BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G40030.1 Length=6348 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg483042 jgi|Araly1|483042|fgenesh2_kg.4__2102__AT2G40030.1 9755 0.0 > Ahg483042 jgi|Araly1|483042|fgenesh2_kg.4__2102__AT2G40030.1 Length=6258 Score = 9755 bits (5282), Expect = 0.0 Identities = 5823/6085 (96%), Gaps = 34/6085 (1%) Strand=Plus/Plus Query 4 GAAGAACAAAAGA-TTTT-TGAGAGAG-AAAAGTAGAGTCACTCCAAAATTGTTCTCTCG 60 ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1 GAAGAACAAAAGATTTTTGTGAGAGAGAAAAAAAAGAGTCACTCCAAAATTGTTCTCTGG 60 Query 61 CAATCTTCTTTCT-CGG-TTTCCTCTTTTAAGAAAAAGTCCGCCATTTTCACTCTCACTC 118 ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CAATCTTCTTTCTGGGGTTTTTCTCTTTAAAGAAAAAGTCCGCCATTTTCACTCTCACTC 120 Query 119 AGATTTCTTCCCTCTTCTCACCTGCAAAAACCCTTGTTTCCCGCTGTTTCGTTTCTTCTC 178 ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 121 AGATTTC-TCCCTCTTTTCACCTGCAAAAACCCTTGTTTCCCGTTGTTTCGTTTCTTCTC 179 Query 179 CGGTTGAGGAACCAAAACGGGTCAAATACGCAGCTGAATCATCGAATTCTTAGGGT-TTT 237 |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||| Sbjct 180 TGGTTCAGGAGCCAAAACGGGTCAAATACGCTGCTGAATCGTCG-ATTCTTA-GGTATTT 237 Query 238 T-TCATGGAGGAAGAATCTACATCAGAGATTCTTGACGGAGAGATTGTTGGAATCACATT 296 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 238 TGTCATGGAGGAAGAATCTTCATCAGAGATTCTTGAAGGAGAGATTGTTGGAATCACATT 297 Query 297 TGCTCTTGCTAGTCACCATGAAATATGTAT-TCAATCGATTAGTGAATCCGCAATTAATC 355 ||||||||| | |||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||| |||| Sbjct 298 TGCTCTTGCAACTCACCATGAAATTTGTATAGC-ATCAATTAGTGGATCCGCAATCAATC 356 Query 356 ATCCCAGTCAACTCACTAACGCATTCTTGGGGTTACCTCTTGAATTTGGTAAATGTGAAT 415 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 357 ATCCCAGTCAACTCACTAACTCATTCTTGGGGTTACCTCTTGAATTTGGTAAATGTGAAT 416 Query 416 CTTGCGGTGCGACAGAACCAGATAAATGTGAAGGTCATTTTGGTTATATTCAGCTTCCAG 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 417 CTTGCGGTGCGACAGAACCAGATAAATGTGAAGGTCATTTTGGTTATATTCAGCTTCCAG 476 Query 476 TGCCAATATACCATCCTGCTCATGTTAATGAGTTGAAACAAATGCTGAGCCTTCTGTGCT 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 477 TGCCAATATACCATCCTGCTCATGTTAATGAGTTGAAACAAATGCTGAGCCTTCTGTGCT 536 Query 536 TGAAATGTCTGAAGATAAAGAAGGCAAAGGGCACAAGTGGTGGTCTGGCGGATCGCTTGT 595 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 537 TGAAATGTCTGAAGATAAAGAAGGCAAAGAGCACAAGTGGTGGTCTGGCGGATCGCTTAT 596 Query 596 TGGGTGTCTGTTGTGAGGAAGCTTCGCAAATCTCAATCAAAGATAGAGCATCAGATGGTG 655 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 597 TGGGTGTCTGTTGTGAGGAAGCTTCGCAAATCTCAATCAGAGATAGAGCATCAGATGGTG 656 Query 656 CCTCATATCTAGAACTGAAGCTCCCATCTAGGTCAAGACTGCAGCCTGGTTGCTGGAATT 715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 657 CCTCATATCTAGAACTGAAGCTCCCATCTAGGTCAAGACTGCAGGCGGGTTGCTGGAATT 716 Query 716 TCCTGGAAAGATATGGTTATCGCTATGGAAGCGATTACACGCGTCCCCTGCTGGCAAGAG 775 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 