BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G48060.1
Length=7984
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg322444 jgi|Araly1|322444|fgenesh1_pm.C_scaffold_4002501 7640 0.0
Ahg322445 jgi|Araly1|322445|fgenesh1_pm.C_scaffold_4002502 3227 0.0
Ahg483994 jgi|Araly1|483994|fgenesh2_kg.4__3054__AT2G48040.1 1188 0.0
Ahg951560 jgi|Araly1|951560|scaffold_803447.1 139 3e-31
Ahg951802 jgi|Araly1|951802|scaffold_17700001.1 122 3e-26
> Ahg322444 jgi|Araly1|322444|fgenesh1_pm.C_scaffold_4002501
Length=4422
Score = 7640 bits (4137), Expect = 0.0
Identities = 4296/4375 (98%), Gaps = 2/4375 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2137 ATGTACCGATCGTGTGGAACATACATTGCTTTCATCACTATTCTCATAAGTGTATACCTG 2196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTACCGATCGTGTGGAACATACATTGCTTTCATCACTATTCTCATAAGTGTATACCTG 60
Query 2197 GTCAAACCCAATTATGTATCATTTGGATATATTTTCCTTCTCTTGCTCTGGATTACTGGA 2256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTCAAACCCAATTATGTATCATTTGGATATATTTTCCTTCTCTTGCTCTGGATTACTGGA 120
Query 2257 AGACAACTGTTTGAAGAAACTAAGAGACGCTTGTGGTTCCCTTTGAAAGCATATGCAGTT 2316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGACAACTGTTTGAAGAAACTAAGAGACGCTTGTGGTTCCCTTTGAAAGCATATGCAGTT 180
Query 2317 TTGGTGTTTATGTTTATCTACTGCTTAAGTAGCTTTGTCAGCTTGCAGCTTTGGTTATCT 2376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTGGTGTTTATGTTTATCTACTGCTTAAGTAGCTTTGTCAGCTTGCAGCTTTGGTTATCT 240
Query 2377 GGATTTATTGATCTCTACTTTTATTTGGGTTACAACTCTAAAGCCCCATTGCTGGATAAT 2436
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GGATTCATTGATCTCTACTTTTATTTGGGTTACAACTCTAAAGCCCCATTGCTGGATAAT 300
Query 2437 GTCTGGGAATCTCTTGCTGTGTTGATCGTGATGCAACTTTACAGCTATGAAAGGAGGCAG 2496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTCTGGGAATCTCTTGCTGTGTTGATCGTGATGCAACTTTACAGCTATGAAAGGAGGCAG 360
Query 2497 AGTGGACACTACATTCCAGGTCAATCTAGTTTGCTTCATCCTGGGGtttttggatttttt 2556
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 361 AGTGGACACTACGTTCCAGGTCAATCTAGTTTGCTTCATCCTGGAGTTTTTGGTTTTTTT 420
Query 2557 gagagatttttGGCATGGCATGGTCAGAAGATCTTGTTCGCGGCATTGTTTTATGCATCA 2616
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAGAGATTTTTGGTATGGCATGGTCAGAAGATCTTGTTCGTGGCATTGTTTTATGCATCA 480
Query 2617 TTGTCTCCGATTAGTGTGTTTGGATTTGTATATCTCCTTGGCCTTGTCATCTGCACAACC 2676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTGTCTCCGATTAGTGTGTTTGGATTTGTATATCTCCTTGGCCTTGTCATCTGCACAACC 540
Query 2677 TTCCCAAAGTCTTCTTCAATACCATCCAAATCATTCTTGATTTATACTGGATTTCTGGTG 2736
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 541 TTCCCAAAGTCTTCTTCAATACCATCCAAATCATTCTTGATTTATACTGGATTTCTAGTG 600
Query 2737 TCTGCGGAGTATCTTTTCCAATTGTGGGGGATGCAAGCTCAGATGTTCCCTGGGCAAAAA 2796
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TCTGCGGAGTATCTTTTCCAACTGTGGGGCATGCAAGCTCAGATGTTCCCTGGGCAAAAA 660
Query 2797 TATGCTGAGTTGTCTTTCTACTTGGGGCTTCGAGTATATGAACCTGGATTTTGGGGTATA 2856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TATGCTGAGTTGTCTTTCTACTTGGGGCTTCGAGTATATGAACCTGGATTTTGGGGTATA 720
Query 2857 GAATCAGGTCTACGAGGAAAAGTGCTGGTTGTTGCAGCCTGTACTCTGCAGTACAATGTA 2916
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GAATCAGGTCTACGAGGAAAAGTGCTGGTTGTTGCTGCCTGTACTCTGCAGTACAATGTA 780
Query 2917 TTTCGTTGGCTAGAAAGAACATCTGGTTTAACTGTTATCAAAGGAAAATATGAAGAGCCG 2976
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TTTCGTTGGCTAGAAAGAACACCTGGTTTAACTGTTATCAAAGGAAAATATGAAGAGCCG 840
