BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G45340.1 Length=2352 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg346338 jgi|Araly1|346338|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002680 3332 0.0 Ahg346342 jgi|Araly1|346342|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002684 2364 0.0 Ahg346340 jgi|Araly1|346340|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002682 2359 0.0 > Ahg346338 jgi|Araly1|346338|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002680 Length=2079 Score = 3332 bits (1804), Expect = 0.0 Identities = 1990/2081 (96%), Gaps = 7/2081 (0%) Strand=Plus/Plus Query 18 atggtctctccactcacactctttctcat-c-c-tcttcttcttcttcctttcttctgca 74 |||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || || Sbjct 1 ATGGCCTCTCCACTCTCACTCTTTCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTTTCTCCTTCA 60 Query 75 ctgtcttcctcctcctcAGAGCTCGACATTCTCCTCGATATCAAATCCTCTCTCGACCCT 134 |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTGTCTTCCTCCTCATCGGAGCTTGACATTCTCCTCGATATCAAATCCTCTCTCGACCCT 120 Query 135 GAAAAACGTTTCCTCACTTCATGGACTCCCGACGCCGACCCTTGCTCCTCTGGCTCCTTC 194 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GAAAAACGTTTCCTTACTTCATGGACTCCCGACGCTGACCCTTGCTCCTCTGGCTCCTTC 180 Query 195 GACGGTGTCGCGTGCGACGGAAACCGCCGTGTTGCTAACATCTCTCTTCAAGGAATGGGT 254 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GACGGTGTCGCTTGCGACGGAAACCGCCGTGTTGCTAACATCTCTCTTCAAGGAATGGGT 240 Query 255 CTCACTGGAACTATCCCTCCTTCAATCGGTCTTCTCACAAGCTTAACCGGTTTATACCTT 314 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 241 CTCACTGGAACTATCCCTCCATCAATCGGTCTTCTCACTAGCTTAACTGGTTTATACCTT 300 Query 315 CACTTCAACTCCTTGACCGGTCATATTCCTAAAGATATCTCAAATCTGCCTCTCCTCACC 374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CACTTCAACTCCTTGACCGGTCATATTCCTAAAGATATGTCAAATCTGCCTCTCCTCACC 360 Query 375 GATTTATACCTCAATGTCAACAATCTCTCCGGTGAAATCCCTCCTCTAATCGGGAACTTA 434 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct 361 GATTTATACCTCAATGTCAACAATCTCTCCGGCGAAATCCCTCCTCAAATCGGAAACTTA 420 Query 435 GACAATCTTCAAGTTATACAGTTATGTTACAACAAGTTAAGTGGAAGTATACCGACACAG 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GACAATCTTCAAGTTATACAGTTATGTTACAACAAGTTAAGTGGAAGTATACCGACACAG 480 Query 495 TTTGGTTCTCTTAAGAAGATAACTGTCTTGGCTTTACAGTATAACCAACTCTCCGGCGCC 554 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TTAGGTTCTCTTAAGAAGATAACTGTCTTGGCTTTACAGTATAACCAACTCTCCGGCGCC 540 Query 555 ATTCCGGCGAGTTTAGGCGATATTGA-TACGTTAACGAGGCTTGATTTGAGCTTCAACAA 613 ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 541 ATTCCGGCGAGTTTAGGTGATA-TAAGTACGTTAACGAGACTTGATTTGAGCTTCAACAA 599 Query 614 CCTCTTTGGTCCTGTTCCGGTGAAACTCGCCGGTGCTCCTTTGCTTGAAGTTCTCGACAT 673 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 TCTCTTTGGTCCTGTGCCTGTGAAACTCGCCGGTGCTCCTTTGCTTGAAGTTCTCGACAT 659 Query 674 TCGTAATAACTCCTTCTCCGGCTTCGTTCCCTCTGCTTTGAAGAGGCTAAACAATGGATT 733 |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 TCGTAATAACTCTTTCTCAGGCTTCGTTCCCTTTGCTTTGAAGAGGCTAAACAATGGATT 719 Query 734 CCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGTTTCACTGATTTGAAAGCTTGCAC 793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| Sbjct 720 CCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGGTTCACGGATTTGAATGCTTGCAC 779 Query 794 CGGCTTAAACGGTCCGAACCCT-AACCGACCAGACCCAACAAACCCAACGAATTTCACAA 852 ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 CGGTTTAAACGGTCCGAA-CCTAAACCGGCCAGACCCAACAAACCCAACGAATTTCACAA 838 Query 853 CAGTTGACGTGAAACCAGAATCAGCAGATTTACAACGAAGCAATTGCAGTAACAACAATG 912 | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 839 CCGTTGACGTGAAACCAGAATCGGCAGATTTACAACGAAGCAATTGCAGTAACAACAATG 898 Query 913 GCGGGTGTTCATCAAAATCCTTAAAGTCTTCACCTTTAGGAATCGTCATGGGTCTAATAG 972 ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 899 GCGGGTGTTCATCAAAAACCTCAAAGTCTTCACCTTTAGGAATCGTCATGGGTCTTATGG 958 Query 973 GATCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGCGGTTCAACATTCACATGGTACAGACGAAGGA 1032 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 GTTCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGTGGTTCAACATTCACATGGTACAGACGAAGGA 1018 Query 1033 AACAGAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGTAGGATTAGTACTGAGTACAACT 1092 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1019 AACAAAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGTAGGATTAGCACTGAGTACAACT 1078 Query 1093 TCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTGATCAGCTTAGAGTACGCAAGTG 1152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct 1079 TCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTGATCAGCCTAGAGTATGCAAGTG 1138 Query 1153 GTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAACAACAGTGCATTGTCTCAAGAAG 1212 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1139 GTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAACAACAGTGCATTGTCTCAAGAAG 1198 Query 1213 TCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGATTGAGAGAGCTACTCAGAGCTTCTCTG 1272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 TCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGATTGAGAGAGCTACTCAGAGCTTCTCTG 1258 Query 1273 AGATTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTCTCTTCAGTTTATAAAGGTATCCTTAGAGATG 1332 || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1259 AGGTTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTATCTTCGGTTTATAAAGGTATCCTTAGAGATG 1318 Query 1333 GTTCTGTTGCAGCTATCAAATGTATAGCTAAATCGAGCTGTAAATCCGATGAATCCGAGT 1392 |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1319 GTTCTGTTGCAGCTGTAAAATGTATAGCGAAATCGAGCTGTAAATCCGATGAATCCGAGT 1378 Query 1393 TTCTCAAAGGGTTGAAGATGCTGACACTGTTGAAGCATGAGAATTTAGCGAGGTTGAGAG 1452 |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1379 TTCTCAAAGGGTTGAAGACGCTGACATTGTTGAAGCATGAGAATTTAGTGAGGTTGAGAG 1438 Query 1453 GATTCTGCTGCTCGAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTTATCTATGAGTTTGTTCCCAATG 1512 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1439 GATTCTGCTGCTCAAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTTATCTATGAGTTTGTCCCCAATG 1498 Query 1513 GTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACTGGAGAGGTTCTTGAATGGGCAA 1572 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct 1499 GTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACTGGAGAGGTTCTCGAATGGACAA 1558 Query 1573 CTCGAGTTTCCATCATAAACGGAATCGCCAGAGGGATTGTGTACTTGCATGGAGAAAATG 1632 |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| Sbjct 1559 CTCGAGTTTCCATCATTAATGGCATCGCCAGAGGGATTGTTTACCTACATGGAGAAAATG 1618 Query 1633 GGAACAAACCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCAGAGAAGATTCTCATTGATCACT 1692 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1619 GAAACAAGCCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCAGAGAAGATTCTCATTGATCATT 1678 Query 1693 GGTATAATCCTTCTCTTGCAGATTCCGGTCTTCACAAGCTTTTCACAGATGATATCGTTT 1752 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct 1679 GGTATAATCCTTCTCTTGCGGATTCCGGTCTTCACAAGCTTTTCACGGATGACATCGTTT 1738 Query 1753 TCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTAGCTCCTGAGTACATAACTACAG 1812 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1739 TCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTAGCTCCTGAGTACATAACTACAG 1798 Query 1813 GGAGGTTCACTGATAAGAGCGATGTTTATGCATTTGGTATGATTCTGTTGCAGATACTGA 1872 ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1799 GGAGGTTTACTGATAAGAGCGACGTGTATGCCTTTGGTATGATTCTGTTGCAGATACTGA 1858 Query 1873 GTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAAGCTGTAGAGTCAGGAAGACTGA 1932 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 GTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAAGCTGTAGAGTCAGGAAGACTGA 1918 Query 1933 ATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTCCCGGAAGTAGAAGCGGCTCAGC 1992 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| Sbjct 1919 ATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTCCCGGAAGCAGAAGCAGCTGAGC 1978 Query 1993 TCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACTCATGAATCCTCAAACCAAAGACCATCCATGGAAG 2052 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1979 TCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACCCATGAATCCTCAAACCAGAGACCATCCATGGAAG 2038 Query 2053 ATGTTATCCAAGAACTGAATAATCTCGCCGCGGATTATTAG 2093 | ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||||| Sbjct 2039 ACGTTATGCAAGAACTGAACAAACTCGCAGCGAATTATTAG 2079 > Ahg346342 jgi|Araly1|346342|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002684 Length=1512 Score = 2364 bits (1280), Expect = 0.0 Identities = 1431/1503 (95%), Gaps = 13/1503 (1%) Strand=Plus/Plus Query 593 GCTTGATTTGAGCTTCAACAACCTCTTTGGTCCTGTTCCGGTGAAACTCGCCGGTGCTCC 652 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 21 GCTTGATTTGAGCTTCAACAACCTCTTTGGTCCTGTTCCGGTGAAACTCGCTGGTGCTCC 80 Query 653 TTTGCTTGAAGTTCTCGACATTCGTAATAACTCCTTCT-CCGGCTTCGTTCCCTCTGCTT 711 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || || | Sbjct 81 TTTGCTTGAAGTTCTCGACATTCGTAATAAC-CCTT-TGCCGGCTTCGTT-CC-CT-C-- 133 Query 712 TGAAGAGGCTAAACAATGGATTCCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGTT 771 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 134 T---GAGGCTAAACAATGGATTCCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGGT 190 Query 772 TCACTGATTTGAAAGCTTGCACCGGCTTAAACGGTCCGAACCCT-AACCGACCAGACCCA 830 |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| Sbjct 191 TCACGGATTTGAATGCTTGCACCGGTTTAAACGGTCCGAA-CCTAAACCGGCCAGACCCA 249 Query 831 ACAAACCCAACGAATTTCACAACAGTTGACGTGAAACCAGAATCAGCAGATTTACAACGA 890 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 250 ACAAACCCAACGAATTTCACAACCGTTGACGTGAAACCAGAATCAGCAGATTTACAACGA 309 Query 891 AGCAATTGCAGTAACAACAATGGCGGGTGTTCATCAAAATCCTTAAAGTCTTCACCTTTA 950 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 310 AGCAATTGCAGTAACAATAATGGCGTGTGTTCATCAAAAACCTCAAAGTCTTCACCTTTA 369 Query 951 GGAATCGTCATGGGTCTAATAGGATCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGCGGTTCAACA 1010 ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 370 GGAATCGTCATGGGTCTTATGGGTTCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGTGGTTCAACA 429 