BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G07100.1
Length=4096
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg478029 jgi|Araly1|478029|fgenesh2_kg.3__730__AT3G07100.1 6340 0.0
> Ahg478029 jgi|Araly1|478029|fgenesh2_kg.3__730__AT3G07100.1
Length=4018
Score = 6340 bits (3433), Expect = 0.0
Identities = 3862/4061 (95%), Gaps = 62/4061 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AATTCCGTATCGAAAATCTTCTTCGGGTCAGACGATCTGAAGCCGATCGCTGTAGAATCA 60
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AATTCCGTATCGAAAATCTTCTTCAGGTCAGACGATCTGAAGCCGATCGCTGTAGAATCA 60
Query 61 GTTTCGTGCTCCGCAGTTTCTCGAGTTTCCTCTCACTTCAGATC-TTCATAA-GAGAATT 118
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || || ||||
Sbjct 61 GTTTCGTGCTGCGCAGTTTCTCGAGTTTCCTCTCACTTAAG-TCTTTCAGAAGGA-AATT 118
Query 119 CACTTACGGAGAGGGACTTTTTCGTAGACGATTCTCACTGGA-TATCTATCACCCGGTAA 177
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 119 CACTTACGGAGAGGGACTTTTTCGTAGACGATTCTCACTGGATTATCTATCACCTGGTAA 178
Query 178 GATCGTCTTGCTCGAAAAGAATTGAAAAGTTTTTAAGTAATTGAATAAGGAACTGTGAAT 237
|||||||||||||| || || | || || | || || ||||||||||||||
Sbjct 179 GATCGTCTTGCTCG--AA-AA-T---AA----TT--G-AA---AAGAAGGAACTGTGAAT 221
Query 238 CGGAGAGGCTTACTTTTTTGAAAAGATCTAAACCATCGTAGAAGATCGTCCTCAAATATC 297
||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 222 CGGAGGGGCTTA-GTTTTTGAAGAGATCTAAACCATCGTACAAGATCGT-CTCAAATATC 279
Query 298 ------TCACAGAAGTTACCAATTTTGA-AAGATCACTAGAGATAGCTACGGATTTTGAG 350
| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||
Sbjct 280 TGTTGTTGACAGAAGTTACCAATTTTGATTAGATCACTTGAGAAAGCTACGGATTGACAG 339
Query 351 AGGCGGATCTGTCCAGGTCGGCACTGTGAAAGAGAACTACACT-GGTTTTTTCCAGATGA 409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||
Sbjct 340 AGGCGGATCTGTCCAGGTCGGCACTGTGAAAGAGAACTACACTAGTTTTTTTCAAGAGGA 399
Query 410 TATGAAGCTTCCGTGAACGAATCTGATTCTAAGGTACTCATCGAAGAGAATCTGGGATTG 469
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 400 TATGAAGCTTCCGTGAATGAATCTGATTCT-AGGTACTCATTGAAGAGAATCTGGGATTG 458
Query 470 TATTGATCTGGTCCCTTAGCTTCCAGTTTGGCTATAACTCTGACAACTGTTGTAAGTGAT 529
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||
Sbjct 459 TATTGATCTGGTCCCTTTGCTTCCTGTTTGGCTATAACTTTGACAAGTGTTGTAGGTGAT 518
Query 530 AAGTTGTGATCAATAATGGGTACGGAGAATCAGGGCTATCCAAATTTTCCAGCTAGGCCT 589
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 519 AAGTTGTGATCAATAATGGGTACGGAGAATCAGGGCTATCCAAATTTTCCTGCTAGACCT 578
Query 590 GCTTCCTCTCCATTTGCATCTGCTCCGCCACCAGGGATTCCTCCTCAATCAGGTGGACCA 649
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 579 GCCTCCTCTCCATTCGCATCTGCTCCGCCACCAGGGATTCCTCCTCAATCCGGTGGACCA 638
Query 650 CCCACTGGATCAGAGGCGGTTGGCTTTAGACCTTTTACACCATCTGCATCCCAACCTACA 709
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 639 CCCATTGGATCAGAGGCGGTTGGCTTTAGACCTTTTACACCATCTGCATCCCAACCTACA 698
