BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G48110.1
Length=4122
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg484003 jgi|Araly1|484003|fgenesh2_kg.4__3063__AT2G48110.1 4082 0.0
> Ahg484003 jgi|Araly1|484003|fgenesh2_kg.4__3063__AT2G48110.1
Length=3961
Score = 4082 bits (2210), Expect = 0.0
Identities = 2349/2418 (97%), Gaps = 4/2418 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1535 GTATCTGCTCTGTAACATTTCTTGTTGGTCTCTAGTGATGAAGGGTTCTCCTCTAACACC 1594
||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 GTATC-GCT-GGTAATATTTCTTGTTGGTCTCTAGCGATGAAGGGTTCTCCTCTAACACC 1583
Query 1595 GTCATTGACAAATTCACTAATCACAACTCCAGCTTCTAGCTTAGCAGAGATTGAAAAGAT 1654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584 GTCATTGACAAATTCACTAATCACAACTCCAGCTTCTAGCTTAGCAGAGATTGAAAAGAT 1643
Query 1655 GTACGAGGTTGCAACTACTGGTTCAGAAGATGAGAAGATAGCCGTGGCTTCTATTCTCTG 1714
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1644 GTACGAGGTTGCAACTACTGGTTCAGAAGATGAGAAGATAGCCGCAGCTTCTATTCTCTG 1703
Query 1715 TGGAGCATCTCTGTTTCGTGGTTGGAGCATACAGGAGCATGTTATTATCTTCATTGTAAC 1774
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 TGGAGCATCTCTATTTCGTGGTTGGAGCATACAGGAGCATGTTATTATCTTCATTGTAAC 1763
Query 1775 TTTACTTTCGCCTCCGGCTCCAGCTGATCTTTCTGGGAGTTATAGCCATCTAATCAATTC 1834
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1764 TTTACTCTCACCTCCGGCTCCAGCTGATCTTTCTGGGAGTTATAGCCATCTAATCAGTTC 1823
Query 1835 TGCGCCGTTTCTTAATGTTCTTCTTGTCGGGATATCACCCATAGATTGTGTTCACATTTT 1894
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1824 TGCGCCGTTTCTTAATGTTCTTCTTGTCGGGATATCACCCATAGATTGTGTTCAGATTTT 1883
Query 1895 CTCATTGCACGGGGTGGTCCCATTACTTGCTGGTGCTTTGATGCCAATATGTGAAGCGTT 1954
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1884 CTCATTGCATGGGGTGGTCCCATTACTTGCTGGTGCTTTGATGCCAATATGTGAAGCGTT 1943
Query 1955 TGGCTCCGGCGTTCCAAACATTACGTGGACTCTCCCGACTGGCGAATTAATCTCCTCTCA 2014
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1944 TGGCTCCGGCATTCCGAACATTACGTGGACTCTCCCGACTGGCGAAGTAATCTCCTCTCA 2003
Query 2015 TGCTGTTTTCTCCACTGCATTTACACTTCTTCTGAGGCTATGGAGATTTGATCACCCACC 2074
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2004 TGCTGTTTTCTCCACTGCATTTACACTTCTTCTAAGGCTATGGAGATTTGATCACCCACC 2063
Query 2075 ACTAGATTACGTCTTGGGAGATGTTCCCCCGGTGGGCCCTCAACCCAGCCCTGAGTATCT 2134
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2064 ACTAGATTACGTCTTGGGAGACGTTCCGCCGGTGGGCCCTCAACCAAGCCCCGAGTATCT 2123
Query 2135 GTTGTTAGTAAGAAATTGCCGTCTGGAATGTTTTGGAAAGTCCCCAAAGGATCGCATGGC 2194
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2124 TTTGTTAGTAAGAAATTGCCGTCTGGAATGTTTTGGAAAGTCCCCAAAGGATCGCATGGC 2183
Query 2195 ACGTCGAAGATTTTCGAAAGTGATAGATATCTCTGTGGATCCCATCTTCATGGATTCATT 2254
