BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G38950.1
Length=2482
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg482914 jgi|Araly1|482914|fgenesh2_kg.4__1974__AT2G38950.1 3446 0.0
Ahg900344 jgi|Araly1|900344|Al_scaffold_0004_994 876 0.0
> Ahg482914 jgi|Araly1|482914|fgenesh2_kg.4__1974__AT2G38950.1
Length=2378
Score = 3446 bits (1866), Expect = 0.0
Identities = 2195/2355 (93%), Gaps = 18/2355 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 52 TGAATGTGTAATG-TCTCATAAGTCTTCGGATCTCACTTCGTCCGGGAAGTTGCATCTTT 110
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 28 TGAATGTGTAATGTTCTCATAAGTCATCGGATCTCACTTCGTCCGGGAAGTTGCATCTAT 87
Query 111 ATTGACCTCATCTGAAGTTCAATTTATTTCGTCTTCCGG-AAATCAATCCTTTTGGTGGC 169
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||
Sbjct 88 ATTGATCTCATCTGAAGTTCAATTTATTTCCTCTTCGGGAAAAT-AATCCTTTTGGTGGC 146
Query 170 TGTAAGGTTTAATGGGCATTGAAGGTGTATCAACGTATTTGAAATCTGGAAATATGGACA 229
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 147 TGTAAGGTTTAATGGGCATTGAAGGTGTGCCTACGTATTCAAAATCTGGAAATATGGACA 206
Query 230 CAATTTCTGCTCCGCCAGGTTTTGTATCTCAAACATCGTTTGTGCTGAGGAATGTACCCC 289
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 207 TAATTTCAACTCCGCCAGGTTTTGTATCTCAAACATCGTTTGTGCTGAGGAATGTACGTC 266
Query 290 GAGACAAAGAAAGTCCCAGGTCCGTGTCGAGACAAGAGCAGACAACTGGATTCGGCACAG 349
|||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267 GAGACAAAGAAAGTTCCAGGTCGGTGTCGACACAAGAGCAGACAACTGGATTCGGCACAG 326
Query 350 ATGATAAAGATAGTTGCAATATGTTTCTTA-AAAGCCGACCGTGGATAGTGCATGGTCAC 408
||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 ATGGTGAAGATAGTTGCAATATGTTTCTTACAAA-CCGACCGTGGATAGTGCATGGTCAC 385
Query 409 ACAATTCCCAGCTCAGAGGCCTTAAGGCCGaaaaaaaCTGAGGTACGGAGAAGACGGCCC 468
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 ACAATTCCCAGCTTAGAGGCCTTAAGGCCGAGAAAAACTGAGGTACGGAGAAGACGGCCC 445
Query 469 CTCAAAGTGTCTGAGACCAAAGTCCTTGAGGAAGCTCCTGTGTTCAACCCAACCGAAGAG 528
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 446 CTCAAAGTGTCTGAGACCGAAGTCCTTGAGGAAGCTCCTGTGTTCAACCCAACCGAAGAG 505
Query 529 GAATTCAGGGACACACTCTCATATATATCAAGCTTGCGTGACAGAGCTGAGCCGTATGGA 588
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506 GAATTCAGTGACACACTTTCATATATATCAAGCTTGCGTGACAGAGCTGAGCCGTATGGA 565
Query 589 ATCTGTTGTGTTGTTCCTCCACCTTCATGGAAACCTCCATGTCTTCTCAAGGAGAAACAA 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 566 ATCTGTTGTGTTGTTCCTCCACCTTCATGGAAACCTCCATGTCTTCTCAAGGAGAAAAAA 625
Query 649 ATATGGGAGGCTTCTACATTTTTCCCTCAAGTTCAGCTCTTTGGAATTCAGACCGAGAAC 708
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 626 ATATGGGAGGCTTCTACATTTTTCCCTCAAGTTCAGCTCTTTGGAAGTCATACCGAGAAC 685
Query 709 CGAAAGATTAAAAAGGAGGTTGATGCAGATAGTAATGATGCTGCATCTGAAGGG-GTTCA 767
| |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| || |||||
Sbjct 686 CCAAAGATTAAAAAGGCGGCTGATGCGGATAGTGATGATGCTGCACCTGA-GGAAGTTCA 744
