BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G46560.1
Length=7741
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg935637 jgi|Araly1|935637|scaffold_403625.1 4924 0.0
> Ahg935637 jgi|Araly1|935637|scaffold_403625.1
Length=7417
Score = 4924 bits (2666), Expect = 0.0
Identities = 2934/3066 (96%), Gaps = 8/3066 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3333 TAGTCCCAATTCACCTGCAACAGACTTGGAATTTAGTGGCTTCTGCGAGCAGCTCAAGAA 3392
||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3332 TAGTCACAGTTCACCTGCAACAGACTTGGACTTTAGTGGCTTCTGCGAGCAGCTCAAGAA 3391
Query 3393 GTTATCAGATGAAGGAAATATTTCCAGGATAGAAATATTGCAATATTTTGCAATTGTTGA 3452
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3392 GTTATCAGATGGAGGAAATATTTCCAGTATAGAAAAATTGCAATATTTTGCAATTGTTGA 3451
Query 3453 CCTTCTTTGTGAAATTAGTAACCCACATTCTACGTCTGTCTATGCAAGTCTTGATGAACC 3512
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3452 CCTTCTTTGTGAAATTAGTAACCCACATTCTACGTCTGTCTATGCAAGTCTTGATGAAGC 3511
Query 3513 TGGGAGAAGATTTTGGGTCACACTTAGGTTTAAACAGCTATTCTTAGCTCGAAGTTCTGG 3572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 3512 TGGGAGAAGATTTTGGGTCACACTTAGGTTTAAACAGCTATCCTTAGCTCGAAGATCTGG 3571
Query 3573 TAAAACAGCATCTCTGGAAGAGCTTGATATTGACTCTAGTATGATAGGATGGGCTTTTCA 3632
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3572 GAAAACAGCATCTCTGGAAGAGCTGGATATTGACTCTAGTATGATAGGATGGGCTTTTCA 3631
Query 3633 CTCAGAGTCTCAAGAAAATTTGTCTGGTTCTCTTTTGCCCAATGAATCATCATGGCAACA 3692
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3632 CTCAGAGTCTCAAGAAAATTTGTCTGGTTCTCTTTTACCCAATGAATCATCATGGCAACA 3691
Query 3693 AATGCGATCACAGGGTTTTGGATTTTGGTATTCAAATGCAGCACAATTGCGATCACGGAT 3752
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3692 AATGCGATCATTGGGTTTTGGATTTTGGTATTCAAATGTAGCACAATTGCGTTCACGTAT 3751
Query 3753 GGAGAAACTGGCCCGACAGCAATACCTGAAGAACAAGAATCCTAAAGATTGTGCGCTTCT 3812
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3752 GGAGAAACTGGCCCGACAGCAGTACCTGAAGAACAAGAATCCTAAAGATTGTGCGCTTCT 3811
Query 3813 CTATATAGCTTTAAATAGAGTTCAAGTTTTGGCTGGTCTTTTCAAATTAAGCAAGGATGA 3872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3812 CTATATAGCTTTAAATAGAGTTCAAGTTTTGGCTGGTCTTTTCAAATTAAGCAAGGATGA 3871
Query 3873 GAAAGATAAACCCTTGGTGGTTTTTCTTTCACGCAATTTTCAGGAAGAGAAAAATAAGGC 3932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3872 GAAAGATAAACCCTTGGTGGTTTTTCTTTCACGCAATTTTCAGGAAGAGAAAAATAAGGC 3931
Query 3933 AGCAGCCTTGAAAAATGCATATGTACTAATGGGTAAACACCAACTGGAACTGGCTATAGG 3992
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3932 AGCAGCCTTGAAAAATGCATATGTGCTAATGGGTAAACACCAACTGGAGTTGGCTATAGG 3991
Query 3993 TTTCTTTCTCCTTGGAGGTGAAGCTTCATCTGCAATAAATGTTTGTGTGAAAAATCTTCA 4052
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3992 TTTCTTTCTGCTTGGAGGTGAAGCTTCATCTGCAATAAATGTTTGTGTGAAAAATCTTCA 4051
Query 4053 GGATGAGCAGCTTGCGCTCGTAATTTGCCGGCTTATTGATGGGCAGGGTGGGGCCCTGGA 4112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4052 GGATGAGCAGCTTGCGCTCGTAATTTGCCGGCTTATTGATGGGCAGGGTGGGGCCCTGGA 4111
Query 4113 AAGTAATCTTATAAAGAAATATATACTCCCATCTGCTGTTCAGAGAGGAGACTTTTGGCT 4172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4112 AAGTAATCTTATAAAGAAATATATACTCCCATCTGCTGTTCAGAGAGGAGACTTTTGGCT 4171
