BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G46020.2
Length=6747
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg483746 jgi|Araly1|483746|fgenesh2_kg.4__2806__AT2G46020.1 1.092e+04 0.0
> Ahg483746 jgi|Araly1|483746|fgenesh2_kg.4__2806__AT2G46020.1
Length=6561
Score = 1.092e+04 bits (5911), Expect = 0.0
Identities = 6369/6589 (97%), Gaps = 35/6589 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCAATCTGGAGGCAGTGGCGGAGGGCCCGCTCGGAATCCGGCCATGGGTCCGGCTGGT 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAATCTGGAGGCAGTGGCGGAGGGCCCGCTCGGAATCCGCCCATGGGTCCGGCTGGT 60
Query 61 CGGACTGCTTCCACGTCATCCGCTGCTTCTCCTTCTTCTTCCTCTTCATCTGTgcagcag 120
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |
Sbjct 61 CGGACTGCGTCCACGTCATCCGCTGCTTCTCCTTCTTCTTCCTCTTC--C--T-C--C-G 112
Query 121 cagcaacagcaacagcaacagcagcaacagcaacagcagctggcgtctaggcagcagcag 180
| |||| | | | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 113 -TG---CAGC-A-A-C-A-A-CAGCAACAG---CAGCAGCTGGCGTCTAGGCAGCAACAG 159
Query 181 cagcagcacagAAACTCAGATACAAACGAAAATATGTTTGCATATCAACCTGGTGGGGTT 240
|||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 160 CAGCAGCAGAGAAACTCAGATGCAAACGAAAACATGTTTGCATATCATGCTGGTGGGGTT 219
Query 241 CAGGGAATGATGGGCGGTGGCAACTTTGCTTCGTCTCCGGGCTCTATGCAAATGCCTCAG 300
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 220 CAGGGAATGATGGGAGGTGGCAACTTTGCTTCGTCTTCTGGCTCTATGCAAATGCCTCAG 279
Query 301 CAGTCTA-GAAAtttttttGAGTCTCCTCAGcaacaacaacaacaacaacaacaGGGTTC 359
||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct 280 CAGTCTAGGAAA-TTCTTTGAGTCTCCTCAACAACAACAACAACAGCAGCAACAGGGCTC 338
Query 360 TTCTACCCAAGAGGGCCAGCAAAATTTTAATCCAATGCAGCAAGCGTATATTCAGTTTGC 419
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 TTCTACCCAAGAGGGCCAGCAAAGTTTTAATCCAATGCAGCAAGCGTATATTCAGTTTGC 398
Query 420 TATGCAGGCTCAGCATCAAAAAGCACAGCAGCAAGCTAGGATGGGAATGGTGGGTTCATC 479
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||
Sbjct 399 TATACAGGCTCAGCAACAAAAAGCACAGCAGCAAGCTAGAATGGGAATGATAGGTTCATC 458
Query 480 AAGTGTGGGAAAGGATCAAGATGCACGAATGGGAATGTTGAATATGCAAGACTTGAATCC 539
|||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 459 AAGTGTCGGAAAAGATCAAGATGCACGGATGGGAATGTTGAATATACAAGATTTGAATCC 518
Query 540 GTCTAGTCAGCCCCAGGCCTCATCATCGAAGCCATCGGGCGATCAGTTTGCTCGCGGTGA 599
|||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 519 GTCTAGTCAGGCCCAGGCCTCATCGTCTAAGCCATCGGGAGATCAGTTTGGTCGCGGTGA 578
Query 600 AAGGCAGACT-GAATCAAGTTCTCAGCAAAGGAACGAAACAAAATCTCATCCTCAGCAGC 658
|||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 579 AAGGCAGA-TGGAATCAGGTTCTCAGCAAAGGAACGAAACAAATTCTCATCCTCAGCAGC 637
Query 659 AGGTGGGTACCGGACAACTAATGCCTGGAAATATGATAAGGCCAATGCAAGCACCACAGG 718
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 638 AGGTGGGTACCGGACAACTAATACCTGGAAATATGATAAGGCCAATGCAGGCACCACAGC 697
