BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G40770.1
Length=5261
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg483135 jgi|Araly1|483135|fgenesh2_kg.4__2195__AT2G40770.1 3683 0.0
Ahg934443 jgi|Araly1|934443|scaffold_402431.1 1602 0.0
> Ahg483135 jgi|Araly1|483135|fgenesh2_kg.4__2195__AT2G40770.1
Length=5100
Score = 3683 bits (1994), Expect = 0.0
Identities = 2280/2415 (94%), Gaps = 32/2415 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2794 ATTGCTCCAGACAATGGTTTAAAGAAGGATGGAGAGTGTCATGAAGAATGCAAAACTCTG 2853
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2714 ATT-CTCCAGACAGTGGTTTAAAGAAGGATGGAGAGTATCATGAAGAATGCAAAACTCTG 2772
Query 2854 GATATAGTTTGTGACACACTGAAGGTTAAGTATTTATCCGCATTCAACTCAAAGCTTTCT 2913
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2773 AATATAGTTTGTGACACATTGAAAGTTAAGTATTTATCCGCATTCAACTCAAAGCTATCT 2832
Query 2914 GCAGCACAGCACGAATTCAAAAAATCATACAATCAGGTTTCTGAGTCGTTGAGCAATATG 2973
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2833 GCAGCACAGCAGGAATTCAAAAAATCATACAATCAGGTTTCTGAGTCGTTGAGCAATATG 2892
Query 2974 GGGAAACAACGTTCAGTTTGGTGGTTGGATGCCCTGCAACTTACTGAACAGAATAAAGAC 3033
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2893 GGGAAACAACGTTCAGTTTGGTGGTTGGATGCCCTGCAACTTGCTGAACAGAATAAAGAC 2952
Query 3034 TTCTCTAGCGAGTTGACAAGGAAGATTGAAGAGGCCCTCCATGGAAACTTAAACAATTCA 3093
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2953 TTCTCTAGCGAGTTGACCAGGAAGATTGAAGAGATCCTCCATGGAAGCTTAAACAATTCA 3012
Query 3094 AGCTCCTCCAGAGAGAGTTCTCGATTTAGAACTATACATGGCATGAAACTTCATCTGCAG 3153
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3013 AGCTCCTCCAGAGCGAGTTCTCGCTTTAGAACTATACATGGCATGAAACTTCATCTGCAA 3072
Query 3154 ACGTGTATGGATATGCTGGAGAGATCTAGAAAGAAAGTGATAGATAGGATTCTAGAAATT 3213
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3073 ACTTGTATGGATATGCTGGAGAGCTCTAGAAAGAAAGTGATAGATAGGATTCTAGAAATT 3132
Query 3214 GATCAGACTATGGAGAAACCAAAGTTGGAGGATATTGAGCGTATTAGCAACTGCAAGTAT 3273
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3133 GACCAGACTATGGAGAAACCAAAATTGGAGGATATTGAGCGTATTAGCAACTGCAAGTAT 3192
Query 3274 TGCAATAAGAATAG-TGATGGCCCCCCGTGTATTCATTGCGAGCTAGATGAACTATTCCA 3332
||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3193 TGCAAGAAGAA-GGATGATGGCCCCACGTGTATTCATTGCGAGCTAGATGAATTATTCCA 3251
Query 3333 GGAATATGAGGCTAGGCTTTTCCGTCTTAACAAATCTCGCAGGGGAGTAATGGAAATTGC 3392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3252 GGAATATGAGGCTAGGCTTTTCCGTCTTAACAAATCTCGCAGGGGAGTAATGGAAATTGC 3311
Query 3393 GGCTGCTGAAGAGACGGTACATTTGCAGAAGAAGAGAGATGCTCGTAATCtttt-tttAT 3451
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 3312 GGCTGCTGAAGAGACGGTACATTTGCAGAAGAAGAGAGATGCTCTTAATCTTTTCTTTA- 3370
Query 3452 TTGGTTTATCATCAAGAAGCAAGGATCTAAATGCATCACGTGGTGATGACGAGGAGCCAA 3511
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3371 TTGGTTTGTCATCAAGAAGCAAGGATCTAAATGCACCACGTGGTGATGATGAGGAGCCAA 3430