717 TCCTGGAAAGATATGGTTATCGCTATGGAAGCGATTATACGCGACCCCTGCTGGCAAGAG 776 Query 776 AGGTTAAGGAAATTCTAAGACGGATCCCCGAAGAATCAAGAAAGAAACTCACGGCAAAGG 835 |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct 777 AGGTAAAGGAAATTTTAAGACGGATCCCCGAAGAAACAAGAAAGAAACTCACAGCAAAGG 836 Query 836 GACATATTCCTCAAGAAGGATACATACTAGAGTATCTTCCTGTCCCGCCTAACTGTTTGT 895 |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 837 GACATATTCCTCAAGAAGGATACATATTAGAATATCTTCCTGTCCCGCCTAACTGCTTGT 896 Query 896 CAGTGCCAGAGGCTTCTGATGGTTTCAGCACCATGTCAGTGGATCCTTCCAGAATTGAGC 955 |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 897 CAGTGCCAGATGTTTCTGATGGTTACAGCTCCATGTCAGTGGATCCTTCCAGAATTGAGC 956 Query 956 TAAAGGACGTTCTGAAGAAAGTCATAGCCATAAAAAGCTCTAGGTCTGGCGAGACAAACT 1015 |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 957 TAAAAGACGTCCTTAAGAAAGTGATAGCCATAAAAAGCTCTAGGTCTGGCGAGACAAACT 1016 Query 1016 TTGAGTCGCATAAGGCTGAAGCCAGTGAGATGTTTAGAGTGGTGGATACCTATCTCCAGG 1075 |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1017 TTGAGTCGCATAAGGCTGAAGCCAATGACATGTTTAGAGTGGTGGATACCTATCTGCAGG 1076 Query 1076 TGAGGGGTACTGCAAAAGCGGCAAGAAACATTGATATGAGATACGGGGTGTCTAAGATCT 1135 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 TGAGGGGTACTGCAAAAGCTGCAAGAAACATTGATATGAGATACGGGGTGTCTAAGATCT 1136 Query 1136 CGGATAGTTCATCTTCAAAAGCTTGGACAGAAAAAATGAGAACACTTTTCATCCGTAAGG 1195 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 1137 CGGATAGTTCATCTTCAAAAGCTTGGACACAAAAAATGAGGACACTTTTCATCCGAAAGG 1196 Query 1196 GTTCAGGTTTCTCTTCCCGTAGCGTCATCACTGGAGATGCTTACCGACATGTGAATGAGG 1255 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| Sbjct 1197 GTTCAGGTTTCTCTTCCCGTAGCGTCATCACTGGAGATGCTTACAGACACGTGAATGAGG 1256 Query 1256 TAGGGATCCCAATAGAAATTGCGCAGAGAATCACATTTGAGGAAAGGGTTAGTGTCCACA 1315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1257 TAGGGATCCCAATAGAAATTGCGCAGAGAATCACATTTGAGGAAAGGGTTAGTGTCCACA 1316 Query 1316 ATAGAGGTTATCTACAAAAGTTGGTAGACGACAAGTTGTGTTTGAGTTATACTCAAGGTT 1375 | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1317 ACATAGGTTATCTACAAAAGTTGGTAGACGACAAGTTGTGTTTGAGTTATACTCAAGGTT 1376 Query 1376 CTACGACCTATTCTTTAAGGGATGGATCCAAGGGGCACACTGAGCTTAAACCCGGGCAGG 1435 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1377 CCACGACCTATTCTTTAAGGGATGGATCCAAGGGGCACACTGTGCTTAAACCCGGGCAGG 1436 Query 1436 TTGTTCATCGCAGGGTCATGGATGGGGATGTTGTGTTTATCAACAGACCCCCGACAACAC 1495 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | Sbjct 1437 TTGTTCATCGCAGGGTCATGGATGGGGATGTTGTGTTCATCAACCGACCCCCGACAACCC 1496 Query 1496 ATAAACATTCTCTTCAAGCGCTTCGGGTGTATGTTCATGAAGACAACACCGTGAAGATTA 1555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1497 ATAAACATTCTCTTCAAGCGCTTCGGGTGTATGTTCATGAAGACAACACCGTGAAGATTA 1556 Query 1556 ACCCTCTGATGTGTAGCCCCCTCAGTGCTGATTTTGATGGTGATTGTGTCCATTTGTTCT 1615 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 1557 ACCCTCTGATGTGTAGCCCCCTCAGTGCTGATTTTGATGGTGATTGTGTCCATCTCTTCT 1616 