BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G38770.1
Length=4837
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg482889 jgi|Araly1|482889|fgenesh2_kg.4__1949__AT2G38770.1 7971 0.0
Ahg900341 jgi|Araly1|900341|Al_scaffold_0004_991 1225 0.0
> Ahg482889 jgi|Araly1|482889|fgenesh2_kg.4__1949__AT2G38770.1
Length=4789
Score = 7971 bits (4316), Expect = 0.0
Identities = 4641/4796 (97%), Gaps = 30/4796 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 51 ACTTCTCTCTGAGCAAGAAGCTTTCGCGTGAGAG-AATGACGAAGGTCTATGGAACTGGC 109
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1 ACTTCTCTCTGAACAAGAAGCTTTCGCGTGAGAGAAATGACGAAGGTCTATGGAACCGGT 60
Query 110 ACGTACGACTTCAAGCGCCACAGAGTGGCGGAGTATCCATTGGAGTTACCTAGCCATCCT 169
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACGTACGACTTCAAACGCCACAGAGTGGCGGAGTATCCATTGGAGTTACCTAGCCATCCT 120
Query 170 GCTGAGAAGCCTCTAG-AGTCAAAGCCTGGATCTAATTTGCCGAGCTCCATCACTTTATC 228
||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GCTGAGAAGCCACTAGAAG-CAAAGCCTGGATCCAATTTACCGAGCTCCATCACTTTATC 179
Query 229 GGAGATTCAGCAAGATAGGTTAACGAAAATCGCTGAGGAGAGCTGGATTAAGACTGGAGG 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GGAGATTCAGCAAGATAGGTTAACGAAAATCGCTGAGGAGAGCTGGATTAAGACTGGAGG 239
Query 289 TAAGCTCCCTGAGAAACCGTTCGATCCGGAGGTTGTGAAGGAGATTTATGTGACGGAGCT 348
||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 CAAGCTACCGGAGAAACCTTTCGATCCGGAGGTTGTGAAGGAGATTTATGTGACGGAGCT 299
Query 349 TAAGGTAACTAGTGGTCGTAAACCTGTTCCACTTCAGCGAGTTATGATTCTGGAAGTGAG 408
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 300 TAAGGTAACTAGTGGTCGTAAACCGGTTCCACTTCAGCGAGTTATGATTTTGGAAGTGAG 359
Query 409 TCAGTATTTGGAGAACTATCTATGGCCGAATTTTGATCCTGAGACTGCTACGTTCGAGCA 468
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 360 TCAGTATTTGGAGAACTATCTATGGCCGAATTTTGACCCTGAGACGGCTACGTTTGAGCA 419
Query 469 TGTTATGTCTATGATTCTTATGATTAACGAGAAGTTCCGGGAGAATGTGGCAGCTTGGAT 528
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TGTCATGTCTATGATTCTTATGATTAACGAGAAGTTCCGGGAGAATGTGGCAGCTTGGAT 479
Query 529 TTGCTTTCATGATCGGGATGATCTATTCAAAAAGTTTCTACAGAAGGTTCTTCGCCTTAA 588
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TTGCTTTCATGATCGGGACGATCTATTCAAAAAGTTTCTTCAGAAGGTTCTTCGCCTTAA 539
Query 589 AGAGGGAAGAGACTTGACTATTGCTGAGAAGACAAACTATTTGGTCTTCATGATTAATGC 648
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 AGAGGGAAGAGACTTGACTATTGCTGAGAAGACAAATTATTTGGTCTTCATGATTAATGC 599
Query 649 TTTCCAGAGTTTGGAAGACGCAGTGGTTAATGAGATTGTTCTAAGTCTAGCAGGATTACA 708
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TTTCCAGAGTTTGGAAGACGCGGTGGTTAATGAGATTGTTCTAAGTCTAGCAGGATTACA 659
Query 709 ATCTTGGCACAGCTTGTCTTATGGACGTTTCCAGATGGAGCTCTGCCTTCAACCTGATCT 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 ATCTTGGCACAGCTTGTCTTATGGACGTTTCCAGATGGAGCTCTGCCTTCAACCTGATCT 719
Query 769 AATTAAAAAGTGGAAGAGGTCATCAAAGAAATGGGCAGCTGAGGCAAAGTCAAAGGGAGA 828
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 720 AATAAAAAAATGGAAGAGGTCATCAAAGAAATGGGCAGCTGAGGCGAAGTCAAAGGGAGA 779
Query 829 GAAATTTGATTTATCCTCATCCCCTGAAGCAAATTTTGTTCGAGGCCTAATAGAAGAATT 888
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 780 GAAATTTGATCTATCCTCATCACCTGAAGCAAATTTTGTTCGAGGCATAATAGAAGAATT 839
