BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G03940.1
Length=2862
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg927930 jgi|Araly1|927930|scaffold_300387.1 3760 0.0
Ahg488686 jgi|Araly1|488686|fgenesh2_kg.6__1820__AT5G18190.2 2314 0.0
Ahg340491 jgi|Araly1|340491|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000254 1122 0.0
Ahg340552 jgi|Araly1|340552|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000315 833 0.0
> Ahg927930 jgi|Araly1|927930|scaffold_300387.1
Length=2149
Score = 3760 bits (2036), Expect = 0.0
Identities = 2110/2146 (98%), Gaps = 3/2146 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 353 TTTTGCATGGAGTAAGAATGCCAGAGTTAAGAAGTGGAGCAAGGAGATCGAGACGCCTTG 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 TTTTGCATGGAGTAAGAATGCCAGAGTTAAGAAGTGGAGCAAGGAGATCGAGACGCCTTG 63
Query 413 ACGAGCAGCCTAACCCTCCGCTAGTTGAACAAGCAGAAAATATCGTACTTCCTCCTCAGA 472
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 64 ACGAGCAGCCTAACCCTCAGCTAGTTGAACAAGCAGAAAATATTGTACTTCCTCCTCAGA 123
Query 473 CTGCAACAAGGAGAAGAGGTGGTGGTAGAGGAAGGGGGAATGCTGCTTTAGCTAAAGGTG 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 124 CTGCAACAAGGAGAAGAGGTGGTGGTAGAGGAAGGGGGAATGCTGCTTTAGCTAAAGCTG 183
Query 533 CGGCACCTCCAAGACCAACTGCTGCCGGTAGGGGCAGGGGTATCAGGTTGACAGACTTAG 592
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 184 CGCCACCTCCAAGACCAACTGCTGCCGGTAGGGGCAGGGGTATCAGGTTGACTGACTTAG 243
Query 593 AGCCAGAACCTTGTGAGGTTCGTCCAGCTGCA-G-G-TGCTATAGGGGCCACTGAACCTG 649
|||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 AGCCAGAACCTTGTGAGGTTCGTCCAGCTGCAGGTGCTGCTATAGGGGCCACTGAACCTG 303
Query 650 CCTTAAATCGAGTTGAAGGGGTAGCTGATAAGGATATTGCTGCGGAAGGCGGTAGCGCAG 709
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 CCTTAAATCGAGTTGAAGGGGTCGCTGATAAGGATATTGCTGCGGAAGGCGGTAGCGCAG 363
Query 710 AGAAAGTAGTAGGCATGGAAGAAGATTCCAGCATGGGTCCAGTCCCTGAGAGGGTACAAG 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 364 AGAAAGTAGTAGGCATGGAAGAAGATTCCAGCATGGGTCCAGTCCCTGAAAGGGTACAAG 423
Query 770 TTGGAAATTCTCCTGTTTATAAGACGGAGAGGAAACTTGGTAAAGGTGGCTTTGGTCAAG 829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 424 TTGGAAATTCTCCTGTTTATAAGACGGAGAGGAAACTTGGTAAGGGTGGCTTTGGTCAAG 483
Query 830 TTTATGTTGGCAGAAGGGTGAGTGGTGGCAGTGATAGGATTGGAGCAGATGCAATTGAGG 889
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 TTTATGTTGGCAGAAGGGTGAGTGGGGGCAGTGATAGGATTGGAGCAGATGCAATTGAGG 543
Query 890 TAGCTCTAAAACTTGAACATCGCAATAGTAAAGGCTGTAACTTTGGCCCACCTTACGAGT 949
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 544 TAGCTCTGAAACTTGAACATCGAAATAGTAAAGGCTGTAATTTTGGCCCACCTTACGAGT 603
