BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G07980.1
Length=4514
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg903697 jgi|Araly1|903697|Al_scaffold_0003_825 6767 0.0
Ahg478740 jgi|Araly1|478740|fgenesh2_kg.3__1441__AT3G13530.1 5090 0.0
> Ahg903697 jgi|Araly1|903697|Al_scaffold_0003_825
Length=4113
Score = 6767 bits (3664), Expect = 0.0
Identities = 3965/4113 (96%), Gaps = 9/4113 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 134 ATGGCGCGACAGATGACGTCATCCCAGTTCCACAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAC 193
||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCGACAGATGACGTCATCTCAGTTTCATAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAT 60
Query 194 ATGCTAGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGGTCGAGTTTATATAGGATTAGACTTG 253
||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 61 ATGCTTGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGCTCGGGTTTATATAGGATTAGACCTG 120
Query 254 GAGAATGGAGACTTTGTTGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAACATTGGTCAAGAGGAT 313
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 121 GAGAATTGTGACTTTGTTGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAATATTGGTCAAGAGGAT 180
Query 314 CTTAACACCATAATGCAAGAAATCGATCTCCTAAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTC 373
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTTAACACCATCATGCAAGAAATCGATCTCCTAAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTC 240
Query 374 AAGTATCTCGGATCGTTGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTCTGGAGTACGTTGAG 433
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 241 AAGTATCTTGGATCGTTGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTCTGGAGTATGTTGAG 300
Query 434 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCTAATAAATTTGGACCTTTCCCAGAGTCGTTG 493
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 301 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCAAATAAATTTGGACCTTTCCCTGAGTCGTTG 360
Query 494 GTGACTGTTTACATTGCACAGGTCTTGGAAGGTTTAGTATATCTTCATGAGCAGGGTGTC 553
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 361 GTGACTGTTTACATTGCACAGGTCTTGGAAGGTTTAGTATATCTGCATGAGCAGGGTGTC 420
Query 554 ATACATCGTGATATCAAGGGTGCAAATATTTTGACAACCAAGGAGGGCCTTGTTAAGCTT 613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATACATCGTGATATCAAGGGTGCAAATATTTTGACAACCAAGGAGGGCCTTGTTAAGCTT 480
Query 614 GCTGATTTTGGAGTTGCCACAAAACTCAACGAGGCTGATTTTAACACTCACTCAGTGGTC 673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 481 GCTGATTTTGGAGTTGCCACAAAACTCAACGAGGCTGATTTCAACACTCACTCAGTGGTC 540
Query 674 GGAACTCCTTACTGGATGGCTCCTGAGGTTATTGAATTGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTCT 733
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGAACTCCTTACTGGATGGCTCCGGAGGTTATTGAATTGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTCT 600
Query 734 GACATTTGGAGTGTTGGATGCACTATTATTGAACTTTTGACTTGTGTACCTCCTTACTAT 793
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 601 GACATTTGGAGTGTTGGGTGCACTATTATTGAACTTTTGACGTGTGTACCTCCTTACTAT 660
Query 794 GATCTGCAACCCATGCCAGCCCTCTATCGCATTGTTCAGGATGATACCCCTCCTATTCCT 853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 661 GATCTGCAACCCATGCCAGCCCTCTATCGCATTGTTCAGGATGATACCCCTCCCATTCCT 720
Query 854 GATAGTCTTTCTCCTGATATTACAGACTTCCTAAGACTGTGCTTCAAGAAGGATTCCAGG 913
|||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GATAGTCTATCTCCCGATCTTACAGACTTCCTACGACTGTGCTTCAAGAAGGATTCCAGG 780
Query 914 CAGAGGCCTGATGCGAAGACACTTCTCTCTCACCCTTGGATACGTAACTCGAGACGAGCA 973
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||
Sbjct 781 CAGAGGCCTGATGCAAAGACACTTCTCTCACACCCTTGGATACGTAACTCAAAACAAGCA 840
Query 974 TTGCGGTCATCGCTTCGGCATAGTGGAACCATCAGATATATGAAGGAAACCGATTCAAGT 1033
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 841 TTGCGGTCATCACTTCGGCATAGTGGAACCATCAGATATATGAAGGAACCCGATTCAAGT 900
