BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G47980.1 Length=3644 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg935788 jgi|Araly1|935788|scaffold_403776.1 5341 0.0 Ahg944576 jgi|Araly1|944576|scaffold_700805.1 4621 0.0 > Ahg935788 jgi|Araly1|935788|scaffold_403776.1 Length=3298 Score = 5341 bits (2892), Expect = 0.0 Identities = 3127/3240 (97%), Gaps = 17/3240 (1%) Strand=Plus/Plus Query 249 GACGGAAGCGGCGGAGAGAATCAGGAGCGCAGCAGCGACCAGATTGAGCTCGATGACGAC 308 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || | | | Sbjct 72 GACGGCAGCGGCGGAGAGAATCAGGAGCGCAGCAGCGACCAGA-T-A----GA-G-C-TC 122 Query 309 GATTTCCAGGAAACCCGTCCCAAGCCCAAGCGTAGTCGCACCCA---TCCTCCTCAACAG 365 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 123 GATTTCCAGGAAACGCGTCCCAAGCCCAAGCGTAGTCGCACCCATCCTCCTCCTCAACAG 182 Query 366 AATCTCATTGAGGTTGTCAAAGGCAACGGGGATCTTATTTCTAAAGCCGTCAAGATTTGG 425 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 183 AATCTCATTGAGGTTGTCAAAGGCAACGGGGATCTTATTTCTAAATCCGTCAAGATTTGG 242 Query 426 GTTGAAAGATATGAAGACTCTCCCAGCCTTGCTACCACTGAGCTCTTGTCAATGCTCTTT 485 ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 243 GTTGAAAGATATGAACACTCTCCCAGACTTGCCACCACTGAGCTCTTGTCAATGCTCTTT 302 Query 486 CAGGCTTGCGGTGCTAAATACTCCATCAAGGATGATCTGCTTGATGAGACTGATGTCGAT 545 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 GAGGCTTGCGGTGCTAAATACTCCATCAAGGAAGATCTGCTTGATGAGACTGATGTCGAT 362 Query 546 GATGTTGTCGTTTCCCTTGTTAATCTTGCTAGAGCCGGGGAACTCGAAGATTATCAGAGT 605 |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| Sbjct 363 GATGTTGTCGTTGCCCTTGTTCATCTTGCTAGAACCGGGGAAATTGAAGATTATCAGAGT 422 Query 606 TCCAGAAAGAAGGAACTCAAGAACTTCAAAGAAAATCTTGTTTCCTTCTGGAATAATCTC 665 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || Sbjct 423 TCGAGAAAGAAGGAACTCAAGAACTTCAAAGAAAATCTTGTTTCATTCTGGAATGACCTG 482 Query 666 ATTATCGAGTGCCAAAACGGACCATTGTTTGATAGAGTCTTGTTCGACAAGTGCATGGAC 725 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 483 ATTATCGAGTGCCAAAACGGACCATTGTTCGATAAAGTCTTGTTCGACAAGTGCATGGAC 542 Query 726 TACATTATCGCACTGTCATGTACTCCACCCAGAGTTTACCGTCAAACTGCCACGCTAATG 785 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 543 TACATTATCGCACTCTCATGTACTCCACCTAGAGTTTACCGTCAAACTGCCACGCTAATG 602 Query 786 GGCCTCCAACTAGTCACATCTTTCATTTCTGTTGCAAACACACTCGGTTCACAGCGAGAA 845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 603 GGCCTCCAACTAGTCACATCTTTCATTTCTGTTGCAAACACACTCGGTTCACAGCGAGAA 662 Query 846 ACCACCCAAAGACAATTGAATGCTGAAAGCAAGAAGAGAGCTGACGGCCCTCGTGTGGAC 905 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 663 ACCACCCAAAGACAATTGAATGCTGAAAGCAAGAAGAGAGCTGACGGCCCTCGTGTGGAG 722 Query 906 TCCCTCAACAAAAGGTTGTCTGTTACTCATGAACAGATAACTACACTGGAGGACATGATG 965 