BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G01610.1
Length=2756
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg927596 jgi|Araly1|927596|scaffold_300053.1 4024 0.0
Ahg920561 jgi|Araly1|920561|scaffold_101842.1 2542 0.0
> Ahg927596 jgi|Araly1|927596|scaffold_300053.1
Length=2507
Score = 4024 bits (2179), Expect = 0.0
Identities = 2402/2510 (96%), Gaps = 13/2510 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 120 AGC-TCTAATTCAGTACGATGGGGAGGAGAGGT--C-GCGGCGGCGGCGGTGGTATGGGC 175
||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 AGCTTCTAATTCAGTACGATGGTGAGGAGAGGTCGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTATGGGC 62
Query 176 GGAGGAATCAATCGTAGATATCTGAGTCAAGTTATGGATACGTGCGGCAAGGATTTATCT 235
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||
Sbjct 63 GGAGGAATCAATCGTAGATATCTGAGTAAAGTTATGGATTCATGCGGCAAGGATTTAGCT 122
Query 236 ACGGCGGAGGACATCGTTGATGATCTTCGTTCCAGGTACGGCAATTTTGCGAGGTTGACT 295
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 123 ACGGCGGAGGACATCGTCGATGATCTCCGTTCCAGGTACGGTGATTTTGCGAGGTTGACT 182
Query 296 CGGCAAGTGCTTCTACTCAATGTCAGGCAAGTCCTTAATGTTAGAAACAACAAGAGGGTT 355
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 183 CGGCAGGTGCTTCTGCTCAATGTCAGGCAAGTCCTTAATGTCAGAAACAACAAGCGGGTT 242
Query 356 AAAGACGAAGATGAAGATGACAACATTGGAGATGAGGAAGGTTCTGCTTCTCAGAGGAAG 415
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 243 AAAGACGAAGATGAAGATGACAACAATGGCGATGAGGAAGGTTCTGCTGCTCAGAGGAAG 302
Query 416 AAACAGAGACGGGTTGATGAGAAAGAGGAGAAATTGCAGCGAGCGGAGCAGTCGCATTTA 475
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 303 AAACAGAGGCGGGTTGATGAGAAAGAGGAGAAGTTGCAGCGAGCGGAGCAGTCGCATCTG 362
Query 476 AGGAAGAGGAATATGGAACGTTCAGTGtcttcttctccgtcttcttcttcttcttcGGAA 535
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 363 AGGAGGAGAAATATGGAACGTTCAGTGTCTTCTTCTCCG---TCTTCTTCTTCGTCGGAA 419
Query 536 GACAGTGGTGATGTGTCGACTTCTGAGGACGCGGTTTATGGCGAGAAGCTGAGTCCGCCG 595
|| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GATAGTGGTGATGTGTCGACTTCTGAGGACGCGATTTATGGCGAGAAGCTGAGTCCGCCG 479
Query 596 CGGTTTGATCTGATCAATGACAGTCTAAGAGATAACTACGCTAAGTTGAACAGCTCCTCG 655
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 480 CGGTTTGATTTGATCAATGACAGTCTACGAGATAACTACGCCAAGTTGAACAGCTCCTCG 539
Query 656 AAGAAACCAATTGGGTCGCCTGCGGAAAAGAATGTGGAAGTTGAGACTGTGAGCAACAAA 715
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 AAGAAACCAATTGGGTCGCCTGTGGAAAAGAATGTGGAAGTTGAGACTGTGAGCAACAAA 599
Query 716 GGTAGAAGCAAGTTGGCTACAATGGGGGCCAGAAAGGAGGCTAAAGTTTCTCTTTCCCTC 775
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 600 GGTAGGAGCAAGTTGGCTACAATGGGGGCCAGAAAGGAGGCTAAAGGCTCTCTTTCCCTC 659