Query 2977 TGTCCACTTTTTGTCTCTGCAGAAGACACTACTGCAAGTGTTTCCAGTTCTAATGGTGAA 3036
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TGTCCACTATTTGTCTCTGCAGAAGACACTACTGCAAGTGTTTCCAGTTCTAATGGTGAA 900
Query 3037 AATCCATCTTCGACTGATCATGCTTCTATATCAATGAAACAAGGCGAGGCAACGAGTAAC 3096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AATCCATCTTCGACTGATCATGCTTCTATATCAATGAAACAAGGCGAGGCAACGAGTAAC 960
Query 3097 TCATGGCCTTTCTTCTCTCCCCGTGGTAACCAGGGAGCTGGTTTTTTGCACCCCAAGACT 3156
|||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCATGGCCTTTCTTCTCTCCCCATGATAATCAGGGAGCTGGTTTTTTGCACCCCAAGACT 1020
Query 3157 GGAGGCTCTGAAAGTGGCAGTAGTAGGAAATTTTCATTTGGTCACTTCTGGGGAAGTATC 3216
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1021 GGAGGCTCTGAAAGTGGCAGTAGTAGGAAATTTTCATTTGGTCACTTCTGGGGAAGCATC 1080
Query 3217 AAAGAGAGTCACAGGTGGAACAGGAGGAGAATTCTTGCATTGAAGAAGGAGAGGTTCGAA 3276
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1081 AAAGAGAGTCACAGGTGGAACAGGAGGAGAATTCTTGCATTGAAGAAGGAGAGGTTTGAA 1140
Query 3277 ACACAGAAGAATCTGTTGAAAATTTACTTGAAGTTTTGGATAGAGAATATGTTTAATCTC 3336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 ACACAGAAGAATCTGTTGAAAATTTACTTGAAGTTTTGGATAGAGAATATGTTTAATCTC 1200
Query 3337 TATGGCCTTGAGATAAACATGATTGCGCTGCTTCTTGCGAGTTTTGCTTTGCTGAATGCC 3396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TATGGCCTTGAGATAAACATGATTGCGCTGCTTCTTGCGAGTTTTGCTTTGCTGAATGCC 1260
Query 3397 ATCTCCATGGTATATATTGCACTGCTTGCTGCATGTGTCCTCTTGAGAAGACGTGTAATT 3456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1261 ATCTCCATGGTATATATTGCACTGCTTGCTGCATGTGTCCTCTTGAGAAGACGCCTAATT 1320
Query 3457 CAGAAACTATGGCCTGTTGTTGTTTTTCTGTTTGCATCAATTCTCGCAATTGAGTATGTT 3516
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1321 CAGAAACTATGGCCTGTCGTTGTTTTTCTGTTTGCATCAATTCTTGCAATTGAGTACGTT 1380
Query 3517 GCCACATGGAATAGTTTTTTGCCTTCAGATCAGGCTCCAAGTGAAACTAGTGTGCATTGC 3576
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GCCACATGGAATAGCTTTTTGCCTTCAGATCAGGCTCCAAGTGAAACTAGTGTGCATTGC 1440
Query 3577 CATGACTGCTGGAGTATCGCAGCTCTCTACTTTAAATTTTGCCGGGAGTGTTGGCTTGGA 3636
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CATGACTGCTGGAGTATTGCAGCCCTCTACTTTAAATTTTGCCGGGAGTGTTGGCTTGGA 1500
Query 3637 GTGAGAGTGGACGACCCCCGGACTCTTATTAGCTATTTTGTGGTATTCATGCTTGCCTGT 3696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GTGAGAGTGGACGACCCCCGGACTCTTATTAGCTATTTTGTGGTATTCATGCTTGCCTGT 1560
Query 3697 TTCAAACTTCGGGCTGATCACATATCCAGTTTCTCTGAGTCATCGACATATCATCAGATG 3756
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 TTCAAACTTCGGGCTGATCACATATCCAGTTTCTCAGAGTCATCGACATATCATCAGATG 1620
Query 3757 AAGTCTCAAAGAAAGAATTCATTTGTCTGGAGAGATCTCTCCTTCGAGACAAAAAGCATG 3816
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1621 AAGTCTCAAAGAAAGAACTCATTTGTCTGGAGAGATCTCTCCTTCGAGACAAAGAGCATG 1680
Query 3817 TGGACTGTGCTTGATTACCTGAGGCTATATTGTTATGTCCATCTGCTGGATGTTGTGCTT 3876
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 TGGACTGTGCTTGATTACCTGAGGCTTTATTGTTATGTCCATCTGCTGGATGTTGTGCTT 1740
Query 3877 ATTCTGATTCTAATCACAGGAACTCTTGAGTATGACATTCTACACCTGGGTTATCTTGCA 3936
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 ATTCTGATTTTAATCACAGGAACTCTTGAGTATGACATTCTACACCTGGGTTATCTTGCA 1800
Query 3937 TTCGCTCTTGTTTTTGCCCGAATGAGACTTGAAATACTGAAGAAGAAAAACAAAATATTC 3996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 TTCGCTCTTGTTTTTGCCCGAATGAGACTTGAAATACTGAAGAAGAAAAACAAAATATTC 1860
