BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G07160.1
Length=5870
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg340908 jgi|Araly1|340908|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000671 8495 0.0
> Ahg340908 jgi|Araly1|340908|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000671
Length=5616
Score = 8495 bits (4600), Expect = 0.0
Identities = 4937/5100 (97%), Gaps = 22/5100 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCTCGAGCTGAGTCATCTTGGGAGAGGCTGGTGAATGCTGCTTTACGGAGAGATAGA 60
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTCGAGCTGAGTCATCGTGGGAGAGGCTAGTGAGTGCTGCTTTACGGAGAGATAGA 60
Query 61 ACAGGAGGAGTTGCTGGTGGTAATCAAAGCAGTATTGTTGGTTATGTCCCTTCCTCACTA 120
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 61 ACAGGAGGAGTTGCTGGTGGTAACCAAAGCAGTATTGTTGGCTATGTCCCTTCGTCACTA 120
Query 121 TCCAACAATAGGGACATCGATGCAATTCTTAGAGCTGCCGATGAGATTCAGGATGAGGAT 180
|| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 121 TCGAACAATAGGGACATAGATGCCATTCTCAGAGCTGCAGATGAGATCCAGGATGAGGAT 180
Query 181 CCCAACATTGCAAGAATCTTATGTGAGCATGGTTACTCACTTGCACAAAATCTCGATCCT 240
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCAAACATTGCAAGGATCTTATGTGAGCATGGTTACTCACTTGCACAAAATCTCGATCCT 240
Query 241 AATAGTGAAGGCAGAGGTGTTTTACAGTTCAAAACTGGATTGATGTCTGTTATTAAGCAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AATAGTGAAGGCAGAGGTGTTTTACAGTTCAAAACTGGATTGATGTCTGTTATTAAGCAA 300
Query 301 AAATTAGCAAAAAGAGAGGTTGGGACCATAGACAGAAGTCAGGATATTCTTCGACTACAA 360
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 301 AAATTAGCAAAAAGAGAGGTTGGGAACATAGACAGAAGTCAGGATATTCTCCGACTACAA 360
Query 361 GAATTTTACAGGCTATACAGAGAAAAGAACAATGTTGACACGTTGAAGGAGGAAGAGAAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 361 GAATTTTACAGGCTATACAGAGAAAAGAACAATGTTGACACGTTGAAGGAGGAGGA-AAA 419
Query 421 -CAGCTCCGTGAGTCGGGGGCTTTCACTGACGAGCTGGAACGGAAAACAGTAAAAAGGAA 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GCAGCTCCGTGAGTCGGGGGCTTTCACTGACGAGCTGGAACGGAAAACAGTAAAAAGGAA 479
Query 480 AAGAGTTTTTGCCACCCTGAAAGTTCTGGGAAGTGTGTTGGAGCAGTTGGCAAAAGAGAT 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 480 AAGAGTTTTTGCCACCCTGAAAGTTCTGGGAAGTGTGTTGGAGCAATTGTCAAAAGAGAT 539
Query 540 TCCTGAAGAGCTTAAGCATGTTATTGATTCAGACGCTGCAATGAGTGAAGACACAATTGC 599
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TCCTGAAGAGCTGAAGCATGTTATTGATTCAGATGCTGCAATGAGTGAAGACACAATTGC 599
Query 600 TTATAACATTATTCCTCTTGATGCTCCTGTCACGACAAATGCCACTACAACTTTCCCTGA 659
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 600 TTATAACATAATTCCTCTTGATGCTCCTGTCACGACAAATGCCACTACGACTTTCCCTGA 659
Query 660 GGTTCAAGCGGCAGTTGCAGCATTGAAGTATTTTCCAGGCTTGCCTAAATTGCCTCCTGA 719
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 660 GGTTCAAGCTGCAGTTGCAGCATTGAAGTATTTTCCAGGCTTGCCTAAATTGCCTGCTGA 719