Query 4173 AGCAAGCCTTCTTAAGTGGGAATTAGGAGAGTACCACCGGTCAATTCTTGCTATGGCTGG 4232
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4172 AGCAAGCCTTCTTAAGTGGGAATTAGGAGAGTACCACCAGTCAATTCTTGCTATGGCTGG 4231
Query 4233 GTGTCTAGAGAACCCTGCTACTGAGAGCTCTACTGTTTCTTCAAATCACGTCTCTTTTGT 4292
| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4232 ATCTCTAGGGAACCCTGTTACTGAGAGCTCTACTGTTTCTTCAAATCACATCTCTTTTGT 4291
Query 4293 GGATCCTAGTATTGGCCTATACTGCCTCATGTTGGCAACCAAAAATAGTGTGAAGAACGC 4352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4292 GGATCCTAGTATTGGCCTATACTGCCTCATGTTGGCAACCAAAAATAGTGTGAAGAACGC 4351
Query 4353 ATTGGGGGAAAGAACTGCCTCAACTCTTAGTAGATGGGCATCCTTAATGGCTGCTACCGC 4412
||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4352 ATTGGGGGAAAAAATTGCTTCAACTCTTAGTAGATGGGCAACCTTAATGGCTGCTACCGC 4411
Query 4413 CTTCAGCAGATGTGGGCTCCCGCTCGAGGCGTTAGAATGTCTTTCACCATCTGCCAGCGG 4472
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4412 CTTCAGCAGATGTGGGCTCCCGCTCGAGGCGTTAGAATGTCTTTCAGCATCTGCCAGCGG 4471
Query 4473 TCATGGTGGGACCCATCAGACTAGCGTTCCAAGTAACGGTCAGTTGCATACTACACAAGG 4532
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || | | |||||
Sbjct 4472 TCATGGTGGTACCCATCAGACTAGCGATCCAAGTAATGGTCAGTTGCGTAGTCCTCAAGG 4531
Query 4533 TGTTTTTGATCACTCTGTTCCTCATTCGTCGAATTGGGTATCAAGCGGTGTTTCATCTAC 4592
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4532 TGTTTTTGATCATTCTGTTCCTCATTCGTCGAATTGGGTATCAAGCGGTGTTTCATCTAC 4591
Query 4593 TGTGGACACTCATTTTAGATTGGGTTTAGCCGTCCAGTTCCTCTCGATGATCTTACGGGA 4652
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||
Sbjct 4592 TGTGGACACTCATTTTAGACTGGGTTTAGCCGTCCAGTTTCTCTCAAGGATCTTACGGGA 4651
Query 4653 AGCAACTGCACCCTTAATGAATTCTGAAGTTGTTTCATGTGAGAAA-TTCTCACGATTTC 4711
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4652 AGCTACTGCACCCTTAATGAATTCTGAAATTGTTTCGTGTGAGAAAATT-TCACGATTTC 4710
Query 4712 AACATAAGCTACAAACAGCTTTGGAGCAATTTCACCAGAGATTTTCGCTGTCTGCATCTT 4771
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 4711 AACATAAGCTACAAACAGCGTTGGAGCAATTTTACCAGAGATTTTCGCTGTCTTCGTCTT 4770
Query 4772 ACCTACGTAATATGATGATTCTGTCAGCATACAACCGAGGGTTACTATCCATGGGACACA 4831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4771 ACCTACGTAATATGATGATTCTGTCAGCATACAACCGAGGGTTACTATCCATGGGACACA 4830
Query 4832 ATATATTTCAGGAAAATAGTTCCTCAGGACTCTCAGACGACAAGTCTCACACAGATGAAG 4891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4831 ATATATTTCAGGAAAATAGTTCCTCAGGACTCTCAGACGACAAGTCTCACACAGATGAAG 4890
Query 4892 ATCTCCTCCAGTATTCAGCGTTGTCTAAATTGATTCTAAAAGCGACTGATGAGAAATCAT 4951
|| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 4891 ATATCTTCCAGTATTCAGCTTTGTCTAAATTGATTCTAAAAGCGACTGAAGAGATATCAT 4950
Query 4952 -TGGTGTTATCACGTATCATTGCTGCGTGCAGTGTCACTTGCTTACACTCAGTGCCATGC 5010
|| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4951 GTG-TATTATCACGTATCATTGCTGCATGCAGTGTCACTTGCTTACACTCAGTGCCATGG 5009
Query 5011 TTTGAGGAAAACAAGGTGTCATCTGGACCTGATCCAAAGTGGTCCAATGCTTTGCGGTTT 5070
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5010 TTTGAGGAAAACAAGGTGTCATCTGGACCTGAACCAAAGTGGTCCAATGCTTTGCGATTT 5069
Query 5071 TACTTTCAAGGAATTCTGGAATCGTTCTCTAATTTAAGAACTTCTATAAGGCTGTGCTTG 5130