Query 3997 AGGTTCTTGCGGGTGTACAATTTTGTTCTCATCATCTTTTCTCTCGCATATCAGTCTCCA 4056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 AGGTTCTTGCGGGTGTACAATTTTGTTCTCATCATCTTTTCTCTCGCATATCAGTCTCCA 1920
Query 4057 TTTGTTGGAAACTTCAATGATGGAAAATGTGAAACGGTTGATTATATATACGAGGTGATT 4116
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 TTTGTTGGAAACTTCAATGATGGAAAATGTGAAACCGTTGATTATATATACGAGGTGATT 1980
Query 4117 GGATTTTACAAGTATGACTATGGGTTTCGAATCACTGCAAGATCTGCTCTCGTTGAGATC 4176
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 GGATTTTACAAGTATGACTATGGATTTCGAATCACTGCAAGATCTGCTCTCGTTGAGATC 2040
Query 4177 ATCATATTTATGCTAGTATCTCTTCAGTCCTACATGTTTTCCTCCCAGGAGTTTGATTAT 4236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 ATCATATTTATGCTAGTATCTCTTCAGTCCTACATGTTTTCCTCCCAGGAGTTTGATTAT 2100
Query 4237 GTGTCGCGGTATCTTGAAGCAGAGCAAATCGGTGCTATTGTGCGGGAGCAAGAGAAGAAA 4296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 GTGTCGCGGTATCTTGAAGCAGAGCAAATCGGTGCTATTGTGCGGGAGCAAGAGAAGAAA 2160
Query 4297 GCAGCACGGAAGACCGAGCAACTGCAACAAATTCGTGAGGCTGAGGaaaaaaaaaGGCAG 4356
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2161 GCAGCACGGAAGACCGAGCAACTGCAACAAATTCGTGAGGCTGAGGAAAAAAAACGGCAG 2220
Query 4357 CGAAATTTGCAGGTGGAAAAGATGAAATCTGAAATGCTGAACCTACGTGTACAGCTTCAC 4416
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 2221 CGGAATTTGCAGGTGGAAAAGATGAAATCTGAAATGCTGAACCTGCGGGTACAGCTTCAC 2280
Query 4417 AGAATGAATTCTGATTCTAATTTTGGAGTTGCTTCTCCGCGCACTGAAGGTCTAAGAAGG 4476
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 AGAATGAATTCTGATTCTAATTTTGGAGTCGCTTCTCCGCGCACTGAAGGTCTAAGAAGG 2340
Query 4477 AGGAAGAGTCCGTATCTAATTCCAGATAGTGGTGCAGCCAGTCCTGAGATTGACGGAGTG 4536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 AGGAAGAGTCCGTATCTAATTCCAGATAGTGGTGCAGCCAGTCCTGAGATTGACGGAGTG 2400
Query 4537 GTCCACAGGAAAGAAGAGCAGCCTATTGACGAGGATTCACAGTATCCTTTTGAAGCGCAT 4596
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 GTCCACAGGAAAGAAGAGCAGCCTATTGACGAGGAGTCACAGTATCCTTTTGAAGCGCAT 2460
Query 4597 GAGTTTCCAGTGAGTACCACTCCAGAAGCACTAGATTCTCCAGAGTAT-TCATTTGGAGC 4655
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 2461 GAGTTTCCAGTGAGTACCACTCCAGAAGCACTAGATTCTCCAGAGTATAT-ATTTGGAGC 2519
Query 4656 ATCTCCTTGTGAGATAACTGAAGTTCAACAGGATCTTGATGTGATGTCTATGGAACGTGA 4715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2520 ATCTCCTTGTGAGATAACTGAAGTTCAACAGGATCTTGATGTGATGTCTATGGGACGTGA 2579
Query 4716 AAGAAAGCAAAAGTCTGAGGGAAAGGAGAATCCATTAATTTCTGCGGTGCAACTCATCGG 4775
||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 AAGAAAGGAAAAGTCCGAGGGAAAGGAGAATCCGTTGATTTCTGCGGTGCAACTCATCGG 2639
Query 4776 TGATGGTGTTTCCCAGGTACAGTTTATTGGAAATCAGGCAGTAAATAACCTTGTGAATTT 4835
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 TGATGGTGTTTCCCAGGTACAATTTATTGGAAATCAGGCAGTAAATAACCTTGTGAATTT 2699
Query 4836 CTTAAACATCTCGCCGGAAAATTCAGATACAAATGAGCAGTCTTCTGTTGATGATGAGGT 4895
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2700 CTTAAACATATCGCCGGAAAATTCAGATACAAATGAGCAGTCTTCTGTTGATGATGATGT 2759
Query 4896 GTATGATGAAATGGAAAGTCAGAAAAGAAAACACACACCTTTCGAACGGTCAACATCTCT 4955
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2760 GTATGATGAAATGGAAAGTCAGAAAAGAAAACACACGCCTTTCGAACGGTCAACATCTCT 2819
Query 4956 ACAATCTGACAGGAGTAGTGATGGCACTAGTTTTCAGATAGGAAGGATCTTTCGTCATAT 5015
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 ACAATCTGACAGGAGTAGTGATGGCACTAGCTTTCAGATAGGAAGGATCTTTCGTCATAT 2879