Query 720 TTTCCCCATTCCCGCTACAAGGACTGCTGATATGCTTGATTTTCTCCACTATATTTTTGG 779
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 720 TTTCCCCATTCCCGTTACAAGGATTGCTGATATGCTTGATTTTCTCCACTATATATTTGG 779
Query 780 GTTTCAGAAAGACAGTGTCTCGAATCAGCGTGAACATATAGTTCTTCTTCTGGCTAATGA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GTTTCAGAAAGACAGTGTCTCGAATCAGCGTGAACATATAGTTCTTCTTCTGGCTAATGA 839
Query 840 GCAATCCCGTCTTAATATTCCAGAAGAAACAGAACCTAAACTGGATGACGCTGCAGTGCG 899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GCAATCCCGTCTTAATATTCCAGAAGAAACAGAACCTAAACTGGATGACGCTGCAGTGCA 899
Query 900 TAAGGTGTTCTTGAAGTCCCTGGAAAACTACATCAAGTGGTGTGATTACCTTTGTATTCA 959
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 900 TAAGGTGTTCTTAAAGTCCCTGGAAAACTACATCAAGTGGTGTGATTACCTCTGTATTCA 959
Query 960 ACCTGCGTGGAGCAATTTAGAAGCCATCAATGGAGATAAGAAACTGCTATTCCTCTCTTT 1019
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ACCTGCGTGGAGCAATTTAGAAGCCATCAGTGGAGAGAAGAAACTGCTATTCCTCTCTTT 1019
Query 1020 GTACTTCCTGATTTGGGGAGAAGCTGCCAACATACGGTTTCTTCCAGAATGTTTGTGCTA 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GTACTTCCTGATTTGGGGAGAAGCTGCCAACATACGGTTTCTTCCAGAATGTTTGTGCTA 1079
Query 1080 CATATTCCACCATATGGTTAGAGAAATGGATGAGATCTTACGCCAGCAGGTTGCTCGCCC 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 CATATTCCACCATATGGTTAGAGAAATGGATGAGATCCTACGCCAGCAGGTTGCTCGCCC 1139
Query 1140 AGCTGAGAGTTGTATGCCAGTCGATAGTCGTGGCTCTGATGATGGTGTATCATTCCTTGA 1199
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AGCTGAGAGTTGTATGCCAGCCGATAGTCGTGGCTCTGATGATGGTGTATCATTCCTTGA 1199
Query 1200 TCATGTCATTGCTCCGCTGTATGGAGTGGTTTCAGCGGAAGCTTTTAACAATGACAATGG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TCATGTCATTGCTCCGCTGTATGGAGTGGTTTCAGCGGAAGCTTTTAACAATGACAATGG 1259
Query 1260 CCGAGCACCTCATTCAGCTTGGAGAAACTATGATGATTTCAATGAATATTTTTGGTCTCT 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1260 CCGAGCACCTCATTCAGCTTGGAGAAACTATGATGATTTCAATGAATATTTTTGGTCACT 1319
Query 1320 TCACTCCTTTGAGCTTGGTTGGCCGTGGCGTACCAGTTCATCtttttttCAGAAACCTAT 1379
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1320 TCATTCCTTTGAGCTTGGTTGGCCGTGGCGTACCAGTTCATCTTTCTTTCAGAAACCTAT 1379
Query 1380 ACCGAGAAAAAAGC-T---C--AAAACCGGCAGGGCAAAACATCGAGGAAAAACTTCCTT 1433
||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 ACCGAGAAAAAAGTATGAGCTTAAAACCGGCAGGGCAAAACATCGAGGAAAAACTTCCTT 1439
Query 1434 TGTTGAGCACCGGACATTTTTGCATCTGTACCACAGTTTCCATCGGTTATGGATATTTCT 1493
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TGTTGAGCACCGGACATTTTTGCATCTCTACCACAGTTTCCATCGGTTATGGATATTTCT 1499
Query 1494 TGCTATGATGTTTCAGGCATTAGCCATAATTGCGTTCAATAAAGATGACCTTACTTCCAG 1553
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1500 TGCTATGATGTTTCAGGCATTAGCCATAATTGCGTTCAATAAAGATGACCTTACGTCCAC 1559