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 5070 TACTTTCAGGGAATTCTGGAATCGTTCTCTAATTTAAGAACTTCTTTAAGGTTGTGCTTG 5129
Query 5131 GGCTCCTCTGTGGAAGACCTGAAAACAAAACTTGCAGTTGTTCTTGATTTAGTCGAATAT 5190
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5130 AGCTCCTCTGTGGAAGACCTGAAAACAAGACTCGCAGTTGTTCTTGATTTAGTCGAATAT 5189
Query 5191 TGTTTGAGACTCGCAATGGCTTGGGTTCTGGGAGACGTGCATTGTCTCTTTCGAATGGTT 5250
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 5190 TGTTCGAGACTCGCAATTGCTTGGGTTCTGGGAGATGTAAATTGTCTCTTTCGAATGGTT 5249
Query 5251 CAGCCCCTTGTGATATCATATTTTAATGGGCATATGCCTTATGAGGTTGACCTGGAAAGT 5310
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5250 CAGCCCCTTGTGATAGCATATTTTCATGGGCATATGCCTTATGAGGTTGACCTGGAAAGT 5309
Query 5311 GTGAAGAGAGTATACCACCAGGAAGCTTCTGTTAGTGTACCAGATGCATCAGATGTAGGA 5370
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5310 GTGAAGAGAGTATACCACCAGGAAGCTTCTGCTAGTGTACCAGATGCATCAGATGTTGGA 5369
Query 5371 GTTAATTCTAAGTTCAGCAGTGTTGTTGAGAATCACGGAGTTGGCTATCCAGTATACTCA 5430
|||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5370 GTTAATTCTAAGGTCAGCAGAGATGTTGAGAATTACGAAGTTGGCTATCCAGTGTACTCA 5429
Query 5431 ATTCCAGAAGATGAAAGATGTCTGGTAACACAAGCTTGTTTCTGGAAGCATGTTTCAGAC 5490
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5430 ATTCCAGAAGATGAAAGATGTCTTGTAACACAAGCATGTTTCTGGAAGCACGTTTCAGAC 5489
Query 5491 TTTGTGAAACTTAAGCTGGTATCTATTTCGATCAATCTAGATGATGGTATTTCGAATAGT 5550
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5490 TTTGTGAAACATAAGCTAGTATCTATTTCGATCAATCTAGATGATGGTATTTCGAATAAT 5549
Query 5551 GGTTCCGCTGAAAATTTTGATGCCCAGACATCATTGGACTCCAGTGATGACATTGTATGC 5610
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5550 GGTTCCCCTGAAAATTTTGATGCTCAGACATCATTGGACTCCAGTGATGACATTGTATGC 5609
Query 5611 GTAACGGAGAAGATAATGTCTGTTCTGGGAAAAACACTGATTAGCACCCTAGCTCAACTC 5670
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5610 GTAACGGAGAAGATAATGTCTGTTCTGGGAAAAACACTGATTAGTACCCTAGCTCAACTC 5669
Query 5671 TCTTCGTACCATGTAAAACAACTAGTATTAGTCTTGAAA-CAGAAACTAGAGAAGAGACT 5729
||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |
Sbjct 5670 TCTTCATACCATGTAAAACAAGTAGTATTGGTCTTGAAATC-GAAACTAGAGAAGAGAAT 5728
Query 5730 TCAGGTTCCTACCTTGTTATGGCTGCTCGAATGTCAGGGATCTCAAGCAAATTTTCTTAA 5789
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5729 TCAGGTTCCTACCTTGTTATGGCTGCTCGAATGTCGGGGATCTCAAGCAAATTTTCTTAA 5788
Query 5790 TCGGGATATCCCAGATGCAGGTGTAGAGACGGaaaaaaaCGGTGACCCTGTGGTTTCTGT 5849
||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5789 ACGGGATATCCCTGATGCAGGTATAGAAAATGAAAACAACGGTGACCCTGTGGTTTCTGT 5848
Query 5850 GAGGTTCTGGAAGCTTTGTGTTGATCCTCATTTACTACACGAAGCTTTCTTGTTAGAAAA 5909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 5849 GAGGTTCTGGAAGCTTTGTGTTGATCCTCATTTACTATACGAAGCTTTCTTGCTAGAAAA 5908
Query 5910 TTTTGACATATTTGAATGGTCAAAATCTAAACCATTGGAAGATTGGAGCGATATGTACAG 5969
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5909 TTTTGACATATTTGAATGGTCAAAATCTAAACCATTGGAATATTGGAGCGATATGTACAA 5968
Query 5970 AGAAGTAATCAGGAAGAATGAGCTCTATGTGCCATGCAATCAAGATGGTCGAAGTAGTAA 6029
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5969 AGAAGTAACCAGGAAGAATGAGCTCCATGTGCCATGCAATCAAGATGGTCGAAGTAGTAA 6028
Query 6030 TGAGGTGGCTTCACTTGCAAACCACGCTTCAAATTCTTCACCA-AAAGCTGCGGTAACTG 6088