Query 1011 TTCACATGGTACAGACGAAGGAAACAGAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGT 1070 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 430 TTCACATGGTACAGACGAAGGAAACAAAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGT 489 Query 1071 AGGATTAGTACTGAGTACAACTTCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTG 1130 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 490 AGGATTAGCACTGAGTACAACTTCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTG 549 Query 1131 ATCAGCTTAGAGTACGCAAGTGGTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAAC 1190 |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 550 ATCAGCCTAGAGTATGCAAGTGGTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAAC 609 Query 1191 AACAGTGCATTGTCTCAAGAAGTCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGATTGAG 1250 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 610 AACAGTGCATTGTCTCAAGAAGTCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGAATGAG 669 Query 1251 AGAGCTACTCAGAGCTTCTCTGAGATTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTCTCTTCAGTT 1310 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 670 AGAGCTACTCAGAGCTTCTCTGAGGTTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTCTCTTCGGTT 729 Query 1311 TATAAAGGTATCCTTAGAGATGGTTCTGTTGCAGCTATCAAATGTATAGCTAAATCGAGC 1370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| Sbjct 730 TATAAAGGTATCCTTAGAGATGGTTCTGTTGCAGCTGTAAAATGTATAGCGAAATCGAGC 789 Query 1371 TGTAAATCCGATGAATCCGAGTTTCTCAAAGGGTTGAAGATGCTGACACTGTTGAAGCAT 1430 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 790 TGTAAATCCGACGAATCCGAGTTTCTCAAAGGGTTGAAGATGCTGACATTGTTGAAGCAT 849 Query 1431 GAGAATTTAGCGAGGTTGAGAGGATTCTGCTGCTCGAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTT 1490 |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 850 GAGAATTTAGTGAGGTTGAGAGGATTCTGCTGCTCAAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTT 909 Query 1491 ATCTATGAGTTTGTTCCCAATGGTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACT 1550 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 910 ATCTATGAGTTTGTCCCCAATGGTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACT 969 Query 1551 GGAGAGGTTCTTGAATGGGCAACTCGAGTTTCCATCATAAACGGAATCGCCAGAGGGATT 1610 ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| Sbjct 970 GGAGAGGTTCTCGAATGGACAACTCGAGTTTCCATCATTAATGGCATCGCCAGAGGGATT 1029 Query 1611 GTGTACTTGCATGGAGAAAATGGGAACAAACCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCA 1670 || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1030 GTTTACCTACATGGAGAAAATGGAAACAAGCCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCA 1089 Query 1671 GAGAAGATTCTCATTGATCACTGGTATAATCCTTCTCTTGCAGATTCCGGTCTTCACAAG 1730 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1090 GAGAAGATTCTCATTGATCATTGGTATAATCCTTCTCTTGCGGATTCCGGTCTTCACAAG 1149 Query 1731 CTTTTCACAGATGATATCGTTTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTA 1790 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1150 CTTTTCACGGATGACATCGTTTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTA 1209 Query 1791 GCTCCTGAGTACATAACTACAGGGAGGTTCACTGATAAGAGCGATGTTTATGCATTTGGT 1850 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| Sbjct 1210 GCTCCTGAGTACATAACTACAGGGAGGTTTACTGATAAGAGCGACGTGTATGCCTTTGGT 1269 Query 1851 ATGATTCTGTTGCAGATACTGAGTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAA 1910 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1270 ATGATTCTGTTGCAGATACTGAGTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAA 1329 Query 1911 GCTGTAGAGTCAGGAAGACTGAATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTC 1970 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1330 GCTGTAGAGTCAGGAAGACTGAATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTC 1389 Query 1971 CCGGAAGTAGAAGCGGCTCAGCTCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACTCATGAATCCTCA 2030 ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1390 CCGGAAGCAGAAGCAGCTGAGCTCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACCCATGAATCCTCA 1449 Query 2031 AACCAAAGACCATCCATGGAAGATGTTATCCAAGAACTGAATAATCTCGCCGCGGATTAT 2090 ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| ||||| Sbjct 1450 AACCAGAGACCATCCATGGAAGACGTTATGCAAGAACTGAACAAACTCGCAGCGAATTAT 1509 Query 2091 TAG 2093 ||| Sbjct 1510 TAG 1512 > Ahg346340 jgi|Araly1|346340|fgenesh1_pg.C_scaffold_4002682 Length=1512 Score = 2359 bits (1277), Expect = 0.0 Identities = 1431/1504 (95%), Gaps = 15/1504 (1%) Strand=Plus/Plus Query 593 GCTTGATTTGAGCTTCAACAACCTCTTTGGTCCTGTTCCGGTGAAACTCGCCGGTGCTCC 652 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 21 GCTTGATTTGAGCTTCAACAACCTCTTTGGTCCTGTTCCGGTGAAACTCGCTGGTGCTCC 80 Query 653 TTTGCTTGAAGTTCTCGACATTCGTAATAACTCCTTCT-CCGGCTTCGTTCCCTCTGCTT 711 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || || | Sbjct 81 TTTGCTTGAAGTTCTCGACATTCGTAATAAC-CCTT-TGCCGGCTTCGTT-CC-CT-C-- 133 Query 712 TGAAGAGGCTAAACAATGGATTCCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGTT 771 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 134 T---GAGGCTAAACAATGGATTCCAGTATTCAAACAATCACGGTTTATGCGGAGATGGGT 190 Query 772 TCACTGATTTGAAAGCTTGCACCGGCTTAAACGGTCCGAACCCT-AACCGACCAGACCCA 830 |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| Sbjct 191 TCACGGATTTGAATGCTTGCACCGGTTTAAACGGTCCGAA-CCTAAACCGGCCAGACCCA 249 Query 831 ACAAACCCAACGAATTTCACAACAGTTGACGTGAAACCAGAATCAGCAGATTTACAACGA 890 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 250 ACAAACCCAACGAATTTCACAACCGTTGACGTGAAACCAGAATCAGCAGATTTACAACGA 309 Query 891 AGCAATTGCAGTAACAACAATGGCGGGTGTTCATCAAAATCCTTAAAGTCTTCACCTTTA 950 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 310 AGCAATTGCAGTAACAATAATGGCGTGTGTTCATCAAAAACCTCAAAGTCTTCACCTTTA 369 Query 951 GGAATCGTCATGGGTCTAATAGGATCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGCGGTTCAACA 1010 ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 370 GGAATCGTCATGGGTCTTATGGGTTCAATCCTCGCAGTTGCAATCTTTGGTGGTTCAACA 429 Query 1011 TTCACATGGTACAGACGAAGGAAACAGAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGT 1070 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 430 TTCACATGGTACAGACGAAGGAAACAAAAGATTGGAAGCAGTCTTGATGCAATGGACGGT 489 Query 1071 AGGATTAGTACTGAGTACAACTTCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTG 1130 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 490 AGGATTAGCACTGAGTACAACTTCAAAGAAGTTTCTAGAAGAAAAAGCTCTTCTCCATTG 549 Query 1131 ATCAGCTTAGAGTACGCAAGTGGTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAAC 1190 |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 550 ATCAGCCTAGAGTATGCAAGTGGTTGGGATCCGTTAGGACGAGGACAGAGCAGTAACAAC 609 Query 1191 AACAGTGCATTGTCTCAAGAAGTCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGATTGAG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 