Query 768 GTTATGTAGAGTAGAACGTGGTCCTGGGTATACTTTGAAGTCCTTTAAAAACTTTGCAGA 827
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||
Sbjct 745 GTTTTGTAGAATAGAACGTGGTCCTGGGTATACTTTGGAGACCTTTAAAGTCTTTGCAGA 804
Query 828 TACATACAAGAAGAGTCATTTTGGCATGAAGGATGAGGTTTTGGGTTCAGAGAACTCATC 887
| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 805 TTCATACAAGAAGAGACATTTTAGCACGAAGGATGAGGTTCTGGGTCCAGAGAACTCATC 864
Query 888 TCCATCACTTAAACCAAATGAGCTAATTGTGGCAGACATTGAAAAAGAGTACAGACAAAT 947
| |||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| |
Sbjct 865 TACATCACTTAAACCAGAGGAGCTTACTGTGGCAGAAATTGAAAAAGAGTATAGACAACT 924
Query 948 TGTTGAGAGTCCACTTATTGAAATTGGGGTGCTTTATGGCAATGATTTAGACACTGCAAC 1007
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 925 TGTTGAGAGTCCACTTGTTGAAATTGGGGTGCTTTATGGCAATGATCTAGACACCACAAC 984
Query 1008 GTTTGGAAGTGGATTTCCCTTATCTGCACCATCTGAATCTAGCAAATATTCATCAGGTTG 1067
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||
Sbjct 985 GTTTGGAAGTGGATTTCCCTTATCTGCACCATCTGAGTCTTGCAAGTACCCATCAGGTTG 1044
Query 1068 GAATCTGAACAGTACGGCTAAGCTTCCTGGTTCTCTTCTATCATTAGAAGACTGCGAATC 1127
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1045 GAATCTGAATAGTACGGCTAAGCTTCCTGGTTCTCTTCTATCATTAGAAGACTGTGAATC 1104
Query 1128 -AGTTTGTGTTCCTCGTCTAAGTGTAGGAATGTGCTTGTCTTCCCAGTTCTGGAAATCTG 1186
| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 TA-TTTGTGTTCCTCGCCTAAGTGTAGGAATGTGCTTGTCTTCCCAGTTCTGGAAATCTG 1163
Query 1187 AGAAGGAGAGACTCTACTCTCTCTGCTATTTGCATGTGGGCG---CTCCTAGAGTGTGGT 1243
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1164 AGAAGGAGAGACTCTACTCTCTCTGCTATTTGCATGTGGGCGGTGCTCCTAGAGTGTGGT 1223
Query 1244 ATTCCGTAGCAGGATGTCATCGATCAAAGTTTAAGGCTGCCATGAAAAGCTTCATCCTTG 1303
|||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||
Sbjct 1224 ATTCTGTAGCGGGATGTCATCGATCAAAGTTTACGGCTGCCATGAAGAGCTTAATCCCTG 1283
Query 1304 AGATGTCAGGAGAACAGCCAAAGAAGAGTCATAA-TCC--TGTGATGATGATGTCTCCAT 1360
|||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||| | |
Sbjct 1284 AGATGTCAGGAGAACAACCAAAGAAGAATCATAACTTCGATGTGATGATAATGTCTGCTT 1343
Query 1361 ATCAATTGAGCGTGGAGGGTATACCAGTGACCCGCTGTGTCCAGCACCCTGGCCAGTATG 1420
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1344 ATCAATTGAGCATGGAGGGTATACCAGTGACCCGCTGTGTCCAGAACCCTGGCCAGTATG 1403
Query 1421 TTATTATATTTCCAGGGTCGTATTACTCTGCCTTTGACTGTGGCTTCAACTGTTTGGAGA 1480
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 TTATTATATTTCCAGGCTCGTATTACTCTGCCTTTGACTGTGGCTTCAACTGTTTGGAGA 1463
Query 1481 AAGCAAACTTTGCTCCCCTTGATTGGTTGCCCCATGGGGATATTGCTGTTCAGGTGAATC 1540
||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1464 AAGCAAATTTTGCTCCACTTGATTGGTTGCCGCATGGGGATATTGCTGTTCAGCTGAATC 1523
Query 1541 AAGAGATGAGTAAAACGTCGCTGATATCGTATGATAAGCTATTATTTAGTGCTGCAAGGG 1600
|||||| |||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1524 AAGAGAAGAGTAAAAAGTCGTTAATTTCGTACGATAAGCTATTATTAAGTGCTGCAAGGG 1583
