BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G47430.1
Length=3677
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg483920 jgi|Araly1|483920|fgenesh2_kg.4__2980__AT2G47430.1 5210 0.0
Ahg937833 jgi|Araly1|937833|scaffold_502024.1 3816 0.0
Ahg489665 jgi|Araly1|489665|fgenesh2_kg.6__2799__AT2G47430.1 3542 0.0
Ahg937835 jgi|Araly1|937835|scaffold_502026.1 652 0.0
> Ahg483920 jgi|Araly1|483920|fgenesh2_kg.4__2980__AT2G47430.1
Length=3608
Score = 5210 bits (2821), Expect = 0.0
Identities = 3340/3590 (93%), Gaps = 37/3590 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 35 TTGCTCCGAGGAAGAAG-A-T---AATATGAAAAGAGCTTTTTAGGGTTTATCATTCTCC 89
||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 TTGCTCCGAGGAAGAAGAAGTGAGAATAAGAAAAGTGTTTTTTAGGGTTTATCATTCTCC 61
Query 90 TTGACTTTGCAAAACGTGAAATCAGCTTCTTC-CTT-GGAGGACTAATCAAGACAGAAAT 147
|||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | | |||| ||||||||||||||
Sbjct 62 TTGACTTTACAAAACGTGAAATCAGCTTC-TCTCTTCGCA-GACTGATCAAGACAGAAAT 119
Query 148 CTGTTCCTCTAAAAACGATCGCCGTTCTA-GT--TCACTCAAATGATGGTGAAAGTTACA 204
|||||| ||| |||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 CTGTTCTTCTGAAAACGATAGCCGCTCTAGGTAATCAATCAAATGATGGTGAAAGTTACA 179
Query 205 AAGCTTGTGGCTTCACGTCCAATTGTGGTCTTTTGCGTCCTGGCATTCCTGGTGGTTGTT 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 180 AAGCTTGTGGCTTCACGTCCAATTGTGGTCTTTTGCGTCCTGGCATTTTTGGTGGTTGTT 239
Query 265 TTCGAGTGCATTTGGATCTCAAATTGGCGAACAACAACGGAGAACCTAGTCAAAGAGGTC 324
|| | |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||
Sbjct 240 TTTGGGTGCATAACGATCTCGGAGTGGCGAACAACAACGGATAACGTAGCCAAAGACGTC 299
Query 325 GCTTCATTTACCGAAGATCTCCGGACAAGTCTAGTTTCGGAGATTGAAAACATCGGAAAA 384
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GCTTCATTTACCAAAGATCTCCGGACAAGTATAGTTTCCGAGATTGAAAACATCGGAAAA 359
Query 385 TTTACATATGCCAAGACAAACTTATCTACGATCGGTTTAGCGAGAGTTATAGATTCTTAT 444
|| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TTCACATATCCCAAGACAAACTTATCTACAATCGGCTTAGCGAGAGTTATAGATTCTTAT 419
Query 445 ATCACCAACAACGACACTGGTTTTACAGAGATTCAAACACAGATCGCACCATTGTTGTTT 504
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 420 CTCACCAACAACGACACTGGTTTCGCAGAGATTCAAACACAGATTGCACCATTGTTGTTT 479
Query 505 GTAGCTTATTCAACGATCCTTCAAGTCTCACAAGTTTCGTACATCAGTAGGGACGGTCTC 564
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 480 GAAGCTTATTCAACGATCCCTCAAGTCTCACAAGTTTCCTACATTAGTAGGGACGGTCTC 539
Query 565 ATGTTTTCTTACATTGCAGAATCAAACACAAGTGTCGCTGTTTTTGCCAATTCCTCGTCG 624
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 540 TTCTTTTCTTACATTGCAGAATCAAACACAAGTGTCGCTGTTTTTGCCAATTCGTCGTCA 599
Query 625 AATTCAAGTCGTGGAGACTACACTTGGTACACTCAAACCGTGGATCAGTTAACTGGTCGT 684
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||
Sbjct 600 AATTCAAGTGGTGGAGACTACACTTGGTACACTCAAAACATTGATCAATTAACCGGTCGT 659
Query 685 CTTAACGGGAACTCAACGAAATCTCAGTCGTTAGATGTAACCCATACAGATTGGTTCCAA 744
|| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CTCAACGGGAACGCAACGAAATCTCAGCCGTTAGATTTAACCCATACAGATTGGTTCCAA 719
Query 745 GCAGCACAGAGTAATAACTACACTA-CAGCCTTTGTAGGAACGAGCTTGGGAGGAGAAGA 803
|||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| | ||||
Sbjct 720 GCAGCACAAAGTAATAATTACACTACCA-CCTTTCTAGGAACGAGTTTGGGAGAAAAAGA 778
Query 804 TAACGAGACTCTAATACAGAGCGTGGTTAGCTTGTACAGCAAGAAAGGTCTTGTTTCTTT 863
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 779 TAACGAGACTCTGATTCAGAGCGTGGTTAGCTTGTACAACAAGAAAGGTCTTGTTTCGCT 838
Query 864 AGGGTTTCCGGTTAAGACTTTAACCGAAGTTTTGAACAGTTTGAATCTACACGGCGAAGA 923
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 AGGGTTTCCGGTTAAGACTTTAACCGATGTTTTGAACAGTTTGAATCTACACGGCGAAGA 898
Query 924 GCTTTACATGTGGACAAAGGACGGGACGGTGCTTGTTCGTGAAGGTTCACTGAATGATTC 983
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 899 GCTTTACATGTGGACAAAGGACGGGACGGTACTTGTTCGTGAAGGTTCACTGAATGCTTC 958
Query 984 TTTCTTCATCTCCAATGGCTCGATTTGCTTCGGTAGAGAATCGAACTCCCTCTGGTCTCA 1043
| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||
Sbjct 959 TCTCTTTATCTCCAATGGCTCGATATGCTTTGGTAGAGATTCTAAATCCGTCTGGTCTCA 1018
Query 1044 ATGCATCCCTGAAAATTGCAGTTCCAGTGGCTACGAGGTGGAGATCAAAAGATTAAGATA 1103
||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1019 ATGCATCTCTGAAAATTGCAGTACCATTGGCTACAAGGTGGAGATCAAAAGATCAACATA 1078
Query 1104 CCAAGCTTTTTGCTCTGTTATTGAAGTTTCGGGCGTTCCTCTGAGATACACACTCATGTT 1163
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TCAAGCTTTTTGCTCTGTTCTTGAAGTTTCGGGTGTTCCTCTGAGATACACACTCATGTT 1138
Query 1164 TCCCAACAAAGGAGGAGCAACACGCATCAAGCACCAAGCGGAAAAGGCAAAATATCAACT 1223
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 1139 TCCCAACGAAGGAGGAGCAACACGAATCAAGCACCAAGCGGATAAGGCAATGTATCAACT 1198
Query 1224 TATTGTGGTTATGATATTTCTTGGCTTCGGTTGGCCTGTATGGTTTGTGTGGTTTATGAT 1283