Query 3512 CCAAAAGAAATGCTGGTGACATTGTGGTTCTTTCAAAATCTCCATCTGAGACGGAAATAG 3571
||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3431 CCAAAAGAAATGCTGGTGACACCGTGGTTGTTTCTAAATCTCCATCTGAGACGGAAATAG 3490
Query 3572 TTCTTGGAGTGATAAGAAACCATTGCAAAACTCATTTAGATAGGGAAAGCAAATTGGCAG 3631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3491 TTCTTGGAGTGATAAGAAACCATTGCAAAACTCATTTAGATAGGGAAAGCAAATTGGCAG 3550
Query 3632 CTACAAAACATTTGCATACCCTTGAGGTGATGCGAAAGGAATATGTACATGCAAGGGTCT 3691
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 3551 CCACAAAACATTTGCATACCCTTGAGGTGATGCGAAAGGAATATGCACATGCAAGGGCCT 3610
Query 3692 TAGCTAGGGATCAAGCTCAACTCCTACGTGCCTATGATGAGATTAACATGTCAACAATGA 3751
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3611 TGGCTAGGGCTCAAGCTCAACTCCTACGTGCCTATGATGAGATTAACATGTCAACAATGA 3670
Query 3752 GACTACAGCTT-AGAGAATCGGAAGATGACACATCGATCTATGCTTTGGGCCGGGACGAG 3810
||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 3671 GACTACAGCTTAAG-GAATCTGAAGATGACACATCTATCTATGCTTTGAGCCGGGATGAG 3729
Query 3811 TTAGATGTTGCTAGTGTGCTGAACACAAATGACAAATTTATGGCTCAATCCTCGTTGCTT 3870
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3730 TTAGATGTTGCTAGTGTGCTGAACACAAATGATAAATTTATGGCTCAATCCTCGGTGCTT 3789
Query 3871 AGTATAAAAGGGAAACTTCGTTATTTGAAGGGTTTGATGAAATCCAAACAGAAACAAGAA 3930
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3790 AGTATCAAAGGGAAACTTCGTTATTTGAAGGGTTTGATCAAATCCAAACAGAAACAAGAA 3849
Query 3931 TCCGAGAGTCCAGATCTTTCCTCACCAATACATGAAACAGTCGATGCTTCGGATCCTGCT 3990
|| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||||| |
Sbjct 3850 TCTGAGAGTCCAGATCTTTCCTCACCAATTCACGAAACACTTGAGGCTTCAGATCCTGTT 3909
Query 3991 GAACAGGAAAGCGAAAACCTGCTTAAGAGAGATGAAGCATGCCCGATTTGTCATGAAATT 4050
||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3910 GAACAGGAAGGAGAAAACCTGCTTAAGCGAGATGAAGCATGCCCGATTTGTCAAGAAATT 3969
Query 4051 CTAAGGAATCAGAAGATGGTTTTCCAGTGCGGGCATTCCACTTGCTGTAACTGCTTTTTT 4110
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3970 CTACGGAATCAGAAGATGGTTTTCCAGTGCGGGCATTCCACTTGCTGTAACTGCTTTTTT 4029
Query 4111 GCTATGACTGAGCGCAAATCAGTTCAAGAAACGCTGCAAAAGTGGGTGATGTGTCCAATA 4170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4030 GCTATGACTGAGCGCAAATCAGTTCAAGAAACGCTGCAAAAGTGGGTGATGTGTCCAATA 4089
Query 4171 TGCAGGCAGCATACAGATGTTAGAAATATTGCATATGCTGATGATAGAAGAAACAGTTCT 4230
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 4090 TGCAGGCAGCATACAGATGTTAGAAATATTGCATATGCTGATGACAGACGAAACAGTTCT 4149
Query 4231 TCGTCAGATCAAGATCACAAAGACAGTGAAGCATCATTGGTGGTTCAAGGTTCATATGGA 4290
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4150 TCGTCAGATCAAGATCACAAAGACAATGAAGCATCATTGGTGGTTCAAGGTTCATATGGA 4209
Query 4291 ACAAAGATTGAAGCTGTTACTAGAAGAATCTTATGGATCAAGTCAAGTGACCCACAAACG 4350
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 4210 ACAAAGATCGAAGCTGTTACTAGAAGAATCTTATGGATCAAGTCAAGTGACCCGCAAGCA 4269