Query 1034 TCAGAGAAGGATGCTGAAGGTAGTCAAGAAGTAGTTGAAAGCGTTTCAGCAGAAAAAGTA 1093
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 901 TCAGAGAAGGATGATGAAGGTAGTCAAGAAGTAGCTGAAAGCTTTTCAGCAGAAAAAGTG 960
Query 1094 GAGGTGACAAAAACTAACTCGAAAAGCAAATTACCTGTTATAGGTGGGGCGAGTTTTAGG 1153
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 961 GAGGTGACAAAAACTAACTCGAAAAGCAAATTGCCTGTTATAGGTGTGGCGAGTTATAGG 1020
Query 1154 TCTGAGAAAGATCAATCTTCACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAACGGATTCAGAAGAT 1213
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1021 TCTGAGAAAGATCAGTCTTCACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAACGGATGCAGAAGAT 1080
Query 1214 GATATCAATTCAGATCAAGGTCCTACATTGTCTATGCACGATAAGTCTTCTCGTCAATCC 1273
|| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1081 TATCTTAATTCAGTTCAAGGTCCTACATTGTCTACGCACGATCAGTCTTCTCGTCAATCC 1140
Query 1274 GGTACTTGCAGTATTTCTTCGGATGCAAAGGGGACATCTCAAGATGTATTAGAGAACCAT 1333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GGTACTTGCAGTATTTCTTCGGATGCAAAGGGGACATCTCAAGATGTATTAGAGAACCAT 1200
Query 1334 GAGAAATATGATCGTGATGAAATACCTGGAAATCTTGAAACGGAAGCTTCTGAAGGTAGA 1393
|||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1201 GAGACATCTGAACGTGATGAAATACCTGGAAATCTTGAAAAGGAAGCTTCTGAAGGTAGA 1260
Query 1394 AGGAATACTTTAGCAACAAAGCTGGTTGGAAAAGAATATTC--T--A--T--C-CAGTCA 1444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||
Sbjct 1261 AGGAATACTTTAGCAACAAAGCTGGTTGGAAAAGAATATTCTGTCCAGGTGGCGCAGTCA 1320
Query 1445 TCACATAGTTTTAGCCAAAAAGGTGAAGATGGGCTTAGAAAGGCTGTGAAGACTCCATCT 1504
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TCACATAGTTTTAGCCAAAAAGGTGAAGTTGGGCTTCGAAAGGCTGTGAAGACTCCATCT 1380
Query 1505 AGTTTTGGTGGGAATGAACTGACCAGATTCAGTGATCCTCCTGGGGATGCTTCTTTGCAT 1564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 AGTTTTGGTGGGAATGAACTGACCAGATTCAGTGATCCTCCTGGGGATGCTTCTTTGCAT 1440
Query 1565 GATTTATTTCATCCACTGGATAAAGTTCCTGAGGGAAAAACAAATGAAGCCTCAACATCG 1624
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GATTTGTTTCATCCATTGGATAAAGTTCCTGAGGGAAAACCAAATGAAGCCTCAACATCG 1500
Query 1625 ACGCCTACTGCAAATGTAAATCAGGGTGATTCTCCTGTTGCAGATGGTGGAAAGAATGAT 1684
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 ACGCCTACTACAAATGTAAATCAGGGTGATTCTCCTGCTGCAGATGGTGGAAAGAATGAT 1560
Query 1685 CTGGCAACGAAATTGAGGGCTAGAATTGCTCAGAAGCAAATGGAGGGTGAAACGGGGCAC 1744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 CTGGCAACGAAATTGAGGGCTAGAATTGCTCAGAAGCAAATGGAGGGTGAAACGGGGCAC 1620
Query 1745 TCACAAGATGGTGGTGATCTTTTCCGCTTAATGATGGGTGTTTTGAAAGATGATGTCCTT 1804
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1621 TCACAAGATGGTGGTGATCTTTTCCGCTTAATGATGGGTGTTTTGAAAGATGATGTTCTT 1680
Query 1805 AACATCGATGACTTGGTATTTGATGAAAAAGTTCCCCCGGAGAATCTTTTTCCTCTGCAG 1864
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1681 AACATCGATGACTTGGTATTTGATGAAAAAGTGCCCCCGGAGAATCTTTTCCCTCTGCAG 1740
Query 1865 GCAGTCGAGTTCAGCAGATTGGTGAGCTCCTTAAGGCCAGATGAATCAGAAGATGCAATA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GCAGTCGAGTTCAGCAGATTGGTGAGCTCCTTAAGGCCAGATGAATCAGAAGATGCAATA 1800
Query 1925 GTAACTTCCTCTTTGAAACTTGTTGCCATGTTTCGTCAGAGACCTGGGCAGAAAGCAGTA 1984
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1801 GTAACTTCTTCTTTGAAACTTGTTGCCATGTTTCGTCAGAGACGTGGGCAGAAAGCAGTA 1860
Query 1985 TTTGTGACACAGAATGGTTTCCTCCCTCTAATGGATCTACTCGATATTCCTAAATCTCGA 2044
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1861 TTTGTGACACAGCATGGTTTCCTCCCTCTAATGGATCTACTTGATATTCCTAAATCTCGA 1920
Query 2045 GTAATATGTGCCGTGCTGCAGCTGATAAATGAAATTGTAAAAGATAATACCGACTTCCTG 2104
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 GTAATATGTGCCGTGCTGCAGCTGATAAACGAAATTGTAAAAGATAATACCGACTTCCTG 1980
Query 2105 GAAAATGCTTGTCTTGTTGGTCTTATTCCTTTGGTAATGAGTTTTGCTGGTTTTGAGAGG 2164
