BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G06480.1
Length=3605
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg477953 jgi|Araly1|477953|fgenesh2_kg.3__654__AT3G06480.1 4072 0.0
> Ahg477953 jgi|Araly1|477953|fgenesh2_kg.3__654__AT3G06480.1
Length=3627
Score = 4072 bits (2205), Expect = 0.0
Identities = 2604/2787 (93%), Gaps = 65/2787 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGTTCTTGATCCTCTCTGGTTCGCACCCGTGTTTTTAATCAATTCTGGTTCGCATAGGTG 60
||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 CGTTCTTGATCCTCTCTGGCTCGCACCGGTGTCTTTATTCAACTCTGGTTCGCATAGGTG 60
Query 61 ACTCCGGTACTGTTTCTTCGTCGA--T-AGCCTTTTCCTATGGCCACAACAGAAGATACT 117
||||||||||| |||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 61 ACTCCGGTACTATTTCTTCGCCGATGTAAGTCTTTGCCTATGGCCACAACAGAAGCTACT 120
Query 118 CCAGCTTCTGCTGGTCCAAGATATGCTCCAGAGGACCCAACTCTTCCCCAACCATGGAAG 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CCAGCTTCTGCTGGTCCAAGATATGCTCCAGAGGACCCAACTCTTCCCCAACCATGGAAG 180
Query 178 GGACTTATTGATGGAAGCACAGGAATTCTCTATTACTGGAATCCTGAAACCAATGTCACT 237
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GGACTTATTGATGGAAGCACAGGAATTCTGTATTACTGGAATCCTGAAACCAATGTCACT 240
Query 238 CAGTATGAAAGACCTTCTGCGCCTCCTCC-CCACTCTGCCA-C---AACACCGAAGCTAG 292
||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | | || ||||| |
Sbjct 241 CAGTATGAAAGACCTTCTGCGCCTCCTCCACCA-T-TGCCAGCTGGTGCTCCAAAGCTCG 298
Query 293 CTCAGATTCCTGTACCCTCTTCAGGACAAGGTCACCAAGCTCAGCATGAACAAGCAAAAC 352
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 299 CTCAGATTCCTGTACCCTCTTCAGGACAAGGTCACCAAGCTCAGCACGAACAAGCAAAAC 358
Query 353 CAGTTGGTCATGTGTCTCAGCAGCATGGTTTCCAACAACAGCCACAGCAATTTCCATCCC 412
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 359 CAGTTGGTCACGTGTCTCAGCAGCATGGTTTACAACAACAGCCACAGCAATATCCATCCC 418
Query 413 AACATGTAAGACCCCAAATGAT------GCAG---CAGCATCCGGCCCAGCAAATGCCTC 463
||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 419 AACATGTCAGACCCCAAATGATGCAGCAGCAGCACCAGCATCCGGGCCAGCAAATGCCTC 478
Query 464 AACAATCAGGTCAACAGTTTCCCCAACAACAGAGCCAATCGATGGTGCCGCACCCACATG 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||
Sbjct 479 AACAATCAGGTCAACAGTTTCCCCAACAACAGAGCCAATCGATGGTGTCGCAGCCGCATG 538
Query 524 GGCATCCTTCTGTACAGACTTATCAGCCAACGACGCAGCAGCAGCAGCAAGGGATGCAGA 583
|||||||||||||||||||||||||| | | | | | | | | || | ||||
Sbjct 539 GGCATCCTTCTGTACAGACTTATCAG-C--C-A---A-C-G-A-C-GC-----A-GCAG- 579
Query 584 ATCAGCATTCACAAATGCCTCAGCAGCTGAGCCATCAGTATGCTCATTCACAACAACATT 643
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 580 --CAGCATTCACAAATGCCTCAGCAGCAGAGCCATCAGTATGCACATTCACAACAACAGT 637
Query 644 ACATGGGTTTTCGGCCTCACATGCAAACGCA-AGGACTT-CAAAATTCACATCAGACACC 701