Query 1616 ACCCTCAGTCTCTTAGTGCTAAGGCAGAGGTTATGGAGCTCTTCTCTGTGGAGAAGCAAC 1675 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1617 ACCCTCAGTCACTTAGTGCTAAGGCAGAGGTTATGGAGCTTTTCTCTGTGGAGAAGCAAC 1676 Query 1676 TGCTTAGCTCACATACTGGACAGCTGATTTTGCAGATGGGTAGTGATTCTTTACTGTCTT 1735 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| Sbjct 1677 TGCTTAGCTCGCATACTGGACAGCTGATTCTGCAGATGGGTTGTGATTCTTTACTATCTT 1736 Query 1736 TGAGGGTAATGCTGGAGCGGGTATTTCTGGACAAGGCAACTGCTCAACAGTTAGCTATGT 1795 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1737 TGAGGGTAATGCTGGAGGGGGTGTTTCTGGACAAGGCAACTGCTCAACAGTTAGCTATGT 1796 Query 1796 ATGGCTCTCTGTCCCTGCCACCACCAGCACTAAGGAAGTCCAGTAAATCTGGCCCAGCTT 1855 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1797 ATGGCTCTCTGTCTCTGCCACCACCAGCACTAAGGAAGTCCAGTAAATCTGGCCCAGCTT 1856 Query 1856 GGACAGTTTTCCAGATTCTACAGCTTGCCTTTCCAGAACGTCTGAGTTGCAAAGGAGACA 1915 |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | Sbjct 1857 GGACAGTTTTTCAGATTTTACAGCTTGCCTTTCCAGAGCGTCTGAGCTGCAAAGGAGATA 1916 Query 1916 GATTCCTGGTTGATGGAAGTGATTTGCTGAAGTTTGATTTCGGGGTTGACGCGATGGGGT 1975 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1917 GATTCATGGTTGATGGAAGTGATTTGCTGAAGTTTGATTTCGGGGTTGACGCGATGGCAT 1976 Query 1976 CCATCATCAATGAAATTGTAACTTCAATCTTCCTGGAGAAGGGTCCAAAGGAGACACTTG 2035 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1977 CCATCATCAATGAAATTGTAACTTCAATCTTCCTGGAGAAGGGTCCAAAGGAGACACTTG 2036 Query 2036 GATTCTTTGATTCGCTGCAGCCTCTATTGATGGAAAGTCTGTTTGCTGAGGGATTTAGTC 2095 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2037 GATTCTTTGATTCACTGCAGCCTCTATTGATGGAAAGTCTGTTTGCTGAGGGCTTTAGTG 2096 Query 2096 TAAGTTTGGAAGACTTATCCATGTCTAGGGCAGACATGGATGTAATTCACAACCTAATAA 2155 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2097 TAAGTTTGGAAGACTTATCCATGTCCAGGGCAGACATGGATGTAATTCACAACCTAATAA 2156 Query 2156 TCCGAGAGATTTCACCTATGGTGTCTCGCTTGAGATTATCATATAGAGATGAATTGCAGC 2215 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 2157 TCCGAGAGATTTCACCTATGGTGTCTCGCTTGAGATTATCATATAGAGATGAACTGCAAC 2216 Query 2216 TAGAGAACAGCATCCACAAAGTGAAGGAAGTGGCTGCTAACTTTATGCTGAAGTCATATT 2275 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2217 TAGAGAACAGCCTCCACAAAGTGAAGGAAGTGGCTGCTAACTTTATGCTGAAGTCATATT 2276 Query 2276 CCATTCGGAACTTGATTGATATCAAGAGTAACTCAGCAATCACCAAGCTGGTGCAGCAGA 2335 |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2277 CCATGCGGAACTTGATTGACATCAAGAGTAACTCAGCAATCACCAAGCTGGTGCAGCAAA 2336 Query 2336 CAGGCTTCTTGGGTCTTCAGCTTTCTGACAAGAAGAAGTTTTACACGAAGACTCTGGTAG 2395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 2337 CAGGCTTCTTGGGTCTTCAGCTTTCTGACAAGAAGAAGTTCTATACGAAGACTCTGGTAG 2396 Query 2396 AGGACATGGCTATCTTTTGTAAGAGAAAGTATGGCAGGATTTCTTCATCTGGTGATTTTG 2455 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2397 AGGACATGGCCCTCTTTTGTAAGAGAAAGTATGGCAGGATTTCTTCATCTGGTGATTTTG 2456 Query 2456 GAATAGTGAAGGGCTGCTTCTTTCATGGGCTGGATCCGTATGAAGAGATGGCTCATTCAA 