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 GAAAATGCTTGTCTCGTTGGTCTTATTCCTTTGGTAATGAGTTTTGCTGGTTTTGAGAGG 2040
Query 2165 GATCGATCACGAGAAATTCGTAAGGAAGCAGCCTACTTCTTGCAGCAGCTTTGTCAGTCA 2224
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2041 GATCGATCTCGAGAAATTCGTAAGGAAGCAGCCTACTTCTTGCAGCAGATTTGTCAGTCA 2100
Query 2225 AGCCCCTTGACGTTGCAAATGTTCATATCTTGCCGTGGAATACCCGTTTTGGTGGGATTT 2284
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 AGCCCCTTGACGTTGCAAATGTTCATAGCTTGCCGTGGAATACCCGTTTTGGTGGGATTT 2160
Query 2285 CTTGAAGCAGACTATGCCAAACACAGGGAGATGGTTCACTTGGCTATTGATGGGATGTGG 2344
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 CTTGAAGCAGATTATGCCAAACACAGGGAGATGGTTCACTTGGCTATTGATGGGATGTGG 2220
Query 2345 CAGGTATTTAAACTCAAAAAATCCACCTCGAGAAATGATTTTTGCCGTATTGCTGCAAAG 2404
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CAGGTATTTAAACTCAAAAGATCCACCTCTAGAAATGATTTCTGCCGTATTGCTGCAAAG 2280
Query 2405 AATGGAATTCTTCTTAGGCTAGTCAACACTCTTTATAGCTTGAGTGAGGCAACTCGACTG 2464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 AATGGAATTCTTCTTAGGCTAGTCAACACTCTTTATAGCTTGAGTGAGGCAACTCGACTG 2340
Query 2465 GCTTCTATATCGGGGGATGCATTGATTTTGGATGGTCAAACTCCACGAGCACGCTCTGGT 2524
||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 GCTTCTATATCAGGGGACGCATTGATTTTGGATAGTCAAACTCCACGAGCACGCTCTGGT 2400
Query 2525 CAACTTGACCCTAACAATCCTATCTTTAGTCAGCGTGAGACTTCACCTAGTGTGATTGAT 2584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 CAACTTGACCCTAACAATCCTATCTTTAGTCAGCGTGAGACTTCACCTAGTGTGATTGAT 2460
Query 2585 CATCCTGATGGGTTGAAAACTAGGAATGGGGGTGGTGAAGAGCCTTCTCATGCTTTAACT 2644
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2461 CATCCTGATGGGTTGAAAACTAGGAATGGGGGTGGTGAAGAGCCTTCTCATGCTTTAATT 2520
Query 2645 TCAAATTCTCAAAGTTCAGATGTCCATCAACCCGATGCCTTGCACCCAGATGGTGATAGG 2704
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 TCAAATTCTCAAAGATCAGATGTCCATCAACCCGATGCCTTGCACCCAGATGGTGATAGG 2580
Query 2705 CCTAGATTAAGCAGTGTTGTAGCAGATGCCACAGAGGATGTTATACAACAACATAGGATA 2764
||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 CCTAGATTAAGCAGTGTTGCAGCAGATGCCGCAGAAGATGTTATACAACAACATAGGATA 2640
Query 2765 TCTCTTTCTGCCAATAGAACATCAACAGATAAGCTTCAGAAACTGGCGGAGGGTGCGTCT 2824
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 TCTCTTTCTGCCAATATAACATCAACAGATAAGCTTCAGAAACTGGCGGAGGGTGCGTCT 2700
Query 2825 AATGGTTTTCCTGTTACTCAGCCAGATCAAGTTCGACCTTTGCTTAGCTTATTGGAGAAA 2884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 AATGGTTTTCCTGTTACTCAGCCAGATCAAGTTCGACCTTTGCTTAGCTTATTGGAGAAA 2760
Query 2885 GAACCTCCTTCAAGAAAAATTTCTGGTCAACTGGATTACGTAAAGCATATCGCTGGCATA 2944
|| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||
Sbjct 2761 GAGCCCCCTTCAAGAAAATTTTCTGGTCAACTGGATTATGTGAAGCATATCACTGGCATA 2820
Query 2945 GAGAGGCATGAAAGTAGACTTCCTCTTTTGTATGCATCAGACGAAAAGAAAACCAATGGA 3004
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2821 GAGAGACATGAAAGTAGACTTCCTCTTTTGTATGCATCAGACGAAAAGAAAACCAGTGGA 2880
Query 3005 GACCTAGAATTTATAATGGCTGAATTTGCAGAAGTCTCTGGACGTGGAAAGGAAAACGGA 3064
|||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2881 GACCTAGAATTTATAATGGCCGAATTAGCAGGAGTCTCTGGACGTGGAAAGGAAAACGGA 2940
Query 3065 AATCTTGATACTGCGCCAAGATATTCCAGCAAGACGATGACTAAGAAGGTTATGGCTATT 3124
||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2941 AATCTCGATACTGCACCTAGATATTCCAGTAAGACGATGACTAAGAAGGCTATGGCTATT 3000
Query 3125 GAGAGAGTCGCATCTACGTGTGGGATTGCATCTCAGACAGCATCTGGTGTTCTGTCAGGT 3184
|| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 3001 GAAAGAGTCGCTTCTGCGTGTGGGATTGCATCTCAGACAGTATCTAGTGTTCTGTCAGGT 3060
Query 3185 TCGGGTGTTTTAAATGCTAGACCTGGAAGTACCACATCATCTGGTTTACTTGCCCATGCG 3244
|| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3061 TCAGGTGTTTTAAATGCTAGAGCTGGAAGTACTACATCATCTGGTTTACTTGCCCATGCG 3120