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 TATTGTGGTTGTGATATTTCTTGGCTTGGGTTGGCCTGTATGGTTTGTGTGGTTTATGAT 1258
Query 1284 GCAAGCAACAAGGAGAGAGATGCATATGCGTGCAACGCTGATAAACCAAATGGAAGCGAC 1343
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1259 GCAAGCAACAAGGAGAGAGATGCGTATGCGTGCAATGCTGATAAACCAAATGGAAGCAAC 1318
Query 1344 ACAACAAGCTGAGAGAAAGAGCATGAACAAGAGTCAAGCATTTGCAAATGCTAGCCACGA 1403
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 ACAACAGGCTGAGCGAAAGAGCATGAACAAGAGTCAAGCATTTGCAAATGCTAGCCACGA 1378
Query 1404 TATTAGAGGTGCCCTTGCAGGGATGAAAGGTCTGATTGATATATGTCGTGATGGAGTTAA 1463
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1379 TATTAGAGGTGCCCTTGCAGCGATGAAAGGTCTGATAGATATATGTCGTGATGAAGTTAA 1438
Query 1464 ACCTGGCTCCGACGTAGACACCACTCTCAACCAAGTGAATGTTTGCGCCAAGGATTTGGT 1523
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 1439 ACCTGGCTCCGACATAGACACCACTCTCAAGCAAGTGAATGCTTGCTCCAAGGATTTGGT 1498
Query 1524 TGCTCTGCTCAACTCTGTTTTGGACATGAGCAAAATCGAAAGCGGGAAGATGCAGTTAGT 1583
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 TGTTCTGCTCAACTCTGTTTTGGACATGAGCAAAATCGAAAGCGGGAAGATGCAGTTAGT 1558
Query 1584 GGAAGAAGATTTCAACTTGTCGAAACTTCTTGAAGACGTCATCGATTTTTACCATCCCGT 1643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 1559 GGAAGAAGATTTCAACTTGTCGAAACTTCTTGAAGACGTTACCGATTTTTACCATCCCGT 1618
Query 1644 TGCGATGAAGAAAGGGGTTGATGTAGTTTTGGATCCGCACGATGGCTCGGTTTTCAAATT 1703
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1619 TGCGATGAAGAAAGGGGTTGATGTAGTTTTGGATTCACACGATGGCTCAATTTTCAAATT 1678
Query 1704 CTCGAATGT-ACGAGGGGATAGTGGCAGACTGAAGCAGATTCTGAACAATCTTGTTAGCA 1762
||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1679 CTCGAATGTGA-GAGGGGATAGTGGCAAACTGAAGCAGATTCTCAACAATCTTGTCAGCA 1737
Query 1763 ATGCTGTCAAGTTCACCGTCGACGGGCACATTGCGGTAAGAGCTTGGGCTCAGAGGCCAG 1822
|||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 ATGCTGTCAAATTCACAGTCGACGGGCACATTTTGATCAGAGCTTGGGCTCAGAGGCCAG 1797
Query 1823 GTTCCAATAGCTCTGTGGTCCTTGCATCATATCCTAAAGGTGTGTCCAAGTTTGTAAAGA 1882
||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1798 GTTCCAAAAGCTCTGTGATCCTTGCATCAGACCCTCAAGGTGTGTCCAAGTTTTTAAAGA 1857
Query 1883 GTATGTTCTGCAAGAATAAAGAAGAGTCATCAACCTACGA-GACAGAAATATCGAATTCC 1941
||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||
Sbjct 1858 GTATGTTATGCAAGAATAAAGACCAGTCATCAAACTACGAAG-CAGAAATTTCGAATTCC 1916
Query 1942 ATAAGAAACAATGCAAACACGATGGAGTTTGTGTTTGAAGTGGATGATACTGGTAAAGGG 2001
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1917 ATAAGAAACAATGCCAACACGATGGAGTTTGTGTTTGAAGTGGATGATACAGGTAAAGGG 1976
Query 2002 ATACCTATGGAGATGCGTAAGTCGGTATTTGAAAACTATGTTCAAGTAAGAGAAACAGCT 2061
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 ATACCTATGGAGATGCGTAAATCGGTGTTTGAAAACTATGTTCAAGTAAGAGAAACAGCT 2036
Query 2062 CAAGGACACCAAGGAACTGGTTTAGGGCTCGGGATTGTGCAGTCTTTGGTAAGATTAATG 2121
|||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2037 CAAGGACAACAAGGGACTGGTTTAGGGCTTGGGATTGTGCAGTCTTTGGTACGATTAATG 2096
Query 2122 GGAGGGGAGATAAGAATCACCGACAAGGCCATGGGAGAGAAAGGAACATGTTTCCAATTC 2181
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 GGAGGGGAGATAAGAATCACAGACAAGGCCATGGGGGAGAAAGGAACATGTTTCCAATTC 2156
Query 2182 AATGTTTTATTGACAACATTAGAGTCTCCTCCAGTGAGTGACATGAAAGTGAGAC-AGGA 2240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2157 AATGTTTTATTGACAACATTAGAGTCTCCTCCAGTGAGTGACATGAAAGTGAGACCAG-A 2215
Query 2241 GAT-CGAAGCAGGAGGCGATTATGTATCCACGCCAAACCTCGGGCTGACTATAAACACTT 2299
|| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2216 TATTC-AAGCAGGAGGCGATTACATATCCACGCCAGACCTCGGGCTAACTATAAACACTT 2274
Query 2300 CACTTGGAGGTAGCATGAATATACGTAACCTGAGTCCTAGATTCAACAACTGTCTCAGCT 2359
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2275 CACTGGGAGGTAGCATGAATATACGCAACCTGAGTCCTAGATTCAACAATTGTCTCAGCT 2334
Query 2360 CAAGTCCAAAGCAAGAAGGTTCTAGAGTGGTTCTTCTATTGAAAAATGAAGAACGCAGAA 2419
||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2335 CAAGTCCGAAGCAAGAATGTTCTAGAGTGGTTCTCCTATTGAAAAATGAAGAACGTAGGA 2394
Query 2420 GAGTTACAGAGAAATACATAAAGAATCTTGGGATTAAAGTTACAGTGGTGGAGAAATGGG 2479
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2395 GAGTTACCGAGAAATACATAAAGAATCTTGGGATTAAAGTTACAATGGTGGAGAAATGGG 2454
Query 2480 AGCATTTGAGTTATGCTTTGGAGAGACTTTTTGGATTTTCACCTCAGAGTTCCATGGGAA 2539
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 AGCATTTGAGTTATGCCTTGGAGAGACTTTTTGGATTTTCACCTCAGAGTTCCATGGGAA 2514
Query 2540 GAGCAGAGTGTAGTTTGTCATGTCCGAGCTCAAGGGAGTTACCTTTCATTGGCATGGACG 2599
|||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2515 GAGCAGAGAGTAGTTTGTCATGTCCAAGCTCAAGAGAGTTACCTTTGATTGGCATGGATG 2574
Query 2600 GTATTGATTCAAGAAGCCAACTTCCTAAAAGGAGAAGCATCAGTTTCTCTGCAGTTGTCC 2659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 GTATTGATTCAAGAAGCCAACTTCCTAAAAGGAGAAGCACCAGTTTCTCTGCAGTTGTCC 2634