Query 719 CTCAGCAGCTTGTCAATAACATGGGAAACAACCAACTCGCATTTGCACAACAGTGGCAGG 778
|||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 698 CTCAACAGCTTATCAATAATATGGGAAATAACCAACTCGCATTTGCACAACAGTGGCAGG 757
Query 779 CAATGCAGGCATGGGCGCGTGAGCGTAATATCGATCTCTCACATCCTGCCAACGCCAGCC 838
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 CAATGCAGGCATGGGCGCGTGAGAGGAATATCGATCTCTCACATCCTGCCAACGCCAGCC 817
Query 839 AAATGGCACACATCCTTCAGGCAAGAATGGCTGCTCAACAGAAAGCTGGTGAAGGCAATG 898
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 818 AAATGGCACACATCCTTCAGGCAAGAATGGCTGCCCAACAGAAAGTTAGTGAAGGCAATG 877
Query 899 TGGCCTCACAGTCACCATCTATTCCAATCTCTAGCCAGCCGGCTTCATCTTCGGTTGTTC 958
|||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 878 TGGCTTCACAGGCACCTTCTATTCCAATCTCTAGCCAGCCGGCTTCATCTTCGGTTGTTC 937
Query 959 CAGGTGAGAATTCACCACATGCCAACTCTGCTAGTGATATCTCTGGGCAGTCAGGATCAG 1018
|||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 938 CAGGTGAGAATTCACCGCGTACCAACTCTGCTAGTGATATCTCTGGGCAGTCAGGATCAG 997
Query 1019 CGAAGGCCAGACATGCATTATCTACTGGCTCATTTGCCTCGACTTCCAGTCCCAGAATGG 1078
| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 CAAAGGCCAGGCATGCAATATCTACTGGCTCATTTGCTTCGACTTCCAGTCCCAGAATGG 1057
Query 1079 TCAATCCTGCTATGAATCCCTTCTCCGGCCAAGGGAGAGAGAATCCAATGTATCCTCGAC 1138
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1058 TCAATCCTGCTATGAATCCCTTCTCCGTCCAAGGGAGAGATAATCCAATGTATCCTCGAC 1117
Query 1139 ATTTAGTTCAGCCTACAAATGGGATGCCCTCAGGAAATCCCCTGCAGACTTCTGCAAATG 1198
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1118 ATTTAGTTCAGCCTACAAATGGGATGCCCTCAGGAAATTCCCTGCAGACTTCTGCAAATG 1177
Query 1199 AGACTCCTGTTTTGGATCAGAATGCATCTACaaaaaaaaGTTTAGGTCCTGCTGAACATT 1258
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 AGACTCTTGTTTTGGATCAGAATGTGTCTACAAAAAAAAGTTTAGGTCCTGCTGAACATT 1237
Query 1259 TGCAAATGCAGCAGCCTAGGCAACTGAATACACCGACTCCAAATTTAGTAGCGCCATCTG 1318
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1238 TGCAAATGCAGCAGCCTAGGCAACTGAATGCACCGACTTCAAATTTACTAGCGCCATCTG 1297
Query 1319 ATACTGGTCCACTCAGTAACTCGTCCCTTCAGAGTGGACAGGGGACCCAACAAGCACAGC 1378
||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 ATACTGGTCCACTCAGTAATTCTTCCTTTCAGAGTGGACAGGGGACCCAACAAGCACAGC 1357
Query 1379 AGCGATCAGGATTTACCAAACAGCAACTCCATGTTCTCAAAGCCCAGATACTGGCATTTA 1438
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 AGCGAGCAGGATTTACCAAACAGCAACTCCATGTTCTCAAAGCCCAGATACTGGCATTTA 1417
Query 1439 GGCGTTTGAAGAAAGGGGAAGGTTCTTTGCCTCCGGAGCTTCTTCAAGCTATTTCTCCAC 1498
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1418 GGCGTTTGAAGAAAGGGGAAGGTTCTTTGCCTCCAGAGCTTCTTCAAGCTATTGCTCCAC 1477
Query 1499 CACCGCTTGAACTACAGACGCAGAGGCAAATATCTCCTGCCATAG-GGA-AAGTTCAGGA 1556
|||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||
Sbjct 1478 CACCGCTTCAACTGCAGACACAGAGGCAAATAACTCCTG--TTGGAGGACAAGTTCAGGA 1535
Query 1557 TAGATCTTCAG-ACAAAACTGGAGAAGACCAAGCAAGGTCGCTAGAGTGTGGCAAGGAGT 1615