Query 4351 AAGGTTCTTGTTTTCTCCAGCTGGAACGATGTTCTTGATGTGTTGGAACATGCCTTCGCT 4410
||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4270 AAGGTTCTTGTCTTCTCCAGTTGGAACGACGTTCTTGATGTGTTGCAACATGCCTTCGCT 4329
Query 4411 GCAAATAGCATCACCTGCATCCGGATGAAAGGGGGCAGGAAATCACAGACAGCCATTAGC 4470
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4330 GCCAATAGCATCACCTGCATCCGGATGAAAGGAGGCAGGTAATCACAGACAGCCATTAGC 4389
Query 4471 AAATTCAAGGGATCTGAGAAAGAAACCCAAAAGACAAACTCCCATCAAAAAGAGGAAAAA 4530
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||
Sbjct 4390 AAATTCAAGGGATCTGAGAAAGAAACCCAAAAGACAAA-TC--A--AAAA-GAGGAAAA- 4442
Query 4531 TC-GATTCAAGTGTTATTGCTTTTGGTGCAGCATGGTGCCAACGGTCTTAATCTTCTAGA 4589
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4443 TCCGATTCAAGTGTTATTGCTTTTGGTGCAGCATGGTGCCAACGGTCTTAATCTTCTAGA 4502
Query 4590 AGCACAGCATGTTATTCTGGTGGAGCCACTTCTAAATCCAGCTGCGGAAGCGCAAGCTGT 4649
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4503 AGCACAGCATGTTATTCTGGTGGAGCCGCTTCTAAATCCAGCTGCGGAAGCGCAAGCTGT 4562
Query 4650 TGGGCGTGTTCACCGAATTGGACAAGAGAAGCCTACTCTAGTTCATCGGTTTCTGGTATC 4709
||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 4563 TGGGCGTGTTCACCGGATTGGACAAGAAAAACCTACTCTAGTTCATCGTTTTCTGGTAAC 4622
Query 4710 GGGCACAGTGGAAGAGAGCATCTACAAACTGAACAGGAATAAGAATACAAACTTAAGTTC 4769
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4623 GGGGACGGTGGAAGAGAGCATCTACAAACTGAACAGGAATAAGAATACAAACTTAAGTTC 4682
Query 4770 ATTTAGCAGCAGGAATACAAAGAATCAAGATCAACAGTTCTTGACACTAAAAGATCTTGA 4829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4683 ATTTAGCAGCAGGAATACAAAGAATCAAGATCAACAGTTCTTGACACTAAAAGATCTCGA 4742
Query 4830 ATCTCTATTTGCTTCACCAACAGCAGAAACAGCAGAGATGGAACAAAACCCAGGAGAGAG 4889
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||
Sbjct 4743 ATCTCTATTTGCTTCACCAGCAGCAGAAACAGCAGAGATAAAAGAAAACCCGGGAGAGAG 4802
Query 4890 ACAGGAGAATCTGAGAGATCTACCACCCTCAGTCGCTGCAGCATTAGCAGCCGAGAGGAG 4949
|| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4803 ACGGGAGAATCTGAGAGACCTACCACCCTCGGTCGCTGCAGCATTAGCAGCCGAGAGGAG 4862
Query 4950 AATGAAGGAAAGTAATGCATCCTCATCAACTACAAACGCATCATGACTATGGAAAAGGTT 5009
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4863 AATGAAGGAAAGCAGTGCATCCTCATCAGCTACAAACGCATCATGACTATGAAAAAGGTT 4922
Query 5010 GCAGAGAGATTGGTTCCAGCCAAATGTTTGTTGGAGCGTCTTGTTGTATGCACATAAGAT 5069
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4923 GCAGAGAGATTGGTTCCAGCCAAATGTTTGTTGTAGGGTCTTGTTGTATGTACATAAGAT 4982
Query 5070 GGTGAAGAGAGAAGCTGCTCGAAATAATACTTTCTCTTTTGTGTCGTCCACGTTCATTAT 5129
|||||||||||||||| ||| | | | | ||||||| || |||||| |
Sbjct 4983 GGTGAAGAGAGAAGCT-CTC----T--T--T--C------GTGTCGTTTACATTCATTTT 5025
Query 5130 GTAGGTTAGGCAAAGGATAAGCTCTTTTATTTATTCATTGTATTGCAACAGACATTACTG 5189
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5026 GTAGGTTAGGCAAAGAATAAGATCTTTTATTTATTCATTGTATTGCAACAGACATTACTT 5085