Query 2660 TTTTGGTGATTGATGCAAAAACTGGACCATTTTTTGAGCTGTGCGATATTGTCAAACAGT 2719
|| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 2635 TTCTGGTGATTGATGCAAAAACTGGACCACTTCTTGAGCTTTACGATATTGTCAAACAGT 2694
Query 2720 TTCGTAGAGGCTTGCCCCATGGAATATCCTGTAAAGTTGTTTGGCTTAACGAATCGAGCA 2779
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 TTCGTAAAGGCTTGCCCCATGGAATAACCTGTAAAGTTGTTTGGCTTAACGAATCGAGCA 2754
Query 2780 CTCGTGTAAGTGAGAGAGGGGACATTAGTTGTTCGAGACCTTTGCACGGATCGCGTCTTA 2839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||
Sbjct 2755 CTCGTGTAAGTGAGAGAGGGGACATTAGTTGTTCGAGGCCCTTGCACGGATCACGTCTTA 2814
Query 2840 TGGAAGTCTTGAAGATGTTGCCTGAATTTGGAGGAACTGTGCTAAAAGAACCACCTACTG 2899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2815 TGGAAGTCTTGAAGATGTTGCCTGAATTTGGAGGAACTGTGCTAAAAGAAACACCTACTG 2874
Query 2900 AGCTGCAAAGGGAATCATTGCTGAGACATTCTTTTGTTGCAGAGAGATCACCAAAACATA 2959
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2875 AGCTGCAAAGGGAATCACTGCTGAGACATTCTTTTGTTGCAGAGAGATCACCAAAACATA 2934
Query 2960 AAGTCCAAGAAGAGGGGCCAAGCTCAATGTTTAACAAAAAATTAGGTAAGAGGATAATGG 3019
|| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 2935 AATTCCAAGAAGAAGGACCATGCTCAATGTTTAACAAAAAGTTAGGTAAGACGATAATGG 2994
Query 3020 CATCAACAGATTCAGAGAGTGAGACTAGGGTCAAGTCAGTGCGTACCGGTCGAAAGCCTA 3079
|| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||
Sbjct 2995 CACCAACAGCTTCAGAGAGCGAGACTAGGATCAAGTCAGTGAGTAGTGGTCAAAAGCCTA 3054
Query 3080 TTGGGAACCCAGAGGACGAGCAAGAGA-CTTCCAAGCCGAGTGACGATGAATTCTTAAGA 3138
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3055 TTGGAAACCCAGAGGACGAGGAAG-GAACTTCCAAGCCGAGTGACGATGAATTCTTAAGA 3113
Query 3139 GGAAAGAGAGTTCTTGTGGTCGATGATAACTTTATATCACGTAAAGTTGCAACAGGAAAG 3198
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3114 GGAAAGAGAGTTCTTGTGGTCGATGATAACTTTTTAACACGTAAAGTTGCAACAGGAAAG 3173
Query 3199 CTGAAGAAGATGGGAGTCTCAGAGGTCGAACAATGCGACAGTGGGAAAGAAGCTTTGAGA 3258
||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3174 CTGAAGAAGATGGGAGTTTCCGAGGTCTTACAATGCGACAGTGGAAAAGAAGCTTTGAGA 3233
Query 3259 TTAGTCACTGAAGGGCTTACACAAAGAGAAGAACAAGGTTCAGTAGATAAACTTCCGTTT 3318
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||
Sbjct 3234 TTAGTCACTGAAGGGCTTACACAAAAAGAAGAACAATGTTCAGTAAATAAGCTTCCGTTT 3293
Query 3319 GACTACATATTCATGGACTGCCAAATGCCAGAAATGGATGGCTATGAAGCAACTAGAGAG 3378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3294 GACTACATATTCATGGACTGCCAAATGCCAGAAATGGATGGATATGAAGCAACTAGAGAG 3353
Query 3379 ATTAGGAAAGTGGAGAAAAGTTATGGGGTGCGTACACCAATTATAGCTGTATCTGGTCAT 3438
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3354 ATTAGGAAAGTGGAGAGAAGTTATGGGGTGCGTATACCAATTATAGCGGTATCTGGTCAT 3413
Query 3439 GATCCTGGTTCA-GAGGAAGCAAGAGAAACCATTCAAGCTGGAATGGACGCCTTCTTAGA 3497
|||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3414 GATCCTGGTTCAAGAG-AAGCAAGAGAAACCGTTCAAGCTGGGATGGACGCCTTCTTAGA 3472
Query 3498 TAAAAGCTTGAATCAACTTGCAAACGTCATTAGAGAAATCGAAAGCAA-ACG--T-C--- 3550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |
Sbjct 3473 TAAAAGCTTGAATCAACTTGCAAACGTCATTAGAGAAATCGAGAGCAAGACGACTACTCT 3532
Query 3551 --ACTAGTATTGTATAAGTAGACAGCACGCAGC-TTTGTGCTACTACCAT 3597
||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||
Sbjct 3533 GCACTAGTATTGTATAAGTTGACAGTATGCAGCATTT-TGCTAGTACCAT 3581
> Ahg937833 jgi|Araly1|937833|scaffold_502024.1
Length=3238
Score = 3816 bits (2066), Expect = 0.0
Identities = 2506/2721 (92%), Gaps = 19/2721 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 253 CTGGTGGTTGTTTTCGAGTGCATTTGGATCTCAAATTGGCGAACAACAACGGAGAACCTA 312
|||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 4 CTGGTGGTTGTTTTCGGGTGCACATGGATCTCGAATTGGCGAACAACGACGGAGAACGTA 63
Query 313 GTCAAAGAGGTCGCTTCATTTACCGAAGATCTCCGGACAAGTCTAGTTTCGGAGATTGAA 372
| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||
Sbjct 64 GCCAAAGACGTCGCTTCATTTACCGAAGATCTCCGGACAAGTCTTGTTTCCGAGATTTAA 123
Query 373 AACATCGGAAAATTTACATATGCCAAGACAAACTTATCTACGATCGGTTTAGCGAGAGTT 432
||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 124 AACATTGGAAAATTTACATATCCCAAGACGAACTTATCTACAATCGGTTTAGCAAGAGTT 183
Query 433 ATAGATTCTTATATCACCAACAACGACACTGGTTT-TACAGAGATTCAAACACAGATCGC 491
||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||
Sbjct 184 TTAGATTCTTATCTCACCAACAA-GACACTGATTTCT-CAGAGATTCAAACAAAGATCGC 241
Query 492 ACCATTGTTGTTTGTAGCTTATTCAACGATCCTTCAAGTCTCACAAGTTTCGTACATCAG 551
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 242 ACCATTGTTGTTTGAAGCTTATTCAACGATCCCTCAAGTCTCACAAGTTTCGTACATTAG 301
Query 552 TAGGGACGGTCTCATGTTTTCTTACATTGCAGAATCAAACACAAGTGTCGCTGTTTTTGC 611
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 302 TAGGGCCGGTCTCCTGTTTTCTTACATTGCAGAATCAAACACAAGTGTAGCTGTTTTTGC 361
