA 1272
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 TTGGATCATTTTGACCGGCGAAGTGCTAAGGCAGATGAAAATTTGAGATTAATTCGTTCA 498
Query 1273 TCACTGTCGGAGGCTGTTGAATCCTGTATTGATGCCGCTGGACATGAATTTGATGTAACT 1332
||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 TCATTGTCTGAGGCTGTTGAATCCTGTATTGATGCCGCTGGACATGAATTTGATGTAACT 558
Query 1333 CGTCAGAGGGCTCTGTTACGAGCGGCAAGTTATGGACAAGCTTTCTGCAGCAATTTTCAG 1392
||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 CGTCAGAGGGCTCTGGTACGAGCAGCAAGCTATGGACAAGCTTTCTGCAGCAATTTTCAG 618
Query 1393 CGTGAACGTGTCCAAGAGACTTGTAGAACGTTACGGGTTTTAAATGCGGT-TCGTGATCC 1451
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
Sbjct 619 CGTGATCGTGTCCAAGAGACTTGTAGAACGTTACGGGTTTTAAATGCGGTAT-GTGATTC 677
Query 1452 TGCTATTGGCATACCTCTTAGCATTCAGCAGTACAAGTTACTGACACCAGTGGTTTTGAT 1511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 TGCTATTGGCATACCTCTTAGCATTCAGCAGTACAAGTTACTGACACCAGTGGTTTTGAT 737
Query 1512 TAGTCGCCTTATTAATGCTAATTGTCACCTTCTTGCTCTGCGGATATCTGAGTACTTAGA 1571
||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 TAGTCGCCTTATTAATGCTCATTGCCACTTTCTTGCTCTGCGGATATCTGAGTACTTAGA 797
Query 1572 TATGAATAAAGAAGTGGTGATAATGCATTGGGCATGTGCAAAGATAACTGCTTCACCATC 1631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 798 TATGAATAAAGAAGTGGTGATAATGCATTGGGCATGTGCAAAGATAACTGCTTCACCATC 857
Query 1632 AACTCCAGATTCTCATCTTCTTGAAATTTTACTTGATAAGCTCCAACTATGCAAAGGAAT 1691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 AACTCCAGATTCTCATCTTCTTGAAATTTTACTTGATAAGCTCCAACTATGCAAAGGAAT 917
Query 1692 ATCGTATGCTGCAGTGGCCACTCATGCTGATAACTGTGGCCGTCGAAAGTTAGCTGCAAT 1751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 918 ATCGTATGCTGCAGTGGCCACTCATGCTGATAACTGTGGGCGTCGAAAGTTAGCTGCAAT 977
Query 1752 GCTAGTTGAACATGAACCACGCTCCACGAAACAGGTACCTCTTTTATTAAGCATTGGGGA 1811
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 978 GCTAGTTGAACATGAACCACGCTCCACAAAACAGGTACCTCTTCTATTAAGCATTGGGGA 1037
Query 1812 GGAAGACACTGCTTTAGTGAAAGCAACTGAGAGTGGTGACACTGACCTGGTTTATCTGGT 1871
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1038 GGAAGACACTGCTTTAGTGAAAGCAACTGAGAGCGGTGACACCGACCTGGTTTATCTGGT 1097
Query 1872 CATATTTCATATATGGCAAAAGAGGCCTCCTTTGGAATTCTTTGCGATGATCCAAGGAAG 1931
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098 CATATTTCATATCTGGCAAAAGAGGCCTCCTTTGGAATTCTTTGCGATGATCCAAGGAAG 1157
Query 1932 AGTTTTGGCACGTGATCTATTTGTAGCTTATGCACGGTGTCATAAGCATGAATTTCTGAA 1991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1158 AGTTTTGGCACGTGATCTATTTGTAGCTTATGCACGGTGTCATAAACATGAATTTCTGAA 1217
Query 1992 GGATTTCTTCTTATCTACGGGCCAGATTCATGAGGTAGCTTTTCTTTTATGGAAAGAATC 2051
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1218 GGATTTCTTCTTATCTACGGGCCTGATTCATGTGGTAGCTTTTCTATTATGGAAAGAATC 1277
Query 2052 ATGGGATATGGGGAAAAACCCAATGGCTAGCAAAGGATCTCCATTGCACGGTCCGCGCAT 2111
