BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G06920.1 Length=2616 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg478011 jgi|Araly1|478011|fgenesh2_kg.3__712__AT3G06920.1 4433 0.0 Ahg359368 jgi|Araly1|359368|fgenesh1_pg.C_scaffold_159000001 1768 0.0 > Ahg478011 jgi|Araly1|478011|fgenesh2_kg.3__712__AT3G06920.1 Length=2616 Score = 4433 bits (2400), Expect = 0.0 Identities = 2545/2617 (97%), Gaps = 2/2617 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGTGGGATTCGCTAGAACAAAATTTTGTAAGAACTTATCATCTTTATCTGATAATGGC 60 |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1 ATGGTGGGATTCGCAAGAACAAAATTTTGTAAGCACTTATCATCTTTGTCTGATAATGGC 60 Query 61 GAAAATCATGAGAAACCATATACATTTGAGGGTAATAGGCAAACTGTTAATGATATTTGC 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 61 GAAAATCATGAGAAACCATATACATTTGAGGGTAATAGGCAAATTGTTAATGATATTTGC 120 Query 121 AATGTTTTGGAGACTGGTCCATGGGGACCTTCAGCTGAGAATACTCTATCTGCTCTAAGT 180 |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 121 AATGTTTTGGAGACTGGTGCTTGGGGTCCTTCAGCTGAGAATGCTCTATCTGCTCTAAAC 180 Query 181 TTTAAACCACAACCAGAATTTGTCATTGGGGTTTTACGGAGGCTGAAAGATGTTAATCGG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTTAAACCACAACCAGAATTTGTCATTGGGGTTTTACGGAGGCTGAAAGATGTTAATCGG 240 Query 241 GCTATTGAGTATTTCCGTTGGTATGAGAGAAGAACCGAGCTGCCTCATTGTCCTGAATCA 300 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 241 GCGATTGAGTATTTCCGTTGGTATGAGAGAAGAACCGAGCTGCCTCATTGTCCCGAATCA 300 Query 301 TACAACTCCTTGCTTTTGGTGATGGCTCGTTGTAGAAATTTTGATGCTTTGGACCAGATT 360 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TACAACTCCTTGCTTTTAGTGATGGCTCGTTGTAGGAATTTTGATGCTTTGGACCAGATT 360 Query 361 CTTGGAGAAATGAGTGTTGCAGGATTTGGCCCTTCTGTTAACACTTGTATTGAGATGGTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CTTGGAGAAATGAGTGTTGCAGGATTTGGCCCTTCTGTTAACACTTGTATTGAGATGGTT 420 Query 421 TTGGGCTGCGTTAAGGCTAATAAGCTTAGGGAAGGTTATGATGTTGTGCAG-ATGATGAG 479 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| Sbjct 421 TTGAGCTGCGTTAAGGCTAATAAGCTTAGGGAAGGTTTTGATGTTGTGCAGAAT-ATGAG 479 Query 480 GAAGTTCAAGTTCCGACCTGCTTTTTCAGCTTACACAACTCTTATCGGTGCTTTCTCGGC 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 480 GAAGTTCAAGTTCCGACCTGCTTTTTCAGCTTACACAACTCTTATCGGTGCTTTCTCAGC 539 Query 540 AGTTAATCATTCTGATATGATGTTGACACTCTTTCAGCAAATGCAGGAGTTAGGATATGA 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 AGTTAATCATTCTGATATGATGTTGACACTCTTTCAGCAAATGCAGGAGTTAGGATATGA 599 Query 600 ACCGACCGTTCATCTGTTTACAACATTGATTCGGGGATTTGCCAAAGAGGGTCGAGTTGA 659 || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 GCCAACCGTTCATCTTTTTACAACATTGATTCGGGGCTTTGCCAAAGAGGGTCGAGTTGA 659 