BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G39480.1
Length=4893
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg482971 jgi|Araly1|482971|fgenesh2_kg.4__2031__AT2G39480.1 8058 0.0
Ahg485955 jgi|Araly1|485955|fgenesh2_kg.5__1947__AT3G55320.1 4626 0.0
> Ahg482971 jgi|Araly1|482971|fgenesh2_kg.4__2031__AT2G39480.1
Length=4861
Score = 8058 bits (4363), Expect = 0.0
Identities = 4703/4867 (97%), Gaps = 24/4867 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 45 aaaaaaaaaaaGTATCTCACCGGAAACGATTTCTTCGCCGATTCCAAGACTTTTCTT-C- 102
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1 AAAAAAAGAAAGTATCTCACCGGAAACGATTTCTTCGCCGATTCCAAGACTTTTCTTCCT 60
Query 103 CT-AAGCTTTTTAACAGATCCGGTGAAAATTTCAAAATCCGAAGAATTCTCTAAAGCTAG 161
|| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||
Sbjct 61 CTAAAGCTTTTTAGCAGATCCGGTGAAGATTTCAAAAT-CAAAGAATCCTCTAAACCTAG 119
Query 162 GGTTTCTTAATTC-AC-GAGACGGAGGTGATATAATTccccc-ccG--TCGTAGCT---- 212
|||| ||| | | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 120 GGTTCCTT-CTACGCCGGAGACGGAGGTGATATTATTCCCCCGTCGTATCGTAGCTAAAA 178
Query 213 -ATGATGATTTCGAGAGGTTTGTTTGGTTGGTCTCCGCCGCATATACAACCGTTAACTCC 271
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 GATGATGATTTCCAGAGGTTTGTTTGGTTGGTCTCCGCCGCATATACAACCGTTAACTCC 238
Query 272 TGTTTCTGAAGTTTCCGAGCCTCCTGAGTCTCCATCTCCTTACCTTGATCCTGGTGCTGA 331
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 GGTTTCTGAAGTTTCCGAGCCTCCTGAGTCACCTTCTCCTTACCTTGATCCTGGTGCTGA 298
Query 332 GCACGGTGGTACAGGAACAGCGGCGCAAGCGGATGATGAGGAGGAAATGGAGGAGCCGGA 391
| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 299 GAACGGTGGTTCGGGAACGGCGGCGCAAGCGGATGATGAGGAAGATATGGAGGAGCCGGA 358
Query 392 GGAGATGGAGCCTCCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTATTTGCTTGTGCTGATCG 451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 GGAGATGGAGCCTCCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTATTTGCTTGTGCTGATCG 418
Query 452 CTTTGATTGGGTTCTTATGGTTTTTGGATCCGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTACTGCGCT 511
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 419 GTTTGATTGGGTGCTTATGGTTTTTGGATCCGTAGCTGCTGCTGCTCATGGCACTGCGCT 478
Query 512 TATTGTTTACTTGCACTACTTCGCCAAAATTGTTCAGGTTCTTGCATTTCCCACTGATTC 571
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||
Sbjct 479 TATTATCTACTTGCACTACTTCGCCAAAATTGTTCAGGTTCTTGCATTTCCTAGTGAATC 538
Query 572 GGATCATCTGATAAGTGATGATCAGTTCAATCGTCTCCTCGAGCTTTCGCTGACCATTGT 631
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 539 GGATCACCTGATTAGTGATGATCAGTTCAATCGTCTCGTCGAGCTTTCGTTGACCATTGT 598
Query 632 ATATATCGCTGGAGGTGTTTTCATATCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGGATACTGAC 691
||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 ATACATTGCTGGAGGTGTTTTTGTATCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGGATACTGAC 658
Query 692 TGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCAAAGTACGTCCAAGTGCTACTAAATCAGGA 751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 659 TGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCAAAGTACGTCCAAGTACTACTAAATCAGGA 718
Query 752 TATGAGTTTCTTTGATACATATGGGAATAACGGGGATATAGTAAGCCAAGTACTGAGTGA 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 719 TATGAGTTTCTTTGATACATATGGGAATAACGGGGATATAGTAAGCCAAGTGCTGAGTGA 778
Query 812 TGTTCTACTTATTCAGTCGGCTCTAAGTGAAAAAGTTGGGAATTACATTCATAACATGGC 871
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 TGTCCTACTTATTCAGTCGGCTCTAAGCGAAAAAGTTGGGAATTACATTCATAACATGGC 838
Query 872 GACATTTATCAGTGGTCTTATTATTGGTTTTGTCAACTGCTGGGAAATTGCCCTCATTAC 931
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 839 AACATTTATCAGTGGTCTTGTTATCGGTTTTGTCAACTGCTGGGAAATTGCGCTCATTAC 898
Query 932 GTTAGCCACCGGTCCTTTCATTGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATATTTCTCCACAG 991
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 GTTAGCCACCGGTCCTTTCATTGTTGCTGCAGGAGGCATATCAAATATATTTCTCCACAG 958
Query 992 ACTTGCTGAGAATATTCAAGATGCATATGCTGAAGCAGCCAGCATTGCTGAACAGGCAGT 1051
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 959 ACTTGCTGAGAATATTCAAGATGCATATGCTGAAGCAGCCGGCATTGCTGAACAGGCAGT 1018
Query 1052 CTCTTATGTTAGGACTTTGTATGCCTTTACAAATGAAACTCTTGCAAAATACTCTTATGC 1111
