BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT3G05340.1

Length=2704
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg928124 jgi|Araly1|928124|scaffold_300581.1                       3177    0.0  
  Ahg928123 jgi|Araly1|928123|scaffold_300580.1                       1085    0.0  
  Ahg340702 jgi|Araly1|340702|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000465           267    4e-70


> Ahg928124 jgi|Araly1|928124|scaffold_300581.1
Length=2074

 Score = 3177 bits (1720),  Expect = 0.0
 Identities = 1951/2060 (95%), Gaps = 26/2060 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  114   TGGTGAATGAATTCGAGATGGGTGATTCAGAAACTGACCTCTCACCTTCCTTCTTGCTTA  173
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| 
Sbjct  18    TGGTGAATGAATTCGAGATGGGTGATTCAGAAACTGACCTCTCACCTACCTTCTTGCTTC  77

Query  174   TCTACCGTTTTGTCCCCTTCGAAAATCCTAATCCGGCAGAGCCCAAATTACCAAGTCTCG  233
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
Sbjct  78    TCTACCGTTTTGTCCCCTTCGAAAATCCTAATCCGGCAGAGCCCAAGTTACCAAGTCTCC  137

Query  234   ACCTTTCTCCTCAACCATGTCGATATGAGCCTTCTCTTATCCATCTGCGGCAGAGAAGGC  293
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138   ACTTTTCTCCTCAACCATGTCGATATGAGCCTTCTCTTATCCATCTGCGGCAGAGAAGGC  197

Query  294   TGGTTTCCTCATCTGGGTCCTTGTCTCCACGCCTCCATTATCAAAAATCCTGAATTTTTC  353
             ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct  198   TGGTTTCCTTATCTGGGTCCGTGTCTCCATGCCTCCATTGTCAAGAATCCTGAATTTTTC  257

Query  354   GAGCCTGTAGATGCTGATATCCATCGAAACGCTCTGGTTGTTTGGAACTCTTTGCTTTCT  413
             || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  258   GATCCTGTAGATGTTGATATCCATCGAAACGCTCTTGTTGTTTGGAACTCTTTGCTTTCT  317

Query  414   CTGTATGCGAAATGTGGGAAGTTAGTTGATGCCA-TTAAGTTGTTCGACGAAATGCCCAT  472
             ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct  318   CTGTATGTGAAATGTGGGAAGTTAGGTGATG-CACTTAAGTTGTTCGATGAAATGCCCGT  376

Query  473   GAGAGACGTTATTTCGCAGAATATAGTGTTTTATGGGTTTCTGAGAAACAGAGAGACTGA  532
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  377   GAGAGATGTTATTTCGCAGAATATAGTGTTTTATGGGTTTCTGAGGAACAGAGAGACTGA  436

Query  533   GTCTGGTTTTGTATTGCTTAAACGAATGCTTGGGTCAGGTGGGTTTGATCATGCGACTTT  592
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct  437   GTCTGGTTTTGTATTGCTTAAACGAATGCTTGGTTCAGGTGGGTTTGATCAAGCGACCTT  496

Query  593   GACGATTGTTTTATCAGTGTGTGATACGCCAGAGTTCTGTTTGGTGACAAAGATGATTCA  652
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497   GACGATTGTTTTATCAGTTTGTGATACGCCAGAGTTCTGTTTGGTGACAAAGATGATTCA  556

Query  653   CGCTTTAGCAATTTTAAGCGGTTATGACAAGGAAATTTCCGTGGGGAACAAACTGATCAC  712
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  557   CGCTTTAGCAATTTTAAGCGGTTATGACAAGGAGATTTCCGTGGGGAACAAATTGATCAC  616

Query  713   ATCTTATTTCAAATGTGGATGTTCAGTTTCTGGGAGAGGGGTTTTTGA-TGGGATGTCAC  771
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||
Sbjct  617   ATCTTATTTCAAATGTGGATCTTCAGTTTCTGGGAGATGGGTTTTT-AGTGAGATGGCAC  675