||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 638 ACATGGGTTATCGGCCTCACATGC-AAC-CACAGGGGTTACAAAATTCACATCAGACACC 695
Query 702 TCAGGGTGGTCCCCATGGTCAGCAGTTTCCGAGCCAGCAAGAGTACAACTCATTGGCTCC 761
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 696 TCAGGGTGGTCCCCAAGGTCAGCAGTTTCCGAGCCAGCAAGAGTACAACTCATTGGTTCC 755
Query 762 GAAGAGGGAGGGGGATGAGTTCCATGGGGGTAAGAAAACTGGGTTTTCTCAACCCCATTT 821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 756 AAAGAGGGAGGGGGATGAGTTCCATGGGGGTAAGAAAACTGGGTTTCCTCAACCCCATTT 815
Query 822 ACCAAATTCTGAACGTTCACCATCTCAAAATACCCACTTTGAAGCCAATGCAGCATCACA 881
||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 ACCAAATTCTGAAAATTCGCCATCTCAAAATACCCCCTTTGAAGCCAATGCAGCATCAC- 874
Query 882 AAAG-ACGAATGCAAACTTGGCTATGGCTCAGAAATGCAATGGACCTCAAGC-AA-ATG- 937
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||
Sbjct 875 AAAGAACGAATGCAAACTTGGCTATGGCTCAGAAATACAATGGACCTCAAGCAAACATGC 934
Query 938 -----C----TGCAGTCACACAGTTTCAACAGCCAGGGGCGAACCTAATTCACCAGCAAC 988
| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |
Sbjct 935 AACATCATGTTGCAGTCACACAGTTTCAACAGCCAGGGTCTAACCTGATTCACCAGCAGC 994
Query 989 TTGGACCTAGGGCGCCAAATCAAATGGACCAGACAATGTTGCACCAGAAGTCTCACGTTT 1048
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 995 TTGGACCTAGGGCTCCAAATCAAATGGACCCGACAATGTTGCACCAGAAGTCTCATGCTT 1054
Query 1049 CCCCTTTCCAATCAAATAATACTTATGAGAATAATCTACAATCTAGGCCTGGTAATGACT 1108
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1055 CCTCTTTCCAGTCAAATAATACTTATGAGAATAATCTACAATCTAGACCTGGGAATGACT 1114
Query 1109 CGTACGTTAACATGAGAATGGAAGTGCCGGTTAGGGGTGCCCAACCACTTCATCCTGCAG 1168
| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 CATACGTTAACGCGAGAATGGAAGGGCCGGTTAGGGGTGCCCAACCACTTCATCCTGCAT 1174
Query 1169 CAATGCCTAAGGATATAAGGATAAGTGGTGGTCCACCAACAAATGCTGATCCCGCCATGG 1228
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 CAATGCCTAAGGATATAAGGATAGGTGGTGGTCCACCTATAAATGCTGATCCCGCCATGG 1234
Query 1229 GGCAAACAGGGCATGGAACATATGGACACGCTGGTCCAGCTTTTCCAAATAAATCCTTGG 1288
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235 GGCAAACAGGACATGGAACATATGGACACGCTGGTCCAGCTTTTCCAAATAAATCCTTGG 1294
Query 1289 TGCGGCCTCATTTTGTCACATCTCCTGATGTTCCCCATCTCTCTCCCGTTGAAATATACC 1348
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1295 TGAGGCCTCATTTTGCCACATCTCCTGATGTTCCCCATCTCTCGCCCGTTGAAATATACC 1354
Query 1349 GAAAACAACATGAAGTCACAACAACTGGCGAGAACATTCCAGCACCATACATCACATTTG 1408
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 GAAAGCAACATGAAGTCACAACAACTGGCGAGAACATTCCAGCACCATACATCACATTTG 1414
Query 1409 AATCTAGTGGTCTCCCACCTGAAATCCTTAGAGAGTTGCTTTCTGCTGGATTTCCATCGC 1468
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 AATCTAGTGGTCTCCCACCTGAAATACTTAGAGAGTTGCTTTCTGCTGGATTTCCATCGC 1474