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 CTCTTACGTTAGGACTTTGTATGCCTTTACAAATGAAACTCTTGCAAAATACTCTTATGC 1078
Query 1112 AACTTCTCTCCAAGCAACTCTGAGATATGGTATATTGATTAGTCTTGTGCAAGGACTTGG 1171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 AACTTCTCTCCAAGCAACTCTGAGATATGGTATATTGATTAGTCTTGTGCAAGGACTTGG 1138
Query 1172 ACTTGGATTTACTTATGGGCTTGCTATATGTTCATGTGCTATGCAACTTTGGATTGGTCG 1231
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1139 ACTTGGATTTACTTACGGGCTTGCTATATGTTCATGTGCTCTGCAACTTTGGATTGGTCG 1198
Query 1232 GTTCTTTGTTATTCATCATAGAGCAAATGGTGGAGAGATCATAACAGCCCTTTTTGCTGT 1291
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1199 GTTCTTTGTTATTCATCATAGAGCAAATGGTGGAGAAATCATCACAGCCCTTTTTGCTGT 1258
Query 1292 TATTTTAAGTGGGCTGGGTTTAAATCAAGCGGCTACAAACTTTTATTCATTTGATCAAGG 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TATTTTAAGTGGGCTGGGTTTAAATCAAGCGGCTACAAACTTTTATTCATTTGATCAAGG 1318
Query 1352 AAGAATTGCGGCGTATAGGCTTTTTGAGATGATAAGTCGTTCATCCTCTGGGACTAATCA 1411
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 AAGAATTGCAGCGTATAGGCTTTTTGAGATGATAAGCCGTTCATCCTCTGGGACTAATCA 1378
Query 1412 AGAGGGAATTATTTTGTCTGCTGTCCAAGGAAATATTGAGTTTCGGAATGTATATTTCAG 1471
|||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 AGAGGGAACTATTTTGTCTGCTGTTCTAGGAAATATTGAGTTTCGGAATGTATATTTCAG 1438
Query 1472 CTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGTGGATTTTACCTTACTGTGCCGGCTAA 1531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1439 CTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGTGGATTTTACCTCACTGTGCCGGCTAA 1498
Query 1532 AAAAGCTGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGTATCATTCCTCTAAT 1591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1499 AAAAGCTGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGCATCATTCCTCTAAT 1558
Query 1592 GGAACGGTTTTATGATCCTACACTAGGAGAAGTTCTACTTGATGGAGAAAATATTAAAAA 1651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1559 GGAACGGTTTTATGATCCTACACTAGGAGAAGTTCTACTTGATGGGGAAAATATTAAAAA 1618
Query 1652 TCTAAAATTAGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGCCTGGTGACACAGGAGCCTGCTTTGCT 1711
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 TCTAAAGTTAGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGCCTGGTGACACAGGAGCCTGCTTTGCT 1678
Query 1712 TAGTCTGAGCATAAGAGAGAATATTGCATACGGCCGAGATGCTACTCTGGATCAGATAGA 1771
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 TAGTCTTAGCATAAGAGAGAATATTGCATATGGCCGAGATGCTACTCTGGATCAGATAGA 1738
Query 1772 GGAAGCAGCTAAAAAAGCACATGCACACACATTTATCAGCTCACTTGAAAAAGGATATGA 1831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 GGAAGCAGCTAAAAAAGCACATGCACACACATTTATCAGCTCACTTGAAAAAGGATATGA 1798
Query 1832 AACTCAGGTTGGAAAGACTGGTTTAACGTTGACAGAGGAGCAGAAAATAAAGCTATCGAT 1891
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1799 AACTCAGGTTGGGAAGACTGGTTTAACGTTGACAGAGGAGCAGAAAATAAAACTATCGAT 1858
Query 1892 TGCTAGAGCCGTACTCTTAGATCCAACAATTCTTTTGCTTGACGAGGTCACTGGAGGACT 1951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 TGCTAGAGCCGTACTCTTAGATCCAACAATTCTTTTGCTTGACGAGGTCACTGGAGGACT 1918
Query 1952 AGACTTTGAAGCTGAAAGAGTTGTCCAAGAAGCCCTTGATCTTCTAATGTTAGGAAGGTC 2011
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 AGACTTTGAAGCTGAAAGAGTTGTCCAAGAAGCTCTTGATCTTCTAATGTTAGGAAGGTC 1978
Query 2012 TACCATAATAATAGCCCGACGACTAAGTCTGATAAGAAATGCTGACTATATTGCTGTAAT 2071
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 GACCATAATAATAGCCCGACGACTAAGTCTGATAAGAAATGCTGACTATATTGCTGTAAT 2038
Query 2072 GGAGGAGGGCCAGCTACTTGAAATGGGTACGCATGATGAACTAATCAACCTTGGTAATTT 2131
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2039 GGAGGAGGGTCAGCTACTTGAAATGGGTACGCATGATGAATTAATCAACCTTGGTAATTT 2098
Query 2132 GTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTACCCAGACGGATGCCAGTTAG 2191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 GTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTACCCAGACGGATGCCAGTTAG 2158
Query 2192 GAACTACAACGATTCTGCTGCGTTTCAGGCTGAGAGGGATTCTTCAGCTGGTCGTGGCTT 2251
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2159 GAACTACAATGATTCTGCTGCGTTTCAGGTTGAGAGGGATTCTTCAGCTGGCCGTGGCTT 2218
Query 2252 CCAAGAACCATCATCGCCCAAAATGGCTAAGTCTCCATCTCTTCAGAGAGGTCATAATGT 2311