Query 889 CGTTGAGGTGCTTGATCATGGGGTTTTTGCGGATGAGGTTGATGATACTGCTGGATCTCA 948
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 840 CGTCGAGGTGCTTGATCATGGGGTTTTTGCGGATGAGGTTGATGATACTGCTGGGTCTCA 899
Query 949 ATTGGTCGATGATTCTTCTGTCTTATATTGTGAGAGATTCATGGAATTTCTTATTGACAT 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 900 ATTGGTCGATGATTCTTCTGTCTTATATTGTGAAAGATTCATGGAATTTCTCATTGACAT 959
Query 1009 GCTGAACCAACTTCCAACAAGAAGATACCTAAGACCTCTTGTGGCGGATATAGCAGTTGT 1068
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 960 GCTGAACCAACTTCCAACCAGAAGATACCTAAGACCTCTTGTGGCGGATATAGCTGTTGT 1019
Query 1069 TGCCAAATGTCGACTGAGTGCCCTATACAAACATGAAAAAGGGAAGCTTTTCGCCCAACT 1128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 TGCCAAATGTCGACTGAGTGCCCTATACAAACATGAAAAGGGGAAGCTTTTCGCCCAACT 1079
Query 1129 AGTTGACTTGTTACAGTTCTACGAAAAGTTTGAGATAAAGGATCATGATGGAACACAATT 1188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AGTTGACTTGTTACAGTTCTACGAAAAGTTTGAGATAAAGGATCATGATGGAACACAATT 1139
Query 1189 AACTGATGATGAAGCACTTCAATTTCATTACGATCGTTTTATGGCGTTTCAGCTACTTGC 1248
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AACTGATGATGAAGCACTTCAATTTCATTATGATCGTTTTATGGCGTTTCAGCTACTTGC 1199
Query 1249 CTTTAAGAAAATACCTAAGTTGCAAGATCTGTCTTTGGCTAACATTGGTTCGATTCACAA 1308
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1200 CTTTAAGAAAATACCTAAGTTGCAAGATCTGTCTTTGGCTAACATTGGTTCGGTTCACAA 1259
Query 1309 GAGTTCTGATCTTCGGAGGAGATTGTCTGTGCTTTCTCTTGAAGATTTAAGGGATGTTGT 1368
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GAGTTCTGATCTTCGGAGGAGATTGTCGGTGCTTTCTCTTGAAGATTTAAGGGATGTTGT 1319
Query 1369 CTGCTCAAAGCTCAAACTGGTTTCAAGACATGATCCTTGGGCAGATAGTAAAGATTTTCT 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1320 CTGCTCAAAGCTCAAACTGGTTTCAAGACATGATCCTTGGGCAGATAGTAAGGATTTTCT 1379
Query 1429 GACTGAAGTCGTTGTCTCCTCTTTTGAGAAGCAACAGTCTCAGAAAGAAGCAATAAACGC 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 GACTGAAGTCGTTGTCTCCTCTTTTGAGAAGCAACAGTCTCAGAAAGAAGCAATAAACGC 1439
Query 1489 TCTGCCTTTGTACCCAAATGAGCAAATCATGTGGGACGAAAGTGTTATTCCAAGCATTAA 1548
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 CCTGCCTTTGTACCCAAATGAGCAAATCATGTGGGACGAAAGTGTTATTCCAAGCATTAA 1499
Query 1549 TTATTCTGGGGAAGGTTGCCTTGCTCTTCCAAAGCTTAATCTTCAGTTTCTAACACTCCA 1608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TTATTCTGGGGAAGGTTGCCTTGCTCTTCCAAAGCTTAATCTTCAGTTTCTAACACTCCA 1559
Query 1609 TGATTATCTCCTTAGAAACTTCAACCTCTTCCGTCTAGAATCCACCTATGAGATTCGTGA 1668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1560 TGATTATCTCCTTAGAAACTTCAACCTCTTCCGTCTAGAATCCACCTATGAGATTCGGGA 1619
Query 1669 AGATATACAAGAAGCTGTACCACATCTTCTTGCACATATAAATAACGAGGGAGACACTGC 1728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1620 AGATATACAAGAAGCTGTACCACATCTTCTTGCACATATAAATAATGAGGGAGACACTGC 1679
Query 1729 TTTTCGTGGTTGGTCACGAATGGCGGTTCCTATTAATGATTTCAAAATCGCTCAGGTGAA 1788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1680 TTTTCGTGGTTGGTCACGAATGGCGGTTCCTATTAATGATTTCAAAATCGCCCAGGTGAA 1739
Query 1789 ACAGCCTAATATTGGAGAAGAGAAGCCTTCATCTGTGACAGCAGAAGTTACTTTCAGTAT 1848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 ACAGCCTAATATTGGAGAAGAGAAGCCTTCATCTGTGACTGCAGAAGTTACTTTCAGTAT 1799