2515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2457 GAATAGTGAAGGGCTGCTTCTTTCATGGGCTGGATCCGTATGAAGAGATGGCTCATTCAA 2516 Query 2516 TTGCAGCTAGGGAGGTAATTGTTCGCTCTTCAAGGGGATTAGCTGAGCCTGGAACCCTCT 2575 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2517 TTGCAGCTAGGGAGGTAATTGTTCGCTCTTCAAGGGGGTTAGCTGAGCCTGGAACCCTCT 2576 Query 2576 TTAAGAACCTGATGGCTGTTCTTCGGGATATCGTGATTACAAACGATGGAACTGTAAGAA 2635 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2577 TTAAGAACCTGATGGCTGTTCTTCGGGATATCGTGATTACAAACGATGGAACTGTACGAA 2636 Query 2636 ACACCTGTAGTAACTCAGTCATCCAGTTCAAATATGGAGTTGATTCTGAACGTGGACATC 2695 |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2637 ACACCTGTAGTAACTCAGTCGTCCAGTTCACATATGGAGTTGATTCTGAACTTGGACATC 2696 Query 2696 AAGGTCTGTTTGAAGCTGGAGAACCTGTTGGAGTATTGGCAGCTACTGCCATGTCAAATC 2755 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2697 AAGGTCTGTTTGAAGCGGGAGAACCTGTTGGAGTATTGGCAGCTACTGCCATGTCAAATC 2756 Query 2756 CTGCATATAAGGCAGTGCTTGATTCCT-CTCCAAATAGTAATTCATCATGGGAGCTAATG 2814 |||| |||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct 2757 CTGCGTATAAGGCAGTGCTTGATTC-TACTGCTAATAGTAATTCATCGTGGGAGCAAATG 2815 Query 2815 AAGGAAGTTCTGCTCTGCAAAGTCAATTTCCAAAACACTACTAATGATCGGCGCGTAATC 2874 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2816 AAGGAAGTTCTGCTCTGCAAAGTCAATTTCCAAAACACTACTAATGATCGGCGCGTAATT 2875 Query 2875 CTTTATTTAAACGAATGCCATTGTGGAAAAAGGTTTTGCCAGGAAAATGCTGCTTGCACA 2934 |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2876 CTTTATCTAAATGAATGCCATTGTGGAAAAAGGTTTTGCCAGGAAAATGCTGCTTACACA 2935 Query 2935 GTCAGGAACAAGCTGAATAAAGTTAGTCTTAAAGATACTGCAGTGGAATTCCTAGTCGAA 2994 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2936 GTCAGGAACAAGCTGAAGAAAGTTAGTCTTAAAGATACTGCAGTGGAATTCCTAGTCGAA 2995 Query 2995 TATAGAAAGCAACCAACTATATCAGAAATTTTTGGAATTGATTCATGCCTACATGGCCAT 3054 || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2996 TACAGAAAGCAACAAACTATATCAGAAATATTTGGAATCGATTCATGCCTACATGGCCAT 3055 Query 3055 ATTCATCTTAATAAGACATTGCTGCAAGATTGGAACATCAGTATGCAGGATATACATCAA 3114 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3056 ATTCATCTTGATAAGACATTGTTGCAAGATTGGAACATCAGTATGCAGGATATACTTCAA 3115 Query 3115 AAGTGTGAGGATGTAATTAACTCACTAGGACAAAAGAAAAAGAAGAAAGCTACTGATGAT 3174 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3116 AAGTGTGAGGATGTAATTAATTCACTAGGACAAAAGAAAAAGAAGAAAGCTACTGATGAC 3175 Query 3175 TTCAAGAGAACAAGTTTGTCTGTCAGTGAGTGCTGCTCTTTCCGAGATCCTTGTGGGAGC 3234 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3176 TTCAGGAGAACAAGTTTGTCTGTCAGTGAGTGCTGCTCTTTCCAAGATCCTTGTGGGAGA 3235 Query 3235 AAAGGTTCGGATATGCCTTGTTTGACGTTCTCCTACAATGCCACCGATCCCGATCTAGAA 3294 |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct 3236 AAAGATTCGGATATGCCTTGTTTGATGTTCTCCTACAGTGCCACCGATCCTGATCTAGAA 3295 Query 3295 CGAACTCTTGATGTTCTTTGCAATACAGTTTACCCAGTTCTGCTGGAAATAGTGATCAAA 3354 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3296 