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||
Sbjct 6029 TGAGGTGGCTTCACTTGCAAGCCACACTTCAAATTCTTCAC-AGAAAGCTGCGATAACTG 6087
Query 6089 CCAATGAAAACTCTGCGTTCCAGAACCCCAAAGAAATCCATAAGAGGACCGGGGAGCTTA 6148
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6088 CCAATGAAAACTCTGCTTTCCAGAACCCCAAAGAAATCCATAAGAGGACCGGGGAGCTTA 6147
Query 6149 TAGAGGCCCTTTGTATCAACGCCATTAACCATCGGCAAGCTGCATTAGCTAGCAACCGCA 6208
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 6148 TAGAGGCCCTTTGTATCAACGCCATCAACCATCGGCAAGCTGCATTTGCTAGCAACCGCA 6207
Query 6209 AGGGTATAATTTTCTTTAACCTAGAAGATGGTGATTCTTCCCAAAATCAGTCAGACTATA 6268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||
Sbjct 6208 AGGGTATAATTTTCTTTAACCTAGAAGATGGTGATTCCTGCAAAAATCAGTCAGACTATA 6267
Query 6269 TCTGGTCAGATGCTGACTGGCCACATAATGGTTGGGCTAACTCTGAGTCAACTCCCGTTC 6328
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6268 TCTGGTCAGATGCTGACTGGCCACATATTGGTTGGGCTAACTCTGAGTCAACTCCTGTTC 6327
Query 6329 CAACATGTGTTTCACTCGGTGTTGGTCTTGGGGATAAGAAAGGAGCACACCTTGGGTTAG 6388
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6328 CAACATGTGTCTCACTCGGTGTTGGTCTTGGGGATAAGAAAGGAGCACACCTTGGATTAG 6387
Query 6389 GTGGGG 6394
|| |||
Sbjct 6388 GTTGGG 6393
Score = 4878 bits (2641), Expect = 0.0
Identities = 3039/3232 (94%), Gaps = 24/3232 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 64 GATCGGATCGATCATTTGCCTCTCCGGCAACTCAGATCGGAGATCGTTCCTCCAGCTCCG 123
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 GATCCGATCGATAATTTGCCTCTCCGGCAACTCAGATCGGAGATCGTTCCTCCAGCTCCG 131
Query 124 ACTCGATCCCAATCTTCTATTGATTGGCTTCCCGACTTCGCTAATTACTCATGGCTTGCT 183
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 132 AATCGATCCCAATCTTCTATTGACTGGCTTCCCGACTTCGCCGGTTACTCATGGCTTGCT 191
Query 184 TACGGAGCATCCACTCTCGTCGTCATCTCTCATCTACCTTCTCCTCTCCGCGGCGAAGAT 243
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 TATGGAGCATCCACTCTCCTCGTCATCTCTCATCTACCTTCTCCTCTCCGCGGCGAAGAT 251
Query 244 TCCACGAACGGACCATTTTTCCGTCAGATTCTAGAGGTTTCCGGCGA---------ACCA 294
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 252 TCTACTAACGGACCATTTTTCCGTCAGATTCTAGAGGTTTCCGGCGATGTTTCGTCTCCA 311
Query 295 GTTACTGCAGTTTGCTGGTCTCCTGTAACGCCGTCTGTAGGCGAGCTCGCTGTTGGCTCT 354
|||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 312 GTTACTTCCGTTTCCTGGTCTCCTGTAACGCCGTCAGTAGGCGAGCTCGCTGTTGGGTCT 371
Query 355 GGGAACTATATCTTCCTCTTCGCGC--G--T---G--ATTTGAAAGGTTCTTTTTGTTGG 405
||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 372 GGGAACTATATCTTCCTCTTCGCGCGTGATTCCAGTAATTTGAATGGTTCTTTTTGTTGG 431
Query 406 AGTCAGAATGCCATACTGGTGCAGGAAACAATAGTTGAAGCGATTGAGTGGACAGGATCC 465
||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 432 AGTCAGAATGCCATACTGGTGCAAGAGACAAAAGTTGAGGCGATTGAGTGGACAGGATCC 491
Query 466 GGGGATGGGATAATAGTTGGTGGAACTGATATTGTTCTGTGGAAGAGAAGGAACCAATCT 525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 GGGGATGGGATAATAGTTGGTGGAACTGATATTGTTCTGTGGAAGAGAAGGAACCAATCT 551
Query 526 TGGGAAATAGCTTGGAAGTTCTCTGGGGATCACCTTCAGGATCTGGTTTCCTCCACCTGG 585
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 552 TGGGAAATAGCTTGGAAGTTCTCGGGGGATCACCTTCAAGATCTGGTATCCTCCACCTGG 611
Query 586 TCATTCGAGGGTCCTTTTGCCACAGCAACTTCTTGGAGGAAGTTTCCAGCTGAGTGTGAC 645
