BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G03300.1 Length=4824 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg317213 jgi|Araly1|317213|fgenesh1_pm.C_scaffold_3000229 5581 0.0 Ahg903170 jgi|Araly1|903170|Al_scaffold_0003_298 305 2e-81 > Ahg317213 jgi|Araly1|317213|fgenesh1_pm.C_scaffold_3000229 Length=6102 Score = 5581 bits (3022), Expect = 0.0 Identities = 3358/3523 (95%), Gaps = 12/3523 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1214 GGTCTATACCTGTGAGAATGAGTCTGTGCTGGCTGGGTTTGTCCCCTTTTCTACACCAAG 1273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2586 GGTCTATACCTGTGAGAATGAGTCTGTGCTGGCTGGGTTTGTCCCCTTTTCTACACCAAG 2645 Query 1274 CTTCAAGTATTACCAGCACATAAAAATACCAAGTCCCAAACGAGCAAGCTTGGTAGAGAA 1333 |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2646 GTTCAAGTATTACCAGCACATGGGGATACCAAGTTCCAAACGAGCAAGTTTGGTAGAGAA 2705 Query 1334 GCTAGAAAGACTAACGATAAAGCATCGCTTATCCCTTGGAACCTTGGATCTC-AACTCCT 1392 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| Sbjct 2706 GCTAGAAAAACTAATGATAAAGCATCGCTTATCCCTTGCAACCTTGGATCTCAAAC-CCT 2764 Query 1393 CTACTGTTGATTCTGTAGAGAAGAGACTGTTGAGGATAAGTTCAACTCTAACATATTGTT 1452 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2765 CTACTGTTGATTCTATAGAGAAGAGACTGTCGAGGATAAGTTCAACTCTAACATATTGTT 2824 Query 1453 TGGATGATCTCGGAATTTTGCTGGCCCAGAAGGCTGCTCAGTCATTGTCAGCCAGTCAGA 1512 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2825 TGGATGATCTCGGAATTTTGCTGGCGCAGAAGGCTGCTCAGTCATTGTCAGCCAGTCAGA 2884 Query 1513 ATGACTCTTTCTTGTGGGGCGAACTAAATATGTTTAGCGTGGCCTTGGTaaaaaaaTTCT 1572 |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| Sbjct 2885 ATGACTTTTTCTTGTGGGGGGAACTAAATATGTTTAGCGTGACCTTGGTAAAAAAGTTCT 2944 Query 1573 GCTCTGATGCTTCACAGGAGTTTTTGGCTGAGATACCTCAA-GGTCTTAATTGGAGTGTT 1631 | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| || Sbjct 2945 GTTCTGATGCTTCACAGGCGTTTTTGGCTGACATACCT-AATGGTCTTAGTTGGAGTATT 3003 Query 1632 GCAAACATAAATGGAAATGCGGAGGCAGGTCTCCTAACTTTAAAAACTGTCTGCCTCATT 1691 || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || Sbjct 3004 GCTAACATAAATGGAAACGTGGAGGCAGGTCTCCTAACATCAAAAACAGTCTGCCTGGTT 3063 Query 1692 GAGACTCTTCTTGGTTATAGCTC-CTTGGAGAACATACGGTGCATCATTTTTGTGGATAG 1750 ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3064 GAGACTCTTCTTGGTTATAGCTCAC-TGGAGAACATACGGTGCATCATTTTTGTGGATAG 3122 Query 1751 GGTGATAACAGCCATCGTTCTGGAATCCCTTTTGGCTGAGATTCTTCCAAACTGTAATAA 1810 ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3123 GGTGATAACAGCCATTGTTCTGGAATCTCTGTTGGCTGAGATTCTTCCAAACTGTAATAA 3182 Query 1811 CTGGAAAACCAAGTACGTTGCAGGAAATAACTCTGGTCTGCAAAATCAAACTCGGAAGAA 1870 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3183 CTGGAAAACCAAGTACGTTGCTGGGAATAACTCTGGTCTGCAAAATCAAACTCGGAAGAA 3242 Query 1871 GCAAAATGAAATTGTGGAAGACTTCCGGAGAGGCTTGGTTAACATCATTGTAGCAACATC 1930 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3243 GCAAAATGAAATTGTGGAAGACTTCCGGAGAGGCTTGGTAAACATCATTGTAGCAACATC 