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 723 TCCCTCAACAAAAGGTTGTCTGTTACTCATGAACAGATAACTACACTGGAGGACATGATG 782 Query 966 CGCAAAATTTTCACTGGGTTGTTTGTACACCGATATCGAGATATTGATAACGATATTCGG 1025 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 783 CGCAAAATTTTCACTGGGTTGTTTGTACACCGATATCGAGATATTGATAACGATATTCGG 842 Query 1026 ATGTCATGCATTCAGTCTCTGGGCATTTGGATTTTGTCTTATCCTTCTCTTTTCTTACAA 1085 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 843 ATGTCATGCATTCAGTCTCTGGGCATTTGGATTTTGTCTTATCCTTCTCTCTTCTTACAA 902 Query 1086 GATCTGTATTTAAAATATCTTGGATGGACGCTTAATGACAAAAATGCTGGAGTGAGGAAA 1145 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 903 GATCTGTACTTAAAATATCTTGGATGGACCCTTAATGACAAAAATGCTGGAGTGAGGAAA 962 Query 1146 GCTTCTCTATTGGCATTGCAAAAACTTTATGAAATGGATGAAAACGTCCCCACTCTTGGT 1205 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct 963 GCTTCTCTATTGGCATTGCGAAATCTTTATGAAACGGATGAAAACGTCCCCACGCTTGGT 1022 Query 1206 CTTTTCACTCAGAGATTTTCCAATCGAATGATCGAGATGGCTGATGATGTTGATATGTCT 1265 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1023 CTATTCACTGAGAGATTTTCCAATCGAATGATCGAGATGGCTGATGATGTTGATATGTCT 1082 Query 1266 GCAGCTGTATGTGCTATAGGGCTTGTAAAGCAACTGCTAAGACACCAGCTGATACCTGAT 1325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1083 GCAGCTGTATGTGCTATAGGGCTTGTAAAGCAACTGCTAAGACACCAGCTGATACCTGAT 1142 Query 1326 GATGACCTAGGCCCTTTGTACGATTTGCTTATTGATCAACCTCAAGAAATCAGACGTGCG 1385 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1143 GATGACCTAGGTCCTTTGTACGATTTGCTTATTGATCAACCTCAAGAAATCAGACGTGCG 1202 Query 1386 ATAGGAGAGTTAGTGTATGACCACTTGATCGCACAGAAGTTTAACAGTTCTCCGTCCAGT 1445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1203 ATAGGAGAGTTAGTGTATGACCACTTGATCGCACAGAAGTTTAACAGTTCTCCGTCCAGT 1262 Query 1446 CTTACAGGTCATGATGATTCTTCCTCTGAGATCCATATCTTCAGAATGTTACAAATATTA 1505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1263 CTTACAGGTCATGATGATTCTTCCTCTGAGATCCATATCTTCAGAATGTTACAAATATTA 1322 Query 1506 CGGGAGTTCTCCACAGATCCGATTTTATGTGTATATGTAATTGATGATGTTTGGGAGTAC 1565 |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1323 CGGGAGTTTTCCACAGATCCGATTCTAAGTGTTTATGTAATTGATGATGTTTGGGAGTAC 1382 Query 1566 ATGAAGGCCATGAAGGACTGGAAGTGTATCATCTCTATGCTTTTGGATCAGAATCCTCGA 1625 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1383 ATGAAGGCCATGAAGGACTGGAAGTGTATCATCTCTATGCTTTTGGATCAGAATCCTCGA 1442 Query 1626 ACTGGGTCTACTACTGACGAGGACTCGACAAACTTGATCAGACTTCTGTTTGTGTCAATC 1685 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1443 ACTGGGTCTACTACTGAGGAGGACTCGACAAACTTGATCAGACTTCTGTTTGCGTCAATC 1502 Query 1686 AGAAAGGCTGTCGGGGAGAAGATAATTCCTTCAACGGATAATCGAAAGCAGTATCACAGT 1745 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1503 AGAAAGGCTGTCGGGGAGAAGATAATTCCTTCAACGGATAATCGAAAGCAGTATCACAGT 