AGAACTCTTGATGTTCTTTGCAATACAATTTACCCGGTTCTGCTGGAAACAGTGATCAAA 3355 Query 3355 GGTGATTCACGGATTTGCTCAGCAAATATAATCTGGAATAGTTCAGACATGACAACGTGG 3414 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3356 GGTGATCCACGGATTTGCTCAGCAAATATAATCTGGAATAGTTCAGACATGACAACATGG 3415 Query 3415 ATCCGGAATCGTCATGCATCCCGCCGAGGGGAATGGGTTTTGGATGTCACTGTTGAAAAA 3474 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3416 ATCCGGAATTGTCATGCATCCCGCCGAGGGGAATGGGTTTTGGATGTCACTGTTGAAAAA 3475 Query 3475 TCTGCTGTCAAGCAAAGTGGTGATGCATGGAGGGTTGTGATAGACTCATGTCTTTCAGTG 3534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3476 TCTGCTGTCAAGCAAAGTGGTGATGCATGGAGGGTTGTGATAGACGCATGTCTTTCAGTG 3535 Query 3535 CTTCATCTAATAGACACAAAACGGTCAATCCCTTATTCTGTAAAACAAGTGCAAGAATTG 3594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3536 CTTCATCTAATAGACACAAAACGGTCAATCCCTTATTCTATAAAACAAGTGCAAGAATTG 3595 Query 3595 CTTGGGTTATCCTGTGCTTTTGAGCAAGCAGTACAGCGTCTATCAGCTTCAGTGAGAATG 3654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3596 CTTGGGTTATCCTGTGCTTTTGAGCAAGCAGTACAGCGTCTATCAGCTTCAGTGAGAATG 3655 Query 3655 GTCTCCAAGGGAGTTTTGAAAGAACACATCATTCTCCTAGCAAACAACATGACTTGTTCA 3714 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3656 GTCTCCAAAGGAGTTTTGAAAGAACACATCATTCTCCTAGCAAACAACATGACTTGTTCA 3715 Query 3715 GGGACTATGTTGGGTTTCAATTCTGGAGGTTACAAAGCTTTGACCCGATCCTTAAACATC 3774 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3716 GGGAATATGTTGGGTTTCAATTCTGGAGGTTACAAAGCTTTGACCCGATCCTTAAACATC 3775 Query 3775 AAGGCTCCATTCACAGAAGCAACTCTGATTGCACCAAGAAAATGTTTTGAGAAAGCGGCT 3834 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3776 AAGGCTCCATTCACAGAAGCAACTCTGATTACACCAAGAAGATGTTTTGAGAAAGCGGCT 3835 Query 3835 GAGAAATGTCATACAGATTCACTATCAACAGTCGTTGGGTCTTGTTCTTGGGGAAAACGC 3894 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3836 GAGAAATGTCATACAGATTCTCTGTCAACAGTCGTTGGGTCTTGTTCTTGGGGAAAACGC 3895 Query 3895 GTGGATGTTGGTACAGGCTCACAGTTTGAGCTCCTATGGAACCAAAAAGAGACTGGTCTA 3954 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3896 GTGGATGTTGGTACAGGTTCACAGTTTGAGCTCCTATGGAACCAAAAAGAGACTGGTCTA 3955 Query 3955 GATGATAAAGAAGAAACAGATGTGTACAGCTTCCTTCAAATGGTCATATCCACGACAAAC 4014 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| Sbjct 3956 GATGATAAAGAAGAAACAGATGTGTACAGCTTTCTCCAAATGGTCAGATCCACGACAAAT 4015 Query 4015 GCAGATGCATTTGTTTCTTCCCCTGGTTTTGATGTTACAGAGGAAGAAATGGCTGAATGG 4074 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4016 GCAGATGCATATGTTTCTTCCCCTGGTTTTGATGTTACAGAGGAAGAAATGGCTGAATGG 4075 Query 4075 GCTGAATCGCCCGAGCGAGACTCTGCTCTTGGAGAGCCCAAGTTTGAGGACAGTGCCGAC 4134 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4076 GCTGAATCGCCCGAGCGAGACTCTGCTCTTGGAGAGCCCAAGTTTGAGGACAGTGCCGAG 4135 Query 4135 TTCCAAAATTTACATGACGAAGGCAAGCCATCAGGAGCCAACTGGGAGAAAAGCTCTTCG 4194 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| Sbjct 4136 TTCCAAAATTTACATGACGAAGGCAAGCCATCAGAATCCAACTGGGAGAAAAGCTCTTCA 4195 