BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G45350.1
Length=1842
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg483672 jgi|Araly1|483672|fgenesh2_kg.4__2732__AT2G45350.1 2848 0.0
Ahg935489 jgi|Araly1|935489|scaffold_403477.1 1799 0.0
Ahg935487 jgi|Araly1|935487|scaffold_403475.1 1799 0.0
> Ahg483672 jgi|Araly1|483672|fgenesh2_kg.4__2732__AT2G45350.1
Length=1821
Score = 2848 bits (1542), Expect = 0.0
Identities = 1732/1825 (95%), Gaps = 8/1825 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 22 ATGGAGTGTTCGATTTCATCCACCATTCATGTCCTTGGAAGCTGCAAAACTTCAGATGAC 81
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1 ATGGAGTGTTCGATTTCATCCACCATTCAAGTCCTTGGAAGCTGCAAAACTTCATATGAC 60
Query 82 GTGAACCAAATCCACG-GGCGATTGATTAAGACGGGAATCATCAAAAACTCAAATCTCAC 140
|||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 61 GTGAACAAAATCCACGCGG-GATTGATTAAGACGGGAATTATCAAAAATTCTAATCTCAC 119
Query 141 TACGAGGATTGTTCTGGCTTTTGCCTCTTCTCGACGTCCGTATCTCGCCGATTTCGCGCG 200
||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 120 TACAAGGATTGTTCTCGCTTTTGCCGCTTCTCGACGACCGTATCTCGCTGAATTCGCGCG 179
Query 201 TTGTGTCTTCCACGAGTATCACGTATGTTCGTTTTCATTTGGAGAGGTGGAGGATCCATT 260
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 180 TTGTGTCTTCCACGAGTATCACGTATGTTCATTTTCACCCGGAGAGATGGAGGATCCATT 239
Query 261 TTTATGGAACGCCGTGATCAAGTCTCACTCTCATGGAAAGGATCCGAGACAAGCTCTGCT 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TTTATGGAACGCCGTGATCAAGTCTCACTCTCATGGAAAGGATCCGAGACAAGCTCTGCT 299
Query 321 CTTGCTCTGTTTGATGCTCGAGAATGGGGTTTCCGTGGACAAATTCTCACTGTCACTTGT 380
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 300 CTTGTTCTGTTTGATGCTCGAGAATGGTGTTTCCGTGGACAAATTCTCACTGTCCCTTGT 359
Query 381 TCTTAAAGCGTGTTCGAGGTTAGGTTTTGTAAAAGGAGGAATGCAGATTCATGGGTTTTT 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TCTTAAAGCGTGTTCGAGGTTAGGTTTTGTAAAAGGAGGAATGCAGATTCATGGGTTTTT 419
Query 441 GaaaaaaaCTGGACTTTGGTCGGATTTGTTTCTACAGAATTGTTTGATTGGCTTGTATCT 500
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 420 GAGAAAGACTGGACTTTGGTCGGATTTGTTTCTACAGAATTGTTTGATTGGGTTGTATCT 479
Query 501 GAAATGTGGTTGTTTAGGTTTAT-CACGCCAGATGTTTGATAGAATGCCGAAGAGAGACT 559
||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 480 GAAATGTGGTTGTTTAGGTTT-TGCCCGCCAGATATTTGATAGAATGCCGCAGAGAGACT 538
Query 560 CTGTTTCTTATAATTCCATGATTGATGGGTATGTCAAATGTGGATTGATTGTATCCGCGC 619
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 539 CTGTTTCTTACAATTCCATGATTGACGGGTATGTCAAATGCGGATTGATTGAATCCGCGC 598
Query 620 GTGAATTGTTCGATTTGATGCCTATG-GAGATGAAGAATTTGATATCTTGGAACTCTATG 678
|||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 GTGAATTGTTCGATTTGATGTC-AAGAGAGATGAAGAATTTGATATCTTGGAACTCTATG 657
Query 679 ATAAGTGGTTATGCTCAGACATCAGATGGAGTTGACATAGCGTCTAAACTGTTTGCTGAT 738
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 658 ATAAGTGGATATGCTCAGACATCAGATGGAGTTAACATAGCTTCAAAACTGTTTGCTGAA 717
Query 739 ATGCCTGAGAAGGACTTGATTTCGTGGAACTCAATGATAGATGGATATGTAAAACACGGA 798
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 718 ATGCCTGAGAAGGACTTGATTTCATGGAACTCAATGATCGATGGATATGTAAAACACGGA 777
Query 799 AGAATCGAAGATGCTAAGGGTTTATTCGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTAGTTACTTGG 858
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 778 AGAATCGAGGATGCTAAGGGTTTATTTGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTGGTTACTTGT 837
Query 859 GCTACCATGATTGATGGGTATGCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCACGCTAAGACTCTGTTT 918
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 838 GCTACCATGATTGATGGGTATGCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCAGGCTAAGACTCTGTTT 897
Query 919 GACCAAATGCCTCATAGAGATGTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAA 978
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 GACCAAATGCCTCTTAGAGATGTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAA 957
Query 979 AACAAGTATCACATGGAAGCTCTTGAAATATTTAGTGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTG 1038
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 AACAAGTGTCACATGGAAGCTCTTGAAATATTTAACGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTG 1017
Query 1039 TTACCCGATGATACGACTTTGGTAAT-AGTTCTGCCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATT 1097
| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 TCACCCGATGAAACGACTTTGGTAATCA-TTCTTTCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATT 1076
Query 1098 ATCCAAAGCCATAGATATGCATTTGTACATCGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAA 1157
||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 ATCGAAAGCCACCGATATGCATTTGTATATTGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAA 1136
Query 1158 ACTCGGTGTTGCTCTCATTGATATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTT 1217
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 ACTCGGCGTTGCTCTCATTGATATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTT 1196
Query 1218 GGTTTTCGAGGGAATCGAAAACAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCT 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 GGTTTTCGAGGGAATCGAAAACAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCT 1256
Query 1278 CGCTATTCATGGTCTAGGGGAATCTGCATTCGATATGCTCTTGCAGATTGAGAGACTCTC 1337
||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1257 AGCTGTTCATGGTCTTGGAGAATCCGCATTCAATATGCTCTTGCAGATCGAGAGACTCTC 1316
Query 1338 TTTAAAACCAGACGATATCACCTTTGTTGGCGTTTTAAATGCTTGCAGCCACTCTGGGTT 1397
||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1317 CATAATACCAGATGATATCACCTTTGTTGGAGTTTTAAATGCTTGTAGCCACTCTGGATT 1376
Query 1398 AGTAAAGGAAGGCCTTCTCTGCTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAG 1457
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 AGTGAAGGAAGGCCTTCTCTGCTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAG 1436
Query 1458 ATTGCAACACTATGGTTGTATGGTAGACATACTATCGAGATCCGGAAGTATAGAGCTAGC 1517
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1437 GTTGCAACACTATGGGTGTATGGTCGACATACTATCGAGATCCGGTAGTATAGAGCTAGC 1496
Query 1518 CAAAAACTTAATAGAGGAAATGCCTGTTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACGTTTCT 1577
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1497 CAAAAACTTAATAGAGGAAATGCCAATTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACATTTCT 1556
Query 1578 CACCGCTTGTAGTCACCACAAGGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCAAAACACCTTAT 1637
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1557 CACCGCTTGTAGTCACCACAAGGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCGAAACACCTTAT 1616
Query 1638 TTTGCAGGCTGGATATAACCCGAGCTCATATGTGCTACTCTCTAACATGTATGCTAGTTT 1697
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 TTTGCAGGCTGGCTATAACCCGAGCTCATATGTGCTTCTCTCTAACATGTATGCTAGTTT 1676
Query 1698 TGGAATGTGGAAGGATGTTCGTAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAA 1757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 TGGAATGTGGAAGGATGTTCGTAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAA 1736
Query 1758 AATTCCTGGTTGTAGTTGGATTGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAG 1817
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 AATTCCTGGATGTAGTTGGATTGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAG 1796
Query 1818 CATTGAAGTTTCCAGTACATTGTAG 1842
|||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1797 CATTGAAGTTTCCAATACATTGTAG 1821
> Ahg935489 jgi|Araly1|935489|scaffold_403477.1
Length=1282
Score = 1799 bits (974), Expect = 0.0
Identities = 1088/1144 (95%), Gaps = 4/1144 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 702 AGATGGAGTTG-A-CATAGCGTCTAAACTGTTTGCTGATATGCCTGAGAAGGACTTGATT 759
||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 119 AGATGCAATTGCAGCATAGCGTCAAAACTGTTTGCTGAAATGCCTGAGAAGGACTTGATT 178
Query 760 TCGTGGAACTCAATGATAGATGGATATGTAAAACACGGAAGAATCGAAGATGCTAAGGGT 819
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 179 TCATGGAACTCAATGATCGATGGATATGTAAAACACGGAAGAATCGAGGATGCTAAGGGT 238
Query 820 TTATTCGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTAGTTACTTGGGCTACCATGATTGATGGGTAT 879
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 239 TTATTTGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTGGTTACTTGTGCTACCATGATTGATGGGTAT 298
Query 880 GCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCACGCTAAGACTCTGTTTGACCAAATGCCTCATAGAGAT 939
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 299 GCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCAGGCTAAGACTCTGTTTGACCAAATGCCTCTTAGAGAT 358