Query 1601 AAGCTGTAAAATGTCTTAAGGAATATGGGTTGTCGAAGAAAAACACAGCATGTTACACGA 1660
||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584 AAGCTGTGAAATGTCTTAAGGAATATGCTTTGTCCAAGAAAAACACAGCATGTTACACGA 1643
Query 1661 GATGGAATGATTCTTGTGGGACGGATGGGTTGTTCTCCAACATAATCAAGTCACGGATCA 1720
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1644 GATGGAATGATTCTTGTGGGACAGATGGGTTATTCTCCAACATAGTCAAGTCACGGATCA 1703
Query 1721 AACTGGAGAAAAATAGACGTGAATTTCTTATCAGTTCACTAGAATCGCAAAGGATGGACA 1780
| | ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 AGCAGGAGAAAAACAGACGTGAATTTCTTAGCAATACACTAGAATCGCAAAGGATGGACA 1763
Query 1781 AGAGTTATGATGCTGTGAACAAAAGGGAATGCTGTGTATGTCTTGGGGATTTGTATCTTT 1840
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764 AGAGTTATGATGCTGTGAGCAAAAGAGAATGCTGTGTATGTCTTGGGGATTTGTATCTTT 1823
Query 1841 CCGCGGTTAACTGTTCATGCTCTGCTAATCGTTACTCGTGTCTGAACCACATGAGGAAGC 1900
|||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1824 CCGCTGTTAAATGTTCATGCTCAGCTGATCGTTACTCGTGTCTGAGCCACATGAGGAAGC 1883
Query 1901 TCTGTGCATGTCCGTGTGACAGAAAGAGTTTTCTCTATAGGTACACTATGGATGAGTTGA 1960
||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1884 TCTGTGCCTGTCCGAGTGACAGAAAGAGTTTTCTCTATAGGTACACTATCGAAGAGTTGA 1943
Query 1961 ATCTTCTCGTTGAAGCCCTGGAAGGTAAAAAGCTCAGCTCTATGTTCAGATGGGCAGGCA 2020
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944 ATCTTCTCGTAGAAGCGTTGGAAGGTAAAAAGCTCAGCTCTATGTTCAGATGGGCAGGCA 2003
Query 2021 TAGATCAAAAATTCTGTGCTTCTCCAGCCACCACAAGTTCAAAACCCGAAGAAGACAAAG 2080
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2004 TAGAACAAAAATACTGTGCTTCTCCAGCCACCACAAGTTCACAACCCGAAGAAGACAAAG 2063
Query 2081 GCAAGGAAACAGATGAGGTTACACCCTGTAATATCACGAGGAAAGATGTCGCAGCTGGAA 2140
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2064 GCAAGGAAACAGATGAGGTTACACCCTGTAACATCACGAGGAAAGATGTCGCAGCTGGAA 2123
Query 2141 CTAAGGACCAGACAAGAGTGAAGGCGAGATCTTTGGCTGATATACTGAATGTTAAAGATG 2200
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2124 CTAAGGACCAGATGAGAGTGAAGGCGAGATCTATGGCTGAGATACTGAATGTTAAAGATG 2183
Query 2201 GAAACAATGATGCAAAGGAGACTTTAGAA-TCTTGTTCTAAGAAATCAAACAGGCCATGC 2259
|||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2184 GAAACAGTGATGCAAAGGAGACTTT-GAAATCCTGTTCTAAGAAATCAAACAGGCCATGC 2242
Query 2260 GATAACGATTCCTCTGAGGCCAACGCGCCAAAGAAACAGAAGCAGTGATGAATAATGAAG 2319
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2243 GATAACGATTCTTCTGAGGCCAACACGCCAAAGAAACAGAAGCAGTGATGAATCATGAAG 2302
Query 2320 GAGATTGTAGTTTAGTCACAAAATGC-AAGACGATAAAAACACTTTTGTCTTCTTCTTAA 2378
|| | |||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2303 GAAAATGTAGTTTAGACATAATTTGCCAAGACAATAAAAACACTTTTATCTTCTTCTTAA 2362
Query 2379 ATCGATATATGAAGC 2393
||| |||||||||||
Sbjct 2363 ATCAATATATGAAGC 2377
Score = 52.8 bits (28), Expect = 1e-05
Identities = 28/28 (100%), Gaps = 0/28 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 12 TCACCATAACAAAATCCAGAGGCTCTGT 39
