BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT2G45340.1

Length=2352
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg346338 jgi|Araly1|346338|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002680          3332    0.0  
  Ahg346342 jgi|Araly1|346342|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002684          2364    0.0  
  Ahg346340 jgi|Araly1|346340|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002682          2359    0.0  


> Ahg346338 jgi|Araly1|346338|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002680
Length=2079

 Score = 3332 bits (1804),  Expect = 0.0
 Identities = 1990/2081 (96%), Gaps = 7/2081 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  18    atggtctctccactcacactctttctcat-c-c-tcttcttcttcttcctttcttctgca  74
             |||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||
Sbjct  1     ATGGCCTCTCCACTCTCACTCTTTCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTTTCTCCTTCA  60

Query  75    ctgtcttcctcctcctcAGAGCTCGACATTCTCCTCGATATCAAATCCTCTCTCGACCCT  134
             |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    CTGTCTTCCTCCTCATCGGAGCTTGACATTCTCCTCGATATCAAATCCTCTCTCGACCCT  120

Query  135   GAAAAACGTTTCCTCACTTCATGGACTCCCGACGCCGACCCTTGCTCCTCTGGCTCCTTC  194
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   GAAAAACGTTTCCTTACTTCATGGACTCCCGACGCTGACCCTTGCTCCTCTGGCTCCTTC  180

Query  195   GACGGTGTCGCGTGCGACGGAAACCGCCGTGTTGCTAACATCTCTCTTCAAGGAATGGGT  254
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   GACGGTGTCGCTTGCGACGGAAACCGCCGTGTTGCTAACATCTCTCTTCAAGGAATGGGT  240

Query  255   CTCACTGGAACTATCCCTCCTTCAATCGGTCTTCTCACAAGCTTAACCGGTTTATACCTT  314
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct  241   CTCACTGGAACTATCCCTCCATCAATCGGTCTTCTCACTAGCTTAACTGGTTTATACCTT  300

Query  315   CACTTCAACTCCTTGACCGGTCATATTCCTAAAGATATCTCAAATCTGCCTCTCCTCACC  374
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  301   CACTTCAACTCCTTGACCGGTCATATTCCTAAAGATATGTCAAATCTGCCTCTCCTCACC  360

Query  375   GATTTATACCTCAATGTCAACAATCTCTCCGGTGAAATCCCTCCTCTAATCGGGAACTTA  434
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct  361   GATTTATACCTCAATGTCAACAATCTCTCCGGCGAAATCCCTCCTCAAATCGGAAACTTA  420

Query  435   GACAATCTTCAAGTTATACAGTTATGTTACAACAAGTTAAGTGGAAGTATACCGACACAG  494
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421   GACAATCTTCAAGTTATACAGTTATGTTACAACAAGTTAAGTGGAAGTATACCGACACAG  480

Query  495   TTTGGTTCTCTTAAGAAGATAACTGTCTTGGCTTTACAGTATAACCAACTCTCCGGCGCC  554
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   TTAGGTTCTCTTAAGAAGATAACTGTCTTGGCTTTACAGTATAACCAACTCTCCGGCGCC  540

Query  555   ATTCCGGCGAGTTTAGGCGATATTGA-TACGTTAACGAGGCTTGATTTGAGCTTCAACAA  613
             ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  541   ATTCCGGCGAGTTTAGGTGATA-TAAGTACGTTAACGAGACTTGATTTGAGCTTCAACAA  599

Query  614   CCTCTTTGGTCCTGTTCCGGTGAAACTCGCCGGTGCTCCTTTGCTTGAAGTTCTCGACAT  673
              |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600   TCTCTTTGGTCCTGTGCCTGTGAAACTCGCCGGTGCTCCTTTGCTTGAAGTTCTCGACAT  659

Query  674   TCGTAATAACTCCTTCTCCGGCTTCGTTCCCTCTGCTTTGAAGAGGCTAAACAATGGATT  733
             |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   TCGTAATAACTCTTTCTCAGGCTTCGTTCCCTTTGCTTTGAAGAGGCTAAACAATGGATT  719

Query  734   CCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGTTTCACTGATTTGAAAGCTTGCAC  793
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct  720   CCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGGTTCACGGATTTGAATGCTTGCAC  779

Query  794   CGGCTTAAACGGTCCGAACCCT-AACCGACCAGACCCAACAAACCCAACGAATTTCACAA  852
             ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780   CGGTTTAAACGGTCCGAA-CCTAAACCGGCCAGACCCAACAAACCCAACGAATTTCACAA  838