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 CCAAGAACCATCATCGCCCAAAATGGCCAAGTCTCCATCTCTTCAGAGAGGTCATAATGT 2278
Query 2312 TTTCCGCTCCCAGGAATTGTGCTTTAATAGTGAAGAATCGCCCAATGATCATAGCCCTGC 2371
||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 TTTTCGCTCCCAGGAAGTGTGCTTTAATAGTGAAGAATCGCCCAATGATCATAGCCCTGC 2338
Query 2372 ACCAGAGAAACTGGGAGAAAATGGCTCGTCGTTGGATGTTGGTGAGAAGGAACCCACCAT 2431
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||
Sbjct 2339 ACCAGAGAAAATGGGAGAAAATGGCTCGTCGTTGGATGTTGGTGATAAGGAACCAAGCAT 2398
Query 2432 CAAAAGACAAGATAGTTTCGAGATGCGGTTACCAGAATTACCAAAAATTGACATTCAGTG 2491
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 CAAAAGACAAGATAGTTTCGAGATGCGGTTACCAGAGCTACCAAAAATTGACATTCAGTG 2458
Query 2492 TCCACAACGTCAGAAATCAAATGGTTCAGATCCGGAGTCCCCTATATCACCCCTTTTGAT 2551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 TCCACAACGTCAGAAATCAAATGGTTCAGATCCGGAGTCCCCTATATCACCCCTTTTGAT 2518
Query 2552 ATCAGATCCCCAAAATGAGCGCTCTCATTCACAGACTTTTAGCCGCCCTCTTGGTCACTC 2611
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 ATCCGATCCCCAAAATGAGCGCTCCCATTCACAGACTTTTAGCCGCCCTCTTGGTCACTC 2578
Query 2612 AGATGACACTTCAGCAAGTGTTAAGGTGGCCAAGGACGGTCAACACAAGGAGCCACCTTC 2671
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 AGATGACACTTCAGCAAATGTTAAGGTGGCCAAGGACGGTCAACACAAGGAGCCACCTTC 2638
Query 2672 ATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTTCCAGAGTGGCTATACGCTGTATTAGGGAGTAT 2731
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2639 ATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTTCCAGAGTGGCTATATGCTGTATTAGGGAGTAT 2698
Query 2732 TGGTGCTGCAATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTTCTAGCTTATGTTATTGCATTAGTAGT 2791
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 TGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTTCTAGCTTATGTTATTGCATTAGTAGT 2758
Query 2792 GACGACATACTATACGAGCAAGGGAAGCCACCTGCGTGAAGAGGTTGACAAGTGGTGTTT 2851
||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2759 GACAACATACTATAAGAGCACGGGAAGCCACCTGCGTGAGGAGGTTGACAAGTGGTGCTT 2818
Query 2852 GATCATTGCCTGCATGGGAATAGTGACAGTTGTTGCCAATTTCTTACAGCACTTCTACTT 2911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2819 GATCATTGCCTGCATGGGAATAGTGACAGTTGTTGCCAATTTCTTGCAGCATTTCTACTT 2878
Query 2912 TGGTATTATGGGGGAGAAAATGACTGAGAGAGTGCGGCGAATGATGTTCTCAGCAATGCT 2971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2879 TGGTATTATGGGGGAGAAAATGACTGAGAGAGTGCGGCGAATGATGTTCTCAGCAATGCT 2938
Query 2972 GCGTAATGAAGTTGGATGGTATGACGAAGAAGAGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCG 3031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 GCGTAATGAAGTTGGATGGTATGACGAAGAAGAGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCG 2998
Query 3032 CCTAGCAAATGATGCCACTTTTGTCCGAGCTGCCTTCAGCAACAGGCTTTCCATATTTAT 3091
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2999 CCTAGCAAATGATGCCACTTTTGTCCGAGCCGCCTTCAGCAACAGGCTTTCGATATTTAT 3058
Query 3092 TCAGGATAGTTTTGCTGTTATCGTTGCCATTCTTATTGGGCTGCTGCTCGGTTGGCGTTT 3151
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3059 TCAGGATAGTTTTGCTGTTATTGTTGCCATTCTTATTGGGTTGCTGCTCGGTTGGCGTTT 3118
Query 3152 GGCCCTTGTTGCATTAGCGACTTTGCCAGTACTTACTCTTTCTGCCATTGCCCAGAAACT 3211
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3119 GGCCCTTGTTGCATTGGCGACTTTGCCAGTACTTACTCTTTCTGCCATTGCCCAGAAACT 3178
Query 3212 TTGGCTTGCTGGATTCTCAAAGGGCATCCAGGAGATGCATCGAAAGGCGTCCT-TAGTAC 3270
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3179 TTGGCTTGCTGGATTCTCAAAGGGCATCCAGGAGATGCATCGAAAGGCGT-CTCTAGTAC 3237
Query 3271 TCGAGGATGCTGTCAGAAACATATATACTGTTGTCGCGTTCTGTGCCGGCAACAAGGTGA 3330
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3238 TCGAGGATGCTGTCAGAAACATATATACTGTTGTCGCGTTCTGTGCCGGCAACAAGATGA 3297
Query 3331 TGGAACTCTACAGACTGCAACTCCAACGGATACTCAGGCAGAGCTTTTTCCATGGGATGG 3390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3298 TGGAACTCTACAGACTGCAACTCCAACGGATACTCAGACAGAGCTTTTTCCACGGGATGG 3357
Query 3391 CTATTGGCTTTGCGTTTGGCTTCTCACAGTTTCTTCTCTTCGCCTGTAATGCGCTCCTCC 3450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3358 CTATTGGCTTTGCGTTTGGCTTCTCACAGTTTCTTCTCTTCGCCTGTAATGCGCTCCTCC 3417
