BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G01460.1
Length=6947
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg927617 jgi|Araly1|927617|scaffold_300074.1 1.008e+04 0.0
> Ahg927617 jgi|Araly1|927617|scaffold_300074.1
Length=6593
Score = 1.008e+04 bits (5458), Expect = 0.0
Identities = 6218/6583 (94%), Gaps = 59/6583 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAACCCACTGATTCTACTAA-CGAGCAACTCGGAGACACTAAGACCGCCGCTGTCAA 59
||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 22 ATGGAACTCACTGATTCTAC-AACCGAGCAACTCGGAGACACTCGGACCGCCGCTCTCAA 80
Query 60 GGAAGAGAGTCGCTCCTTTCTCGGCATCGATCTCAACGAAATCCCTACCGGCGCTACTCT 119
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 81 GGAAGAGAATCGCTCCTTTCTCGGTATCGATCTCAACGAAATCCCTACCGGCCCTACTCT 140
Query 120 CGGCGGTGGTTGCACC-GCTGGTCAGGATGACGACGGCGAATATGAACCTGTTGAAGTTG 178
|||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 141 CGGCGGTGGTTGCACCGGC-GGTCAGGACGACGACGGCGAATATGAACCTGTTGAAGTTG 199
Query 179 TTAGGTCAATTCACGATAACCCGGACCCAGCCCCTGGAGCCCCTGCCGAGGTTCCTGAAC 238
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 200 TTAGGTCAATTCACGATAACCCGGACCCAGCGCCTGGAGCCCCTGCGGAGGTTCCTGAAC 259
Query 239 CGGATCGGGATGCTTCGTGCGGCGCGTGTGGAAGACCTGAGTCTATAGAGCTCGTTGTAG 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 260 CGGATCGGGATGCTTCGTGCGGCGCGTGTGGAAGACCAGAGTCTATGGAGCTCGTTGTAG 319
Query 299 TCTGCGATGCCTGTGAGCGAGGCTTTCATATGTCTTGTGTCAACGATGGAGTTGAGGCGG 358
|||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 320 TCTGCGATGCTTGTGAGCGAGGGTTTCATCTGTCTTGTGTTAACGATGGAGTTGAGGCGG 379
Query 359 CTCCTTCCGCCGATTGGATGTGCAGCGACTGTCG-TACTGGCGGCGAGAGGAGCAAACTG 417
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 380 CTCCTTCCGCCGATTGGATGTGCAGCGACTGT-GTTACTGGCGGCGAGAGGAGTAAACTG 438
Query 418 TGGCCGTTGGGGGTTAAGTCCAAGCTCATTCTGGACATGAACGCCTCGCCGCCCAGTGAT 477
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 439 TGGCCGTTGGGGGTGAAGTCCAAGCTCATTCTGGATATGAACGCCTCGCCGCCCAGCGAT 498
Query 478 GCTGAGGGATACGGA-GCTGAGGAGACGTCTGATTCGAGAAAGCATATGCTCGCCAGCAG 536
|| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 GCAGAGGGATACGGAGGC-GAGGAGACGTCTGATTCGAGAAAGCATATGCTCGCCAGCAG 557
Query 537 CTCTTGCATTGGAAACTCTTTTGATTATGCAATGATGCATTCAAGCTTCTCAAGT-CTCG 595
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 558 CTCTTGCATGGGAAACTCTTTTGATTATGCAATGATGCATTCAAGCTTCTCAAGTCCT-G 616
Query 596 GTAGAGGACATGCTAGTCTCGAAGCTTCAGGGTTAAT-GTCTCGTAATACTAAAATGAGT 654
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||
Sbjct 617 GTAGAGGACTTGCTAGTCTCGAAGCTTCAGGGTTAATAG-CTCGTAATACCAAAATGAGT 675
Query 655 ATGGATGCATTGGGTTCACATAATCTAGGTTTTGGATTCCCATTAAACTTGAACAATAGT 714
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 676 ATGGATGCATTGGCTACACATAATCTAGGTTTTGGATTCCCATTAAGCCTGAACAATAGT 735