Query 3245 CTGAGTGCAGATGTCTCAATGGATTACTTGGAGAAAGTGGCTGATCTGCTTCTTGAATTT 3304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3121 CTGAGTGCAGATGTCTCAATGGATTACTTGGAGAAAGTGGCTGATCTGCTTCTCGAATTT 3180
Query 3305 GCCCGAGCTGAAACGACAGTAAAATCATACATGTGCAGCCAAAGTTTACTCAGTCGTCTT 3364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 3181 GCCCGAGCTGAAACGACAGTAAAATCATACATGTGCAGCCAGAGCTTACTCAGTCGTCTT 3240
Query 3365 TTCCAGATGTTCAACCGTGTGGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAATGCACCAAT 3424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241 TTCCAGATGTTCAACCGTGTGGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAATGCACCAAT 3300
Query 3425 CATTTATCCACGGATCCAAATTGCTTGGAAAATCTTCAGCGTGCAGATGCAATCAAGCAA 3484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3301 CATTTATCCACGGATCCAAATTGCTTGGAAAATCTTCAGCGTGCAGATGCAATTAAGCAA 3360
Query 3485 TTGATCCCCAACCTTGAGCTTAAGGAAGGGCCTCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTA 3544
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3361 TTGATCCCCAACCTTGAACTTAAGGAAGGGCATCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTA 3420
Query 3545 CTTAGTGCACTATTCAACCTCTGCAAGATAAACAAGAGGAGGCAGGAACAAGCTGCTGAA 3604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3421 CTTAGTGCACTATTCAACCTCTGCAAGATAAACAAGAGGAGGCAGGAACAAGCGGCTGAA 3480
Query 3605 AATGGAATCATTCCGCACCTGATGCTTTTCGTCATGTCGGATTCTCCTCTGAAACAATAT 3664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 AATGGAATCATTCCGCACCTGATGCTTTTCGTCATGTCGGATTCTCCTCTGAAACAATAT 3540
Query 3665 GCATTGCCACTACTTTGTGATATGGCTCATGCATCTCGGAATTCAAGAGAGCAGTTAAGG 3724
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3541 GCATTGCCACTACTATGTGATATGGCTCATGCATCTCGGAATTCAAGAGAGCAGTTAAGG 3600
Query 3725 GCCCACGGCGGTCTGGATGTTTACCTGAGTTTACTCGATGATGAATATTGGTCCGTGATA 3784
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3601 GCCCACGGCGGTCTGGATGTTTACCTAAGTTTACTCGATGATGAATATTGGTCCGTGATA 3660
Query 3785 GCCTTGGATTCAATTGCTGTTTGCTTGGCGCAAGACGTTGACCAAAAGGTGGAGCAGGCG 3844
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3661 GCCTTGGATTCAATTGCTGTTTGCTTGGCGCAAGACATTGACCACAAGGTTGAGCAGGCA 3720
Query 3845 TTTCTCAAGAAAGATGCAATTCAGAAATTAGTTAACTTTTTCCAGAACTGTCCAGAGAGA 3904
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3721 TTTCTCAAGAAAGATGCAATTCAGAAATTAGTTAACTTCTTCCAGAACTGTCCAGAAAGA 3780
Query 3905 CATTTTGTGCACATTTTGGAGCCATTCTTGAAGATCATCACGAAATCATCTTCAATCAAT 3964
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3781 CATTTTGTGCACATTTTGGAGCCATTCTTGAAGATCATCACGAAATCATCTTCAATTAAT 3840
Query 3965 AAGACATTAGCGTTAAATGGACTGACTCCGTTACTCATTGCAAGACTAGACCACCAAGAT 4024
||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3841 AAGACATTAGCATTAAATGGATTGACTCCGCTACTTATTTCAAGACTAGACCACCAAGAT 3900
Query 4025 GCTATTGCTCGACTTAACCTCCTGAAACTCATCAAGGCCGTTTACGAGAAGCATCCGAAG 4084
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3901 GCGATTGCTCGACTTAACCTCCTGAAACTCATTAAGGCTGTTTACGAGAAGCATCCAAAG 3960
Query 4085 CCAAAACAGCTGATCGTAGAGAACGATCTTCCACAAAAACTGCAGAATCTGATAGAAGAA 4144
|||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3961 CCAAAACAGCTGATCGTAGAGAACAATCTTCCTCAGAAACTGCAGAATCTGATTGAAGAA 4020
Query 4145 CGACGTGATGGACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAGCAAATGGCAACATCTCTC 4204
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4021 CGACGTGGTGGACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAGCAAATGGCAACATCTCTC 4080
Query 4205 CTCAAAGCACTTCACATCAACACCATCTTGTGA 4237
|||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4081 CTCAAAGCACTTCACATCAACACCGTCTTGTGA 4113
> Ahg478740 jgi|Araly1|478740|fgenesh2_kg.3__1441__AT3G13530.1
Length=4296
Score = 5090 bits (2756), Expect = 0.0
Identities = 3713/4164 (89%), Gaps = 110/4164 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 134 ATGGCGCGACAGATGACGTCATCCCAGTTCCACAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAC 193
