BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G41700.1
Length=5846
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg483249 jgi|Araly1|483249|fgenesh2_kg.4__2309__AT2G41700.1 7973 0.0
> Ahg483249 jgi|Araly1|483249|fgenesh2_kg.4__2309__AT2G41700.1
Length=5886
Score = 7973 bits (4317), Expect = 0.0
Identities = 4671/4839 (97%), Gaps = 36/4839 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 987 ATTGCAGTTTGCATTGTGCTCTGGGATTATTACAGCTTGTACGATGGGAAGTCTCTTTAA 1046
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 ATTGTA-TTTGCATTGTGCTCTGGGATTATTACAGCTTGTACGATGGGAAGTCTCTTTAA 1121
Query 1047 GTATAGTGATAAGACCTTAGTCTTCACATACTTCTTTTTATTTGGGCTCAGCGCAATCAT 1106
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 GTATAGTGATAAGACATTAGTCTTCACATACTTCTTTTTATTTGGGCTCAGCGCAATCAT 1181
Query 1107 GCTCTCATTTATGATATCAACATTTTTTACTCGAGCAAAGACAGCTGTGGCAGTTGGGAC 1166
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 GCTCTCATTTATGATATCAACATTTTTCACTCGAGCAAAGACAGCTGTGGCAGTTGGGAC 1241
Query 1167 CCTTACCTTTCTCGGAGCCTTTTTCCCTTACTACACTGTAAACGATGAATCTGTCTCCAT 1226
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 CCTAACCTTTCTCGGAGCCTTCTTCCCTTACTACACTGTAAACGATGAATCTGTCTCCAT 1301
Query 1227 GGTATTGAAGGTAGTGGCTTCTTTGCTTTCGCCTACTGCATTTGCTCTTGGGTCAATCAA 1286
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302 GGTATTGAAGGTAGTTGCTTCTTTGCTTTCGCCTACTGCATTTGCTCTTGGGTCAATCAA 1361
Query 1287 CTTTGCTGATTATGAGCGTGCACATGTTGGACTTCGTTGGAGCAATATATGGCGGGCATC 1346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 CTTTGCTGATTATGAGCGTGCACATGTTGGACTTCGTTGGAGCAATATATGGCGGGCATC 1421
Query 1347 TTCTGGAGTAAGCTTTTTTGTCTGCCTCTTAATGATGTTGCTCGACTCTATTCTTTACTG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422 TTCTGGAGTAAGCTTTTTTGTCTGCCTCTTAATGATGTTGCTCGACTCTATTCTTTACTG 1481
Query 1407 CGCACTTGGACTTTATCTGGACAAGGTCCTCCCCAGGGAAAATGGTGTGCGGTACCCATG 1466
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 TGCACCTGGACTTTATCTGGACAAGGTCCTCCCCAGAGAAAATGGTGTGCGGTACCCATG 1541
Query 1467 GAACTTCATCTTCAGCAAGTATTTTGGGAGGAAGAAAAACAACTTACAAAATCGCATTCC 1526
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1542 GAACTTCATCTTCAGCAAGTGCTTTGGGAGGAAGAAAAAAAACTTCCAAAATCGCATTCC 1601
Query 1527 AGGTTTTGAAACTGATATGTTTCCAGCGGATATAGAGGTTAATCAGGGAGAGCCTTTTGA 1586
|||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 AGGTCTCGAAACTGATATGTTTCCGGAGGATGTAGAGCTTAATCAGGGAGAGCCTTTTGA 1661
Query 1587 TCCTGTTTTTGAATCAATAAGCCTGGAAATGAGGCAACAAGAGCTTGATGGAAGGTGCAT 1646
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1662 TCCTGTTATTGAATCAATAAGCCTGGAAATGAGGCAACAAGAGCTTGATGGGAGGTGCAT 1721
Query 1647 ACAAGTTAGAAATCTGCATAAGGTCTATGCCTCAAGAAGGGGAAATTGTTGTGCAGTTAA 1706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722 ACAAGTTAGAAATCTGCATAAGGTCTATGCCTCAAGAAGGGGAAATTGTTGTGCAGTTAA 1781
Query 1707 TTCATTGCAACTTACATTATACGAGAACCAGATACTTTCACTTCTGGGACATAATGGAGC 1766