Query 715 AGTTTGCCCATGAGATTTCCATCCTTGGATCCAAGTGAGTTGTTTCTGCAAAATCTCAGG 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 AGTTTGCCCATGAGATTTCCATCCTTGGATCCAAGTGAGTTGTTTCTGCAAAATCTCAGG 795
Query 775 CATTTCATATCTGAAAGGCATGGAGTATTGGAAGATGGCTGGCGTGTCGAATTCAGACAA 834
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||
Sbjct 796 CATTTCATATCTGAAAGGCATGGAGTATTGGAAGATGGTTGGCGTGTCGAATTTAAACAA 855
Query 835 CCTTTAAATGGTTATCAGTTATGTGCAGTGTATTGTGCTCCGAATGGAAAAACATTTAGT 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 856 CCTTTAAATGGTTATCAGTTATGTGCAGTGTATTGTGCTCCGAATGGAAAAACATTTAGT 915
Query 895 TCAATACAAGAAGTTGCTTGTTATCTGGGCTTGGCAATTAATGGTAACTACAGCTGTATG 954
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 TCAATACAAGATGTTGCTTGTTATCTGGGCTTGGCAGTTAATGGTAACTACAGCTGTATG 975
Query 955 GATGCTGAAATCAGGAATGAGAATTCTCTTCTTCAAGAAAGATTGCATACGCCCAAGAGA 1014
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 976 GATGCTGACATCAGGAATGAGAGTTCTCTTCTTCAAGAAAGATTGCATATGCCCAAGAGA 1035
Query 1015 AGAAAGACATCAAGATGGCCAAACAATGGTTTCCCTGAGCAAAAGGGTAGTTCAGTGAGT 1074
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1036 AGAAAGACATCAAGATGGCCAAACAATGGTTTCCCTGAGCAAAAGGGTAGTTCAGTCAGT 1095
Query 1075 GCTCAACTCAGGCGTTTTCCATTCAATGGTCAGACCATGTCTCCTTTCGCCGTTAAATCT 1134
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||
Sbjct 1096 GCCCAACTCAGGCGTTTTCCATTCAATGGTCAGACAATGTTTCCTTTTGTTGTTAAATCT 1155
Query 1135 GGTACTCATTTTCAGGCTGGTGGTTCTCTTAGCTCTGGAAATAATGGATGCGGTTGTGAG 1194
||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 GGTACTCATCTCCAGGCTGGTGATTCTCTTAACTCTGGAAATAATGGATGCGGTTGTGAG 1215
Query 1195 GAAGCTAAGAATGGA-TGTCCGATGCAGTTTGAAGATTTCTTTGTTCTGTCGCTTGGACG 1253
|||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216 GAAGCTAATAATGGACT-TCCGATGCAGTATGAAGATTTCTTTGTTCTGTCGCTTGGACG 1274
Query 1254 AATTGACATAAGACAGTCTTACCATAATGTCAACGTGATTTATCCAATAGGATATAAGTC 1313
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 AATTGACATAAGACAGTCTTACCATAATGTCAACGTAATTTATCCAATAGGATATAAGTC 1334
Query 1314 CTGCTGGCATGACAAGATCACGGGGTCACTATTTACATGTGAAGTATCTGATGGCAATTC 1373
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1335 CTGCTGGCATGATAAGATCACGGGGTCTCTATTTACATGTGAAGTATCTGATGGCACTTC 1394
Query 1374 TGGTCCCATTTTCAAGGTTACACGGTCACCATGCTCGAAATCATTTATTCCAGCTGGATC 1433
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1395 TGGTCCTGTTTTCAAGGTTACACGGTCACCATGTTCTAAATCATTTATTCCAGTTGGATC 1454
Query 1434 AACTGTCTTCTCCTGCCCAAAGATTGATGAAATGGTGGAACAGAACAGTGACAAACTTAG 1493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1455 AACTGTCTTCTCCTGCCCAAAGATTGATGAAATGGTGGAACAGAACATTGACAAACAAAG 1514
Query 1494 TAATCGTAGAGATAGTACTCAAGAGCGTGATGATGACGCTAGTGTTGAGATCCTTCTTTC 1553
| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||
Sbjct 1515 TGATCGTAGAGACAGTACTCTAGAGCATGATGATGACGCTAATATTGAGACCCTTCTTTC 1574
Query 1554 GGAACACTGCCCACCTCTTGGAGATGATATATTGTCTTGTTTACGTGAGAAGAGTTTCTC 1613