1562 Query 1746 AAAGCTCAGCGAGAAATATTTGAAAACAACAGGAAAGACATAACTGTGGCCATGATGAAG 1805 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 1563 AAAGCTCAGCGAGAAATGTTTGAAAACAACAGGAAAGACATAACGGCGGCCATGATGAAG 1622 Query 1806 AATTATCCACAGCTTCTACGTAAATTCATGGCTGACAAAGCAAAAGTGTCATCTTTGGTC 1865 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1623 AATTATCCACAGCTTCTAAGTAAATTCATGGCTGACAAAGCAAAAGTGTCGTCTTTGGTT 1682 Query 1866 GAGATTATTATATTTATGAAACTTGAGCTCTATTCTCTTAAAAGACAGGAGCAGAGTTTT 1925 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1683 GAGATTATTATGTTTATGAAACTTGAGCTCTATTCTCTTAAAAGACAGGAGCAGAGTTTT 1742 Query 1926 AAAGCTGCCGTCCGACTCATAAAGGATGCTTTTTTCAAACACGGGGAGAAGGAAGCACTA 1985 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1743 AAGGCTGCCGTCCGACTCATAAAGGATGCTTTTTTCAAACACGGGGAGAAGGAAGCACTA 1802 Query 1986 AGATCTTGCGTCAAGGCTATAACATTTTGTGCGTCAGAAAGTAAAGGGGAGCTTCAAGAT 2045 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1803 AGATCTTGCGTCAAGGCTATAACATTTTGTGCATCAGAGAGTAAAGGGGAGCTTCAAGAT 1862 Query 2046 TTTTCACGTGGGAAGCTTAAAGATCTTGAAGATGAGCTTTTAGATAAGATCACTTCTGCA 2105 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1863 TTTTCCCGTGGGAAGCTTAAAGATCTTGAAGATGAGCTTTTAGATAAGCTCACTTCTGCA 1922 Query 2106 ATTAGAGAAGTCAAGGATGGAAATGATGAATACTCCCTCCTAGTAAATCTGAAAAGGTTG 2165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 1923 ATTAGAGAAGTCAAGGATGGAAATGATGAATACTCCCTCCTTGTCAATCTGAAAAGGTTG 1982 Query 2166 TATGAGCTTCAATTGTCAAAGCCTGTGCTTGTTGAGAGCATGTTCGATGAGATTGCTTTG 2225 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1983 TATGAGCTTCAATTGTCCAAGCCTGTGCTTGTTGAGAGCATGTTCGATGAGATTGCTTTG 2042 Query 2226 ACGCTCCATAATTTCAGAAATTTGGACGAAGAGGTTATCTGTTTCCTGCTTCTGAATATG 2285 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct 2043 ACGCTCCATAATTTCAGAAATTTGGACGAAGAGGTTATCTGTTTCCTGCTTATCAATATG 2102 Query 2286 CACATGTATTTGGCGTGGTATCTGCACTCCATCATAAATTGTGAAGCTATCTCTGAAGCT 2345 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2103 TACATGTATTTGGCGTGGTCTCTGCACTCCATCATAAATTGTGAAGCTATCTCCGAAGCT 2162 Query 2346 TCCTTATCTTCCCTTATATCAAAGCGTGATACCCTGTTTGAGGAGCTTTCGTACTTCCTG 2405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2163 TCCTTATCTTCCCTTATATCAAAGCGTGATACCCTGTTTGAGGAGCTTTCGTACTTCCTG 2222 Query 2406 AATGGAATTGAGGAATCGAAGAAATATGGTAATCAGCTATCGAACAGGATCTGTGCTATA 2465 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2223 AATGGAATTGAGGAATCGAGGAAATATGGTAATCAGCTATCGCTCAGGATCTGTGCTATA 2282 Query 2466 CTCGCCGAAACATGGTGTTTGTTTAGAAAGTCAAATTATGACTCGGGTAAACTTGAAAGA 2525 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2283 CTTGCCGAAACATGGTGTTTGTTTAGAAAGTCAAATTATGACTCGAGTAAACTTGAAAGA 2342 Query 2526 TTAGGATACTGTCCCGACAGTGTCTTTCTTGAGAAATTTTGGAAACTCTGTGCAGAAATG 2585 