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
Sbjct 612 TCATTTGAGGGTCCTTTTGCCACAGCAACTTCTTGGAGGAAGCTTCCAGATGAGTGTGGC 671
Query 646 GACGCAGGAAAAAGTGTCTTGGCCTATTATAGTGATGGTGAATCATATCATAACTTTGAA 705
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 672 GAGGCAGGTAAAAGTGTCTTGGCCTATTATAGTGATGGGGAATCATATCATAAATTTGAA 731
Query 706 TTGCCTCATCCTCAGAGAATATCCATGATTCAGTGGAGACCGATGGCTGCAGAACAGTCT 765
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 TTGCCACATCCTCAGAGAATATCCATGATTCAGTGGAGACCGATGGCTGCAGAACAGTCT 791
Query 766 GCAATAGGTATAGGTAAATCAATGAGGAATGTGCTAATGACATGTTGCTTGGATGGGGCA 825
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 792 GCAATAGGTATAGGGAAATCAATGAGGAATGTGCTAATGACATGTTGCTTGGATGGGGCA 851
Query 826 GTAAGGTTATGGTGTGAGGTAGATGGTGGAAAGACaaaaaaaGGCATGAAAGATGTGCCT 885
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 852 GTAAGGTTATGGAGTGAGGTAGATGGTGGAAAGACAAAAAAGGGCATGAAAGATGTACCT 911
Query 886 GATCATAAAAAATCGTTTTGCGTGGCAGCTGTGATAGAGATAAATCAGGTCTTGGATGGC 945
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 912 GATCATAAAAAATCGTTTTGTGTGGCAGCTGTGATAGAGATAAATCAGGTCTTGGATGGC 971
Query 946 TGTTTGGGTAGAGATTTATTTCTTTTTTGGGGAACTCGTACAGGGGGTATATTCAAAACC 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 972 TGTTTGGGTAGAGATTTATTTCTTTTTTGGGGAACTCGTACAGGGGGTATATTGAAAACC 1031
Query 1006 ATCGAAGGTACTAATCAAGTTTTTTCTATGGAAAAGTACGATAATGAGAATGTTGGAAAA 1065
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 1032 ATCGAAGGTACTAATCAATTTTTTTCTATGGAAAAGTATGATCATGAGAATGTTGGAAAA 1091
Query 1066 TGTGAGTGGTTGGTAGGGTATGGCCCTGGAAATTTTGCTACTTTGTGGGCTGTCCATTGT 1125
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 TGTGAGTGGTTGGTAGGGTATGGCCCTGGAAATTTGGCTACTTTGTGGGCTGTCCATTGT 1151
Query 1126 CTTGATGACATCTCTCCTATGAGGTTTCCACGAGTAACATTGTGGGCGAAACAAGAATCA 1185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 CTTGATGACATCTCTCCTATGAGGTTTCCACGAGTAACATTGTGGGCGAAACAAGAATCA 1211
Query 1186 AATGAAATTGGTGCAGGATCACTCTCTCTAGCG-AGTGCTACAGGTTCTTCTGATCGATT 1244
|||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1212 AATGAAATTGGTGCAGTATCACTCTCTCTAGCGGA-TGCTACAGGTTATTCTGATCGATT 1270
Query 1245 ACCCCTTAAGAAAGTTTCTGTATTGAGAAATAACCTTTATGGCACACCACTTATCTGCTC 1304
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1271 ACACCTTAAGAAAGTTTCTGTATTGAGAAATAACCTTTATAGCACACCACTTATCTGCTC 1330
Query 1305 GTCGATTTATTTATCTCCGCAGAATACTGTATATTGGTCTTCCTTGCACACAATAAAGTC 1364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1331 GTCGATTTATTTATCTCCGCAGAATACTGTATATTGGTCTTCCTTGCACACAATAAAATC 1390
Query 1365 ACATGACTCGGAAGATTCATCCCCAAATAAATCCAGTTTATTGAAGTGCATTGATGGAAA 1424
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 ACATGACTCAGAAGATTCATCTCCAAATAAATCCAGTTTGTTGAAGTGCATTGATGGAAA 1450
Query 1425 AGTATTATATCTTGATGGTCATGGTGGGAAAATCCTACAGGTTGCCTCTGATCCTTTTGT 1484
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1451 AGTATTATATCTAAATGGTCATGGTGGGAAAATCCTACAGGTTGCCTTTGATCCTTTCAT 1510
Query 1485 ATGTGAGGCGGGATACACTGCTTCCCTGGATTCTAATGGTCTGATAATAATCTGCTCCTC 1544
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||
Sbjct 1511 ATGTGAGGCGGGATACACTGCTTCCCTGGATTCTAATGGTTTGGTAATAATCTGGTCCTC 1570
Query 1545 TAGTGTTTATTTGAACCG-GACTATTGAGCATCCTATATCTGTTGCCTCTTGGAAGCCTT 1603