|||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1536 TAGAGCTTCAGAAC-AAACTGGAGAAGACCAAGCAAGGTCGCTAGAGTGTGGCAAAGAGT 1594
Query 1616 CTCAGGCTGCTGCTTCTTCAAATGGACCAATTTTTTCTAAAGAGGAAGATAATGTTGGAG 1675
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595 CTCAGGCTGCTGCTTCTTCAAATGGACCGATTTTTTCTAAAGAGGAAGATAATGTTGGAG 1654
Query 1676 ATACAGAAGTAGCTTTGACGACAGGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCTGGGAAAAGAAG 1735
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 ATACAGAAGTAGCTTTGACAACAGGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCTGGGAAAAGAAG 1714
Query 1736 CTACTTCTACTGACGTGGCTACGAAAGAGGAGCAACAGACTGATGTATTCCCTGTTAAGT 1795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1715 CTACTTCTACTGACGTGGCTACGAAAGAGGAGCAACAAACTGATGTATTCCCTGTTAAGT 1774
Query 1796 CAGACCAAGGAGCAGATTCTAGTACTCAAAAGAATCCTAGAAGTGATTCTACAGCTGATA 1855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 CAGACCAAGGAGCAGATTCTAGTACTCAAAAGAATCCTAGAAGTGATTCTACAGCTGATA 1834
Query 1856 AGGGAAAGGCTGTTGCATCTGATGGAAGCCAATCTAAGGTTCCTCCACAAGCAAACTCTC 1915
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1835 AGGGAAAGGCTGTTGTATCTGATGGAAGCCAATCTAAGGTTCCTCCACAAGCAAACTCTC 1894
Query 1916 CCCAGCCGCCCAAGGATACAGCCTCTGCCAGGAAATATTATGGACCGTTGTTTGATTTTC 1975
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895 CCCAGCAGCCCAAGGATACAGCCTCTGCCAGGAAATATTATGGACCGTTGTTTGATTTTC 1954
Query 1976 CCTTTTTCACTCGAAAACTTGACTCTTATGGGTCTGCAACAGCCAATGCCAATAACAATC 2035
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1955 CCTTTTTCACTCGAAAACTTGATTCTTATGGGTCTGCAACAGCCAATGCCAATAACAATC 2014
Query 2036 TCACATTAGCATATGATATTAAAGATCTGATTTGTGAAGAAGGTGCAGAGTTCCTTAGTA 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 TCACATTAGCATATGATATTAAAGATCTGATTTGTGATGAAGGTGCAGAGTTCCTTAGTA 2074
Query 2096 AGAAAAGAACAGACAGTTTGAAGAAGATAAATGGTCTGCTAGCAAAAAATTTAGAAAGGA 2155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2075 AGAAAAGAACAGACAGTTTGAAGAAGATAAATGGTCTGCTAGCAAAAAATTTAGAAAGGA 2134
Query 2156 AAAGGATTAGGCCTGATCTTGTTTTACGGCTTCAAATTGAAGAGAAAAAGCTTAGGCTAT 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 AAAGGATTAGGCCTGATCTTGTTTTACGGCTTCAAATTGAAGAGAAAAAGCTTAGGCTAT 2194
Query 2216 CTG-ATCTTCAGTCTCGTGTTAGAGAGGAAGTAGATCGACAACAACAGGAGATAATGTCC 2274
| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195 C-GAATCTTCAGTCTCGTGTTAGAGAGGAAGTGGATCGACAACAACAGGAGATAATGTCC 2253
Query 2275 ATGCCGGATAGGCCGTACCGCAAATTTGTGAGGTTATGCGAACGGCAACGCCTAGAAATG 2334
||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2254 ATGCCCGATAGGCCATACCGCAAATTTGTGAGGTTGTGCGAACGGCAACGCCTTGAAATG 2313
Query 2335 AATAGACAAGTACTGGCCAATCAGAAAGCTGTCAGAGAGAAGCAGCTGAAAACCATTTTT 2394
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2314 AATAGACAAGTACTGGCCAACCAGAAAGCTGTTAGAGAGAAGCAGCTGAAAACCATTTTT 2373