Query 710 AGACCTTTCACTGCCTCTGGTCCTCCTCCGGCTCCACCAGTGGGTACGATGAGGCCTGGC 769
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 699 AGACCTTTCACAGCTTCTGGTCCTCCTCCGGCTCCACCAGTGGGTGCGATGAGGCCTGGC 758
Query 770 CAGCCGTCTCCTTTTGTTTCTCAGATTCCTGGGAGTAGACCTCCACCGCCATCATCAAAT 829
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 759 CAGCCTTCTCCTTTTGTTTCTCAGATTCCAGGGAGTAGACCTCCACCGCCATCATCGAAT 818
Query 830 TCGTTTCCTTC-ACCAGCATATGGTCCTCCTGGTGGTGCCCCTTTTCAGCGTTTTCCATC 888
|| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 819 TCATTTCCTTCTA-CAGCATATGGTCCTCCTGGTGGTGCCTCTTTTCAGCGTTATCCATC 877
Query 889 CCCGCCATTCCCGACTACACAAAACCCTCCTCAGGGCCCACCACCACCTCAAACTCTTGC 948
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 878 CCCGCAATTCCCGACTACACAAAACCCTCCTCAGGGTCCACCACCACCTCAAACTCTTGC 937
Query 949 AGGTCACTTATCTCCTCCTA-TGTCTCTTCGCCCACAGCAACCGATGGCACCTGTAGCAA 1007
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 938 AGGTCACTTATCTCCTCC-ACCGTCTCTTCGCCCACAGCAACCGATGGCACCTGTAACAA 996
Query 1008 TGGGGCCTCCGCCACAAAGTACGACTTCTGGGCTACCTGGAGCAAATGCTTATCCCCCTG 1067
|||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 997 TGGGACCTCCTCCACAAAGTATGACTTCTGGGCTACCTGGAGCAAATGCTTCTCCCCCTG 1056
Query 1068 CTACAGATTATCATATGCCTGCCAGGCCTGGTTTTCAACAGTCAATGCCTCCAGTTACTC 1127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 1057 CTACAGATTATCATATGCCTGCCAGGCCTGGTTTTCAACAGTCGATGGCTCCAGTTACTC 1116
Query 1128 CGTCTTATCCTGGCGTGGGCGGTTCGCAGCCATCTTTTCCTGGTTATCCTAGCAAGCAGG 1187
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1117 TGTCTTATCCTGGCGTGGGCGGTTTACAGCCATCTTTTCCTGGTTATCCCAGCAAGCA-G 1175
Query 1188 TCTTACAGGCTCCGACGCCATTCCAGACATCTCAAGGTCCCCCAGGACCCCCTCCAGTCT 1247
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1176 -----CAGGCTCCAATGCCATTCCAGACATCTCAAGGTCCCCCGGGACCCCCTCCAATCT 1230
Query 1248 CATCATATCCTCCTCACACAGGAGGTTTTGCTCAGCGACCAAATATGGCAGCACAGCAGA 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 1231 CATCATATCCTCCTCACACAGGAGGTTTTGCTCAGCGCCCAAATATGGTAGCACAGCAGA 1290
Query 1308 ATCTGCATCCAAACTATGCACCTCCTCCCAGTAACGTTCAAGGCTTGACTGAAGATTTTA 1367
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1291 ATCTACATCCAAGCTATGCACCTCCTCCCAGTAACGTACAAGGCTTGACTGAAGATTTTA 1350
Query 1368 ACTCGCTATCTCTTTCATCTATTCCTGGATCGCTGGAACCAGGACTTGATCATAAATCAT 1427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 ACTCGCTATCTCTTTCATCTATTCCTGGATCGCTGGAACCAGGACTTGATCATAAATCAT 1410
Query 1428 TCCCAAGGCCATTGGATGGTGACGTGGAGCCAAATTCATTTGCTGAAATGTACCCAATGA 1487
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411 TCCCAAGGCCATTGGATGGTGATGTGGAGCCAAGTTCATTTGCTGAAATGTACCCAATGA 1470
Query 1488 ATTGCCATTCTAGATATCTACGACTGACGACTAGTGCTATACCAAATTCCCAGTCTCTGG 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 ATTGCCATTCTAGATATCTACGACTGACGACTAGTGCTATACCAAATTCCCAGTCTCTGG 1530
Query 1548 CTTCAAGGTGGCATTTACCTCTAGGAGCTGTGGTTTGTCCACTTGCTGAGACTCCTGAAG 1607