Query 4195 TGGGACAATGGTTGCAGTGGTGGTTCAGAGTGGGGAGTCTCAAAAAGTACAGGTGGTGAG 4254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4196 TGGGACAATGGTTGCAGTGGTGGTTCAGAGTGGGGAGTCTCAAAAAATACAGGTGGTGAG 4255 Query 4255 GCAAACCCGGAGTCTAATTGGGAAAAGACTACAAATGTTGAGAAGGAAGATGCTTGGTCT 4314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4256 GCAAACCCGGAGTCTAATTGGGAAAAGACTACAAATGTTGAGAAGGAAGATGCTTGGTCT 4315 Query 4315 AGTTGGAACACTAGAAAAGATGCTCAAGAATCTTCCAAGTCAGATTCAGGGGGTGCTTGG 4374 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 4316 AGTTGGAACACTAAAAAAGATGCTCAAGAATCTTCCAAGTCAGATTCAGGGGTTGCTTGG 4375 Query 4375 GG-TATAAAGACAAAGGATGCTGATGCAGATACAACACCAAACTGGGAAACAAGTCCAGC 4433 || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4376 GGCT-TAAAGACAAAGGATGATGATGCAGATACAACACCAAACTGGGAAACAAGACCAGC 4434 Query 4434 TCCGAAGGATTCCATTGTCCCAGAAAATAATGAGCCGACTTCTGACGTTTGGGGACACAA 4493 || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4435 TCAGACGGATTCTATTGTCCCAGAAAATAATGAGCCAACTTCTGACGTTTGGGGACACAA 4494 Query 4494 ATCTGTTTCAGACAAATCGTGGGACAAAAAGAACTGGGGAACTGAATCAGCTCCTGCTGC 4553 ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4495 ATCTGGTTCAGACAAATCTTGGGACAAAAAGAACGGGGGAACTGAATCAGCTCCTGCTGC 4554 Query 4554 ATGGGGTTCTACAGATGCTGCTGTTTGGGGTTCTAGTGATAAAAAGAACTCGGAAACAGA 4613 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4555 ATGGGGTTCTACAGATGCTGCTGTTTGGGGTTCTAGTGATAAAAAGAACTCGGAAACGGA 4614 Query 4614 ATCAGATGCTGCTGCTTGGGGTTCCAGGGACAAAAATAATTCTGACGTTGGGTCAGGTGC 4673 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| Sbjct 4615 ATCAGATGCTGCTGCTTGGGGTTCTAGGGACAAAAAGAATTCTGAAGTTGGATCAGGTGC 4674 Query 4674 TGGTGTTTTAGGTCCCTGGAACAAGAAGAGCTCGGAAACTGAGTCAAATGGTGCTACTTG 4733 ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4675 TGGTGTTTTGGGTCCCTGGAACAAGAAGAGCTCGAAAACTGAGTCAGATGGTGCTACTTG 4734 Query 4734 GGGTTCTAGTGACAAAACCAAATCAGGTGCTGCTGCATGGAATTCTTGGGACAAAAAGAA 4793 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 4735 GGGTTCTAGTGACAAAACTAAATCAGGTGCTGCTGCATGGAGTTCTTGGGACAAAAAGAA 4794 Query 4794 CATAGAAACTGACTCAGAACCTGCTGCTTGGGGTTCTCAGGGAAAAAAGAATTCTGAAAC 4853 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| Sbjct 4795 CATGGAAACTGACTCGGAACCTGCTGCTTGGGGTTCTCAGAGCAAAAATAAACCTGAAAC 4854 Query 4854 TGAGTCAGGTCCTGCTGCTTGGGGTGCTTGGGACAAAAAGAAATCGGAAACTGAACCAGG 4913 ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| Sbjct 4855 TGAGTCAGGTCCTTCTACTTGGGGTGCTTGGGATACAAAGAAATCGGAAACTGAATCAGG 4914 Query 4914 TCCTGCTGGTTGGGGTATGGGGGACAAAAAGAATTCTGAAACTGAATTAGGCCCTGCTGC 4973 |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 4915 TCCTGCTGGTTGGGGTATCGTGGACAAAAAGAATTCTGAAACTGAATCAGGTCCTGCTGC 4974 Query 4974 TATGGGTAATTGGGACAAAAAGAAATCGGATAC-GAAATCAGGTCCAGCTGCTTGGGGAT 5032 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4975 TATGGGTAATTGGGACAAAAAGAAATCGGATACTGAA-TCAGGTCCAGCTGCTTGGGGAT 5033 Query 5033 CTACAGATGCTGCTGCTTGGGGTTCTAGTGACAAAAACAACTCGGAAACTGAATCAGATG 