Query 1849 CAAGAGTTACAGAACGCAGATAAGATCTGAATGGAATTCCCTTAAAGAGCATGACGTGTT 1908
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1800 TAAAAGTTACAGAACGCAGATAAGATCTGAATGGAATTCCCTTAAAGAGCATGACGTATT 1859
Query 1909 GTTTTTGCTTTGTATACGCCCTTCATTTGAGCCATTAGGTCCTGAGGAAGCTGATAAAGC 1968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1860 GTTTTTGCTTTGTATACGCCCTTCATTTGAGCCATTAGGTCCTGATGAAGCTGATAAAGC 1919
Query 1969 TACAGTTCCACAGAGGCTCGGGCTTCAGTATGTTCGTGGTTGTGAAATCATCGATATCCG 2028
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 TACAGTACCACAGAGGCTCGGGCTTCAGTATGTTCGTGGTTGTGAAATCATCGATATCCG 1979
Query 2029 CGATGAGGAGGGTAATCTGATGAATGATTTTACTGGAAGAGTTAAACGGGATGAATGGAA 2088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 CGATGAGGAGGGTAATCTGATGAATGATTTTACTGGAAGAGTTAAACGGGATGAATGGAA 2039
Query 2089 GCCCCCAAAAGGTGAAATGAGGACTGTGACTGTCGCTTTAGATGCTGCACAGTATCATAT 2148
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 GCCCCCAAAAGGTGAAATGAGGACTGTGACTGTTGCTTTAGATGCTGCACAGTATCATAT 2099
Query 2149 AGATGTTACAGACATCGCTGAAAAAGGTGCTGAGGATGTGTATGGCACATTTAATGTGCT 2208
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 AGATGTTACAGACATGGCTGAAAAAGGTGCTGAGGATGTGTATGGCACATTTAATGTGCT 2159
Query 2209 AATGAGGAGGAAACCAAAAGAGAACAACTTCAAGGCTATTCTGGAATCTATCAGAGATCT 2268
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 AATGAGGAGGAAACCAAAGGAGAACAACTTCAAGGCTATTCTGGAATCTATCAGAGATCT 2219
Query 2269 TATGAACGAATATTGTATTGTGCCGGAGTGGTTGCATAATGTTTTTCTTGGGTATGGCAA 2328
|||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 TATGAATGAATATTGCATTGTGCCGGAGTGGCTGCATAATGTTTTTCTTGGGTATGGCAA 2279
Query 2329 CCCTTCTGCTGCACAGTGGCCTAATATGCCAAACCTGTTGGAAATAGTGGACTTCAAAGA 2388
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2280 CCCTTCTGCTGCACAGTGGCCTAATATGCCAAACCTGTTGGAAACAGTGGACTTCAAAGA 2339
Query 2389 CACTTTCCTTAATGCAAATCATCTCAGTGAAAGTTTTTCAGATTATGAGGTTTCTTTCAT 2448
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2340 TACTTTCCTTGATGCAAATCATCTCAGTGAAAGTTTTCCAGATTATGAGGTATCTTTCAT 2399
Query 2449 CAATGCTGAAGGTGCTGAAGCTCTGGATCCAAGTCCTCCGTTTCGAATCACTCTTCCAAA 2508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 CAATGCTGAAGGTGCTGAAGCTCTGGATCCAAGTCCTCCGTTTCGAATCACTCTTCCAAA 2459
Query 2509 GACACTAAAAGGAAATGGTGCTATTTCTGGAAACAAGATATCTGAAGTGAATCCAGCAGA 2568
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2460 GACACTAAAAGGAAATGCTGCTATTTCTGGAAACAAGATATCTGAAGTCAATCCAGCAGA 2519
Query 2569 TAATGTTAATATGGTGGATGCTTCCCCGAAGGAGAAACTTATTGTTGAGGCATATACCCC 2628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 CAATGTTAATATGGTGGATGCTTCCCCGAAGGAGAAACTTATTGTTGAGGCATATACCCC 2579
Query 2629 ACCTGACCCAGGGCCTTATCCTCAGGACCAGCCGAAGCAGAACTCAGTTAAATTTACACC 2688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2580 ACCTGACCCAGGGCCTTATCCTCAGGACCAGCCGAAGCAGAACTCTGTCAAATTTACACC 2639
Query 2689 TACACAGGTTGGAGCAATTATCTCTGGTATTCAGCCTGGGCTAACTATGGTGGTTGGTCC 2748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 TACACAGGTTGGAGCAATTATCTCTGGTATTCAGCCTGGGCTAACTATGGTGGTTGGTCC 2699