Query 3451 TGTGGTACACCGCGTTATCAGTAGACCGCAGATATATGAAATTGTCTACAGCTCTAACCG 3510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3418 TGTGGTACACCGCGTTATCAGTAGACCGCAGATATATGAAATTGTCTACAGCTCTGACCG 3477
Query 3511 AGTACATGGTCTTCTCCTTTGCTACATTTGCTCTTGTGGAGCCATTCGGATTAGCACCTT 3570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3478 AGTACATGGTCTTCTCCTTTGCTACATTTGCTCTTGTGGAGCCATTCGGATTAGCACCTT 3537
Query 3571 ACATTCTCAAGCGCCGTAGATCTCTCGCTTCAGTTTTTGAAATAATAGATCGAGTTCCTA 3630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3538 ACATTCTCAAGCGCCGTAGATCTCTCGCTTCAGTTTTTGAAATAATAGATCGAGTTCCTA 3597
Query 3631 CAATCGAACCTGATGATACCTCGGCTCTTAGTCCGCCTAACGTGTATGGAAGCATTGAAC 3690
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3598 CAATCGAACCTGATGATACCTCGGCTCTTAGTCCGCCTAATGTGTATGGAAGCATTGAAC 3657
Query 3691 TGAAAAACATCGACTTCTGCTACCCAACCCGCCCGGAAGTGTTAGTACTAAGCAACTTCA 3750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3658 TGAAAAACATCGACTTCTGCTACCCAACCCGCCCGGAAGTGTTAGTACTAAGCAACTTCA 3717
Query 3751 GTCTCAAAGTCAATGGCGGACAAACAGTAGCTGTGGTTGGTGTTTCTGGTTCTGGAAAGA 3810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3718 GTCTCAAAGTCAATGGCGGACAAACAGTAGCTGTGGTTGGTGTTTCTGGTTCTGGAAAGA 3777
Query 3811 GCACAATAATATCGTTGATCGAGAGATACTACGACCCAGTTGCTGGTCAGGTCTTATTAG 3870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3778 GCACAATAATATCGTTGATCGAGAGATACTACGACCCAGTTGCTGGTCAGGTCTTATTAG 3837
Query 3871 ATGGGCGAGACTTGAAGTCATATAATTTGAGATGGTTAAGAAGCCATATGGGTCTGATTC 3930
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3838 ATGGGCGAGACTTGACGTCGTATAATTTGAGATGGTTAAGAAGCCATATGGGTCTGATTC 3897
Query 3931 AACAGGAACCCATAATCTTTTCCACAACGATCAGAGAAAACATTATATACGCAAGGCACA 3990
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3898 AACAGGAACCCATAATCTTTTCCACGACGATCAGAGAAAACATTATATATGCAAGGCACA 3957
Query 3991 ATGCAAGTGAAGCTGAGATGAAGGAAGCAGCAAGGATTGCAAATGCCCACCATTTCATCA 4050
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3958 ATGCAAGTGAGGCTGAGATGAAGGAAGCAGCAAGAATTGCAAATGCCCACCATTTCATCA 4017
Query 4051 GCAGCTTACCTCACGGATACGACACACATATCGGGATGAGAGGTGTTGAGCTTACCCAAG 4110
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 4018 GCAGCTTACCTCACGGATACGACACGCATATCGGGATGAGAGGCGTTGAACTTACCCAAG 4077
Query 4111 GACAAAAACAGAGAATCGCTATAGCTCGGGTAGTGCTGAAGAATGCTCCAATACTGTTGA 4170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4078 GACAAAAACAGAGAATCGCTATAGCTCGGGTAGTGCTGAAGAATGCTCCAATACTGTTGA 4137
Query 4171 TTGACGAAGCGAGTTCATCTATCGAATCCGAGTCGAGCCGTGTTGTGCAGGAAGCTCTTG 4230
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4138 TTGACGAAGCGAGTTCATCAATCGAATCCGAGTCGAGCCGTGTTGTGCAGGAAGCTCTTG 4197
Query 4231 ATACATTGATAATGGGGAACAAAACAACAATTCTGATAGCGCATAGAGTAGCGATGATGA 4290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4198 ATACATTGATAATGGGGAACAAAACAACAATTCTGATAGCGCATAGAGTAGCGATGATGA 4257
Query 4291 GACATGTGGATAACATTGTGGTTCTCAATGGAGGCAAAATAGTAGAGGAAGGTACGCATG 4350
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4258 GACATGTGGATAACATCGTGGTTCTCAATGGAGGCAAAATAGTAGAGGAAGGTACACATG 4317
Query 4351 ATTGTTTAGCGGGTAAAAACGGATTGTATGTCCGTTTAATGCAACCACATTTTGGCAAGA 4410
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4318 ATTCTTTAGCGGGTAAAAACGGATTGTATGTCCGTTTAATGCAACCACATTTTGGCAAGA 4377
Query 4411 ATCTACGGCGACATCAACTGATCTAAAAGAGATTGGACTCATGTGCCTAATTGAGATTAG 4470
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4378 ATCTACGGCGACATCAACTGATCTAAA-GAGATTGGACTCCTGTGCCTAATTGAGATTAG 4436
Query 4471 TTCAGTCACATACCAACCATCATGTGATATGCCACGAGATAACGTTATTGGATGTAGTTA 4530
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||
Sbjct 4437 TTCAGTCACATACCAACCATCACGTGATATGCCACGGGATAATGTTATTGGATGCAATTA 4496
Query 4531 CAGGACATGCATCTGATCAAAGGCTTATCGGGTCCGGGATGACAGCAGATGAGCAGAAGT 4590
| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||
Sbjct 4497 CGGGACATGCATCTGATCAGAGGCTTATCGAGTCCGAGATGACACCAAATGAGCAGAAGT 4556
Query 4591 TGTACAACCACGGTTAGTTTCTGTAAGCAACTTAGGAGTTTGTAGACGTTAGATTCCCTT 4650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4557 TGTACAACCACGGTTAGTTTCTGTAAGCAACTTAGGAGCTTGTAGACGTTAGATTCCCTT 4616
Query 4651 ATTCTTTCAGGAGGCTAAGCAATGAAGTAGGACTGTGTTATTTATTCATTGATT-GGTCT 4709
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||
Sbjct 4617 ATTCTTTCAGGAGGCTAAGCAATGAAGTAGGACTGTGTAATTTATTCATT-ATTTGGTCT 4675