|||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCGGCAAATGACGTCATCTCAGTTTCATAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAT 60
Query 194 ATGCTAGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGGTCGAGTTTATATAGGATTAGACTTG 253
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 61 ATGCTGGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGGTCGAGTTTATAAAGGATTAGACTTG 120
Query 254 GAGAATGGAGACTTTGTTGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAACATTGGTCAAGAGGAT 313
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 121 GAGAATGGAGACTTTGTGGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAACATTGTTCAAGAGGAT 180
Query 314 CTTAACACCATAATGCAAGAAATCGATCTCCTAAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTC 373
||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTTAACACCATAATGCAAGAAATTGATCTTTTGAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTG 240
Query 374 AAGTATCTCGGATCGTTGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTCTGGAGTACGTTGAG 433
|||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 241 AAGTATCTTGGGTCGTCGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTTTGGAGTACGTTGAG 300
Query 434 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCTAATAAATTTGGACCTTTCCCAGAGTCGTTG 493
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||
Sbjct 301 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCAAATAAATTCGGACCTTTCCCAGAATCATTG 360
Query 494 GTGACTGTTTACATTGCACAGGTCTTGGAAGGTTTAGTATATCTTCATGAGCAGGGTGTC 553
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 361 GTGGCTGTTTACATTGCTCAGGTCTTGGAAGGTTTGGTATATCTGCATGAGCAGGGTGTC 420
Query 554 ATACATCGTGATATCAAGGGTGCAAATATTTTGACAACCAAGGAGGGCCTTGTTAAGCTT 613
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||
Sbjct 421 ATACACCGTGATATCAAGGGTGCAAATATTTTGACGACAAAGGAGGGTCTTGTGAAGCTT 480
Query 614 GCTGATTTTGGAGTTGCCACAAAACTCAACGAGGCTGATTTTAACACTCACTCAGTGGTC 673
||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 481 GCTGACTTTGGAGTTGCCACTAAACTTAACGAGGCTGATGTTAATACTCACTCAGTGGTT 540
Query 674 GGAACTCCTTACTGGATGGCTCCTGAGGTTATTGAATTGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTCT 733
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGAACTCCTTACTGGATGGCTCCTGAGGTTATTGAAATGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTCT 600
Query 734 GACATTTGGAGTGTTGGATGCACTATTATTGAACTTTTGACTTGTGTACCTCCTTACTAT 793
||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 601 GACATTTGGAGCGTTGGATGCACTGTTATCGAACTTCTGACATGTGTACCTCCTTACTAT 660
Query 794 GATCTGCAACCCATGCCAGCCCTCTATCGCATTGTTCAGGATGATACCCCTCCTATTCCT 853
|||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 661 GATCTGCAACCCATGCCAGCTCTCTTTCGTATTGTTCAGGATGATAACCCTCCTATTCCC 720
Query 854 GATAGTCTTTCTCCTGATATTACAGACTTCCTAAGACTGTGCTTCAAGAAGGATTCCAGG 913
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GATAGTCTTTCTCCGGATATTACTGACTTTCTACGACAGTGCTTCAAGAAGGATTCCAGG 780
Query 914 CAGAGGCCTGATGCGAAGACACTTCTCTCTCACCCTTGGATACGTAACTCGAGACGAGCA 973
|||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 781 CAGAGGCCTGATGCAAAGACGCTACTCTCTCACCCTTGGATACGGAACTCTAGACGAGCA 840
Query 974 TTGCGGTCATCGCTTCGGCATAGTGGAACCATCAGATATATGAAGGAAACCGA-TTCAAG 1032
|||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||||
Sbjct 841 TTGCAGTCATCACTTCGGCATAGTGGCACCATCAAATATATGAAGGAAGCC-ACTGCAAG 899
Query 1033 TTCAGAGAAGGATGCTGAAGGTAGTCAAGAAGTAGTTGAAAGCGTTTCAGCAGAAAAAGT 1092
|||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 900 TTCAGAGAAGGATGATGAAGGTAGTCAAGATGCAGCTGAAAGCCTTTCAGCAGAAAATGT 959
Query 1093 AGAGG--TGACAAAAACTAACTCGAAAAGCAAATTACCTGTTATAGGTGGGG-CGAGTTT 1149
| || || |||||| | |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||
Sbjct 960 -G-GGAATGTCAAAAAGTGACTCGAAAAGCAAATTACCTCTGCTAGG-GGGGTCGAGTTT 1016