3302 Query 1931 TATTCTAGAGGAGGGTCTAGATGTTCAAAGTTGCAACCTGGTTATCAGATTTGACCCTGC 1990 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3303 TATTCTAGAGGAGGGACTAGATGTTCAAAGTTGCAATCTGGTTATCAGATTTGATCCTGC 3362 Query 1991 ATCCAACATTTGCAGTTTCATACAGTCTCGTGGGCGTGCTAGAATGCAAAATTCAGATTA 2050 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3363 ATCCAACATTTGCAGTTTCATACAGTCTCGTGGGCGTGCCAGAATGCAAAATTCAGATTA 3422 Query 2051 TTTGATGATGGTGGAAAGCGGAGATCTGTTAACACAATCTCGATTAATGAAATATCTTTC 2110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 3423 TTTGATGATGGTGGAAAGCGGAGATCTGTTAACACAATCTCGGTTAAAAAAATATCTTTC 3482 Query 2111 TGGTGGGAAAAGAATGCGCGAAGAGTCTTTGGATCATTCTCTTGTTCCCTGTCCACCTCT 2170 |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3483 TGGTGGGAAAAGAATGCGTGAAGAGTCTTTGCATCATTCTCTTGTTCCCTGTCCACCTCT 3542 Query 2171 TCCAGATGATTCAGATGAACCACTCTTCCGTGTCGAAAGTACTGGAGCAACTGTAACTCT 2230 ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3543 TCCAGATGATTCAGACGAACTATTCTTCCGTGTCGAAAGTACTGGCGCAACTGTAACTCT 3602 Query 2231 TAGCTCAAGCGTCAGCTTAATATATCATTACTGCTCAAGGCTTCCTTCAGATGAGTACTT 2290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3603 TAGCTCAAGCGTCAGCTTAATATATCATTACTGCTCAAGGCTTCCTTCAGATGAGTACTT 3662 Query 2291 CAAACCAGCCCCTAGATTTGATGTAAACAAGGATCAGGGGAGTTGCACCCTTTACCTTCC 2350 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3663 CAAACCTGCTCCTAGATTTGATGTAAACAAGGATCAGGGGAGTTGTACCCTTTACCTTCC 3722 Query 2351 TAAGAGTTGCCCAGTAAAAGAAGTTAAAGCTGAAGCAAATAATAAAGTGTTAAAACAAGC 2410 |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3723 TAAGAGCTGCCCAGTAAAAGAAGTTAAAGCTCAAGCAAATAATAAAGTGTTAAAACAAAC 3782 Query 2411 TGTCTGTCTTAAAGCTTGCATTCAACTGCACAAAGTTGGAGCTCTAAGTGATCATCTTGT 2470 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3783 TGTCTGTCTTGAAGCTTGCATTCAACTGCACAAAGTTGGAGCTCTAAGTGATCATCTTGT 3842 Query 2471 GCCTGACATGGTTGTGGCGGAAACTGTCTCACAAAAACTCGAGAAAATCCAATATAACAC 2530 ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3843 GCCTGACATGGTTCTGGCGGAAACTGTCGCACAAAAACTCGAGAAAATCCAATATAACCC 3902 Query 2531 AGAGCAGCCATGTTACTTCCCCCCAGAGCTAGTCTCCCAGTTTTCAGCACAGCCGGAGAC 2590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3903 AGAGCAGCCATGTTACTTCCCCCCAGAGCTAGTCTCCCAGTTTTCAGTACAGCCGGAGAC 3962 Query 2591 AACATACCACTTCTACTTAATAAGAATGAAGCCAAACTCTCCAAGAAATTTTCATTTAAA 2650 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3963 AACATACCACTTCTACCTAATAAGAATGAAGCCAAACTCTCAAAGAAATTTTCATTTAAA 4022 Query 2651 CGATGTTTTACTAGGCACCAGAGTTGTGCTTGAAGATGACATTGGGAACACAAGCTTCCG 2710 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 4023 TGATGTTTTACTAGGCACCAGAGTTGTGCTTGAAGATGACATTGGGAACACAGGCTTCCG 4082 Query 2711 GTTGGAAGATCATAGGGGTACAATAGCTGTGACATTGAGTTATGTGGGAGCTTTTCACCT 2770 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4083 GTTGGAAGATCATAAGGGTACAATAGCTGTGACATTGAGTTATGTGGGAGCTTTTCACCT 4142 Query 2771 TACACAAGAAGAGGTCCTTTTCTGTAGAAGATTTCAGATAACTCTATTCCGAGTTCTTTT 2830 