BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G03720.1
Length=2664
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg340533 jgi|Araly1|340533|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000296 2689 0.0
Ahg952171 jgi|Araly1|952171|scaffold_43500001.1 931 0.0
Ahg927928 jgi|Araly1|927928|scaffold_300385.1 595 5e-169
Ahg918707 jgi|Araly1|918707|Al_scaffold_0492_2 363 5e-99
Ahg927883 jgi|Araly1|927883|scaffold_300340.1 255 9e-67
Ahg927846 jgi|Araly1|927846|scaffold_300303.1 228 2e-58
> Ahg340533 jgi|Araly1|340533|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000296
Length=1914
Score = 2689 bits (1456), Expect = 0.0
Identities = 1540/1581 (97%), Gaps = 4/1581 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 604 ATGAACAGTCTTGTGAGAAGAAAACAAGTTGATTCTGTTCATCTTATCAAAAACGATGGA 663
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACAGTCTTGTCAGAAGGAAACAAGTTGATTCTGTTCATCTGATCAAAAACGATGGA 60
Query 664 CCTCATCAGCTTGCCAAGAAACTATCCGCCGTTGATCTTGTTGCTATTGGAGTTGGGACA 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 61 CCTCATCAGCTTGCCAAGAAACTATCCGCCGTTGATCTTGTCGCTATTGGAGTTGGGACA 120
Query 724 ACAATTGGAGCAGGAGTGTATATTCTTGTGGGAACGGTAGCTAGAGAGCACACAGGACCT 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ACAATTGGAGCAGGAGTGTATATTCTTGTGGGAACAGTAGCTAGAGAGCACACAGGACCT 180
Query 784 GCTCTTGCTGTATCATTCTTCATTGCTGGAGTAGCTGCTGCTCTCTCTGCCTGTTGTTAT 843
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 181 GCTCTTGCTGTATCATTCTTCATTGCTGGTGTAGCTGCTGCTCTCTCGGCCTGTTGTTAT 240
Query 844 GCTGAGCTTGCTTCTCGTTGTCCATCTGCTGGGAGTGCTTATCATTATGCGTACATTTGT 903
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 241 GCTGAGCTTGCTTCTCGTTGTCCATCTGCTGGGAGTGCTTATCATTATGCATACATATGT 300
Query 904 CTTGGAGAAGGGATTGCTTGGTTGGTTGGTTGGGCACTGGTGTTGGATTATACAATTGGT 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CTTGGAGAAGGGATTGCTTGGTTGGTTGGTTGGGCGCTGGTGTTGGATTATACAATTGGT 360
Query 964 GGATCAGCCATTGCCCGTGGCATAACTCCAAATCTGGCATCtttttttGGTGGTTTGGAC 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGATCAGCCATTGCCCGTGGCATAACTCCAAATCTGGCATCATTTTTTGGTGGTTTGGAC 420
Query 1024 AATCTTCCTGTGTTCTTAGCTCGACAAACTATACCCGGGGTTGGTATTGTGGTTGATCCA 1083
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AAACTTCCTGTGTTCTTAGCTCGACAAACTATACCCGGGGTTGGTATTGTGGTTGATCCA 480
Query 1084 TGTGCTGCACTTTTGATTATGATTGTCACGATACTACTATGTTTTGGGATAAAGGAGAGT 1143
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGTGCAGCACTTTTGATTATGATTGTCACGATACTACTATGTTTTGGGATAAAGGAGAGT 540
Query 1144 TCAACAGTACAAGCAATTGTAACATCAGTGAATGTTTGCACCTTGGTTTTCATCATAGTA 1203
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TCATTAGTACAAGCAATTGTAACATCAGTGAATGTTTGCACCTTGGTTTTCATCATAGTA 600
Query 1204 GTTGGTGGATATTTAGCTTGCAAGACTGGATGGGTTGGATATGATCTCCCCAGTGGGTAC 1263
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 601 GTTGGTGGATATTTAGCTTGCAAGACCGGATGGGTTGGATATGATCTTCCGAGTGGGTAT 660
Query 1264 TTTCCTTTTGGACTAAATGGGATACTTGCCGGATCTGCTGTAGTATTCTTCTCATACATT 1323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TTTCCTTTTGGACTAAATGGGATACTTGCCGGATCTGCTATAGTATTCTTCTCATACATT 720
Query 1324 GGATTTGATACTGTAACTAGTACGGCTGAGGAGGTGAAAAATCCTCAAAGGGATCTTCCA 1383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GGATTTGATACTGTAACTAGTACGGCTGAGGAGGTGAAAAATCCTCAAAGGGATCTTCCA 780
Query 1384 TTGGGAATCGGGATTGCATTACTGATATGCTGCATTTTGTATATGCTTTTATCAGTAGTT 1443
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TTGGGAATCGGGATTGCATTACTGATATGCTGCATTTTATATATGCTTTTATCAGTAGTT 840
Query 1444 ATTGTTGGATTGGTCCCATACTATTCATTGAATCCTGATACTCCTATCTCCTCTGCATTT 1503