Query  853   CAGTTGACGTGAAACCAGAATCAGCAGATTTACAACGAAGCAATTGCAGTAACAACAATG  912
             | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839   CCGTTGACGTGAAACCAGAATCGGCAGATTTACAACGAAGCAATTGCAGTAACAACAATG  898

Query  913   GCGGGTGTTCATCAAAATCCTTAAAGTCTTCACCTTTAGGAATCGTCATGGGTCTAATAG  972
             ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct  899   GCGGGTGTTCATCAAAAACCTCAAAGTCTTCACCTTTAGGAATCGTCATGGGTCTTATGG  958

Query  973   GATCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGCGGTTCAACATTCACATGGTACAGACGAAGGA  1032
             | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959   GTTCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGTGGTTCAACATTCACATGGTACAGACGAAGGA  1018

Query  1033  AACAGAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGTAGGATTAGTACTGAGTACAACT  1092
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  1019  AACAAAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGTAGGATTAGCACTGAGTACAACT  1078

Query  1093  TCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTGATCAGCTTAGAGTACGCAAGTG  1152
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct  1079  TCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTGATCAGCCTAGAGTATGCAAGTG  1138

Query  1153  GTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAACAACAGTGCATTGTCTCAAGAAG  1212
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1139  GTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAACAACAGTGCATTGTCTCAAGAAG  1198

Query  1213  TCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGATTGAGAGAGCTACTCAGAGCTTCTCTG  1272
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1199  TCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGATTGAGAGAGCTACTCAGAGCTTCTCTG  1258

Query  1273  AGATTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTCTCTTCAGTTTATAAAGGTATCCTTAGAGATG  1332
             || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1259  AGGTTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTATCTTCGGTTTATAAAGGTATCCTTAGAGATG  1318

Query  1333  GTTCTGTTGCAGCTATCAAATGTATAGCTAAATCGAGCTGTAAATCCGATGAATCCGAGT  1392
             |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1319  GTTCTGTTGCAGCTGTAAAATGTATAGCGAAATCGAGCTGTAAATCCGATGAATCCGAGT  1378

Query  1393  TTCTCAAAGGGTTGAAGATGCTGACACTGTTGAAGCATGAGAATTTAGCGAGGTTGAGAG  1452
             |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1379  TTCTCAAAGGGTTGAAGACGCTGACATTGTTGAAGCATGAGAATTTAGTGAGGTTGAGAG  1438

Query  1453  GATTCTGCTGCTCGAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTTATCTATGAGTTTGTTCCCAATG  1512
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1439  GATTCTGCTGCTCAAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTTATCTATGAGTTTGTCCCCAATG  1498

Query  1513  GTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACTGGAGAGGTTCTTGAATGGGCAA  1572
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct  1499  GTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACTGGAGAGGTTCTCGAATGGACAA  1558

Query  1573  CTCGAGTTTCCATCATAAACGGAATCGCCAGAGGGATTGTGTACTTGCATGGAGAAAATG  1632
             |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||
Sbjct  1559  CTCGAGTTTCCATCATTAATGGCATCGCCAGAGGGATTGTTTACCTACATGGAGAAAATG  1618

Query  1633  GGAACAAACCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCAGAGAAGATTCTCATTGATCACT  1692
             | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  1619  GAAACAAGCCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCAGAGAAGATTCTCATTGATCATT  1678

Query  1693  GGTATAATCCTTCTCTTGCAGATTCCGGTCTTCACAAGCTTTTCACAGATGATATCGTTT  1752
             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct  1679  GGTATAATCCTTCTCTTGCGGATTCCGGTCTTCACAAGCTTTTCACGGATGACATCGTTT  1738

Query  1753  TCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTAGCTCCTGAGTACATAACTACAG  1812
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1739  TCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTAGCTCCTGAGTACATAACTACAG  1798

Query  1813  GGAGGTTCACTGATAAGAGCGATGTTTATGCATTTGGTATGATTCTGTTGCAGATACTGA  1872
             ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1799  GGAGGTTTACTGATAAGAGCGACGTGTATGCCTTTGGTATGATTCTGTTGCAGATACTGA  1858

Query  1873  GTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAAGCTGTAGAGTCAGGAAGACTGA  1932
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1859  GTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAAGCTGTAGAGTCAGGAAGACTGA  1918

Query  1933  ATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTCCCGGAAGTAGAAGCGGCTCAGC  1992
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||
Sbjct  1919  ATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTCCCGGAAGCAGAAGCAGCTGAGC  1978