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782 TTCATTGCGACTTACATTATACGAGAACCAGATACTTTCACTTCTGGGACATAATGGAGC 1841
Query 1767 TGGTAAAAGCACAACAATATCAATGCTTGTTGGCCTTCTTCCCCCAACGTCTGGAGATGC 1826
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 TGGTAAAAGCACAACAATATCAATGCTTGTTGGCCTTCTTCCCCCAACGTCTGGAGATGC 1901
Query 1827 CCTGATACTTGGAAACAGTATTATAACAAACATGGATGAGATACGGAAAGAACTAGGTGT 1886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902 CCTGATACTTGGAAACAGTATTATAACAAACATGGATGAGATACGGAAAGAACTAGGTGT 1961
Query 1887 TTGCCCTCAGCATGACATCCTCTTTCCAGAACTGACAGTTAGAGAACACTTGGAGATGTT 1946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962 TTGCCCTCAGCATGACATCCTCTTTCCAGAACTGACAGTTAGAGAACACTTGGAGATGTT 2021
Query 1947 TGCGGTTCTTAAAGGTGTTGAAGAAGGTTCCTTGAAGAGCACAGTTGTTGATATGGCGGA 2006
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022 TGCGGTTCTTAAAGGTGTTGAAGGAGATTCCTTGAAGAGCACAGTTGTTGATATGGCGGA 2081
Query 2007 GGAAGTGGGATTGTCTGATAAAATTAATACACTTGTACGGGCACTTTCTGGAGGGATGAA 2066
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2082 GGAAGTGGGATTGTCCGATAAAATTAGTACACTTGTGCGGGCACTTTCCGGAGGCATGAA 2141
Query 2067 GAGGAAATTGTCACTTGGAATCGCATTGATAGGTAACAGTAAGGTGATCATTCTCGATGA 2126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 2142 GAGGAAATTGTCACTTGGAATCGCATTGATAGGTAACAGTAAGATCATCATTCTCGATGA 2201
Query 2127 ACCAACCAGTGGAATGGATCCTTACTCAATGCGTCTTACATGGCAGTTAATTAAGAAAAT 2186
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 ACCAACCAGTGGAATGGATCCGTACTCAATGCGTCTTACATGGCAGTTAATTAAGAAAAT 2261
Query 2187 TAAAAAGGGTAGAATAATATTGTTGACAACACATTCCATGGATGAAGCTGAAGAACTTGG 2246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262 TAAAAAGGGTAGAATAATATTGTTGACAACACATTCCATGGATGAAGCTGAAGAACTTGG 2321
Query 2247 AGATCGGATAGGAATCATGGCTAATGGGTCTCTTAAGTGTTGTGGCAG---TTCGATTTT 2303
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2322 AGATCGGATAGGAATCATGGCAAACGGGTCTCTTAAGTGTTGTGGCAGCAGTTCGATTTT 2381
Query 2304 CCTGAAGCATCACTATGGGGTTGGTTACACTCTTACGCTAGTTAAGACTTCTCCAACTGT 2363
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 2382 CCTGAAGCATCACTATGGGGTTGGTTACACTCTTACGCTAGTAAAGACTTCTCCAGCTGT 2441
Query 2364 CTCTGTTGCCGCACATATAGTTCATCGTCACATTCCATCAGCAACCTGTGTGAGTGAGGT 2423
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 CTCTGTTGCCGCACGTATAGTTCATCGTCATATTCCTTCAGCAACCTGTGTGAGTGAGGT 2501
Query 2424 GGGAAACGAAATTTCTTTCAAGCTTCCGTTGGCTTCCTTGCCTTGTTTCGAAAATATGTT 2483
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2502 GGGAAACGAAATTTCTTTCAAGCTGCCTTTGGCTTCCTTGCCTTGTTTCGAAAACATGTT 2561
Query 2484 CAGAGAAATCGAAAGTTGCATGAAGAATTCTGTTGACAGATCTAAGATTAGTGAGATTGA 2543
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562 CAGAGAAATCGAAAGTTACATGAAGAATTCTGTTGACAGATCTAAGATTAGTGAGATTGA 2621
Query 2544 GGACTCAGATTATCCTGGTATTCAGAGTTATGGTATATCTGTCACGACACTTGAAGAGGT 2603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2622 GGACTCAGATTATCCTGGTATTCAGAGTTATGGTATATCTGTCACGACACTTGAAGAGGT 2681