Query 660 TTCTGCTCTATCTTTACTTGATGAGATGAAGAGCAGCTCTCTTGATGCCGACATTGTTCT 719 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 TTCTGCTCTATCTTTGCTTGATGAGATGAAGAGCAGCTCTCTTGATGCCGACATTGTTCT 719 Query 720 TTATAATGTATGTATTGATAGCTTTGGTAAAGTGGGCAAGGTTGATATGGCATGGAAATT 779 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 TTACAATGTATGTATAGATAGCTTTGGTAAAGTGGGCAAGGTTGATATGGCATGGAAATT 779 Query 780 TTTTCATGAGATTGAAGCGAATGGTTTAAAGCCTGATGAAGTCACTTATACCAGCATGAT 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 TTTTCATGAGATTGAAGCGAATGGTTTAAAGCCTGATGAAGTCACTTATACCAGCATGAT 839 Query 840 AGGAGTTCTGTGCAAGGCAAACAGATTGGATGAAGCTGTAGAGATGTTTGAGCATCTAGA 899 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 840 AGGAGTTCTGTGCAAGGCAAATAGATTGGATGAAGCTGTAGAGATGTTTGAGCATTTAGA 899 Query 900 GAAGAATAGACGGGTTCCTTGCACTTATGCTTACAACACGATGATTATGGGTTATGGTTC 959 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 GAAGAATAGACGGGTCCCTTGCACTTATGCTTACAACACGATGATTATGGGTTATGGTTC 959 Query 960 GGCTGGAAAATTTGATGAAGCATACAGTCTCCTAGAGAGACAGAGGGCTAAAGGGTCTAT 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 960 GGCTGGAAAATTTGATGAAGCATACAGTCTCCTAGAGAGACAAAGGGCAAAAGGGTCTAT 1019 Query 1020 ACCGAGTGTGATTGCATATAATTGCATTCTTACATGCTTAAGGAAAATGGGAAAAGTGGA 1079 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 ACCGAGTGTGATTGCATATAATTGCATTCTTACATGCTTAAGGAAAATGGGAAAAGTGGA 1079 Query 1080 CGAAGCTTTGAAAGTTTTCGAGGAGATGAAAAAAGACGCTGCTCCAAATCTTTCAACCTA 1139 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 TGAAGCTTTGAAAGTATTCGAGGAGATGAAAAAAGACGCTGCTCCAAATCTTTCAACCTA 1139 Query 1140 TAATATTCTCATTGACATGCTGTGTAGAGCTGGTAAACTTGACACTGCTTTTGAGCTACG 1199 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1140 TAATATTCTCATTGACATGCTGTGTAGAGCTGGTAAACTTGACTGTGCTTTTGAGCTACG 1199 Query 1200 CGATTCTATGCAGAAGGCTGGTCTGTTTCCTAATGTGAGGACTGTGAACATAATGGTTGA 1259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1200 CGATTCTATGCAGAAGGCTGGTCTGTTTCCTAATGTTAGGACTGTGAACATAATGGTTGA 1259 Query 1260 TCGGCTCTGTAAATCCCAAAAACTTGATGAAGCATGTGCTATGTTCGAGGAGATGGATTA 1319 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| Sbjct 1260 TCGTCTCTGTAAATCCCAAAAACTTGATGAAGCATGTGCTATATTTGAGCAGATGGATTA 1319 Query 1320 TAAGGTTTGTACCCCAGATGAGATTACATTTTGCTCCCTCATAGATGGCTTAGGAAAGGT 1379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1320 TAAGGTTTGTACCCCAGATGAGATTACATTTTGCTCCCTCATAGATGGCTTAGGAAAGGT 1379 Query 1380 CGGAAGAGTTGATGACGCTTACAAAGTCTATGAAAAGATGTTGGATTCTGATTGTCGTAC 1439 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1380 CGGAAGAGTTGATGACGCTTACAAAATCTATGAGAAGATGTTAGATTCTGATTGTCGTAC 1439 Query 1440 