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2343 TTAGGATACTGTCCCGACAGTGTCTTTCTTGAGAAATTTTGGAAACTCTGTGCAGAAATT 2402 Query 2586 TTTAACACTTCAGATGAGACCGATGAGGAGGATGAAAATAAGGAATACATTGAAGAGACA 2645 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2403 TTTAACACTTCAGATGAGACTGATGAGGAGGATGAAAATAAGGAATACATTGAAGAGACA 2462 Query 2646 AACAGAGATGTTTCAGTCATTGCTGCCTGCAAGTTGGTTGCTAGTGATGTGGTTCCAAAG 2705 |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||||| Sbjct 2463 AACAGAGATGTTGCGGTCATTGGTGCCTGCAAGTTGGTTACCAGTGATGTAGTGCCAAAG 2522 Query 2706 GATTATCTAGGACCAGAGATCATATCGCATCTTGGTATGCATGGACCTGGTGTAACAGGC 2765 |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2523 GATTATCTAGGACCAGAGATAATATCGCATTTTGGTATGCATGGACCTGGTGTGACAGGC 2582 Query 2766 ATCATAAAGAATCTTATTACATTCTTAAGGAAAAAAGAAGATGACATCTCTAATATCTAT 2825 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2583 ATCATAAAGAATCTTATTACATGCTTAAGGAAAAAAGAAGATGACATCTCTAATATCTAT 2642 Query 2826 CTCGAATCCTTGAAACGGGCCTATCACCGGTATTCAAGTGAACTTTCTAGTGGC-CGTGA 2884 || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| Sbjct 2643 CTGGAATCCTTGAAAAGGGCCTATCACCGGTATTCAAGTGAAGTTTCTAGTGGCTC-TGA 2701 Query 2885 AGAATCCAGAGTAGATAAATGTCTTGAAGAGTGGCGGGAGCTTGCAGGTGGGCTCTCAGG 2944 ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2702 AGAATCCAGAGTAGAGAAATGTCTTGAAGTGTGCCGGGAGCTTGCAGGTGGGCTCTCAGG 2761 Query 2945 AATGTATATCGGGGCTGCGCGCAACAAATACAGATTGGAGATATTGAGTGTGGTGAAGGA 3004 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 2762 AATGTATATCGGGGCTGCGCGCAACAAATACAGATTGGAGATTTTGAGTGTGGTCAAGGA 2821 Query 3005 AGGTGTTGAGTTTGCTTTTAGGGACGCCCCAAAGCAACTGTTGTTTCTGGAAGTTGCTAT 3064 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2822 AGGTGTTGAGTTTGCTTTTAGGGACGCCCCAAAGCAACTGTTGTTTCTGGAAGTTGCTAT 2881 Query 3065 CCTTCCATTTGCAACCAGACTCTCAGTGTCTGACATCATTGACATTAAGAAGGACGTTCA 3124 ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2882 CCTTCCATTTGCAACCAGACTTTCAGTGCCTGACATCATTGACATTAAGAAGGACGTTCA 2941 Query 3125 GGGGCGTATAGTGCATGTTAATACAGACGAAGATCCCAGTGGATGGCGTCCTTGCTTCAC 3184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2942 AGGGCGTATAGTGCATGTTAATACAGACGAAGATCCCAGCGGATGGCGTCCTTGCTTCAC 3001 Query 3185 CTTCTTGGAAACCTTGGAGGAGAAATGCTTGAAAAACGAGGATTTACAAGACGACAAGGA 3244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3002 CTTCTTGGAAACCTTGGAGGAGAAATGCTTGAAAAACGAGGATTTACAAGACGACAAGGA 3061 Query 3245 AGCAGCAAATGTAAGACGCAGGGGACGGCCAAGAAAACGTCCGGAAACAGAGCGAAAGAG 3304 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3062 AGCAGCAACTGTAAGACGCAGGGGACGGCCAAGAAAACGTCCGGAAACAGAGCGAAAGAG 3121 Query 3305 ACTGTTTGATGAGCAAAGTGGAAGCGATGAGGATGAGTCTATTAGTGGCGGGTCAGACAG 3364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3122 