BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G01780.1
Length=3823
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg477337 jgi|Araly1|477337|fgenesh2_kg.3__38__AT3G01780.1 6231 0.0
> Ahg477337 jgi|Araly1|477337|fgenesh2_kg.3__38__AT3G01780.1
Length=3756
Score = 6231 bits (3374), Expect = 0.0
Identities = 3639/3767 (97%), Gaps = 17/3767 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 20 TTCCAGTTCCATGTCGCATACGTACACAGATTGACAGCGAAGCTAGTTAGCTCAGATTTT 79
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||
Sbjct 1 TTCCAGTTCCATGTCGCATCCGTACACAGATTGACAGCAAAGCTAGGTAGCTCAGA-TTC 59
Query 80 GGA-TCTCGAATTTCAGTTAATTCGATCCGGTTATGGACATTCTTTTTGCTCAGATCCAG 138
|| || | || || | |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 60 CGAGCCTTGGATCTC-G--AATT---T-CAGTTATGGACATTCTTTTCGCTCAGATCCAG 112
Query 139 GCGGACCTCCGTTCAAATGACGCGCTTCGCCAGTCATCGGCGCTTCTTCAGGCGCTGCAG 198
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 113 GCGGACCTCCGTTCTAATGACGCGCTTCGCCAGTCATCCGCGCTTCTTCAGGCGCTGCAG 172
Query 199 CAATCCGCCGCCGGAAGAGATATCTCTGTGATCGCTAAGTCTGCTGTGGAGGAGATTGTT 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 CAATCCGCCGCCGGAAGAGATATCTCTGTGATCGCCAAGTCTGCTGTGGAGGAGATTGTT 232
Query 259 GCTTCTCCGGCTTCAGCTGTTTGTAAGAAGCTGGCATTCGATCTCATCCGATCTACCCGC 318
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 233 GCTTCTCCGGCGTCAGCTGTTTGTAAGAAGCTCGCATTCGATCTCATCCGATCTACCCGC 292
Query 319 CTCACTCCGGATCTTTGGGACACCGTTTGCTCAGGTGTCAAAACGGATCTTCATTTTCCG 378
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 293 CTGACTCCGGATCTTTGGGACACCGTTTGCTCAGGTGTCAAAACGGATCTTCATTTCCCG 352
Query 379 GACCCGGATGTTACCGCCGCTGCCGTCTCCATCCTTGCGGCTCTCCCTGCCTTCTCGCTT 438
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 353 GACCCGGATGTCACCGCCGCTGCCGTCTCCATCCTTGCTGCTCTCCCTTCCTTCTCGCTT 412
Query 439 CCTAAACTCATCTCTGATTGCAGCTCTGAGATTGCTTCCTGCTTCGATTCTCCATCTGAC 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 CCTAAACTCATCTCTGATTGCAGCTCTGAGATTGCTTCCTGCTTCGATTCTCCATCTGAC 472
Query 499 AACCTTCGTTTTTCCATCACCGAGACACTTGGCTGCATCCTCGCGCGTGATGATCTCGTT 558
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 473 AACCTTCGTTTTTCCATTACCGAGACACTTGGCTGCATCCTCGCGCGTGATGATCTCGTT 532
Query 559 ACTTTGTGCGAGAACAATGTGGGTCTCCTCGACAAGGTCTCCAACTGGTGGGCTCGGATC 618
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 ACATTGTGCGAGAACAATGTGGGTCTCCTCGACAAGGTCTCCAACTGGTGGGCTCGGATC 592
Query 619 GGCCAGAACATGCTCGACAAATCCGACGCCGTCTCCAAGGTTGCCTTTGAGTCCGTCGGC 678
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||
Sbjct 593 GGCCAGAACATGCTCGACAAATCCGACGCTGTCTCCAAGGTTGCCTTCGAATCAGTCGGC 652