Query 612 CAATTCCTCGTCGAATTCAAGTCGTGGAGACTACACTTGGTACACTCAAACCGTGGATCA 671
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 362 AAATTCCTCGTCGACTTCAAGTGGTGGAGACTACACTTGGTACACTCAAACCGTTGATCA 421
Query 672 GTTAACTGGTCGTCTTAACGGGAACTCAACGAAATCTCAGTCGTTAGATGTAACCCATAC 731
||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 422 ATTAACCGGTCGTCTCAACGGGAACGCAACGAAATCTCAGCCGTTAGATTTAACCCATAC 481
Query 732 AGATTGGTTCCAAGCAGCACAGAGTAATAACTACACTACAGCCTTTGTAGGAACGAGCTT 791
|||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| || ||
Sbjct 482 AGATTGGTTCCAAGTAGCACAGAGTGATAATTACACTACCGCCTTTCTAGGAACAAGTTT 541
Query 792 GGGAGGAGAAGATAACGAGACTCTAATACAGAGCGTGGTTAGCTTGTACAGCAAGAAAGG 851
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 542 GGGAGGAGAAGAAAACGAGACTCTAATTCAGAGCGTGGTTAGCTTGTACAGCAATAAAGG 601
Query 852 TCTTGTTTCTTTAGGGTTTCCGGTTAAGACTTTAACCGAAGTTTTGAACAGTTTGAATCT 911
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 602 TCTTGTTTCGCTAGGGTTTCCGGTTAAGACTTTAACTGATGTTTTGAACAGTTTGAATCT 661
Query 912 ACACGGCGAAGAGCTTTACATGTGGACAAAGGACGGGACGGTGCTTGTTCGTGAAGGTTC 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 662 ACACGGCGAAGAGCTTTACATGTGGACAAAGGACGAGACGATGCTTGTTCGTCAAGGTTC 721
Query 972 ACTGAATGATTCTTTCTTCATCTCCAATGGCTCGATTTGCTTCGGTAGAGAATCGAACTC 1031
|||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||
Sbjct 722 ACTGAATGCTTCTTTCTTCGTCTCCAATGGATCAATTTGCTTCAGTAGAGAATCTAAATC 781
Query 1032 CCTCTGGTCTCAATGCATCCCTGAAAATTGCAGTTCCAGTGGCTACGAGGTGGAGATCAA 1091
|| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 782 TATCGGGTCTCAATGCATCCCTTATAACTGCAGTTCCAGTGGTTACGAGGTGGAGATCAA 841
Query 1092 AAGATTAAGATACCAAGCTTTTTGCTCTGTTATTGAAGTTTCGGGCGTTCCTCTGAGATA 1151
||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 842 AAGATCAAAATTTCAAGCTTTTTGCTCTGTTCTTGAAGTTTCGGGCGTTTCTCTGAGATA 901
Query 1152 CACACTCATGTTTCCCAACAAAGGAGGAGCAACACGCATCAA-GCACCAAGCGGAAAAGG 1210
||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || | | |||||||||||||
Sbjct 902 CACACTCATGTTTCCTAACAAAAGTGGAGCAACACGCAT-AAGGGATCAAGCGGAAAAGG 960
Query 1211 CAAAATATCAACTTATTGTGGTTATGATATTTCTTGGCTTCGGTTGGCCTGTATGGTTTG 1270
||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||
Sbjct 961 CAATGTATCAACTTATTGTGGTTACGATATTTTTTGGCTTGGGTTGGCCTTTGTGGTTTG 1020
Query 1271 TGTGGTTTATGATGCAAGCAACAAGGAGAGAGATGCATATGCGTGCAACGCTGATAAACC 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 1021 TGTGGTTTATGATGCAAGCAACAAGGAGAGAGATGCATATGCGTGCAGTGCTAATAAACC 1080
Query 1331 AAATGGAAGCGACACAACAAGCTGAGAGAAAGAGCATGAACAAGAGTCAAGCATTTGCAA 1390
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 AAATGGAAGCAACACAACAGGCTGAGAGAAAGAGCATGAACAAGAGTCAAGCATTTGCAA 1140
Query 1391 ATGCTAGCCACGATATTAGAGGTGCCCTTGCAGGGATGAAAGGTCTGATTGATATATGTC 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1141 ATGCTAGCCACGATATTAGAGGTGCCCTTGCAGGGATCAAAGGCCTGATTGATATATGTC 1200
Query 1451 GTGATGGAGTTAAACCTGGCTCCGACGTAGACACCACTCTCAACCAAGTGAATGTTTGCG 1510
|||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1201 GTGATGAAGTTAAACCAGGCTCTGACGTAGATACCACTCTTAGGCAAGTGAATGTTTGCT 1260
Query 1511 CCAAGGATTTGGTTGCTCTGCTCAACTCTGTTTTGGACATGAGCAAAATCGAAAGCGGGA 1570
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CCAAGGATTTGGTTGTTCTGCTCAACTCTGTTTTGGACATGAGCAAAATCGAAAGCGGGA 1320
Query 1571 AGATGCAGTTAGTGGAAGAAGATTTCAACTTGTCGAAACTTCTTGAAGACGTCATCGATT 1630
||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 1321 AGATGCATTTAGTGGAAGAAGATTTCAACTTGGCAAAACTTCTTGAAGACATCATCGACT 1380
Query 1631 TTTACCATCCCGTTGCGATGAAGAAAGGGGTTGATGTAGTTTTGGATCC-GCACGATGGC 1689
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||
Sbjct 1381 TTTACCATCCCGTTGCGATGAAGAAAGGGGTTGATGTAGTTTTGGA-CCTGCACAATGGC 1439
Query 1690 TCGGTTTTCAAATTCTCGAATGTACGAGGGGATAGTGGCAGACTGAAGCAGATTCTGAAC 1749
||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TCGATATTCAAATTCTCGAATGTGCGAGGAGATAGTGGCAAACTGAAGCAGATTCTGAAC 1499
Query 1750 AATCTTGTTAGCAATGCTGTCAAGTTCACCGTCGACGGGCACATTGCGGTAAGAGCTTGG 1809
|||||| | || ||||||||||||||||| || |||||||||||| || | ||||||||
Sbjct 1500 AATCTTATCAGTAATGCTGTCAAGTTCACAGTGGACGGGCACATTTCGATCCGAGCTTGG 1559
Query 1810 GCTCAGAGGCCAGGTTCCAATAGCTCTGTGGTCCTTGCATCATATCCTAAAGGTGTGTCC 1869
||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||
Sbjct 1560 GCTCAAAGGCCAAGTTCCAAAAGCTCTGTGGTCCTGGCATCGGACCCTCAAGGTGTGTCC 1619
Query 1870 AAG-TTTGTAAAGAGTATGTTCTGCAAGAATAAAGAAGAGTCATCAACCTACGAGACAGA 1928
||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||
Sbjct 1620 AAGATTT-TGAAGAGTATGTTCTGCAAGAATAAAGACCAGTCATCAACCTGCGAAACAGA 1678
Query 1929 AATATCGAATTCCATAAGAAACAATGCAAACACGATGGAGTTTGTGTTTGAAGTGGATGA 1988
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1679 AATATCGAATTCCATAAGAAACAACGCCAACACGATGGAGTTTGTGTTTGAAGTGGACGA 1738
Query 1989 TACTGGTAAAGGGATACCTATGGAGATGCGTAAGTCGGTATTTGAAAACTATGTTCAAGT 2048