Query 1554 AAAGACTTTACTTCAAATTCTCAGCCTGGGTCCGACTTTTGTAGTGATGAAGTTTTCTGA 1613
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 AAAGACTTTACGTGAAATTCTCAGCCTGGGTCCGACTTTTGTAGTGATGAAGTTTTCTGA 1619
Query 1614 GAGTGTTTTGGAAGTTATCATGATGTACGGTGCCTATTCTACAACAAGACGTCTGGCTGT 1673
||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 GAGTGTTCTGGATGTTATCATGATGTATGGTGCCTATTCTACAACAAGACGTCTGGCTGT 1679
Query 1674 TTCTCGCATTTTTCTTCGTTTCATTTGGTTTGGCCTTGCTTCCGTCTTCATCTCTTTCCT 1733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TTCTCGCATTTTTCTTCGTTTCATTTGGTTTGGCCTTGCTTCCGTCTTCATCTCTTTCCT 1739
Query 1734 CTATGTGAAATCACTTAAAGCACCAAATTCTGATTCACCTATAGTTCAGCTTTATTTGAT 1793
|||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||
Sbjct 1740 CTATGTGAAAGCACTTAAAGAACCAAATTCTGACTCACCCATATTTAAGCTTTATTTGAT 1799
Query 1794 CGTCATAGCCATCTATGGAGGTGTTCAGTTCTTTTTTAGTATCCTGATGCGTATCCCAAC 1853
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 CGTCATAGCCATCTATGGTGGTGTTCAGTTCTTCTTTAGTATCCTGATGCGTATCCCAAC 1859
Query 1854 TTGTCACAACATTGCTAATAAATGTGATCGGTGGCCTGTGATTCGATTCTTTAAGTGGAT 1913
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 TTGTCACAACATTGCTAATAAATGTGATCGGTGGCCCGTTATTCGATTCTTTAAGTGGAT 1919
Query 1914 GCGCCAGGAGAGACACTATGTTGGCCGTGGCATGTATGAAAGGACATCTGATTTTATAAA 1973
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GCGCCAGGAGAGACACTATGTTGGGCGTGGCATGTATGAAAGGACATCTGATTTTATAAA 1979
Query 1974 GTACTTGCTATTTTGGCTTGTCGTTCTGTCTGCAAAGTTTTCGTTTGCGTACTTTCTTCA 2033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 GTACTTGCTATTTTGGCTTGTCGTTCTGTCTGCAAAGTTTTCGTTTGCGTACTTTCTTCA 2039
Query 2034 GATTAAGCCGCTCGTTGGCCCCACAAGGATGATAGTGAAACAGAACAATATTCCGTACTC 2093
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 GATTGAGCCGCTCGTTGGCCCCACAAGGATGATAGTGAAACAGAACAATATTCCGTACTC 2099
Query 2094 CTGGCATGATTTTGTGTCGAGAAAAAACTACAATGCTCTGACTGTTGCCAGTTTATGGGC 2153
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 GTGGCATGATTTTGTGTCAAGAAAAAACTACAATGCGCTGACTGTTGCCAGTTTATGGGC 2159
Query 2154 TCCTGTGGTAGCTATATACCTGTTAGACATCCATATATTCTACACCATTTTCTCTGCTTT 2213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2160 TCCTGTGGTAGCTATATACCTGTTAGACATCCATATATTCTACACCATTGTCTCTGCTTT 2219
Query 2214 TTTGGGGTTCTTGCTTGGTGCAAGAGATCGTTTGGGGGAGATAAGATCTTTGGAAGCGAT 2273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2220 TTTGGGGTTCTTGCTTGGTGCAAGAGATCGTTTGGGGGAGATAAGATCTTTGGAAGCAAT 2279
Query 2274 TCATAAACTCTTTGAGGAGTTTCCAGGGGCTTTTATGAGGGCTCTTCATGTTCCTCTTAC 2333
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TCACAAACTCTTTGAGGAGTTTCCAGGGGCCTTTATGAGGGCTCTTCATGTTCCTCTTAC 2339
Query 2334 CAATCGGACGTCTGATACTTCTCATCAGACTGTGGATAAGAAGAACAAAGTAGATGCAGC 2393
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2340 CAATCGGACGTCTGATACTTCTCATCAGGCTGTGGATAAGAA---CAAAGTAGATGCAGC 2396