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCACCATAACAAAATCCAGAGGCTCTGT 28
> Ahg900344 jgi|Araly1|900344|Al_scaffold_0004_994
Length=1527
Score = 876 bits (474), Expect = 0.0
Identities = 604/663 (91%), Gaps = 23/663 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1435 GGGTCGTATTACTCTGCCTTTGACTGTGGCTTCAACTGTTTGGAGAAAGCAAACTTTGCT 1494
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 868 GGGTCGTATTACTCTGCCTTTGACACTGGCTTCAACTGTTTGGAGAAAGCAAATTTTGCT 927
Query 1495 CCCCTTGATTGGTTGCCCCATGGGGATATTGCTGTTCAGGTGAATCAAGAGATGAGTAAA 1554
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 928 CCACTTGATTGGTTGCCCCATGGGGATATTGCTGTTCAGCTGAATCAAGAGAAGAGTAAA 987
Query 1555 ACGTCGCTGATATCGTATGATAAGCTATTATTTAGTGCTGCAAGGGAAGCTGTAAAATGT 1614
| ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 988 AAGTCCCTAACATCGTATGATAAGCTATTATTAAGTGCTGCAAGGGAAGCTGTGAAATGT 1047
Query 1615 CTTAAGGAATATGGGTTGTCGAAGAAAAACACAGCATGTTACACGAGATGGAATGATTCT 1674
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1048 CTTAAGGAATATGCTTTGTCCAAGAAAAACACAGCATGTTACATGAGATGGAATGATTCT 1107
Query 1675 TGTGGGACGGATGGGTTGTTCTCCAACATAATCAAGTCACGGATCAAACTGGAGAAAAAT 1734
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 1108 GGTGGGACGGATGGGTTATTCTCCAACATAGTCAAGTCACGGATCAAGCAGGAGAAAAAC 1167
Query 1735 AGACGTGAATTTCTTA-TCAGTTCACTAGAATCGCAAAGGATGGACAAGAGTTATGATGC 1793
|||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168 AGACTTGAATTTCTTAGT-AATTCACTAGAATCGCAAAGGATGGACAAGAGTTATGATGC 1226
Query 1794 TGTGAACAAAAGGGAATGCTGTGTATGTCTTGGGGATTTGTATCTTTCCGCGGTTAACTG 1853
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1227 TGTGACCAAAAGGGAATGCTATGTATGTCTTGGGGATTTGTATCTTTCCGCTGTTAATTG 1286
Query 1854 TTCATGCTCTGCTAATCGTTACTCGTGTCTGA-ACCACATGAGGAAGCTCTGTGCATGTC 1912
||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287 TTCATGCTCTGCTGATCGTTACTCGTGTCT-AGGCCACATGAGGAAGCTCTGTGCATGTC 1345
Query 1913 CGTGTGACAGAAAGAGTTTTCTCTATAGGTACACTATGGATGAGTTGAATCTTCTCGTTG 1972
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1346 CGTGTGACAGAAAGAGTTTTCTCTATATGTACAATATCGATGAGTTGAATCTTCTCGT-- 1403
Query 1973 AAGCCCTGGAAGGTAAAAAGCTCAGCTCTATGTTCAGATGGGCAGGCATAGATCAAAAAT 2032
| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 A-G------AAG--------CTCAGCTCTATGTTCAGATGGGCAGGCATAGATCAAAAAT 1448
Query 2033 TCTGTGCTTCTCCAGCCACCACAAGTTCAAAACCCGAAGA-AGACAAAGGCAAGGAAACA 2091
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 1449 ACTGTGCTTCTCCAGCCACCACAAGTTCACAACCCGAAGGCA-ACAAAGGCAAGGAAACA 1507
Query 2092 GAT 2094
|||
Sbjct 1508 GAT 1510
Score = 765 bits (414), Expect = 0.0
Identities = 493/528 (93%), Gaps = 17/528 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 451 GTACGGAGAAGACGGCCCCTCAAAGTGTCTGAGACCAAAGTCCTTGAGGAAGCTCCTGTG 510
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1 GTACGGAGAAGACGGCCCCTCAAAGTGTCTGAGACCGAAGTCCTTGAGGAAGTTCCTGTG 60