Query 776 AGTGGAGCTACTGGTAATGGTGATTTGGAAGTTGAGGGTACTAAAGGACCTACTTTTAAA 835
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 660 AGTGGAACTACTGGTAATGGTGATTTGGAAGTTGAGGGTAATAAAGGACCTACTTTTAAA 719
Query 836 GACTTTGGTGGGATTAAGAAAATATTGGATGAATTGGAGATGAATGTTCTATTCCCCATT 895
|| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GATTTTGGTGGGATTAAGAAAGTGTTGGATGAATTGGAGATGAATGTTCTATTCCCCATT 779
Query 896 CTCAATCCTGAGCCGTTTAAGAAGATTGGAGTGAAGCCACCAAGTGGGATTCTATTTCAT 955
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 780 CTCAATCCTGAGCCGTTTAAGAAGATTGGAGTGAAGCCACCAAGCGGGATTCTATTCCAT 839
Query 956 GGACCACCTGGCTGTGGGAAGACTAAGTTGGCCAATGCCATTGCCAATGAAGCTGGTGTT 1015
||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 840 GGACCACCTGGCTGTGGAAAGACCAAGTTGGCTAATGCCATTGCCAATGAAGTTGGTGTT 899
Query 1016 CCGTTTTATAAGATTTCAGCCACAGAGGTGATTTCTGGTGTTTCTGGTGCTTCTGAAGAG 1075
||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 CCGTTTTTTAAGATTTCAGCCACAGAGGTGGTTTCTGGTGTTTCTGGTGCTTCTGAAGAG 959
Query 1076 AATATCAGAGAGCTCTTTTCTAAAGCATATAGGACTGCGCCTTCGATTGTGTTTATCGAT 1135
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 960 AATATTAGAGAGCTCTTCTCTAAAGCATATAGGACTGCGCCTTCGATAGTCTTTATCGAT 1019
Query 1136 GAGATTGATGCGATTGGTTCAAAGAGAGAGAATCAGCAAAGAGAGATGGAGAAGCGGATA 1195
|||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GAGATTGACGCGATTGGATCAAAGAGAGAAAACCAGCAAAGGGAGATGGAGAAGCGGATA 1079
Query 1196 GTAACACAATTGTTGACTTGTATGGATGGACCTGGTAACAAAGGCGATAAAAATGCTCCT 1255
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1080 GTAACACAATTGTTGACTTGTATGGATGGACCCGGTAACAAAGGCGATAAAAATGTTCCT 1139
Query 1256 GATTCTAGTGCTGGTTTTGTTCTTGTCATTGGAGCTACAAATAGGCCTGATGCTCTTGAT 1315
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1140 GATTCTAGTGCTGGATTTGTTCTCGTCATTGGAGCTACAAATAGGCCGGATGCTCTTGAT 1199
Query 1316 CCTGCTTTGAGGAGAAGTGGACGATTTGAAACTGAGATCGCTCTAACTGCTCCAGATGAA 1375
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 CCTGCTTTGAGGAGAAGTGGACGATTTGAATGTGAGATTGCTCTAACTGCTCCAGATGAA 1259
Query 1376 GACGCAAGGGCTGAGATACTCTCTGTTGTAGCCCAAAAACTTAGATTAGAAGGACCCTTT 1435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GACGCAAGGGCTGAGATACTCTCTGTTGTAGCCCAAAAACTTAGATTAGAAGGACCCTTT 1319
Query 1436 GACAAGAAAAGAATAGCTCGTTTAACACCGGGTTTTGTTGGAGCTGATTTGGAGAGTGTT 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GACAAGAAAAGAATAGCTCGTTTAACACCGGGTTTTGTTGGAGCTGATTTGGAGAGTGTT 1379
Query 1496 GCTTACTTGGCTGGCAGGAAAGCCATTAAGAGAATCTTGGATTCAAGGAAATCTGAACAG 1555
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1380 GCTTACTTGGCTGGCAGGAAAGCCATAAAGAGAATCTTAGATTCAAGAAAATCTGAACAG 1439
Query 1556 TCTGGGGACGGTGAAGACGATAAATCTTGGCTGAGGATGCCCTGGCCAGAAGAAGAGTTG 1615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TCTGGGGACGGTGAAGACGATAAATCTTGGCTGAGGATGCCCTGGCCAGAAGAAGAGTTG 1499