Query 5016 ATGGTCTAGGATGCAGTCCAATAACGATATTGTTTGCTATTGCTGCTTCATTATTGCGTT 5075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 ATGGTCTAGGATGCAGTCCAATAACGATATTGTTTGCTATTGCTGCTTCATTATTGCGTT 2939
Query 5076 TCTCTGGAATTTCAGTCTTCTTTCCATGGTCTATCTAGCAGCACTGTTCCTATACGCCCT 5135
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2940 TCTCTGGAATTTCAGTCTTCTTTCCATGGTCTATCTAGCAGCACTGTTCCTATATGCCCT 2999
Query 5136 CTGCGTTCACACTGGCCCTACTCACATCTTCTGGGTCATCATGCTAATGTACACAGAAAT 5195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 CTGCGTTCACACTGGCCCTACTCACATCTTCTGGGTCATCATGCTAATGTACACAGAAAT 3059
Query 5196 TTATATCCTGCTCCAGTATTTATACCAGATTATAATCCAGCACTGTGGGTTAAGCATTGA 5255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3060 TTATATCCTGCTCCAGTATTTATACCAGATTATAATCCAGCACTGTGGGTTAAGCATTGA 3119
Query 5256 TGCACCTCTTCTTCATGAATTGGGATTTCCAACGCAAAGAATCAAATCATCATTTGTTGT 5315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 TGCACCTCTTCTTCATGAATTGGGATTTCCAACGCAAAGAATCAAATCATCATTTGTTGT 3179
Query 5316 CAGCTCGTTGCCTCTGTTCCTTATTTACATATTTACTCTCATACAGAGTTCTATAACAGT 5375
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 3180 CAGCTCGTTGCCTCTATTCCTTATTTACATATTTACTCTCATACAGACTGCTATAACAGT 3239
Query 5376 GAAAGATGGTGATTGGGTTCCTTCTGCTGATTTTACTTCGCGCCGGAATGCCCGTGGTAG 5435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3240 GAAAGATGGTGATTGGGTTCCTTCTGCTGATTTTACTTCGCGCCGGAATGCCCGTGGTAG 3299
Query 5436 CCAGAAGGATCTTACAAGAATTAGATTGAGCCAGAGAATCTTGGATGTGTTTAAGAAGCT 5495
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3300 CCAGAAGGATCTTACAAGAATTAGCTTGAGCCAGAGAATCTTGGATGTGTTCAAGAAGCT 3359
Query 5496 AAGAGATAGTGCGAAATTGGTGATCAGAAGCATCTACCGATACTGGATATCTCTGACACG 5555
||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 AAGAGATAGTGGGAAGCTGGTGATCAGGAGCATCTGCCGATACTGGATATCTCTGACACG 3419
Query 5556 TGGAGCAGAATCCCCTCCGTACTTTGTTCAGGTGACAATGGATGTTCACATGTGGCCTGA 5615
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 TGGAGCAGAATCCCCTCCTTACTTTGTTCAGGTGACAATGGATGTTCACATGTGGCCTGA 3479
Query 5616 AGATGGAATTCAGCCTGAAAGAGTTGAATGTAGAATGAATCAGTTGCTTAGGCTTGTCCA 5675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 AGATGGAATTCAGCCTGAAAGAGTTGAATGTAGAATGAATCAGTTGCTTAGGCTTGTCCA 3539
Query 5676 TAATGAGAGATGCGAGAAGGGAAACCCTGATCTCTGCCCTTACTCTAGCAGGGTTCACGT 5735
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 TAATGAGAGATGCGAGAAAGGAAACCCTGATCTCTGCCCTTACTCTAGCAGGGTTCACGT 3599
Query 5736 ACAAAGTATAGAGAGAAGTACAGAAACCCCAAACGAGGCCTTAGTTGTTCTCGAGGTTGA 5795
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3600 ACAAAGTATAGAGAGGAGTACAGAAACCCCAAACGAGGCCTTAGTTGTTTTCGAGGTTGA 3659
Query 5796 GTATGCTTCTCCCACAAATGGCTGTTCTTCAGCAGAATGGTACAAATCACTTACTCCAGC 5855
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3660 GTATGCTTCTCCCACGAATGGGTGTTCTTCAGCAGAATGGTACAAATCACTTACCCCAGC 3719
Query 5856 CTCGGATGTGGCGAAAGAAATTCGTAAAGCTCAACATAGTGGACTTGGTGAAGGAACTGG 5915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3720 CTCGGATGTGGCGAAAGAAATTCGTAAAGCTCAACATAGTGGACTTGTTGAAGGAACTGG 3779
Query 5916 ATTTCCTTACCCCATTCTCTCTGTAATTGGCGGAGGAAAGAGAGATACAGACCTCTACGC 5975
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 3780 ATTTCCATACCCCATTCTCTCTGTGATTGGCGGAGGAAAGAGAGATACTGACCTCTATGC 3839
Query 5976 CTACATTTTTGGTGCTGACTTGATAGTCTTCTTTCTGGTTGCCATTTTCTACCAATCAGT 6035
