BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G08530.1
Length=5638
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg928500 jgi|Araly1|928500|scaffold_300957.1 8959 0.0
Ahg478454 jgi|Araly1|478454|fgenesh2_kg.3__1155__AT3G11130.1 7313 0.0
Ahg338955 jgi|Araly1|338955|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001054 379 1e-103
> Ahg928500 jgi|Araly1|928500|scaffold_300957.1
Length=5152
Score = 8959 bits (4851), Expect = 0.0
Identities = 5036/5128 (98%), Gaps = 2/5128 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 147 GATCTGAGGTCAAACATGGCGGCTGCCAACGCCCCCATCACGATGAAGGAGGTCCTGACG 206
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6 GATCTGAGGTCAAACATGGCTGCTGCCAACGCCCCCATCACGATGAAGGAGGTCCTGACG 65
Query 207 CTTCCGAGCATCGGGATCAATCAGCAATTCATCACGTTTACAAATGTTACTATGGAGTCT 266
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 CTTCCGAGCGTCGGGATCAATCAGCAATTCATCACGTTTACAAATGTTACTATGGAGTCT 125
Query 267 GACAAGTATATCTGTGTACGAGAGACGTCACCGCAAAACAGTGTTGTAATTATAGATATG 326
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126 GACAAGTACATCTGTGTACGAGAGACGTCACCGCAAAACAGTGTTGTAATTATAGATATG 185
Query 327 AATATGCCGATGCAGCCTCTTAGGAGGCCTATTACTGCAGACTCTGCTCTTATGAACCCA 386
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 186 AATATGCCGATGCAGCCTCTAAGGAGACCTATTACTGCAGATTCTGCTCTTATGAACCCA 245
Query 387 AACTCGAAGATCCTTGCCTTGAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAGGATCATCTACAG 446
||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 246 AACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAAGATCATCTACAG 305
Query 447 ATATTTAACATTGAAGCCAAAGCAAAGTTGAAATCACATCAGATGCCTGAGCAGGTTGTC 506
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 306 ATATTTAACATTGAAGCAAAAGCAAAGTTGAAATCTCATCAGATGCCTGAGCAGGTTGTC 365
Query 507 TTTTGGAAGTGGATTACACCAAAGATGTTGGGGCTGGTCACACAGAATTCCGTCTATCAT 566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 TTTTGGAAGTGGATTACACCAAAGATGTTGGGGCTGGTCACACAGAATTCCGTCTATCAT 425
Query 567 TGGTCAATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACAGCCAATTTGGCC 626
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 426 TGGTCAATTGAAGGCGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACAGCCAATTTGACC 485
Query 627 AACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTGGTTTTAATTGGA 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486 AACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTGGTTTTAATTGGA 545
Query 687 ATTGCTCCTGGCTCTCCTGAGAGACAACAATTGGTAAAAGGAAATATGCAGCTTTTCTCT 746
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 ATTGCTCCTGGCTCCCCTGAGAGACAACAATTGGTTAAAGGAAATATGCAGCTTTTCTCT 605
Query 747 GTGGATCAACAGCGGAGTCAGGCCCTTGAGGCACATGCTGCATCGTTTGCGCAGTTTAAG 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 GTGGATCAACAGCGGAGTCAGGCCCTTGAGGCACATGCTGCATCGTTTGCGCAGTTTAAG 665
Query 807 GTTCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCATTTGCAAGCAAGAGCTTTAATGCT 866
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 GTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCATTTGCAAGCAAGAGCTTTAATGCT 725
Query 867 GGGCAGATAACATCAAAGTTGCATGTCATTGAGCTTGGTGCCCAACCTGGAAAACCATCA 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 GGGCAGATAACATCAAAGTTGCATGTCATTGAGCTTGGTGCCCAACCTGGAAAACCATCA 785
Query 927 TTTACaaaaaaaCAAGCAGATCTCTTTTTTCCC-CCTGATTTTGCTGATGATTTTCCTGT 985
||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 TTTACAAAAAAGCAAGCAGATCTC-TTTTTCCCACCTGATTTTGCTGATGATTTTCCTGT 844
Query 986 TGCCATGCAGGTCTCTCACAAATTTAACTTGATATATGTTATCACCAAACTTGGCCTGTT 1045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 845 TGCCATGCAGGTCTCTCACAAATTTAACTTGATATATGTTATCACCAAACTTGGCCTGTT 904
Query 1046 GTTTGTGTACGATCTAGAGACTGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGATTAGTCCAGACCC 1105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 905 GTTTGTGTACGATCTAGAGACTGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGATTAGTCCAGACCC 964
Query 1106 AATTTTCTTGACTTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCATTAATAGGCGAGG 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 AATTTTCTTGACTTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCATTAATAGGCGAGG 1024
Query 1166 ACAAGTTCTTTTGGCTACAGTAAACGAGGCTACCATTATACCTTTTATTAGTGGCCAATT 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 ACAAGTTCTTTTGGCTACAGTAAACGAGGCTACCATTATACCTTTTATTAGTGGCCAATT 1084
Query 1226 GAACAATTTGGAGCTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCCAGGTGCAGAAAA 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 GAACAATTTGGAGCTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCCAGGTGCAGAAAA 1144
Query 1286 TCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAGGAGTTGTTCGCTCAAACAAAGTACAAGGAGGCTGCTGA 1345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145 TCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAGGAGTTGTTCGCTCAAACAAAGTACAAGGAGGCTGCTGA 1204