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1575 GGATCACAGCCCACCTCTTGGAGATGATATATTGTCTTGTTTACGTGAGAAGAATTTCTC 1634
Query 1614 CAAGACAGTCAATTCCCTGCGCTCAGAGGTTGATTCTTCTCGAGTAGATTTTGATAAAAA 1673
||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||
Sbjct 1635 CAAGACATTCAATTGCCTGCGCTCAGAGGTTGGTTCTTCTCAAGTAGAATCTGATAAAGT 1694
Query 1674 TTTATCCTATGATCAGGACCATGGGGTTGAAATTGGTGACATTGTTGTGGAAGAAGATTC 1733
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 TTTATCCTATAATCAGGACCGTGGGGTTGAAATTGGTGAAATTGTTGTGGAAGAAGATTC 1754
Query 1734 ATTGTCTGATGCATGGAAAAAAGTGTCTCAAAAACTTGTTGATGCATGTTCAATTGTACT 1793
| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
Sbjct 1755 ACTATCTGCTGCATGGAATAAGGTGTCTCAAAAACTTGTTGATGCATGCTCCATTGTAAT 1814
Query 1794 GAAGCAGAAGGGTACCCTGAATTTCCTATGTAAGCATGTTGACAGAGAAACAAGTGAAAT 1853
|||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1815 GAAGCAGAAGGGTACCTTGAATTTCCTTTGCAAGCATGTTGACAGAGAAACAAGGGAAAT 1874
Query 1854 CAACTGGGATACCATGAATGAGAAAGACAATGTAATTTTATCGTTGTCAAAATTTTGCTG 1913
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 1875 CAACTGGGATACCATGAATGAGAAAGACAATGTATTTTTATCGTTGTCTAGATTTTGCTG 1934
Query 1914 TTCGTTGGCTCCTTGCAGTGTCACGTGTGGTGAAAAGGATAAAAGCGA-ATTTGCAGCAG 1972
| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |
Sbjct 1935 TACTTTGGGTCCTCACAGTGTTACGTGTGGTGAAAAGGATAAAAGTGAGA-TTGCAACTC 1993
Query 1973 TAGTTGATGCTTTGTCAAGGTGGCTCGATCAAAACAGATTTGGACTTGATGCAGATTTTG 2032
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994 TAGTTGATGCTTTGTCAAGGTGGCTGGATCAAAACAGATTTGGACTTGATGCAGATTTTG 2053
Query 2033 TACAGGAAATGATTGAACATATGCCTGGTGCCGAATCATGTACGAATTATAGGACTCTGA 2092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2054 TACAGGAAATGATTGAACATATGCCTGGTGCCGAATCATGTACAAATTATAGGACTCTGA 2113
Query 2093 AGAGTAGAAGTTCTTCTTCTGTTCCTATAACTGTAGCGGAAGGAGCGCTAGTGGTCAAAC 2152
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2114 AGAGTAGAAGTTCTTCTTCTGTTCCTGTAACTGTAGCGGAAGGAGCGCTAGTTGTCAAAC 2173
Query 2153 CAAAAGGTGGGGAAAATGTCAAGGACGAAGTTTTCGGTGAGATTTCTCGGAAAGCCAAGA 2212
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2174 CAAAAGGTGGGGAAAATGTCAAGGAAGAAGTTTTCGGTGAGATTTCTCGGAAATCCAAGA 2233
Query 2213 AGCCTAAACTAAATGGTGGTCATGGTGTCAGAAATCTACACCCTCCTCCTGGGAGGCCAA 2272
|||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2234 AGCCTAAACTAAATGGAGATTTTGGTGTCAGAAATCTACACCCTCCTCCTGGGAGGCCAA 2293
Query 2273 TGTGTTTGAGGCTCCCTCCTGGGCTTGTTGGTGACTTCCTTCAGGTATCTGAAGTGTTCT 2332
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 TGTGTTTGAGGCTTCCTCCTGGGCTTGTTGGTGACTTCCTTCAGGTATCTGAAGTGTTCT 2353
Query 2333 GGCGTTTCCATGAAATTTTGGGTTTTGAAGAGGCTTTCTCACCTGAAAACCTTGAACAGG 2392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||
Sbjct 2354 GGCGTTTCCATGAAATTTTGGGTTTTGAAGAGGCTTTCTCATCTGAGAAGCTTGAACAGG 2413