Query 1616 GAAAAGCTCTTTGTCAAAATGTCTGATTTCGAGGAAGCAGTGAATCTAGTTCAGGCATCT 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 GAAAAGCTCTTTGTCAAAATGTCTGATTTCGAGGAAGCAGTGAATCTAGTTCAGGCATCT 1559
Query 1676 TTAACAAGAGAAGGATTCTCTATCGTGCCTGATGTCAAGTGGGATGATGTTGGTGGACTT 1735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 TTAACAAGAGAAGGATTCTCTATCGTGCCTGATGTCAAGTGGGATGATGTTGGTGGACTT 1619
Query 1736 GACCATCTACGACTTCAATTCAACCGTTATATAGTGAGGCCTATCAAAAAGCCTGATATT 1795
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 GACCATCTACGACTTCAATTCAATCGTTATATAGTGAGGCCTATCAAAAAGCCTGATATT 1679
Query 1796 TATAAGGCTTTTGGGGTAGACTTAGAGACAGGGTTTTTGCTCTATGGACCACCGGGTTGT 1855
||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TATAAGGCTTTCGGGGTAGACTTAGAGACCGGATTTTTGCTCTATGGACCACCGGGTTGT 1739
Query 1856 GGCAAGACATTGATTGCAAAGGCAGCTGCTAACGAGGCTGGAGCTAATTTCATGCACATC 1915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 GGCAAGACATTGATTGCAAAGGCAGCTGCTAACGAGGCTGGAGCTAATTTCATGCACATC 1799
Query 1916 AAGGGTGCCGAACTTCTAAATAAATACGTTGGAGAAAGTGAGCTTGCTATTCGTACGTTG 1975
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 AAGGGTGCAGAACTTCTAAATAAATACGTTGGAGAAAGTGAGCTTGCTATTCGTACGTTA 1859
Query 1976 TTTCAGCGAGCTCGGACATGTGCACCATGTGTAATCTTCTTTGATGAGGTGGATGCTTTG 2035
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 TTTCAGCGCGCCCGGACATGTGCACCATGTGTAATCTTCTTTGATGAGGTGGATGCTTTG 1919
Query 2036 ACAACAAGTCGTGGCAAAGAAGGTGCTTGGGTTGTTGAACGGCTTTTGAACCAGTTTCTT 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1920 ACAACAAGTCGTGGCAAAGAAGGTGCTTGGGTTGTGGAACGACTTTTGAACCAGTTTCTT 1979
Query 2096 GTTGAGCTGGATGGTGGAGAGAGGCGTAATGTATATGTAATTGGAGCTACAAACAGGCCA 2155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 GTTGAGCTGGATGGTGGAGAGAGGCGTAATGTATATGTAATTGGAGCTACAAACAGGCCA 2039
Query 2156 GATGTAGTTGATCCTGCTTTCTTGAGACCGGGTAGATTTGGGAATCTTCTTTATGTACCC 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 GATGTAGTTGATCCTGCTTTCTTGAGACCGGGTAGGTTTGGGAATCTTCTTTATGTACCC 2099
Query 2216 CTCCCCAACGCAGATGAGCGTGCTTCAATTCTAAAAGCTATTGCAAGGAAGAAACCGATA 2275
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 CTCCCCAACGCGGATGAGCGAGCTTCAATTCTAAAAGCTATTGCAAGGAAGAAACCGATA 2159
Query 2276 GATCCTAGTGTTGATCTGGATGGAATTGCAAAGAAT-AACTGTGAAGGTTTCAGCGGAGC 2334
||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 GATCCTAGTGTTGATCTGGTTGGAATCGCAAAGA-TGAACTGTGAAGGTTTCAGCGGAGC 2218
Query 2335 TGATCTCGCACACTTGGTGCAAAAAGCTACATTCCAAGCAGTGGAGGAGATGATAGGCTC 2394
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2219 TGATCTCGCGCACTTGGTGCAAAAAGCTACATTCCAAGCAGTGGAGGAAATGATAGGCTC 2278