|||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1571 TAGTACTTATTTGAACCGTG-CTATTGACCATCCTATATCAGTTGCCTCTTGGAAACCTT 1629
Query 1604 GTGGACGGCTACAAAATCAAGAGTTCAGATTAAAGTACACAAGTTTATGTTGGGCACCTT 1663
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1630 GTGGATGGCTACAAAATCAAGAGTTCAGATTAAAGTACACAAGTTTATGCGGGGCACCTT 1689
Query 1664 CTTCATTGAAAGATGAGAGATTTCTACTTGTGGGACATGTAGGAGGCGTCGATTGCTTTA 1723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1690 CTTCATTGAAAGATGAGAGATTTCTACTTGTGGGACATGTAGGAGGCGTTGATTGCTTTA 1749
Query 1724 GTGTAAGGAATTGTGGGAAAGGTGATGACGGTTATCTAACCCATTATATATGTACCATAC 1783
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1750 GTGTAAGGAATTGTGGGAAAGGTGATGATGGTTATCTAACCCATTACATTTGTACCATAC 1809
Query 1784 CGTTTACGGTTAATAGCCCTTTGCAGAGTGGTCCGACCAGCATATTTGCAAAACCTCTGT 1843
||| | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1810 CGTCTGCAGTTAACAGCCCTTTGCAGAGTGGTCCAACCAGCATATTTGCAAGACCTCTGT 1869
Query 1844 CTAATTCTTGTGGAAAGACATTTAAAAGTAACAGATTTTTGCTCCTGAGTGTATGGATGA 1903
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1870 CTAATTCTTGTGGAAAGACATTCAAAAGTAACAGATTTTTGCTTCTGAGTGTATGGATGA 1929
Query 1904 AAGAGAAACGGTTTGATGCTCTGTCATGGAGTGTAACCTTACATCATTTTGATACAGCAG 1963
||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1930 AAGAGAAACAGTTTGATGCTCTGTCATGGAGTGTGACCTTGCATCATTTTGATACTGCAG 1989
Query 1964 GAAGTACCTGCGATTGTCATTTTCATGATTTTGATAGTATTGGATTGGGAAAGTGGTTGT 2023
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 1990 GAAGCACCTGCGATTGTCATTTTCATGATTTTGATAGTACTGGATTGGGAAAGTGGTTAT 2049
Query 2024 TCGAAGATACTTTTGCTGGCAAGACGAATTGCCTTGCTATTAGATCATGCTCTTCAGAAA 2083
||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2050 TCGAAGATACTTTTGCTGGTAAGAAGAATTGCATTGCTATTAGGTCATGCTCTTCAGAAA 2109
Query 2084 TACCTGAATCTCACCGTGAGGATGAAGTTACGAGTTTTGCTGTGGTCAATCCAAGTGGGA 2143
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2110 TACCTGAATCTCACCGTGACGATGAAGTTACGAGTTTTGCTGTGGTCAATCCAAGTGGCA 2169
Query 2144 GGGATCTAGAGAATGGTGTGAACAGTGAAAGTCAAGCTTATACTATTGCAACTGGTCAAG 2203
||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2170 GGGCTATAGAGAATGACATGAACAGTGAAATTCAAGCTTATACTATGGCAACTGGTCAGG 2229
Query 2204 CTGATGGCTCTTTAAAACTTTGGAGAAGTAGTTTTCAGGAAAGTTCAACACCTTCCGGTC 2263
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2230 CTGATGGCTCTTTAAAAATTTGGAGAAGTAGTTTTCAGGAAAGTTCAACACCTTGCGTTC 2289
Query 2264 TGTGGGAGCTAGTTGGCATGCTTACGGTTGGCCAAAATCCTGTCAGTGCTATATCTCTGA 2323
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2290 CGTGGGAGCTAGTTGGCATGCTTACCATTGGCCAAAATCCTGTCAGTGCTATATTTCTGA 2349
Query 2324 CTGATTCGGGACACAAGATAGCAGCCCTCTGTACAGAGAGTCATTCAAAAGCTGCCCGCG 2383
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||
Sbjct 2350 CTGATTCGGGACATAAGATAGCAGCCCTCTGTACAGAGAATCATTCAAAAGCTACCTGCA 2409
Query 2384 CAGTTAGTATATGGGAGATTGTACACCTTATAGATTCAGGGGTTTTCATACTAGAGGATA 2443
|| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2410 CAATTAGCATATGGGAGATTATACACCTTATAGATTCAGGGGTTTTCATACTAGAGGATA 2469
Query 2444 AGGTACATGTTGATGCAGAAGTTGTTGCTGTAAGATGGTCAACTACGGGTAATGATCAGC 2503
|| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||
Sbjct 2470 AGTTACATGTTGATGCAGAGGTTGTTGCTGTAAGATGGTCAACTGCGAGTAATGGTCAGC 2529