Query 950 GGCAAGTGTACAATACGCTCAATAGCTGTTATGGAATTCCTGCTGTACATCATAAGGGTC 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 GGCAAGTGTACAATACGCTCAATAGCTGTTATGGAATTCCTGCTGTACATCATAAGGGTC 663
Query 1010 GTCAAGGAGATTTTTACATTCTGGTCATGGACATGCTTGGGCCTAGCCTTTGGGATGTTT 1069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GTCAAGGAGATTTTTACATTCTGGTCATGGACATGCTTGGGCCTAGCCTTTGGGATGTTT 723
Query 1070 GGAATTCTTTGGCTCAATCGATGTCTCCAAACATGGTAGCATGCATTGCAGTGGAGGCGA 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 GGAATTCTTTGGCTCAATCGATGTCTCCAAACATGGTAGCATGCATTGCAGTGGAGGCGA 783
Query 1130 TATCTATTCTTGAAAAACTGCATATGAAGGGGTTTGTGCATGGAGATGTGAAACCAGAAA 1189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 TATCTATTCTTGAAAAACTGCATATGAAGGGGTTTGTGCATGGAGATGTGAAACCAGAAA 843
Query 1190 ACTTTTTGCTTGGTCAGCCTGGAACAGCAGACGAGAAGAAACTATACCTTATCGATCTTG 1249
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 ACTTTTTACTTGGTCAGCCTGGAACAGCAGACGAGAAGAAACTATACCTTATCGATCTTG 903
Query 1250 GTCTAGCATCAAGATGGAAAGATTCACACTCTGGCCAGCATGTTGAATATGATCAAAGGC 1309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 904 GTCTAGCATCAAGATGGAAAGATTCACACTCTGGCCAGCATGTTGAATATGATCAAAGGC 963
Query 1310 CAGATGTATTTAGAGGAACAATAAGGTATGCAAGTTGCCATGCACATCTTGGTCGTACAG 1369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 964 CAGATGTATTTAGAGGAACAATAAGGTATGCAAGTTGTCATGCACATCTTGGTCGGACAG 1023
Query 1370 GAAGTCGGAGGGATGATCTGGAGTCATTGGCTTATACATTAATATTTCTGATGCGGGGAA 1429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1024 GAAGTCGGAGGGATGATCTGGAGTCATTGGCTTATACATTAATATTTTTGATGCGGGGAA 1083
Query 1430 GGTTGCCATGGCAAGGATACCAGGGTGATAACAAGAGCTTTCTTGTTTGCAAGAAAAAGA 1489
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1084 GGTTGCCATGGCAAGGGTACCAGGGTGACAACAAGAGCTTTCTTGTTTGTAAGAAAAAGA 1143
Query 1490 TGTCAACCTCTCCTGAATTGATGTGTTGTTTTTGTCCTCCCCCGTTTAAGCTGTTCCTCG 1549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144 TGTCAACCTCTCCTGAATTGATGTGTTGTTTTTGTCCTCCCCCGTTTAAGCTGTTCCTCG 1203
Query 1550 AGGCAGTTACGAATATGAAGTTTGATGAGGAGCCCAACTATGCCAAGCTTATCTCGATTT 1609
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204 AGGCAGTTACTAATATGAAGTTTGATGAGGAGCCCAACTATGCCAAGCTTATCTCGATTT 1263
Query 1610 TTGATACTCTTATCGAGCCATGTGCTATATCTAGACCAATTAGAATTGATGGGGCTCTAA 1669
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1264 TTGATACTCTTATCGAGCCATGTGCTATATCTAGACCAATTAGAATTGATGGGGCTCTTA 1323
Query 1670 AGGTTGGCCAAAAGCGAGGAAGATTGCTTATCAATTTGGAAGAGGATGAACAGCCAAGGA 1729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 AGGTTGGCCAAAAGCGAGGAAGATTGCTTATCAATTTGGAAGAGGATGAACAGCCAAGGA 1383
Query 1730 AGAAAATTAGAATCGGCAGTCCTGCCACACAGTGGATTTCAGTCTATAATGCACGCCGTC 1789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384 AGAAAATTAGAATCGGCAGTCCTGCCACACAGTGGATTTCAGTCTATAATGCACGCCGTC 1443