Query 2393 AGCTTATCAATCCAGTGTTTGATGGTTTGTTTCTTGATAAACCTGGGAAAGATGATAAGA 2452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414 AGCTTATCAATCCAGTGTTTGATGGTTTGTTTCTTGATAAACCTGGGAAAGATGATAAGA 2473
Query 2453 GAAGTGAGATTAACTTTACTGATAAGGATTCTACAGCTACTAAACTTTTTTCTTTGTTCG 2512
|||||||||| ||||||||| ||||||||| | | | |||| || |||||||||||||||
Sbjct 2474 GAAGTGAGATGAACTTTACTAATAAGGATTGTTCCGGTACTGAATTTTTTTCTTTGTTCG 2533
Query 2513 ATGAATCTCGCCAACCTTTTCCTGCAAAAAATACCTCTGCTTCTGAACTAAAGGAGAAAA 2572
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2534 ATGAATCTCGCCAACCTTTTCCTGCTAAAAATACCTCTGCTTCTGTACTAAAGGAGACAA 2593
Query 2573 AGGCAGGGGATTCTTCTGATTTTAAGATTTCAGATTCCTCTCGTGGGTCGTGTGTGGGTG 2632
|||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 2594 AGGCAGAGGATTCTTCTGATTTTGCGATTTCATATTCCTCTCATGGGCCGTGTGTGGGTG 2653
Query 2633 CACTTCTAACAAGGGCTCACATTTCGCTTCTGCAAGTGCTAATATGTGAGCTGCAATCCA 2692
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2654 CACTTCTAACAAGGACTCACATTTCGCTTCTGCAAGTGCTAATATGTGAGCTGCAATCCA 2713
Query 2693 AGGTAGCTGCATTTGTTGATCCAAACTTTGATTCTGGCGAATCGAGATCCAGACGAGGAC 2752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2714 AGGTAGCTGCATTTGTTGATCCAAACTTTGATTCTGGAGAGTCGAGATCCAGACGAGGAC 2773
Query 2753 GAAAAAAGGATGACAGTACACTTTCTGCTAAAAGAAATAAGCTGCATATGCTTCCTGTTA 2812
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2774 GGAAAAAGGATGACAGTACACTTTCTGCTAAAAGAAACAAGCTGCATATGCTTCCTGTTA 2833
Query 2813 ATGAGTTCACTTGGCCTGAATTGGCCCGTAGGTACATCTTGTCTCTTTTATCCATGGATG 2872
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2834 ATGAGTTCACTTGGCCCGAATTGGCCCGTAGGTACATCTTGTCTCTTTTATCAATGGATG 2893
Query 2873 GGAACCTCGAATCAGCAGAGATTGCTGCACGTGAAAGTGGTAAGGTATTCCGTTGCTTAC 2932
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2894 GGAACCTCGAATCAGCAGAGATTTCTGCGCGTGAAAGTGGTAAGGTATTCCGTTGCTTAC 2953
Query 2933 AAGGGGATGGTGGTTTGCTTTGCGGCTCGCTTACAGGAGTGGCTGGGATGGAAGCAGATT 2992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954 AAGGGGATGGTGGTTTGCTTTGCGGCTCGCTTACAGGAGTGGCTGGGATGGAAGCAGATT 3013
Query 2993 CAATGTTACTTGCAGAGGCTATTAAGAAAATATCTGGTTCGTTGACAAGCGAAAATGATG 3052
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3014 CAATGTTACTTGCAGAGGCTATTAAGAAAATATCTGGTTCTTTGACAAGCGAAAATGATG 3073
Query 3053 TTCTTTCTGTGGAAGATGATGATTCCGATGGCCTTGATGCTACTGAGACAAACACTTGCA 3112
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3074 TTCTTTCTGTGGAAGATGATGATTCCGACGGCCTTGATGCTACTGAGACAAACACTTGCA 3133
Query 3113 GTGGTGATATTCCAGAGTGGGCTCAGGTTTTGGAACCTGTGAAAAAGCTTCCAACAAATG 3172
||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3134 ATGGTGATATTCCAGAGTGGGCACAGGTTCTAGAACCTGTGAAAAAGCTTCCAACAAATG 3193
Query 3173 TTGGGACTAGAATCAGAAAGTGTGTCTATGAAGCTTTAGAGAGAAATCCACCAGAGTGGG 3232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3194 TTGGGACTAGAATCAGAAAGTGTGTCTATGAAGCTTTAGAGAGAAATCCACCAGAGTGGG 3253
Query 3233 CAAAGAAGATATTGGAGCATTCTATCAGTAAAGAAATATATAAAGGCAATGCATCAGGAC 3292