Query 1150 TAGGTCTGAGAAAGATCAATCTTCACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAAC-G--GATTC 1206
||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1017 TAGGTCTGATAAAGATCAGTCTACACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAACAGATAATTC 1076
Query 1207 AGAAGATGATATCAAT-TCAGATCAAGGTCCTACATTGTCTATGCACGATAAGTCTTCTC 1265
|||||||||||| || ||||||||| || | | | | || | ||| ||
Sbjct 1077 AGAAGATGATAT-TATGTCAGATCAA-GT--T-C-----C--T--AC----A--CTT-TC 1115
Query 1266 GTCAATCCGGTACTTGCAGTATTTCTTCGGATGCAAAGGGGACATCTCAAGATGTATTAG 1325
| |||| | || || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 1116 G---ATCC---A--TG-AG-AAATCTTCGGATGCGAAGGGGACACCTCAAGATGTATCAG 1165
Query 1326 AGAACCATGAGAAATATGATCGTGATGAAATACCTGGAAATCTTGAAACGGAAGCTTCTG 1385
|| |||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1166 AGTTTCATGGGAAATCTGAACGTGTTGAAACACCTGAAAATCTTGAAACAGAAACTTCTG 1225
Query 1386 AAGGTAGAAGGAATACTTTAGCAACAAAGCTGGTTGGAAAAGAA-TAT---T-CTA-T-- 1437
||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||| | | | |
Sbjct 1226 AAGCTAGAAAAAATACTTCAGCAAAAAAGCAGGTTGGCAAAGAATTATCCATCCCAGTGG 1285
Query 1438 -CCAGTCATCACATAGTTTTAGCCAAAAAGGTGAAG-A--TGGGCTTAGAAAGGCTGTGA 1493
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||
Sbjct 1286 ACCAGACATCACATAGTTTTGGCCAAAAAGGTGAAGAACGTGGGATTCGAAAGGCTGTGA 1345
Query 1494 AGACTCCATCTAGTTTTGGTGGGAATGAACTGACCAGATTCAGTGATCCTCCTGGGGATG 1553
|||||||||||||| || |||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||
Sbjct 1346 AGACTCCATCTAGTGTTAGTGGGAATGAACTGGCTAGGTTTAGTGATCCTCCTGGGGATG 1405
Query 1554 CTTCTTTGCATGATTTATTTCATCCACTGGATAAAGTTCCTGAGGGAAAAACAAATGAAG 1613
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1406 CTTCTTTGCATGATTTGTTTCATCCATTGGATAAAGTTTCTGAGGGAAAACCAAATGAAG 1465
Query 1614 CCTCAACATCGACGCCTAC-TGCAAATGTAAATCAGGGTGATTCTCCTGTTGCAGATGGT 1672
|||||||||||| |||||| | ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1466 CCTCAACATCGATGCCTACAT-CAAATGTCAACCAAGGTGATTCTCCTGTCGCAGATGGT 1524
Query 1673 GGAAAGAATGATCTGGCAACGAAATTGAGGGCTAGAATTGCTCAGAAGCAAATGGAGGGT 1732
||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525 GGAAAGAATGATCTGGCTACAAAATTGAGGGCTACAATTGCTCAGAAGCAAATGGAGGGG 1584
Query 1733 GAAACGGGGCACTCACAA-GATGGTGGTGATCTTTTCCGCTTAATGATGGGTGTTTTGAA 1791
||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1585 GAAACAGGGCACTCA-AATGATGGTGGTGATCTTTTTCGCTTGATGATGGGTGTTTTGAA 1643
Query 1792 AGATGATGTCCTTAACATCGATGACTTGGTATTTGATGAAAAAGTTCCCCCGGAGAATCT 1851
||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||
Sbjct 1644 AGATGATGTTATTGACATTGATGGCTTGGTATTTGATGAAAAGGTGCCCGCGGAAAATCT 1703
Query 1852 TTTTCCTCTGCAGGCAGTCGAGTTCAGCAGATTGGTGAGCTCCTTAAGGCCAGATGAATC 1911
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1704 TTTCCCTCTGCAGGCAGTTGAGTTCAGCAGATTGGTCAGCTCCTTAAGGCCCGATGAGTC 1763
Query 1912 AGAAGATGCAATAGTAACTTCCTCTTTGAAACTTGTTGCCATGTTTCGTCAGAGACCTGG 1971
|||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764 AGAAGATGCAATAGTATCTTCTTGTCAGAAACTTGTTGCCATGTTTCGTCAGAGACCTGA 1823
Query 1972 GCAGAAAGCAGTATTTGTGACACAGAATGGTTTCCTCCCTCTAATGGATCTACTCGATAT 2031
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1824 GCAGAAAGCAGTATTTGTGACACAGCATGGTTTCCTGCCTCTTATGGATCTACTCGATAT 1883
Query 2032 TCCTAAATCTCGAGTAATATGTGCCGTGCTGCAGCTGATAAATGAAATTGTAAAAGATAA 2091
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||
Sbjct 1884 TCCTAAATCTCGAGTAATATGTACCGTGCTGCAGCTGATAAACGAAATTATTAAAGATAA 1943
Query 2092 TACCGACTTCCTGGAAAATGCTTGTCTTGTTGGTCTTATTCCT-TTGGTAATGAGTTTTG 2150
||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||
Sbjct 1944 TACTGACTTCCAGGAAAATGCTTGTCTTGTTGGCCTCATTCCTGTT-GTAATGAGTTTTG 2002
Query 2151 CTGGTTTTGAGAGGGATCGATCACGAGAAATTCGTAAGGAAGCAGCCTACTTCTTGCAGC 2210
||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2003 CTGGTCCTGAGAGGGATCGTTCTCGCGAAATTCGTAAAGAAGCAGCTTACTTCTTGCAGC 2062