Query 679 AGACTCTTCCAGGAGTTCGACTCCAAGCGGATGAGCCGTCTTGCTGGCGATAAGCTCGTT 738
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 653 AGACTCTTCCAGGAGTTCGACTCCAAGCGGATGAGCCGTCTTGCTGGCGACAAGCTCGTT 712
Query 739 GACAGCGAGAACTCCCTCGCCATCAGGTCCAAGTGGGTCTCTTCCATGGTTGACATTGTA 798
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 GACAGCGAGAATTCCCTCGCCATCAGGTCCAAGTGGGTCTCTTCCATGGTTGACATTGTA 772
Query 799 TGGAGAAAGAGGAGCGCTTTGATGGCTAGGTCTTTAGTCCTTCCTGTCGAAACCTTCAGA 858
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||
Sbjct 773 TGGAAAAAGAGGAGCGCTTTGATGGCTAGGTCTTTTGTTCTTCCTGTTGAAACCTTCAGA 832
Query 859 GCCACTGTTTTCCCTCTTGTCTTTGCTGTCAAAGCTGTTGCTTCCGGTAGTGTCGAAGTG 918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 GCCACTGTTTTCCCTCTTGTCTTTGCTGTCAAAGCTGTTGCTTCCGGTAGTGTCGAAGTG 892
Query 919 ATTAGACAGCTTTCCAAGGCTTCCTCTGCTGCTGCTGCAGCTAATGCCACCGTTGTGGAC 978
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 ATAAGACAGCTTTCCAAGGCTTCCTCCGCTGCTGCTGCAGCTAATGCCACCGTTGTGGAC 952
Query 979 TCCAACGCCGAGAAGCTGGTTGGCGTCTCAGATTTGGTTACCCATTTGGCGCCATTCTTG 1038
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 TCCAACGCTGAGAAGCTGGTTGGCGTCTCAGATTTGGTTACCCATTTGGCGCCATTCTTG 1012
Query 1039 GCTTCCTCTTTGGATCCAGCTTTGATTTTTGAAGTGGGAATTAACATGCTCTACCTGGCA 1098
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 GCTTCCTCTTTGGATCCAGCTTTGATTTTTGAAGTGGGAATTAACATGCTCTACCTGGCT 1072
Query 1099 GATGTTGCCGGAGGCAAGCCAGAGTGGGCTTCACAGTCCATTATTGCAATTTTAACACTC 1158
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 GATGTTGCCGGAGGGAAGCCAGAGTGGGCTTCACAGTCCATTATTGCAATTTTAACACTT 1132
Query 1159 TGGGACCGCCAAGAATTTTCCTCTGCTAGAGAGAGTATAGTCAGGGCCGTTGTTACGAAC 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1133 TGGGACCGCCAAGAATTTTCCTCTGCTAGAGAGAGTATAGTCAGGGCCGTTGTCACGAAC 1192
Query 1219 CTGCACTTGCTTGATCTGCATATGCAGGTTTCGTTGTTTAGAAGACTGCTGCTTATGGTG 1278
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1193 CTGCACTTGCTTGATCTGCATATGCAGGTTTCTTTGTTTAGAAGACTCCTGCTTATGGTG 1252
Query 1279 AGAAACTTGAGAGCAGAATCGGACAGGATGCACGCATTAGCCTGTATCTGTCGGACAGCT 1338
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1253 AGGAACTTGAGAGCAGAATCGGACAGGATGCACGCATTAGCATGTATCTGCCGGACAGCT 1312
Query 1339 CTCTGTGTTCACCTTTTTGCCAGAGAAAGTGCCCGAAGAGGTCAGAAGCCTCTGCCTGGG 1398
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 CTATGTGTTCACCTTTTTGCCAGAGAAAGTGCCCGAAGAGGTCAGAAGCCTCTGCCTGGG 1372
Query 1399 ACAGATATTATTTCTCTCTTTGAAGATGCAAGGATTAAAGATGATCTCAATAGTGTTACC 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 ACAGATATTATTTCTCTCTTTGAAGATGCAAGGATTAAAGATGATCTCAATAGTGTTACC 1432
Query 1459 AGTAAGAGCTTATTTCGGGAAGAGCTGGTGGCAATGCTTGTGGAAAGCTGCTTCCAGTTG 1518