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1278 ATGGGATATGGGGAAAAACCCAACGGCAAGCAAAGGATCTCCGTTGCATGGTCCGCGCAT 1337
Query 2112 AAAACTAATAGAGAAGGCTAGAAACCTTTTCTCCCAAACAAAGGAACACACTTTCGAGTC 2171
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338 AAAACTAATAGAGAAGGCTAGAAACCTTTTCTCCCAGACAAAGGAACACACTTTCGAGTC 1397
Query 2172 TAAGGCTGCTGAGGAACATGCAAAACTCCTGAAGATACAACATGAGCTAGAAGCTAGTAC 2231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1398 TAAGGCTGCTGAGGAACATGCAAAACTCCTGAAGATACAACATGAGCTAGAAGCTTGTAC 1457
Query 2232 GAAGCAGGCTATCTTTGTTGATTCAAGCATCAATGATACTATACGCACATGTATTGTCCT 2291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458 GAAGCAGGCTATCTTTGTTGATTCAAGCATCAATGATACTATACGCACATGTATTGTCCT 1517
Query 2292 GGGTAATAACCGTGCTGCAATAAAAGTGAAGACAGAATTCAAGGTCAGTGATAAAAGATG 2351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518 GGGTAATAACCGTGCTGCAATAAAAGTGAAGACAGAATTCAAGGTCAGTGATAAAAGATG 1577
Query 2352 GTATTGGCTTAAAGCATTTGCTCTCGCTACAATCAAAGACTGGGCAGCGCTTGAAAAGTT 2411
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1578 GTATTGGCTTAAAGCATTTGCTCTCGCTAGAATCAAAGACTGGGCAGCGCTTGAAAAGTT 1637
Query 2412 TTCGAAGGAAAAGAGACCACCAATGGGGTTTCGTCCATTTGTGGAGGCATGCATTGATGC 2471
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638 TTCAAAGGAAAAGAGACCACCAATGGGGTTTCGTCCATTTGTGGAGGCATGCATTGATGC 1697
Query 2472 AGATGAGAAAGCGGAAGCTCTAAAATACATCCCCAAACTGTCTGATCTTGTGGAAAGAGG 2531
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1698 AGATGAGAAAGCGGAAGCTCTAAAATACATCCCCAAACTGTCAGATCTTGTGGAAAGAGG 1757
Query 2532 CGAGGCTTATGCTCGTATTGGAATGGCAAAGGAAGCGGCTGATTGCGCAGCTCAGGCAAA 2591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758 CGAGGCTTATGCTCGTATTGGAATGGCAAAGGAAGCGGCTGATTGCGCAGCTCAGGCAAA 1817
Query 2592 TGATGGAGGAGAATTGCTTGAGAGATTCAGGAAGACGTTTGTACAGAATGCTATTTTCGA 2651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1818 TGATGGAGGAGAATTGCTTGAGAGATTCAGGAAGACGTTTGTACAGAATGCTATTTTCGA 1877
Query 2652 TACCTTGTTAATGCCTTTCCAAGGAGCCTCCTAG 2685
||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1878 TACCTTGAAAATGCCTTTCCAAGGAGCCTCTTAG 1911
Score = 272 bits (147), Expect = 1e-71
Identities = 147/147 (100%), Gaps = 0/147 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 688 ATGTCTGGGATTGCTGAGGTGTTGGTAGCAGTTGGCGATGATATTTTTGTTGTGGAGGAG 747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTGGGATTGCTGAGGTGTTGGTAGCAGTTGGCGATGATATTTTTGTTGTGGAGGAG 60
Query 748 GACATGGTTCAAACTATTAGGTTTGATGAGCCTAGTGTTGATGACTCTGAGATGCAGAAT 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GACATGGTTCAAACTATTAGGTTTGATGAGCCTAGTGTTGATGACTCTGAGATGCAGAAT 120
Query 808 GATGATTCTGGGAATTTGATTGGAGTG 834
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GATGATTCTGGGAATTTGATTGGAGTG 147
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 108519108005
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5