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3254 CAAAGAAGATATTGGAGCATTCCATCAGTAAAGAAGTATATAAAGGCAATGCATCAGGAC 3313
Query 3293 CAACAAAGAAAGCTGTCCTCTCATTGCTAGCGGATATTCGAGGTGGAGACTTGGTGCAGA 3352
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3314 CAACAAAGAAAGCTGTCCTCTCATTGCTAGCGGATGTTCGAGGTGGAGATTTGGTGCAGA 3373
Query 3353 GGTCTATTAAAGGAACCAAAAAGCGGACATATATAAGTGTATCTGATGTCATTATGAAGA 3412
||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3374 GGTCTGTTAAAGGAACCAAAAAGCGAACATCTATAGGTGTATCTGATGTCATTATGAAGA 3433
Query 3413 AATGCCGTGCTGTATTGCGTGGTGTTGCAGCTGCAGACGAGGATAAAGTCCTTTGCACTT 3472
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 3434 AATGCCGTGCTGTATTGCGTGGTGTTGCAGCCGCAGACGAAGATAAAGTCTTTTGCACTT 3493
Query 3473 TACTGGGAAGAAAGTTACTGAATTCCAGTGATAATGATGATGACGGGCTCCTGGGATCAC 3532
| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3494 TGCTGGGGCGAAAGTTGCTGAATTCCAGTGATAATGATGATGACGGGCTCCTGGGAACAC 3553
Query 3533 CTGCAATGGTTTCGCGTCCCTTAGACTTCAGAACTATTGATTTGAGGTTGGCTGCTGGTG 3592
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3554 CTGCAATGGTTTCGCGTCCCTTGGACTTCAGAACTATTGATTTGAGGTTGGCTGCTGGTG 3613
Query 3593 CGTATGACGGATCAACTGAAGCTTTTCTTGAAGATGTTCTTGAGCTGTGGAGTAGTATAC 3652
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3614 CATATGACGGATCAACTGAAGCTTTTCTTGAGGATGTTCTTGAGCTGTGGAGTAGTATAC 3673
Query 3653 GTGTTATGTATGCAGATCAGCCCGATTGTGTGGACCTGGTTGCAACATTGTCTGAAAAAT 3712
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3674 GTGTTATGTATGCAGATCAGCCCGATTGTGTGGAACTGGTTGCAACATTGTCTGAAAAAT 3733
Query 3713 TCAAGTCGTTATACGAGGCTGAGGTTGTACCACTTGTTCAGAAACTTAAGGACTACAGGA 3772
||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 3734 TCAAGTCGTTATATGAGGCTGAGGTTCTACCACTCGTTCAGAAACTTATGGAGTACAGGA 3793
Query 3773 AATTGGAATGCCTAAGTGCAGAGATGAAGAAGGAAATTAAGGACATAGTTGTTTCAGTAA 3832
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3794 AATTGGAATGCCTAAGTGCAGAGATGAAGAAAGAAATTAAGGACATAGTTGTTTCAGTAA 3853
Query 3833 ATAAGCTTCCCAAGGCCCCGTGGGATGAGGGGGTATGTAAAGTATGTGGCGTTGACAAAG 3892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3854 ATAAGCTTCCCAAGGCCCCGTGGGATGAGGGGGTATGTAAAGTATGTGGTGTTGACAAAG 3913
Query 3893 ATGATGACAGTGTTCTCTTGTGTGATACATGCGATGCTGAGTATCACACATATTGTTTAA 3952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3914 ATGATGACAGTGTTCTCTTGTGTGATACATGCGATGCTGAGTATCACACATATTGTTTAA 3973
Query 3953 ATCCACCTCTTATTAGAATTCCTGATGGAAATTGGTATTGTCCATCTTGTGTCATTGCCA 4012
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3974 ATCCACCTCTTATTCGAATTCCTGATGGAAATTGGTATTGTCCATCTTGTGTCATTGCCA 4033
Query 4013 AGCGCATGGCTCAAGAGGCTTTGGAATCTTACAAACTAGTTAGGCGGCGGAAAGGTAGAA 4072
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4034 AACGCATGGCTCAAGAGGCTTTGGAATCTTACAAACTAGTCAGGCGGCGGAAAGGTAGAA 4093
Query 4073 AGTATCAGGGGGAACTCACCCGAGCTTCTATGGAACTGACTGCTCACCTGGCAGATGTGA 4132