||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 1739 TACAGGTAGAGGGATACCTATGGAGATGCGTAAATCGGTGTTTGAAAACAATGTTCAAGT 1798
Query 2049 AAGAGAAACAGCTCAAGGACACCAAGGAACTGGTTTAGGGCTCGGGATTGTGCAGTC-T- 2106
|||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |
Sbjct 1799 AAGAGAAACA----A-G-ACACCAAGGAACTGGTTTAGGGCTTGGCATTGTACAGTCGTC 1852
Query 2107 TT-GGTAAGATTAATGGGAGGGGAGATAAGAATCACCGACAAGGCCATGGGAGAGAAAGG 2165
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1853 TTTGGTAAGATTAATGGGAGGAGAGATAAGAATCACCGACAAGGCCATGGGAGAGAAAGG 1912
Query 2166 AACATGTTTCCAATTCAATGTTTTATTGACAACATTAGAGTCTCCTCCAGTGAGTGACAT 2225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1913 AACATGTTTCCAATTCAATGTTTTATTGACAACATTAGATTCTCCTCCAGTAAGTGACAT 1972
Query 2226 GAAAGTGAGACAGGAGATCGAAGCAGGAGGCGATTATGTATCCACGCCAAACCTCGGGCT 2285
||||| || |||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973 GAAAGCGAAACAGGACATCGAAGTAGGAGGCGAATACGTATCCACGCCAAACCTCGGGCT 2032
Query 2286 GACTATAAACACTTCACTTGGAGGTAGCATGAATATACGTAACCTGAGTCCTAGATTCAA 2345
||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 GACTATAAATACTTCACTGGGAGCTATTATGAATATACGCAACCTGAGTCCTAGATTCAA 2092
Query 2346 CAACTGTCTCAGCTCAAGTCCAAAGCAAGAAGGTTCTAGAGTGGTTCTTCTATTGAAAAA 2405
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2093 CAACTGTCTCAGCTCAAGTCCAAAGCAAGAATGTTCTAGAGTGGTTCTCCTATTGAAAAA 2152
Query 2406 TGAAGAACGCAGAAGAGTTACAGAGAAATACATAAAGAATCTTGGGATTAAAGTTACAGT 2465
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2153 CGAAGAACGCAGAAGAGTTACTGAGAAATATATAAAGAATCTTGGGATTAAAGTTTCAGT 2212
Query 2466 GGTGGAGAAATGGGAGCATTTGAGTTATGCTTTGGAGAGACTTTTTGGATTTTCACCTCA 2525
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 GGTGGAGAAATGGGAGCATTTAAGTTATGCCCTGGAGAGACTTTTTGGATTTTCACCTCA 2272
Query 2526 GAGTTCCATGGGAAGAGCAGAGTGTAGTTTGTCATGTCCGAGCTCAAGGGAGTTACCTTT 2585
||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 2273 GAGTTCCATGGGAAGAGCAGAGTGTAGCTTGTCAAATCCGAGCTCACGGGAGTTACCATT 2332
Query 2586 CATTGGCATGGACGGTATTGATTCAAGAAGCCAACTTCCTAAAAGGAGAAGCATCAGTTT 2645
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2333 GATTGGCATGGATGGTATTGATTCAAGAAGCCAACTTCCTAAAAAGAGAAGCAACAGTTT 2392
Query 2646 CTCTGCAGTTGTCCTTTTGGTGATTGATGCAAAAACTGGACCATTTTTTGAGCTGTGCGA 2705
||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 2393 CTCTGCACTTGTCCTCTTGGTGATTGATGCAAAAACTGGACCATTTTTTGAGTTGTACGA 2452
Query 2706 TATTGTCAAACAGTTTCGTAGAGGCTTGCCCCATGGAATATCCTGTAAAGTTGTTTGGCT 2765
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2453 TATTGTCAAACAGTTTCGTAGAGGCTTGCCCCATGGAATAACCTGTAAAGTTGTTTGGCT 2512
Query 2766 TAACGAATCGAGCACTCGTGTAAGTGAGAGAGGGGACATTAGTTGTTCGAGACCTTTGCA 2825
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2513 AAACGAATCGAGCACTCGTGTAAGTGAGAAAGGGGACATTAGTTGTTCTAGACCCTTGCA 2572
Query 2826 CGGATCGCGTCTTATGGAAGTCTTGAAGATGTTGCCTGAATTTGGAGGAACTGTGCTAAA 2885
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 2573 CGGATCGCATCTTATGGAAGTCTTGAAGATGTTACCTGAATTTGGAGGAACTTTTCTAAA 2632
Query 2886 AGAACCACCTACTGAGCTGCAAAGGGAATCATTGCTGAGACATTCTTTTGTTGCAGAGAG 2945
|||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2633 AGAAACACCAACTGAGCTGCAAAGGGAATCACTGTTGAGACATTCTTTTGTTGCAGAGAG 2692
Query 2946 ATCACCAAAACATAAAGTCCA 2966
|||||||||||| ||| ||||
Sbjct 2693 ATCACCAAAACA-AAATTCCA 2712
Score = 468 bits (253), Expect = 1e-130
Identities = 299/320 (93%), Gaps = 7/320 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 3030 TTCAGAGAGTGAGACTAGGGTCAAGTCAGTGCGTACCGGTCGAAAGCCTATTGGGAACCC 3089
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||
Sbjct 2717 TTCAGAGAGTGAGACTTGGGTCAAGTCAGTGCGTACAGGTGGAAATCTTATTGGGAACCC 2776
Query 3090 AGAGGACGAGCAA-GAGACTTCCAAGCCGAGTGACGATGAATTCTTAAGAGGAAAGAGAG 3148
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2777 AGAGGACGAGCAAGGA-ACTTCCAAGCCGAGTGACGATGAATTCTTAAGAGGAAAGAGAG 2835
Query 3149 TTCTTGTGGTCGATGATAACTTTATA-TCACGTAAAGTTGCAACAGGAAAGCTGAAGAAG 3207
||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2836 TTCTTGTGGTCGATGATAACTTTTTAAT-ACGTAAAGTTGCAACAGGAAAGCTAAAGAAG 2894
Query 3208 ATGGGAGTCTCAGAGGTCGAACAATGCGACAGTGGGAAAGAAGCTTTGAGATTAGTCACT 3267
||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2895 ATGGGAGTCTCCGAGGTCAAACAATGCGACAGTGGAAAAGAAGCTTTGAGATTAGTCACT 2954
Query 3268 GAAGGGCTTACACAAAGA-GA-A-GAACAAGGTTCAGTAGATAAACTTCCGTTTGACTAC 3324
||||||||| |||||||| || | |||||||||||| || |||| |||||||||||||||
Sbjct 2955 GAAGGGCTTGCACAAAGAAGAGAAGAACAAGGTTCAATATATAACCTTCCGTTTGACTAC 3014
Query 3325 ATATTCATGGACTGCCAAAT 3344
||||||||||||||||||||
Sbjct 3015 ATATTCATGGACTGCCAAAT 3034
Score = 265 bits (143), Expect = 2e-69
Identities = 160/168 (95%), Gaps = 2/168 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3379 ATTAGGAAAGTGGAGAAAAGTTATGGGGTGCGTACACCAATTATAGCTGTATCTGGTCAT 3438