Query 5190 CGTTAGGTCTTCTAT 5204
||||||||||||||
Sbjct 5086 TGTTAGGTCTTCTAT 5100
Score = 2867 bits (1552), Expect = 0.0
Identities = 1657/1709 (97%), Gaps = 2/1709 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1063 ATTCAGGGCGGTATCCTTGCTGATGAAATGGGATTGGGAAAAACGGTGGAACTACTTGCT 1122
|||||| ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1017 ATTCAGTACGG-ATGC-TGCAGATGAAATGGGATTGGGAAAAACGGTTGAACTACTTGCT 1074
Query 1123 TGTATCTTTTCTCATCGAAAACCAGCGGAGGATGAAATTTCTGTGTCTAATGGTTCATCA 1182
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 TGCATCTTTTCTCATCGAAAACCAGCGGAGGATGAAATTTCTGTGTCTAATGGTTCATCA 1134
Query 1183 GTTACTGATGTTTTGAACGCTGGCTTGAGAAGATTGAAAAGAGAACGTGTTGAGTGCATA 1242
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 TTTACTGATGATTTGAACGCTGGCTTGAGAAGATTGAAAAGAGAACGTGTTGAGTGCATA 1194
Query 1243 TGTGGAGCTGTCAGTGAAAGTCACAAATACAAAGGAGTTTGGGTACAGTGTGACCTTTGT 1302
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 TGTGGAGCTGTCAGTGAAAGTCGCAAATACAAAGGAGTTTGGGTACAGTGTGACCTTTGT 1254
Query 1303 GATGCTTGGCAGCATGCCGACTGTGTAGGTTATTCACCTAAAGGGAAAGGTAAGAAGGAT 1362
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1255 GATGCTTGGCAGCATGCCGATTGTGTAGGTTATTCACCTAAAGGGAAAGGTAAGAAAGCT 1314
Query 1363 AGTCAACATATTGATGAAAAAGCATCTCAAAAGAAGAGCAAAAAGGATGCAACGGAAATT 1422
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 AGTCAACATGTTGATGAAAAAGTATCTCAAAAGAAGAGCAAAAAGGATGCAACGGAAATT 1374
Query 1423 ATTGTCAGAGAAGGTGAATATATTTGCCAAATGTGCTCTGAACTTCTACAAGTCACTGCC 1482
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 ATTGACAGAGAAGGTGAATATATTTGCCAAATGTGCTCTGAACTTCTACAAGTCACTGCC 1434
Query 1483 TCTCCCATCTCTACGGGTGCCACTCTTATTGTCTGTCCAGCTCCTATATTACCGCAATGG 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1435 TCTCCCATCTCTACGGGTGCCACTCTTATTGTCTGTCCAGCTCCTATATTACCACAATGG 1494
Query 1543 CATTCCGAGATTACACGCCATACACGCTTGGGATCTCTCATAACATGTATCTATGAAGGT 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 CATTCCGAGATTACACGCCATACACGCTTGGGATCTCTCGTAACATGTATCTATGAAGGT 1554
Query 1603 GTGAGGAACGCCTCACTTTCTGAAGAACCTATGATTGACATTACTGAACTTCTCAATGCG 1662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1555 GTGAGGAACGCCTCACTTTCTGAAGAACCTATGATTGACATCACTGAACTCCTCAATGCT 1614
Query 1663 GACATTGTTTTAACTACGTATGATGTCCTTAAAGAGGACTTGACACATGACTTCGACAGG 1722
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 GACATTGTTTTAACTACATATGATGTCCTTAAAGAGGACTTGACACATGACTTCGACAGG 1674
Query 1723 CATGATGGTGACCGGCACTGTCTTAGATTCCAGAAAAGGTACCCTGTTATTCCGACTCCA 1782
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 CATGATGGTGACCGGCATTGTCTTAGATTCCAGAAAAGGTACCCTGTTATTCCGACTCCA 1734
Query 1783 CTCACCAGAATATTTTGGTGGAGGATTTGTTTGGATGAGGCCCAGATGGTGGAGAGCAAT 1842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 CTCACCAGAATATTTTGGTGGAGGATTTGTTTGGATGAGGCCCAGATGGTGGAGAGCAAT 1794
Query 1843 GCAGCTGCTGCAACAGAGATGGCGTTGAGATTATACACCAAACACCGTTGGTGTATCACC 1902