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3840 CTACATATTTGGTGCTGACTTGATAGTCTTCTTTCTGGTTGCCATTTTCTACCAATCAGT 3899
Query 6036 CATTAAAAATAAAAGCGAGTTTATTGATGTATATCAGCTAGAAGACCAGTTTCCATTCGA 6095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3900 CATTAAAAATAAAAGCGAGTTTATTGATGTATATCAGCTAGAAGACCAGTTTCCATTTGA 3959
Query 6096 CTTTGTCATTATTCTTATGGTTATCTTCTTCCTAATTGTTGTTGATCGCGTCATCTATCT 6155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3960 CTTTGTCATTATTCTTATGGTTATCTTCTTCCTAATTGTTGTTGATCGCGTCATCTATCT 4019
Query 6156 TTGCTCATTTGCGACTGGAAAAGTGGTATACTATCTCTTCAGTCTTATTCTCTTCACATA 6215
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4020 TTGCTCATTTGCGACTGGAAAAGTGGTATACTATCTCTTCAGCCTTATTCTCTTCACATA 4079
Query 6216 TGCAGTGACAGAGTATGCTTGGAGCATATATCCTACCCAGCAACACGCTGCTGGCTTGGC 6275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4080 TGCAGTGACAGAGTATGCTTGGAGCATATATCCTACCCAGCAACACGCTGCTGGCTTGGC 4139
Query 6276 TCTCAGAATCATATTTCTTGCCAAAGCAATGTCACTAGCTCTCCAGGCCATACAAATCCG 6335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4140 TCTCAGAATCATATTTCTTGCCAAAGCAATGTCACTAGCTCTCCAAGCCATACAAATCCG 4199
Query 6336 CTATGGACTACCTCATAAAAGCACCTTGTATCGGCAGTTTTTGACAAGTGAAGTATCACG 6395
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4200 CTATGGACTACCTCATAAAAGCACCTTGTATCGGCAGTTTTTGACAAGTGAAGTTTCACG 4259
Query 6396 GATCAATTACTATGGTTACAGACTTTACCGTGCTCTTCCTTTCCTGTATGAACTGAGATG 6455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4260 GATCAATTACTATGGTTACAGACTTTACCGTGCTCTTCCCTTCCTGTATGAACTGAGATG 4319
Query 6456 TGTGCTTGACTGGTCTTGCACAGCTACATCACTGACAATGTATGACTGGCTCAAG 6510
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4320 TGTGCTTGACTGGTCTTGCACAGCTACATCACTGACAATGTATGACTGGCTCAAG 4374
> Ahg322445 jgi|Araly1|322445|fgenesh1_pm.C_scaffold_4002502
Length=1881
Score = 3227 bits (1747), Expect = 0.0
Identities = 1820/1856 (98%), Gaps = 2/1856 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 232 ATGGCGAGTTTTTTGGTGGGCTTCTTGTTGCCTTCGCTTCTTCTGGCAGCTGCACTTATT 291
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGAGTTTTCTGGTGGGCTTCTTGTTGCCTTCGCTACTTCTGGCAGCTGCACTTATT 60
Query 292 AACTGGAGTGTCATATCCTTTCTTGATTTGATAGCTTTCCTCCTCGTTCACTATATTGCA 351
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AACTGGAGTGTCATATCCTTGGTTGATTTGATTGCTTTCCTCCTCGTTCACTATATTGCA 120
Query 352 CCTGAAATTGGATACCGTTTTCAGAGGAGGCATTGGCTATTATGGCCCATTTTCATCTTT 411
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CCTGAAATTGGACACCGTTTTCAGAGGAGGCATTGGCTATTATGGCCCATTTTCATCTTT 180
Query 412 TCCTTTGCAGTATTTCTTGCTCAAGTGGTCTACCTTGTCATTTGGGCTGCTCTAGGTCAA 471
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 181 TCCTTTGCAGTATTTCTTGCTCAAGTGGTCTACCTTGTCATTTGGGCTACTCTAGGTCAA 240
Query 472 GACTGGGATACACCAGATACTGGCTGGATGAGAGTTATTGGCTTTATGATATTAAAGTCT 531
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GACTGGGATACAGCAGATACTGGCTGGATGAGAGTTTTTGGCTTTATGATATTAAAGTCT 300
Query 532 TGGAGAAACCCCACCGTTATGTATTTCCTGGCTTTACAACTACTAACATCATTGGTTGCT 591
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 301 TGGAGAAACCCCACTGTTATGTATTTCTTGGCTTTACAACTACTAACATCATTAGTTGCT 360
Query 592 TTAGCTGACATATACAGTAGTAGATTCGGCTTCGCT-AGATGGCGGGACACATGGTGGTC 650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTAGCTGACATATACAGTAGTAGATTCGGCTTCGCTCA-ATGGCGGGACACATGGTGGTC 419
Query 651 TCACTTCTCAGGAATTTTCGAACACCTAGGAAGTCATCTTAGGGTTGCCTCCTGCTTGTT 710
| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTACTTTTCAGGAATTTTCGAACACCTAGGAAGTCATCTTAGGGTTGCCTCCTGCTTGTT 479
Query 711 GTTACCAGCAGTTCAATTGGCAGTGGGAATCTGCAATCCATCATGGGTTTCTTTGCCATT 770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GTTACCAGCAGTTCAATTGGCAGTGGGAATCTGCAATCCATCATGGGTTTCTTTGCCATT 539
Query 771 TTTTATTGGAAGCTGTGCCGGTCTTGTGGACTGGTCCTTGACAAGCAATGTTTCAGGACT 830
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 540 TTTTATTGGAAGCTGTGCCGGTCTTGTGGACTGGTCCTTGACAAGCAACGTTTCAGGAAT 599
Query 831 TTTCAGGTGGTGGAGAGTTCTTTATATCTACGCAGGATTCAACATTGTCCTGCTTTACCT 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TTTCAGGTGGTGGAGAGTTCTTTATATCTACGCAGGATTCAACATTGTCCTGCTTTACCT 659
Query 891 CTATCAACTACCAATAAACTTTTCCGATATGATTCGTTGGATAGCAAGCTTTATAGGTCT 950
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CTATCAACTACCAATAAACTTTTCAGATATGATTCGATGGATAGCAAGCTTTATAGGTCT 719
Query 951 ATTCAGAATCTCCCTGGAAACTGAAGGCCCTGATATTTGTTCTGGTCTTTTCCTTGTGTT 1010
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 720 ATTCAGAATCTCCATGGAAACTGAAGGCCCTGATATTTGTTCTGGTGTTTTCCTTGTGTT 779
Query 1011 GTTCTACATCATGCTATCCTATGTAAGGTCAGACCTCGAGGATATGGACTTTATCATGTC 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GTTCTACATCATGCTATCCTATGTAAGGTCAGACCTCGAGGATATGGACTTTATCATGTC 839
Query 1071 CACGAGTGAAAATAACTTGGCAGAGCGGCTTCTTCCTCCAAAATATTCATTTTTTATTCG 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CACGAGTGAAAATAACTTGGCAGAGCGGCTTCTTCCTCCAAAATATTCATTTTTTATTCG 899
Query 1131 AGAATCAAGGGCCGGTGTCAGGCACACCAATGTTTTACTGAGGGGAGCTGTGTTTAAGAC 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 AGAATCAAGGGCCGGTGTCAGGCACACCAATGTTTTACTGAGGGGAGCTGTGTTTAAGAC 959
Query 1191 TTTCAGTATTAATTTCTTCACATATGGTTTTCCGGTCTCTCTATTTGCTCTTTCGTTCTG 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 TTTCAGTATTAATTTCTTCACATATGGTTTTCCGGTCTCTCTATTTGCTCTTTCGTTCTG 1019
Query 1251 GAGTTTTCACTTTGCGAGCTTGTGTGCTTTTGGCCTCCTTGCATATGTTGGTTACATTAT 1310
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GAGTTTTCACTTTGCGAGCTTGTGCGCTTTTGGCCTCCTTGCATATGTTGGTTACATTAT 1079
Query 1311 TTATGCCTTCCCGTCATTGTTCCAGTTGCACAGATTAAATGGCCTTCTTCTCGTATTTAT 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TTATGCCTTCCCGTCATTGTTCCAGTTGCACAGATTAAATGGCCTTCTTCTCGTATTTAT 1139
Query 1371 ACTCTTATGGGCTGTCAGTACGTATATATTCAATGTGGCCTTTTCTTTTCTGAACACTAA 1430
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 ACTCTTATGGGCTGTCAGTACGTACATATTCAATGTGGCATTTTCTTTTCTGAACACTAA 1199
Query 1431 GGTTGGAAAGTTTGGTTTGGGGATGTTGGTCGCGTTGGGTAATCTTGTAAACAATTCTGT 1490
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1200 GGTTGGAAAGTTTGGTTTGGGGATGTTGGTCGCTTTGGGTAATCTTGTAAACAACTCTGT 1259
Query 1491 TTTTCTGTACCTGTCTGAAGAGAGCTCCAGATCTTCCAATGAGAGATCTTACGTTGAAGC 1550
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1260 TTTTCTGTACCTGTCTGAAGAAAGCTCCAGATCTTCCAATGAGAGATCTTACGCTGAAGC 1319
Query 1551 TGATGAAGAAACAAAGGTGTTGGTCGTCGCGACCATTGCTTGGGGATTGCGGAAATGCTC 1610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 TGATGAAGAAACAAAGGTGTTGGTCGTCGCGACCATTGCTTGGGGATTGCGGAAATGCTC 1379
Query 1611 ACGGGCTATTATGCTTGCACTGATTTTTCTCATTGCTATGAAACCTGGGTTTTTCCATGC 1670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 ACGGGCTATTATGCTTGCACTGATTTTTCTCATTGCTATGAAACCTGGGTTTTTCCATGC 1439
Query 1671 CGTATATGTGATATTCTTCCTTATGTATCTGTTGAGCCACAACATCAACAGAAAGATACG 1730
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 CGTATATGTGATATTCTTTCTTATGTATCTGTTGAGCCACAACATCAACAGAAAGATACG 1499