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3033 ATTAGGAAAGTGGAGAAAAGTTATGGGGTGCGTATACCAGTTATAGCTGTATCTGGTCAT 3092
Query 3439 GATCCTGGTTC-AGAGGAAGCAAGAGAAACCATTCAAGCTGGAATGGACGCCTTCTTAGA 3497
|||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3093 GATCATGGTTCAAG-GGAAGCAAGAGAAACCATTCAAGCTGGAATGGACGCCTTCTTAGA 3151
Query 3498 TAAAAGCTTGAATCAACTTGCAAACGTCATTAGAGAAATCGAAAGCAA 3545
||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3152 TAAAAACTTGAATCAACTTGCAAATGTCATTAGAGATATCGAAAGCAA 3199
> Ahg489665 jgi|Araly1|489665|fgenesh2_kg.6__2799__AT2G47430.1
Length=3342
Score = 3542 bits (1918), Expect = 0.0
Identities = 2335/2539 (92%), Gaps = 18/2539 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 190 ATGGTGAAAGTTACAAAGCTTGTGGCTTCACGTCCAATTGTGGTCTTTTGCGTCCTGGCA 249
|||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1 ATGGTGAACGTTAAAAAGCTTGTGGCTTCACGTCTAATTGTGGTCTTTGGCATCCTGGCA 60
Query 250 TTCCTGGTGGTTGTTTTCGAGTGCATTTGGATCTCAAATTGGCGAACAACAACGGAGAAC 309
|| ||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||
Sbjct 61 TTTATGGTGGTTGTTTTCGGGTGCATATGGATTTCGAATTGGCGAACAACAACGAAGAGT 120
Query 310 CTAGTC-AAAGAGGTCGCTTCATTTACCGAAGATCTCCGGACAAGTCTAGTTTCGGAGAT 368
||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 121 GTAG-CGAAAGACGTTGCTTCATTTACCGAAGATCTCCGGACAAGTCTAGTTTCCGAGAT 179
Query 369 TGAAAACATCGGAAAATTTACATATGC-CAAGACAAACTTATCTACGATCGGTTTAGCGA 427
| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 180 TCAAAACATTGGAAAATTTACATA-CCTCAAGACGAACTTATCTACAATCGGTTTAGCAA 238
Query 428 GAGTTATAGATTCTTATATCACCAACAACGACACTGGTTTTACAGAGATTCAAACACAGA 487
|| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 239 GAATGGTAGATTCTTATCTCACCAACAACGACACTGGTTTCACAGAGATTCAAACACAGA 298
Query 488 TCGCACCATTGTTGTTTGTAGCTTATTCAACGATCCTTCAAGTCTCACAAGTTTCGTACA 547
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 TCGCACCATTGTTGTTTGAAGCTTATTCAACGATCCCTCAAGTCTCACAAGTTTCGTACA 358
Query 548 TCAGTAGGGACGGTCTCATGTTTTCTTACATTGCAGAATCAAACACAAGTGTCGCTGTTT 607
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 TTAGTAGGGACGGTCTCCTGTTTTCTTACATTGCAGAATCAAACACAAGTGTCGCTGTTT 418
Query 608 TTGCCAATTCCTCGTCGAATTCAAGTCGTGGAGACTACACTTGGTACACTCAAACCGTGG 667
|||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 419 TTGCCAATTCTTCGTCGACTTCAAGTGGTGGAGACTACACTTGGTACACTCAAACCGTTG 478
Query 668 ATCAGTTAACTGGTCGTCTTAACGGGAACTCAACGAAATCTCAGTCGTTAGATGTAACCC 727
|||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 479 ATCAGTTAACCGGTCGTCTCAACGGGAACGCAACAAAATCTCAGGCGTTAGATTTAACCC 538
Query 728 ATACAGATTGGTTCCAAGCAGCACAGAGTAATAACTACACTACAGCCTTTGTAGGAACGA 787
||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 539 ATACATATTGGATCCAAGCAGCACAGAGTAATAATTACACTACCGCCTTTCTAGGAACGA 598
Query 788 GCTTGGGAGGAGAAGATAACGAGACTCTAATACAGAGCGTGGTTAGCTTGTACAGCAAGA 847
| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 599 GTTTGGGAGGAGAAGATAGCGAGACTCTAATTCAGAGCGTAGTTAGCTTGTACAGCAAGA 658
Query 848 AAGGTCTTGTTTCTTTAGGGTTTCCGGTTAAGACTTTAACCGAAGTTTTGAACAGTTTGA 907
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||
Sbjct 659 AAGGTCTTGTTTCGCTAGGGTTCCCGGTTAAGACTTTAACCGATGTTCTGAACAGATTGA 718
Query 908 ATCTACACGGCGAAGAGCTTTACATGTGGACAAAGGACGGGACGGTGCTTGTTCGTGAAG 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 719 ATCTACACGGCGAAGAGCTTTACATGTGGACAAAGGATGGGACAGTGCTTGTTCGCGAAG 778
Query 968 GTTCACTGAATGATTCTTTCTTCATCTCCAATGGCTCGATTTGCTTCGGTAGAGAATCGA 1027
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 779 GTTCATTGAATGCTTCTTTCTTCATCTCCAATGGCTCAATTTGTTTCGGTAGAGAATCGA 838
Query 1028 ACTCCCTCTGGTCTCAATGCATCCCTGAAAATTGCAGTTCCAGTGGCTACGAGGTGGAGA 1087
| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 839 AATCCGTCTGGTCTCAATGCATCCCTGATAACTGCAGTTCTAGTGGTTACGAGGTGGAGA 898
Query 1088 TCAAAAGATTAAGATACCAAGCTTTTTGCTCTGTTATTGAAGTTTCGGGCGTTCCTCTGA 1147
||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 899 TCAAAAGATCAACATTCCAAGCTTTTTGCTCTGTTCTTGAAGTTTCAGGCGTTCCTCTGA 958
Query 1148 GATACACACTCATGTTTCCCAACAAAGGAGGAGCAACACGCATCAAGCACCAAGCGGAAA 1207
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 959 GATACACACTGATGTTTCCCAACAAAGGAGGAGCAACACGCATCAGGCACCAAGCGGAAA 1018
Query 1208 AGGCAAAATATCAACTTATTGTGGTTATGATATTTCTTGGCTTCGGTTGGCCTGTATGGT 1267
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 1019 AGGCAATGTATCAACTTATTGTGGTTACGATATTTCTTGGCTTGGGTTGGCCTTTATGGT 1078
Query 1268 TTGTGTGGTTTATGATGCAAGCAACAAGGAGAGAGATGCATATGCGTGCAACGCTGATAA 1327
| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TCGTGTGGTTTATGATGCAAGCAACAAGGAAAGAGATGCATATGCGTGCAACGCTGATAA 1138
Query 1328 ACCAAATGGAAGCGACACAACAAGCTGAGAGAAAGAGCATGAACAAGAGTCAAGCATTTG 1387