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 GCAGCTGCTGCAACAGAGATGGCATTGAGATTATACACCAAACACCGTTGGTGTATCACT 1854
Query 1903 GGAACTCCTATACAACGCAAACTTGATGACTTATTTGGACTATTGAAGTTTCTTAAAGCA 1962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 GGAACTCCTATACAACGCAAACTTGATGACTTATTTGGACTATTGAAGTTTCTTAAAGCA 1914
Query 1963 AATCCTTTCGATGTTTCAAGATGGTGGATTGAAGTTATAAGAGACCCATATGAGAGGCGA 2022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 AATCCTTTCGATGTTTCAAGATGGTGGATTGAAGTTATAAGAGACCCATATGAGAGGCGA 1974
Query 2023 GACACAAAGGCCATGGAATTTACGCATAAGTTTTTCAAACAAGTTATGTGGCGTTCTTCA 2082
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 GACACAAAGGCCATGGAATTCACGCATAAGTTTTTCAAACAAGTTATGTGGCGTTCTTCA 2034
Query 2083 AAAGTCCATGTGGCTGATGAGTTGCAACTTCCACCTCAAGAGGAATGCGTCTCGTGGCTT 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2035 AAAGTCCATGTGGCTGATGAGTTGCAACTTCCACCTCAAGAGGAATGCGTCTCATGGCTC 2094
Query 2143 AAATTTTCCGCAATTGAAGAACACTTTTACAGTAGACAGCATGACACTTGTGTGAGTTAT 2202
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2095 AAATTTTCTGCAATTGAAGAACACTTCTACAGTAGACAGCATGAAACTTGTGTGAGTTAT 2154
Query 2203 GCTCGTGAAGTTATAGAAACTTTGAAACGTGATATTCTCAAAAGAGGTCATACTTCTTCT 2262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 GCTCGTGAAGTTATAGAAACTTTGAAACGTGATATTCTCAAAAGAGGTCATACTTCTTCT 2214
Query 2263 GATAATCCTTTAGTCACTCATGCTGAAGCTGCAAAACTGTTGAACTCGCTCTTGAAATTG 2322
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 GATAATCCTTTAATCACTCATGCCGAAGCTGCAAAACTGTTGAACTCGCTCTTGAAATTG 2274
Query 2323 CGCCAAGCTTGCTGCCACCCTCAAGTAGGAAGTTCAGGTTTACGCTCTTTGCAACAAAGT 2382
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
Sbjct 2275 CGCCAAGCTTGCTGCCACCCTCAAGTAGGAAGTTCAGGTTTACGTTCATTGCAACAAACT 2334
Query 2383 CCAATGACCATGGAAGAAATTTTAATGGTCCTTGTGAAAAAGACCCAGAGCGAGGGAGAA 2442
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2335 CCAATGACCATGGAAGAAATTCTAATGGTCCTTGTGAAAAAGACCCAGAAAGAGGGAGAA 2394
Query 2443 GAAGCTCTTAGAGTGTTAATTGTTGCATTAAATGGGATTGCTGCTATTGCCATGCTTAAG 2502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 GAAGCTCTTAGAGTGTTAATTGTTGCATTAAATGGGATTGCTGCTATTGCCATGCTTAAG 2454
Query 2503 CAAGAATTTTCTGAAGCTGTGTCCTTATACAAGGAAGCATTAAGTATAACTGAAGAACAC 2562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 CAAGAATTTTCTGAAGCTGTGTCCTTATACAAGGAAGCATTAAGTATAACTGAAGAACAC 2514
Query 2563 GCCGAGGATTTTCGTCTTGATCCATTGTTAAATATTCACATTCTTCACAATTTAGCTGAG 2622
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 GCTGAGGATTTTCGTCTTGATCCATTGTTAAATATTCACATTCTTCACAATTTAGCTGAG 2574
Query 2623 ATACTACCAATGGCCAAAAGCTACGGTGGAAAACTTTCTGCATCAGGAAGGCCTGAAACA 2682
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 ATACTACCAATGGCCAAAAGCTACGGCGTAAAACTTTCTGCATCAGGAAGGCCTGAAATT 2634
Query 2683 AAAATAGATGTAAAAGATGATGATCATCATCGTGCATCGAAGAGGCAAAGGATCAATGAG 2742