Query 2395 CAGTGAGTCGTCTGAAGATGATGTTACAGATATAACGCAGTGTACAATCAAGACGAGGCA 2454
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||
Sbjct 2279 CAGTGAGTCGTCTGAAGATGATGTTTCAGATATAACCCAGTGTACAATCAAGTCAAAACA 2338
Query 2455 TTTCGAGCAAGCCTTGTCCTTAGTCTCACCATCTGTGAACAAACAGCAAAGAAGACACTA 2514
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2339 TTTCGAGCAAGCCTTGTCCTTAGTCTCGCCCTCTGTGAACAAACAGCAAAGAAAACACTA 2398
Query 2515 TGACGCACTATCAACAAAGCTTCAAGAAAGCGTTGGGAGGAACACTGAA---CAAGTCAC 2571
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||
Sbjct 2399 TGACGCACTATCAAAAAAGCTTCAAGAAAGCGTTGGAAAGAACACTGAAGAACAAGTCAC 2458
Query 2572 CATAGGGCCATCTTTTACCCTCGAGTAAAAACACTCTTTACTTATAGAAT 2621
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 2459 CATAGGGCCATCTTTTACCCTCGAGTAAAAACACTCCT-ACTTATAGAAT 2507
> Ahg920561 jgi|Araly1|920561|scaffold_101842.1
Length=2341
Score = 2542 bits (1376), Expect = 0.0
Identities = 1806/2011 (90%), Gaps = 40/2011 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 560 GAGGACGCGGTTTATGGCGAGAAGCTGAGTCCGCCGCGGTTTGATCTGATCAATGACAGT 619
|||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 330 GAGGACGCTGTTTACAGCGAGAAGCTGAGT---CCAAGGTTTGATTTGATCAATGACAGT 386
Query 620 CTAAGAGATAACTACGCTAAGTTGAACAGCTCCTCGAAGAAACCAATTGGGTCGCCTGCG 679
||| |||||||||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 387 CTACGAGATAACTATGCCAAGCTAAACAGTTCCTTGAAGAAACCAATTGGGTCGCCTGTG 446
Query 680 GAAAAGAATGTGGAAGTTGAGACTGTGAGCAACAAAGGTAGAAGCAAGTTGGCTACAATG 739
|| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 447 GAGAAGAATGTGGAAGTTGAGACTGTGGGAAACAAAGGTAGAAGTAAGATGGCTACAATG 506
Query 740 GGGGCCAGAAAGGAGGCTAAAGTTTCTCTTTCCCTCAGTGGAGCTACTGGTAATGGTGAT 799
||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 507 GGGTCGAGAAAGGAGTCTAAAGGCTCTCTTTCCGTCAGTGGAACTACTGGTAATGGTGAA 566
Query 800 TTGGAAGTTG-AGGGT-ACTAAAGGACCTACTTTTAAAGACTTTGGTGGGATTAAGAAAA 857
||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 567 TTGGAAG-TGAAGGGTGA-TAAAGGACCTACTTTTAAAGATTTTGGTGGGATTAGGAAAG 624
Query 858 TATTGGATGAATTGGAGATGAATGTTCTATTCCCCATTCTCAATCCTGAGCCGTTTAAGA 917
| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 625 TGTTGGATGAATTGGAGAGGAATGTTTTGTTCCCGATTCTCAATCCTGAACCGTTTAAGA 684
Query 918 AGATTGGAGTGAAGCCACCAAGTGGGATTCTATTTCATGGACCACCTGGCTGTGGGAAGA 977
|||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 685 AGATCGGAGTTAAGCCACCAAGCGGGATTCTATTCCATGGACCACCTGGCTGTGGAAAGA 744
Query 978 CTAAGTTGGCCAATGCCATTGCCAATGAAGCTGGTGTTCCGTTTTATAAGATTTCAGCCA 1037
| |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 745 CCAAGTTGGCTAATGCTATAGCCAATGAAGTTGGTGTTCCGTTTTATAAGATTTCAGCTA 804
Query 1038 CAGAGGTGATTTCTGGTGTTTCTGGTGCTTCTGAAGAGAATATCAGAGAGCTCTTT-TCT 1096