Query  772   ATCGAAATGTCATCACTTTGACAGCTGTGATTTCGGGTCTGATAGAGAATGAGTTACACG  831
             || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  676   ATAGAAATGTCATCACTTGGACAGCTGTGATTTCGGGTCTGATAGAGAATGAGTTACATG  735

Query  832   AAGATGGTCTAAGATTGTTTAGTTTGATGCGTAGAGGATTGGTCCATCCTAACTCAGTAA  891
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  736   AAGATGGTCTAAGATTGTTTAGTTTGATGCGTAGAGGATTGGTCCATCCAAACTCAGTAA  795

Query  892   CTTATTTGAGTGCTCTAGCTGCTTGTTCTGGTTCACAGCGGATAGTGGAGGGGCAACAGA  951
             |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||
Sbjct  796   CTTATTTGAGTGCTCTTGCTGCTTGTTCAGGCTCACAGATGATAGTGGAAGGGCAACAGA  855

Query  952   TTCATGCCCTTTTGTGGAAATATGGGATTGAATCAGAATTGTGCATTGAGAGTGCGCTAA  1011
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856   TTCATGCCCTTTTGTGGAAATTTGGGATTGAATCAGAATTGTGCATTGAGAGTGCGCTAA  915

Query  1012  TGGATATGTACTCTAAATGTGGAAGCATTGAAGATGCGTGGACGATTTTCGAGTCCACGA  1071
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |
Sbjct  916   TGGACATGTACTCTAAATGTGGAAGCATTGAAGATGCATGGAAGATTTTCGAGTCCTC-A  974

Query  1072  C-GGAAGTTGATGAAGTTTCCATGACTGTGATATTAGTTGGTTTAGCACAAAATGGGTCA  1130
             |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  975   CAAGAAGTTGATGAAGTTTCCATGACTGTGATATTAGTTGGTTTAGCACAAAATGGGTTA  1034

Query  1131  GAGGAAGAAGCTATACAGTTCTTCATTAGAATGCTTCAAGCTGGAGTAGAGATTGATGCA  1190
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1035  GAGGAAGAAGCTATACAGTTCTTCATTAGAATGCTTCAAGCTGGTGTAGAGATTGATGCA  1094

Query  1191  AATGTAGTCTCAGCTGTTCTTGGAGTTTCGTTTATCGATAATTCTTTGGGTCTAGGCAAG  1250
             ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1095  AATGTAGTCTCAGCTATTCTTGGAGTTTCATTTGTCGATAACTCTTTGGGTCTAGGCAAG  1154

Query  1251  CAACTGCATTCTTTGGTTATCAAACGAAAATTCTCCGGTAACACCTTTGTCAACAATGGA  1310
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1155  CAACTGCATTCTTTGGTTATCAAACGAAAATTCTGCGGTAACACCTTTGTCAACAATGGA  1214

Query  1311  CTCATTAACATGTACTCAAAATGTGGAGATCTGACCGACTCACAAACTGTCTTTAGACGA  1370
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||
Sbjct  1215  CTCATTAACATGTACTCAAAATGTGGAGACCTGACTGATTCACAAACTATCTTTAGAAGA  1274

Query  1371  ATGCCGAAGAGGAACTATGTTTCATGGAACTCGATGATTGCAGCATTTGCTCGCCATGGT  1430
             ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1275  ATGCCAAAAAGGAACTATGTTTCATGGAACTCGATGATTGCAGCATTTGCTCGCCATGGT  1334

Query  1431  CATGGATTAGCTGCCTTGAAACTATACGAAGAAATGACTACGCTAGAAGTGAAGCCTACA  1490
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1335  CATGGATTAGCTGCCTTGAAACTATACGAAGAAATGACTACGCTAGAAGTGAAGCCTACA  1394

Query  1491  GATGTTACCTTTCTATCACTACTTCATGCTTGTAGCCATGTAGGGTTGATTGATAAAGGC  1550
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1395  GATGTTACCTTCCTATCACTACTTCATGCTTGTAGCCATGTGGGGTTGATTGATAAAGGC  1454