Query 2395 CAGTGGCGTAAGAAACTCCTTGAGGCTCATTGGGCTATACGTGATGCACGCACTGCTCGT 2454
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2374 CAGTGGCGTAAGAAACTCCTTGAGGCTCACTGGGCTATACGTGATGCACGCACTGCTCGT 2433
Query 2455 AACAGGGGAGTGGCCAAATACCATGAAAAGATGTTGAGAGAGTTTTCAAAGAGAAAAGAT 2514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2434 AACAGGGGAGTGGCCAAATACCATGAAAAGATGTTGAGAGAGTTTTCGAAGAGAAAAGAT 2493
Query 2515 GATGGCCGCAACAAAAGGATGGAGGCCTTGAAGAATAATGATGTAGAAAGATACAGGGAG 2574
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2494 GATGGCCGGAACAAAAGGATGGAGGCCTTGAAGAATAATGATGTAGAAAGGTACAGGGAG 2553
Query 2575 ATGTTGCTGGAACAGCAAACTAATATGCCTGGTGATGCTGCTGAAAGATATGCTGTTCTC 2634
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2554 ATGTTGCTGGAACAGCAAACAAATATGCCTGGTGATGCTGCTGAAAGATATGCTGTTCTC 2613
Query 2635 TCTTCATTTTTGACCCAAACCGAAGATTATCTTCATAAACTTGGAGGTAAGATTACTGCC 2694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2614 TCTTCATTTTTGACCCAAACCGAAGATTATCTTCATAAACTTGGAGGTAAGATTACTGCC 2673
Query 2695 ACAAAAAATCAACAGGAAGTGGAGGAGGCAGCAAATGCTGCAGCAGTAGCAGCGAGATTG 2754
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2674 ACAAAAAATCAACAGGAAGTGGAGGAGGCAGCGAATGCTGCAGCAGTAGCAGCCAGATTG 2733
Query 2755 CAGGGGTTGTCAGAAGAAGAGGTCAGGGCAGCAGCTACTTGTGCTCGAGAAGAAGTTGTG 2814
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2734 CAGGGCTTGTCAGAAGAAGAGGTCAGGGCAGCAGCTACTTGTGCTCGAGAAGAAGTTGTG 2793
Query 2815 ATCAGAAATAGATTTACGGAAATGAATGCGCCAAAAGAAAATTCATCTGTCAACAAGTAC 2874
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2794 ATCAGAAATAGATTTACGGAAATGAATGCGCCAAAAGAAAATTCATCTGTCAACAAGTAT 2853
Query 2875 TATACTCTGGCTCATGCTGTAAATGAAGTGGTTGTAAGACAACCTTCAATGCTTCAGGCT 2934
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2854 TATACTCTGGCTCATGCTGTAAATGAAGTGGTTATAAGACAACCTTCAATGCTTCAGGCT 2913
Query 2935 GGAACTTTGCGTGATTACCAGCTGGTTGGATTACAATGGATGCTATCGTTGTATAATAAC 2994
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2914 GGAACTTTGCGTGATTACCAGCTGGTTGGATTACAATGGATGCTATCGCTGTATAATAAC 2973
Query 2995 AAATTAAACGGGATCTTGGCTGATGAGATGGGTCTTGGAAAAACTGTTCAGGTAATGGCA 3054
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2974 AAATTAAATGGGATCTTGGCTGATGAGATGGGTCTTGGAAAAACTGTGCAGGTAATGGCA 3033
Query 3055 CTGATTGCTTACCTTATGGAGTTTAAAGGGAATTATGGACCGCATCTCATCATCGTTCCC 3114
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3034 CTGATTGCTTACCTTATGGAGTTTAAGGGGAATTATGGACCGCATCTCATCATCGTTCCC 3093
Query 3115 AATGCTGTTCTGGTGAATTGGAAGAGTGAACTCCATACTTGGCTGCCATCTGTTTCATGC 3174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3094 AATGCTGTTCTGGTGAATTGGAAGAGTGAACTCCATACTTGGCTGCCATCTGTTTCATGC 3153
Query 3175 ATATATTATGTTGGTACAAAGGATCAACGTTCAAAATTGTTCTCTCAGGAGGTTTGCGCC 3234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3154 ATATATTATGTTGGTACAAAGGATCAACGTTCAAAATTGTTCTCTCAGGAGGTTTGCGCC 3213