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 AGTAAAAGCTTATTTCGGGAAGAGCTGGTGGCAATGCTTGTGGAAAGCTGCTTCCAGTTG 1492
Query 1519 TCTCTACCTTTGCCTGAACaaaaaaaCTCGGGTATGGAGAGCAGAGTGATTGGTGCGTTA 1578
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1493 TCTCTACCTTTGCCTGAACAAAAAAACTCTGGTATGGAGAGCAGAGTGATTGGTGCACTA 1552
Query 1579 GCATATGGTACTGGTTATGGTGCTCTGAACTGGACAGAACCAGCCCTTGAGGTTGTGGAA 1638
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 GCATATGGCACTGGTTATGGTGCTCTGAACTGGACAGAACCAGCCCTTGAGGTTGTGGAA 1612
Query 1639 GTTTGTAGGCCTTGTGTCAAATGGGATTGTGATGGCAGGACGTACGCTGTAGATTGCTAT 1698
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1613 GTTTGTAGGCCTTGTGTCAAATGGGATTGTGATGGCAGGACGTACGCTATAGATTGCTAT 1672
Query 1699 TTGAAATTGCTTGTTAGGCTGTGCCATATCTATGATACCCGTGGAGGAGTGAAGAGGCTG 1758
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1673 TTGAAATTGCTTGTTAGGCTATGCCATATCTATGATACCCGTGGAGGTGTGAAGAGGCTT 1732
Query 1759 AAAGATGGTGCTTCCCAGGATCAAATATTAAATGAGACACGATTGCAGAACTTGCAACGT 1818
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1733 AAAGACGGTGCTTCCCAGGATCAAATATTAAATGAGACCCGATTGCAGAACTTGCAACGT 1792
Query 1819 GAGCTTGTTAAGGATCTCCAAGAGGTAAATACCCCAAGAATCCTCGGGCGTCTTATATGG 1878
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1793 GAACTCGTTAAGGATCTCCAAGAGGTAAATACCCCAAGAATCCTTGGGCGTCTTATATGG 1852
Query 1879 ACAATCGCAGAACATATTGATCTAGAAGGTCTAGATCCACTTTTAGCTGATGACCCCGAT 1938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1853 ACAATCGCAGAACATATTGATCTAGAAGGTCTAGATCCACTTTTAGCTGATGACCCCGAT 1912
Query 1939 GATCCATTGAATATTATCATAGCAAACATACATAAGGTTCTCTTCAACTTGGATGCCGCT 1998
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 GATCCGTTGAATATTATCATAGCAAACATACATAAGGTTCTCTTCAACTTGGATGCCGCT 1972
Query 1999 GCTACTACATCGAATAGGCTACAAGATGTTCAGGCAGTCTTATTATGCGCCCAGAGGATG 2058
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1973 GCTACTACATCGAACAGGCTACAAGATGTTCAGGCAGTCTTATTATGTGCCCAGAGGATG 2032
Query 2059 GGATCGCGTCATGCAAGAGCTGGCCAGTTATTAACCAAAGAGCTTGAAGAGTATAGGAAC 2118
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2033 GGATCACGTCATGCAAGAGCTGGCCAATTATTAACCAAAGAGCTTGAGGAGTATAGGAAC 2092
Query 2119 CATGCTGCTGCAGATACAGTTAGCAAACATCAAACCCGTTTAATATTGCAGAGGATCAAA 2178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 CATGCTGCTGCAGATACAGTTAGCAAACATCAAACCCGTTTAATATTGCAGAGGATCAAA 2152
Query 2179 TATGTTTCAAATCTTCCTGAAAGAAAGTGGGCTGGAGTTAGTGAGACAAGAGGAGATTAC 2238
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2153 TATGTTTCAAATCTTCCTGAAAGAAAGTGGGCTGGAGTCAGTGAGACAAGAGGAGATTAC 2212
Query 2239 CCGTTTAGCCACCATAAGCTTACTGTTCAGTTTTACGAACCATCAGCTGCTCAAGACAGG 2298