Query  1551  CGAGAACTCTTAAACGAGATGAAAGAGGTCCATGGAATCGAGCCCAGGACAGAGCATTAT  1610
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct  1455  CGAGAACTCTTAAACGAGATGAAAGAGGTCCATGGAATCAAGCCCAGGACAGAGCACTAT  1514

Query  1611  ACCTGTATTATTGACATGTTGGGTCGAGCTGGTCTTTTGAAAGAAGCAAAGAGCTTTATA  1670
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1515  ACCTGTATTATTGACATGTTGGGTCGAGCTGGTCTTATGAAAGAAGCAAAGAGCTTTATA  1574

Query  1671  GACTCATTGCCTTTGAAACCTGACTGTAAAATTTGGCAAGCGTTGCTTGGAGCTTGTAGT  1730
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1575  GACTCATTGCCTTTGAAACCTGACTGTAAAATTTGGCAAGCGTTGCTTGGAGCTTGTAGT  1634

Query  1731  TTCCATGGTGATACAGAAGTAGGGGAATATGCAGCTGAACAGTTGTTTCAAACTGCACCT  1790
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1635  TTCCATGGTGATACAGAAGTAGGGGAATATGCAGCTGAACAGTTGTTTCAAACTGCACCT  1694

Query  1791  GATAGCTCATCTGCTCATATCTTGATCGCTAACATATATTCATCCAGAGGAAAATGGAAG  1850
             ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1695  GATAGCTCAGCTGCTCATATCTTGATGGCTAACATATATTCATCCAGAGGAAAATGGAAG  1754

Query  1851  GAGAGGGCGAAGACGATCAAGAGAATGAAAGCAATGGGAGTGACTAAAGAAACAGGCATA  1910
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1755  GAGAGGGCGAAGACGATCAAGAGAATGAAAGCAATGGGAGTGACTAAAGAAACAGGCATA  1814

Query  1911  AGTTCGATTGAAATTGAGCATAAAACACACAGCTTTGTGGTTGAGGACAAATTGCATCCA  1970
             |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  1815  AGTTGGATTGAAATTGAGAATAAAACACACAGCTTTGTGGTTGAGGACAAAATGCATCCA  1874

Query  1971  CAAGCAGAGGCTATATATGATGTTCTGTCTGGATTGTTTCCGGTTATGGTAGATGAAGGT  2030
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |   | | |||
Sbjct  1875  CAAGCAGAGGCTATATATGATGTTCTGTCTGGATTGTTTCC--T---G-T---T-ACGGT  1924

Query  2031  TACAGACCTGATAAGAGGTTTATTCTGTGTTATACAGGAGATGACAG-GAACGGCACG-G  2088
              |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||  |
Sbjct  1925  -A--GACCTGATAAGAGGTTTATTCTCTGTTATACAGGAGAAGACAGAGAA-GACACAAG  1980

Query  2089  TATCATAGTTCCTTAACGCCTTCTCTCTACATGAATGTGTACATACAAGAGTAGAGAATA  2148
             | || | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | |||||| |||||| |
Sbjct  1981  TGTCTTTGTTCCTTAACGCCTTCTCTCTACATGAATATATA--T-CAAGAGAAGAGAAAA  2037

Query  2149  TCCATGGCGTTTTGTA-AAG  2167
              ||||||||| ||||| |||
Sbjct  2038  CCCATGGCGTCTTGTAGAAG  2057


> Ahg928123 jgi|Araly1|928123|scaffold_300580.1
Length=2446

 Score = 1085 bits (587),  Expect = 0.0
 Identities = 661/698 (95%), Gaps = 0/698 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1380  AGGAACTATGTTTCATGGAACTCGATGATTGCAGCATTTGCTCGCCATGGTCATGGATTA  1439
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct  1212  AGGAACTATGTTTCATGGAACTCGATGATTGCAGCATTTGCTTGCCATGGTCACGGATTA  1271