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4143 TACACAAGAGGAGGTCCTTTTGTGTAGAAGATTTCAGATAACTCTATTCCGAGTTCTTTT 4202 Query 2831 AGATCACAGTGTGGAAAATTTGATGGAGGCATTGAATGGATTGCATCTCAGAGATGGGGT 2890 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | Sbjct 4203 AGATCACAGTGTGAAAAATTTGATGGAGGCATTGAATGGATTGCTTCTCAGAGACGGGAT 4262 Query 2891 GGCACTTGATTATCTACTAGTTCCATCCACTCATTCACATGAAACATCTCTTATTGATTG 2950 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4263 AGCACTTGATTATCTACTAGTTCCATCCACTCATTCACATGAAACATCTCCTATTGATTG 4322 Query 2951 GGAAGTGATCAGATCCGTGAATCTAACTTCTCATGAGGT-TTTGGAAAAACACGAAAATT 3009 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| Sbjct 4323 GGAAGTGATCAGATCCGTGAATCTAACTTGTCATGA-ATCTTTGGAAAAACACGTAAATT 4381 Query 3010 GTTCTACCAACGGTGCTTCTCGCATTCTACACACAAAAGACGGCTTGTTTTGTACTTGTG 3069 |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4382 GTTCTATCAACGGCGCTTCTCGTATTCTACACACAAAAGACGGCTTGTTTTGTACTTGTG 4441 Query 3070 TCGTACAAAATGCATTGGTTTACACACCACATAATGGATACGTCTACTGCACAAAAGGTG 3129 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | Sbjct 4442 TCGTACAAAATGCATTGGTTTACACACCACATAATGGATACTTCTACTGCACGAAAGGCG 4501 Query 3130 TTCTCAACAATCTAAACGGAAATTCATTATTGACCAAGAGAAATTCTGGCGATCAGACTT 3189 ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4502 TTCTCAACAATATAAATGCAAATTCATTCTTGACGAAGAGAAATTCTGGCGATCAGACTT 4561 Query 3190 ACATTGAGTACTACGAGGAAAGGCATGGGATTCAATTAAATTTTGTGGATGAACCTCTTC 3249 |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4562 ACATAGAGTACTATGAGGAACGGCATGGGATTCAATTAAATTTTGTGGATGAACCTCTTC 4621 Query 3250 TAAATGGAAGACACATTTTCACGTTGCATAGTTATCTTCACATGGCCAAGAAGAAGAAGG 3309 | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| Sbjct 4622 TGAATGGAAGACACATTTTCACGTTGCATAATTATCTTCACATGACCAAGAAGAAAAAGG 4681 Query 3310 AGAAAGAGCATGACAGGGAATTTGTTGAACTACCTCCTGAGCTTTGTCATGTCATTTTGT 3369 ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 4682 AGAAAGAGCATGACAAAGAGTTTGTTGAACTACCTCCTGAACTGTGTCATGTCATTTTGT 4741 Query 3370 CCCCAATATCAGTTGATATGATCTATTCATATACTTTTATCCCATCTGTTATGCAACGCA 3429 ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4742 CCCCAATATCAGTTGATGTGATCTATTCGTATACTTTCATCCCATCTGTTATGCAACGCA 4801 Query 3430 TTGAATCTTTGCTTATAGCATACAACCTGAAGAAAAGCATCCCAAAAGTCAATATTCCAA 3489 |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4802 TTGAATCTTTGCTTATTGCATACAACCTGAAGAAGAGCATCCCAAAAGTCAATATTCCAA 4861 Query 3490 CCATTAAGGTTTTGGAAGCTATTACGACAAAGAAGTGCGAAGATCAGTTCCACTTGGAAT 3549 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| Sbjct 4862 CCATCAAGGTTTTGGAAGCTATAACGACAAAGAAGTGCCAAGATCAGTTTCACTTGGAAT 4921 Query 3550 CACTAGAAACTCTTGGTGACTCTTTTCTGAAATATGCTGTTTGTCAGCAACTATTCCAAC 3609 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4922 CACTAGAAACTCTTGGTGACTCTTTTCTAAAATATGCTGTTTGTCAGCAACTATTCCAAC 4981 Query 3610 ACTGTCATACTCACCATGAGGGTCTTCTTAGCACGAAGAAAGATGGAATGATTTCAAATG 3669 |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4982 