Query 940 GTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAAAACAAGTATCACATGGAAGCT 999
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 359 GTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAAAACAAGTGTCACATGGAAGCT 418
Query 1000 CTTGAAATATTTAGTGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTGTTACCCGATGATACGACTTTG 1059
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 419 CTTGAAATATTTAACGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTGTCACCCGATGAAACGACTTTG 478
Query 1060 GTAAT-AGTTCTGCCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATTATCCAAAGCCATAGATATGCA 1118
||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 479 GTAATCA-TTCTTTCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATTATCGAAAGCCACCGATATGCA 537
Query 1119 TTTGTACATCGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAAACTCGGTGTTGCTCTCATTGA 1178
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 538 TTTGTATATTGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAAACTCGGCGTTGCTCTCATTGA 597
Query 1179 TATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTTGGTTTTCGAGGGAATCGAAAA 1238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 TATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTTGGTTTTCGAGGGAATCGAAAA 657
Query 1239 CAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCTCGCTATTCATGGTCTAGGGGA 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||
Sbjct 658 CAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCTAGCTGTTCATGGTCTTGGAGA 717
Query 1299 ATCTGCATTCGATATGCTCTTGCAGATTGAGAGACTCTCTTTAAAACCAGACGATATCAC 1358
||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||
Sbjct 718 ATCCGCATTCAATATGCTCTTGCAGATCGAGAGACTCTCCATAATACCAGATGATATCAC 777
Query 1359 CTTTGTTGGCGTTTTAAATGCTTGCAGCCACTCTGGGTTAGTAAAGGAAGGCCTTCTCTG 1418
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 778 CTTTGTTGGAGTTTTAAATGCTTGTAGCCACTCTGGATTAGTGAAGGAAGGCCTTCTCTG 837
Query 1419 CTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAGATTGCAACACTATGGTTGTAT 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 838 CTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAGGTTGCAACACTATGGGTGTAT 897
Query 1479 GGTAGACATACTATCGAGATCCGGAAGTATAGAGCTAGCCAAAAACTTAATAGAGGAAAT 1538
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 GGTCGACATACTATCGAGATCCGGTAGTATAGAGCTAGCCAAAAACTTAATAGAGGAAAT 957
Query 1539 GCCTGTTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACGTTTCTCACCGCTTGTAGTCACCACAA 1598
||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 GCCAATTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACATTTCTCACCGCTTGTAGTCACCACAA 1017
Query 1599 GGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCAAAACACCTTATTTTGCAGGCTGGATATAACCC 1658
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1018 GGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCGAAACACCTTATTTTGCAGGCTGGCTATAACCC 1077
Query 1659 GAGCTCATATGTGCTACTCTCTAACATGTATGCTAGTTTTGGAATGTGGAAGGATGTTCG 1718
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 GAGCTCATATGTGCTTCTCTCTAACATGTATGCTAGTTTTGGAATGTGGAAGGATGTTCG 1137
Query 1719 TAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAAAATTCCTGGTTGTAGTTGGAT 1778
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1138 TAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAAAATTCCTGGATGTAGTTGGAT 1197
Query 1779 TGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAGCATTGAAGTTTCCAGTACATT 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1198 TGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAGCATTGAAGTTTCCAATACATT 1257
Query 1839 GTAG 1842
||||
Sbjct 1258 GTAG 1261
> Ahg935487 jgi|Araly1|935487|scaffold_403475.1
Length=1270
Score = 1799 bits (974), Expect = 0.0
Identities = 1088/1144 (95%), Gaps = 4/1144 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 702 AGATGGAGTTG-A-CATAGCGTCTAAACTGTTTGCTGATATGCCTGAGAAGGACTTGATT 759
||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 107 AGATGCAATTGCAGCATAGCGTCAAAACTGTTTGCTGAAATGCCTGAGAAGGACTTGATT 166
Query 760 TCGTGGAACTCAATGATAGATGGATATGTAAAACACGGAAGAATCGAAGATGCTAAGGGT 819
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 167 TCATGGAACTCAATGATCGATGGATATGTAAAACACGGAAGAATCGAGGATGCTAAGGGT 226