Query  1440  GCTGCCTTGAAACTATACGAAGAAATGACTACGCTAGAAGTGAAGCCTACAGATGTTACC  1499
             ||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1272  GCTGCCTTGAAACTATATGAAGAAATGATTATGCAAGACGTGAAGCCTACAGATGTTACC  1331

Query  1500  TTTCTATCACTACTTCATGCTTGTAGCCATGTAGGGTTGATTGATAAAGGCCGAGAACTC  1559
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct  1332  TTTCTATCACTACTTCATGCTTGTAGCCATGCAGGGTTAATCGATAAAGGCCGAGAACTC  1391

Query  1560  TTAAACGAGATGAAAGAGGTCCATGGAATCGAGCCCAGGACAGAGCATTATACCTGTATT  1619
             |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1392  TTAAACGATATGAAAGATGTCTATGGAATCGAGCCCAGGACAGAGCATTATACCTGTATT  1451

Query  1620  ATTGACATGTTGGGTCGAGCTGGTCTTTTGAAAGAAGCAAAGAGCTTTATAGACTCATTG  1679
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1452  ATTGACATGTTGGGTCGAGCTGGTCTTATGAAAGAAGCAAAGAGCTTTATAGACTCATTG  1511

Query  1680  CCTTTGAAACCTGACTGTAAAATTTGGCAAGCGTTGCTTGGAGCTTGTAGTTTCCATGGT  1739
             ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1512  CCCGTGAAACCTGACTGTAAAATGTGGCAGGCCTTGCTTGGAGCTTGTAGTTTCCATGGT  1571

Query  1740  GATACAGAAGTAGGGGAATATGCAGCTGAACAGTTGTTTCAAACTGCACCTGATAGCTCA  1799
             ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1572  GATACAGAAATAGGGAAATATGCAGCTGAACAGTTGCTTCAAACTGCACCTGATAGCTCA  1631

Query  1800  TCTGCTCATATCTTGATCGCTAACATATATTCATCCAGAGGAAAATGGAAGGAGAGGGCG  1859
              |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct  1632  GCTGCTCATATCTTGATGGCTAACATATACTCATCCAGAGAAAAATGGAAGGAAAGGGCG  1691

Query  1860  AAGACGATCAAGAGAATGAAAGCAATGGGAGTGACTAAAGAAACAGGCATAAGTTCGATT  1919
             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct  1692  AAGACTATCAAGAGAATGAAAGCAATGGGAGTGACTAAAGGAACAGGCATAAGTTGGATT  1751

Query  1920  GAAATTGAGCATAAAACACACAGCTTTGTGGTTGAGGACAAATTGCATCCACAAGCAGAG  1979
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct  1752  GAAATTGAGCATAAAACACACTGCTTTGTGGTTGAGGACAAAATGCATCCACAAGAAGAG  1811

Query  1980  GCTATATATGATGTTCTGTCTGGATTGTTTCCGGTTATGGTAGATGAAGGTTACAGACCT  2039
             |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1812  GCTATATATGATGTTCTGTCTGAATTGTTTCCCGTTATGGTAGATGAAGGTTACAGACCT  1871

Query  2040  GATAAGAGGTTTATTCTGTGTTATACAGGAGATGACAG  2077
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct  1872  GATAAGAGGTTTATTCTCTGTTATACAGGAGATGGCAG  1909


 Score =  414 bits (224),  Expect = 1e-114
 Identities = 251/263 (95%), Gaps = 5/263 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  987   GAATTGTGCATTGAGAGTGCGCTAATGGATATGTACTCTAAATGTGGAAGCATTGAAGAT  1046
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954   GAATTGTGCATTGAGAGTGCGCTAATGGATATGTACTCTAAATGTGGAAGCATTGAAGAT  1013

Query  1047  GCGTGGACGATTTTCGAGTCCAC-GACGGAAGTTGATGAAGTTTCCATGAC-TGTGATAT  1104
             ||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||| | ||||||
Sbjct  1014  GCGTGGAAGATTTTCGAGTCCACCGAAG-AAGTTGATGAAGTTTCGATGACAT-TGATAT  1071