TAACTCTATCGTTTACACATCCCTCATAAAAAACTTCTTCAACCACGGTAGAAAAGAAGA 1499 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1440 TAACTCTATTGTTTACACATCCCTCATAAAAAACTTCTTCAACCACGGTAGAAAAGAAGA 1499 Query 1500 TGGACACAAGATATACAAGGACATGATTAATCAAAACTGTTCTCCTGATTTACAGCTTCT 1559 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1500 TGGACACAAGATATACAAGGACATGGTTAATCAAAACTGTTCTCCTGATTTACAGCTTCT 1559 Query 1560 TAATACGTACATGGATTGCATGTTCAAGGCTGGAGAACCAGAAAAGGGAAGGGCCATGTT 1619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1560 TAATACGTACATGGATTGCATGTTCAAGGCTGGAGAACCAGAAAAGGGAAGGGCGATGTT 1619 Query 1620 TGAAGAAATAAAAGCCCGTCGGTTTGTCCCAGATGCTCGAAGCTACTCGATTTTAATTCA 1679 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1620 TGAAGAAATAAAATCCCGTCGGTTTGTCCCAGATGCTCGAAGCTACTCGATTTTAATTCA 1679 Query 1680 TGGACTAATAAAAGCAGGATTTGCAAATGAAACTTATGAGTTGTTTTATTCCATGAAAGA 1739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1680 TGGACTAATAAAAGCAGGATTTGCAAATGAAACTTATGAGTTGTTTTATTCCATGAAAGA 1739 Query 1740 GCAAGGGTGTGTCTTGGACACACGTGCTTACAATATTGTCATTGACGGTTTCTGCAAGTG 1799 |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1740 GCAAGGCTGTGTCTTGGACACCCGTGCTTACAATATTGTCATTGACGGTTTCTGCAAGTG 1799 Query 1800 TGGAAAAGTTAACAAAGCTTATCAGCTGCTGGAGGAAATGAAGACAAAAGGTTTTGAGCC 1859 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1800 CGGAAAAGTGAACAAAGCTTATCAGCTGCTGGAGGAAATGAAGACAAAAGGTTTTGAGCC 1859 Query 1860 AACTGTTGTTACGTATGGTTCAGTCATCGACGGGCTTGCAAAAATAGATCGGCTTGATGA 1919 |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1860 AACTGTCGTTACGTATGGTTCAGTCATTGACGGGCTAGCAAAAATAGATCGGCTTGATGA 1919 Query 1920 AGCTTATATGCTCTTTGAGGAAGCAAAATCGAAGAGAATAGAGCTAAACGTGGTGATTTA 1979 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 1920 AGCTTATATGCTCTTTGAGGAAGCAAAATCAAAGAGAATAGAGCTAAATGTGGTAATTTA 1979 Query 1980 CAGTAGTCTTATTGATGGGTTTGGAAAAGTTGGTAGGATAGATGAAGCTTACCTTATCTT 2039 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1980 CAGTAGTCTAATTGATGGGTTTGGAAAAGTTGGTAGGATAGATGAAGCTTACCTTATCTT 2039 Query 2040 GGAAGAGCTTATGCAGAAAGGATTAACACCTAATCTTTACACATGGAACTCATTGCTTGA 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2040 GGAAGAGCTTATGCAGAAAGGATTAACACCTAATGTTTATACATGGAACTCATTGCTTGA 2099 Query 2100 TGCATTGGTCAAAGCTGAGGAAATCAACGAAGCGCTTGTCTGTTTTCAGTCGATGAAAGA 2159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2100 TGCATTGGTCAAAGCTGAGGAAATCAACGAAGCGCTTGTCTGTTTTCAGTCGATGAAAGA 2159 Query 2160 ACTGAAATGCACGCCAAACCAAGTTACTTATGGTATCCTAATAAATGGTCTTTGTAAGGT 2219 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2160 ATTGAAATGCACGCCAAACCAAGTTACTTATGGTATCCTAATAAATGGTCTTTGTAAGGT 2219 Query 2220 