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1139 ACCAAATGGAAGCAACACAACAGGCTGAGAGAAAGAGCATGAACAAGAGTCAAGCGTTTG 1198
Query 1388 CAAATGCTAGCCACGATATTAGAGGTGCCCTTGCAGGGATGAAAGGTCTGATTGATATAT 1447
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 1199 CAAATGCTAGCCACGATATTAGAGGTGCCCTTGCTGGGATCAAAGGTCTAATTGATATAT 1258
Query 1448 GTCGTGATGGAGTTAAACCTGGCTCCGACGTAGACACCACTCTCAACCAAGTGAATGTTT 1507
|| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1259 GTTGTGATGAAGTTAAGCCTGGCTCTAATGTAGACACCACTCTCAAGCAAGTGAATGTTT 1318
Query 1508 GCGCCAAGGATTTGGTTGCTCTGCTCAACTCTGTTTTGGACATGAGCAAAATCGAAAGCG 1567
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 GCTCCAAGGATTTGGTTGTTCTGCTCAACTCTGTTTTGGACATGAGCAAAATCGAAAGCG 1378
Query 1568 GGAAGATGCAGTTAGTGGAAGAAGATTTCAACTTGTCGAAACTTCTTGAAGACGTCATCG 1627
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 GGAAGATGCAATTAGTGGAAGAAGATTTCAACTTGGCAAAACTTCTTGAAGACGTCATCG 1438
Query 1628 ATTTTTACCATCCCGTTGCGATGAAGAAAGGGGTTGATGTAGTTTTGGATCCGCACGATG 1687
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||
Sbjct 1439 ACTTTTACCATCCTGTTGCGATGAAGAAAGGGGTTGATGTAGTTTTTGACCCACACGATG 1498
Query 1688 GCTCGGTTTTCAAATTCTCGAATGTACGAGGGGATAGTGGCAGACTGAAGCAGATTCTGA 1747
||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 1499 GCTCGATATTCAAATTCACGAATGTGCGAGGGGATAGTTGCAAACTGAAGCAGATTCTGA 1558
Query 1748 ACAATCTTGTTAGCAATGCTGTCAAGTTCACCGTCG-ACGGGCACATTGCGGTAAGAGCT 1806
|||||||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||
Sbjct 1559 ACAATCTTGTCAGTAATTCTGTCAAGTTCACAA-CGGACGGGCACATTTCGATCCGAGCT 1617
Query 1807 TGGGCTCAGAGGCCAGGTTCCAATAGCTCTGTGGTCCTTGCATCATATCCTA-AAGGTGT 1865
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | | | |||||||
Sbjct 1618 TGGGCTCAGAGGCCAGGTTCCAAAAGCTCTGTGGTCCTGGCATCAGA-CATTCAAGGTGT 1676
Query 1866 GTCCAAG-TTTGTAAAGAGTATGTTCTGCAAGAATAAAGAAGAGTCATCAACCTACGAGA 1924
||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |
Sbjct 1677 GTCTAAGATTT-TGAAGAGTATGTTCTGCAAGAATAAAGACCAGTCGTCAACTTACGAAA 1735
Query 1925 CAGAAATATCGAATTCCATAAGAAACAATGCAAACACGATGGAGTTTGTGTTTGAAGTGG 1984
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1736 TAGAAATATCGAATTCCATAAGAAACAATGCCAACACGATGGAGTTTGTGTTTGAAGCGG 1795
Query 1985 ATGATACTGGTAAAGGGATACCTATGGAGATGCGTAAGTCGGTATTTGAAAACTATGTTC 2044
| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1796 ACGATACAGGTAAAGGGATACCTATAGAGATGCGTAAATCGGTGTTTGAAAACTATATTC 1855
Query 2045 AAGTAAGAGAAACAGCTCAAGGACACCAAGGAACTGGTTTAGGGCTCGGGATTGTGCAGT 2104
||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||
Sbjct 1856 AAGTAAGAGGAACAG-----G-ACACCAAGGAACTGGTTTGGGGCTTGGCATTGTACAGT 1909
Query 2105 CTTTGGTAAGATTAATGGGAGGGGAGATAAGAATCACCGACAAGGCCATGGGAGAGAAAG 2164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910 CTTTGGTAAGATTAATGGGAGGGGAGATAAGAATCACCGACAAGGCCATGGGAGAGAAAG 1969
Query 2165 GAACATGTTTCCAATTCAATGTTTTATTGACAACATTAGAGTCTCCTCCAGTGAGTGACA 2224
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||
Sbjct 1970 GAACATGTTTCGAATTCAATGTTTTATTGACAACATTAGAGTCTCCTCCAATGAATAACA 2029
Query 2225 TGAAAGTGAGACAGGAGATCGAAGCAGGAGGCGATTATGTATCCACGCCAAACCTCGGGC 2284
||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2030 TGAAAGTAAAACAGGACATCGAAGCAGGAGGTGATTACGTATCCACGCCAAACCTCGGAC 2089
Query 2285 TGACTATAAACACTTCACTTGGAGGTAGCATGAATATACGTAACCTGAGTCCTAGATTCA 2344
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||
Sbjct 2090 TGACTATAAACACTTCACTGGGAGGTAGCATGAATCTACGCAACCTAAGTCCTAAATTCA 2149
Query 2345 ACAACTGTCTCAGCTCAAGTCCAAAGCAAGAA-GGTTCTAGAGTGGTTCTTCTATTGAAA 2403
|||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2150 ACAACTGTCTTAGCTCAAGTCCAAAGCAAGAATGGT-CTAGAGTGGTTCTCCTATTGAAA 2208
Query 2404 AATGAAGAACGCAGAAGAGTTACAGAGAAATACATAAAGAATCTTGGGATTAAAGTTACA 2463
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2209 AGCGAAGAACGCAGAAGAGTTACCGAGAAATACATAAAGAATGTTGGGATTAAAGTTTCA 2268
Query 2464 GTGGTGGAGAAATGGGAGCATTTGAGTTATGCTTTGGAGAGACTTTTTGGATTTTCACCT 2523
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269 GTGGTGGAGAAATGGGAGCATTTGAGTTATGCCTTGGAGAGACTTTTTGGATTTTCACCT 2328
Query 2524 CAGAGTTCCATGGGAAGAGCAGAGTGTAGTTTGTCATGTCCGAGCTCAAGGGAGTTACCT 2583
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2329 CAGAGTTCCATGGGAAGAGCAGAGTGTAGCTTGTCATGTTCGAGCTCAAGGAAGTTACCA 2388
Query 2584 TTCATTGGCATGGACGGTATTGATTCAAGAAGCCAACTTCCTAAAAGGAGAAGCATCAGT 2643
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 2389 TTGATTGGCATGGATGGTATTGATTCAAGAAGCCAACTTCCTAAAAGGAGAAGAAACAGT 2448
Query 2644 TTCTCTGCAGTTGTCCTTTTGGTGATTGATGCAAAAACTGGACCATTTTTTGAGCTGTGC 2703
||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2449 TTCCCTGCACTTGTCCTTCTGGTGATTGATGCAAAAACTGGACCATTTTTTGAGCTGTAC 2508
Query 2704 GATATTGTCAAACAGTTTC 2722
|||| ||||||||| ||||
Sbjct 2509 GATACTGTCAAACAATTTC 2527
Score = 1088 bits (589), Expect = 0.0