Query 1790 CTATGAAACAGAGATATCATTACAACGTTGCAGACTTAAGACTTGCACAGCATGTTGAGA 1849
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444 CTATGAAACAGAGATATCATTACAATGTTGCAGACTCAAGACTTGCACAGCATGTTGAGA 1503
Query 1850 AAGGTAATGAGGATGGCCTTTTCATAAGCTGTGTAGCATCATCAGCTAATCTCTGGGCCA 1909
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1504 AAGGTAACGAGGATGGCCTTTTCATAAGCTGTGTAGCATCAGCAGCTAATCTCTGGGCCA 1563
Query 1910 TCATCATGGATGCTGGGACTGGTTTCAGTTCTCAAGTTTATGAACTGTCCTCAGTCTTCC 1969
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1564 TCATCATGGATGCTGGGACTGGTTTCAGTTCTCAAGTTTATGAACTGTCCTCGGTCTTCC 1623
Query 1970 TGCACAAGGACTGGATCATGGAACAATGGGAAAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTG 2029
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624 TGCACAAGGACTGGATTATGGAACAATGGGAAAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTG 1683
Query 2030 GTGCAAATAATGGAAGCTCGTTGGTTGTTATGGCTAAAGGAACTCCTTATACCCAGCAAT 2089
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684 GTGCAAATAATGGGAGCTCGTTGGTTGTTATGGCTAAAGGAACTCCTTATACCCAGCAAT 1743
Query 2090 CTTACAAAGTCAGCGACTCATTTCCATTCAAGTGGATAAATAAAAAGTGGAAAGAAGGTT 2149
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1744 CATACAAAGTCAGCGACTCATTTCCATTCAAGTGGATAAATAAAAAGTGGAAAGAAGGTT 1803
Query 2150 TTCATGTAACATCCATGACCACCGCTGGGAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGGAACT 2209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804 TTCATGTAACATCCATGACCACCGCTGGGAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGGAACT 1863
Query 2210 CAGGCTACTCTGAACAGGTGGTGGAGCTTGACTTCTTGTACCCAAGTGAAGGAATACATC 2269
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1864 CGGGCTACTCTGAACAGGTGGTGGAGCTTGACTTTTTGTACCCAAGTGAAGGAATACATC 1923
Query 2270 GAAGGTGGGAAAGTGGATACAGGATAACATCAATGGCTGCAACAGCTGATCAAGCAGCTC 2329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 GAAGGTGGGAAAGTGGATACAGGATAACATCAATGGCTGCAACAGCTGATCAAGCAGCTC 1983
Query 2330 TTATATTGAGTATACCTAAACGAAAAATAACCGATGAAACCCAAGAGACTCTCCGGACTT 2389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1984 TTATATTGAGTATACCTAAACGAAAAATAACCGATGAAACCCAAGAGACTCTCCGCACTT 2043
Query 2390 CTGCCTTCCCAAGTACCCATGTCAAGGAGAAATGGGCGAAAAATCTGTACATTGCATCAA 2449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2044 CTGCCTTCCCAAGTACCCATGTCAAGGAGAAATGGGCAAAAAATCTGTACATTGCATCAA 2103
Query 2450 TATGCTATGGTCGGACAGTTTGCTGATGAAACATGGAGTATACTGT 2495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2104 TATGCTATGGTCGGACAGTTTGCTGATGAAACATGGAGTATACTGT 2149
> Ahg488686 jgi|Araly1|488686|fgenesh2_kg.6__1820__AT5G18190.2
Length=2632
Score = 2314 bits (1253), Expect = 0.0
Identities = 1887/2187 (86%), Gaps = 68/2187 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 309 TCTGGTTAATCTAAAGAGG-TGACCGAAAG-AAGAAAAC-TT-TTACGT-TTTGCATGGA 363