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2184 ACGTCGAAGATTTTCGAAAGTGATAAATATCTCTGTGGATCCTATCTTCATGGATTCATT 2243
Query 2255 CCCCAGACTGAAACAGTGGTACCGGCAGCATCAGGAATGTATGGCTTCAATTCTCTCTGA 2314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2244 CCCCAGACTGAAACAGTGGTACCGGCAGCATCAGGAATGTATGGCTTCAATTCTCTCTGA 2303
Query 2315 ACTAAAGACAGGAAGCCCAGTGCATCACATTGTCGATTCCCTCCTTAGCATGATGTTCAA 2374
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2304 ACTAAAGACAGGAAGCCCAGTACATCACATTGTTGATTCCCTCCTTAGCATGATGTTCAA 2363
Query 2375 GAAGGCAAACAAAGGTGGTAGTCAGTCACTGACCCCATCTTCAGGGAGCAGTAGTTTATC 2434
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2364 GAAGGCAAATAAAGGTGGTAGTCAGTCACTGACTCCATCTTCAGGGAGCAGTAGTTTATC 2423
Query 2435 TACTTCTGGAGGTG-ATGACTCGTCTGATCAACTCAAGTTACCTGCATGGGATATCTTGG 2493
||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2424 TACTTCTGG-GGTGGACGACTCGTCTGATCAACTCAAGTTACCTGCATGGGATATCTTGG 2482
Query 2494 AAGCGGCMCCGTTTGTGCTTGATGCTGCTCTAACTGCTTGTGCTCATGGATCACTCTCTC 2553
||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2483 AAGCGGCCCCGTTTGTGCTTGATGCTGCCCTTACTGCATGTGCTCATGGATCACTCTCTC 2542
Query 2554 CCCGGGAACTAGCAACAGGTCTTAAAATCTTGGCTGATTTTCTGCCGGCAACACTTGGAA 2613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2543 CCCGGGAACTAGCAACAGGTCTTAAAATCTTGGCTGATTTTCTGCCGGCAACACTAGGAA 2602
Query 2614 CCATGGTTAGCTACTTTTCTTCGGAAGTAACACGAGGTCTGTGGAAGCCCGTTTCCATGA 2673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2603 CCATGGTTAGCTACTTTTCTTCGGAAGTAACACGAGGTCTGTGGAAGCCCGTTTCCATGA 2662
Query 2674 ACGGAACTGACTGGCCTAGTCCTGCTGCAAATTTAGCAAGCGTTGAGCAACAGATAGAGA 2733
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2663 ACGGAACTGACTGGCCTAGTCCTGCTGCAAATTTAGCAAGCGTTGAGCAACAGATAGAAA 2722
Query 2734 AGATCTTAGCAGCTACTGGCGTTGACGTACCAAGGCTTCCAGCAGATGGAATCTCTGCGG 2793
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2723 AGATCTTAGCTGCTACTGGCGTTGACGTCCCAAGGCTTCCAGCAGATGGAATCTCTGCGG 2782
Query 2794 CTACACTTCCCTTGCCTCTCGCTGCACTAGTGAGCCTTACTATAACCTACAAGCTTGACA 2853
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2783 CCACACTTCCCTTGCCTCTCGCTGCACTAGTCAGCCTCACTATAACCTACAAGCTTGACA 2842
Query 2854 AAGCAACAGAGCGCTTCCTTGTACTTGTAGGACCGGCCTTAGACTCCCTTGCTGCTGCTT 2913
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2843 AAGCAACAGAGCGCTTCCTTGTACTTGTCGGACCGGCCTTAGACTCCCTTGCTGCCGCTT 2902
Query 2914 GCCCCTGGCCCTGCATGCCTATTGTGACATCGCTGTGGACCCAGAAAGTGAAGCGCTGGA 2973
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2903 GCCCCTGGCCCTGCATGCCGATTGTGACATCGCTGTGGACCCAGAAAGTGAAACGCTGGA 2962
Query 2974 GCGACTTTCTTATCTTTTCAGCCTCCAGAACTGTGTTCCACCACAACAGAGATGCTGTTA 3033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2963 GCGACTTTCTTATCTTTTCAGCCTCCAGAACTGTGTTCCACCACAACAGAGATGCTGTTA 3022