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4094 AGTATCAGGGGCAACTCACCCGAACTTCTATGGAAATGACTGCTCACCTGGCAGATGTGA 4153
Query 4133 TGGAAGAAAAGGACTACTGGGAGTTTAGTGCTGAGGAGAGAATCTTGCTGCTTAAGCTTC 4192
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 4154 TGGAAGAAAAGGACTACTGGGAGTTCAGTGCTGAGGAGAAAATCTTGCTGCTCAAGCTTC 4213
Query 4193 TATGCGATGAACTGCTTAGTTCATCTCTTGTCCATCAACACCTTGAGCAGTGTGCCGAAG 4252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4214 TATGCGATGAACTGCTTAGTTCATCTCTTGTCCATCAACACCTTGAGCAGTGTGCCGAAG 4273
Query 4253 CAATAATTGAAATGCAGCAGAAGTTACGCTCTCTTTCCTCAGAATGGAAAAACGCAAAAA 4312
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4274 CAATAATTGAAATGCAGCAGAAGTTACGCTCTCTTTCCTCAGAATGGAAAAATGCAAAAA 4333
Query 4313 TGCGGCAAGAATTCCTGACGGCTAAACTGGCAAAGGTTGAACCGAGTATTCTGAAGGAAG 4372
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4334 TGCGCCAAGAATTCCTGACGGCTAAACTCGCAAAGGTTGAACCGAGTATTCTGAAGGAAG 4393
Query 4373 TGGGCGAACCACATAATTCAAG-CTACTTTGCAGACCAAATGGGATGTGATCCACAACCA 4431
|||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 4394 TGGGTGAACCACATAATTCAGGTC-ACTTTGCAGACCAAATGGGATGTGATCAACGACCA 4452
Query 4432 CAGGAGGGCGTTGGAGACGGAGTTACTCGTGATGATGAGACTTCCTCTACTGCATATCTT 4491
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4453 CAGGAGGGCGTTGGAGACGGAGTTACTC---ATGATGA---TTCCTCTACTGCATATCTT 4506
Query 4492 AACAAGAATCAAGGTAAATCTCCACTTGAAACCGATACTCAACCCGGAGAGTCGCATG-T 4550
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || | |
Sbjct 4507 AACAAGAATCAAGGTAAAGCTCCGCTTGAAACCGATTCTCAACCTGGAGAGTTTCAAGAT 4566
Query 4551 T---AAT-T------TCG---GT-------GAGAGCAAAATTTCCTCCCCGGAAACAAT- 4589
| || | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4567 TCTCAACCTGGAGAGTCGCATGTTAATTTCGAGAGCAAAATTTCCTCCCCAGAAACAATT 4626
Query 4590 ATCATCCCCTGGGAGGCATGAGCTACCTATAGCAGATACCTCTCCTCTTGTAACAGATAA 4649
| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 4627 A-CATCCCCTGGAAGGCATGAGAAACCTATAGCAGATACCTCTCCTCATGTAACGGATAA 4685
Query 4650 TCTGCCT---GAAAAAGATACCTCGGAGACCTTGCTTAAGTCAGTTGGAAGGAATCATGA 4706
|| | || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4686 TCCGTCTTTTGAAAAAGATACCTCAGAGACCTTGCACAAGTCAGTTGGAAGGAATCATGA 4745
Query 4707 AACACATTCACCAAATTCCAATGCAGTAGAATTGCCGACAGCTCATGATGCATCTTCTCA 4766
||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4746 AACACATTCACTAAATTCCAATGCAGTAGAATTCCCGACAGCTCATGATGCATCTTCTCA 4805
Query 4767 GGCTTCCCAAGAGTTGCAGGCTTGTC-AGCAGGATTTGAGTGCCACTAGTAATGAAATTC 4825
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 4806 GGCTTCCCAAGAGTTGCAGGCTTGTCTA-CAGGATTTGAATGCCACTAGTCATGAAATTC 4864
Query 4826 AGAATCTTCAGCAATCAATTAGAAGCATAGAATCACAGCTTCTAAAGCAATCTATACGGA 4885
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4865 AGAATCTGCAGCAATCAATTAGAAGCATAGAATCACAGCTTCTAAAGCAATCTATACGGA 4924
Query 4886 GAGATTTTCTGGGAACCGATGCTAGTGGTCGGTTATATTGGGGTTGCTGCTTCCCAGATG 4945