|||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||
Sbjct 805 CAGATGTGGTTTCTGGTGTCTCTGGTGCTTCTGAAGAGAATATTAGAGAGCT-TTTCTCT 863
Query 1097 AAAGCATATAGGACTGCGCCTTCGATTGTGTTTATCGATGAGATTGATGCGATTGGTTCA 1156
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 864 AAAGCGTATAGGACTGCGCCTTCCATTGTGTTTATCGATGAGATTGATGCGATTGGATCA 923
Query 1157 AAGAGAGAGAATCAGCAAAGAGAGATGGAGAAGCGGATAGTAACACAATTGTTGACTTGT 1216
||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||
Sbjct 924 AAGAGGGAAAATCAGCAAAGGGAGATGGAGAAGCGGATTGTAACGCAATTATTGACTTGT 983
Query 1217 ATGGATGGACCTGGTAACAAAGGCGATAAAAATGCTCCTGATTCTAGTGCTGGTTTTGTT 1276
|||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 984 ATGGATGGACCTAGTAACAAA---G--------G-TCCTGAGTCTAGTGCTGGATTTGTT 1031
Query 1277 CTTGTCATTGGAGCTACAAATAGGCCTGATGCTCTTGATCCTGCTTTGAGGAGAAGTGGA 1336
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1032 CTCGTCATTGGAGCTACAAATAGGCCTGATGCTCTGGATCCTGCTTTGAGAAGAAGTGGA 1091
Query 1337 CGATTTGAAACTGAGATCGCTCTAACTGCTCCAGATGAAGACGCAAGGGCTGAGATACTC 1396
|||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1092 CGATTTGAGTGTGAGATCGCTCTGAGTGTTCCAGATGAAGATGCAAGGGCTGAGATCCTC 1151
Query 1397 TCTGTTGTAGCCCAAAAACTTAGATTAGAAGGACCCTTTGACAAGAAAAGAATAGCTCGT 1456
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 TCTGTTGTAGCCCAAAAACTTAGACTAGAAGGGCCCTTTGACAAGAAAAGAATAGCTCGT 1211
Query 1457 TTAACACCGGGTTTTGTTGGAGCTGATTTGGAGAGTGTTGCTTACTTGGCTGGCAGGAAA 1516
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| |
Sbjct 1212 TTAACACCGGGGTTTGTTGGAGCCGATTTGGAGGGTGTTGCTAACATGGCTGGCAGGATA 1271
Query 1517 GCCATTAAGAGAATCTTGGATTCAAGGAAATCTGAACAGTCTGGGGACGGTGAAGACGAT 1576
|||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||| | |||||||||| |||
Sbjct 1272 GCCACAAAGAGGATCTTGGATTTAAGAAAATCTCAACTGTCTGAGAACGGTGAAGATGAT 1331
Query 1577 -A-AA-TCTTGGCTGAGG-ATGCCCTGGCCAGAAGAAGAGTTGGAAAAGCTCTTTGTCAA 1632
| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1332 GATAATTCTTGGCTGAGGCAT-CCCTGGCCAGAAGAAGAGTTGGAAAAACTCTTTGTCAA 1390
Query 1633 AATGTCTGATTTCGAGGAAGCAGTGAATCTAGTTCAGGCATCTTTAACAAGAGAAGGATT 1692
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1391 GATGTCTGATTTTGAGGAAGCAGTGAATCTAGTTCAAGCATCTTTGACAAGAGAAGGATT 1450
Query 1693 CTCTATCGTGCCTGATGTCAAGTGGGATGATGTTGGTGGACTTGACCATCTACGACTTCA 1752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 1451 CTCTATCGTGCCTGATGTCAAGTGGGATGATGTTGGTGGACTTGAGCATCTACGACTTGA 1510
Query 1753 ATTCAACCGTTATATAGTGAGGCCTATCAAAAAGCCTGATATTTATAAGGCTTTTGGGGT 1812
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1511 ATTCAACCGTTATATAGTCAGACCTATCAAAAAGCCTGATATTTATAAGGCTTTTGGGGT 1570
Query 1813 AGACTTAGAGACAGGGTTTTTGCTCTATGGACCACCGGGTTGTGGCAAGACATTGATTGC 1872