Query 2749 ACCAGGTACCGGAAAGACTGATACAGCAGTGCAAATTTTGAATGTTCTATACCACAACTG 2808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 ACCAGGTACCGGAAAGACTGATACAGCAGTGCAAATTTTGAATGTTCTATACCACAACTG 2759
Query 2809 TCCTTCTCAGAGGACATTGATAATCACTCATTCAAATCAGGCTTTGAATGATCTTTTTGA 2868
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2760 TCCTTCTCAGAGGACCTTGATAATCACTCATTCAAATCAGGCTTTGAATGATCTTTTTGA 2819
Query 2869 GAAGATAATGGAGAGGGATGTACCAGCGCGGTATCTACTTCGTTTGGGTCAAGGTGAACA 2928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 GAAGATAATGGAGAGGGATGTACCAGCGCGGTATCTACTTCGTTTGGGTCAAGGTGAACA 2879
Query 2929 AGAGCTTGCCACTGATCTTGACTTTAGCAGACAAGGCCGTGTCAATGCCATGCTTGTTCG 2988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 AGAGCTTGCCACTGATCTTGACTTTAGCAGACAAGGCCGTGTCAATGCCATGCTTGTTCG 2939
Query 2989 GCGTCTGGAACTCCTCAGTGAGGTTGAGAGACTAGCAAGATCTCTTCAGCTTCCAGAGGA 3048
|||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 GCGTTTGGAACTGCTTAATGAGGTTGAGAGACTAGGAAGATCTCTTCAGCTTCCAGAGGA 2999
Query 3049 TGTAGGATATACTTGTGAAACAGCTGGATATTTCTGGTTGCTTCATGTATACTCGCGTTG 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3000 TGTAGGATATACTTGTGAAACAGCTGGATATTTCTGGTTGCTTCATGTATACTCGCGCTG 3059
Query 3109 GGAGCTGTTTCTCGCAGCTTGTGCAGGAAATGAAGACAATCAATCTTTTGTGCGAGATCG 3168
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3060 GGAGTTGTTTCTCGCTGCTTGTGCAGGAAATGAAGACAATCAATCTTTTGTTCGAGATCG 3119
Query 3169 CTTCCCGTTCAAAGATTTCTTCTCAGACACCCCTAAACCTGTTTTTAATGGGGAGTCATT 3228
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 3120 CTTCCCGTTCAAAGATTTCTTCTCAGACACCCCTAAACCTGTATTTAGTGGGGAGTCATT 3179
Query 3229 TGAGAAAGACATGAGGGCAGCTAAAGGTTGTTTCTCTCATCTCAAGACTGTGTTCCAAGA 3288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 TGAGAAAGACATGAGGGCAGCTAAAGGTTGTTTCTCTCATCTCAAGACTGTGTTCCAAGA 3239
Query 3289 GCTAGAAGAGTGTAGGGCCTTTGAACTACTCAAGTCAACTGCTGATAGAGCAAATTATCT 3348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3240 GCTAGAAGAGTGTAGGGCCTTTGAACTACTCAAGTCAACTGCTGATAGAGCAAATTATCT 3299
Query 3349 GATGACCAAACAAGCAAAGATTGTAGCAATGACGTGTACTCATGCTGCATTAAAGAGGAG 3408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3300 GATGACCAAACAAGCAAAGATTGTAGCAATGACGTGTACTCATGCGGCATTAAAGAGGAG 3359
Query 3409 AGATTTTCTTCAGTTAGGGTTCAAATATGATAACTTATTGATGGAAGAAAGTGCTCAGAT 3468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 AGATTTTCTTCAGTTAGGGTTCAAATATGATAACTTATTGATGGAAGAAAGTGCTCAGAT 3419
Query 3469 TTTGGAAATTGAGACTTTCATACCAATGCTGCTTCAGAGGCAAGAAGATGGTCATGCACG 3528
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 TTTGGAAATTGAAACTTTCATACCAATGTTGCTTCAGAGGCAAGAAGATGGTCATGCACG 3479
Query 3529 ACTCAAGCGCTGTATATTGATTGGTGATCACCACCAGCTGCCTCCCGTGGTGAAGAATAT 3588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 ACTCAAGCGCTGTATATTGATTGGTGATCACCACCAGCTGCCTCCCGTGGTGAAGAATAT 3539
Query 3589 GGCTTTCCAGAAATATAGTCACATGGATCAGAGTTTGTTTACGAGGTTTGTTCGTCTTGG 3648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 GGCTTTCCAGAAATATAGTCACATGGATCAGAGTTTGTTTACGAGGTTTGTTCGTCTTGG 3599
Query 3649 TATTCCTTATATTGAGCTCAATGCTCAAGGAAGAGCCAGGCCAAGTTTAGCCAAACTCTA 3708
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 3600 TATTCCTTATATTGAGCTCAATGCTCAAGGAAGAGCCAGGCCAACCTTAGCCAAACTTTA 3659