Query 1731 CAAGTCCTTGATTCTACTATGTGAAGTTCATTTTGCACTTCTCTACATTCTTGAGATTGA 1790
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 CAAGTCCTTGATTCTACTATGTGAAGTTCATTTTGCTCTTCTCTACATTCTTGAGATTGA 1559
Query 1791 CCTGGTGTCGAACTCCTTAAAGCAGGAAGGCTCTGCGAGCAGAGAAGTTCTATTTCAGTT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 CCTGGTGTCGAACTCCTTAAAGCAGGAAGGCTCTGTGAGCAGAGAAGTTCTATTTCAGTT 1619
Query 1851 AGGTCTCCTTAGGTCTGAAAGCTCTTGGGACTTCTTGGAGATAGCCTTGCTAGCTTGCTT 1910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1620 AGGTCTCCTTAGGTCTGAAAGCTCTTGGGACTTCTTGGAGATAGCCTTGCTAGCTTGTTT 1679
Query 1911 CTGTGCTATCCATAATCATGGTTTTGAGGTGCTATTTTCCTTTTCAGCAATTGTACGCCA 1970
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 CTGTGCTATCCATAATCATGGTTTCGAGGTGCTATTTTCATTTTCAGCAATTGTACGCCA 1739
Query 1971 TACACCAAGCCCTCCAATTGGATTTAGCATATTGAAAGCTGGTCTCAACAAATCAGTCCT 2030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 TACACCAAGCCCTCCAATTGGATTTAGCATATTGAAAGCTGGTCTCAACAAATCAGTCCT 1799
Query 2031 CTTGTCTGTCTATTCGTCTCCATCTTCAAGTTATAGCCAGGATAATACCACTTACG 2086
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1800 CTTGTCTGTCTATTCGTCTCCATCTTCAAGTTATAGCCAGGATAATACTACTTACG 1855
> Ahg483994 jgi|Araly1|483994|fgenesh2_kg.4__3054__AT2G48040.1
Length=1180
Score = 1188 bits (643), Expect = 0.0
Identities = 655/661 (99%), Gaps = 0/661 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6670 ATGTATAGCAGTGGTAACCCGACAAACATTGCCAATCCGATAAAAGATGCGAGCGTTCAG 6729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTATAGCAGTGGTAACCCGACAAACATTGCCAATCCGATAAAAGATGCGAGCGTTCAG 60
Query 6730 ATTGATTTAAAAACAGTTGGTGGAAAGCTTACTTTGTACCAAACGACCCTATGCGAGAGA 6789
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATCGATTTAAAAACAGTTGGTGGAAAGCTTACTTTGTACCAAACGACCCTATGCGAGAGA 120
Query 6790 ATCTCAGGGGATAACATTGATCTCGGGCTAGATCTCGGGTCTCAAAGCTTTTTGCCAACA 6849
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATCTCAGGAGATAACATTGATCTCGGGCTAGATCTCGGGTCTCAAAGCTTTTTGCCAACA 180
Query 6850 TACAACAAAAATGACATCCAGCTGATATGCTGTCAAGCTGATGCAAGTGTTTTATGGCTT 6909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TACAACAAAAATGACATCCAGCTGATATGCTGTCAAGCTGATGCAAGTGTTTTATGGCTT 240
Query 6910 GTCCCTGACACAGTTGTGACCAGATTTATTCAATCCCTTGACTGGGACACAGATATGGAC 6969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTCCCTGACACAGTTGTGACCAGATTTATTCAATCCCTTGACTGGGACACAGATATGGAC 300
Query 6970 ATCACCTTTACTTGGGTTCTTAACAGAGACCGCCCTAAAGGCAAGGAGACTGTGAAATAT 7029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCACCTTTACTTGGGTTCTTAACAGAGACCGCCCTAAAGGCAAGGAGACTGTGAAATAT 360
Query 7030 GAAAGAAGTGTCGACCCTCTGGACCTTCCAAAACGCTCTGATATCCAAATGGTTCTCAAT 7089
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 361 GAAAGAAGTGTCGACCCTCTGGACCTTCCAAAACGCTCTGATGTCCAAATGGTTCTCAAT 420
Query 7090 GGGTCGATGGATGGATTTAGAGTGCATAATTTGTACCCAAAGTTCTTCCGTGTTACTGGT 7149
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GGGTCGATGGATGGATTTAGGGTGCATAATTTGTACCCAAAGTTCTTCCGTGTTACTGGT 480
Query 7150 TCTGGTGATGTCAGGTCTTTCGAGGATCAGACGGATGAAGTGAGTGCAGACATACTCATT 7209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TCTGGTGATGTCAGGTCTTTCGAGGATCAGACGGATGAAGTGAGTGCAGACATACTCATT 540
Query 7210 AACCATGCAAATTTCAAGTGGTGGTGGTCATTCCATAATCTTAAAGCGTCTGAAAATATC 7269
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AACCATGCAGATTTCAAGTGGTGGTGGTCATTTCATAATCTTAAAGCGTCTGAAAATATC 600