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 CCGTTTAGCCACCATAAGCTTACTGTTCAGTTTTACGAACCATCAGCTGCTCAAGACAGA 2272
Query 2299 AAATTAGAAGGTCTAATTCACAAGGCCATTCTCGAGCTTTGGAGGCCAAAGCCCACTGAA 2358
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2273 AAATTAGAAGGTCTAATTCACAAGGCCATTCTAGAGCTTTGGAGGCCGAAGCCCACTGAA 2332
Query 2359 TTAACTCTCTTCCTTACAAAAGGGGTCGACTCAACTTCTATCAAGGTTCCTCCCACAGCA 2418
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 TTGACTCTCTTCCTTACAAAAGGGGTCGACTCGACTTCGATCAAGGTTCCTCCCACAGCA 2392
Query 2419 TATCCTTTGACCGGAAGCAGTGATCCTTGCTATATAGAAGCTTACCATTTAGCAGATACA 2478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 TATCCTTTGACCGGAAGCAGTGATCCTTGCTATATAGAAGCTTACCATTTAGCAGATACA 2452
Query 2479 AATGATGGAAGGGTCACTTTGCACTTGAAGATTATTAATTTGACAGAACTTGAACTGAAT 2538
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2453 AATGATGGAAGGGTCACTCTGCACTTGAAGATTATTAATTTGACAGAACTTGAACTGAAT 2512
Query 2539 CGTGTGGATATACGGGTTGGATTATCTGGTGCCCTATACTTCATGGATGGCTCTCCTCAA 2598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 CGTGTGGATATACGGGTTGGATTATCTGGTGCCCTATACTTCATGGATGGCTCTCCTCAA 2572
Query 2599 GCAGTGCGGCAGTTGCGTAATCTTGTCTCACAGGATCCTGTACAATGCAGTGTCACCGTT 2658
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 GCAGTGCGGCAGTTGCGCAATCTTGTCTCACAGGATCCTGTACAATGCAGTGTCACCGTT 2632
Query 2659 GGTGTGTCCCAATTTGAAAGATGTGGTTTCTGGGTTCAAGTCCTCTACTATCCATTCCGT 2718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2633 GGTGTGTCCCAATTTGAAAGATGTGGTTTCTGGGTTCAAGTCCTCTACTATCCATTCCGT 2692
Query 2719 GGTGCTAGGGGAGAATATGACGGTGACTACATAGAAGAGGATCCACAGATCATGAAGCAG 2778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2693 GGTGCTAGGGGAGAATATGACGGTGACTACATAGAAGAGGATCCACAGATCATGAAGCAG 2752
Query 2779 AAGAGAGGTTCAAAAGCAGAACTCGGAGAGCCTGTGATCTTAAGATGTCAGCCTTACAAG 2838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 AAGAGAGGTTCAAAAGCAGAACTCGGAGAGCCTGTGATCTTAAGATGTCAGCCTTACAAG 2812
Query 2839 ATCCCACTGACTGAGCTTCTTCTACCGCACAAAATCTCACCAGTCGAGTTCTTTCGTTTG 2898
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ATCCCACTGACTGAGCTTCTTCTCCCGCACAAAATTTCACCAGTCGAGTTCTTTCGTTTG 2872
Query 2899 TGGCCTAGCTTGCCAGCTGTTGCAGAGTACACTGGCACATATATGTATGAAGGAAGCGGC 2958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2873 TGGCCTAGCTTGCCAGCTGTTGCAGAGTACACTGGCACATATATGTATGAAGGAAGTGGC 2932
Query 2959 TTCATGGCGACCGCCGCACAACAGTATGGGGCTTCACCATTTTTAAGCGGACTCAAATCA 3018
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2933 TTCATGGCGACTGCCGCACAACAGTATGGTGCTTCACCATTTCTAAGCGGACTCAAATCA 2992
Query 3019 TTATCCTCGAAGCCATTCCACAGAGTCTGTTCCCACATTATACGCACAGTTGCTGGCTTT 3078