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571 AGACTTAGAGACAGGATTTTTACTCTATGGACCACCTGGTTGTGGCAAGACATTGATTGC 1630
Query 1873 AAAGGCAGCTGCTAACGAGGCTGGAGCTAATTTCATGCACATCAAGGGTGCCGAACTTCT 1932
|||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1631 AAAGGCGGTTGCCAACGAGGCAGGAGCTAATTTCATGCACATAAAGGGTGCAGAACTTCT 1690
Query 1933 AAATAAATACGTTGGAGAAAGTGAGCTTGCTATTCGTACGTTGTTTCAGCGAGCTCGGAC 1992
||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||
Sbjct 1691 AAACAAATACGTTGGAGAGAGCGAGCTTGCTATTCGGACATTGTTTCAGCGGGCCCGGAC 1750
Query 1993 ATG-TGCACCATGTGTAATCTTCTTTGATGAGGTGGATGCTTTGACAACAAGTCGTGGCA 2051
||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1751 ATGCT-CGCCATGTGTAATCTTCTTTGACGAGGTGGATGCTTTGACAACAAGCCGTGGCA 1809
Query 2052 AAGAAGGTGCTTGGGTTGTTGAACGGCTTTTGAACCAGTTTCTTGTTGAGCTGGATGGTG 2111
|||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810 AAGAAGGTGCCTGGGTTGTTGAGCGGCTTTTAAACCAGTTTCTTGTTGAGCTGGATGGTG 1869
Query 2112 GAGAGAGGCGTAATGTATATGTAATTGGAGCTACAAACAGGCCAGATGTAGTTGATCCTG 2171
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1870 GAGAGAGGCGTAATGTATATGTAATTGGAGCTACAAACAGGCCAGATGTAATTGATCCTG 1929
Query 2172 CTTTCTTGAGACCGGGTAGATTTGGGAATCTTCTTTATGTACCCCTCCCCAACGCAGATG 2231
| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1930 CGTTCTTGAGACCCGGTAGGTTTGGGAATCTTCTATACGTACCCCTCCCTAACGCGGATG 1989
Query 2232 AGCGTGCTTCAATTCTAAAAGCTATTGCAAGGAAGAAACCGATAGATCCTAGTGTTGATC 2291
| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 1990 AACGTGCTTCAATTTTAAAAGCTATCGCAAGGAAGAAGCCCATAGATCCTAGTGTTGATC 2049
Query 2292 TGGATGGAATTGCAAAGAAT-AACTGTGAAGGTTTCAGCGGAGCTGATCTCGCACACTTG 2350
||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2050 TGGATGGCATTGCAAAGA-TGAAATGTGAAGGTTTCAGCGGAGCTGATCTTGCTCACTTG 2108
Query 2351 GTGCAAAAAGCTACATTCCAAGCAGTGGAGGAGATGATAGGCTCCAGTGA-G-TCGTCTG 2408
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||| |||| | | | ||
Sbjct 2109 GTGCAAAAAGCTACATTCCAGGCAGTGGAGGAGATAACAAGTTCCGGTGAAGAT-GA-TG 2166
Query 2409 AAGATGATGTTACAGATATAACG-CAGTGTACAATCAAGACGAGGCATTTCGAGCAAGCC 2467
| |||||| ||||||||| || | |||||||| || |||| || |||||||||||||||
Sbjct 2167 ATGATGATATTACAGATACAA-GTCAGTGTACGATTAAGATGACTCATTTCGAGCAAGCC 2225
Query 2468 TTGTCCTTAGTCTCACCATCTGTGAACAAACAGCAAAGAAGACACTATGACGCACTATCA 2527
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||
Sbjct 2226 TTGTCCTTAGTCTCACCTTCTGTGAACAAACAGCAAAGAAGACACTACCAGGAACTATCG 2285
Query 2528 ACAA-AGCTTCAAGAAAGC-GTTGGGAGGAA 2556
|| | || ||||||||| || || |||||
Sbjct 2286 GTAAGA-CTCCAAGAAAGCAGT-GGAAGGAA 2314
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 103986368850
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5