|||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2635 AAAATAGATGTACAGGATGACGATCATCACCGTGCATCAAAAAGGCAAAGGATCAATGAG 2694
Query 2743 CTCGAGAGTTTAACTCATGATTCTTCAGA 2771
|||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2695 CTCGAGAGTTTAACTCATGATTCTCCAGA 2723
Score = 1640 bits (888), Expect = 0.0
Identities = 979/1024 (96%), Gaps = 2/1024 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTAGGAGAAAGCAATCCAAGCCCCAGCGTGCAGTGGGTTTGATCACTCCAACTGGT 60
|||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1 ATGGGTAGGAGAAAACAATCCAAGCCACAGCGTTCAGTGGGTTTGATCACTCAAACTGGT 60
Query 61 TCTGAATCCGATAGAAATCAATTACCCGGCGACGAAGCTGAGGGTTCAGGGGACAAGAAT 120
||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 61 TCTGAATCCGATAGAAAGGATTTACCTGGCGACGAAGCTGAGGGTTCGGGGGAAAAGAAT 120
Query 121 GTTGAAGATATCGATAAGCCGTATTATGTGAACATATGTTTAAGTAGTCG-AGTTTCGGA 179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||
Sbjct 121 GTTGAAGATATCGATAAGCCGTATTATGTGAACATATGTTTAAGTAGTCGTA-TTTCTGA 179
Query 180 GCAGCAGCAGAACTTTGATTTAGCTGAAGTTGTTCTAACGAATTTTAGTGTAAGAGAACG 239
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 180 GCAGCAGCAGCACTTTGATATAGCTGAAGTTGTTCTAACGAATTTTAGTTTAAGAGAACG 239
Query 240 TGTAGGAAGTAGTAGTACATTCACAAAACCTATTGAGGTTGATCATGATCTGGATTGCTC 299
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TGTAGGAAGTAGTAGTACAGTCACAACACCTATTGAGGTTGATCATGATCTGGATTGCTC 299
Query 300 GTTACGGTTTCGGCTTTGCAATGTGACTAATTTTGTTGATCGGATTAAGCTTGGTCACTG 359
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GTTACGGTTTCGGCTTTGCAATGTGACCAATTTTGTTGATCGGATTAAGCTTGGTCACTG 359
Query 360 GCCGGTTTTGTCTTCGAGTGATATAACTTTGGAATTGGTTGATAATAAGGTGTCTGATGA 419
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 360 GCCGGTATTGTCTTCCAGTGATATAACTTTGGAATTGGTTGATAATAAAGTGTCTGATGA 419
Query 420 TGAGGTTGGGTCAGTGATTTGGTCTGCAAGTTTTGATGGTCCAGGTGAAGGGGTTTCGGG 479
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 420 TGAGGCTGGATCAGTGATTTGGTCTGCAAGTTTTGACGGTCCAGGGGAAGGGGTTTCGGG 479
Query 480 TCTTGCTCATTTGGCAAGTATAAAGTTTTTGACTTTAAGGCTCATGCCTGGTAATGAGGG 539
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 480 TCTTGCTCATTTGGCAAGTATAAAGTTCTTGACTTTAAGGCTCATGCCGGGTAATCAGGG 539
Query 540 ATTGTTGTCTCCTAGAGTTAGAGTTGAGATGCTTCAGCAGGCTTTTGATGCATGTGATTC 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 540 CTTGTTGTCTCCTAGAGTTAGAGTTGAGATGCTTCAGCAGGCTTTTGATTCTTGTGATTC 599
Query 600 TCTTCTTGAGAATACAAGGCAGATTTGGAAAAAGAGTATGATTCATGTCATGTCTTGGTT 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 600 TCTTCTTGAGAATACAAGGCAGATTTGGAAAAAGAGTATGATTCATGTCATGTCCTGGTT 659
Query 660 GAGGCCAGAGGTAATGACATCAGAGGCTAGGTATGGGACAAGATTCAACGTCAAGGATAT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 660 GAGGCCAGAGGTAATGACATCAGAGGCTAGGTATGGGACAAGATTCAACGTGAAGGATAT 719
Query 720 TGAGTCATCAGTTGTGACGGAAGATGAAACTTTGGACTCTAGTAAGCAGTCTAGTTTTGA 779