5092 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 5034 CTACAGATGCTGCTGTTTGGGGTTTTAGTGACAAAAACAATTCGGAAACTGAATCAGATG 5093 Query 5093 CTGCTGCTTGGGGTTCTAGGAACAAAAAGACTTCTGAAATTGAATCAGGTGCTGGC-GCT 5151 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| Sbjct 5094 CTGCTGCTTGGGGTTCTAGGGACAAAAAGACTTCTGAAACTGAATCAGGTGCTG-CTGCT 5152 Query 5152 TGGGGTTCGTGGGGACAGCCAAGTCCCACTGCAG-AAGACAAGGATACCAATGAGGATGA 5210 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||| Sbjct 5153 TGGGGTTCTTGGGGACAGCCAACTCCCACTGCAGCAA-ACGAGGATGCCAATGAAGATGA 5211 Query 5211 TAGAAATCC-GTGGGTTTCCTTGAAGGAGACCAAAAGTAGAGAGAAGGATGATAAAGAGA 5269 | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 5212 T-GAAAACCCGTGGGTTTCCTTGAAGGAGACCAAAAGTAGAGATAAGGATGATAAAGAGA 5270 Query 5270 GAAGCCAGTGGGGAAATCCAGCCAAGAAATTTCCATCTAGTGGTGGCTGGTCCAATGGTG 5329 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5271 GAATCCAGTGGGGAAATCCAGCCAAGAAATTTCCATCTAGTGGTGGCTGGTCCAATGGTG 5330 Query 5330 GTGGTGCAGACTGGAAAGGAAATAGGAACCATACTCCTAGGCCACCTAGATCTGAGGATA 5389 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5331 GTGGTGCAGACTGGAAAGGAAAGAGGAACCATACTCCTAGGCCACCTAGATCTGAGGATA 5390 Query 5390 ATTTGGCTCCCATGTTTACAGCAACGAGACAGCGCTTGGACTCATTCACCTCTGAGGAGC 5449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5391 ATTTGGCTCCCATGTTTACAGCAACGAGACAGCGCTTGGACTCATTCACCTCTGAGGAGC 5450 Query 5450 AAGAGCTGCTCTCAGATGTTGAGCCAGTCATGAGGACTCTCAGGAAAATTATGCATCCGT 5509 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 5451 AAGAGCTGCTCTCAGATGTTGAGCCAGTCATGAGGACTCTCAGGAAAATAATGCATCCGT 5510 Query 5510 CTGCGTACCCTGATGGAGACCCAATTTCTGATGATGACAAGACGTTTGTCCTGGAGAAGA 5569 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5511 CTGCGTACCCTGATGGAGACCCAATTTCTGATGATGACAAGACGTTTGTCCTGGAGAAGA 5570 Query 5570 TTTTGAACTTCCATCCCCAAAAAGAGACAAAGCTTGGTTCTGGCGTTGACTTCATCACGG 5629 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 5571 TTTTGAACTTCCATCCCCAAAAAGAGACAAAGCTCGGTTCTGGTGTTGATTTCATCACGG 5630 Query 5630 TTGATAAGCACACCATCTTCTCAGACAGCAGGTGCTTCTTTGTTGTCTCAACTGATGGGG 5689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5631 TTGATAAGCACACCATCTTCTCAGACAGCAGGTGCTTCTTTGTTGTCTCAACTGATGGGG 5690 Query 5690 CCAAACAGGACTTTTCATACCGAAAATCCCTCAACAACTATTTGATGAAGAAATACCCTG 5749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5691 CCAAACAGGACTTTTCATACCGAAAATCCCTCAACAACTATTTGATGATGAAATACCCTG 5750 Query 5750 ACCGTGCTGAAGAATTCATTGACAAGTACTTTACGAAACCTCGGCCTAGCGGAAACAGAG 5809 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5751 ACCGCGCTGAAGAATTCATTGACAAGTACTTTACGAAACCTCGGCCTAGCGGAAACAGAG 5810 Query 5810 ACAGGAACAACCAAGATGCCACACCACCTGGGGAAGAACAGTCTCAGCCTCCGAATCAGT 5869 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 5811 ACAGGAACAACCAAGATGCCACACCACCTGGGGAAGAACAGTCTCAGCCTCCGACTCAGT 5870 Query 5870 CTATAGGTAATGGAGGTGACGACTTTCAGACAcagactcagtctcagtctccatctcaga 5929 |||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 