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1531 CTTCGAGGTGGCATTTACCTCTAGGAGCTGTGGTTTGTCCACTTGCCGAGACTCCTGAAG 1590
Query 1608 GGGAGGAGGTACCACTTATTGATTTTGGCTCAACTGGCATCATCCGCTGCAGAAGATGCC 1667
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591 GGGAGGAGGTACCACTTATTGATTTTGGCTCAACCGGCATCATCCGCTGCAGAAGATGCC 1650
Query 1668 GTACCTATGTGAATCCTTTTGTGACTTTTACAGATTCTGGAAGAAAGTGGCGGTGTAATA 1727
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651 GTACCTATGTGAATCCTTATGTGACTTTCACAGATTCTGGAAGAAAGTGGCGGTGTAATA 1710
Query 1728 TATGTTCGATGCTTAATGATGTGCCTGGTGAATACTTCTCACATTTGGATGCTACTGGCC 1787
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711 TATGTTCTATGCTTAATGATGTACCTGGTGAATACTTCTCACATTTGGATGCTACTGGCC 1770
Query 1788 GAAGAATGGATATGGATCAACGACCTGAGCTGACTAAAGGCAGTGTTGAAATCATAGCTC 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1771 GAAGAATGGATATGGATCAACGACCTGAGCTGACTAAGGGCAGTGTTGAAATCATTGCTC 1830
Query 1848 CAACTGAATACATGGTTCGGCCTCCGATGCCACCTATCTACTTCTTCCTCATTGATGTTT 1907
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1831 CAACTGAATACATGGTCCGGCCTCCGATGCCACCTATCTACTTCTTCCTCATTGATGTTT 1890
Query 1908 CGATTTCGGCTACTAAAAGTGGAATGCTTGAGGTTGTTGCTCAAACGATTAAGTCTTGTT 1967
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1891 CGATTTCAGCTACTAAAAGTGGGATGCTTGAGGTTGTTGCTCAAACGATTAAGTCGTGTT 1950
Query 1968 TGGATAACCTGCCTGGTTATCCAAGAACTCAAATTGGATTTATTACTTATGACAGCACGT 2027
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 TGGATAACCTGCCTGGTTATCCCAGAACTCAAATTGGATTTATTACTTATGACAGCACGT 2010
Query 2028 TACATTTTTACAACATGAAGTCATCTTTGAGCCAGCCGCAGATGATGGTTGTATCAGATC 2087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2011 TACATTTTTACAACATGAAGTCATCTTTGAGCCAGCCGCAGATGATGGTTGTATCGGATC 2070
Query 2088 TAGATGATATCTTTGTCCCATTGCCAGACGATCTGCTTGTAAATCTATCTGAATCTAGAA 2147
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2071 TAGATGATATATTTGTCCCATTGCCAGATGATCTCCTTGTCAATCTATCTGAATCTAGAA 2130
Query 2148 CTGTGGTGGACGCCTTTTTGGACAGTCTACCTTTGATGTTTCAAGATAATTTCAATGTGG 2207
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2131 CTGTGGTGGAAGCCTTTTTGGACAGTCTACCTTTGATGTTTCAAGATAATGTCAATGTGG 2190
Query 2208 AATCAGCTTTTGGCCCAGCCCTCAGAGCGGCGTTTATGGTTATGAACCAACTTGGGGGCA 2267
|||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2191 AATCGGCTTTTGGCCCAGCTCTCAGAGCGGCATTTATGGTTATGAACCAACTTGGGGGCA 2250
Query 2268 AGTTACTAATTTTCCAGAACTCATTACCTTCTCTTGGTGCTGGGAGGTTAAAGTTGCGGG 2327
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2251 AGTTGCTAATTTTCCAGAACTCGTTACCTTCTCTTGGTGCTGGGCGGTTAAAGTTGCGGG 2310
Query 2328 GAGATGATCCTCGTGTCTATGGAACTGACAAAGAATATGCATTAAGGGTAGCTGAAGATC 2387
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2311 GAGATGATCCTCGTGTCTATGGAACGGACAAAGAATATGCATTAAGGGTAGCTGAAGATC 2370
Query 2388 CCTTCTATAAACAAATGGCTGCTGATTGTACCAAGTTCCAGATAGGAATTAATGTTTATG 2447