Query 3235 ATGAAGTTCAATGTCCTCGTTACGACTTATGAGTTCATTATGTATGATCGATCAAAACTC 3294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3214 ATGAAGTTCAATGTCCTCGTTACGACTTATGAGTTCATTATGTATGATCGATCAAAACTC 3273
Query 3295 TCAAAAGTTGACTGGAAATATATTATAATTGATGAAGCACAACGGATGAAGGACAGAGAA 3354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3274 TCAAAAGTTGACTGGAAATATATTATAATTGATGAAGCACAACGGATGAAGGACAGAGAA 3333
Query 3355 TCTGTTTTGGCCCGAGATCTTGACCGGTATCGCTGCCAGAGGAGATTACTTCTCACTGGA 3414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3334 TCTGTTTTGGCCCGAGATCTTGACCGGTATCGCTGCCAGAGGAGATTACTTCTCACTGGA 3393
Query 3415 ACACCTTTGCAGAACGATCTGAAAGAGCTTTGGTCACTATTGAACCTTCTCCTTCCTGAT 3474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3394 ACACCTTTGCAGAACGATCTGAAAGAGCTTTGGTCACTATTGAACCTTCTCCTTCCTGAT 3453
Query 3475 GTCTTTGACAATCGAAAAGCATTTCATGATTGGTTTGCGCAACCCTTTCAAAAAGAAGGT 3534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3454 GTCTTTGACAATCGAAAAGCATTTCATGATTGGTTTGCGCAACCCTTTCAAAAAGAAGGT 3513
Query 3535 CCTGCGCATAATATAGAAGATGACTGGCTGGAGACTGaaaaaaaGGTCATAGTCATTCAC 3594
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3514 CCTGCGCATAATATAGAGGATGACTGGCTGGAGACTGAAAAAAAGGTTATAGTCATTCAC 3573
Query 3595 AGACTTCATCAAATTTTAGAGCCATTCATGCTCAGACGCCGTGTTGAGGATGTGGAAGGG 3654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3574 AGACTTCATCAAATTTTAGAGCCATTCATGCTCAGACGCCGTGTTGAGGATGTGGAAGGG 3633
Query 3655 TCACTTCCTGCTAAGGTTTCTGTAGTCTTACGATGTAGAATGTCTGCTATTCAGAGTGCC 3714
|||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3634 TCACTTCCTGCTAAGGTTTCTGTAGTTTTAAGGTGTAGAATGTCTGCTATTCAGAGTGCC 3693
Query 3715 GTTTATGATTGGATTAAAGCGACTGGAACTCTTAGAGTTGATCCAGACGATGAAAAACTT 3774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3694 GTTTATGATTGGATTAAAGCGACTGGAACTCTTAGAGTTGATCCAGACGATGAAAAACTT 3753
Query 3775 AGGGCTCAAAAGAATCCGATATACCAAGCCAAGATATATAGAACTTTAAATAATAGGTGC 3834
||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3754 AGGGCCCAGAAGAATCCAATATACCAAGCCAAGATATATAGAACTTTAAATAATAGGTGC 3813
Query 3835 ATGGAGTTGAGGAAAGCCTGCAATCATCCTTTGCTCAATTATCCATATTTCAATGACTTT 3894
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 3814 ATGGAGTTGAGGAAAGCCTGCAATCATCCTTTACTCAACTATCCATATTTCAACGACTTT 3873
Query 3895 TCCAAAGATTTCCTCGTAAGGTCATGTGGAAAATTGTGGATTCTGGACAGGATCCTTATA 3954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3874 TCCAAAGATTTCCTCGTAAGGTCATGTGGAAAATTGTGGATTCTGGATAGGATCCTTATA 3933
Query 3955 AAGCTACAGAGGACAGGCCATCGTGTATTGCTCTTCAGTACAATGACTAAACTTCTTGAT 4014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3934 AAGCTACAGAGGACAGGCCATCGTGTATTGCTCTTCAGTACAATGACTAAACTTCTTGAT 3993
Query 4015 ATCTTGGAAGAGTATCTACAATGGAGAAGGCTTGTATACAGAAGAATTGATGGGACTACC 4074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3994 ATCTTGGAAGAGTATCTACAATGGAGAAGGCTTGTATACAGAAGAATAGATGGGACTACC 4053