610 AACAGTGCATTGTCTCAAGAAGTCTTTGAGAGCTTTATGTTCAATCTTGAGGAGATTGAG 669 Query 1251 AGAGCTACTCAGAGCTTCTCTGAGATTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTCTCTTCAGTT 1310 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 670 AGAGCTACTCAGAGCTTCTCTGAGGTTAACTTGTTGGGGAAGAGTAATGTATCTTCGGTT 729 Query 1311 TATAAAGGTATCCTTAGAGATGGTTCTGTTGCAGCTATCAAATGTATAGCTAAATCGAGC 1370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| Sbjct 730 TATAAAGGTATCCTTAGAGATGGTTCTGTTGCAGCTGTAAAATGTATAGCGAAATCGAGC 789 Query 1371 TGTAAATCCGATGAATCCGAGTTTCTCAAAGGGTTGAAGATGCTGACACTGTTGAAGCAT 1430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| Sbjct 790 TGTAAATCCGATGAATCCGAGTTTCTCAAAGGGTTGAAGACGCTGACATTGTTGAAGCAT 849 Query 1431 GAGAATTTAGCGAGGTTGAGAGGATTCTGCTGCTCGAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTT 1490 |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 850 GAGAATTTAGTGAGGTTGAGAGGATTCTGCTGCTCAAAAGGACGTGGAGAATGTTTCCTT 909 Query 1491 ATCTATGAGTTTGTTCCCAATGGTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACT 1550 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 910 ATCTATGAGTTTGTCCCCAATGGTAATCTTTTGCAGTATCTTGATGTGAAGGATGAGACT 969 Query 1551 GGAGAGGTTCTTGAATGGGCAACTCGAGTTTCCATCATAAACGGAATCGCCAGAGGGATT 1610 ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| Sbjct 970 GGAGAGGTTCTCGAATGGACAACTCGAGTTTCCATCATTAATGGCATCGCCAGAGGGATT 1029 Query 1611 GTGTACTTGCATGGAGAAAATGGGAACAAACCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCA 1670 || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1030 GTTTACCTACATGGAGAAAATGGAAACAAGCCTGCAATAGTTCACCAGAATCTATCTGCA 1089 Query 1671 GAGAAGATTCTCATTGATCACTGGTATAATCCTTCTCTTGCAGATTCCGGTCTTCACAAG 1730 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1090 GAGAAGATTCTCATTGATCATTGGTATAATCCTTCTCTTGCGGATTCCGGTCTTCACAAG 1149 Query 1731 CTTTTCACAGATGATATCGTTTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTA 1790 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1150 CTTTTCACGGATGACATCGTTTTCTCGAAGCTCAAAGCAAGTGCGGCAATGGGATACTTA 1209 Query 1791 GCTCCTGAGTACATAACTACAGGGAGGTTCACTGATAAGAGCGATGTTTATGCATTTGGT 1850 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| Sbjct 1210 GCTCCTGAGTACATAACTACAGGGAGGTTTACTGATAAGAGCGACGTGTATGCCTTTGGT 1269 Query 1851 ATGATTCTGTTGCAGATACTGAGTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAA 1910 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1270 ATGATTCTGTTGCAGATACTGAGTGGTAAAAGCAAAATCAGCCATTTGATGATCTTACAA 1329 Query 1911 GCTGTAGAGTCAGGAAGACTGAATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTC 1970 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1330 GCTGTAGAGTCAGGAAGACTGAATGAAGACTTCATGGATCCAAATCTTCGAAAGAACTTC 1389 Query 1971 CCGGAAGTAGAAGCG-GCTCAGCTCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACTCATGAATCCTC 2029 ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1390 CCGGAAGCAGAAG-GAGCTGAGCTCGCTAGACTTGGTCTTCTCTGCACCCATGAATCCTC 1448 Query 2030 AAACCAAAGACCATCCATGGAAGATGTTATCCAAGAACTGAATAATCTCGCCGCGGATTA 2089 |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||| Sbjct 1449 AAACCAGAGACCATCCATGGAAGACGTTATGCAAGAACTGAACAAACTCGCAGCGAATTA 1508 Query 2090 TTAG 2093 |||| Sbjct 1509 TTAG 1512 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 88597909870 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5