Query 3709 CAACTGGAGATACAGAGATTTAGGAGACCTTTCCATTGTTAAGGAAGCACCCATCTTCCA 3768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 CAACTGGAGATACAGAGATTTAGGAGACCTTTCCATTGTTAAGGAAGCACCCATCTTCCA 3719
Query 3769 AAGAGCAAATGCTGGATTCTCATATGAATATCAGTTGGTGAATGTGCCTGATTATGAGGG 3828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3720 AAGAGCAAATGCTGGATTCTCATATGAATATCAGTTGGTGAATGTGCCTGATTATGAGGG 3779
Query 3829 GAGAGGAGAATCAACACCATCTCCTTGGTTTTATCAAAATCAGGGAGAAGCTGAATATAT 3888
|| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3780 GAAAGGAGAATCGACACCATCTCCATGGTTTTATCAAAATCAGGGAGAAGCTGAATATAT 3839
Query 3889 CGTCAGTGTCTATATATACATGAGATTGTTAGGATATCCTGCGAATAAGATATCAATATT 3948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3840 CGTCAGTGTCTATATATACATGAGATTGTTAGGATATCCTGCGAATAAGATATCAATATT 3899
Query 3949 GACAACATATAATGGTCAGAAGCTCTTAATCCGTGATGTTATCAACCGACGATGTGTTCC 4008
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3900 GACAACATATAATGGTCAGAAGCTCTTAATCCGTGATGTTATCAACCGTCGATGTGTTCC 3959
Query 4009 GTATCCTTTCATTGGCCCGCCGAGCAAGGTGACTACAGTGGACAAGTTCCAAGGACAACA 4068
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3960 ATATCCATTCATTGGCCCGCCGAGCAAGGTGACGACAGTGGACAAGTTCCAAGGACAACA 4019
Query 4069 GAATGATTTCATATTGCTCTCTCTTGTACGGACACGCTTCGTAGGTCATCTACGTGATGT 4128
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4020 GAATGATTTTATATTGCTCTCTCTTGTACGGACACGCTTTGTAGGTCATCTACGTGATGT 4079
Query 4129 AAGAAGGTTGGTAGTTGCAATGTCACGTGCTCGGCTCGGTTTGTATGTGTTCTGCCGCCG 4188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4080 AAGAAGGTTGGTAGTTGCAATGTCACGTGCTCGGCTCGGTTTGTATGTGTTCTGCCGTCG 4139
Query 4189 TTCGCTCTTTGAACAATGCTATGAGCTGCAACCAACGTTTCAACTTCTTCTTCAAAGACC 4248
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4140 TTCTCTCTTTGAACAATGCTATGAGCTGCAACCAACGTTTCAACTTCTTCTTCAAAGACC 4199
Query 4249 CGATCGGCTCGGACTCAATTTTAATGAGAACACAGCATATACAGATCGTG-TGGTGGAGG 4307
||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||
Sbjct 4200 CGATCGGCTCGGACTCAATCTCAATGAGAACACAACGTATACAGATCGTGCTG-TGGAGG 4258
Query 4308 AAGTTGAAAATTCTTATCTCGTTCATGATGTTGAAGAGATGGCACACATAGTTGACGACA 4367
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
Sbjct 4259 AAGTTGGAAATCCTTATCTCGTTCATGATGTTGAAGAAATGGCACACATAGTTCACGATA 4318
Query 4368 GGATGAACAAGTTCTACCAGGCACAAGGAGCT-TATGAGCAATACCAAAACAACATGGCA 4426
|||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 4319 GGATGAACCAGTTCTACCAGGCACAAGGAG-TGTATGAGCAATACCAGAACAACATGCCA 4377
Query 4427 CAGATGGAAGATGGTAATCACGACATGGAGAGTGATTCAGTAGTAG-A--TG--G-TG-- 4478
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||
Sbjct 4378 CAGATGGAAGATGGTAATCACGACATGGAGAGTGATTCAGTAGTAGGAACTGTAGATGGT 4437
Query 4479 -ATGAATCTGaaaaaaaTATGCAGCAGCTAAACCAATCTCCAGACATAGACGGTGAATTA 4537
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 4438 GATGAATCTGAGAAAAATATGCAGCAGCTAAAACAAGCTCCAGACATAGACAGTGAATTC 4497
Query 4538 TCGAAGGAGGTGGTTGGAATGGAGGTGGACAATAATGGATTTAGCAGTGAGAATGGAAAG 4597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4498 TCGAAGGAGGTGGTTGGAATGGAGGTGGACAATAATGGATTTAGCAGTGAGAATGGAAAG 4557
Query 4598 GCTGATGAGAAGAATTAGGACAAAACAAACTGGGAATTTCAAAGTTATCCTTTCGGGAGG 4657
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||