Query  1993  TCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACTCATGAATCCTCAAACCAAAGACCATCCATGGAAG  2052
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1979  TCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACCCATGAATCCTCAAACCAGAGACCATCCATGGAAG  2038

Query  2053  ATGTTATCCAAGAACTGAATAATCTCGCCGCGGATTATTAG  2093
             | ||||| ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||
Sbjct  2039  ACGTTATGCAAGAACTGAACAAACTCGCAGCGAATTATTAG  2079


> Ahg346342 jgi|Araly1|346342|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002684
Length=1512

 Score = 2364 bits (1280),  Expect = 0.0
 Identities = 1431/1503 (95%), Gaps = 13/1503 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  593   GCTTGATTTGAGCTTCAACAACCTCTTTGGTCCTGTTCCGGTGAAACTCGCCGGTGCTCC  652
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  21    GCTTGATTTGAGCTTCAACAACCTCTTTGGTCCTGTTCCGGTGAAACTCGCTGGTGCTCC  80

Query  653   TTTGCTTGAAGTTCTCGACATTCGTAATAACTCCTTCT-CCGGCTTCGTTCCCTCTGCTT  711
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || || |  
Sbjct  81    TTTGCTTGAAGTTCTCGACATTCGTAATAAC-CCTT-TGCCGGCTTCGTT-CC-CT-C--  133

Query  712   TGAAGAGGCTAAACAATGGATTCCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGTT  771
             |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  134   T---GAGGCTAAACAATGGATTCCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGGT  190

Query  772   TCACTGATTTGAAAGCTTGCACCGGCTTAAACGGTCCGAACCCT-AACCGACCAGACCCA  830
             |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||
Sbjct  191   TCACGGATTTGAATGCTTGCACCGGTTTAAACGGTCCGAA-CCTAAACCGGCCAGACCCA  249

Query  831   ACAAACCCAACGAATTTCACAACAGTTGACGTGAAACCAGAATCAGCAGATTTACAACGA  890
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  250   ACAAACCCAACGAATTTCACAACCGTTGACGTGAAACCAGAATCAGCAGATTTACAACGA  309

Query  891   AGCAATTGCAGTAACAACAATGGCGGGTGTTCATCAAAATCCTTAAAGTCTTCACCTTTA  950
             ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct  310   AGCAATTGCAGTAACAATAATGGCGTGTGTTCATCAAAAACCTCAAAGTCTTCACCTTTA  369

Query  951   GGAATCGTCATGGGTCTAATAGGATCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGCGGTTCAACA  1010
             ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  370   GGAATCGTCATGGGTCTTATGGGTTCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGTGGTTCAACA  429

Query  1011  TTCACATGGTACAGACGAAGGAAACAGAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGT  1070
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430   TTCACATGGTACAGACGAAGGAAACAAAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGT  489

Query  1071  AGGATTAGTACTGAGTACAACTTCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTG  1130
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490   AGGATTAGCACTGAGTACAACTTCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTG  549

Query  1131  ATCAGCTTAGAGTACGCAAGTGGTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAAC  1190
             |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550   ATCAGCCTAGAGTATGCAAGTGGTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAAC  609

Query  1191  AACAGTGCATTGTCTCAAGAAGTCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGATTGAG  1250
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  610   AACAGTGCATTGTCTCAAGAAGTCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGAATGAG  669

Query  1251  AGAGCTACTCAGAGCTTCTCTGAGATTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTCTCTTCAGTT  1310
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  670   AGAGCTACTCAGAGCTTCTCTGAGGTTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTCTCTTCGGTT  729

Query  1311  TATAAAGGTATCCTTAGAGATGGTTCTGTTGCAGCTATCAAATGTATAGCTAAATCGAGC  1370
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||
Sbjct  730   TATAAAGGTATCCTTAGAGATGGTTCTGTTGCAGCTGTAAAATGTATAGCGAAATCGAGC  789

Query  1371  TGTAAATCCGATGAATCCGAGTTTCTCAAAGGGTTGAAGATGCTGACACTGTTGAAGCAT  1430
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  790   TGTAAATCCGACGAATCCGAGTTTCTCAAAGGGTTGAAGATGCTGACATTGTTGAAGCAT  849

Query  1431  GAGAATTTAGCGAGGTTGAGAGGATTCTGCTGCTCGAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTT  1490
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850   GAGAATTTAGTGAGGTTGAGAGGATTCTGCTGCTCAAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTT  909