ACTGCCATACTCACCATGAGGGTCTTCTTAGCGCGAAGAAAGATGGAATGATTTCAAATG 5041 Query 3670 TCATGCTCTGCCAATTTGGATGTCAGCAGAAACTTCAGGGATTTATCCGCGATGAGTGTT 3729 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 5042 TCATGCTCTGCCAATTTGGATGTCAGCAGAAACTTCAGGGATTTATCCGCAATGAGTGTT 5101 Query 3730 TTGAACCCAAAGGTTGGATGGTTCCAGGTCAATCA-TCTGCAGCTTATTCACTTGTAAAC 3788 ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||| Sbjct 5102 TTGAACCCAAAGGTTGGATGGTTCCTGGTCAA-CATTCTGCAGCTTATGCACTTGTAAAT 5160 Query 3789 GATACTCTACCCGAGTCTAGAAACATATACGTTGCTAGTAGGAGGAATCTGAAACGCAAG 3848 ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct 5161 GATACCCTACCCCAGTCTAGAAACATATACGTTGCTAGCAGGAGGAATTTGAAACGCAAG 5220 Query 3849 AGTGTGGCCGATGTTGTAGAATCATTAATTGGAGCATATCTCAGCGAGGGAGGTGAACTT 3908 |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 5221 AGTGTGGCTGATGTTGTAGAATCACTAATTGGAGCATATCTCAGTGAGGGAGGTGAACTT 5280 Query 3909 GCAGCTTTGATGTTCATGAATTGGGTTGGAATAAAGGTCGACTTT-ACAACTACGAAGAT 3967 | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| Sbjct 5281 GGAGCTTTGATGTTCATGAATTGGGTTGGTATAAAGGTCGA-TTTCACTACTACGAAGAT 5339 Query 3968 CCAGAGAGATTCCCCAATACAAGCAGAGAAGCTTGTGAATGTAGGTTATATGGAGTCGCT 4027 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 5340 CCAGAGAGAGTCCCCAATACAAGCAGAGAAGCTTGTGAATGTAGGTTATATGGAGTCACT 5399 Query 4028 GTTGAATTACAGTTTTGAGGATAAGTCTCTTCTAGTTGAAGCATTGACTCATGGTTCATA 4087 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5400 GTTGAATTACAGTTTTGAGGATAAGTCTCTTCTAGTTGAAGCATTGACTCATGGTTCATA 5459 Query 4088 CATGATGCCTGAAATTCCAAGATGCTATCAGCGGTTGGAGTTCCTCGGTGACTCTGTATT 4147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 5460 CATGATGCCTGAAATTCCAAGATGCTATCAGCGGTTGGAGTTCCTCGGTGACTCGGTATT 5519 Query 4148 GGATTATCTCATAACCAAGCATCTATACGACAAATATCCTTGTCTGTCCCCTGGACTATT 4207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5520 GGATTATCTCATAACCAAGCATCTATACGACAAATATCCTTGTCTGTCTCCTGGACTATT 5579 Query 4208 AACCGACATGCGATCAGCTTCTGTTAACAATGAATGTTATGCCCTAGTGGCGGTGAAAGC 4267 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 5580 AACTGACATGCGATCAGCTTCTGTTAACAATGAATGTTATGCTCTAGTGGCGGTTAAAGA 5639 Query 4268 AAACCTGCACAAACACATCCTGTACGCCTCTCATCATCTCCATAAGCACATCTCTAGAAC 4327 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 5640 AAATCTGCACAAACACATCCTGCACGCCTCTCATGATCTCCACAAGCACATCTCTAGAAC 5699 Query 4328 TGTCAGTGAGTTTGAACAGTCTTCTTTGCAATCCACTTTCGGATGGGAATCCGATATATC 4387 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5700 AGTCAGTGAGTTCGAACAGTCTTCTTTGCAATCCACTTTCGGATGGGAATCCGATATATC 5759 Query 4388 TTTTCCAAAGGTTCTTGGAGATGTGATAGAATCTCTAGCAGGCGCGATATTTGTTGACTC 4447 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5760 TTTTCCTAAGGTTCTTGGAGATGTGATAGAATCTTTAGCAGGCGCGATATTTGTTGACTC 5819 Query 4448 AGGTTACAACAAGGAAGTAGTGTTTGCAAGTATTAAACCACTTTTGGGTTGTATGATAAC 4507 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 5820 AGGTTACAACAAGGAAGTAGTGTTTGCGAGTATTAAACCACTCTTGGGTTGTATGATAAC 