CAGGAAGTTCAATAAAGCCTTTGTCTTTTGGCAGGAGATGCAGAAACAGGGGATGAAACC 2279 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2220 CAGGAAGTTCAATAAAGCCTTTGTCTTTTGGCAAGAGATGCAGAAACAGGGGATGAAACC 2279 Query 2280 CAGTACTATTTCTTACACCACCATGATATCAGGACTTGCAAAGGCTGGGAATATTGCAGA 2339 || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2280 TAGCACTATTTCTTACACCACCATGATATCGGGGCTTGCAAAGGCTGGGAATATTGCAGA 2339 Query 2340 GGCTGGGGCGCTCTTCGATCGGTTCAAGGCAAACGGTGGTGTTCCAGACTCTGCTTGTTA 2399 |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2340 GGCTGGGGCGCTATTTGATCGGTTTAAGGCAAACGGTGGTGTTCCAGACTCTGCTTGTTA 2399 Query 2400 TAATGCCATGATCGAAGGTCTAAGTAACGGAAACAGGGCAATGGATGCTTTTTCTCTTTT 2459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2400 TAATGCCATGATCGAAGGTCTAAGTAACGGAAACAGGGCAATGGATGCTTTTTCTCTTTT 2459 Query 2460 TGAGGAAACACGTCGAAGAGGATTACCTATCCATAACAAAACCTGTGTTGTTCTTTTGGA 2519 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2460 TGAGGAAACACGTCGAAGAGGATTACATATCCATAACAAAACCTGTGTTGTTCTTTTGGA 2519 Query 2520 TACTTTGCATAAGAATGATTGTCTTGAGCAAGCAGCTATTGTGGGAGCTGTTTTGAGGGA 2579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2520 TACTTTGCATAAGAATGATTGTCTTGAGCAAGCAGCTATTGTTGGAGCTGTTTTGAGGGA 2579 Query 2580 AACGGGAAAGGCACGGCATGCTGCCCGATCTTGGTAG 2616 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2580 AACGGGAAAGGCACGGCATGCTGCACGATCTTGGTAG 2616 > Ahg359368 jgi|Araly1|359368|fgenesh1_pg.C_scaffold_159000001 Length=1134 Score = 1768 bits (957), Expect = 0.0 Identities = 1031/1067 (97%), Gaps = 4/1067 (0%) Strand=Plus/Plus Query 26 TTTGTAAGAACTTATCATCTTTATCTGATAATGGCGAAAATCATGAGAAACCATATACAT 85 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 68 TTTGTAAGCACTTATCATCTTTGTCTGATAATGGCGAAAATCATGAGAAACCATATACAT 127 Query 86 TTGAGGGTAATAGGCAAACTGTTAATGATATTTGCAATGTTTTGGAGACTGGTCCATGGG 145 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 128 TTGAGGGTAATAGGCAAATTGTTAATGATATTTGCAATGTTTTGGAGACTGGTGCTTGGG 187 Query 146 GACCTTCAGCTGAGAATACTCTATCTGCTCTAAGT-TTTAAACCACAACCAGAATTTGTC 204 || |||||||||||||| | ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 188 GATCTTCAGCTGAGAATGCCCTATCTGCTCT-ATTCTTTAAACCACAACCAGAATTTGTC 246 Query 205 ATTGGGGTTTTACGGAGGCTGAAAGATGTTAATCGGGCTATTGAGTATTTCCGTTGGTAT 264 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 247 ATTGGGGTTTTAAGGAGGCTGAAAGATGTTAATCGTGCGATTGAGTATTTCCGTTGGTAT 306 Query 265 GAGAGAAGAACCGAGCTGCCTCATTGTCCTGAATCATACAACTCCTTGCTTTTGGTGATG 324 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 307 GAGAGAAGAACCGAGCTGCCTCATTGTCCCGAATCATACAACTCCTTGCTTTTAGTGATG 366 Query 325 GCTCGTTGTAGAAATTTTGATGCTTTGGACCAGATTCTTGGAGAAATGAGTGTTGCAGGA 384 