Query 2394 ACACTTTGCTCCATTTTGGAACCAAATAATAAAAAGTTTACGAGAGGAAGACTACATCAC 2453
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2397 ACACTTTGCTCCTTTTTGGAACCAAATAATTAAAAGTTTACGAGAGGAAGACTACATCAC 2456
Query 2454 TGATTTTGAGATGGAATTGCTCCTGATGCCCAAGAATTCTGGTAGGCTCGAATTGGTTCA 2513
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2457 TGATTTTGAGATGGAGTTGCTCTTGATGCCCAAGAATTCTGGTAGGCTCGAATTGGTTCA 2516
Query 2514 GTGGCCACTTTTTCTTCTTTCCAGCAAGATATTATTGGCCAAAGAGATTGCAGCTGAGAG 2573
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2517 ATGGCCACTTTTTCTTCTTTCCAGCAAGATATTATTGGCCAAAGAGATTGCTGCTGAGAG 2576
Query 2574 TAATTCGCAAGAGGAGATTCTGGAGAGGATTGAAAGGGATGACTATATGAAGTATGCTGT 2633
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2577 TAATTCGCAAGAGGAGATTCTGGAGAGAATTGAAAGGGATGAATATATGAAGTATGCTGT 2636
Query 2634 TGAGGAAGTCTATCACACTCTCAAACTTGTCCTAACAGAAACTCTGGAAGCCGAAGGAAG 2693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2637 TGAGGAAGTCTATCACACTCTCAAACTTGTCCTAACAGAAACTCTGGAAGCCGAAGGGAG 2696
Query 2694 GCTGTGGGTGGAGAGAATCTATGAAGATATCCAAA-CCAGCTTAAAGGAGAGAAATATAC 2752
| |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2697 GATGTGGGTGGAGAGAATCTTTGATGATATC-AAGGCCAGCTTAAAGGAGAGAAATATAC 2755
Query 2753 ATCATGATTTTCAGTTGAACAAGCTCTCCCTTGTTATCACGAGAGTGACTGCACTCTTGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2756 ATCATGATTTTCAGTTGAACAAGCTCTCCCTTGTTATCACGAGAGTGACTGCATTCTTGG 2815
Query 2813 GAATCCTGAAAGAAAATGAAACACCGGAGCATGCAAAAGGGGCTATCAAAGCACTTCAGG 2872
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2816 GAATCCTGAAAGAAAATGAAACACCGGAGCATGAAAAAGGGGCCATCAAAGCACTTCAGG 2875
Query 2873 ATCTCTACGATGTTATGCGGCTTGACATATTGACTTTTAATATGAGGGGTCATTATGAAA 2932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2876 ATCTCTACGATGTTATGCGGCTTGACATATTGACTTTTAATATGAGGGGTCATTATGAAA 2935
Query 2933 CGTGGAACCTGTTAACTCAAGCCTGGAATGAAGGTCGGCTTTTTACAAAGTTGAAATGGC 2992
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2936 CGTGGAACCTATTAACTCAAGCCTGGAATGAAGGTCGGCTTTTTACAAAATTGAAATGGC 2995
Query 2993 CTAAAGACCCTGAGCTGAAAGCACTCGTCAAAAGATTGTACTCTCTATTTACTATCAAAG 3052
||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2996 CTAAAGATCCTGAGATGAAAGCTCTCGTCAAAAGATTGTACTCTTTATTTACTATCAAAG 3055
Query 3053 ATTCTGCAGCGCATGTTCCTAGAAATCTTGAGGCCAGACGTAGACTTCAATTCTTCACCA 3112
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 3056 ATTCTGCAGCGCATGTTCCTAGAAATCTTGAGGCCAGACGCAGACTGCAATTCTTCACCA 3115
Query 3113 ATTCTCTTTTCATGGATGTGCCACCACCTAAGTCTGTCCGCAAGATGTTATCCTTCAGTG 3172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 ATTCTCTTTTCATGGATGTGCCACCACCTAAGTCTGTCCGCAAGATGTTATCCTTCAGTG 3175
Query 3173 TCTTCACTCCATACTATTCCGAGGTTGTGCTATACAGCATGGCTGAACTCACCAAGAGAA 3232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3176 TCTTCACTCCATACTATTCCGAGGTTGTGCTATACAGCATGGCTGAACTCACCAAGAGAA 3235