Query 4710 CTTAAGGTATATCGATTTGTTTATTGAAACTGAAGATTAGAGGCAATTTTATTTGCTGAG 4769
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 4676 CTTAAGGTATATCGATTTGTTTATTGAAACTGAAGATTAGGGGCAATTT-ATTTGCTGAG 4734
Query 4770 GTTTGCTTTTTTGTT---GTTGTGAGTGATTTAGGTGGAGAAGTGTGTAATGGCTAGGAA 4826
||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4735 GTTTGTTTTTTTTTTATTGTTGTGAGTGATTTAGGTGGAGAAGTGTGTAATGGTTAGGAA 4794
Query 4827 GAAATATGTCTGTTTTGTAAATACATTATTTCCACTTTATTTGCAAGTTTGATTGAATTA 4886
|||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4795 GAAAGATGTCTGTTTTGTAAATACATTATATGCACTTTATTTGCAAGTTTGATTCAATTA 4854
Query 4887 CTGAACC 4893
|||||||
Sbjct 4855 CTGAACC 4861
> Ahg485955 jgi|Araly1|485955|fgenesh2_kg.5__1947__AT3G55320.1
Length=4627
Score = 4626 bits (2505), Expect = 0.0
Identities = 3687/4259 (87%), Gaps = 75/4259 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 213 ATGATGATTTCGAGAGGTTTGTTTGGTTGGTCTCCGCCGCATATACAACCGTTAACTCCT 272
|||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 1 ATGATGATCTCTAGAGGTTTATTCGGATGGTCTCCGCCTCATATGCAACCACTAACTCCA 60
Query 273 GTTTCTGAAGTTTCCGAGCCTCCTGAGTCTCCATCTCCTTACCTTGATCCTGGTGCTGAG 332
|| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 61 GTCTCTGAAGTCTCCGAGCCTCCTGAGTCTCCTTCTCCTTATCTCGACCCTGGTGCTGAG 120
Query 333 CAC-GGTGGT---ACA-G-G-AACAGCGGCGCAAGCGGATGATGAGGAGGAAATGGAGGA 385
| |||||| ||| | | | |||||||||||||| | ||| || || ||||| ||
Sbjct 121 -TCTGGTGGTGGCACAGGTGCCGCGGCGGCGCAAGCGGAGGCTGATGAAGAGATGGATGA 179
Query 386 GCCGGAGGAGATGGAGCCTCCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTATTTGCTTGTGC 445
|| || ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 180 GCAAGACGAGGTTGAACCACCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTCTTCGCTTGCGC 239
Query 446 TGATCGCTTTGATTGGGTTCTTATGGTTTTTGGATCCGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTAC 505
||| || || ||||||| |||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TGACCGGTTCGATTGGGGGCTTATGATTGTTGGCTCTGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTAC 299
Query 506 TGCGCTTATTGTTTACTTGCACTACTTCGCCAAAATTGTTCAGGTTCTTGCATTTC-CCA 564
|||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| | |
Sbjct 300 TGCGCTTATTGTCTACTTGCATTACTTCGCCAGGATTGTTGATGTTCTTGC-TTTCTCTA 358
Query 565 CTGATTCGGA-TCATCTGATAAGTGATGATCAGTTCAATCGTCTCCTCGAGCTTTCGCTG 623
||||||| || ||| | || | ||| ||||||| | || ||| | ||||||||| ||
Sbjct 359 CTGATTC-GAGTCAGCAGAGATCTGAACATCAGTTTGACCGACTCGTTGAGCTTTCGTTG 417
Query 624 ACCATTGTATATATCGCTGGAGGTGTTTTCATATCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGG 683
|| ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 ACTATTGTGTACATTGCCGGAGGTGTTTTCATTTCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGG 477
Query 684 ATACTGACTGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCAAAGTACGTCCAAGTGCTACTA 743
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |
Sbjct 478 ATACTGACGGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCCAAGTATGTCCAAGTATTATTG 537
Query 744 AATCAGGATATGAGTTTCTTTGATACATATGGGAATAACGGGGATATAGTAAGCCAAGTA 803
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||
Sbjct 538 AATCAGGATATGAGTTTCTTTGATACGTATGGTAATAATGGAGATATTGTGAGCCAAGTG 597
Query 804 CTGAGTGATGTTC-TACTTATTCAGTCGGCTCTAAGTGAAAAAGTTGGGAATTACATTCA 862
|| || |||| || |||| |||||||| ||| |||| || |||||||| ||||| |||||
Sbjct 598 CTAAGCGATG-TCTTACTCATTCAGTCAGCTTTAAGCGAGAAAGTTGGAAATTATATTCA 656
Query 863 TAACATGGCGACATTTATCAGTGGTCTTATTATTGGTTTTGTCAACTGCTGGGAAATTGC 922
||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 TAACATGGCTACGTTTATCAGTGGACTTGTTATTGGATTTGTCAACTGCTGGGAAATTGC 716
Query 923 CCTCATTACGTTAGCCACCGGTCCTTTCATTGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATATT 982
| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 ATTGATTACACTAGCCACCGGCCCTTTCATCGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATATT 776
Query 983 TCTCCACAGACTTGCTGAGAATATTCAAGATGCATATGCTGAAGCAGCCAGCATTGCTGA 1042
||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 777 TCTTCACAGACTTGCTGAGAACATACAAGACGCATATGCTGAAGCAGCCGGTATTGCTGA 836
Query 1043 ACAGGCAG-TCTCTTATGTTAGGACTTTGTATGCCTTTACAAATGAAACTCTTGCAAAAT 1101