Query 4075 AGCCTAGAAGATCGGGAATCAGCTATTGTGGACTTCAATGATCCTGATACGGATTGCTTT 4134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4054 AGCCTAGAAGATCGGGAATCAGCTATTGTGGACTTCAATGATCCTGATACGGATTGCTTT 4113
Query 4135 ATCTTCTTGCTTAGTATACGTGCAGCTGGACGGGGTCTCAACCTTCAGACTGCTGACACA 4194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4114 ATCTTCTTGCTTAGTATACGTGCAGCTGGACGGGGTCTCAACCTTCAGACTGCTGACACA 4173
Query 4195 GTTGTTATATATGATCCTGATCCAAATCCCAAGAATGAGGAACAAGCAGTTGCCAGAGCC 4254
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4174 GTTGTGATATATGATCCGGATCCAAATCCCAAGAATGAGGAACAAGCAGTTGCCAGAGCC 4233
Query 4255 CATCGTATAGGGCAGACAAGGGAAGTAAAAGTGATTTATATGGAGGCAGTTGTTGAAAAA 4314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4234 CATCGTATAGGGCAGACAAGGGAAGTAAAAGTGATTTATATGGAGGCAGTTGTTGAAAAA 4293
Query 4315 CTCTCCAGCCATCAAAAGGAGGACGAGCTTAGAAGTGGTGGTTCAGTAGACCTAGAGGAT 4374
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4294 ATCTCCAGCCATCAAAAGGAGGACGAGCTTAGAAGTGGTGGTTCAATAGACCTAGAGGAT 4353
Query 4375 GACATGGCTGGGAAGGACCGATATATAGGATCTATAGAGGGTCTCATAAGGAATAATATT 4434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4354 GACATGGCTGGGAAGGACCGATATATAGGATCTATAGAGGGTCTCATAAGGAATAATATT 4413
Query 4435 CAACAGTATAAGATTGACATGGCTGATGAGGTCATTAATGCTGGTCGTTTTGACCAAAGG 4494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4414 CAACAGTATAAGATTGACATGGCTGATGAGGTCATTAATGCTGGGCGTTTTGACCAAAGG 4473
Query 4495 ACAACTCATGAAGAGCGACGAATGACATTGGAGACTTTATTGCATGACGAAGAGAGATAT 4554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4474 ACAACTCATGAAGAGCGACGAATGACATTGGAGACTCTATTGCATGACGAAGAGAGATAT 4533
Query 4555 CAAGAAACTGTCCATGATGTACCTTCTCTGCATGAGGTGAACAGAATGATTGCCAGAAGC 4614
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4534 CAAGAAACTGTCCATGATGTACCTTCTCTGCATGAGGTGAACAGGATGATTGCCAGAAGC 4593
Query 4615 GAGGAGGAAGTTGAGTTATTTGATCAGATGGATGAAGAATTTGACTGGACGGAGGAGATG 4674
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4594 GAAGAGGAAGTTGAGTTATTTGATCAGATGGATGAAGAATTTGACTGGACGGAGGAGATG 4653
Query 4675 ACTAATCATGAGCAGGTGCCTAAGTGGCTTCGAGCTAGTACCAGAGAGGTGAATGCTACT 4734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4654 ACTAATCATGAGCAGGTGCCTAAGTGGCTTCGAGCTAGTACCAGAGAGGTGAATGCTACT 4713
Query 4735 GTTGCTGATTTGTCTAAGAAACCGTCAAAGAACATGTTGTCTAGCAGTAACCTGATTGTA 4794
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4714 GTTGCTGATTTGTCTAAGAAACCTTCAAAGAACATGTTGTCTAGCAGTAATCTGATTGTG 4773
Query 4795 CAACCTGGTGGACCTGGAGGTGAGAGAAAAAGGGGCCGGCCCAAGAGCAAAAAGATTAAC 4854
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4774 CAACCTGGTGGACCGGGAGGTGAGAGAAAAAGGGGGCGGCCCAAGAGCAAAAAGATTAAC 4833
Query 4855 TACAAGGAAATTGAAGATGACATTGCAGGTTACTCTGAGGAAAGCTCTGAGGAAAGGAAC 4914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4834 TACAAGGAAATTGAAGATGACATTGCAGGTTACTCTGAGGAAAGCTCTGAGGAAAGGAAC 4893
Query 4915 ATTGATTCTGGGAATGAAGAAGAGGGAGATATTCGACAATTTGATGATGATGAACTTACT 4974