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 ATTGTTGGATTAGTCCCATACTATTCATTGAATCCTGATACTCCTATCTCCTCTGCATTT 900
Query 1504 GGAGACAGTGGGATGCAATGGGCAGCGTACATCTTAACCACTGGGGCAATAACTGCTCTA 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GGAGACAGTGGGATGCAATGGGCAGCGTACATCTTAACCACTGGGGCAATAACTGCTCTA 960
Query 1564 TGTGCGAGTTTGTTGGGTTCCCTTCTGGCTCAGCCACGAATATTCATGGCAATGGCTAGG 1623
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 961 TGCGCGAGTTTGTTGGGTTCCCTTCTGGCTCAGCCACGAATTTTCATGGCAATGGCTAGG 1020
Query 1624 GATGGATTGTTGCCAGCTTTCTTTTCAGAAATTAGCCCACGAACTCAAGTACCAGTGAAA 1683
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GATGGATTGTTGCCGGCTTTCTTTTCAGAAATTAGCCCACGAACTCAAGTACCAGTGAAA 1080
Query 1684 AGCACAATAGCTATTGGTGTTCTTGCCGCTGCACTCGCATTTTTCATGGATGTTGCACAG 1743
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 AGCACAATAGCTATTGGTGTGCTTGCCGCTGCACTCGCATTTTTCATGGATGTTGCACAG 1140
Query 1744 TTGTCCGAGATGGTTAGTGTAGGCACTCTAATGGCATTCACTGCCGTTGCAGTC-TGTGT 1802
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 1141 TTGTCCGAAATGGTTAGTGTAGGCACTCTAATGGCATTCACTGCCGTTGCAG-CATGTGT 1199
Query 1803 GCTAGTTCTTAGATATGTACCACCAGATGGAGTTCCCCTATCATCTTCCTCCCAAACTTT 1862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1200 GCTAGTTCTTAGATATGTACCACCAGATGGAGTTCCCCTATCATCTTCCTCTCAAACTTT 1259
Query 1863 GAGTGATACCGATGAAAGTAGAGCTGAAACTGAAAATTTTCTTGTGGATGCTATAGAATC 1922
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GAGTGATACCGATGAAAGTGGAGCTGAAACTGAAAATTTTCTTGTGGATGCTATAGAATC 1319
Query 1923 TTCTGATTCCCCTCTACTTGGAAATGAAACTGCTCGAGATGAAAAGTATTTTGGAAAGAG 1982
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 TTCTGATTCCCCTCTACTTGGCAATGAAACTGCACGAGATGAAAAGTATTTTGGAAAGAG 1379
Query 1983 GAGAAAAATTGC-TGCCTGGAGTATAGCTCTTGTGTGCATAGGTGTCCTAGGTCTTGCTT 2041
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1380 AAGAAAAATTGCGT-CCTGGAGTATAGCTCTTGTGTGCATAGGTGTGCTAGGTCTTGCTT 1438
Query 2042 CAGCAGCTTCAGCTGAGCGTCTTCCAAGTTTTCCTCGTTTCACTATATGTGGTGTCAGTG 2101
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 CAGCAGCTTCGGCTGAGCGTCTTCCAAGTTTTCCTCGGTTCACTATATGTGGTGTCAGTG 1498
Query 2102 CAGTCATCTTGCTTGGCAGTTTGATTACTCTTGGCTACATTGACGAGGATGAAGAAAGGC 2161
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1499 CCGTCATCTTGCTTGGCAGTTTGATTACTCTTGGCTACATCGACGAGGATGAAGAAAGGC 1558
Query 2162 ACAACTTTGGACACAAAGGAG 2182
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 ACAACTTTGGACACAAAGGAG 1579
Score = 396 bits (214), Expect = 5e-109
Identities = 236/247 (96%), Gaps = 0/247 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2182 GGGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATTTTGATCAACACCTAC 2241
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1664 GGGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATATTGATCAACACCTAC 1723
Query 2242 TTGATCATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGATATGGCTACTTATTGGA 2301
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1724 TTGATCATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGGTATGGCTACTTATTGGA 1783
Query 2302 AGCATGATCTATATCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTACGTT 2361
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1784 AGCATGATCTATCTCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTGCGTT 1843
Query 2362 CCCACAATGACTTGTACGAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGATCAAT 2421
|| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1844 CCAAGGACGACTTGTACCAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGTTCAAT 1903
Query 2422 GCTGCAG 2428
|| ||||
Sbjct 1904 GCAGCAG 1910
> Ahg952171 jgi|Araly1|952171|scaffold_43500001.1