Sbjct 4558 GCTGATGAGAAGAATTAGGACAAATCAAACTGGGAATATCAAATTTATCCACTCGG-AGG 4616
Query 4658 GTGATAAGTGAGTTGATGTTTGAAACATG-G--AttttttttGCTACTGTAAGATAAT-T 4713
||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||| ||| |
Sbjct 4617 GTGATAAGTGAGTTGATGTTTGAAACATGAGGGAATTTGTT-GCTACTGTAAGA-AATAT 4674
Query 4714 TTACTGCATTTGAGTAAATTCTGGTAAGTGATACATGACAT-GAGGaaaaaaaTAGCATT 4772
|||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 4675 TTACTGAATTTGAGTAAATTCTGGTAAGTGTTATATGACACCGAGGAAAAAG-TAGCATT 4733
Query 4773 GTCTGAC----CTT-CCTCACCGACTTTTTGTAACTTCTAGTTGAGTATTCAAGCT 4823
||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 4734 GTCTGACAATTCTTTCCTCACCAACTTTTTGTAACTTCTATTTGAGTTTTCAAGCT 4789
> Ahg900341 jgi|Araly1|900341|Al_scaffold_0004_991
Length=2322
Score = 1225 bits (663), Expect = 0.0
Identities = 728/759 (96%), Gaps = 5/759 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2882 AGGGATGTACCAGCGCGGTATCTACTTCGTTTGGGTCAAGGTGAACAAGAGCTTGCCACT 2941
|||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 694 AGGGATGTACAAGCGCGGTATCTACTGCGTTTAGGTCAAGGTGAACAAGAGCTTGCTACT 753
Query 2942 GATCTTGACTTTAGCAGACAAGGCCGTGTCAATGCCATGCTTGTTCGGCGTCTGGAACTC 3001
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 GATCTTGACTTTAGCAGACAAGGCCGTGTCAATGCCATGCTTGTTCGGCGTCTGGAACTG 813
Query 3002 CTCAGTGAGGTTGAGAGACTAGCAAGATCTCTTCAGCTTCCAGAGGATGTAGGATATACT 3061
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CTCAATGAGGTTGAGAGACTAGCAAGGTCTCTTCAGCTTCCAGAGGATGTAGGATATACT 873
Query 3062 TGTGAAACAGCTGGATATTTCTGGTTGCTTCATGTATACTCGCGTTGGGAGCTGTTTCTC 3121
|||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||
Sbjct 874 TGTGAAACAGCTGGGTATTTCTGGTTGCTTCATATATGCTCGCGCTGGGAGCTATTTCTC 933
Query 3122 GCAGCTTGTGCAGGAAATGAAGACAATCAATCTTTTGTGCGAGATCGCTTCCCGTTCAAA 3181
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 934 GCTGCTTGTGCAGGAAATGAAGACAATCAATCTTTTGTTCGAGATGGCTTCCCGTTCAAA 993
Query 3182 GATTTCTTCTCAGACACCCCTAAACCTGTTTTTAATGGGGAGTCATTTGAGAAAGACATG 3241
||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 994 GATTTCTTCTCAGACACCCCTAAACCTGTATTTAGTGGGGAGTCATTTGAGAAAGACATG 1053
Query 3242 AGGGCAGCTAAAGGTTGTTTCTCTCATCTCAAGACTGTGTTCCAAGAGCTAGAAGAGTGT 3301
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054 AGGGCAGCTAAAGGTTGTTTCTCTCATATCAAGACTGTGTTCCAAGAGCTAGAAGAGTGT 1113
Query 3302 AGGGCCTTTGAACTACTCAAGTCAACTGCTGATAGAGCAAATTATCTGATGACCAAACAA 3361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114 AGGGCCTTTGAACTACTCAAGTCAACTGCTGATAGAGCAAATTATCTGATGACCAAACAA 1173
Query 3362 GCAAAGATTGTAGCAATGACGTGTACTCATGCTGCATTAAAGAGGAGAGATTTTCTTCAG 3421
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174 GCAAAGATTGTAGCAATGATGTGTACTCATGCGGCATTAAAGAGGAGAGATTTTCTTCAG 1233
Query 3422 TTAGGGTTCAAATATGATAACTTATTGATGGAAGAAAGTGCTCAGATTTTGGAAATTGAG 3481
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1234 TTAGGGTTCAAATATGATAACTCATTGATGGAAGATAGTGCTCAAATTTTGGAAATTGAG 1293
Query 3482 ACTTTCATACCAATGCTGCTTCAGAGGCAAGAAGATGGT---CATGCACGACTCAAGCGC 3538
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1294 ACTTTCATACCAATGTTGCTTCAGAGGCAAGAAGATGGTGGTCATGCACGACTCAAGCGC 1353