|||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 837 ACAGGC-GATCTCTTACATTAGGACTTTATATGCCTTTACAAATGAAACTCTAGCAAAAT 895
Query 1102 ACTCTTATGCAACTTCTCTCCAAGCAA-CTCTGAGATATGGTATATTGATTAGTCTTGTG 1160
| || ||||||||||| || ||||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||
Sbjct 896 ATTCATATGCAACTTCCCTTCAAGCAACCT-TGAGATACGGCATATTAATTAGTCTTGTG 954
Query 1161 CAAGGACTTGGACTTGGATTTACTTATGGGCTTGCTATATGTTCATGTGCTATGCAACTT 1220
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 955 CAAGGCCTTGGACTTGGGTTTACTTATGGGCTTGCTATATGCTCGTGTGCGCTGCAACTT 1014
Query 1221 TGGATTGGTCGGTTCTTTGTTATTC-AT-CATAGAGCAAATGGTGGAGAGATCATAACAG 1278
|||||||| || ||||||||| | || | || |||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1015 TGGATTGGACGATTCTTTGTT-CACAATGGA-AGGGCAAATGGTGGAGAAATCATAGCAG 1072
Query 1279 CCCTTTTTGCTGTTATTTTAAGTGGGCTGGGTTTAAATCAAGCGGCTACAAACTTTTATT 1338
| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 1073 CTCTTTTTGCTGTTATTTTAAGTGGCCTAGGATTAAATCAAGCTGCTACGAACTTCTATT 1132
Query 1339 CATTTGATCAAGGAAGAATTGCGGCGTATAGGCTTTTTGAGATGATAAGTCGTTCATCCT 1398
| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1133 CTTTTGATCAAGGAAGGATTGCTGCGTATAGACTTTTTGAGATGATAACTCGTTCATCTT 1192
Query 1399 CTG-GGACTAATCAAGAGGGAATTATTTTGTCTGCTGTCCAAGGAAATATTGAGTTTCGG 1457
||| || |||| ||||| ||| | | || || |||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 1193 CTGTGG-CTAACCAAGAAGGAGCTGTGCTGGCTTCTGTTCAGGGAAATATTGAGTTCCGG 1251
Query 1458 AATGTATATTTCAGCTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGTGGATTTTACCTT 1517
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1252 AATGTATATTTCAGTTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGCGGATTTTACCTC 1311
Query 1518 ACTGTGCCGGCTAAAAAAGCTGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGT 1577
|| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 ACGGTTCCTGCTAAAAAAGCAGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGC 1371
Query 1578 ATCATTCCTCTAATGGAACGGTTTTATGATCCTACACTAGGAGAAGTTCTACTTGATGGA 1637
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1372 ATCATTCCTTTAATGGAACGGTTTTATGATCCAACATTAGGAGAAGTTCTTCTTGATGGA 1431
Query 1638 GAAAATATTAAAAATCTAAAATTAGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGCCTGGTGACACAG 1697
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 1432 GAAAATATTAAAAATCTAAAACTGGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGGCTGGTTACCCAG 1491
Query 1698 GAGCCTGCTTTGCTTAGTC-TGAGCATAAGAGAGAATATTGCATACGGCCGAGATGCTAC 1756
||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||
Sbjct 1492 GAGCCTGCTCTGCTAAG-CTTGAGCATAAGAGAGAATATTGCGTATGGTCGTGATGCTAC 1550
Query 1757 TCTGGATCAGATAGAGGAAGCAGCTAAAAAAGCACATGCACACACATTTATCAGCTCACT 1816
||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 TCTTGATCAGATAGAGGAGGCAGCTAAAATTGCGCATGCACACACATTTATCAGCTCACT 1610
Query 1817 TGAAAAAGGATATGAAACTCAGGTT-GGAAAGACTGGTTTAACGTTGACAGAGGAGCAGA 1875
|| ||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1611 TGCAAAAGGATATGAAACGCAGGTTGGGAGAG-CAGGTTTAGCAATGACAGAGGAGCAGA 1669
Query 1876 AAA-TAAAGCTATCGATTGCTAGAGCCGTACTCTTAG-ATCCAACAATTCTTTTGCTTGA 1933
||| |||| || |||||||||||||| || || || | |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1670 AAATTAAA-CTTTCGATTGCTAGAGCTGTGCT-TTTGAATCCAACAATTCTTCTGCTTGA 1727
Query 1934 CGAGGTCACTGGAGGACTAGACTTTGAAGCTGAAAGAGTTGTCCAAGAAGCCCTTGATCT 1993
|| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||
Sbjct 1728 TGAAGTAACTGGAGGATTAGACTTCGAAGCTGAAAGAATTGTGCAGGAAGCTCTTGATCT 1787
Query 1994 TCTAATGTTAGGAAGGTCTACCATAATAATAGCCCGACGACTAAGTCTGATAAGAAATGC 2053
||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 1788 TCTGATGTTGGGACGGTCAACCATAATAATAGCCCGACGATTAAGTTTGATAAAAAATGC 1847
Query 2054 TGACTATATTGCTGTAATGGAGGAGGGCCAGCTAC-TTGAAATGGGTACGCATGATGAAC 2112
|||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1848 TGACTATATTGCCGTGATGGAGGAGGGTCAGCT-CGTTGAAATGGGTACACACGATGAAT 1906
Query 2113 TAATCAACCTTGGTAATTTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTAC 2172
| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1907 TGATAAATCTTGGTGGGCTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTTC 1966
Query 2173 CCAGACGGATGCCAGTTAGGAACTACAACGATTCTGCTGCGTTTCAGGCT-GAGAGGGAT 2231
| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| | ||||| ||
Sbjct 1967 CAAGAAGGATGCCAGTTAGGAACTACAAGGAGTCTGCGGTGTTTCAGG-TCGAGAGAGAC 2025
Query 2232 TCTTCAGCTGGTC-GTGGCTTCCAAGAACCATCATCGCCCAAAATGGCT-AAGTCTCCAT 2289
||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||
Sbjct 2026 TCTTCAGCTGG-CTGTGGCGTCCAAGAACCATCATCACCCAAAAT-GATCAAGTCTCCAT 2083
Query 2290 CTCTTCAGAGAGGTCATAATGTTTTCCGCT-CCCAGGAATTGTGCTTTAATAGTGAAGAA 2348
||||||| |||||| || ||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||| |||||||
Sbjct 2084 CTCTTCAAAGAGGTAATGGTGTGTTCCG-TCCCCAGGAACTGTGTTTTGATACTGAAGAA 2142
Query 2349 TCGCCCAATGATCATAGCCCTGCACCAGAGAAACTGGGAGAAAATGGCTCGTCGT-TGGA 2407
|| || || ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| | | | ||||
Sbjct 2143 TCACCTAAAGATCATAGCCCTGCACCTGAGAAAATGGGGGAAAATGGCTTG-CCTCTGGA 2201
Query 2408 TGTTGGTGAGAAGGAACCCACCATCAAAAGACAAGATAGTTTCGAGATGCGGTTACCAGA 2467
| || ||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2202 CGATGCTGATAAAGAGCCAACTATCAAAAGGCAAGATAGTTTCGAGATGAGGTTACCAGA 2261
Query 2468 -ATTACCAAAAATTGACATTCAGTGTCCACAACGTCAGAAATCAAATGGTTCAGATCCGG 2526
|| || ||||||||| |||||||||| | || || |||||||| || ||||| || |
Sbjct 2262 CCTT-CCGAAAATTGACGTTCAGTGTCC-C--CGACAAAAATCAAACGGCTCAGAGCCAG 2317
Query 2527 AGTCCCCTATATCACCCCTTTTGATATCAGATCCCCAAAATGAGCGCTCTCATTCACAGA 2586
|||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||
Sbjct 2318 AGTCCCCTGTTTCACCCCTTTTGACATCAGATCCTAAAAACGAGCGTTCCCATTCGCAGA 2377
Query 2587 CTTTTAGCCGCCCTCTT-GGTCACTCAGATGACACTTCAGCAAGTGTTAAGGTGGCCAAG 2645
| |||| || |||||| | || | ||||||||||| | |||| || ||||| | | |||
Sbjct 2378 CGTTTATTCGTCCTCTTAGTTCTC-CAGATGACACTACTGCAAATGGTAAGGCGTCTAAG 2436
Query 2646 GACGGTCAACACAAGGAGCCACCTTCATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTTCCAGAG 2705
|| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2437 GATGCTCAACACAAGGAGTCACCTTCATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTCCCAGAG 2496
Query 2706 TGGCTATACGCTGTATTAGGGAGTATTGGTGCTGCAATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTT 2765
||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2497 TGGCTTTATGCTGTATTAGGAAGTCTCGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTT 2556
Query 2766 CTAGCTTATGTTATTGCATTAGTAGTGACGACATACTATACGAGCAAGGGAAG-CCACCT 2824
|| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| || || ||||||
Sbjct 2557 CTGGCTTATGTCATTGCGTTGGTAGTGACGGCATATTATAAAAGCAAAGG-AGTCCACCT 2615
Query 2825 GCGTGAAGAGGTTGACAAGTGGTGTTTGATCATTGCCTGCATGGGAATAGTGACAGTTGT 2884
||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2616 GCGCGAGGAGGTTGACAAATGGTGTTTGATCATTGCCTGCATGGGGATTGTGACAGTTGT 2675
Query 2885 TGCCAATTTCTTACAGCACTTCTACTTTGGTATTATGGGGGAGAAAATGACTGAGAGAGT 2944
|||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2676 TGCCAATTTCTTGCAGCACTTCTATTTTGGGATAATGGGGGAGAAAATGACAGAGAGAGT 2735
Query 2945 GCGGCGAATGATGTTCTCAGCAATGCTGCGTAATGAAGTTGGATGGTAT-GACGAAGAAG 3003
||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||
Sbjct 2736 TCGGAGGATGATGTTCTCAGCAATGCTGCGTAATGAAGTTGGATGGT-TCGATGATGAAG 2794
Query 3004 AGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCGCCTAGCAAATGATGCCACTTTTGTCCGAGCTG 3063
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2795 AGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCGTTTAGCAAATGATGCTACTTTTGTCCGAGCTG 2854
Query 3064 CCTTCAGCAACAGGCTTTCCATATTTATTCAGGATAGTTTTGCTGTTATCGTTGC-CATT 3122
| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||
Sbjct 2855 CGTTCAGCAACAGGCTTTCAATATTTATTCAAGATAGTTTTGCTGTTATAGTTGCTC-TT 2913
Query 3123 CTTATTGGGCT-GCTGCTCGGTTGGCGTTTGGCCCTTGTTGCATTAGCGACTTTGCCAGT 3181
||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |
Sbjct 2914 CTTATCGGGTTGGC-GCTTGGTTGGCGTTTGGCCCTTGTTGCATTGGCAACTCTGCCAAT 2972
Query 3182 ACTTACTCTTTCTGCCATTGCCCAGAAACTTTGGCTTGCTGGATTCTCAAAGGGCATCCA 3241
|| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2973 TCTCACTCTTTCTGCCATTGCTCAGAAACTGTGGCTTGCCGGATTCTCAAAAGGCATACA 3032
Query 3242 GGAGATGCATCGAAAGGCGTCCTTAGTACTCGAGGATGCTGTCAGAAACATATATACTGT 3301
|||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||
Sbjct 3033 GGAGATGCATAGAAAGGCATCTTTAGTCCTCGAGGATGCTGTTAGAAACATCTACACTGT 3092