Length=1105
Score = 931 bits (504), Expect = 0.0
Identities = 562/590 (95%), Gaps = 4/590 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1865 GTGATACCGATGAAAGTAGAGCTGAAACTGAAAATTTTCTTGTGGATGCTATAGAATCTT 1924
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTGATACCGATGAAAGTGGAGCTGAAACTGAAAATTTTCTTGTGGATGCTATAGAATCTT 578
Query 1925 CTGATTCCCCTCTACTTGGAAATGAAACTGCTCGAGATGAAAAGTATTTTGGAAAGAGGA 1984
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 579 CTGATTCCCCTCTACTTGGCAATGAAACTGCACGAGATGAAAAGTATTTTGGAAAGAGAA 638
Query 1985 GAAAAATTGCTG-CCTGGAGTATAGCTCTTGTGTGCATAGGTGTCCTAGGTCTTGCTTCA 2043
|||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 639 GAAAAATTGC-GTCATGGAGTATAGCTCTTGTGTGCATAGGTGTGCTAGGTCTTGCTTCA 697
Query 2044 GCAGCTTCAGCTGAGCGTCTTCCAAGTTTTCCTCGTTTCACTATATGTGGTGTCAGTGCA 2103
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 698 GCAGCTTCGGCTGAGCGTCTTCCAAGTTTTCCTCGGTTCACTATATGTGGTGTCAGTGCC 757
Query 2104 GTCATCTTGCTTGGCAGTTTGATTACTCTTGGCTACATTGACGAGGATGAAGAAAGGCAC 2163
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 758 GTCATCTTGCTTGGCAGTTTGATTACTCTTGGCTACATCGACGAGGATGAAGAAAGGCAC 817
Query 2164 AACTTTGGACACAAAGGAGGGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGC 2223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 AACTTTGGACACAAAGGAGGGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGC 877
Query 2224 ATTTTGATCAACACCTACTTGATCATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTG 2283
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 878 ATATTGATCAACACCTACTTGATCATCAACATTGG--CTGGGACATGGATCAGGGTCTTG 935
Query 2284 ATATGGCTACTTATTGGAAGCATGATCTATATCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTG 2343
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 936 GTATGGCTACTTATTGGAAGCATGATCTATCTCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTG 995
Query 2344 AACAATGCGGTTTACGTTCCCACAATGACTTGTACGAGAAAAACAACAGATCATCTTGCT 2403
||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 996 AACAATGCGGTTTGCGTTCCAAGGACGACTTGTACCAGAAAAACAACAGATCATCTTGCT 1055
Query 2404 TAAGATTGGTGGATCAATGCTGCAGTTAAAGGGACTCGAGCTCAAGCTTT 2453
|||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||
Sbjct 1056 TAAGATTGGTGGTTCAATGCAGCAGCTGAAGGGAGTCGAGCTCAAGCTTT 1105
> Ahg927928 jgi|Araly1|927928|scaffold_300385.1
Length=506
Score = 595 bits (322), Expect = 5e-169
Identities = 366/387 (95%), Gaps = 4/387 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2068 AGTTTTCCTCGTTTCACTAT-ATGTGGTGTCAGTGCAGTCATCTTGCTTGGCAGTTTGAT 2126
||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 AGTTTTCCTCGGTTCACTGTGA-GTGGTGTCAGTGCAGTCATCTTGCTTGGCAGTTTGAT 181
Query 2127 TACTCTTGGCTACATTGACGAGGATGAAGAAAGGCACAACTTTGGACACAAAGGAGGGTT 2186
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 182 TACTCTTGGCTACATCGACGAGGATGAAGAAAGGCACAACTTTGAACACAAAGGAGGGTT 241
Query 2187 TCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATTTTGATCAACACCTACTTGAT 2246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 242 TCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATATTGATCAACACCTACTTGAT 301
Query 2247 CATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGATATGGCTACTTATTGGAAGCAT 2306
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 CATCAACATTGG--CTGGGACATGGATCAGGGTCTTGGTATGGCTACTTATTGGAAGCAT 359
Query 2307 GATCTATATCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTACGTTCCCAC 2366
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 360 GATCTATCTCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTACGTTCCAAG 419
Query 2367 AATGACTTGTACGAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGATCAATGCTGC 2426
| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 420 GACGACTTGTACCAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGTTCAATGCAGC 479
Query 2427 AGTTAAAGGGACTCGAGCTCAAGCTTT 2453
|| | |||||| |||||||||||||||
Sbjct 480 AGCTGAAGGGAGTCGAGCTCAAGCTTT 506
> Ahg918707 jgi|Araly1|918707|Al_scaffold_0492_2
Length=402
Score = 363 bits (196), Expect = 5e-99
Identities = 231/246 (94%), Gaps = 9/246 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 2183 GGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATTTTGATCAACACCTACT 2242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 162 GGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATATTGATCAACACCTACT 221
Query 2243 TGATCATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGATATGGCTACTTATTGGAA 2302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 222 TGATCATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGGTATGGCTACTTATTGGAA 281
Query 2303 GCATGATCTATATCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTACGTTC 2362
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 GCATGATCTATCTCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTAC---- 337
Query 2363 CCACAATGACTTGTACGAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGATCAATG 2422
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 338 --AC---GACTTGTACCAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGTTCAATG 392
Query 2423 CTGCAG 2428
| ||||
Sbjct 393 CAGCAG 398
> Ahg927883 jgi|Araly1|927883|scaffold_300340.1
Length=1078
Score = 255 bits (138), Expect = 9e-67
Identities = 217/254 (85%), Gaps = 10/254 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 95 ACAAGAAA-G-GA-GATGACAAGAATAACTGGAAAGTGATTCAACCTTT-AATGAATCAA 150
|||| ||| | || |||||||| |||| |||||||||| || ||||||| || ||| |||
Sbjct 511 ACAAAAAAGGAGATGATGACAACAATAGCTGGAAAGTGCTTGAACCTTTGAA-GAAACAA 569
Query 151 CGATGCGTGGATATGGTGTGTAAAGAAAGCAAGCTTTACGTGCTTACTGATACTC-ACGT 209
| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||
Sbjct 570 CAATACGTAGATATGGTGTGTAAAGAAAGCAAGCTTTACGTGCTTAGTGATACTCGA-GT 628
Query 210 CACTGTTCTTGATTTCTCCCACGCTGATGCTTCTCCAATACAATGTGCAAGTTTCAAATC 269
|||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 629 CACTGTTCTTGATTTCTCCCGTGATGATTCTCCTCCAATAAAATGTGCAAGTTTCAAATC 688
Query 270 TCCGAATTATGGTAATGATTCGTTTTGCGGCAAGAATCTTGCTGTGACTTTGTCAGGACA 329
|| | ||||| | | |||||| | || ||||||||||| |||||||||||| | |||
Sbjct 689 TCTGGATTATCCT--T-ATTCGTCTCACGACAAGAATCTTGTTGTGACTTTGTCTGTACA 745
Query 330 AGTTTTGATCGTTA 343
||||||||||||||
Sbjct 746 AGTTTTGATCGTTA 759
> Ahg927846 jgi|Araly1|927846|scaffold_300303.1
Length=247
Score = 228 bits (123), Expect = 2e-58
Identities = 154/167 (92%), Gaps = 9/167 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 2257 GGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGATATGGCTACTTATTGGAAGCATGATCTATATC 2316
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 87 GGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGGTATGGCTACTTATTGGAAGCATGATCTATCTC 146
Query 2317 TTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTACGTTCCCACAATGACTTGT 2376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 147 TTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTAC------AC---GACTTGT 197
Query 2377 ACGAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGATCAATGC 2423
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 198 ACCAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGTTCAATGC 244
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 100482066310
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5