|||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4925 GAGACTTTCTGGGAAACGATGCTAGTGGTCGTTTATATTGGGGTTGCTGCTTCCCAGACG 4984
Query 4946 AAAATCCTCGTATATTGGTTGATGGAAGCATATCTTTGCAGAAACCTGTTCAAGCCGATT 5005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4985 AAAATCCTCGTATATTGGTTGATGGAAGCATATCTTTGCAGAAACCTGTTCAAGCCGATT 5044
Query 5006 TGATAGGTTCAAAAGTCCCCTCTCCGTTTCTCCATACCGTTGACCATGGAAGACTAAGGC 5065
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5045 TGATGGGTTCAAAAGTCCCCTCTCCGTTTCTCCATGCCGTTGACCATGGAAGACTAAGGC 5104
Query 5066 TTTCACCCTGGACGTATTATGAAACTGAAACCGAGATCAGTGAGCTTGTCCAATGGCTTC 5125
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5105 TTTCACCCTGGACTTATTATGAAACCGAAACCGAGATCAGCGAGCTTGTCCAATGGCTTC 5164
Query 5126 ATGATGATGATCTGAAAGAAAGAGACCTGAGAGAGTCTATTTTGTGGTGGAAAAGGTTAC 5185
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5165 ATGATGATGATCTGAAAGAAAGAGACCTGAGAGAGTCTATTTTGTGCTGGAAAAGGTTAC 5224
Query 5186 GATATGGAGACGTTCAAAAGGAAAAGAAACAAGCTCAGAATTTATCTGCTCCGGTATTTG 5245
||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 5225 GATTTGGGGACGTCCAAAAGGAAAAGAAACAAGCTCAGAATTTATCTGCTCCGATATTGG 5284
Query 5246 CTACGGGTCTTGAGACCAAGGCTGCCATGTCAATGGAGAAGAGATATGGTCCATGCATCA 5305
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5285 CTAGGGGTCTTGAGACCAAGGCTGCCATGTCAATGGAGAAGAAATATGGTCCATGCATCA 5344
Query 5306 AACTGGAGATGGAAACCTTaaaaaaaCGGGGGAAGAAGACAAAGGTTGCAGAGCGAGAGA 5365
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5345 AACTAGAGACGGAAACCTTAAAAAAACGGGGGAAGAAGACAAAGGTTTCAGAGCGAGAGA 5404
Query 5366 AATTGTGTAGATGCGAATGCTTGGAATCCATTTTGCCATCTATGATTCACTGCCTCATAT 5425
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5405 AAGTGTGTAGATGCGAGTGCTTGGAATCCATTTTGCCATCCATGATTCACTGCCTCATAT 5464
Query 5426 GCCATAAAACATTCGCAAGTGATGATGAGTTTGAGGATCACACTGAGAGTAAGTGTATTC 5485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5465 GCCATAAAACATTCGCAAGTGATGATGAGTTTGAGGAGCACACTGAGAGTAAGTGTATTC 5524
Query 5486 CTTATTCATTAGCAACTGAAGAAGGCAAGGACATCTCTGATTCTTCAAAAGCCAAAGAAA 5545
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5525 CTTATTCATTAGCAACTGAAGAAAGCAAGGAAATCTCTGATTCTTCAAAAGCAAAAGAAA 5584
Query 5546 GTCTGAAATCCGATTATCTTAATGTAAAGTCTAGTGCCGGCAAAGATGTAGCTGAAATAT 5605
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 5585 GTCTGAAATCTGATTATCTTAATGTAAAGTCTAGCGCCGGCAAAGCTGTAGGTGAAATAT 5644
Query 5606 CCAATGTTTCTGAACTTGATTCTGGGTTGATAAGATATCAAGAAGAAGAATCTATTTCCC 5665
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5645 CCAATGTGTCTGAACTTGATTCTGGGTTGATAAGATATCAAGAAGAAGAATCTATTTCCC 5704
Query 5666 CATACCATTTTGAGGAGATCTGTTCCAAGTTTGTGACAAAGGATTGCAACAGAGATTTGG 5725
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5705 CATACCATTTTGAGGAGATCTGCTCCAAGTTTGTGACAAAGGATTCCAACAGAGATTTGG 5764
Query 5726 TTAAAGAGATCGGTCTGATCAGTTCAAATGGCATTCCAACATTTCTTCCATCGTCATCTA 5785