Query 2604 GTTTCTGAGAGTTGCTGGCTGTAACTTAGATATCGAGGATAAGCAGGAAGATATATTTGT 2663
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2682 GTTTCTGAGAGTTGCTGGCTGTAACTTAGATATCGAAGATAAGCAGGAAGAAATATTTGT 2741
Query 2664 TTCTCCTGATACCAAGTCTTCTCTGGTATGCATTGGATCTAATCAGAAAAGTAGTATGCA 2723
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2742 TTCTCCTGATACCAAGGCTTCTCTGGTATGCATTGGATCTAATCAGAAAAGTATTATGCA 2801
Query 2724 ACCCAAGTTGCTAGCAAGTTGTAATGATGGCGCTGGAGTTATAATTACCTCAGTTGCAAA 2783
|||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2802 ACCCAAGTTGCTAGAAAGTTGTAATGAGGGGGCTAGAGTTATAATTACCTCAGTTGCAAA 2861
Query 2784 AGCTTTCAGATTAATTGTTGCTGCAGTTTGGACTCTCATTGGATTTATTAGCATTCAATG 2843
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2862 AGCTTGCAGATTAATTGTTGCTGCAGTTTGGACTCTCATTGGATTCATTAGCATGCAATG 2921
Query 2844 TTGTGGTTGTTCCATTATCTCAAGGTCAATGTTTTGGCGGCATTGCAAAGCATTGTTCAT 2903
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2922 TTGTGGTTGTTCCATTATCTCGAGGACAATGTTTTGGCGGCATTGCAAAGCATTGTTCAT 2981
Query 2904 AAAAAGAGCGAGATCTGCTTGCAGAGACCGCAAAACAGTGGCATTCCAATTCATCATCCC 2963
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2982 AAAAAGAGCCAGATCTGCTTCCAGAGACCGCAAAACAGTGGCATTCCAATTCATCATTCC 3041
Query 2964 AGCAGTTTTCTTGCTTTTTGGCCTTCTTTTTCTTCAGCTCAAGCCACATCCTGATCAAAA 3023
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3042 TGCAGTTTTCTTGCTTTTTGGCCTTCTTTTTCTTCAGCTCAAGCCACATCCTGATCAGAA 3101
Query 3024 ATCCATAACTTTGACAACTGCATATTTTAATCCTCTGCTGAGCGGAAAGGGTGGTGGTGG 3083
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 3102 ATCCATAACTTTGACAACTGCATATTTTAATCCTCTCCTGAGCGGCAACGGTGGTGGTGG 3161
Query 3084 CCCGATTCCTTTTGATCTGTCTGTGCCAATTGCCAAAGAGGTTGCACAATATATCGAAGG 3143
||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3162 TCCGGTTCCTTTTGATCTGTCTGAGCCAATTGCCAAAGAGGTTTCTCAATATATCGAAGG 3221
Query 3144 AGGCTGGATTCAGCCCTTGAGGAATACTTCATATAAATTTCCTAATCCAAAAGAGGCACT 3203
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3222 AGGCTGGATTCAGCACTTGAGGAATACTTCATATAAATTTCCTAATCCAAAAGAGGCACT 3281
Query 3204 GGCTGATGCAATTGATGCAGCAGGTCCCACGTTGGGGCCTACTCTACTTTCAATGAGCGA 3263
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3282 GGCTGATGCAATTGATGCAGCAGGTCCCACGTTGGGCCCCACTCTACTTTCAATGAGCGA 3341
Query 3264 ATTTCTGATGTCTAGTTTTGATCAGTCCTACCAGTCAAGGTATGGGTCAATTTTAATGGA 3323
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3342 ATTTCTGATGTCTAGTTTTGATCAGTCCTACCAGTCAAGGTATGGGGCAATTTTAATGGA 3401
Query 3324 TGGCCAGCATCCAGATGGGAGTTTAGGATACACCGTGTTACACAACGGTACTTGTCAGCA 3383
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3402 TGGCCAGCATCCAGATGGGAGTTTAGGATACACCGTATTACACAACGGTACTTGTCAGCA 3461
Query 3384 TGCTGGTCCAATCTACATCAATGTTATGCATGCTGCGATTCTCCGACTTGCTACGGGTAA 3443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3462 TGCTGGTCCAATCTACATCAATGTTATGCATGCTGCGATTCTCCGACTTGCTACGGGTAA 3521
Query 3444 CAAGAATATGACCATTCAAACCCGAAACCATCCTTTGCCCCCTACAAAAACTCAGCGCAT 3503