Query 820 TTATTCGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTAGTTACTTGGGCTACCATGATTGATGGGTAT 879
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 227 TTATTTGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTGGTTACTTGTGCTACCATGATTGATGGGTAT 286
Query 880 GCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCACGCTAAGACTCTGTTTGACCAAATGCCTCATAGAGAT 939
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 287 GCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCAGGCTAAGACTCTGTTTGACCAAATGCCTCTTAGAGAT 346
Query 940 GTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAAAACAAGTATCACATGGAAGCT 999
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 347 GTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAAAACAAGTGTCACATGGAAGCT 406
Query 1000 CTTGAAATATTTAGTGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTGTTACCCGATGATACGACTTTG 1059
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 407 CTTGAAATATTTAACGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTGTCACCCGATGAAACGACTTTG 466
Query 1060 GTAAT-AGTTCTGCCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATTATCCAAAGCCATAGATATGCA 1118
||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 467 GTAATCA-TTCTTTCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATTATCGAAAGCCACCGATATGCA 525
Query 1119 TTTGTACATCGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAAACTCGGTGTTGCTCTCATTGA 1178
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 526 TTTGTATATTGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAAACTCGGCGTTGCTCTCATTGA 585
Query 1179 TATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTTGGTTTTCGAGGGAATCGAAAA 1238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 TATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTTGGTTTTCGAGGGAATCGAAAA 645
Query 1239 CAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCTCGCTATTCATGGTCTAGGGGA 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||
Sbjct 646 CAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCTAGCTGTTCATGGTCTTGGAGA 705
Query 1299 ATCTGCATTCGATATGCTCTTGCAGATTGAGAGACTCTCTTTAAAACCAGACGATATCAC 1358
||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||
Sbjct 706 ATCCGCATTCAATATGCTCTTGCAGATCGAGAGACTCTCCATAATACCAGATGATATCAC 765
Query 1359 CTTTGTTGGCGTTTTAAATGCTTGCAGCCACTCTGGGTTAGTAAAGGAAGGCCTTCTCTG 1418
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 766 CTTTGTTGGAGTTTTAAATGCTTGTAGCCACTCTGGATTAGTGAAGGAAGGCCTTCTCTG 825
Query 1419 CTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAGATTGCAACACTATGGTTGTAT 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 826 CTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAGGTTGCAACACTATGGGTGTAT 885
Query 1479 GGTAGACATACTATCGAGATCCGGAAGTATAGAGCTAGCCAAAAACTTAATAGAGGAAAT 1538
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 GGTCGACATACTATCGAGATCCGGTAGTATAGAGCTAGCCAAAAACTTAATAGAGGAAAT 945
Query 1539 GCCTGTTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACGTTTCTCACCGCTTGTAGTCACCACAA 1598
||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 946 GCCAATTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACATTTCTCACCGCTTGTAGTCACCACAA 1005
Query 1599 GGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCAAAACACCTTATTTTGCAGGCTGGATATAACCC 1658
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1006 GGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCGAAACACCTTATTTTGCAGGCTGGCTATAACCC 1065
Query 1659 GAGCTCATATGTGCTACTCTCTAACATGTATGCTAGTTTTGGAATGTGGAAGGATGTTCG 1718
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 GAGCTCATATGTGCTTCTCTCTAACATGTATGCTAGTTTTGGAATGTGGAAGGATGTTCG 1125
Query 1719 TAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAAAATTCCTGGTTGTAGTTGGAT 1778
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1126 TAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAAAATTCCTGGATGTAGTTGGAT 1185
Query 1779 TGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAGCATTGAAGTTTCCAGTACATT 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1186 TGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAGCATTGAAGTTTCCAATACATT 1245
Query 1839 GTAG 1842
||||
Sbjct 1246 GTAG 1249
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 69171884920
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5