||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5765 TTAAAGAAATTGGTCTGATCGGTTCAAATGGCATTCCAACATTTCTTCCAGCGTCATCTA 5824
Query 5786 CTCATCTTAACGACTCCGTGCTCATCTCTGCCAAATCC-AATAAGCCAGATGGTGGTGAT 5844
|||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 5825 CTCACCATAACGACTCAGTGCTCATCAATGCCAA-TCCCAATAAGCTAGATGGTGGTGAT 5883
Query 5845 TCAGGGGATCAGGTCATTTTTGCTGGTCCTGAAACCAATGTTGAAGGCTTAAATTCTGAA 5904
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5884 TCAGGGGACCAGGTCATTTTTGCTGGTCCTGAAACCAATGTTGAAGGCTTAAATTCTGAA 5943
Query 5905 TCTAACATGTCATTCGATAGATCTGTCACAGACAGTCACGGGGGTCCACTGGATAAACCA 5964
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||
Sbjct 5944 TCTAACTTGTCATTCGATGGATCTGTCACAGACAATCATGGCGGTCCACTGAATAAACTG 6003
Query 5965 AGTGGACTGGGTTTTGGCTTCTCAGAGCAAAAGAATAAGAAATCTTCAGGTAGTGGGTTG 6024
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6004 ACCGGACTGGGTTTTGGCTTCTCAGAGCAAAAGAATAAGAAATCTTCAGGTAGTGGGCTG 6063
Query 6025 AAAAGCTGCTGTGTGGTTCCACAGGCTGCTTTGAAACGAGTAACTGGCAAAGCTTTGCCG 6084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6064 AAAAGCTGCTGTGTGGTTCCACAGGCTGCTTTGAAACGAATAACTGGCAAAGCTTTGCCG 6123
Query 6085 GGTTTCAGGTTCCTGAAAACCAACTTGCTTGATATGGATGTAGCACTGCCTGAAGAAGCT 6144
| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 6124 GTTTTCAGGTTCCTTAAAACCAACTTACTTGATATGGATGTGGCACTGCCTGAAGAAGCT 6183
Query 6145 TTAAGACCATCGAAATCACATCCAAACCGTAGAAGAGCTTGGCGTGTATTTGTTAAATC- 6203
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6184 TTAAGACCATCGAAATCTCATCCAGACCGTAGAAGAGCTTGGCGTGTATTTGTGAAATCC 6243
Query 6204 GTCGCAAAGTATATACGAGTTGGTTCAGGCAACAATTGTGGTAGAAGATATGATTAAGAC 6263
| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6244 G-CGCAAAGCATATACGAGTTGGTTCAGGCAACATTTGTGGTAGAAGATATGATTAAGAC 6302
Query 6264 AGAGTACTTGAAAAATGAATGGTGGTACTGGTCTTCTCTTTCAGCGGCTGCTAAAATCTC 6323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6303 AGAGTACTTGAAAAATGAATGGTGGTACTGGTCTTCTCTTTCAGCGGCTGCTAAAATATC 6362
Query 6324 GACTCTCTCAGCGTTATCCGTCCGTATCTTCTCCCTCGACGCTGCTATCATTTATGATAA 6383
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 6363 TACTCTCTCAGCGTTATCCGTTCGTATCTTCTCCCTCGATGCAGCTATCATTTATGATAA 6422
Query 6384 ACCCATAACTCCATCAAATCCTATCGATGAAACAAAGCCGATCATCAGCTTACCGGACCA 6443
||||||||| |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6423 ACCCATAACCCCATCAGATCATAACGATGAAACTAAGCCGATCATCAGCTTACCAGACCA 6482
Query 6444 AAAGTCACAGCCGGTTTCGGATTCTCAAGAAAGAAGCAGCAGAGTTA---GAAGATCTGG 6500
||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 6483 GAAGTCACAGCCGGTTTCAGATTCACAAGAAAAAAGCAGCAGAGTAAACAGAAGATCTGG 6542
Query 6501 CAAGAAAAGGAAAGAACCCGAGGGATCCTAGTTAATTATTAAA 6543
||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 6543 TAAGAAGAGGAAAGAACCCGAGGGATCATAGTTATTTATTAAA 6585
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 263358405160
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5