Query 3034 TTCAGCTCCTCAGAAGCTGCTTCACTTGCACCCTTGGTCTAACACCTACTTCCCAACTCT 3093
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3023 TTCAGCTTCTCAGAAGCTGCTTCACTTGCACTCTTGGTCTAACACCTACCTCCCAACTCT 3082
Query 3094 GCAGCTATGGGGGAGTGGGTGCACTCCTTGGCCATGGCTTTGGGTCCCGTTACTCTGGAG 3153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3083 GCAGCTATGGGGGAGTGGGTGCACTCCTTGGCCATGGCTTTGGCTCCCGTTACTCTGGAG 3142
Query 3154 GAATTTCCACAGCTGCCCCAGGAATCTTGTACATAAAAGTGCACAGATCGATCAGAGATG 3213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3143 GAATTTCCACAGCTGCCCCAGGAATCTTGTACATAAAAGTGCACAGATCGATCAGAGATG 3202
Query 3214 TCATGTTCCTGACAGAAGAAATCCTGTCTCTTCTGATGTTCTCTGTGAAGAGCATTGCCA 3273
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3203 TCATGTTCCTGACAGAAGAAATCCTCTCTCTTCTGATGTTCTCTGTGAAGAGCATTGCCA 3262
Query 3274 CGAGGGAGCTACCAGCAGGGCAAGCAGAGAAATTGAAGAAAACGAAAGATGGGTCGAGGT 3333
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3263 CCAGGGAGCTACCAGCAGGGCAAGCAGAGAAATTGAAGAAAACGAAAGATGGGTCGAGGT 3322
Query 3334 ACGGGATTGGGCAGGTTTCACTTTCTTTAGCAATGAGACGTGTCAAGCTGGCAGCTTCCC 3393
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3323 ACGGGATTGGGCAGGTTTCACTTTCTTTGGCAATGAGACGTGTCAAGCTGGCAGCTTCCC 3382
Query 3394 TGGGAGCCTCTCTGGTGTGGATCTCCGGTGGCCTAAACCTGGTTCAGGCACTGATCAAGG 3453
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3383 TGGGAGCCTCTCTGGTGTGGATCTCCGGTGGCCTGAACCTGGTTCAGGCTCTGATCAAGG 3442
Query 3454 AGACATTACCGTCTTGGTTCATCTCGGTTCACGGAGAAGAAGATGAGTTGGGAGGTATGG 3513
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3443 AGACATTACCGTCTTGGTTCATATCGGTTCACGGAGAAGAAGATGAGTTGGGAGGTATGA 3502
Query 3514 TTCCGATGCTAAGAGGCTATGCTTTAGCCTACTTTGCAATCCTGAGCAGTGCATTTGCCT 3573
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3503 TTCCGATGCTAAGAGGGTATGCTTTAGCCTACTTTGCAATCCTGAGCAGTGCATTTGCTT 3562
Query 3574 GGGGAGTGGACTCCTCATATCCTGCATCAAAACGTCGGCCAAGGGTTCTGTGGCTGCATT 3633
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3563 GGGGAGTGGACTCCTCATCTCCTGCCTCAAAACGTCGGCCAAGGGTTCTGTGGCTGCATT 3622
Query 3634 TGGAGTTTATGGTGAGTGCCTTGGAAGGGAAGATATCACTGGGCTGTGATTGGGCGACAT 3693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3623 TGGAGTTTATGGTGAGTGCCTTGGAAGGGAAGATATCACTGGGCTGTGATTGGGCGACAT 3682
Query 3694 GGCAAGCTTACGTGACAGGCTTTGTGAGCCTGATGGTGCAATGCACGCCGGCTTGGGTGC 3753
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3683 GGCAAGCATACGTGACAGGCTTTGTGAGCCTGATGGTGCAATGCACGCCGGCTTGGGTGC 3742
Query 3754 TAGAGGTGGATGTTGAAGTAATAAAGAGACTAAGCAAAAGTCTGAGGCAGTGGAACGAGC 3813
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3743 TAGAGGTGGATGTAGAAGTAATAAAGAGACTAAGCAAAAGTCTGAGGCAGTGGAACGAGC 3802
Query 3814 AAGACTTGGCTCTGGCTCTGCTTTGTGCCGGCGGCCTTGGGACAATGGGTGCAGCTACAG 3873