Query  1491  ATCTATGAGTTTGTTCCCAATGGTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACT  1550
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910   ATCTATGAGTTTGTCCCCAATGGTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACT  969

Query  1551  GGAGAGGTTCTTGAATGGGCAACTCGAGTTTCCATCATAAACGGAATCGCCAGAGGGATT  1610
             ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct  970   GGAGAGGTTCTCGAATGGACAACTCGAGTTTCCATCATTAATGGCATCGCCAGAGGGATT  1029

Query  1611  GTGTACTTGCATGGAGAAAATGGGAACAAACCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCA  1670
             || ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1030  GTTTACCTACATGGAGAAAATGGAAACAAGCCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCA  1089

Query  1671  GAGAAGATTCTCATTGATCACTGGTATAATCCTTCTCTTGCAGATTCCGGTCTTCACAAG  1730
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1090  GAGAAGATTCTCATTGATCATTGGTATAATCCTTCTCTTGCGGATTCCGGTCTTCACAAG  1149

Query  1731  CTTTTCACAGATGATATCGTTTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTA  1790
             |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1150  CTTTTCACGGATGACATCGTTTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTA  1209

Query  1791  GCTCCTGAGTACATAACTACAGGGAGGTTCACTGATAAGAGCGATGTTTATGCATTTGGT  1850
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||
Sbjct  1210  GCTCCTGAGTACATAACTACAGGGAGGTTTACTGATAAGAGCGACGTGTATGCCTTTGGT  1269

Query  1851  ATGATTCTGTTGCAGATACTGAGTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAA  1910
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1270  ATGATTCTGTTGCAGATACTGAGTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAA  1329

Query  1911  GCTGTAGAGTCAGGAAGACTGAATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTC  1970
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1330  GCTGTAGAGTCAGGAAGACTGAATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTC  1389

Query  1971  CCGGAAGTAGAAGCGGCTCAGCTCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACTCATGAATCCTCA  2030
             ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1390  CCGGAAGCAGAAGCAGCTGAGCTCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACCCATGAATCCTCA  1449

Query  2031  AACCAAAGACCATCCATGGAAGATGTTATCCAAGAACTGAATAATCTCGCCGCGGATTAT  2090
             ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||
Sbjct  1450  AACCAGAGACCATCCATGGAAGACGTTATGCAAGAACTGAACAAACTCGCAGCGAATTAT  1509

Query  2091  TAG  2093
             |||
Sbjct  1510  TAG  1512


> Ahg346340 jgi|Araly1|346340|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002682
Length=1512

 Score = 2359 bits (1277),  Expect = 0.0
 Identities = 1431/1504 (95%), Gaps = 15/1504 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  593   GCTTGATTTGAGCTTCAACAACCTCTTTGGTCCTGTTCCGGTGAAACTCGCCGGTGCTCC  652
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  21    GCTTGATTTGAGCTTCAACAACCTCTTTGGTCCTGTTCCGGTGAAACTCGCTGGTGCTCC  80

Query  653   TTTGCTTGAAGTTCTCGACATTCGTAATAACTCCTTCT-CCGGCTTCGTTCCCTCTGCTT  711
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || || |  
Sbjct  81    TTTGCTTGAAGTTCTCGACATTCGTAATAAC-CCTT-TGCCGGCTTCGTT-CC-CT-C--  133

Query  712   TGAAGAGGCTAAACAATGGATTCCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGTT  771
             |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  134   T---GAGGCTAAACAATGGATTCCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGGT  190

Query  772   TCACTGATTTGAAAGCTTGCACCGGCTTAAACGGTCCGAACCCT-AACCGACCAGACCCA  830
             |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||
Sbjct  191   TCACGGATTTGAATGCTTGCACCGGTTTAAACGGTCCGAA-CCTAAACCGGCCAGACCCA  249

Query  831   ACAAACCCAACGAATTTCACAACAGTTGACGTGAAACCAGAATCAGCAGATTTACAACGA  890
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  250   ACAAACCCAACGAATTTCACAACCGTTGACGTGAAACCAGAATCAGCAGATTTACAACGA  309

Query  891   AGCAATTGCAGTAACAACAATGGCGGGTGTTCATCAAAATCCTTAAAGTCTTCACCTTTA  950
             ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct  310   AGCAATTGCAGTAACAATAATGGCGTGTGTTCATCAAAAACCTCAAAGTCTTCACCTTTA  369