Query 3233 ATGAGGATGGAATATCAATACTGTTTTATCTTCAGAAAATATATCCAGATGAGTGGAAAA 3292
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3236 ATGAGGATGGAATATCAATCCTGTTTTACCTTCAGAAAATATATCCAGATGAGTGGAAAA 3295
Query 3293 ATTTTCTTGCACGCATAGGACGAGACGAAAATGCGTTAGAAGGCGATCTAGATAATGAAA 3352
|||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3296 ATTTTCTTGCACGCATAGGAAGGGATGAAAATGCGTTAGAAGGCGATCTAGATAATGAAA 3355
Query 3353 GAGACATACTTGAACTTCGATTTTGGGCCTCTTACCGTGGACAAACGTTAGCTAGAACAG 3412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3356 GAGACATACTTGAACTTCGATTTTGGGCCTCTTACCGTGGACAAACGTTAGCTAGAACAG 3415
Query 3413 TTCGTGGGATGATGTATTATAGGAAAGCCCTCATGCTTCAGTCTTATCTGGAAAGAAAAG 3472
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 3416 TTCGCGGGATGATGTATTATAGGAAAGCCCTCATGCTTCAGTCTTATCTGGAGAGAAAGG 3475
Query 3473 CTGGCA-A-----TGA---CGCTACAGACGCTGAAGGATTTGAGTTATCTCCAGAAGCAA 3523
|||| | | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3476 CTGGAAGAGACGATGAGGACGCAACAGACGCTGAAGGCTTTGAGTTATCTCCAGAAGCAA 3535
Query 3524 GGGCCCAAGCAGATCTCAAGTTCACATATGTTGTCACATGCCAGATATATGGAAGACAAA 3583
||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3536 GGGCCCAGGCAGATCTGAAGTTTACATATGTCGTCACATGCCAGATATATGGAAGACAGA 3595
Query 3584 AAGAAGATCAAAAACCTGAAGCTGTTGACATTGCATTGCTAATGCAAAGAAATGAAGCCC 3643
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3596 AAGAAGATCAAAAACCTGAAGCTGTTGACATTGCCTTGCTAATGCAAAGAAATGAAGCCC 3655
Query 3644 TTCGCATTGCTTATATTGATGTTGTTGATAGTCCAAAAGAGGGTAAATCTCATACGGAAT 3703
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3656 TTCGCATTGCTTATATTGATGTTGTTGATACTCCAAAAGAGGGTAAATCTTATACGGAAT 3715
Query 3704 ATTATTCAAAACTTGTGAAGGCCGACATCAGTGGAAAGGATAAGGAAATTTACTCCATAA 3763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3716 ATTATTCAAAACTTGTGAAGGCCGACATCAGTGGAAAAGATAAGGAAATTTACTCCATAA 3775
Query 3764 AGTTGCCTGGGGACCCGAAACTTGGCGAAGGCAAACCTGAGAATCAAAACCACGCCATTG 3823
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 3776 AGTTGCCTGGGGACCCAAAACTTGGCGAAGGCAAACCTGAGAATCAAAACCATGCTATTG 3835
Query 3824 TGTTTACTCGCGGAAATGCTATCCAAACTATTGATATGAATCAGGATAATTATTTTGAAG 3883
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3836 TGTTTACTCGTGGAAATGCTATCCAAACTATTGATATGAATCAGGATAATTATTTTGAAG 3895
Query 3884 AAGCCTTAAAGATGAGAAATCTTTTGGAGGAATTTGACCGGGACCATGGAATTCGACCAC 3943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3896 AAGCCTTAAAGATGAGAAATCTTTTGGAGGAATTTGACCGGGACCATGGAATTCGACCAC 3955
Query 3944 CTACTATTCTTGGAGTTAGGGAACATGTCTTTACTGGAAGTGTCTCCTCCTTGGCATCTT 4003
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 3956 CTACCATTCTTGGAGTTAGGGAACACGTCTTTACTGGAAGTGTCTCCTCATTGGCCTCTT 4015
Query 4004 TCATGTCCAATCAAGAAACCAGCTTTGTAACTCTAGGTCAACGAGTATTGGCAAAACCCT 4063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4016 TCATGTCCAATCAAGAAACCAGCTTTGTAACTCTAGGTCAACGAGTATTGGCAAAACCCT 4075