||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |
Sbjct 3803 AAGACTTGGCTCTCGCTCTGCTTTGTGCCGGTGGTCTGGGGACAATGGGTGCAGCTACTG 3862
Query 3874 AACTCATTGTGGAGACTTGCCATCAACATTAGCTTGACGTCTTTCAACTTTCTTTTCTCG 3933
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3863 AACTCATTGTGGAGACTTGCCATCAACATTAGCTTTACGTCTTTCAACTTTCTTTTCTCG 3922
Query 3934 ACTAATCTAAACTGTGAT 3951
||||||||||||||||||
Sbjct 3923 ACTAATCTAAACTGTGAT 3940
Score = 2305 bits (1248), Expect = 0.0
Identities = 1352/1404 (96%), Gaps = 0/1404 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 79 TGGCTCCGTCGGAGTTCCAACCGAGTCTCTGGGAATCGGTTACGTCGCTGATTAGGTCAG 138
||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8 TGGCTCCGTCGGATTTCCAACCGACTCTCTGGGACTCGGTTACGTCGCTGATTAGGTCAA 67
Query 139 CCCAGGAGAAGAACGTGGATCCGCTTCATTGGGCTCTTCAGCTTCGCTTGACCCTCGCGT 198
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 68 CCCAGGAGAAGAACGTCGATCCGCTTCAGTGGGCTCTTCAGCTTCGCCTGACCCTCGCGT 127
Query 199 CTGCTGGAATCTCCCTTCCCTCTCCGGACCTCGCTCAATTCCTCGTCACCCACATCTTCT 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 128 CTGCTGGAATCTCCCTTCCCTCTCCGGACCTCGCTCAATTCCTCGTCACCCACATCTTCT 187
Query 259 GGGAAAATCACTCTCCTCTTTCATGGAAGCTTCTCGAAAAAGCTATATCCGTCAATATTG 318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 188 GGGAAAATCACTCTCCTCTTTCATGGAAGCTTCTCGAAAAAGCTATATCCGTCAATATCG 247
Query 319 TCCCTCCCCTACTTGTCCTCGCCCTTCTCTCCCCAAGGGTAATCCCAAACAGAAAGCTTC 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 TCCCTCCCCTACTTGTCCTCGCCCTTCTCTCCCCAAGGGTAATCCCAAACAGAAAGCTTC 307
Query 379 ATCCCGCAGCCTATAGGCTCTATATGGAACTCCTCAAGAGACATGCATTCTCATTCATGC 438
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308 ACCCCGCTGCCTATAGGCTCTATATGGAACTCCTCAAGAGACATGCATTCTCATTCATGC 367
Query 439 CTCTAATCAGAGCACCAGGATATCACAAAACAATGAATTCCATCGATGATATCCTCCATC 498
||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 CTCAAATCAGAGCACCAGGATATCACAAAACAATTAATTCCATCGATGATATCCTCCATC 427
Query 499 TTTCTGAAACCTTTGGTGTCCAAGATCAAGAACCGGGAAGTATTCTCCTTGCATTTGTCT 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428 TTTCTGAAACCTTTGGTGTCCAAGATCAAGAACCGGGAAGTATTCTCCTTGCATTTGTCT 487
Query 559 TCTCCATTGTCTGGGAGCTACTTGATGCATCCCTAGACGAGGAAGGGCTTTTAGAACTGA 618
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 488 TCTCCATTGTCTGGCAGCTAGTTGATGCATCCCTAGACGAGGAAGGGCTTTTAGAACTCA 547
Query 619 CATCTAATAAGAGATCTAAATGGCCAAGCAGCCCACACGACATGGATTTAGACGGGCTGG 678
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 548 CATCTAATAAGAGGTCTAAATGGCCAAGCAGGCCACATGACATGGAAATAGACGGGCTGG 607
Query 679 AAAATTCTGTGAAGAGAAATGAAAACCATGATGCACTAGAGAAAGCAAACACTGAAATGG 738
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 608 AAAATTCTGTCAAGAGAAATGAAAACCACGATGCACTTGAGAAAGCAAACACTGAAATCG 667