Query 2504 TATTACTTGGAGTTTGCACACAGATTGAGATGCGGGTGTATGGTATTGCTCGGCAG-CCT 2562
|||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2530 TATTGCTTGGAGTTTGCACACAGAAGGAGCTGCGGGTGTATGGTATTGCTCGGCAGTCCT 2589
Query 2563 TGCAAAAGTACCAGTTTCGCGGCCTATGATTATTCTTCAGAGGCACAGATTTGGCAATGC 2622
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 -GCAAAAGTACCAGTTTCGCGGTCTCTGATTATTCTTCAGAGGCACAGATTTGGCAATGC 2648
Query 2623 TTCGCTGTTACTCGTACATTTTCGGCTATACATGATTTATGGTGGGGACCCAAAGCCATG 2682
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2649 TTCGCTGTTACTCGTACATTTTCTGCTATATGTGATTTATGGTGGGGACCCAAAGCCATG 2708
Query 2683 ACTTGTCTTGTTCACAATGATTATATTAGTCTACATGGTCAATGGCTGGCTGTTGTTGAT 2742
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2709 ACTTGTCTTGCTCATAATGATTATATTAGTCTACATGGTCAATGGCTGGCTGTTGTTGAT 2768
Query 2743 AAGAAGCAAAAGATTGATAACTATCCAGAAATATTTGCATCCAATCTTCCCAACTTAGTA 2802
||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2769 AAGAAACAAAAGATCGATAACTATCCAGAAATTTTTGCAGCCAATCTTCCCAACCTAGTA 2828
Query 2803 AATGCTACAGAAGAAGGCAGAGACTCTGAATTCTTATCTGATTCTGGTACTAATGATATC 2862
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2829 AATGCTACAGAAGAAGGCAGAGACTTTGAATTGTTATCTGACTCTGGTACTAATGATATC 2888
Query 2863 AACGAAGCTGATACCACATCTACTAGCAGAGGTTGTATTCCTCTACCTTCAACTAGTAAT 2922
|| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 2889 AAAGAAGCTGATACTGCATATATTAGCAGAGGATGTATTCCTCAACCTTCAACTAGGAAT 2948
Query 2923 GCAATTGATGACGGGCAAGTCAATAGTATGTCACTGATTGGGACCGCATATGGCTCAAAT 2982
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 2949 GCAATTGATGACGGGCAAGTCAATAGTATGTCATTGATTGGGACCGCATATGGTTCAGAT 3008
Query 2983 ACTATTGATGACATTATGAGCATGGGACATATGGTGGAGAAGTTAGGAGGTGCTTTACCA 3042
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009 ACTATTAATGAAATTATGAGCATGGGACATATGGTGGAGAAGTTAGGAGGTGCTTTACCA 3068
Query 3043 CTTTATCATCCTCATGCCCTCCTTGTAGCTATACGTTCAGGCAATTGGAAACGAGCAAGT 3102
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3069 CTTTATCACCCTCAAGCCCTCCTTGTAGCTATACATTCAGGCAATTGGAAACGAGCAAGC 3128
Query 3103 GCAGCTCTTAGACATCTTGCTGAATATATTACTTCAAGTGATACCTCCGAGAAGGGATAT 3162
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 3129 GCAGCTCTAAGGCATCTTGCTGAATATATTACTTCAAGTGATGCCTCCGAGAAGGTATAT 3188
Query 3163 GCTGTAAAGTCAGTTCTTTGTCCAGATATCCTTTTGTCAAAATATTATGAAGGATCTCTC 3222
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3189 ACTGTAAAGTCAGTTCTTTATCCAGATATCCTTTTGTCAAAATATTATGAAGGGTCTCTC 3248
Query 3223 TCCAATGGCCCAAATCCTAAGGATTTCCAATGGGGTGGGACGTCTGGTTCAA 3274
|||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3249 TCCACTGGTCCAAATCATAAGGATTTCCAGTGGGGTGGGACATCTGGTTCAA 3300
Score = 1628 bits (881), Expect = 0.0
Identities = 989/1040 (95%), Gaps = 11/1040 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 6527 TAGGTTGGGAAACTCAAGAAGAATTTGAAGAGTTTGTTGATCCTCCCCCAACAGTTGAAA 6586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6385 TAGGTTGGGAAACTCAAGAAGAATTTGAAGAGTTTGTTGATCCTCCCCCAACAGTTGAAA 6444
Query 6587 GTGTTATTACGAGAGCATTCTCTAATCACCCGACAATGCCCCTCTTCTTGGTTGGCTCAA 6646
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6445 CTGTTATTACGAGAGCATTCTCTAATCACCCAACAATGCCCCTCTTCTTGGTTGGCTCAA 6504
Query 6647 GCAACACTCACATATACTTGTGGGAGTTTGGAAACGAAAGAGCTACTGCAACTTATGGTG 6706