Query 1469 CAACACCGATCCAGGCCCAAACATGGCCAATTGCTCTGCAAAGCAGGGATATAGTTGCAA 1528
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1475 CAACACCGATCCAGGCTCAAACATGGCCAATTGCTCTGCAGAGCAGGGATATAGTTGCAA 1534
Query 1529 TTGCAAAAACTGGTTCTGGTAAAACATTGGGATACTTGATCCCTGCCTTCATTCTTCTAA 1588
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535 TTGCAAAAACTGGTTCCGGTAAAACATTGGGATACTTGATCCCTGCCTTCATTCTTCTAA 1594
Query 1589 GGCACTGTCGTAACGACTCCCGCAATGGCCCCACAGTTTTGATCCTAGCTCCTACTCGGG 1648
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595 GGCACTGTCGTAACGACTCCCGCAATGGGCCCACAGTTTTGATCCTAGCTCCTACTCGGG 1654
Query 1649 AGCTAGCCACACAAATACAAGACGAAGCACTAAGGTTTGGACGGTCTTCCAGGATATCAT 1708
|||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1655 AGCTAGCCACACAAATACAAGATGAAGCCCTTAGGTTTGGCCGGTCTTCCAGGATATCAT 1714
Query 1709 GCACTTGTTTGTATGGTGGAGCTCCAAAGGGTCCTCAATTGAAAGAGTTGGAACGAGGAG 1768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1715 GCACTTGTTTGTATGGTGGAGCTCCAAAGGGTCCTCAGTTGAAAGAGTTGGAACGAGGAG 1774
Query 1769 CTGATATTGTGGTGGCAACTCCTGGGCGTCTAAATGATATACTGGAGATGAAGATGATTG 1828
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1775 CTGATATTGTGGTGGCAACTCCTGGGCGTCTAAATGATATACTGGAGATGAAGAAGATTG 1834
Query 1829 ATTTCCAGCAGGTTTCCCTTCTTGTGCTTGACGAGGCAGACCGAATGCTTGACATGGGTT 1888
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1835 ATTTCCAGCAGGTTTCCCTTCTTGTGCTTGATGAGGCAGACAGAATGCTTGACATGGGTT 1894
Query 1889 TTGAACCCCAAATCCGTAAGATTGTGAATGAAATACCTCCTCGGAGACAGACTCTTATGT 1948
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1895 TTGAACCCCAAATCTGTAAGATTGTGAATGAAATACCTCCTAGGAGACAGACTCTTATGT 1954
Query 1949 ACACAGCCACTTGGCCAAAAGAAGTAAGAAAAATTGCAAGCGATCTTCTTGTGAACCCTG 2008
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1955 ACACAGCAACTTGGCCAAAAGAAGTAAGAAAAATTGCAAGCGATCTTCTTGTGAACCCTG 2014
Query 2009 TCCAAGTTAACATAGGCAGGGTAGATGAGTTGGCTGCTAACAAAGCAATAACGCAGTATG 2068
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 TCCAAGTTAACATAGGTAGGGTAGATGAGTTGGCTGCTAACAAAGCAATAACGCAGTATG 2074
Query 2069 TTGAAGTAGTCCCACAAATGGAGAAAGAGAGACGTTTGGAGCAAATCCTTAGGTCACAAG 2128
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2075 TTGAAGTAGTCCCACAAACGGAGAAAGAGAGACGTTTGGAGCAAATCCTTAGGTCGCAAG 2134
Query 2129 AACGAGGTTCAAAAGTTATAATATTTTGCTCCACGAAGAGGCTTTGTGACCATCTTGCAC 2188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 AACGAGGTTCAAAAGTTATAATATTTTGCTCCACGAAGAGGCTTTGTGACCATCTTGCAC 2194
Query 2189 GTAGTGTCGGACGTCATTTTGGCGCTGTTGTGATCCATGGAGACAAGACTCAAGGTGAGA 2248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195 GTAGTGTCGGACGTCATTTTGGCGCTGTTGTGATCCATGGAGACAAGACTCAAGGTGAGA 2254