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 367 GCTCGTTGTAGGAATTTTGATGCTTTGGACCAGATTCTTGGAGAAATGAGTGTTGCAGGA 426 Query 385 TTTGGCCCTTCTGTTAACACTTGTATTGAGATGGTTTTGGGCTGCGTTAAGGCTAATAAG 444 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 427 TTTGGCCCTTCTGTTAACACTTGTATTGAGATGGTTTTGAGCTGCGTTAAGGCTAATAAG 486 Query 445 CTTAGGGAAGGTTATGATGTTGTGCAG-ATGATGAGGAAGTTCAAGTTCCGACCTGCTTT 503 ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 487 CTTAGGGAAGGTTTTGATGTTGTGCAGAAT-ATGAGGAAGTTCAAGTTCCGACCTGCTTT 545 Query 504 TTCAGCTTACACAACTCTTATCGGTGCTTTCTCGGCAGTTAATCATTCTGATATGATGTT 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 546 TTCAGCTTACACAACTCTTATCGGTGCTTTCTCAGCAGTTAATCATTCTGATATGATGTT 605 Query 564 GACACTCTTTCAGCAAATGCAGGAGTTAGGATATGAACCGACCGTTCATCTGTTTACAAC 623 | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| Sbjct 606 GGCACTCTTTCAGCAAATGCAGGAGTTAGGATATGAGCCAACCGTTCATCTTTTTACAAC 665 Query 624 ATTGATTCGGGGATTTGCCAAAGAGGGTCGAGTTGATTCTGCTCTATCTTTACTTGATGA 683 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 666 ATTGATTCGGGGCTTTGCCAAAGAGGGTCGAGTTGATTCTGCTCTATCTTTGCTTGATGA 725 Query 684 GATGAAGAGCAGCTCTCTTGATGCCGACATTGTTCTTTATAATGTATGTATTGATAGCTT 743 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 726 GATGAAGAGCAGCTCTCTTGATGCCGACATTGTTCTTTACAATGTATGTATAGATAGCTT 785 Query 744 TGGTAAAGTGGGCAAGGTTGATATGGCATGGAAATTTTTTCATGAGATTGAAGCGAATGG 803 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 786 TGGTAAAGTGGGCAAGGTTGATATGGCATGGAAATTTTTTCATGAGATTGAAGCGAATGG 845 Query 804 TTTAAAGCCTGATGAAGTCACTTATACCAGCATGATAGGAGTTCTGTGCAAGGCAAACAG 863 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 846 TTTAAAGCCTGATGAAGTCACTTATACCAGCATGATAGGAGTTCTGTGCAAGGCAAATAG 905 Query 864 ATTGGATGAAGCTGTAGAGATGTTTGAGCATCTAGAGAAGAATAGACGGGTTCCTTGCAC 923 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 906 ATTGGATGAAGCTGTAGAGATGTTTGAGCATTTAGAGAAGAATAGACGGGTCCCTTGCAC 965 Query 924 TTATGCTTACAACACGATGATTATGGGTTATGGTTCGGCTGGAAAATTTGATGAAGCATA 983 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 966 TTATGCTTACAACACGATGATTATGGGTTATGGTTCGGCTGGAAAATTTGATGAAGCATA 1025 Query 984 CAGTCTCCTAGAGAGACAGAGGGCTAAAGGGTCTATACCGAGTGTGATTGCATATAATTG 1043 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1026 CAGTCTCCTAGAGAGACAAAGGGCAAAAGGGTCTATACCGAGTGTGATTGCATATAATTG 1085 Query 1044 CATTCTTACATGCTTAAGGAAAATGGGAAAAGTGGACGAAGCTTTGA 1090 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1086 CATTCTTACATGCTTAAGGAAAATGGGAAAAGTGGATGAAGCTTTGA 1132 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 98653734550 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5