|||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 720 TGAGTCATCAGTTGCGTCGGAAGCTGAAACTTTGGACTCTAGTAAGCAGTCTGGGTTTGA 779
Query 780 TGCTGCTGCTTTTTATGAAGCCATAAAGCCATCAAAGACGGATGCAATGCTTGGAGATGA 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||
Sbjct 780 TGCTGCTGCTTTTTATGAAGCCATAAAGCCATCAAAGACGAATACGATGCTTGGAGATGA 839
Query 840 CATAGCTGATTTGCTCCCAGAACTTAGGCCGTACCAACGACGGGCAGCTTATTGGATGGT 899
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TATAACTGATTTGCTCCCAGAACTTAGGCCGTACCAACGACGGGCAGCTTATTGGATGGT 899
Query 900 TCAGCGAGAGAGAGGCGATCCAATAACGTTGGGAGACAAGGAAGACAACCAATTCATTTC 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TCAGCGAGAGAGAGGCGATCCAATAACGTTGGGAGACAAGGAAGACAACCAATTCATTTC 959
Query 960 ACCTTTGTCTATCTCCGTGGGATTCCTTGACTCTGCTACAAAAATGTTCTTGAACCCATT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 960 ACCTTTGTCTATCTCCGTGGGATTCCTTGACTCTGCTACAAAAATGTTCTTTAACCCATT 1019
Query 1020 CAGT 1023
||||
Sbjct 1020 CAGT 1023
> Ahg934443 jgi|Araly1|934443|scaffold_402431.1
Length=1348
Score = 1602 bits (867), Expect = 0.0
Identities = 972/1024 (95%), Gaps = 2/1024 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTAGGAGAAAGCAATCCAAGCCCCAGCGTGCAGTGGGTTTGATCACTCCAACTGGT 60
|||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 21 ATGGGTAGGAGAAAACAATCCAAGCCACAGCGTTCAGTGGGTTTGATCACTCAAACTGGT 80
Query 61 TCTGAATCCGATAGAAATCAATTACCCGGCGACGAAGCTGAGGGTTCAGGGGACAAGAAT 120
||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 81 TCTGAATCCGATAGAAAGGATTTACCTGGCGACGAAGCTGAGGGTTCGGGGGAAAAGAAT 140
Query 121 GTTGAAGATATCGATAAGCCGTATTATGTGAACATATGTTTAAGTAGTCG-AGTTTCGGA 179
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | |||| ||
Sbjct 141 GTTGAAGATATCGATAAGCCGTACTATGTGAACATATGTTCAACTAGTCGTA-TTTCTGA 199
Query 180 GCAGCAGCAGAACTTTGATTTAGCTGAAGTTGTTCTAACGAATTTTAGTGTAAGAGAACG 239
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 200 GCAGCAGCAGCACTTTGATATAGCTGAAGTTGTTCTAACGAATTTTAGTTTAAGAGAACG 259
Query 240 TGTAGGAAGTAGTAGTACATTCACAAAACCTATTGAGGTTGATCATGATCTGGATTGCTC 299
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260 TGTAGGAAGTAGTAGTACAGTCACAACACCTATTGAGGTTGATCATGATCTGGATTGCTC 319
Query 300 GTTACGGTTTCGGCTTTGCAATGTGACTAATTTTGTTGATCGGATTAAGCTTGGTCACTG 359
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 320 GTTACGGTTTCGGCTTTGCAATGTGACCAATTTTGTTGATCGGATTAAGCTTGGTCACTG 379
Query 360 GCCGGTTTTGTCTTCGAGTGATATAACTTTGGAATTGGTTGATAATAAGGTGTCTGATGA 419
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 380 GCCGGTATTGTCTTCCAGTGATATAACTTTGGAATTGGTTGATAATAAAGTGTCTGATGA 439
Query 420 TGAGGTTGGGTCAGTGATTTGGTCTGCAAGTTTTGATGGTCCAGGTGAAGGGGTTTCGGG 479
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 440 TGAGGCTGGATCAGTGATTTGGTCTGCAAGTTTTGACGGTCCAGGGGAAGGGGTTTCGGG 499
Query 480 TCTTGCTCATTTGGCAAGTATAAAGTTTTTGACTTTAAGGCTCATGCCTGGTAATGAGGG 539
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||
Sbjct 500 TCTTGCTCATTTGGCAAGTATAAAGTTCTTGACTTTAAGGCTGATGCCAGGTAATCAGGG 559