Query 739 CTATCGAGCTAATCCAAGAATTTTTGCAGAATAAAGTCACATCGAGGATTCTTCATTTGG 798
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 668 CTATCGAGCTAATCCAAGACTTTTTGCAGAATAAAGTCACATCGAGGATTCTTCACTTGG 727
Query 799 CAAGTCAAAACATGGAGAGCAAGACCATCCCTCGAGGAGAATTTCATGCGATTGTCTCCT 858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728 CAAGTCAAAACATGGAGAGCAAGACCATCCCTCGAGGAGAATTTCATGCGATTGTCTCCT 787
Query 859 CTGGTTCTAAGTTAGCATTGACCAGTGATTCTGCACTTTGGTTGCCCATTGATCTTTTCT 918
||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 CTGGTTCTAAGCTAGCATTGACTAGTGACTCTGCACTTTGGTTGCCCATTGATCTTTTCT 847
Query 919 TCGAAGACATAATGGATGGGACACAAGCTGCAGCAGCTAGCGCTGTTGAAAATCTAACCG 978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 848 TCGAAGACATAATGGATGGGACACAAGCTGCAGCAGCCAGCGCTGTTGAAAATCTAACTG 907
Query 979 GTCTTGTAAAAGCATTGCAAGCAGCTAATAGTACATCATGGCATGATGCCTTTCTAGCTC 1038
||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 908 GTCTTGTTAAAGCATTGCAGGCAGCTAACAGTACAACATGGCATGATGCCTTTCTAGCTC 967
Query 1039 TATGGTTAGCAGCCTTACGCCTTGTGCAAAGGGAGAATCTATGTCTGCGTTATTGCTTTT 1098
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 968 TATGGTTAGCAGCCTTACGCCTTGTGCAAAGGGAGAATCTATGTCTGCGTTATTGCTTTA 1027
Query 1099 TCATGCATATGTTGGAAATATTATCTGAAGAAAGAGATCCAATCGAGGGTCCTGTGCCCC 1158
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 TCATTCATATGATGGAAATATTATCTGAAGAAAGAGATCCAATCGAGGGTCCTGTGCCCC 1087
Query 1159 GCACCGACACTTTTCTTTGTGTATTACTTTCTGTCACTCCACTTGCAGTTGCCAATATTA 1218
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 GCACCGACACTTTTCTTTGTGTATTACTATCTGTCACTCCACTTGCAGTTGCCAATATTA 1147
Query 1219 TCGAAGAAGAAGAAAGTCAGTGGATTGATCAAACTTCGTCTAGTCCAAGCAACCAGTGGA 1278
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1148 TTGAAGAAGAAGAAAGTCAGTGGATTGATCAAACTTCATCTAGCCCAAGCAACCAGTGGA 1207
Query 1279 AAGAGAAAAAAGGAAAATGTCGACAAGGATTAATTAATAGCTTACAACAACTTGGTGATT 1338
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208 AAGAGAAAAAAGGAAAATGTCGACAAGGATTAGTCAATAGCTTACAACAACTTGGTGATT 1267
Query 1339 ATGAAAGCTTGTTGACACCACCTCGTTCTGTACAGTCCGTTGCCAATCAAGCTGCTGCTA 1398
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1268 ATGAAAGCTTGCTGACACCACTTCGTTCTGTACAGTCCGTTGCCAATCAAGCTGCTGCTA 1327
Query 1399 AAGCAATTATGTTCATCTCCGGCATTACAAATAGTAATGGATCCTATGAAAATACAAGCA 1458
||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1328 AAGCAGTTCTTTTCATCTCCGGCATTACAAATGGTAATGGTTCCTATGAAAATACAAGCA 1387
Query 1459 TGAGCGAATCTGCAAGTGGCTGCT 1482
||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1388 TGAGCGAATCTCCAAGTGGCTGCT 1411
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 155845761435
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5