Query 4064 TAAAGATCCGCATGCATTATGGTCATCCAGATGTCTTTGACAGAGTATTTCATATTACAC 4123
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4076 TAAAGATCCGCATGCATTATGGTCATCCAGATGTCTTTGACAGAGTTTTTCATATTACAC 4135
Query 4124 GTGGTGGTATCAGCAAGGCCTCTCGGGTCATCAATATTAGTGAAGATATATTTGCTGGTT 4183
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4136 GTGGTGGTATCAGCAAGGCCTCTCGAGTCATCAATATTAGTGAAGATATTTTTGCTGGTT 4195
Query 4184 TCAACACAACTCTACGTCAAGGGAATGTTACTCATCATGAGTATATTCAGGTGGGCAAAG 4243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4196 TCAACACAACTCTACGTCAAGGGAATGTTACTCATCATGAGTATATTCAGGTGGGCAAAG 4255
Query 4244 GGCGAGATGTTGGGCTCAATCAAATAGCTCTGTTTGAAGGGAAGGTTGCTGGTGGGAATG 4303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4256 GGCGAGATGTTGGGCTCAATCAAATAGCTCTGTTTGAAGGGAAGGTTGCTGGTGGCAATG 4315
Query 4304 GTGAACAGGTTCTTAGTCGAGATGTATACAGACTTGGCCAGCTCCTTGATTTCTTCCGTA 4363
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4316 GTGAACAGGTTCTTAGTCGAGATGTATACAGACTTGGCCAGCTCCTTGATTTCTTCCGAA 4375
Query 4364 TGATGTCATTCTTCTTTACAACCGTTGGCTTCTATCTATGTACAATGTTGACGGTGCTTA 4423
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4376 TGATGTCATTCTTCTTTACAACCGTTGGCTTCTATTTATGTACAATGTTGACGGTGCTTA 4435
Query 4424 CTGTGTATATTTTCTTATATGGGAGGGCATATCTGGCACTTTCTGGAGTTGGAGCTACTA 4483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4436 CTGTGTATATTTTCTTATATGGGAGGGCATATCTGGCACTTTCTGGAGTTGGAGCTACTA 4495
Query 4484 TTCGAGAAAGAGCTATTCTTCTGGACGATACTGCACTTAGCGCCGCCTTGAATGCTCAGT 4543
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4496 TTCGAGAAAGAGCTATTCTTCTGGATGACACTGCACTTAGCGCCGCCTTGAATGCTCAGT 4555
Query 4544 TTCTGTTTCAGATTGGTGTCTTCACTGCTGTGCCAATGGTTTTGGGATTTATTTTGGAAC 4603
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4556 TTCTGTTTCAGATTGGTGTCTTCACTGCTGTGCCAATGGTTTTGGGGTTTATTTTGGAAC 4615
Query 4604 AGGGTTTTCTCCAGGCCATCGTCAGTTTCATAACAATGCAATTTCAGCTATGTACTGTCT 4663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4616 AGGGTTTTCTCCAGGCCATCGTCAGTTTCATAACAATGCAATTTCAGCTATGTACTGTCT 4675
Query 4664 TCTTCACATTTTCCCTTGGTACAAGAACCCATTATTTTGGACGGACAATTCTCCATGGTG 4723
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4676 TCTTCACATTTTCCCTTGGCACAAGAACCCATTATTTTGGACGGACAATTCTCCATGGTG 4735
Query 4724 GTGCAAGGTACCAAGCCACTGGAAGAGGCTTCGTCGTGAAGCATATCAAATTTTCTGAAA 4783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4736 GTGCAAGGTACCAAGCCACTGGAAGAGGCTTCGTCGTGAAGCATATCAAATTTTCTGAAA 4795
Query 4784 ACTACCGTCTTTATTCCAGAAGTCATTTTGTCAAAGCAATGGAAGTTATTCTTTTATTGG 4843
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 4796 ACTACCGTCTTTATTCCAGAAGTCATTTTGTCAAAGGGATGGAAGTTATTCTCTTATTGG 4855
Query 4844 TTGTGTACCTTGCGTATGGCAATGATGAAGCTGGTGCGGTTTCCTACATCCTGCTGACAG 4903