Query 2211 AGCTTTGTCAGTCAAGCCCCTTGACGTTGCAAATGTTCATATCTTGCCGTGGAATACCCG 2270
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 2063 AGCTTTGTCAGTCAAGAATTTTAACGTTGCAAATGTTCATAGCTTGCCGTGGAATACCTG 2122
Query 2271 TTTTGGTGGGATTTCTTGAAGCAGACTATGCCAAACACAGGGAGATGGTTCACTTGGCTA 2330
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2123 TTTTGGTGGGATTTCTTGAAGCAGATTATGCCAAATACAGGGAGATGGTTCACTTGGCTA 2182
Query 2331 TTGATGGGATGTGGCAGGTATTTAAACTCAAAAAATCCACCTCGAGAAATGATTTTTGCC 2390
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||
Sbjct 2183 TTGATGGGATGTGGCAGGTATTTAAACTCAAAAGATCCACCCCAAGAAATGATTTCTGCC 2242
Query 2391 GTATTGCTGCAAAGAATGGAATTCTTCTTAGGCTAGTCAACACTCTTTATAGCTTGAGTG 2450
|||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2243 GTATAGCAGCAAAGAATGGAATTCTTCTGAGGCTAATCAACACTCTTTATAGCTTGAATG 2302
Query 2451 AGGCAACTCGACTGGCTTCTATATC-GGGGGATGCATTGATTTTGGATGGTCAAACTCCA 2509
||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||
Sbjct 2303 AGGCAACCCGGCTGGCTTCTATATCAGGGGGC-GC---GATTGTGGATGGTCAAGCTCCA 2358
Query 2510 CGAGCACGCTCTGGTCAACTTGACCCTAACAATCCTATCTTTAGTCAGCGTGAGACTTCA 2569
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||
Sbjct 2359 CGAGCGCGCTCTGGTCAACTTGACCCTAACAATCCTATTTTTGGTCAAAATGAGACTTCA 2418
Query 2570 C-CTAGTGTGATTGATCATCCTGATGGGTTGAAAACTAGGAATGGGGGTGGTGAAGAGCC 2628
| | ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 2419 CTC-AGTATGATTGATCAGCCTGATGTATTGAAAACCAGGCATGGGGTTGGTGAAGAGCC 2477
Query 2629 TTCTCATGCTTTAACTTCAAATTCTCAAAGTTCAGATGTCCATCAACCCGATGCCTTGCA 2688
||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2478 TTCTCATGCTTCAACCTCAAATTCTCAAAGATCAGATGTCCATCAACCAGATGCTTTGCA 2537
Query 2689 CCCAGATGGTGATAGGCCTAGATTAAGCAGTGTTGTAGCAGATGCCACA--G------A- 2739
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || | |
Sbjct 2538 CCCAGATGGTGATAGGCCTAGAGTAAGCAGTGTTGCACCAGATGCCTCAACGTCCGGCAC 2597
Query 2740 -G--GATGTTATACAACAACATAGGATATCTCTTTCTGCCAATAGAACATCAACAGATAA 2796
| ||| ||| |||||| ||| | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2598 AGAAGATATTAGACAACAGCATCGAATATCTCTCTCCGCCAATAGGACATCGACAGATAA 2657
Query 2797 GCTTCAGAAACTGGCGGAGGGTGCGTCTAATGGTTTTCCTGTTACTCAGCCAGATCAAGT 2856
||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 2658 GCTTCAGAAGCTGGCAGAGGGCGCCTCTAATGGTTTTCCTGTTACTCAGACAGAACAAGT 2717
Query 2857 TCGACCTTTGCTTAGCTTATTGGAGAAAGAACCTCCTTCAAGAAAA-ATTTCTGGTCAAC 2915
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||
Sbjct 2718 TCGACCTTTGCTTAGCTTGTTGGAGAAAGAACCCCCTTCAAGACATTATT-CTGGTCAAC 2776
Query 2916 TGGATTACGTAAAGCATATCGCTGGCATAGAGAGGCATGAAAGTAGACTTCCTCTTTTGT 2975
||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2777 TGGATTATGTTAAGCATATTACTGGCATAGAGAGACATGAAAGTAGACTTCCTCTTTTGC 2836
Query 2976 ATGCATCAGACGAAAAGAAAACCAATGGAGACCTAGAATTTATAATGGCTGAATTTGCAG 3035
||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||
Sbjct 2837 ATGGATCAAATGAAAAGAAAAACAACGGAGACCTAGATTTTCTGATGGCTGAATTTGCAG 2896
Query 3036 AAGTCTCTGGACGTGGAAAGGAAAACGGAAATCTTGATACTGCGCCAAGATATTCCAGCA 3095
| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||| |||| |
Sbjct 2897 AGGTCTCTGGACGTGGAAAGGAAAATGGAAATGTTGATACTACGACTAGATATCCCAGTA 2956
Query 3096 AGACGATGACTAAGAAGGTTATGGCTATTGAGAG-AGTCGCATCTACGTGTGGGATTGCA 3154
| || ||||| ||||||||| |||||||||| || ||| || ||||||| |||||||||
Sbjct 2957 AAACAATGACAAAGAAGGTTCTGGCTATTGA-AGGAGTTGCTTCTACGTCCGGGATTGCA 3015
Query 3155 TCTCAGACAGCATCTGGTGTTCTGTCAGGTTCGGGTGTTTTAAATGCTAGACCTGGAAGT 3214
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3016 TCTCAGACAGCATCTGGAGTACTATCAGGTTCGGGTGTTCTAAATGCTAGACCTGGAAGT 3075
Query 3215 ACCACATCATCTGGTTTACTTGCCCAT--G--CGCT-----GAGTGCAGATGTCT-CAAT 3264
|||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| | |||