||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2371 CCTTCTACAAGCAAATGGCTGCCGATTGTACCAAGTTCCAGATAGGAATTAATGTTTATG 2430
Query 2448 CATTCAGTGATAAGTACACTGATATTGCCTCATTAGGGACTCTGGCAAAATACACTGGAG 2507
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2431 CATTCAGTGATAAGTACACTGATATTGCCTCCTTAGGGACTCTGGCAAAATACACTGGAG 2490
Query 2508 GACAGGTGTACTATTATCCAGGTTTCCAATCATCTGTTCATGGAGATAAGTTAAGACACG 2567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491 GACAGGTGTACTATTATCCAGGTTTCCAATCATCTGTTCATGGAGATAAGTTAAGACACG 2550
Query 2568 AGCTTGCTAGAGACCTTACAAGGGAAACTGCGTGGGAGGCGGTTATGCGAATAAGATGTG 2627
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2551 AGCTGGCTAGAGACCTTACAAGGGAAACTGCGTGGGAGGCGGTTATGCGAATAAGATGTG 2610
Query 2628 GAAAAGGAATTCGTTTCTCGTCCTACCATGGGAACTTCATGCTAAGGTCTACTGACCTGC 2687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2611 GAAAAGGAATTCGTTTCTCGTCCTACCATGGGAACTTCATGCTAAGGTCTACTGACCTGC 2670
Query 2688 TTGCTCTTCCTGCTGTTGACTGTGACAAAGCGTATGCAATGCAGCTATCTCTTGAGGAGA 2747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2671 TTGCTCTTCCTGCTGTTGACTGTGACAAAGCGTATGCAATGCAGCTATCTCTTGAGGAGA 2730
Query 2748 CTTTGCTAACATCCCAGACTGTGTATTTCCAAGTGGCTTTGCTATATACCGCCTCTTGTG 2807
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2731 CATTGCTAACATCCCAGACTGTATATTTCCAAGTGGCTTTGCTATATACTGCCTCTTGCG 2790
Query 2808 GAGAGAGACGTATAAGGGTACACACATCTGTTGCACCAGTGGTTACAGATCTTGGGGAGA 2867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2791 GAGAGAGACGTATAAGGGTACACACATCTGTTGCACCAGTGGTTACAGATCTTGGGGAGA 2850
Query 2868 TGTATAGACAAGCAGACACTGGTTCCATTGTGTCTTTATATGCTAGATTAGCAATTGAGA 2927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2851 TGTATAGACAAGCAGACACTGGTTCCATTGTGTCTTTATATGCTAGATTAGCAATTGAGA 2910
Query 2928 AATCTTTGTCCGCAAAATTGGATGATGCACGGAATGCAATACAGCAAAAGATTGTTAAAG 2987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2911 AATCTTTGTCCGCAAAATTGGATGATGCACGGAATGCAATACAGCAAAAGATTGTTAAAG 2970
Query 2988 CCCTCAAAGAATATCGTAATCTTCACGCGGTGCAGCATCGCTTGGGGTCCAGATTAGTAT 3047
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2971 CCCTCAAAGAATATCGTAATCTTCACGCGGTGCAGCATCGCTTGGGGTCCAGATTAATAT 3030
Query 3048 ACCCAGAGTCTCTGAAGTTCTTGCCATTGTACGGATTGGCAATTACTAAGTCCACTCCTC 3107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3031 ACCCAGAGTCTCTGAAGTTCTTGCCATTGTACGGATTGGCAATTACTAAGTCCACTCCTC 3090
Query 3108 TTCTAGGTGGACCTGCTGATACTTCTCTTGATGAGCGCTGTGCTGCAGGCTTCACCATGA 3167
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3091 TTCTAGGTGGGCCTGCTGATACTTCTCTTGATGAGCGCTGTGCTGCAGGCTTCACCATGA 3150
Query 3168 TGGCTCTGCCTGTCAAAAAGCTATTGAAGCTTTTGTATCCCAATTTATTCCGTGTTGACG 3227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3151 TGGCTCTGCCTGTCAAAAAGCTATTGAAGCTTTTGTATCCCAATTTATTCCGTGTTGACG 3210
Query 3228 AATGGCTCTTAAAGCCATCAGCAGCCCACGATGACTTTAAAGACGTATTAAGGAGATTGC 3287