Query 3539 TGTATATTGATTGGTGATCACCACCAGCTGCCTCCCGTGGTGAAGAATATGGCTTTCCAG 3598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354 TGTATATTGATTGGTGATCACCACCAGCTGCCTCCCGTGGTGAAGAATATGGCTTTCCAG 1413
Query 3599 A-AAT-ATAGTCACATGGATCAGAGTTTGTTTACGAGGT 3635
| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1414 AGAAAGATAGTCACATGGATCAGTGTTTGTTTACGAGGT 1452
Score = 819 bits (443), Expect = 0.0
Identities = 540/582 (93%), Gaps = 25/582 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 2174 GGTGCTGAGGATGTGTATGGCACATTTAATGTGCTAATGAGGAGGAAACCAAAAGAGAAC 2233
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||
Sbjct 139 GGTGCTGAGGATGTGTATAGCACATTTAATGTGCTAAT---GAGGAAGCCAAAGGAGAAC 195
Query 2234 AACTTCAAGGCTATTCTGGAATCTATCAGAGATCTTATGAACGAATATTGTATTGTGCCG 2293
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 196 AACTTCAAGGCTATTCTGGAATCTATCAGAGATCTCATGAATGAATATTGTATTGTGCCG 255
Query 2294 GAGTGGTTGCATAATGTTTTTCTTGGGTATGGCAACCCTTCTGCTGCACAGTGGCCTAAT 2353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256 GAGTGGTTGCATAATGTTTTTCTTGGGTATGGCAACCCTTCTGCTGCACAGTGGCCTAAT 315
Query 2354 ATGCCAAACCTGTTGGAAATAGTGGACTTCAAAGACACTTTCCTTAATGCAAATCATCTC 2413
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 ATGCCAAACCTGTTGGAAACAGTGGACTTCAAAGATACTTTCCTTAATGCAAATCATCTC 375
Query 2414 AGTGAAAGTTTTTCAGATTATGAGGTTTCTTTCATCAATGCTGAAGGTGCTGAAGCTCTG 2473
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 AGTGAAAGTTTTCCAGATTATGAGGTATCTTTCATCAATGCTGAAGGTGCTGAAGCTCTG 435
Query 2474 GATCCAAGTCCTCCGTTTCGAATCACTCTTCCAAAGACACTAAAAGGAAATGGTGCTATT 2533
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 436 GATCCAAGTCCTCCGTTCCGAATCACTCTTCCAAAGACACTAAAAGGAAATGCTGCTATT 495
Query 2534 TCTGGAAACAAGATATCTGAAGTGAATCCAGCAGATAATGTTAATATGGTGGATGCTTCC 2593
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 TCTGGAAACAAGATATCTGAAGTCAATTCAGCAGACAATGTTAATATGGTGGATGCTTCC 555
Query 2594 CCGAAGGAGAAACTTATTGTTGAGGCATATACCCCA-CCTGACCCAGGGCCTTATCCTCA 2652
||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||
Sbjct 556 CCGAAGGAGAAACTTATTGTTGAGGCATATACCTCAACCGGACCCAGGGCGTTATCCTCA 615
Query 2653 GGACCAGCCGAAGCAGAACTCAGTTAAATTTACACCTACACAGGTTGGAGCAATTATCTC 2712
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 616 GGACCAGCCGAAGCAGAACTCAGTT-----------------GG----AGCAATTATCTC 654
Query 2713 TGGTATTCAGCCTGGGCTAACTATGGTGGTTGGTCCACCAGG 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 TGGTATTCAGCCTGGGCTAACTATGGTGGTTGGTCCACCAGG 696
Score = 662 bits (358), Expect = 0.0
Identities = 462/510 (91%), Gaps = 15/510 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 3676 AGGAAGAGCCAGGCCAAGTTTAGCCAAACTCTACAACTGGAGATACAGAGATTTAGGAGA 3735
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1449 AGGTAGAGCCAGGCCAAGCTTAGCCAAACTCTACAACTGGAGATACAGGGATTTAGGAGA 1508
Query 3736 CCTTTCCATTGTTAAGGAAGCACCCATCTTCCAAAGAGCAAATGCTGGATTCTCATATGA 3795
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1509 CCTTTCCATTGTTAAGAAAGCACCCATCTTCCAGAGAGCAAATACTGGATTCTCATATGA 1568
Query 3796 ATATCAGTTGGTGAATGTGCCTGATTATGAGGGGAGAGGAGAATCAACACCATCTCCTTG 3855
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1569 ATATCAGTTGGTGAATGTGCCTGACTATGAGGGGAAAGGAGAATTGACACCATCTCCATG 1628