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 6505 GCAACACTTACATATACTTGTGGGAGTTTGGAAAAGACAGAGCTACTGCAACTTATGGTG 6564
Query 6707 TTCTTCCTGCTGCAAATGTTTCC-CCTCCTTATGCTTTGGCGTCGATATCAGCAGTGCAA 6765
|||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6565 TTCTGCCTGCTGCAAATG-TTCCTCCTCCATATGCTTTGGCGTCAATATCAGCAGTGCAA 6623
Query 6766 TTCGGTCCATTCGGACACAGATTTGCTAGCGCTGCACTGGATGGAACTGTATGCACTTGG 6825
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6624 TTCGGTCCATGCGGACACAGATTTGCTAGCGCTGCACTGGATGGAACTGTATGCACTTGG 6683
Query 6826 CAATCAGAAGTTGGAGGAAGGAGCAATATTCATCCTGTTGAATCATCTCTTTGCTTCAAT 6885
|||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6684 CAATCAGAAGTTGGGGGAAGAAGCAATATCCATCCTGTTGAATCATCTCTTTGCTTCAAT 6743
Query 6886 GGCCATGCATCAGATGTAGGATATATTAGTTCGAGTGGATCCATTGTTGCAGCTTCAGGA 6945
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6744 GGCCATGCATCAGATGTAGAATATATTAGTTCGAGTGGATCCATTGTTGCAGCTTCAGGA 6803
Query 6946 TATAGCTCAAGTGGTGCAAATGTCGTTGTGTGGGATACTCTAGCTCCCCCTTCAACCTCC 7005
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6804 TATAGCTCAAGTGGTGCAAACGTAGTTGTGTGGGATACTCTAGCTCCGCCTTCAACCTCC 6863
Query 7006 CAGGCATCTATCAATTGCCATGAAGGTGGTGCACGCTCTATCTCGGTATTTGATAATGAC 7065
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 6864 CAGGCATCTATCAATTGTCATGAAGGTGGTGCACGGTCTATCTCAGTATTCGATAATGAC 6923
Query 7066 ATTGGTAGTGGTTCAATTTCTCCTATGATTGTGACTGGTGGCAAAAATGGTGATGTCGGT 7125
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6924 ATTGGTAGTGGCTCAATTTCTCCTATGATTGTGACTGGTGGCAAAAACGGTGATGTCGGT 6983
Query 7126 TTGCACGATTTCCGGTTTATTGCAACCGGAAAGATGAAGAAGCAAAGGAACCCTGACGGT 7185
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 6984 CTGCACGATTTCCGGTATATTGCAACCGGAAAGATGAAGAAGCAAAGGAATCCTGACGGA 7043
Query 7186 GGATCTTCGACTGATGGAGATCAAAACAAGAATGGGATGCTTTGGTATATACCAAAGGCT 7245
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7044 AGATCTTCGACTGATGGCGATCAAAACAAGAATGGGATGCTTTGGTATATACCAAAGGCT 7103
Query 7246 CACTTAGGGAGTGTGACAAAAATAGCGACAATCCCACGCACAAGTCTTTTCTTGACGGGA 7305
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 7104 CACTTAGGGAGTGTGACGAAAATAGCGACAATCCCACGCACAAGTCTGTTCTTGACGGGA 7163
Query 7306 AGCAAAGACGGAGAAGTAAAACTTTGGGATGCGAAAGCTGCAAAGTTGATTCATCATTGG 7365
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 7164 AGCAAAGACGGAGAAGTAAAACTTTGGGATGCGAAAGCAGCAAAGTTGATTCATCACTGG 7223
Query 7366 CCTAAACTACACGAAAGACACACTTTTCTGCAGCCAAACTCGAGAGGCTACGGTGGAATC 7425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 7224 CCTAAACTACACGAAAGACACACTTTTCTGCAGCCAAACTCTAGAGGCTACGGTGGAATA 7283
Query 7426 ATCCGGGCTGGGGTGACTGACATACAAGT-TTGTCCGAATGGATTTATAACGTGTGGTGG 7484
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 7284 ATCCGGGCTGGGGTGACTGACATACAA-TATTGTCCGAATGGATTTATAACGTGCGGTGG 7342
Query 7485 TGATGGCACGGTGAAGTTCGTCAGCCTCGTAGATTCTTCCTATGGCGATGCTAAATAAAA 7544
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 7343 TGATGGCACGGTGAAGTTCGTCAGCCT--TAGAGA-TTCCTGTGACGATGGTAAATAAAA 7399
Query 7545 AGAAGATACATTTTCCGGGA 7564
||| | ||||||||||||
Sbjct 7400 -GAA-A--CATTTTCCGGGA 7415
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 293286061413
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5