5871 CTATAGATAATGGTGGTGACGACTTT-A-A----GACTCAGACTCAGTCTCCATCTCAGA 5924 Query 5930 ctcgggctcagtctccat-ctcaggctcaggctcagtctccatctcagacgcagtctcag 5988 ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| Sbjct 5925 CTCAGGCTCAGGCTC-AGGCTCAGGCTCAGGCTCAGTCTCCATCTCAGACTCAGACTCAG 5983 Query 5989 tctcagtctcagtctcagtctcagtctcagtctcagtctcagtctcagtctcagtctcag 6048 |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| Sbjct 5984 TCTCCGTCTCCGTCTCAGACTCAGACTCAGTCTCAGTCTCAGACTCAGGCTCAGACTCAG 6043 Query 6049 tctc-agtctcagtctcagtctcag 6072 ||| | |||||||||| ||| ||| Sbjct 6044 ACTCCA-TCTCAGTCTCCGTCCCAG 6067 Score = 477 bits (258), Expect = 4e-133 Identities = 332/365 (91%), Gaps = 15/365 (4%) Strand=Plus/Plus Query 5990 ctcagtctcagtct-cagtctcagtctcagtctcagtctcagtctcagtctcagtctcag 6048 ||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| Sbjct 5901 CTCAGACTCAGTCTCCA-TCTCAGACTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAG 5959 Query 6049 tct-cagtctcagtctcagtctcagtctcagtctccatcccagactcagactcagtctcc 6107 ||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 5960 TCTCCA-TCTCAGACTCAGACTCAGTCTCCGTCTCCGTCTCAGACTCAGACTCAGTCTCA 6018 Query 6108 gtctcagactcaggctcaggctcagtctccatcatctcagtctccgtccCAGACGCAGAC 6167 ||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6019 GTCTCAGACTCAGGCTCAGACTCAGACT-C--CATCTCAGTCTCCGTCCCAGACGCAGAC 6075 Query 6168 ATAAACTCTTGAGAACCAAAGAAGATTTGGTTCGTTTAGGTAAACCATTCAGTCTCCACT 6227 || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 6076 AT--ACTCTTGAGAACCAAAGAAGATTTGGTTGGTTTAGGTAAACCATTGAGTCTCCACT 6133 Query 6228 GTTTTGTTTT--GATGTACATAAAGAGTGGAGAGAATGGC-GG--TT-TTTATCATTAAA 6281 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| Sbjct 6134 GTTTTGTTTTGAGATGTACATAAAGAGTGGAGAGAATGGCGGGTTTTATTTATCATTAAA 6193 Query 6282 AGACTCTGATGTGAAGTGCAAAACAATGTGTAAATGCAGTTCTCTAGTTTCAGATCGTTT 6341 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6194 AGGCTCTGATGTGAAGTGCAAAACAATGTGTAAATGCAGTTCTCTAGTTTCAGATCGTTT 6253 Query 6342 GTCCT 6346 ||||| Sbjct 6254 GTCCT 6258 Score = 202 bits (109), Expect = 3e-50 Identities = 155/177 (88%), Gaps = 4/177 (2%) Strand=Plus/Plus Query 4983 TTGGGACAAAAAGAA-ATCGGATAC-GAAATCAGGTCCAGCTGCTTGGGGATCTACAGAT 5040 ||||||||||||||| ||| || | |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| Sbjct 4513 TTGGGACAAAAAGAACGGGGGA-ACTG-AATCAGCTCCTGCTGCATGGGGTTCTACAGAT 4570 Query 5041 GCTGCTGCTTGGGGTTCTAGTGACAAAAACAACTCGGAAACTGAATCAGATGCTGCTGCT 5100 ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 4571 GCTGCTGTTTGGGGTTCTAGTGATAAAAAGAACTCGGAAACGGAATCAGATGCTGCTGCT 4630 Query 5101 TGGGGTTCTAGGAACAAAAAGACTTCTGAAATTGAATCAGGTGCTGGCGCTTGGGGT 5157 |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | || |||| Sbjct 4631 TGGGGTTCTAGGGACAAAAAGAATTCTGAAGTTGGATCAGGTGCTGGTGTTTTGGGT 4687 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 240561918933 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5