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3211 AATGGCTCTTAAAGCCATCAATAGACCACGATGACTTTAAGGACGTATTAAGGAGATTGC 3270
Query 3288 CGCTGGCTGCAGAGAGTTTGGATTCTAGAGGCCTTTACATATATGATGATGGTTTTCGAT 3347
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3271 CTCTGGCTGCAGAGAGTTTGGATTCTAGAGGCCTTTACATATATGATGATGGTTTTCGAT 3330
Query 3348 TAGTTTTGTGGTTTGGCCGGATGCTTTCACCTGACATTGCTAAAAATCTTCTTGGGGTTG 3407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3331 TAGTTTTGTGGTTTGGCCGGATGCTTTCACCTGACATTGCTAAAAATCTTCTTGGGGGTG 3390
Query 3408 ACTTTGCAGCAGACCTCTCAAGGGTTACCTTTCAAGAGCAAGAGAATGGGATGTCAAAGA 3467
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3391 ACTTTGCAGCAGAGCTCTCAAGGGTTACCTTTCAAGAGCAAGAGAATGGGATGTCGAAGA 3450
Query 3468 AGCTAATGAGGTTGGTAAAGAAACTGAGGGAGAGTGATCCTTCATATCACCCCATGTGTT 3527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3451 AGCTAATGAGGTTGGTAAAGAAACTGAGGGAGAGTGATCCTTCATATCACCCCATGTGTT 3510
Query 3528 TTCTAGTGAGACAAGGAGAACAACCCCGAGAAGGCTTCCTTCTCCTCAGAAATCTCATTG 3587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3511 TTCTAGTGAGACAAGGAGAACAACCCCGAGAAGGCTTCCTTCTCCTCAGAAATCTCATTG 3570
Query 3588 AGGACCAGATGGGCGGTTCGAGTGGTTATGTCGATTGGATTCTACAACTTCACCGCCAAG 3647
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3571 AGGACCAGATGGGCGGTTCGAGTGGTTATGTTGATTGGATTCTACAACTTCACCGCCAAG 3630
Query 3648 TTCAACAAAACTAAGATAGCTCACAATGACAACTCG-GG-TGCTAGGATGCCACCTCTTT 3705
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||
Sbjct 3631 TTCAACAAAACTAAGATAGCTCACAATG-CAACTCTTGGATGCCAGGATGC-ACCTCTTT 3688
Query 3706 GTAACCATTGAAGAACTCTTGAGCTCAAAAATCTTCTACTTAAGCAGGATCATGGCGGCC 3765
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3689 GTAACCAT-GAAGAACTCTTGAGCTCAAAAATCTTCTACTTAAGCAGGATCATGGCGGCC 3747
Query 3766 TTCTTCCTTGGGCCATAATGTGTTGTTTTGGATAAA-GAAGTGCTACtttttgatttttc 3824
| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 3748 TGCTTCCTTGGGCGTTAATGTGTTGTTTTGAAAAAAAGAAGTGCTA-TTTT-GATTTTTC 3805
Query 3825 ttcatttgtttttctatatagaccttttttctcaagat-taggcttttatttGCCTAACC 3883
||||||| |||| || || |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 3806 TTCATTTATTTT-CTGTA--GACCTTTTC-CTCAAG-TCTAGGCTTTTATTTGCCTAACC 3860
Query 3884 AGAATGGTTATCTCCG-TAAGATTAGTCGTTTTTTAAATCTTTTGTTGCCtttttttttt 3942
||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 3861 AGAATGGTTTTGTCCCATAAGATTAGTCGTTTTTTAA-TCTTTTATTGCCTTTTTTTTTG 3919
Query 3943 GTCCTCATTCGA-TTTTTTGTTGATGTGCGTCTGTTCTAGATTTATTTTGGGAGTTGCAG 4001
|| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3920 GTTCTCTTTCGAATTTTTTGTTGTTGTGCGTCTGTACTAGATTTATTTTGGGAGTTACAG 3979
Query 4002 TTCATGAATCTGTCCTAATTAGGGTTATTAACAAGAAGATG 4042
||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3980 TTCATGAATCT--CGTAATTAGGGTTATTAACAAGAAAATG 4018
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 154856264537
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5