|||||||| | |||||||| | |||||||| || || || || |||| | |||| |||||
Sbjct 266 TCTGGTTAGT-TAAAGAGGTTTACCGAAAGCAA-AATACTTTCTTAC-TCTTTGTATGGA 322
Query 364 GTAAGAATGCCAGAGTTAAGAAGTGGAGCAAGGAGATCGAGACGCCTTGACGAGCAGCCT 423
||||||||||||||| ||||||||||||| | | | ||| |||| || || |||
Sbjct 323 GTAAGAATGCCAGAGCTAAGAAGTGGAGC-A--CG-T--AGA----TTGA-GA-CAACCT 370
Query 424 AACCCTCCGCTAGTTGAACAAGCAGAAAATATCGTACTTCCTCCTCAGACTGCAACAAGG 483
| ||||| | || || || || || ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 371 AGCCCTCAGGTAACTGGTCAGGCGGATAATATTGAACTTCCTCCTCAGCCTGTAACAAGG 430
Query 484 AGAAGA---GGTGGTGGTAGAGGAAGGGGGAATGCTGCTTTAGCTAAAGGTGCGGCACCT 540
|||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||||
Sbjct 431 AGAAGAGGTGGTGGTGGTAGAGGAAGGGGAAACGCTGC---AGCCAAAGGTGCTGCACCT 487
Query 541 CCAAGACCAAC---TGCTGCCGGTAGGGG-CAGGGGTATCAGGTTGACAGACTTAGAGCC 596
|||||||| || || |||||||||||| | | || |||||||| | ||| |||||| |
Sbjct 488 CCAAGACCCACTGGTGGTGCCGGTAGGGGTC-GAGGCATCAGGTTAATAGATTTAGAGGC 546
Query 597 AGAACCTTGTGAGGTTCGTCCAGCTGCAGGTGCTATAGGGGCCACTGAACCTGCCTTAAA 656
|||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||||| || ||
Sbjct 547 AGAACCTTGTGAGGTTCGTCCA---GCA---G---TA--GG----TGAACCTGCTTTTAA 591
Query 657 TCGAGTTGAAGGGGTAGCTGATAAGGATATTGCTGCGGAAGGCGGTAGCGCAGAGAAAG- 715
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||
Sbjct 592 TCAAGTTGAAGGAGTAGCTGATAAGGATATTGCTATGGAAGGTGGTAGCGCAGAG-AAGA 650
Query 716 TAGTAGGCATGGAAGAAGATTCCAGCATGGGTCCAGTCCCTGAGAGGGTACAAGTTGGAA 775
|||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 651 TAGTTGGTGTGGAAGAAGATTCTAGCACAGCTCCAGTCCCTGAAAGGGTACAAGTCGGAA 710
Query 776 ATTCTCCTGTTTATAAGACGGAGAGGAAACTTGGTAAAGGTGGCTTTGGTCAAGTTTATG 835
|||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 711 ATTCTCCTGTATATAAGACTGAGAGGAAACTCGGTAAAGGAGGCTTTGGTCAAGTTTTTG 770
Query 836 TTGGCAGAAGGGTGAGTGGTGGCAGTGATAGGATTGGAGCAGATGCAATTGAGGTAGCTC 895
| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |
Sbjct 771 TAGGTAGAAGGGTGAGTGGTGGCAGCGATAGAATTGGGGCCGATGCAATTGAGGTGGCCC 830
Query 896 TAAAACTTGAACATCGCAATAGTAAAGGCTGTAACTTTGG-CCCACCTTACGAGTGGCAA 954
| ||| |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||||
Sbjct 831 TGAAATTTGAGCATCGAAATAGCAAAGGCTGCAATTTTGGTCCC-CCTTATGAGTGGCAA 889
Query 955 GTGTACAATACGCTCAATAGCTGTTATGGAATTCCTGCTGTACATCATAAGGGTCGTCAA 1014
||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 890 GTGTACAATACTCTCAATGGTTGCTATGGAGTTCCTGCGGTACATCATAAGGGTCGTCAA 949
Query 1015 GGAGATTTTTACATTCTGGTCATGGACATGCTTGGGCCTAGCCTTTGGGATGTTTGGAAT 1074
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||
Sbjct 950 GGAGATTTTTACATTCTTGTCATGGACATGCTTGGTCCAAGTCTCTGGGATGTTTGGAAT 1009