Query 540 ATTGTTGTCTCCTAGAGTTAGAGTTGAGATGCTTCAGCAGGCTTTTGATGCATGTGATTC 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 560 CTTGTTGTCTCCTAGAGTTAGAGTTGAGATGCTTCAGCAGGCTTTTGATTCTTGTGATTC 619
Query 600 TCTTCTTGAGAATACAAGGCAGATTTGGAAAAAGAGTATGATTCATGTCATGTCTTGGTT 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 620 TCTTCTTGAGAATACAAGGCAGATTTGGAAAAAGAGTATGATTCATGTCATGTCCTGGTT 679
Query 660 GAGGCCAGAGGTAATGACATCAGAGGCTAGGTATGGGACAAGATTCAACGTCAAGGATAT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 680 GAGGCCAGAGGTAATGACATCAGAGGCTAGGTATGGGACAAGATTCAACGTGAAGGATAT 739
Query 720 TGAGTCATCAGTTGTGACGGAAGATGAAACTTTGGACTCTAGTAAGCAGTCTAGTTTTGA 779
|||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 740 TGAGTCATCAGTTGCGTCGGAAGCTGAAACTTTGGACTCTAGTAAGCAGTCTGGGTTTGA 799
Query 780 TGCTGCTGCTTTTTATGAAGCCATAAAGCCATCAAAGACGGATGCAATGCTTGGAGATGA 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||
Sbjct 800 TGCTGCTGCTTTTTATGAAGCCATAAAGCCATCAAAGACGAATACGATGCTTGGAGATGA 859
Query 840 CATAGCTGATTTGCTCCCAGAACTTAGGCCGTACCAACGACGGGCAGCTTATTGGATGGT 899
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 860 TATAACTGATTTGCTCCCAGAACTTAGGCCGTACCAACGACGGGCAGCTTATTGGATGGT 919
Query 900 TCAGCGAGAGAGAGGCGATCCAATAACGTTGGGAGACAAGGAAGACAACCAATTCATTTC 959
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 920 TCAGCGAGAGAGAGGCGATCCAATAACGGTGGGAGACAAGGAAGACAACCAATTCAGTTC 979
Query 960 ACCTTTGTCTATCTCCGTGGGATTCCTTGACTCTGCTACAAAAATGTTCTTGAACCCATT 1019
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 980 ACCTTTGTCTATCTCCGTGGGATTCCTGGACTCTGCTACAAAAATGTTCTTTAACCCATT 1039
Query 1020 CAGT 1023
||||
Sbjct 1040 CAGT 1043
Score = 464 bits (251), Expect = 3e-129
Identities = 265/272 (97%), Gaps = 0/272 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1080 TGCTGATGAAATGGGATTGGGAAAAACGGTGGAACTACTTGCTTGTATCTTTTCTCATCG 1139
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1052 TGCAGATGAAATGGGATTGGGAAAAACGGTTGAACTACTTGCTTGCATCTTTTCTCATCG 1111
Query 1140 AAAACCAGCGGAGGATGAAATTTCTGTGTCTAATGGTTCATCAGTTACTGATGTTTTGAA 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 1112 AAAACCAGCGGAGGATGAAATTTCTGTGTCTAATGGTTCATCATTTACTGATGATTTGAA 1171
Query 1200 CGCTGGCTTGAGAAGATTGAAAAGAGAACGTGTTGAGTGCATATGTGGAGCTGTCAGTGA 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172 CGCTGGCTTGAGAAGATTGAAAAGAGAACGTGTTGAGTGCATATGTGGAGCTGTCAGTGA 1231
Query 1260 AAGTCACAAATACAAAGGAGTTTGGGTACAGTGTGACCTTTGTGATGCTTGGCAGCATGC 1319
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 AAGTCGCAAATACAAAGGAGTTTGGGTACAGTGTGACCTTTGTGATGCTTGGCAGCATGC 1291
Query 1320 CGACTGTGTAGGTTATTCACCTAAAGGGAAAG 1351
||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292 CGATTGTGTAGGTTATTCACCTAAAGGGAAAG 1323
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 199193337082
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5