5879 Query 4508 TCCAGAGACTGTCAAGTTGCATCCTGTGAGAGAGTTGACAGAATTATGTCAGAAGTGGCA 4567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct 5880 TCCAGAGACTGTCAAGTTGCATCCTGTGAGAGAGTTGACAGAATTATGTCAGAAATCGCA 5939 Query 4568 GTTCGAGTTGAGTAAAGCTAAAGATTTCGATTCTTTCACGGTTGAGGTGAAAGCTAAGGA 4627 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5940 GTTCGAGTTGAGTAAAGCTAGAGATTTCGATTATTTCACGGTTGAGGTGAAAGCTAAGGA 5999 Query 4628 GATGAGTTTTGCTCACACAGCAAAGGCCTCTGATAAGAAAATGGCCAAGAAATTGGCTTA 4687 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6000 AATGAGTTTTGCTCACACAGCAAAGGCCTCTGATAAGAAAATGGCCAAGAAATTGGCTTA 6059 Query 4688 CAAAGAAGTCTTGAACTTACTTAAGAACAGCCTGGACTACTAA 4730 ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||| Sbjct 6060 CAAAGAAGTCTTGAACTTACTTAAGAAGGGCCTTGCCTCCTAA 6102 Score = 839 bits (454), Expect = 0.0 Identities = 494/514 (96%), Gaps = 0/514 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2 ATCACACTTGTACTGTGGATTCTCCAAGACCTCTGCAGAATGCCTGTGGTTTGGTTCGGT 61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1660 ATCACACTTGTACTGTGGATTCTCCAAGACCTCTGCAGAATGCCTGTGGTTTGGTTCGGT 1719 Query 62 TACATGGCATACTTGTTCTATCTCATATTCTTTCCTTGGTTCTCCGGTGAAGTGTTTGCT 121 ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || Sbjct 1720 TACATGGCATACTTGTTGTATCTGATATTCTTTCCTTGGTTCTCCGGTGAAGTGTATACT 1779 Query 122 GATTCTGGAGACAGAGCATACATGACTATTATGGGATGGGTGGTGACGAGCTCAGGCGCA 181 ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1780 GATTCCGGAAACAGAACATACATGACTATTATGGGATGGGTGGTGACGAGCTCAGGCGCA 1839 Query 182 GATAGGAAACATGAATACATTGGACAACCTGATGTAATGGTTGTGGTGATCCCACATGTG 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1840 GATAGGAAACATGAATACATTGGACAACCTGATGTAATGGTTCTGGTGATCCCACATGTG 1899 Query 242 GTCTTTGTTGTTATCCCCAGTGTCTTGGTTGTGTGTTGTCTGGTTGCTGAGAGAGAAATC 301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1900 GTCTTTGTTGTTATCCCCAGTGTCTTGGTTGTGTGTTGTTTGGTTGCTGAGAGAGAAATC 1959 Query 302 TACAAAGATCACATTCGAACTGTCTCTGGTAAGAAAGAGGATGACCATGACCGGGGAAGG 361 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1960 TACAAAGATCACATTCGAACCGTCTCTGGAAAGAAAGAGGATGATCATGACCGGGGAAGG 2019 Query 362 AAGAAGAGATCACAACGCCGCTCACTGTTATTCTCGAACAGAAGACTGTTTCGGAAATCG 421 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2020 AAGAAGAGATCACAACGCCGCTCGCTGTTATTCTCTAACAGAAGACTGTTTCGTAAATCA 2079 Query 422 GTCTTGCTGGCTTCATTAGCTCTATATTGGAAGCATTTCAAGAATTGCTGGGCATTAGGT 481 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2080 CTCTTGGTGGCTTCATTAGCTCTATATTGGAAGCATTTCAAGAATTGCTGGGCATTAGCT 2139 Query 482 AGAGCTTATGAGATGAATGTGGTTCATTTTCCAG 515 |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2140 AGAGCTTATGAGATGAATATGGTTCATTTTCCAG 2173 Score = 431 bits (233), Expect = 3e-119 Identities = 255/265 (96%), Gaps = 3/265 (1%) Strand=Plus/Plus Query 597 ACCACTGATCAAGTCTCTGCTTCTCCTCTACATTTTGCCAGAAGTTATCAGGTAGAGGCA 656 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2185 