Query 1075 TCTTTGGCTCAATCGATGTCTCCAAACATGGTAGCATGCATTGCAGTGGAGGCGATATCT 1134
|||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||
Sbjct 1010 TCTTCGGGGCAATCGATGTCTCCAAACATGGTAGCCTGCATTGCAGTTGAGTCCATATCT 1069
Query 1135 ATTCTTGAAAAACTGCATATGAAGGGGTTTGTGCATGGAGATGTGAAACCAGAAAACTTT 1194
|||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1070 ATTCTTGAGAAACTTCATATGAAAGGGTTTGTCCACGGAGATGTGAAGCCGGAAAACTTT 1129
Query 1195 TTGCTTGGTCAGCCTGGAACAGCAGACGAGAAGAAACTATACCTTATCGATCTTGGTCTA 1254
|| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 TTACTCGGTCAACCGGGAACAGCAGATGAGAAAAAACTCTACCTTATCGATCTTGGTCTG 1189
Query 1255 GCATCAAGATGGAAAGATTCACACTCTGGCCAGCATGTTGAATATGATCAAAGGCCAGAT 1314
||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1190 GCATCAAAATGGAAAGAGT--CA----GGCCTGCATGTTGAATATGATCAAAGACCTGAT 1243
Query 1315 GTATTTAGAGGAACAATAAGGTATGCAAGTTG-CCATGCACATCTTGGTCGTACAGGAAG 1373
|| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||
Sbjct 1244 GTGTTCAGGGGAACGATAAGGTATGCAAG-TGTTCATGCGCATCTAGGTCGAACTGGAAG 1302
Query 1374 TCGGAGGGATGATCTGGAGTCATTGGCTTATACATTAATATTTCTGATGCGGGGAAGGTT 1433
| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || |||||| ||
Sbjct 1303 TAGGAGAGATGATCTGGAGTCGTTGGCTTATACTTTAGTTTTTCTCTTGAAGGGAAGATT 1362
Query 1434 GCCATGGCAAGGATACCAGGGTGATAACAAGAGCTTTCTTGTTTGCAAGAAAAAGATGTC 1493
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1363 GCCATGGCAAGGATATCAGGGTGACAACAAGAGCTTTCTTGTCTGCAAGAAAAAGATGTC 1422
Query 1494 AACCTCTCCTGAATTGATGTGTTGTTTTTGTCCTCCCCCGTTTAAGCTGTTCCTCGAGGC 1553
||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1423 AACGTCTCCTGAATTGATGTGCTGTTTTTGTCCACCCCCGTTTAAGCTATTCCTCGAGGC 1482
Query 1554 AGTTACGAATATGAAGTTTGATGAGGAGCCCAACTATGCCAAGCTTATCTCGATTTTTGA 1613
|||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1483 AGTTACTAATATGAAGTTTGACGAAGAGCCCAACTATGCAAAGCTTATTTCGATTTTTGA 1542
Query 1614 TACTCTTATCGAGCCATGTGCTA-TATCTAGACCAATTAGAATTGATGGGGCTCTAAAGG 1672
| ||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1543 TTCTCTTATTGAACCATGTGC-ACTATCTAGACCAATTAGAATTGATGGGGCTCTTAAGG 1601
Query 1673 TTGGCCAAAAGCGAGGAAGATTGCTTATCAATTTGGAAGAGGATGAACAGCCAAGGAAGA 1732
|||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1602 TTGGGCAAAAACGAGGAAGATTGCTTCTTAATTTGGAAGAGGATGAACAGCCAAAGAAGA 1661
Query 1733 AAATTAGAATCGGCAGTCCTGCCACACAGTGGATTTCAGTCTATAATGCACGCCGTCCTA 1792
|||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 1662 AAATCAGAATTGGCAGTCCTGCTTGTCAGTGGATCTCAGTCTATAATGCTCGTCGTCCCA 1721
Query 1793 TGAAACAGAGATATCATTACAACGTTGCAGACTTAAGACTTGCA-CAGCATGTTGAGAAA 1851
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||
Sbjct 1722 TGAAACAGAGATATCACTACAACGTTGCAGACTCAAGGC-TGCACCAGCATGTACAGAAG 1780