Query 7270 AGCGCTTGCGAGGGGATGGATGGACCAGTTGCTATCATAATGTCTGAGGAAACACCGCCA 7329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AGCGCTTGCGAGGGGATGGATGGACCAGTTGCTATCATAATGTCTGAGGAAACACCGCCA 660
Query 7330 C 7330
|
Sbjct 661 C 661
Score = 693 bits (375), Expect = 0.0
Identities = 485/534 (91%), Gaps = 23/534 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 7399 GTGGGGCGTTTCATCAGGCTTCAATGCTCTGACCTGCGTATGAGAATACCTTACGAGAAC 7458
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 664 GTGGGGCGTTTCATCAGGCTTCAATGCTCTGACCTGCGTATGAGAATACCGTACGAGAAC 723
Query 7459 CTGCCTTCGTGTGACAGATTAATAGCCATATGCGAGGACTTGTACGCGGCTAGAGCAGAG 7518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 724 CTGCCTTCGTGTGACAGATTAATAGCCATATGCGAGGACTTGTACGCGGCGAGAGCAGAG 783
Query 7519 GGTGAGCTTGGAGTAGAAGAAGTTCTATACTGGACGCTTGTGAAGATCTATAGATCCCCG 7578
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 GGTGAGCTTGGAGTAGAAGAAGTTCTATACTGGACGCTTGTGAAGATCTATAGATCCCCA 843
Query 7579 CACATGCTGCTCGAGTATACAAAGCTAGACTATGATGCTTAGGTCCAAAACCAGTCTCTC 7638
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 844 CACATGCTGCTCGAGTATACAAAGCTAGACTATGATGCTTAGGTCCAA--CCAGTCTCTC 901
Query 7639 ACACTAAAGAAACACTTTGTCATATTTGTACATACTGAGCGGAATATTCTGAGGGATTTG 7698
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 902 ACACTATAGAAACACTTTGTCATATTTGTACATACTGAGCGGAATATTCTGAGGGATATA 961
Query 7699 TTTTGTTTTCAATCAGCTTGTAGTTGATTATTGTAGTTGCGACATAATGAAAAGAGGAGA 7758
|||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 962 TTTT-TTTTCA-TCATCTTGTAGTTGATTATTGTAGTTGTGACATAATGAAAAGAGGAGA 1019
Query 7759 AATG--AGAGATGGGTTCAAAGAAGCATTCCACATTCAGAAGTCCAATCTCCTAAAAGAC 7816
|||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1020 AATGTCAAAGATGGGTTCATA-A-GCATTCCACATTCAGAAGTCCAACCTCCTAAAAGAC 1077
Query 7817 TAAACCAGCCAAAATGAAAAGAGGAGACAGA-GCC--ACACATCCGAGACGATGGGCCGA 7873
||||||||| | | | |||| | || ||| || |||||||||||||||||| |
Sbjct 1078 TAAACCAGCTAGA--GCCTAGAG-ATACCCCCGCCGGACCCATCCGAGACGATGGGCCTA 1134
Query 7874 AACACACATAGTATAATTGAATGTGGGCCGTGGCCCAATATTAAATAATCATCC 7927
|| | | || | | | | |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1135 AA-ATA-ATTG-A-A-T--AATG-GG-CCGCGGCCCACTATTAAATAATCATCC 1179
> Ahg951560 jgi|Araly1|951560|scaffold_803447.1
Length=534
Score = 139 bits (75), Expect = 3e-31
Identities = 91/98 (93%), Gaps = 3/98 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 186 TTCGATGAGAA-T--TGGGATATGGTGATCGTTAAGACAAAAGTTTCCAATGGCGAGTTT 242
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 1 TTCGATGAGAATTGGTGGGATATGGTGATCGTTAAGACAAAAGGTTCCCATGGCGAGTTT 60
Query 243 TTTGGTGGGCTTCTTGTTGCCTTCGCTTCTTCTGGCAG 280
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 61 TCTGGTGGGCTTCTTGTTGCCTTCGCTACTTCTGGCAG 98
> Ahg951802 jgi|Araly1|951802|scaffold_17700001.1
Length=371
Score = 122 bits (66), Expect = 3e-26
Identities = 89/99 (90%), Gaps = 5/99 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 186 TTCGATGAGAA-T--TGGGATATGGTGATCGTTAAGACAAAAGTTTCCAATGGCGAGTTT 242
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||
Sbjct 1 TTCGATGAGAATTGGTGGGATATGGTGATCGTTAAGACAAAAGGTTCCCATGGA-ATTTT 59
Query 243 TT-TGGTGGGCTTCTTGTTGCCTTCGCTTCTTCTGGCAG 280
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 60 TTATGGTGGGCTTCTTGTTGCCTTCGCTACTTCTGGCAG 98
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 302526112356
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5