Query 3302 TGTCGCGTTCTGTGCCGGCAACAAGGTGATGGAACTCTACA-GACTGCAACTCCAACGGA 3360
||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| ||||
Sbjct 3093 TGTTGCTTTCTGTGCTGGTAACAAAGTGATGGAACTGTACAGGA-TGCAACTCCAGCGGA 3151
Query 3361 TACTCAGGCAGAGCTTTTTCCATGGGATGGCTATTGGCTTTGCGTTTGGCTTCTCACAGT 3420
||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||
Sbjct 3152 TACTCAGACAGAGCTATCTCCATGGGATGGCTATTGGTTTTGCGTTTGGTTTTTCACAGT 3211
Query 3421 TTCTTCTCTTCGCCTGTAATGCGCTCCTCCTGTGGTACACCGCGTTATCAGT-AGACCGC 3479
||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| || | ||||
Sbjct 3212 TTCTTCTTTTCGCCTGCAATGCGCTCCTCCTATGGTGCACTGCGTTATCTGTCA-ACCGT 3270
Query 3480 AGATATATGAAATTGTCTACAGCTCTAACCGAGTACATGGTCTTCTCCTTTGCTACATTT 3539
|||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3271 GGATATATGAAGTTATCAACAGCTATAACAGAGTACATGGTTTTCTCATTTGCTACATTC 3330
Query 3540 GCTCTTGTGGAGCCATTCGGATTAGCACCTTACATTCTCAAGCGCCG-TAGATCTCTCG- 3597
|| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |
Sbjct 3331 GCCCTTGTCGAGCCATTTGGATTAGCACCGTATATTCTCAAGCGACGCAAG-TCTCT-GA 3388
Query 3598 CTTCAGTTTTTGAAATAATAGATCGAGTTCCTACAATCGAACCTGATGATACCTCGGCTC 3657
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||
Sbjct 3389 TTTCAGTGTTTGAAATCATAGATCGAGTCCCTACAATTGAACCAGATGATAACTCTGCTC 3448
Query 3658 TTAGTCCGCCTAACGTGTATGGAAGCATTGAACTGAAAAACATCGACTTCTGCTACCCAA 3717
| | |||||||| || || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3449 TCAAACCGCCTAATGTCTACGGAAGCATTGAATTGAAAAACATAGACTTCTGCTACCCAA 3508
Query 3718 CCCG-CCCGGAAGTGTTAGTACTAAGCAACTTCAGTCTCAAAGTCAATGGCGGACAAACA 3776
| || ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 3509 CTCGACCC-GAAGTACTAGTGCTGAGCAACTTCAGTCTCAAAGTCAGTGGCGGACAGACA 3567
Query 3777 GTAGCTGTGGTTGGTGTTTCTGGTTCTGGAAAGAGCACAATAATATCGTTGATCGAGAGA 3836
|||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||
Sbjct 3568 GTAGCTGTGGTTGGCGTTTCAGGTTCTGGAAAAAGCACAATAATCTCACTGGTAGAGAGA 3627
Query 3837 TACTACGACCCAGTTGCTGGTCAGGTCTTATTAGATGGGCGAGACTTGAAGTCATATAAT 3896
||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||| |||||||
Sbjct 3628 TACTACGACCCAGTTGCTGGTCAAGTCCTACTAGATGGGAGAGACTTAAAGTTATATAAT 3687
Query 3897 TTGAGATGGTTAAGAAGCCATATGGGTCTGATTCAACAGGAACCCATAATCTTTTCCACA 3956
||||||||||| |||||||| |||||| || |||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3688 TTGAGATGGTTGAGAAGCCACATGGGTTTGGTTCAGCAAGAACCCATAATCTTTTCCACG 3747
Query 3957 ACGATCAGAGAAAACATTATATACGCAAGGCACAATGCAAGTGAAGCTGAGATGAAGGAA 4016
||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3748 ACGATCAGAGAGAATATCATATATGCAAGGCATAATGCAAGTGAAGCTGAGATGAAGGAA 3807
Query 4017 GCAGCAAGGATTGCAAATGCCCACCATTTCATCAGCAGCTTACCTCACGGATACGACACA 4076
|||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3808 GCAGCAAGAATTGCTAATGCTCACCATTTCATCAGCAGCTTACCTCACGGTTATGACACA 3867
Query 4077 CATATCGGGATGAGAGGTGTTGAGCTTACCCAAGGACAAAAACAGAGAATCGCTATAGCT 4136
||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||
Sbjct 3868 CATATCGGGATGAGAGGGGTAGAACTTACCCCGGGACAGAAACAGAGAATAGCAATAGCA 3927
Query 4137 CGGGTAGTGCTGAAGAATGCT-CCAATACTGTTGATTGACGAAGCGAGTTCATCTATCGA 4195
||||||||||||||||||||| ||| || | || || || ||||| || || |||||||
Sbjct 3928 CGGGTAGTGCTGAAGAATGCTCCCATTA-TCTTAATAGATGAAGCCAGCTCGGCTATCGA 3986
Query 4196 ATCCGAGTCGAGCCGTGTTGTGCAGGAAGCTCTTGATACATTGATAATGGGGAACAAAAC 4255
||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3987 ATCTGAATCGAGTCGGGTTGTGCAGGAGGCTCTTGACACATTGATAATGGGGAACAAAAC 4046
Query 4256 AACAATTCTGATAGCGCATAGAGTAGCGATGATGAGACATGTGGATAACATTGTGGTTCT 4315
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4047 AACAATTCTGATAGCGCATAGAGCGGCTATGATGAGACATGTGGATAACATTGTGGTGCT 4106
Query 4316 CAATGGAGGCAAAATAGTAGAGGAAGGTACGCATGATTGTTTAGCGGGTAAA-AACGGAT 4374
||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||
Sbjct 4107 CAATGGAGGGAGGATAGTAGAGGAAGGTACACATGATTCTTTAGCAGC-AAAGAATGGAT 4165
Query 4375 TGTATGTCCGTTTAATGCAACCACATTTTGGCAA-GAATCTACGGCGACATCAACTGAT 4432
||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||||| | ||||| ||||||
Sbjct 4166 TGTATGTACGTTTGATGCAACCACATTTTGGTAAAGG-TCTACGCCAACATCGACTGAT 4223
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 185188150218
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5