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2993 ATATCCTCCAAGCCATTCCACAGAGTCTGTTCCCACATTATACGCACAGTTGCTGGCTTT 3052
Query 3079 CAGCTTTGTTACGCTGCAAAAACGTGGCATGGAGGTTTTGTGGGTATGATGATCTTTGGC 3138
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3053 CAGCTGTGTTACGCTGCAAAAACATGGCATGGAGGTTTTGTGGGCATGATGATCTTTGGA 3112
Query 3139 GCTAGTGAAGTGAGCAGGAACATGGATCTGGGTGACGAGACTACCACCATGATGTGCAAG 3198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3113 GCTAGTGAAGTGAGCAGGAACATGGATCTGGGTGACGAGACAACCACCATGATGTGCAAG 3172
Query 3199 TTTGTGGTTAGAGCATCAGAAGCATCAATCACAAAGCAAATAGAGTCGGATATTCAGGGA 3258
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 3173 TTCGTGGTTAGAGCATCAGAAGCATCAATCACAAAGCAAATAGAGTCGGATCTACAGGGA 3232
Query 3259 TGGTGTGATGATCTAACTGACGGGGGCGTTGAGTACATGCCAGAGGACGAAGTGAAGGCA 3318
||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3233 TGGTGCGATGATCTAACTGATGGGGGAGTTGAGTACATGCCAGAGGACGAAGTGAAGGCA 3292
Query 3319 ACCGCGGCCGAGAAGCTGAAGATCTCTATGGAGAGGATAGCTTTGTTGAAGGCAGCTCAG 3378
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3293 ACCGCAGCCGAGAAGCTGAAGATCTCGATGGAGAGGATAGCTTTGTTGAAGGCAGCTCAG 3352
Query 3379 CCgaagaagacttcaaagatagaggaggaatcagaaaacgaagaagaagaagaaggagaa 3438
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |
Sbjct 3353 CCGAAGAAGACTCCAAAGATAGAGGAGGAATCAGAAAACGAGGAAGAAGATGAAG-A-A- 3409
Query 3439 gaagaagatgatgatgaagaagtaaaagagaaaaaggagaaagaagagggaaaggacaag 3498
|| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3410 GATGATGATGATGATGAAGATGTAAAAGAGAAAAAGGAGAAAGAAGAGGGAAAGGACAAG 3469
Query 3499 gaagagaagaagaa-aaaa--gagaaggaaaaaggaaCATTTTCTAAGCTGACAGCAGAA 3555
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 3470 GAAGAGAAGAAGAAGAAAAAAGAGAAGGAAAAAGGAACACTGTCTAAGCTGACAGCAGAA 3529
Query 3556 GAAACAGAGCACATGGCGCTTCAGGCAGCAGTGCTCCAAGAATGGCACATCTTGTGCAAA 3615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3530 GAAACAGAGCACATGGCGCTTCAGGCAGCAGTGCTCCAAGAATGGCACATCTTGTGTAAA 3589
Query 3616 GATAGAAAATATACCAAAGTTAACTAAGAGCGAGAGTACTTTTT-TCTCAGATGAAGCTA 3674
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||
Sbjct 3590 GATAGAAAATATACCAAAGTTAACTAAGAGCGAGAGTACTTTTTCTCCCAGATGAAGGTA 3649
Query 3675 CAACAATCttt-gttttcttttgttgtgtgtggtttcttcgtaggtttagatgttttgta 3733
| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3650 CGACAATCTTTTGTATTCTTTTGTTGTGTGTGGTTTCTTCGTAGGTTTAGATGTTTTGTA 3709
Query 3734 ttgttgttgGTGAAGAAAAGAAACAAACCAAGGATGTTACTATTGCC 3780
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 3710 TTGTTGTTGGTGAAGAAAAGAAACGAAGCAAGGATGTTACTATTGCC 3756
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 144466547108
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5