ACTGTTTGATGAGCAAAGTGGAAGCGATGAGGATGAGTCTATTAGTGGTGGGTCAGACAG 3181 Query 3365 AGAAGATAAGCTCGACGAGGACGCTCCTCTAATCGAGACAATTAGATCGGCTGCCAGACG 3424 |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3182 AGAAGATAAGCTAGATGAGGACGCTCCTCTAATCGAGACGATTAGATCGGCTGCCAGACG 3241 Query 3425 GAAAGCGCTCAAGGGTGAACGGTCCAAGGGACACTGACGACGGGTAAAACATTTATCAAT 3484 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 3242 GAAAGCGCTCAGGGGTGAACGGTCCAAGGGACACTGACG--GG-TAAAACATTTATCAAT 3298 Score = 93.5 bits (50), Expect = 1e-17 Identities = 54/56 (96%), Gaps = 0/56 (0%) Strand=Plus/Plus Query 160 ACACCATGGAAGACAGTCCTCAAGGCCTTAAAAGGAGTAGAGATCCGGATCAGGAT 215 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 16 ACACCATGGAAGACAGTCCTCAAGGCCTAAAAAGGAGTAGAGATCGGGATCAGGAT 71 > Ahg944576 jgi|Araly1|944576|scaffold_700805.1 Length=3041 Score = 4621 bits (2502), Expect = 0.0 Identities = 2763/2891 (96%), Gaps = 9/2891 (0%) Strand=Plus/Plus Query 308 CGATTTCCAGGAAACCCGTCCCAAGCCCAAGCGTAGTCGCACCCA---TCCTCCTCAACA 364 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 101 CGATTTCCAGGAAACCCGTCCCAAGCCCAAGCGTAGTCGCACCCATCCTCCTCCTCAACA 160 Query 365 GAATCTCATTGAGGTTGTCAAAGGCAACGGGGATCTTATTTCTAAAGCCGTCAAGATTTG 424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 161 GAATCTCATTGAGGTTGTCAAAGGCAACGGGGATCTTATTTCTAAAGCCGTCAAGATTTG 220 Query 425 GGTTGAAAGATATGAAGACTCTCCCAGCCTTGCTACCACTGAGCTCTTGTCAATGCTCTT 484 |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 221 GGTTGAAAGATATGAACACTCTCCCAGACTTGCCACCACTGAGCTCTTGTCAATGCTCTT 280 Query 485 TCAGGCTTGCGGTGCTAAATACTCCATCAAGGATGATCTGCTTGATGAGACTGATGTCGA 544 ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | Sbjct 281 TCAGGCTTGCGGTGCTAAACACTCCATCAAGGAAGATCTGCTTGATGAGACTGATGTCCA 340 Query 545 TGATGTTGTCGTTTCCCTTGTTAATCTTGCTAG-AGCCGGGGAACTCGAAGATTATCAGA 603 |||||||||| || || |||||||| || | | |||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 341 TGATGTTGTCATTGCCTTTGTTAATAGTGAT-GAAGCCGGGGAAGTTGAAGATTATCAGA 399 Query 604 GTTCCAGAAAGAAGGAACTCAAGAACTTCAAAGAAAATCTTGTTTCCTTCTGGAATAATC 663 ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct 400 GTTGGAGAAACAAGGCTCTCAACAACTTCAAAGAAAATCTTGTTTCTTTCTGGAATTATC 459 Query 664 TCATTATCGAGTGCCAAAACGGACCATTGTTTGAT-AGAGTCTTGTTCGACAAGTGCATG 722 | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||| Sbjct 460 TGATTATCGAGTGCCAACACGGGCCATTGTTTGATCA-ACTCTTGTTCGACAAGTGCATG 518 Query 723 GACTACATTATCGCACTGTCATGTACTCCACCCAGAGTTTACCGTCAAACTGCCACGCTA 782 |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 519 GACTACATAATCGCACTGTCATGTACTCGACCTAGATTTTACCGTCAAACTGCCACGCTA 578 Query 783 ATGGGCCTCCAACTAGTCACATCTTTCATTTCTGTTGCAAACACACTCGGTTCACAGCGA 842 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 579 