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4894 ATTGATTCTGGGAATGAAGAAGAGGGAGATATTCGACAATTTGATGATGATGAACTTAC- 4952
Query 4975 GG-CGCTCTTGGAGATCATCAAACCAACAAGGGAGAATTTGATGGAGAGAACCCCGTCTG 5033
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 4953 GGTCGCTCTTGGAGATCACCAAACCAACAAGGGAGAATCTGATGGAGAGAACCCTGTCTG 5012
Query 5034 TGGTTATGATTATCCTCCGGGTTCTGGTAGTTATaaaaaaaaTCCTCCTCGTGATGATGC 5093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5013 TGGTTATGATTATCCTCCGGGTTCTGGTAGTTATAAAAAAATTCCTCCTCGTGATGATGC 5072
Query 5094 TGGTTCGTCAGGATCTTCTCCAGAGAGCCATAGATCGAAAGAAATGGCATCTCCTGTTTC 5153
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5073 CGGTTCTTCAGGATCTTCTCCAGAGAGCCATAGATCGAAAGAGATGGCATCTCCTGTTTC 5132
Query 5154 TTCACAAAAGTTTGGCTCTTTGTCTGCATTGGACACTAGGCCAGGTTCTGTCTCTAAAAG 5213
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5133 TTCACAAAAGTTTGGCTCTTTGTCTGCATTGGACACTAGGCCAGGTTCTGTCTCAAAAAG 5192
Query 5214 ACTGCTGGATGACCTAGAAGAGGGGGAAATAGCAGCATCAGGGGATTCTCACATAGATCT 5273
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5193 ACTGCTGGATGACCTAGAAGAGGGGGAAATAGCAGCATCAGGGGATTCTCACGTAGATCT 5252
Query 5274 CCAACGATCAGGAAGTTGGGCCCATGACCGTGATGAAGGGGATGAAGAACAGGTTCTGCA 5333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5253 CCAACGATCAGGAAGTTGGGCCCATGACCGTGATGAAGGGGATGAAGAACAGGTTTTGCA 5312
Query 5334 ACCTACGATAAAACGGAAACGGAGTATTCGTCTAAGACCCCGTCAGACGGCAGAAAGAGT 5393
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||
Sbjct 5313 ACCTACGATAAAACGAAAACGGAGTATTCGTCTACGACCCCGTCAAACGGTAGACAGAGT 5372
Query 5394 TGACGGTAGTGAGATGCCTGCAGCTCAGCCATTGCAAGTGGATCGTAGCTACCGATCAAA 5453
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5373 TGACGGTAGTGAGATGCCTGCAGCTCAGCCATTACAAGTTGATCGTAGCTACCGATCAAA 5432
Query 5454 GTTAAGGACAGTTGTTGACTCGCATAGTTCAAGACAAGATCAGAGTGATTCGTCCTCGAG 5513
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5433 GTTAAGGACAGTTGTTGACTCGCATGGTTCAAGACAAGATCAGAGTGATTCGTCCTCTAG 5492
Query 5514 ACTAAGGAGTGTACCTGCAAAGAAGGTAGCTAGTACTTCCAAACTCCATGTCTCATCACC 5573
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5493 ACTTAGGAGTTTACCTGCAAAGAAGGTAGCTAGTACTTCCAAACTCCATGTATCATCACC 5552
Query 5574 AAAATCTGGTAGATTGAATGCTACACAGCTTACCGTGGAGGATAACGCTGAAGCTTCCAG 5633
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5553 AAAATCTGGTAGATTGAATGCCACACAGCTTACCGTGGAGGATAACGCTGAAGCTTCCAG 5612
Query 5634 AGAAACATGGGATGGAACTAGTCCTATTAGCTCTTCAAATGCTGGTGCAAGAATGTCCCA 5693
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5613 AGAAACATGGGATGGAACTAGTCCTATTGGCTCTTCAAATACTGGTGCAAGAATGTCCCA 5672
Query 5694 CATCATACAGAAACGGTGCAAAATCGTGATTAGCAAGCTCCAGAGGAGAATCGACAAGGA 5753
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5673 CATCATACAGAAACGGTGCAAAAACGTGATTAGCAAGCTCCAAAGGAGAATCGACAAGGA 5732