ACCACTGATCAAGTCTCTGCATCTCCTCTACATTTTGCTAGAAGTTATCAGGTAGAGGCA 2244 Query 657 CTTGAGAAAGCTATCAAGCAGAACACTATTGTCTTCTTGGAGACTGGTTCTGGCAAGACC 716 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2245 CTTGAGAAAGCTATCAAGCACAACACTATTGTCTTCTTTGAGACTGGTTCTGGCAAGACC 2304 Query 717 CTTATTGCTATTATGCTTCTTCGTAGCTA-TGCCTACCTTTTCCGCAAGCCTTCACCATG 775 |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2305 CTTATTGCCATTATGCTTCTTCGTAGCTACT-CCTACCTTTTCCGCAAGCCTTCACCCTG 2363 Query 776 CTTCTGTGTCTTCTTGGTTCCTCAAGTGGTTCTTGTCACTCAGCAAGCAGAAGCCCTGAA 835 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2364 CTTCTGTGTCTTCTTGGTTCCTCAAGTGGTTCTTGTCACTCAGCAAGCAGAAGCCCTGAA 2423 Query 836 GATGCATACTGATCTAAAAGTTGGT 860 |||||||||||||||| |||| ||| Sbjct 2424 GATGCATACTGATCTACAAGT-GGT 2447 Score = 228 bits (123), Expect = 4e-58 Identities = 133/138 (96%), Gaps = 0/138 (0%) Strand=Plus/Plus Query 931 AGGTTCTGGTGATGACCCCTGCCATTTTGCTCGACGCGTTGAGGCATAGTTTTCTGAGCT 990 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || Sbjct 2450 AGGTTCTGGTGATGACCCCTGCCATTTTGCTCGATGCATTGAGGCATAGTTTTCTGAACT 2509 Query 991 TGAGCATGATCAAGGTTCTAATAGTTGATGAGTGTCATCATGCAGGGGGAAAGCACCCTT 1050 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 2510 TGAGCATGATCAAGGTTCTAATAGTTGATGAGTGTCATCATGCTGGGGGAAAGCACCCCT 2569 Query 1051 ATGCTTGTATCATGAGGG 1068 |||||||||||||||||| Sbjct 2570 ATGCTTGTATCATGAGGG 2587 > Ahg903170 jgi|Araly1|903170|Al_scaffold_0003_298 Length=882 Score = 305 bits (165), Expect = 2e-81 Identities = 187/198 (94%), Gaps = 0/198 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2 ATCACACTTGTACTGTGGATTCTCCAAGACCTCTGCAGAATGCCTGTGGTTTGGTTCGGT 61 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 442 ATCACACTTGTACTGTGGATTCTCCAATACCTCTGCAGAATGCCTGTGGTTTGGTTCGGT 501 Query 62 TACATGGCATACTTGTTCTATCTCATATTCTTTCCTTGGTTCTCCGGTGAAGTGTTTGCT 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || Sbjct 502 TACATGGCATACTTGTTCTATCTCATATTCTTTCCTTGGTTCTCGGGTGAAGTGTATACT 561 Query 122 GATTCTGGAGACAGAGCATACATGACTATTATGGGATGGGTGGTGACGAGCTCAGGCGCA 181 ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 562 GATTCCGGAAACAGAACATACATGACTATTATTGGCTGGGTGGTGACAAGCTCAGGCGCA 621 Query 182 GATAGGAAACATGAATAC 199 |||||| ||||||||||| Sbjct 622 GATAGGCAACATGAATAC 639 Score = 145 bits (78), Expect = 4e-33 Identities = 108/121 (89%), Gaps = 8/121 (7%) Strand=Plus/Plus Query 264 TCTTGGTTGTGTGTTGTCTGGTTGCTGAGAGAGAAATCTACAAAGATCACATTCGAACTG 323 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | | || Sbjct 640 TCTTGGTTGTATGTTGTCTGGTTGCTGAGAGAGAGATCTACAAAG---AGA---G-A-TG 691 Query 324 TCTCTGGTAAGAAAGAGGATGACCATGACCGGGGAAGGAAGAAGAGATCACAACGCCGCT 383 ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 692 TCTCTGGTATGAATGAGGATGACCATGACCGGGGAAGGAAGAAGAGATCACAACGCCGCT 751 Query 384 C 384 | Sbjct 752 C 752 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 182562177681 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5