ATGGGCCTCCAACTAGTTACATCTTTCATTTCTGTTGCAAACGCACTCGGTTCACAGCGA 638 Query 843 GAAACCACCCAAAGACAATTGAATGCTGAAAGCAAGAAGAGAGCTGACGGCCCTCGTGTG 902 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 639 CAAACCACCCAAAGACAATTGAATGCTCAAAGCAAGAAGAGAGCTGACGGGCCTCGTGTG 698 Query 903 GACTCCCTCAACAAAAGGTTGTCTGTTACTCATGAACAGATAACTACACTGGAGGACATG 962 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 699 GACTCCCTCAACAAAAGGTTGTCTGTTACTCATGAACAGATAACTACACTGGAGGGCATG 758 Query 963 ATGCGCAAAATTTTCACTGGGTTGTTTGTACACCGATATCGAGATATTGATAACGATATT 1022 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 759 ATGCGAAAAATTTTCACTGGGTTGTTTGTACACCGATATCGAGATATTGATAACGATATT 818 Query 1023 CGGATGTCATGCATTCAGTCTCTGGGCATTTGGATTTTGTCTTATCCTTCTCTTTTCTTA 1082 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 819 CGGATGTCATGCATTCAGTCTCTCGGCATTTGGATTTTGTCTTATCCTTCTCTTTTCTTA 878 Query 1083 CAAGATCTGTATTTAAAATATCTTGGATGGACGCTTAATGACAAAAATGCTGGAGTGAGG 1142 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 879 CAAGATCTGTACTTAAAATATCTTGGATGGACGCTTAATGACAAAAACGCTGGAGTGAGG 938 Query 1143 AAAGCTTCTCTATTGGCATTGCAAAAACTTTATGAAATGGATGAAAACGTCCCCACTCTT 1202 |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct 939 AAAGCTTCTCTATTGGCATTGCGAAGACTTTATGAAACGGATGAAAACGTCCCCACGCTT 998 Query 1203 GGTCTTTTCACTCAGAGATTTTCCAATCGAATGATCGAGATGGCTGATGATGTTGATATG 1262 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| Sbjct 999 GGTCTATTCACTCAGAGATTTTCCAATCGAATGATCAAGATGGGTGTTGATGTTGATATG 1058 Query 1263 TCTGCAGCTGTATGTGCTATAGGGCTTGTAAAGCAACTGCTAAGACACCAGCTGATACCT 1322 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1059 TCTGCAGCTGTATGTGCTATAGGGCTTGTAAAGCAACTGCTAAGACAACAGCTGATACCT 1118 Query 1323 GATGATGACCTAGGCCCTTTGTACGATTTGCTTATTGATCAACCTCAAGAAATCAGACGT 1382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1119 GATGATGACCTAGGCCCTTTGTACGATTTGCTTATTGATCAACCTCAAGAAATCAGACGT 1178 Query 1383 GCGATAGGAGAGTTAGTGTATGACCACTTGATCGCACAGAAGTTTAACAGTTCTCCGTCC 1442 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1179 GCGATAGGAGAGTTAGTGTATGACCACTTGATCACACAGAAGTTTAACACTTCTCCGTCC 1238 Query 1443 AGTCTTACAGGTCATGATGATTCTTCCTCTGAGATCCATATCTTCAGAATGTTACAAATA 1502 ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1239 AGTCTTACAGGTCCTGGTGATTTTTCCTCTGAGATCCATATCTTCAGAATGTTACAAATA 1298 Query 1503 TTACGGGAGTTCTCCACAGATCCGATTTTATGTGTATATGTAATTGATGATGTTTGGGAG 1562 ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1299 TTACGGGAGTTCTCCACAGATACGATTATAAGTGTTTATGTAATTGATGGTGTTTGGGAG 1358 Query 1563 TACATGAAGGCCATGAAGGACTGGAAGTGTATCATCTCTATGCTTTTGGATCAGAATCCT 1622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1359 TACATGAAGGCCATGAAGGACTGGAAGTGTATCATCTCTATGCTTTTGGATCAGAATCCT 1418 Query 1623 CGAACTGGGTCTACTACTGACGAGGACTCGACAAACTTGATCAGACTTCTGTTTGTGTCA 