Query 1852 GGTAATGAGGATGGCCTTTTCATAAGCTGTGTAGCATCATCAGCTAATCTCTGGGCCATC 1911
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1781 GGTAATGAGGATGGCCTTTTAATTAGCTGTGTAGCATCAGCAGCTAATCTCTGGGCCCTC 1840
Query 1912 ATCATGGATGCTGGGACTGGTTTCAGTTCTCAAGTTTATGAACTGTCCTCAGTCTTCCTG 1971
|| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||
Sbjct 1841 ATAATGGATGCCGGGACTGGATTCAGCTCTCAAGTTTATGAATTGTCGGCGGTCTTCCTT 1900
Query 1972 CACAAGGACTGGATCATGGAACAATGGGAAAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTGGT 2031
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1901 CACAAGGACTGGATTATGGAACAATGGGAAAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTGGT 1960
Query 2032 GCAAATAATGGAAGCTCGTTGGTTGTTATGGCTAAAGGAAC-TCCTTATACCCAGCAATC 2090
| | |||| || |||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||| ||||||||
Sbjct 1961 GGAGATAACGGGAGCTCGTTAGTTGTTATGTCAAAAGGAACGT-CTTATACTCAGCAATC 2019
Query 2091 TTACAAAGTCAGCGACTCATTTCCATTCAAGTGGATAAATAA-AAAGTGGAAAGAAGGTT 2149
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||
Sbjct 2020 TTACAAAGTCAGCGACTCATTCCCTTTCAAGTGGATAAATAAGAAA-TGGAAAGAAGATT 2078
Query 2150 TTCATGTAACATCCATGACCACCGCTGGGAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGGAACT 2209
||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2079 TTCATGTGACCTCCATGACAACTGCTGGGAATCGTTGGGGTGTAGTAATGTCGAGGAATT 2138
Query 2210 CAGGCTACTCTGAACAGGTGGTGGAGCTTGACTTCTTGTACCCAAGTGAAGGAATACATC 2269
| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||
Sbjct 2139 CTGGCTTCTCTGATCAGGTCGTGGAGCTCGACTTTTTGTACCCAAGCGATGGAATACATA 2198
Query 2270 GAAGGTGGGAAAGTGGATACAGGATAACATCAATGGCTGCAACAGCTGATCAAGCAGCTC 2329
| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 2199 GGAGGTGGGAAAGTGGGTATAGGATAACATCAATGGCAGCAACTGCAGATCAAGCAGCT- 2257
Query 2330 TT-ATATTGAGTATACCTAAACGAAAAATAACCGATGAAACCCAAGAGACTCTCCGGACT 2388
|| ||||| || |||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||| || || ||
Sbjct 2258 TTCATATTAAGCGTACCAAAACGTAAAATGATGGATGAAACTCAAGAGACCCTTCGCACC 2317
Query 2389 TCTGCCTTCCCAAGTACCCATGTCAAGGAGAAATGGGCGAAAAATCTGTACATTGCATCA 2448
||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2318 ACTGCCTTTCCAAGCACTCATGTCAAGGAGAAATGGGCGAAAAATCTGTACATTGCATCA 2377
Query 2449 ATATGCTATGGTCGGACAGTTTGCTGA 2475
||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 2378 ATATGCTTTGGGAGGACAGTTTGCTGA 2404
> Ahg340491 jgi|Araly1|340491|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000254
Length=798
Score = 1122 bits (607), Expect = 0.0
Identities = 686/723 (95%), Gaps = 10/723 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1799 AGAGATATCATTACAACGTTGCAGACTTAAGACTTGCACAGCATGTTGAGAAAGGTAATG 1858