Query 5754 AGGTCAGCAGATTGTACCTATGCTGACAAATTTGTGGAAGAGAATTCAGAATGGTTATGC 5813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5733 AGGTCAGCAGATTGTACCTATGCTGACAAATTTGTGGAAGAGAATTCAGAATGGTTATGC 5792
Query 5814 AGCTGGAGGTGTAAATAACCTTTTGGAACTACGAGAGATAGACCACCGGGTAGAAAGACT 5873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 5793 AGCTGGAGGTGTAAATAACCTTTTGGAACTACGAGAGATAGACCAGCGAGTAGAAAGACT 5852
Query 5874 AGAGTATGCAGGAGTTATGGAACTCGCATCTGACGTGCAGTTAATGCTAAGGGGAGCAAT 5933
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5853 AGAGTACGCAGGAGTTATGGAACTCGCATCTGACGTGCAGTTAATGCTAAGGGGAGCAAT 5912
Query 5934 GCAATTCTATGGGTTTTCACATGAGGTGAGATCTGAAGCAAAGAAGGTTCACAATCTGTT 5993
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5913 GCAATTCTATGGATTTTCACATGAGGTGAGATCTGAAGCAAGGAAGGTTCACAATCTGTT 5972
Query 5994 CTTTGATCTATTAAAGATGTCTTTCCCAGACACAGATTTCCGGGAAGCAAGGAATGCTCT 6053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5973 CTTTGATCTATTAAAGATGTCTTTCCCAGACACAGATTTCCGGGAAGCAAGGAATGCTCT 6032
Query 6054 TTCCTTTTCTGGCTCAGCCCCAACTTTGGTGTCTACACCAACCCCAAGAGGAGCAGGAAT 6113
||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 6033 TTCCTTTTCTGGCCCAATCCCAAATTTGGTGTCTACACCATCCCCAAGAGGAGCAGGCAT 6092
Query 6114 TAGCCAAGGCAAGAGGCAAAAGTTAGTAAACGAGCCGGAAACCGAGCCAAGCTCTCCTCA 6173
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6093 TAGCCAAGGCAAGAGGCAAAAGTTGGTAAACGAGGCGGAACCCGAGCCAAGCTCTCCTCA 6152
Query 6174 GAGATCTCAACAACGTGAGAACTCAAGGATCAGAGTACAGATACCGCAGAAAGAAACAAA 6233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6153 GAGATCTCAACAACGTGAGAACTCAAGGATCAGAGTACAGATACCGCAGAAAGAAACAAA 6212
Query 6234 GCTTGGGGGGACAACAAGCCACACTGATGAATCCCCAATATTAGCTCATCCAGGGGAATT 6293
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6213 TCTTGGGGGCACAACAAGCCACACTGATGAATCCCCAATTTTAGCTCATCCAGGGGAATT 6272
Query 6294 AGTAATCTGCAAGAAAAAGAGGAAAGACCGAGAGAAGTCTGGTCCGAAAACCCGAACTGG 6353
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 6273 AGTTATCTGCAAGAAGAAGAGGAAAGACCGAGAGAAGTCTGCTCCGAAAACCCGAACTGG 6332
Query 6354 TGGCTCCAGCAGCCCAGTTTCACCACCTCCAGCAATGATTGGTCGTGGTCTTAGAAGTCC 6413
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6333 TGGCTCCAGCAGCCCAGTTTCACCACCTCCAGCTATGATTGGTCGTGGTCTTAGAAGTCC 6392
Query 6414 TGTGTCTGGTGGAGTTCCAAGGGAAACAAGGCTAGCACAACAGCAGCGGTGGCCAAACCA 6473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 6393 TGTGTCTGGTGGAGTTCCAAGGGAAACAAGGCTAGCACAGCAGCAGCGCTGGCCAAACCA 6452
Query 6474 ACCCACTCATCCAAACAACAGCGGTGCGGCCGGTGATTCTGTGGGATGGGCAAATCCGGT 6533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6453 ACCCACTCATCCAAACAACAGCGGTGCGGCCGGTGATTCCGTGGGATGGGCAAATCCGGT 6512
Query 6534 GAAGAGGTTAAGGACAGATTCTGGTAAAAGACGGCCTAGCCATTTATAG 6582
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6513 GAAGAGGTTAAGGACAGATTCTGGTAAAAGACGGCCTAGCCATTTATAG 6561
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 255746890560
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5