Sbjct 3076 GCCACATCATCTGGTTTACTTGCCCATATGGTCTCTACCCTGAGTGCAGATGT-TGCAAG 3134
Query 3265 GGATTACTTGGAGAAAGTGGCTGATCTGCTTCTTGAATTTGCCCGAGCTGAAACGACAGT 3324
||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 3135 GGAATACTTGGAGAAAGTTGCTGACCTGCTTCTTGAATTTGCTCGAGCTGATACGACAGT 3194
Query 3325 AAAATCATACATGTGCAGCCAAAGTTTACTCAGTCGTCTTTTCCAGATGTTCAACCGTGT 3384
||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3195 AAAGTCATATATGTGCAGCCAAAGCTTACTCAGTCGTCTTTTCCAGATGTTCAACCGTGT 3254
Query 3385 GGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAATGCACCAATCATTTATCCACGGATCCAAA 3444
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3255 AGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAGTGCACAAATCATTTATCCACTGATCCAAA 3314
Query 3445 TTGCTTGGAAAATCTTCAGCGTGCAGATGCAATCAAGCAATTGATCCCCAACCTTGAGCT 3504
||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3315 TTGCTTGGAGAATCTGCAGCGTGCAGATGCAATTAAGCATTTGATACCCAACCTTGAGCT 3374
Query 3505 TAAGGAAGGGC-CTCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTACTTAGTGCACTATTCAACC 3563
|||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3375 TAAGGATGGGCAC-CTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTGCTTAGTGCACTATTCAACC 3433
Query 3564 TCTGCAAGATAAACAAGAGGAGGCAGGAACAAGCTGCTGAAAATGGAATCATTCCGCACC 3623
| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 3434 TGTGCAAGATAAACAAAAGGAGGCAGGAACAAGCGGCTGAAAACGGAATCATTCCGCATC 3493
Query 3624 TGATGCTTTTCGTCATGTCGGATTCTCCTCTGAAACAATATGCATTGCCACTACTT-TGT 3682
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||
Sbjct 3494 TGATGCTTTTCATCATGTCAGATTCTCCTCTGAAACAGTATGCATTGCCACTA-TTATGT 3552
Query 3683 GATATGGCTCATGCATCTCGGAATTCAAGAGAGCAGTTAAGGGCCCACGGCGGTCTGGAT 3742
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3553 GATATGGCTCATGCATCTCGGAATTCAAGAGAGCAGTTAAGGGCCCACGGGGGTCTGGAT 3612
Query 3743 GTTTACCTGAGTTTACTCGATGATGAATATTGGTCCGTGATAGCCTTGGATTCAATTGCT 3802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 3613 GTTTACCTGAGTTTACTCGATGATGAATATTGGTCCGTGATAGCCTTAGATTCTATCGCT 3672
Query 3803 GTTTGCTTGGCGCAAGACGTTGACCAA----AAGGTGGAGCAGGCGTTTCTCAAGAAAGA 3858
|||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || |||||| ||||
Sbjct 3673 GTTTGCTTGGCGCAAGACAATGAC-AACCGCAAGGTGGAGCAGGCCTTGCTCAAGCAAGA 3731
Query 3859 TGCAATTCAGAAATTAGTTAACTTTTTCCAGAACTGTCCAGAGAGACATTTTGTGCACAT 3918
||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 3732 TGCAATTCAGAAATTAGTTGACTTCTTCCAGAGCTGCCCAGAGAGACACTTTGTGCATAT 3791
Query 3919 TTTGGAGCCATTCTTGAAGATCATCACGAAATCATCTTCA-ATCAATAAGACATTAGC-G 3976
||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |
Sbjct 3792 ATTGGAGCCATTCTTGAAAATTATCACGAAATCATAT-CGGATCAATAAGACATTAGCTG 3850
Query 3977 TTAAATGGACTGACTCCGTTACTCATTGCAAGACTAGACCACCAAGATGCTATTGCTCGA 4036
| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||
Sbjct 3851 T-AAATGGATTGACTCCTTTACTTATTTCAAGGCTAGACCATCAAGATGCGATTGCTAGA 3909
Query 4037 CTTAACCTCCTGAAACTCATCAAGGCCGTTTACGAGA-AGCATCCGAAGCCAAAACAGCT 4095
|| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| ||||||||
Sbjct 3910 CTCAACCTCCTAAAACTCATCAAGGCTGTTTACGA-ACATCATCCGCGGCCGAAACAGCT 3968
Query 4096 GATCGTAGAGAACGATCTTCCACAAAAACTGCAGAATCTGATAGAAGAACGACGTGATGG 4155
||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3969 GATCGTAGAGAACGACCTCCCTCAGAAACTGCAGAATCTGATAGAAGAACGACGAGATGG 4028
Query 4156 ACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAGCAAATGGCAACATCTCTCCTCAAAGCACT 4215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4029 ACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAGCAAATGGCAACATCTCTCCTCAAAGCACT 4088
Query 4216 TCACATCAACACCATCTTGTGAGT 4239
|||||| ||||| || ||||||||
Sbjct 4089 TCACATTAACACAATATTGTGAGT 4112
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 170764330051
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5