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3522 CAAGAATATGACAATTCAAACCCGAAACCATCCTTTGCCCCCTACAAAAACTCAGCGCCT 3581
Query 3504 ACAGCGTCATGATTTGGATGCTTTTTCCGCTGCAATTATTGTTAACATTGCGTTCTCGTT 3563
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3582 ACAGCGTCATGATTTGGATGCCTTTTCCGCTGCAATTATCGTTAATATTGCGTTCTCGTT 3641
Query 3564 CATCCCGGCCTCCTTTGCTGTTCCCATTGTTAAGGAGCGGGAGGTGAAAGCAAAGCATCA 3623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3642 CATCCCGGCCTCCTTTGCTGTTCCCATTGTTAAGGAGCGGGAGGTGAAAGCAAAGCATCA 3701
Query 3624 ACAGCTTATTAGTGGGGTTTCTGTTCTTTCATACTGGTTATCAACGTACGTATGGGATTT 3683
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3702 ACAGCTTATCAGTGGGGTTTCTGTTCTTTCATACTGGTTATCAACGTACGTATGGGATTT 3761
Query 3684 CATCAGTTTCTTATTTCCGTCAACATTTGCAATAATCCTTTTCTACGCTTTTGGTCTGGA 3743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3762 CATCAGTTTCTTATTTCCGTCAACATTTGCAATAATCCTCTTCTACGCTTTTGGTCTGGA 3821
Query 3744 ACAATTTATCGGAATAGGTCGGTTTCTTCCGACTGTCCTTATGCTCCTGGAGTATGGCTT 3803
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3822 ACAGTTTATCGGAATAGGACGGTTTCTTCCGACTGTTCTTATGCTCCTGGAGTATGGCTT 3881
Query 3804 GGCAATTGCATCATCAACGTACTGTCTTACATTTTTCTTCACCGAGCATAGCATGGCTCA 3863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3882 GGCAATTGCATCATCAACGTACTGTCTTACATTTTTCTTCACCGAGCATAGCATGGCTCA 3941
Query 3864 G--AA-T----G-T--T--A-T-T----CTTATGGTCCACTTCTTCTCTGGTCTTATCCT 3905
| || | | | | | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3942 GGCAACTTCTAGCTACTCTAATGTTATTCTTATGGTGCACTTCTTCTCTGGTCTTATCCT 4001
Query 3906 TATGGTTATCTCATTTGTCATGGGCCTTATTCCAGCGACTGCTAGTGCAAATTCATATCT 3965
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4002 TATGGTTATCTCATTTGTTATGGGCCTTATTCCAGCGACTGCTAGTGCAAATTCATATCT 4061
Query 3966 AAAGAACTTCTTCAGATTATCACCAGGATTTTGCTTCTCTGATGGATTGGCTTCATTAGC 4025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4062 AAAGAACTTCTTCAGATTATCACCAGGATTTTGCTTCTCTGATGGATTGGCTTCATTAGC 4121
Query 4026 GCTTCTAAGGCAGGGGATGAAAGACAAATCTAGTCATGGGGTGTTTGAATGGAACGTCAC 4085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4122 GCTTCTAAGGCAGGGGATGAAAGACAAATCTAGTCATGGGGTGTTTGAATGGAACGTCAC 4181
Query 4086 TGGAGCGTCCATCTGTTACCTGGGTTTGGAGAGTATATTCTACTTCCTTGTGACGCTTGG 4145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4182 TGGAGCGTCCATCTGTTACCTGGGTTTGGAGAGTATATTCTACTTCCTTGTGACGCTTGG 4241
Query 4146 GCTTGAGCTCATGCCTGTCCAAAAAGTGATGTCGTTCTCAATTGGGGAGTGGTGGCAGAA 4205
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4242 GCTTGAGCTCATGCCTTTCCAAAAGGTGATGTCGTTCTCAATTGGGGAGTGGTGGCAGAA 4301
Query 4206 TTTGAAGGCTTTCAAGCAAGGTGCTGGTTCTAGTTCTACAGAGCCACTTCTCAAGGATTC 4265
||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4302 TTTCAAAGCTTTCAAACAAGGTGCTGGTTCTAGTTCTACAGAGCCACTTCTCAAGGATTC 4361
Query 4266 GACTGGAGCCATTTCCACTGATATGGAAGATGACATAGACGTGCAAGAGGAAAGAGACAG 4325
| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4362 GCCTGGAGCCATTTCCGCTGATATGGAGGATGACATAGACGTGCAAGAGGAAAGAGACAG 4421
Query 4326 GGTGATTTCGGGGTTGTCAGACAACACGATGCTCTACTTACAGAACCTGAGGAAGGTCTA 4385
|||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4422 GGTGATTTCGGGGTTGACAGACAACACCATGTTCTACTTACAGAACCTGAGGAAGGTCTA 4481
Query 4386 TCCTGGTGACAAACATCACGGCCCAAAAGTAGCTGTACAGTCTTTGACTTTCTCAGTCCA 4445
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4482 TCCTGGTGACAAACATCACGGCCCAAAAGTAGCTGTACAGTCTTTGACTTTCTCGGTCCA 4541
Query 4446 AGCAGGAGAATGTTTTGGCTTTCTAGGGACGAATGGAGCTGGGAAGACTACTACCTTGTC 4505
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4542 AGCAGGAGAATGTTTTGGCTTTTTAGGGACGAATGGAGCTGGGAAGACTACTACCTTGTC 4601
Query 4506 TATGTTATCTGGAGAAGAAACTCCAACTAGTGGAACTGCCTTCATCTTTGGCAAAGACAT 4565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4602 TATGTTATCTGGAGAAGAAACTCCAACTAGTGGAACTGCCTTCATCTTTGGGAAAGACAT 4661
Query 4566 AGTAGCGAGTCCCAAAGCTATTCGTCAGCATATTGGCTACTGCCCCCAGTTCGATGCTTT 4625
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 4662 TGTAGCGAGTCCCAAAGCTATTCGTCAGCATATTGGCTACTGCCCCCAGTTTGACGCTTT 4721
Query 4626 ATTCGAGTATTTGACTGTGAAGGAGCACCTTGAACTTTATGCAAGGATCAAAGGAGTAGT 4685
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4722 ATTCGAGTACTTGACTGTGAAGGAGCACCTTGAACTTTATGCAAGGATCAAAGGAGTAGT 4781
Query 4686 TGATCATAGAATTGATAATGTGGTTACGGAAAAGTTAGTCGAGTTTGACTTGTTGAAACA 4745
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4782 TGATTATAGAATTGATAATGTGGTTACGGAAAAGTTAGTCGAGTTTGACTTGTTGAAACA 4841
Query 4746 TTCTCACAAGCCATCGTTCACTCTTAGTGGCGGAAACAAGCGCAAACTATCCGTTGCTAT 4805
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4842 TTCTCACAAGCCATCGTTCACTCTTAGCGGCGGAAACAAGCGCAAACTATCTGTTGCTAT 4901
Query 4806 TGCAATGATTGGAGATCCTCCTATTGTCATCCTCGATGAACCATCTACAGGTATGGATCC 4865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4902 TGCAATGATTGGAGATCCTCCTATTGTCATCCTCGATGAACCATCTACAGGTATGGATCC 4961
Query 4866 TGTTGCCAAAAGATTCATGTGGGATGTGATATCCCGCTTGTCGACAAGGAGTGGAAAGAC 4925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4962 TGTTGCCAAAAGATTCATGTGGGATGTGATATCCCGCTTGTCGACAAGGAGTGGAAAGAC 5021
Query 4926 AGCGGTCATTCTGACTACTCATAGCATGAATGAAGCTCAAGCACTTTGCACTAGGATCGG 4985
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5022 AGCAGTCATTCTGACTACTCATAGCATGAATGAAGCTCAAGCACTTTGCACTAGGATCGG 5081
Query 4986 GATCATGGTAGGAGGCCGCCTAAGATGCATAGGTAGTCCACAACACTTAAAGACACGCTA 5045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5082 GATCATGGTAGGAGGCCGCCTAAGATGCATAGGTAGTCCACAACACTTAAAGACACGCTA 5141
Query 5046 CGGAAACCACCTAGAGTTAGAGGTCAAACCCAATGAAGTCAGCAATGTGGAATTGGAGAA 5105
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 5142 CGGAAACCACCTTGAGTTAGAGGTCAAACCCAATGAAGTCAGCAGTGAGGAATTGGAGAA 5201
Query 5106 CTTTTGCCAAATAATTCAGCAGTGGCTGTTTAACGTTCCTACGCAGCCTAGAAGTTTACT 5165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5202 CTTTTGCCAAATAATTCAGCAGTGGCTGTTTAACGTTCCTACGCAGCCTAGAAGTTTGCT 5261