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 4856 TTGTCTACCTTGCATATGGCAATGATGAAGCTGGTGCGGTTTCCTACATTCTTCTGACTG 4915
Query 4904 TTAGCAGCTGGTTTTTGGCTGTTTCTTGGCTGTTTGCTCCGTACCTATTCAACCCTGCCG 4963
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4916 TGAGCAGCTGGTTTTTGGCTGTTTCCTGGCTGTTTGCTCCGTACCTGTTCAACCCTGCCG 4975
Query 4964 GATTTGAGTGGCAGAAAGTCGTGGAGGACTTCAAAGAATGGACAAATTGGCTCTTTTACA 5023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4976 GATTTGAGTGGCAGAAAGTCGTGGAGGACTTCAAAGAATGGACAAATTGGCTCTTTTACA 5035
Query 5024 GAGGTGGAATTGGTGTGAAAGGAGCTGAAAGCTGGGAAGCATGGTGGGAAGAAGAACTGT 5083
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5036 GAGGTGGAATTGGTGTGAAAGGAGCTGAAAGCTGGGAAGCATGGTGGGAAGAAGAATTGT 5095
Score = 867 bits (469), Expect = 0.0
Identities = 505/523 (97%), Gaps = 0/523 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5151 GTATGGTATTGTCTACAAACTGAAGCTACAAGGATCAGATACATCATTTGCGGTGTACGG 5210
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5094 GTATGGTATTGTCTACAAACTGCAGCTACAAGGATCAGATACATCATTTGCGGTGTACGG 5153
Query 5211 TTGGTCATGGGTTGCATTTGCAATGATTATAGTTCTTTTCAAGGTCTTTACCTTCAGCCA 5270
||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5154 TTGGTCATGGGTTGCATTTGCGATGAGTATAGTACTTTTCAAGGTCTTTACCTTCAGCCA 5213
Query 5271 GAAGATTTCTGTCAATTTCCAGCTTTTACTGAGGTTTATACAAGGTCTATCCTTATTGAT 5330
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5214 GAAGATTTCTGTCAATTTCCAGCTTTTGCTGAGGTTTATACAAGGTCTATCCTTATTGAT 5273
Query 5331 GGCTCTAGCTGGCATAATCGTAGCAGTTGTGCTCACACCCTTGTCAGTGACAGACATATT 5390
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 5274 GGCTCTAGCTGGCATAATCGTAGCAGTTGTGCTCAAAAAGTTGTCAGTGACAGACATATT 5333
Query 5391 TGCATGCGTATTGGCTTTTATACCGACAGGATGGGGAATTCTTTCTATTGCGTGTGCTTG 5450
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5334 TGCATGCGTATTGGCTTTTATACCGACAGGATGGGGCATTCTTTCTATTGCGTGTGCTTG 5393
Query 5451 GAAGCCAGTCCTAAAGCGAATGGGGATGTGGAAATCGATTCGTTCCCTAGCAAGGCTATA 5510
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5394 GAAGCCAGTTTTAAAGCGAATGGGGATGTGGAAATCGATCCGTTCCCTAGCAAGGCTATA 5453
Query 5511 TGATGCGTTAATGGGAATGCTCATATTTCTTCCCGTTGCTCTCTGCTCCTGGTTCCCTTT 5570
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5454 TGATGCATTAATGGGAATGCTCATATTTCTTCCCGTTGCTCTCTGCTCGTGGTTCCCTTT 5513
Query 5571 TGTGTCGACCTTCCAGACACGTATGATGTTTAACCAAGCCTTCAGCCGCGGTCTCGAGAT 5630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 5514 TGTGTCGACCTTCCAGACACGTATGATGTTTAACCAAGCTTTCAGCCGCGGTCTGGAGAT 5573
Query 5631 CTCTCTTATTCTTGCAGGAGACAATCCCAATTCTGGTCTTTAA 5673
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5574 CTCTCTTATCCTTGCAGGAGACAATCCCAATTCTGGTCTTTAA 5616
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 222370399039
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5