1682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1419 CAAACTGGGTCTACTACTGACGAGGACTCGACAAACTTGATCAGACTTCTGATTGTGTCA 1478 Query 1683 ATCAGAAAGGCTGTCGGGGAGAAGATAATTCCTTCAACGGATAATCGAAAGCAGTATCAC 1742 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1479 ATCAGAAAGGCTGTCGGGGAGAAGACAATTCCTTCAACGGATAATCGAAAGCAGTATCAC 1538 Query 1743 AGTAAAGCTCAGCGAGAAATATTTGAAAACAACAGGAAAGACATAACTGTGGCCATGATG 1802 | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 1539 ACTAAAGCTCAGCGAGAAATGTTTGAAAACAACAGGAAAGACATAACGGCGGCCATGATG 1598 Query 1803 AAGAATTATCCACAGCTTCTACGTAAATTCATGGCTGACAAAGCAAAAGTGTCATCTTTG 1862 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1599 AAGAATTATCCACAGCTTCTACGTAAATTCATGGCTGACAAAGCAAAAGTGTCGTCTTTG 1658 Query 1863 GTCGAGATTATTATATTTATGAAACTTGAGCTCTATTCTCTTAAAAGACAGGAGCAGAGT 1922 || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1659 GTTGAGATTATTATGTTTATGAAACTTGAGCTCTATTCTCTTAAAAGACAGGAGCAGAGT 1718 Query 1923 TTTAAAGCTGCCGTCCGACTCATAAAGGATGCTTTTTTCAAACACGGGGAGAAGGAAGCA 1982 ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 1719 TTTAAGGCTGCCGTCCGACTCATAATTGATGCTTTTTTCAAACACGGGGAAAAAGAAGCA 1778 Query 1983 CTAAGATCTTGCGTCAAGGCTATAACATTTTGTGCGTCAGAAAGTAAAGGGGAGCTTCAA 2042 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1779 CTAAGATCTTGCGTCAAGGCTATAACATTTTGTGCGTCAGAAAGTAAAGGGGAGCTTCAA 1838 Query 2043 GATTTTTCACGTGGGAAGCTTAAAGATCTTGAAGATGAGCTTTTAGATAAGATCACTTCT 2102 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | Sbjct 1839 GATTTTTCCCGTGGGAAGCTTAAAGATCTTGAAGATGAGCTTTTAGATAAGCTCACTTGT 1898 Query 2103 GCAATTAGAGAAGTCAAGGATGGAAATGATGAATACTCCCTCCTAGTAAATCTGAAAAGG 2162 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1899 GCAATTAGAGAAGTCAAGGATGGAAATGATGAATACTCCCTCCTTGTAAATCTGAAAAGG 1958 Query 2163 TTGTATGAGCTTCAATTGTCAAAGCCTGTGCTTGTTGAGAGCATGTTCGATGAGATTGCT 2222 ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 1959 TTGCATGAGCTTCAATTGTTAAAGCCTGTGCTTGTTGAGAGCATGTTCCATGGGATTGCT 2018 Query 2223 TTGACGCTCCATAATTTCAGAAATTTGGACGAAGAGGTTATCTGTTTCCTGCTTCTGAAT 2282 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2019 TTGACGCTCCGCAATTTCAGAAATTTGGACGAAGAGGTTATCTGTTTCCTGCTTATGAAT 2078 Query 2283 ATGCACATGTATTTGGCGTGGTATCTGCACTCCATCATAAATTGTGAAGCTATCTCTGAA 2342 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2079 ATGTACATGTATTTGGCGTGGTCTCTGCACTCCATCATAAATTGTGAAGCTATCTCCGAA 2138 Query 2343 GCTTCCTTATCTTCCCTTATATCAAAGCGTGATACCCTGTTTGAGGAGCTTTCGTACTTC 2402 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2139 GCTTCCTTATCTTCCCTTATATCAAAGCGTGATACTCTGTTTGAGGAGCTTTCGTACTTC 2198 Query 2403 CTGAATGGAATTGAGGAATCGAAGAAATATGGTAATCAGCTATCGAACAGGATCTGTGCT 2462 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2199 