Query 511 TTCAACCCAACCGAAGAGGAATTCAGGGACACACTCTCATATATATCAAGCTTGCGTGAC 570
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTCAACCCAACCGAAGAGGAATTCAGTGATACACTCTCATATATATCAAGCTTGCGTGAC 120
Query 571 AGAGCTGAGCCGTATGGAATCTGTTGTGTTGTTCCTCCACCTTCATGGAAACCTCCATGT 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGAGCTGAGCCGTATGGAATCTGTTGTGTTGTTCCTCCACCTTCATGGAAACCTCCATGT 180
Query 631 CTTCTCAAGGAGAAACAAATATGGGAGGCTTCTACATTTTTCCCTCAAGTTCAGCTCTTT 690
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTTTTCAAGGAGAAAAAAATATGGGAGGCTTCTACAATTTTCCCTCAAGTTCAGCTCTTT 240
Query 691 GGAATTCAGACCGAGAACCGAAAGATTAAAAAGGAGGTTGATGCAGATAGTAATGATGCT 750
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 241 GGAATTCAGACCAAGAACCCAAAGATTAAAAAGGAGGTTGATGCAGATAGTGATGATGCT 300
Query 751 GCATCTGAAGGGGTTCAGTTATGTAGAGTAGAACGTGGTCCTGGGTATACTTTGAAGTCC 810
|||||||||||||||||||| || | | | | ||||||||||||| || ||
Sbjct 301 GCATCTGAAGGGGTTCAGTT-TG--G--T----C-----C-TGGGTATACTTTGGAGACC 345
Query 811 TTTAAAAACTTTGCAGATACATACAAGAAGAGTCATTTTGGCATGAAGGATGAGGTTTTG 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 346 TTTAAAAACTTTGCAGATACATACAAGAAGAGTCATTTTATCATGAAGGATGAGGTTTTG 405
Query 871 GGTTCAGAGAACTCATCTCCATC-ACTTAAACCAAATGAGCTAATTGTGGCAGACATTGA 929
||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 406 GGTTCAGAGAACTCATCTCCA-CGACTTAAACCAGATGAGCTAACTGTGGCAGACATTGA 464
Query 930 AAAAGAGTACAGACAAATTGTTGAGAGTCCACTTATTGAAATTGGGGT 977
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465 AAAAGAGTATAGACAACTTGTTGAGAGTCCACTTATTGAAATTGGGGT 512
Score = 503 bits (272), Expect = 3e-141
Identities = 302/317 (95%), Gaps = 0/317 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1063 GGTTGGAATCTGAACAGTACGGCTAAGCTTCCTGGTTCTCTTCTATCATTAGAAGACTGC 1122
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 553 GGTTGGAATCTGAACAGTACGGCTAAGCTTCCTGGTTCTCTTCTATCATTGGAAGGCTGC 612
Query 1123 GAATCAGTTTGTGTTCCTCGTCTAAGTGTAGGAATGTGCTTGTCTTCCCAGTTCTGGAAA 1182
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 613 GAATCAATTTGTGTTCCTCGCCTAAGTGTAGGAATGTGCTTGTCTTCCCAGTTCTGGGAA 672
Query 1183 TCTGAGAAGGAGAGACTCTACTCTCTCTGCTATTTGCATGTGGGCGCTCCTAGAGTGTGG 1242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 TCTGAGAAGGAGAGACTCTACTCTCTCTGCTATTTGTATGTGGGCGCTCCTAGAGTGTGG 732
Query 1243 TATTCCGTAGCAGGATGTCATCGATCAAAGTTTAAGGCTGCCATGAAAAGCTTCATCCTT 1302
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 733 TATTCTGTAGCAGGATGTCATCGATCAAAGTTTAAGGCTGCCATGAAAAGCTTCATCCCT 792
Query 1303 GAGATGTCAGGAGAACAGCCAAAGAAGAGTCATAATCCTGTGATGATGATGTCTCCATAT 1362
|||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| | |||
Sbjct 793 GAGATGTCAGAAGAACAGCCAAAGAAGAGTTATGATCCTGTGATGATAATGTCTGCTTAT 852
Query 1363 CAATTGAGCGTGGAGGG 1379
||||||||| |||||||
Sbjct 853 CAATTGAGCATGGAGGG 869
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 93549641720
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5