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 AGAGGTATCATTACAACGTTGCAGACTCAAGACTTGCACAGCATGTTGAGAAAGGTAATG 145
Query 1859 AGGATGGCCTTTTCATAAGCTGTGTAGCATCATCAGCTAATCTCTGGGCCATCATCATGG 1918
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 146 AGGATGGCCTTTTCGTAAGCTGTGTAGCATCAGCAGCTAATCTCTGGGCCCTCATCATGG 205
Query 1919 ATGCTGGGACTGGTTTCAGTTCTCAAGTTTATGAACTGTCCTCAGTCTTCCTGCACAAGG 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 206 ATGCTGGGACTGGTTTCAGTTCTCAAGTTTATGAACTGTCCTCGGTCTTCCTGCACAAGG 265
Query 1979 ACTGGATCATGGAACAATGGGAAAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTGGTGCAAATA 2038
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 ACTGGATTATAGAACAATGGGAAAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTGGTGCAAATA 325
Query 2039 ATGGAAGCTCGTTGGTTGTTATGGCTAAAGGAACTCCTTATACCCAGCAATCTTACAAAG 2098
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 326 ATGGGAGCTCGTTGGTTGTTATGGCTAAAGGAACTCCTTATACCCAGCAATCATACAAAG 385
Query 2099 TCAGCGACTCATTTCCATTCAAGTGGATAAATAAAAAGTGGAAAGAAGGTTTTCATGTAA 2158
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 TCAGCAACTCATTTCCATTCAAGTGGATAAATAAAAAGTGGAAAGAAGGTTTTCATGTAA 445
Query 2159 CATCCATGACCACCGCTGGGAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGGAACTCAGGCTACT 2218
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 446 CATCCATGACCACCGCTGGGAGTCGTTGGGAAGTAGTAATGTCCAGGAACTCAGGCTACT 505
Query 2219 CTGAACAGGTGGTGGAGCTTGACTTCTTGTACCCAAGTGAAGGAATACATCGAAGGTGGG 2278
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 506 CTGAACAGGTGGTGGAGCTTGACTTTTTGTACCCCAGTGAAGGAATACATCGAAGATGGG 565
Query 2279 AAAGTGGATACAGGATAACATCAATGGCTGCAACAGCTGATCAAGCAGCTCTTATATTGA 2338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||
Sbjct 566 AAAGTGGATACAGGATAACATCAATGGCTGCAACAGCCGATCAAACAGCTTTTATATTGA 625
Query 2339 GTATACCTAAACGAAAAATAACCGATGAAACCCAAGAGACTCTCCGGACTTCTGCCTTCC 2398
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 626 GTATACCTAAACGAAAAGTAACCGATGAAACCCAAGAGATTCTCCGCACTTCTGCCTTCC 685
Query 2399 CAAGTACCCATGTCAAGGAGAAATGGGCGAAAAATCTGTACATTGCATCAATATGCTATG 2458
|||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 686 CAAGTACCCATGTCAAGG-G----G--CAAAAAATCTGTACATTGCATCAATATGCTATG 738
Query 2459 GTCGGACAGTTTGCTGATGAAACATGGAGTATACTGTTTCAACctctctcactctctctc 2518
||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 739 GTCGGACAGTTTGCTGAGGAAACATG---TATGGTGTTTCAACCTCTCTCACTCTCGCTC 795
Query 2519 tag 2521
|||
Sbjct 796 TAG 798
> Ahg340552 jgi|Araly1|340552|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000315
Length=867
Score = 833 bits (451), Expect = 0.0
Identities = 633/720 (88%), Gaps = 16/720 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1762 TGGATTTCAGTCTATAATGCACG-CCGTCCTATGAAACAGAGATATCATTACAACGTTGC 1820