Query 2249 GAGATTGGGTGCTTAACCAGTTCCGAAGCGGGAAGTCTTGTGTACTGATAGCTACTGACG 2308
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
Sbjct 2255 GAGATTGGGTACTTAGCCAGTTCCGAAGCGGGAAGTCTTGTATATTGATAGCTACTGATG 2314
Query 2309 TTGCTGCCCGGGGACTCGACATAAAAGACATACGAGTTGTGATCAACTACGATTTTCCAA 2368
|||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2315 TTGCTGCCCGAGGACTCGATATAAAAGACATAAGAGTTGTGATCAACTATGATTTTCCAA 2374
Query 2369 CTGGAGTTGAAGACTATGTCCACCGTATTGGGAGAACC-GGTCGAGCTGGTGCAACTGGA 2427
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2375 CTGGAGTTGAAGACTATGTCCACCGTATTGGGAGAACCCGGTCGAGCTGGTGCAACTGGA 2434
Query 2428 GTTGCATTCACTTTCTTTACAGAGCAAGATTGGAAATACGCACCTGATTTGATCAAAGTC 2487
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 2435 GTTGCATTCACTTTCTTTACAGAGCAAGATTGGAAGTACGCACC-GAAATGATCAAAGTC 2493
Query 2488 CTGGAAGGAGCGAACCAGCAAGTACCGCCTCAAGTAAGAGATATTGCAATGCgtggtggt 2547
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2494 CTGGAAGGAGCGAACCAGCAAGTACCGCCTCAAGTAAGGGACATTGCAATGCGTGGTGGT 2553
Query 2548 ggtggtggtggtCCCGGTTATAGCCAGGATCGAAGAGGTATGGTTAACCGGTTTGACTCt 2607
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2554 GGTGGTGGT---CCTGGTTATAGCCAGGATCGAAGAGGTATGGTAAACCGGTTTGACTCT 2610
Query 2608 ggcggtggtggtacccgttgggattctggtggtgggtttggtgggcgtggtggtgggttt 2667
|||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2611 GGCGGTAATGGTAGCCGTTGGGATTCTGCTGATGGGTTTGGTGGGCGCGGTGGTGGGTTT 2670
Query 2668 agtggccgtgagggtgggtttggaggccgtgagggtggATTTGG-GGGCCGTGAGGGTGG 2726
|||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||
Sbjct 2671 GGTGGGCGTGAGGGTGGATTTGGTGGGCGTGAGGGTGGGTTTGGTGGGC-GTGAGGGTGG 2729
Query 2727 ATTTGGAGGCCGTGGGGGAAGATTTGG 2753
||||| || |||| ||| |||||||
Sbjct 2730 GTTTGGTGGGCGTGAGGGTGGATTTGG 2756
Score = 1205 bits (652), Expect = 0.0
Identities = 874/972 (90%), Gaps = 51/972 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 2638 ggtgggtttggtgggcgtg-gtggtgggtttagtggccgtgagggtgggtttggaggccg 2696
||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2683 GGTGGATTTGGTGGGCGTGAG-GGTGGGTTTGGTGGGCGTGAGGGTGGGTTTGGTGGGCG 2741
Query 2697 tgagggtggATTTGG-GGGCCGTGAGGGTGGATTTGGAGGCCGTGGGGGAAGATTTGGAA 2755
||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||
Sbjct 2742 TGAGGGTGGATTTGGTGGG-CGTGAGGGTGGGTTTGGTGGCCGTAGTGGCGGATTTGGAA 2800
Query 2756 TGAGAGATGACTCATTTGGACGTGGCGGGAATCGTGGTCGGGGTTTTACTGGTCCTGATG 2815
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2801 TGAGAGATGACTCATTTGGACGTGGCGGGAATCGTGGTCGGGGTTTTAGTGGTCCTGATG 2860
Query 2816 CTGGTCATATGAATGTGGGTGGTAGAGGCGGATTTGGTCGGTTTGGCAATAATAATAATA 2875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2861 CTGGTCATATGAATGTGGGTGGTAGAGGCGGATTTGGTCGGTTTGGCAATAATAATA-T- 2918