Query 3856 GTTTTATCAAAATCAGGGAGAAGCTGAATATATCGTCAGTGTCTATATATACATGAGATT 3915
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGTTTATCAAAATCAGGGAGAAGCTGAATGTATCGTCAGTGTCTATATATACATGAGATT 1688
Query 3916 GTTAGGATATCCTGCGAATAAGATATCAATATTGACAACATATAATGGTCAGAAGCTCTT 3975
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1689 GTTAGGATATCCTGTGAATAAGATATCAATATTGACAACATTTAATGGTCAGAAGCTCTT 1748
Query 3976 AATCCGTGATGTTATCAACCGACGATGTGTTCCGTATCCTTTCATTGGCCCGCCGAGCAA 4035
|||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1749 AATCTGTGATGTTATCAACCGTCGATGTGTTCCCTATCCATTCATTGGCCCTCCGAGCAA 1808
Query 4036 GG--T---GACTACAGT---GGACAAGT--TC-C-A-AG-G-ACAACAGAATGATTTCAT 4080
|| | | | || | || | | | | || | ||||||||||||||| ||
Sbjct 1809 GGCATTTTGGTTGCAATTTTGGTTTTTTGGTGACTACAGTGGACAACAGAATGATTTTAT 1868
Query 4081 ATTGCTCTCTCTTGTACGGACACGCTTCGTAGGTCATCTACGTGATGTAAGAAGGTTGGT 4140
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1869 ATTGCTCTCTCTTGTACGGACACGCTTTGTAGGTCATCTACGTGATGTAAGAAGGTTGGT 1928
Query 4141 AGTTGCAATGTCACGTGCTCGGCTCGGTTT 4170
|||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1929 AGTTGCAATGTCACGTGCTCGGCTTGGTTT 1958
Score = 274 bits (148), Expect = 4e-72
Identities = 273/325 (84%), Gaps = 41/325 (13%)
Strand=Plus/Plus
Query 4301 GTGGAGGAAGTTGAAAATTCTTATCTCGTTCATGATGTTGAAGAGATGGCACACATAGTT 4360
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2029 GTGGAGGAAGTTGGAAATCCTTATCTCGTTCATGATGTTGAAGAGCTGGCACACATAGTT 2088
Query 4361 GACGACAGGATGAACAAGTTCTACCAGGCACAAGGAGCTTATGAGCAATACCAA-AACAA 4419
|||| ||||||||| |||||| | | | |||||| | ||| ||| |||||
Sbjct 2089 CACGATAGGATGAACCAGTTCT---A--C-C-AGGAGC------G--ATA-CAAGAACAA 2132
Query 4420 CATGGCACAGATGGAAGATGGTAATCACGACATGGAGAGTGATTC---AGT---A---GT 4470
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||
Sbjct 2133 CATGCCACAGACGGAAGATGGTAATCACGACATGGAGAGTGATTCAGTAGTAGGAGCTGT 2192
Query 4471 AGATGGTGATGAATCTGaaaaaaaTATGCAGCAGCTAAACCAATCTCCAGACATAGACGG 4530
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2193 AGATGGTGATGAATCTGAGAAAAATATGCAGCAGCTAAACCAAGCTCCAGACATAGACGG 2252
Query 4531 TGAATTATCGAAGGAGGTGGTTGGAATGGAGGTGGACAATAATGGATTTAGCAGTGAGAA 4590
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 TGAATTATCGAAGGAGGTGG----A-----------CAATAATGGATTTAGCAGTGAGAA 2297
Query 4591 TGGAAAGGCTGATGAGAAGAATTAG 4615
|||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2298 TGGAAAGGCTGATGAGAAAAATTAG 2322
Score = 233 bits (126), Expect = 8e-60
Identities = 132/135 (98%), Gaps = 0/135 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1907 TTGTTTTTGCTTTGTATACGCCCTTCATTTGAGCCATTAGGTCCTGAGGAAGCTGATAAA 1966
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 7 TTGTTTTTGCTTTGTATACGCCCTTCATTTGAGCTATTAAGTCCTGAGGAAGCTGATAAA 66
Query 1967 GCTACAGTTCCACAGAGGCTCGGGCTTCAGTATGTTCGTGGTTGTGAAATCATCGATATC 2026
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 GTTACAGTTCCACAGAGGCTCGGGCTTCAGTATGTTCGTGGTTGTGAAATCATCGATATC 126
Query 2027 CGCGATGAGGAGGGT 2041
|||||||||||||||
Sbjct 127 CGCGATGAGGAGGGT 141
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 183056926130
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5