||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||
Sbjct 154 TGGATTTCAGTCTATAACAAACGTCC-TCCTATGAAACAGAGATTTCATCACAACGTAGC 212
Query 1821 AGACTT-AAGACTTGCA-CAGCATGTTGAGAAAGGTAATGAGGATGGCCTTTTCATAAGC 1878
| | || ||| ||||| || ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||
Sbjct 213 A-AATTCAAG-GTTGCACCATCATGTAGAGAAAGCTAACAATGATGGCCTTTTTATAAGC 270
Query 1879 TGTGTAGCATCATCAGCTAATCTCTGGGCCA-TCATCATGGATGCTGGGACTGGTTTCAG 1937
|||||||||||| ||||||||| |||| || || || ||||| |||||||||||||
Sbjct 271 TGTGTAGCATCAGAAGCTAATCTATGGG-CATTCGTCGTGGATAAAGGGACTGGTTTCAC 329
Query 1938 TTCTCAAGTTTATGAACTG-T-CCTCAGTCTTCCTGCACAAGGACTGGATCATGGAACAA 1995
||||||||||||| || | | ||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||
Sbjct 330 TTCTCAAGTTTAT--ACAGTTATCTCAGCCTTCCTCCCCAAGGACTGGATTATGAAACAA 387
Query 1996 TGGGAAAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTGGTGCAAATAATGGAAGCTCGTTGGTT 2055
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 388 TGGGAGAAGAACTACTATATCAGTTCCATAGCTGGTGCAAATAATGGGGGCTCGTTGGTC 447
Query 2056 GTTATGGCTAAAGGAACTCCTTATACCCAGCAATCTTACAAAGTCAGCGACTCATTTCCA 2115
|||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||
Sbjct 448 GTTATGTCAAAAGGAACTCTTTATACCAAGCAATCATACAAAACCAGCCACTCAATTCCA 507
Query 2116 TTCAAGTGGATAAATAAAAAGTGGAAAGAAGGTTTTCATGTAACATCCATGACCACCGCT 2175
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 508 TTAAAGTGGATGGATAAAAAGTGGAAAGAAGGTTTTCATGTAACATCCATGACCACTGCT 567
Query 2176 GGGAGTCGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGGAACTCAGGCTACTCTGAACAGGTGGTGGAG 2235
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 568 GGGAGTGGTTGGGGTGTAGTAATGTCCAGGAACTCAGGCTTCTCTGAACAGGTGATGGAG 627
Query 2236 CTTGACTTCTTGTACCCAAGTGAAGGA-ATACATCGAAGGTGGGAAAGTGGATACAGGAT 2294
|||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 628 CTTGACTTCTTGAACCCAAGTGAA-GATATAAATCGAAGGTTGGAGAGTGGATACAGGAT 686
Query 2295 AACATCAATGGCTGCAACAGCTGATCAAGCAGCTCTTATATTGAGTATACCTAAACGAAA 2354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 687 AACATCAATGGCTGCAACAGCTGATCAAGCAGCTCTTATATTGAGTATACCCAAACGAAA 746
Query 2355 AATAACCGATGAAACCCAAGAGACTCTCCGGACTTCTGCCTTCCCAAG-TACCCATGTCA 2413
|||||||||||||| |||||||||| | || |||||| ||||||| || | || || |||
Sbjct 747 AATAACCGATGAAATCCAAGAGACTTTACGTACTTCTTCCTTCCCTAGCT-CCTATATCA 805
Query 2414 AGGAGAAATGGGCGAAAAATCTGTACATTGCATCAATATGCTATGGTCGGACAGTTTGCT 2473
|||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 806 AGGACAAATGGGAGAAAAATATGTTCATAACATCAATATGTTATGGTCGGACAGTTTGCT 865
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 108023934820
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5