Query 2876 TGGA-GAGCCGAGGCTTTGGTCGTGGTAGTGGTAGAGGCTTTGGTCGTGGTGTTGGACGG 2934
||| | |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2919 -GGATG-GCCGTGGCTTTGGTCGTGGT-G-G-TAGAGGCTTTGGTCGTGGTGTTGGACGG 2973
Query 2935 TTTGACAACAGAAGAGGTAGAAGTCGCAGCAGAAGTCCTGATTTGGTTCGGCCACGGCGC 2994
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2974 TTTGACAACAGAAGAGGTAGAAGTCGTAGCAGAAGTCCTGATTTGGTTCGGCCACGGCGG 3033
Query 2995 CGTAGCTCGAGCTATAGCCGGAGTCGAAGCCGGAGCGGGAGCTATAGTCGTAGCCGTAGC 3054
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3034 CGTAGCCCGAGCTATAGCCGGAGTCGAAGCCGGAGC------TATAGTCGTAGCCGTAGC 3087
Query 3055 CGTAGCAGGAGCTGGTCACGTTCAAGGAGTCGCAGCCCTAGACATAGCCGTGACCGAGGT 3114
|| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3088 ---AG--G-AGCTGGTCACGTTCAAGGAGTCGTAGCCCTAGACATAGCCGTGACCGTGGT 3141
Query 3115 GGTCATAACAGGAGCAGAAGCTATAGCCGTAGTCCTAGTCCGGTTTATGAAAGACGAGAT 3174
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3142 GGTCATAACCGGAGCAGAAGCTATAGCCGTAGTCCTAGTCCGGTTTATGAAAGACGAGAT 3201
Query 3175 AGAGCGCCACGTGTTTCTGGGTTTGATATTAAACCACCAGTTGAATCTGTAGTGAACCTG 3234
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3202 AGACCGCCACGTGTTTCAGGGTTTGATATTAAACCACCAGTTGAGTCTGTAGTGAACCTG 3261
Query 3235 GACATGAATGCCGCGGCAGCGATTGAAAAC-GTGGTTCCTACATCCTTGTCTGAGAGACA 3293
||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3262 GACATGAATGCCGCGGCAGCGTTTGAAA-CTGCGGTTCCTACGTCCTTGTCTGAGAGACA 3320
Query 3294 AGGGAATGGGGTTGTTGAATCGGAGGTAGAAGCGGCTT----T--AGTACGACCAGTGGT 3347
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||
Sbjct 3321 AGGGAATGGGGTTGTTGAATCGGAGGTAGAAGCTGCTTCAGCTTCAGTACGACCAGTAGT 3380
Query 3348 TGATGAAGAACCCTAAAA-CCAAATCATAGAATGATATAAATCCTCACTA--C----GG- 3399
||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||
Sbjct 3381 TGATGAACA-C--TAAAAGCCAAAACATAGAATGATATAAAACCTCACTAGTCACTAGGG 3437
Query 3400 AGATATCACA-AGCTCACCCCAAATTTTTTGGGTATTGAATGGATTCACCAAATCAGACA 3458
||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||
Sbjct 3438 AGATATCACCCA-CTCATCCCAAAAATTTTGGTTATTAAATGGATCCAGCAAATCAGACA 3496
Query 3459 GCTGACACGTCTTCTCAGATTTGTTGGCTG-AGGtttctttatttt-catttttttattt 3516
||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||
Sbjct 3497 GCTGATGCGTCTTCTCAGATTTGTTGGCTGGAG-TTTCTTTGTTTTTCATTTTTTAATTT 3555
Query 3517 tttt---CTCATGTTCTTGTTGTATCATGGAGAATTAGTTTGTAATGTATTTGAGAATTT 3573
|||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3556 TTTTTTTCTCATTTTCTTGTTGTATCATGGAGGTTTAGTTTGTAATGTATTTGACAATTC 3615
Query 3574 TTATCGTTTATG 3585
||||||||||||
Sbjct 3616 TTATCGTTTATG 3627
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 136169996194
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5