Query 5166 GGGTGATCTCGAAGTTTGTATAGGTGTCTCTGACTCGATTACTCCTGATACGGCTTCAGC 5225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5262 GGGTGATCTCGAAGTTTGTATAGGTGTCTCTGACTCGATTACTCCTGATACAGCTTCAGC 5321
Query 5226 ATCAGAAATCAGTTTGTCACCAGAAATGGTACAGAGGATTGCCAAGTTTCTTGGTAATGA 5285
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5322 ATCAGAAATCAGTTTGTCACCAGAAATGGTACAAAGTATTGCCAAGTTTCTTGGTAATGA 5381
Query 5286 GCAGAGAGTGAGTACTCTGGTACCTCCATTGCCTGAGGAAGATGTGCGATTCGATGACCA 5345
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5382 GCAGAGAGTGAGTACTCTAGTACCTCCATTGCCTGAGGAAGATGTGCGATTCGATGACCA 5441
Query 5346 GTTATCAGAGCAGCTGTTTCGAGATGGTGGTATTCCACTTCCAATATTTGCCGAGTGGTG 5405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5442 GTTATCAGAGCAGCTGTTTCGAGATGGTGGTATTCCACTTCCAATATTTGCCGAGTGGTG 5501
Query 5406 GCTAACCAAAGAAAAGTTCTCAGCATTGGATTCTTTCATACAATCTTCGTTTCCCGGTGC 5465
||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5502 GCTGACCAAAGAAAAGTTTTCAGCATTGGAGTCTTTCATACAATCTTCGTTTCCCGGTGC 5561
Query 5466 AACATTCAAAAGCTGCAATGGACTGAGTATCAAGTACCAGTTGCCATTTGGAGAAGGAGG 5525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5562 AACATTCAAAAGCTGCAATGGACTGAGTATCAAGTACCAGTTGCCGTTTGGAGAAGGAGG 5621
Query 5526 ATTGTCACTTGCGGATGCCTTTGGACATCTTGAAAGAAACCGGAATCGGCTGGGAATAGC 5585
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5622 ATTGTCACTTGCGGATGCCTTTGGACACCTTGAAAGAAACCGGAATCGGCTGGGAATAGC 5681
Query 5586 TGAATACAGTATAAGTCAATCCACACTTGAGACCATATTCAATCATTTTGCAGCTAACTC 5645
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5682 TGAATACAGCATAAGTCAATCCACACTTGAGACCATATTCAATCATTTTGCAGCTAACTC 5741
Query 5646 ATAGCCAGTGAAACCATTATTGCGGCTTGTACAACAAAAACCCTTTGTGACCATAGCCCA 5705
|||||||||| | || || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5742 ATAGCCAGTG------T-ATCGCTGCTTGTATAACAAAAAACCTTTGTGACCATAGCCCA 5794
Query 5706 AAGAGAGATCTGATCACTTATTATAATCTCATCTGCGTACTCAACATAGTTGTAAATATG 5765
|||||||||||||||||| || | | |||||| | ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5795 AAGAGAGATCTGATCACTCAT-A-A-TCTCAT-T---TACCCAACATAGTTGTAAATATG 5847
Query 5766 ACATATACATGAGAAACCTGTGGTCTTAATGTCTATATA 5804
||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 5848 ACATATATATGAGAAAGCTGTGCTCTTAATCTCTATATA 5886
Score = 1668 bits (903), Expect = 0.0
Identities = 964/994 (97%), Gaps = 2/994 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTTCATCGAAGAGGCAATTCAAGGCCATGCTCCGCAAGAATTGGCTCCTCAAAACT 60
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTTCATCGATGAGGCAATTGAAGGCCATGCTCCGCAAGAATTGGCTCCTCAAAACT 60
Query 61 CGTCATCCCTTCGTTACTTCAGCTGAGATTTTGCTTCCGACTATTGTAATGTTGCTGTTG 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 61 CGTCATCCCTTCGTTACTTCAGCTGAGATTTTACTTCCGACTCTTGTAATGTTGCTGTTG 120
Query 121 ATAGCCGTCAGGACACGGGTTGACACCACAATTCACCCGGCTCACTCGAACATAGACAAA 180