Identities = 732/800 (92%), Gaps = 14/800 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2756 TTGTTTGGCTTAACGAATCGAGCACTCGTGTAAGTGAGAGAGGGGACATTAGTTGTTCG- 2814
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 2528 TTGTTTGGCTAAACGAATCGAGCACTCATGTAAGTGAAAGAGGGGACATTAGTTGTT-GT 2586
Query 2815 AGACCTTTGCACGGATCGCGTCTTATGGAAGTCTTGAAGATGTTGCCTGAATTTGGAGGA 2874
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2587 AGACCCTTGCACGGATCGCGTCTTATGGAAGTCTTGAAGATGTTACCTGAATTTGGAGGA 2646
Query 2875 ACTGTGCTAAAAGAACCACCTACTGAGCTGCAAAGGGAATCATTGCTGAGACATTCTTTT 2934
||| |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||
Sbjct 2647 ACTCTGCTAAGAGAAACACCAACTGAGCTGCAAAGAGAATCACCACTGAGATATTCTTTT 2706
Query 2935 GTTGCAGAGAGATCACCAAAACATAAAGTCCAAGAAGAGGGGCCAAGCTC---AATGTTT 2991
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||
Sbjct 2707 GTTGCAGAGAGATCACTAAAACATAAATTCCAAGAAGAGGGACTAAGCTCATTAAGGTTT 2766
Query 2992 AACAAAAAATTAGGTAAGAGGATAATGGCATCAACAGATTCAGAGAGTGAGACTAGGGTC 3051
|||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 2767 AACAAAAAATTAGGCAAGACGTTAATGGCACCAACATCTTCAGAGAGTGAGACTTCGGTC 2826
Query 3052 AAGTCAGTGCGTACCGGTCGAAAGCCTATTGGGAACCCAGAGGACGAGCAA-GAGACTTC 3110
|||| | |||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||
Sbjct 2827 AAGTTACTGCGTATAGGTGGGAATCCTATTGGGAACCTAGAGGACGAGCAAGGA-ACTTC 2885
Query 3111 CAAGCCGAGTGACGATGAATTCTTAAGAGGA-AAGAGAGTTCTTGTGGTCGATGATAACT 3169
|||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886 CAAGCCGAGTGACGATGAGTTCTTAAGA-GAGAAGAGAGTTCTTGTGGTCGATGATAACT 2944
Query 3170 TTATATCACGTAAAGTTGCAACAGGAAAGCTGAAGAAGATGGGAGTCTCAGAGGTCGAAC 3229
|| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2945 TTTTAACACGTAAAGTTGCAATAGGAAAGCTAAAGAAGATGGGAGTCTCCGAGGTCAAAC 3004
Query 3230 AATGCGACAGTGGGAAAGAAGCTTTGAGATTAGTCACTGAAGGGCTTACAC--A-AAGAG 3286
|||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 3005 AATGTGACAATGGAAAAGAAGCTTTGAGATTAGTCACTGAAGGGCTTACACAAAGAAGAG 3064
Query 3287 AAGAACAAGGTTCAGTAGATAAACTTCCGTTTGACTACATATTCATGGACTGCCAAATGC 3346
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3065 AAGAACAAGGTTCAGTAGATAACCTTCCGTTTGACTACATATTCATGGACTGCCAAATGC 3124
Query 3347 CAGAAATGGATGGCTATGAAGCAACTAGAGAGATTAGGAAAGTGGAGAAAAGTTATGGGG 3406
|||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3125 CAGATATGGATGGATATGAAGCAACTAAAGAGATTAGGAAAGTGGAGAAAAGTTATGGGG 3184
Query 3407 TGCGTACACCAATTATAGCTGTATCTGGTCATGATCCTGGTTC-AGAGGAAGCAAGAGAA 3465
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 3185 TGCGTATACCAATTATAGCTGTATCTGGTCATGATCCTGGTTCAAG-GGAAGCAAGAGAA 3243
Query 3466 ACCATTCAAGCTGGAATGGACGCCTTCTTAGATAAAAGCTTGAATCAACTTGCAAACGTC 3525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3244 ACCATTCAAGCTGGAATGGACGCCTTCTTAGATAAAAATTTGAATCAACTTGCAAATGTC 3303
Query 3526 ATTAGAGAAATCGAAAGCAA 3545
|||||||| |||||||||||
Sbjct 3304 ATTAGAGATATCGAAAGCAA 3323
> Ahg937835 jgi|Araly1|937835|scaffold_502026.1
Length=487
Score = 652 bits (353), Expect = 0.0
Identities = 414/444 (93%), Gaps = 2/444 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1146 GAGATACACACTCATGTTTCCCAACAAAGGAGGAGCAACACGCATCAA-GCACCAAGCGG 1204
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| |
Sbjct 8 GAGATACACACTCATGTTTCCCAACAAAAGAGGAGCAACACGCAT-AAGGGACCAAGCCG 66
Query 1205 AAAAGGCAAAATATCAACTTATTGTGGTTATGATATTTCTTGGCTTCGGTTGGCCTGTAT 1264
||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |
Sbjct 67 AAAAGACAATGTATCAACTTATTATGGTTACGATATTTTTTGGCTTGGGTTGGCCTTTGT 126
Query 1265 GGTTTGTGTGGTTTATGATGCAAGCAACAAGGAGAGAGATGCATATGCGTGCAACGCTGA 1324
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 127 GGTTTGTGTGGTTTATGATGCAAGCAACAAGGAGAGAGATGCATATGCGTGCAATGCTGA 186
Query 1325 TAAACCAAATGGAAGCGACACAACAAGCTGAGAGAAAGAGCATGAACAAGAGTCAAGCAT 1384
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 TAAACCAAATGGAAGCAACACAACAGGCTGAGAGAAAGAGCATGAACAAGAGTCAAGCAT 246
Query 1385 TTGCAAATGCTAGCCACGATATTAGAGGTGCCCTTGCAGGGATGAAAGGTCTGATTGATA 1444
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 247 TTGCAAATGCTAGCCACGATAATAGAGGTGCCCTTGCAGGGATCAAAGGTCTGATTGATA 306
Query 1445 TATGTCGTGATGGAGTTAAACCTGGCTCCGACGTAGACACCACTCTCAACCAAGTGAATG 1504
|||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||
Sbjct 307 TATGTCGTGATGAAGTTAAACCAGGCTCTGACGTAGATACCACTCTTAGGCAAGTGAATG 366
Query 1505 TTTGCGCCAAGGATTTGGTTGCTCTGCTCAACTCTGTTTTGGACATGAGCAAAATCGAAA 1564
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 TTTGCTCCAAGGATTTGGTTGTTCTGCTCAACTCTGTTTTGGACATGAGCAAAATCGAAA 426
Query 1565 GCGGGAAGATGCAGTTAGTGGAAG 1588
||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 427 GCGGGAAGATGCATTTAGTGAAAG 450
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 138910141450
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5