Query  951   GGAATCGTCATGGGTCTAATAGGATCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGCGGTTCAACA  1010
             ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  370   GGAATCGTCATGGGTCTTATGGGTTCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGTGGTTCAACA  429

Query  1011  TTCACATGGTACAGACGAAGGAAACAGAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGT  1070
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430   TTCACATGGTACAGACGAAGGAAACAAAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGT  489

Query  1071  AGGATTAGTACTGAGTACAACTTCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTG  1130
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490   AGGATTAGCACTGAGTACAACTTCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTG  549

Query  1131  ATCAGCTTAGAGTACGCAAGTGGTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAAC  1190
             |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550   ATCAGCCTAGAGTATGCAAGTGGTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAAC  609

Query  1191  AACAGTGCATTGTCTCAAGAAGTCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGATTGAG  1250
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610   AACAGTGCATTGTCTCAAGAAGTCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGATTGAG  669

Query  1251  AGAGCTACTCAGAGCTTCTCTGAGATTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTCTCTTCAGTT  1310
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct  670   AGAGCTACTCAGAGCTTCTCTGAGGTTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTATCTTCGGTT  729

Query  1311  TATAAAGGTATCCTTAGAGATGGTTCTGTTGCAGCTATCAAATGTATAGCTAAATCGAGC  1370
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||
Sbjct  730   TATAAAGGTATCCTTAGAGATGGTTCTGTTGCAGCTGTAAAATGTATAGCGAAATCGAGC  789

Query  1371  TGTAAATCCGATGAATCCGAGTTTCTCAAAGGGTTGAAGATGCTGACACTGTTGAAGCAT  1430
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct  790   TGTAAATCCGATGAATCCGAGTTTCTCAAAGGGTTGAAGACGCTGACATTGTTGAAGCAT  849

Query  1431  GAGAATTTAGCGAGGTTGAGAGGATTCTGCTGCTCGAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTT  1490
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850   GAGAATTTAGTGAGGTTGAGAGGATTCTGCTGCTCAAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTT  909

Query  1491  ATCTATGAGTTTGTTCCCAATGGTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACT  1550
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910   ATCTATGAGTTTGTCCCCAATGGTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACT  969

Query  1551  GGAGAGGTTCTTGAATGGGCAACTCGAGTTTCCATCATAAACGGAATCGCCAGAGGGATT  1610
             ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct  970   GGAGAGGTTCTCGAATGGACAACTCGAGTTTCCATCATTAATGGCATCGCCAGAGGGATT  1029

Query  1611  GTGTACTTGCATGGAGAAAATGGGAACAAACCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCA  1670
             || ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1030  GTTTACCTACATGGAGAAAATGGAAACAAGCCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCA  1089

Query  1671  GAGAAGATTCTCATTGATCACTGGTATAATCCTTCTCTTGCAGATTCCGGTCTTCACAAG  1730
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1090  GAGAAGATTCTCATTGATCATTGGTATAATCCTTCTCTTGCGGATTCCGGTCTTCACAAG  1149

Query  1731  CTTTTCACAGATGATATCGTTTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTA  1790
             |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1150  CTTTTCACGGATGACATCGTTTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTA  1209

Query  1791  GCTCCTGAGTACATAACTACAGGGAGGTTCACTGATAAGAGCGATGTTTATGCATTTGGT  1850
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||
Sbjct  1210  GCTCCTGAGTACATAACTACAGGGAGGTTTACTGATAAGAGCGACGTGTATGCCTTTGGT  1269

Query  1851  ATGATTCTGTTGCAGATACTGAGTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAA  1910
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1270  ATGATTCTGTTGCAGATACTGAGTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAA  1329

Query  1911  GCTGTAGAGTCAGGAAGACTGAATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTC  1970
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1330  GCTGTAGAGTCAGGAAGACTGAATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTC  1389

Query  1971  CCGGAAGTAGAAGCG-GCTCAGCTCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACTCATGAATCCTC  2029
             ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1390  CCGGAAGCAGAAG-GAGCTGAGCTCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACCCATGAATCCTC  1448

Query  2030  AAACCAAAGACCATCCATGGAAGATGTTATCCAAGAACTGAATAATCTCGCCGCGGATTA  2089
             |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| ||||
Sbjct  1449  AAACCAGAGACCATCCATGGAAGACGTTATGCAAGAACTGAACAAACTCGCAGCGAATTA  1508

Query  2090  TTAG  2093
             ||||
Sbjct  1509  TTAG  1512



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 88597909870


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5