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 121 ATAGCCGTCAGGACTCGGGTTGACACCACAATTCACCCGGCTCGCTCGAACATAGAGAAA 180
Query 181 GATACAG-TCGTCGAAGTGGGCAAAGGCAACTCTCCTAGTTTTCCAGAAGTTTTGAAGCT 239
||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 181 GATAC-GATCGTCGAAGTGGGAAAAGGCAACTCTCCTAGTTTTCCACAAGTTTTGAAGCT 239
Query 240 TTTGCTTGCTGAGGGGGATTTTTTAGCTTTTGCACCTGACACTGATGAAACTAATAACAT 299
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 240 TTTGCTTGCTGAGGGGGAATTTTTAGCTTTTGCACCTGACACTGATGAAACAAATAACAT 299
Query 300 GATCGACATTTTGTCTCTTAAGTTTCCGGAACTGCGGCTAGTTACTAAAATTTTTAAAGA 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GATCGACATTTTGTCTCTTAAGTTTCCGGAACTGCGGCTAGTTACTAAAATTTTTAAAGA 359
Query 360 TGACATAGAGCTGGAAACTTATATAACATCTGCGCATTATGGTGTCTGTAGCGAAGTGAG 419
|||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 360 TGACATTGAGCTGGAAACTTATATAACCTCTGCTCATTATGGTGTCTGCACCGAAGTGAG 419
Query 420 GAATTGTTCGAATCCAAAAATAAAAGGAGCAGTGGTATTCCATGAACAAGGACCTCATTT 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GAATTGTTCGAATCCAAAAATAAAAGGAGCAGTGGTATTCCATGAACAAGGACCTCATTT 479
Query 480 GTTTGATTATAGCATCCGCTTGAACCACACATGGGCATTCGCAGGATTCCCAAATGTCAA 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 480 GTTTGATTATAGCATCCGCTTGAACCACACATGGGCATTCGCAGGATTCCCTAATGTCAA 539
Query 540 GTCGATCATGGACACAAATGGACCTTATATCAATGATCTCGAAATGGGGATTAATACCAT 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 540 GTCGATCATGGACACAAATGGACCTTATATCAATGATCTGGAAATGGGGATTAATACCAT 599
Query 600 ACCAACAATGCAATACAGCTTTAGCGGATTCTTGACTCTCCAGCAGGTGGTAGACTCTTT 659
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ACCAACAATGCAATACAGCTTCAGCGGATTCTTGACTCTTCAGCAGGTGGTAGACTCTTT 659
Query 660 CATTATATTTGCTTCTCAGCAAAATAACGACTTGCCATTATCACATTCAAATCTTAGTTC 719
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 660 CATTATATTTGCTTCTCAGCAAAATATCGACTTGCCATTATCACATTCAAATCTTGGTTC 719
Query 720 AGCTCTACGCTTTGAGCTGCCATGGACACTGTTTAGCCCCTCAGTGATAAGAATGGTTCC 779
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AGCTCTAAGCTTTGAGCTGCCATGGACTCTGTTTAGCCCCTCAGTGATAAGAATGGTTCC 779
Query 780 ATTTCCAACCCGTGAATACACTGATGATGAGTTTCAATCTATTGTCAAAAGCGTAATGGG 839
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 ATTTCCAACCCGCGAATACACTGATGATGAGTTTCAATCTATTGTCAAAAGCGTAATGGG 839
Query 840 ATTGTTGTACCTTCTGGGATTTCTGTTTCCAATCTCCCGGCTTATCAGCTACTCTGTCTT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 840 ATTGTTGTACCTTCTGGGATTTCTGTTTCCAATCTCCCGGCTTATCAGCTACTCTGTTTT 899
Query 900 TGAGAAGGAACAGAAAATAAGAGAAGGACTATACATGATGGGCTTGAAGGATGAGATCTT 959
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TGAGAAGGAACAGAAAATAAGAGAGGGACTTTACATGATGGGCTTGAAGGATGAGATCTT 959
Query 960 TCATTTGTCGTGGTTTATCACATATGCATTGCAG 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 TCATTTGTCGTGGTTTATCACATATGCATTGCAG 993
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 221457017287
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5