CTGAATGGAATTGAGGAATCGAAGAAATATGGTAATCAGCTATCGCTCAGGATCTGTGCT 2258 Query 2463 ATACTCGCCGAAACATGGTGTTTGTTTAGAAAGTCAAATTATGACTCGGGTAAACTTGAA 2522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2259 ATACTCGCCGAAACATGGTGTTTGTTTAGAAAGTCAAATTATGACTCGAGTAAACTTGAA 2318 Query 2523 AGATTAGGATACTGTCCCGACAGTGTCTTTCTTGAGAAATTTTGGAAACTCTGTGCAGAA 2582 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2319 AGATTAGGATACTGTCCCGACAGTGTCTTTCTTGAGAAATTTTGGATACTCTGTGCAGAA 2378 Query 2583 A-TGTTTAACACTTCAGATGAGACCGATGAGGAGGATGAAAATAAGGAATACATTGAAGA 2641 | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| Sbjct 2379 ACT-TTTAGCACTTCAGATGAGACCGATGAGGAGGATGAAAATATGGAATACGTTGAAGA 2437 Query 2642 GACAAACAGAGATGTTTCAGTCATTGCTGCCTGCAAGTTGGTTGCTAGTGATGTGGTTCC 2701 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 2438 GACAAACAGAGATGTTGCAGTCATTGCTGCCTGCAAGTTGGTTGCTAGTGATGTAGTGCC 2497 Query 2702 AAAGGATTATCTAGGACCAGAGATCATATCGCATCTTGGTATGCATGGACCTGGTGTAAC 2761 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2498 AAAGGATTATCTAGGACCAGAGATAATATCGCATCTTGGTATGCATGGACCTGGTGTAAC 2557 Query 2762 AGGCATCATAAAGAATCTTATTACATTCTTAAGGAAAAAAGAAGATGACATCTCTAATAT 2821 |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2558 AGGCATCATAAAGAATCTTATTACATGCTTAAGCAAAAAAGAAGATGACATCTCTAATAT 2617 Query 2822 CTATCTCGAATCCTTGAAACGGGCCTATCACCGGTATTCAAGTGAACTTTCTAGTGGCCG 2881 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2618 CTATCTGGAATCCTTGAAAAGGGCCTATCACCGGTATTCAAGTGAACTTTCTAGTGGCCG 2677 Query 2882 TGAAGAATCCAGAGTAGATAAATGTCTTGAAGAGTGGCGGGAGCTTGCAGGTGGGCTCTC 2941 |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct 2678 TGAAGAATCCAGAGTAGATAAATGTCTTCAAGTGTGTCGGGAGCTTGCATGTGGGCTCTC 2737 Query 2942 AGGAATGTATATCGGGGCTGCGCGCAACAAATACAGATTGGAGATATTGAGTGTGGTGAA 3001 || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || Sbjct 2738 AGAAATGTATATAGGGGCTGCTTGCAACAAGTACAGATTGGAGATTTTTAGTGTGGTCAA 2797 Query 3002 GGAAGGTGTTGAGTTTGCTTTTAGGGACGCCCCAAAGCAACTGTTGTTTCTGGAAGTTGC 3061 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2798 GGAAGGTGTTGAGTTTGCTTTTAGGGACGCCCCAAAGCAACTGTTGTTTCTGGAAGTTGC 2857 Query 3062 TATCCTTCCATTTGCAACCAGACTCTCAGTGTCTGACATCATTGACATTAAGAAGGACGT 3121 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2858 TATCCTTCCATTTGCAACCAGACTCTCAGTGCCTGACATCATTGACATTAAGAAGGACGT 2917 Query 3122 TCAGGGGCGTATAGTGCATGTTAATACAGACGAAGATCCCAGTGGATGGCGTCCTTGCTT 3181 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2918 TCAAGGGCGTATAGTGCATGTTAATACAGACGAAGATCCCAGCGGATGGCGTCCTTGCTT 2977 Query 3182 CACCTTCTTGG 3192 ||||||||||| Sbjct 2978 CACCTTCTTGG 2988 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 137654241541 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5