Query  1105  TAGTTGGTTTAGCACAAAATGGGTCAGAGGAAGAAGCTATACAGTTCTTCATTAGAATGC  1164
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1072  TAGTTGGTTTAGCACAAAATGGGTCAGAGGAAGAAGCTATACAGTTCTTCATTAGAATGC  1131

Query  1165  TTCAAGCTGGAGTAGAGATTGATGCAAATGTAGTCTCAGCTGTTCTTGGAGTTTCGTTTA  1224
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1132  TTCAAGCTGGTGTAGAGATTGATGCAAATGTAGTTTCAGCTGTTCTTGGAGTTTCGTTTG  1191

Query  1225  TCGATAAT-TCTTTGGGTCTAGG  1246
             |||||||  ||||||||||||||
Sbjct  1192  TCGATAAACTCTTTGGGTCTAGG  1214


 Score =  394 bits (213),  Expect = 2e-108
 Identities = 248/264 (94%), Gaps = 5/264 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  2296  GGGAAAGAGAAGGTAAGAGA-T-A-CAATGGAATGTCTTCGTGTATTTGCTTCGGTACCT  2352
             |||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1914  GGGAGAGAGAAGGTAAGAGATTCAGCAAAGGAATGTCTTCGTGTATTTGCTTCCGTACCT  1973

Query  2353  AAAATCTCTTTCTTCTCCAATTCAAGATACTCAACTTCTCAGCGATTCATTCCCAGTTGC  2412
             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||
Sbjct  1974  AAAATCTCTTTCTTCTCCAGTTCAAGATACTCAACTACTCAACGATTCATCCCCAGTTGC  2033

Query  2413  AGAGGA-AAAAACAGAGAGGATCCTCTCTCCAGCTCTTCACCGTACTCTATACTTGGCGT  2471
             ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2034  AGA-GAGAAAAGCAGAGAGGATCCACTCTCCAGCTCTTCACCGTACTCTATACTTGGCGT  2092

Query  2472  AGAGCCAAGCTGCTCATCTTCCGAGCTAAAGGCAGCTTTTCGTGCCAAAGTATGCATCCA  2531
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2093  AGAGCCAAGCTGCTCATCTTCCGAGCTAAAGGCGGCTTTTCGTGCCAAAGTATGCATCCA  2152

Query  2532  AGAATCACTAATCTGTACTTTTCT  2555
             ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2153  AGAATCACTAATCTGTACTGTTCT  2176


> Ahg340702 jgi|Araly1|340702|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000465
Length=780

 Score =  267 bits (144),  Expect = 4e-70
 Identities = 190/211 (90%), Gaps = 7/211 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  546  TTGCTTAAACGAATGCTTGGGTCAGGTGGGTTTGATCATGCGACTTTGACGATTGTTTTA  605
            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||
Sbjct  22   TTGCTTAAACGAATGCTTGGCTCAGGTGGGTTTGATCAAGCGACCTTGACGACTGTGTTA  81

Query  606  TCAGTGTGTGATACGCCAGAGTTCTGTTTGGTGACAA--A-GATGATTCACGCTTTAGCA  662
            ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||
Sbjct  82   TCAGTGTGTGATACGCCAGAGTTCTCTTTGGTGACCACGATGATGATTCACGCTTTAGCA  141

Query  663  ATTTTAAGCGGTTATGACAA-GGAAA-TT-T-CCGTGGGGAACAAACTGATCACATCTTA  718
            ||| |||| ||||||||||| |||   || | |||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  142  ATTATAAGTGGTTATGACAAAGGATGCTTCTTCCGTGGGGAACAAACTGACCACATCTTA  201

Query  719  TTTCAAATGTGGATGTTCAGTTTCTGGGAGA  749
            |||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct  202  TTTCAAATGTGGATGTTCGGTTTCCGGGAGA  232



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 102005676110


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5