Query 1346 GCTTGCTGCTGAATCTCCTCAAGGAATTCTAAGGACACCTGATACAGTGGCCAAATTCCA 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 GCTTGCTGCTGAATCTCCTCAAGGAATTCTAAGGACACCTGATACAGTGGCCAAATTCCA 1264
Query 1406 GAGTGTTCCTGTACAAGCTGGACAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTTTGGGACTCTTTT 1465
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265 GAGTGTTCCTGTACAAGCTGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTTTGGGACTCTTTT 1324
Query 1466 GACTAGAGGGAAACTCAATTCATATGAGTCACTGGAACTATCTCGGCTGGTTGTGAACCA 1525
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 GACTAGAGGGAAGCTCAATTCATATGAGTCACTGGAACTATCTCGGCTGGTTGTGAACCA 1384
Query 1526 AAACAAGAAGAACCTCCTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAACTAGAATGCAGTGAAGA 1585
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1385 AAACAAGAAGAACCTCCTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAGCTAGAATGCAGTGAAGA 1444
Query 1586 ACTTGGAGACCTTGTGAAGACTGTGGATAATGATCTCGCTCTGAAAATATACATCAAAGC 1645
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1445 ACTTGGAGACCTTGTCAAGACTGTGGATAATGATCTTGCTCTGAAAATATACATCAAAGC 1504
Query 1646 TCGGGCGACTCCAAAAGTTGTAGCAGCTTTTGCAGAAAGAAGGGAGTTTGACAAAATACT 1705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1505 ACGGGCGACTCCAAAAGTTGTAGCAGCTTTTGCAGAAAGAAGGGAGTTTGACAAAATATT 1564
Query 1706 GATTTACTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACCTGTTTCTTCTGCAAACCATACT 1765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565 GATTTACTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACCTGTTTCTTCTGCAAACCATACT 1624
Query 1766 CCGTACAGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCATTAATGATGTCTCAAATGGAAGGAGG 1825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 CCGTACAGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCATTAATGATGTCTCAAATGGAAGGAGG 1684
Query 1826 TTCTCCAGTTGACTACAACACCATCACTGATCTTTTTCTTCAGAGAAATCTGATCCGTGA 1885
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1685 TTCTCCAGTTGACTACAACACCATCACTGATCTTTTTCTTCAGAGAAATCTGATTCGTGA 1744
Query 1886 AGCGACTTCTTTCCTTCTGGATGTGCTAAAGCCAAATTTACCTGAGCATGCTTTTCTGCA 1945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745 AGCGACTTCTTTCCTTCTGGATGTGCTAAAGCCAAATTTACCTGAGCATGCTTTTCTGCA 1804
Query 1946 AACTAAGGTTCTGGAGATAAATTTGGTAACTTTTCCTAATGTGGCTGATGCGGTATTAGC 2005
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1805 AACTAAGGTTCTGGAGATCAATTTGGTAACTTTTCCTAATGTGGCTGATGCGGTATTAGC 1864
Query 2006 AAATGGGATGTTCACCCACTATGACCGGCCTCGCATTGCTCAACTTTGTGAAAAGGCTGG 2065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1865 AAATGGGATGTTCACCCACTATGACCGGCCTCGCATTGCTCAACTTTGTGAAAAGGCTGG 1924
Query 2066 ACTTTATATCCAATCCTTGAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATATAAAACGTGTAATTGT 2125
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1925 ACTTTATATCCAATCCTTGAAGCATTACTCAGAGTTGCCTGATATAAAACGTGTGATTGT 1984
Query 2126 AAACACACATGCTATCGAGCCACAGGCTCTTGTTGAGTTTTTTGGCACTCTTTCTAGCGA 2185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1985 AAACACACATGCTATCGAGCCACAGGCTCTTGTTGAGTTTTTTGGCACTCTTTCTAGCGA 2044
Query 2186 GTGGGCTATGGAGTGCATGAAGGATCTGTTGCTGGTCAACCTGAGAGGCAATCTGCAGAT 2245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2045 GTGGGCTATGGAGTGCATGAAGGATCTGTTGCTGGTCAACCTGAGAGGCAATCTGCAGAT 2104
Query 2246 AATTGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTGATGCATGTATTAAGCT 2305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2105 AATTGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTGATGCATGTATTAAGCT 2164
Query 2306 CTTTGAGCAGTTCAAGTCATATGAAGGGCTATACTTTTTCCTAGGTTCATATTTGAGTAT 2365
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2165 CTTTGAGCAGTTCAAGTCATACGAAGGGCTATACTTTTTCCTAGGTTCATATTTGAGTAT 2224
Query 2366 GAGTGAGGATCCTGAGATCCATTTCAAGTACATTGAAGCAGCTGCCAAGACTGGTCAAAT 2425
|||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2225 GAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAATACATTGAAGCAGCTGCCAAGACTGGTCAAAT 2284
Query 2426 AAAGGAGGTTGAGCGTGTAACTAGAGAGTCTAACTTCTATGATGCTGAAAAGACGAAGAA 2485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 AAAGGAGGTTGAGCGTGTAACTAGAGAGTCTAACTTCTATGATGCTGAAAAGACGAAGAA 2344
Query 2486 CTTTTTGATGGAAGCTAAGCTGCCTGATGCACGACCTTTGATAAATGTCTGTGATCGTTT 2545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2345 CTTTTTGATGGAAGCTAAGCTGCCTGATGCACGACCTTTGATAAATGTCTGCGATCGTTT 2404
Query 2546 CAGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCTTCGTTACATTGA 2605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2405 TGGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCTTCGTTACATTGA 2464
Query 2606 AGGCTACGTGCAGAAGGTGAACCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTCGGGCAGTTGCTTGA 2665
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2465 AGGTTACGTACAGAAGGTGAACCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTCGGGCAGTTGCTTGA 2524
Query 2666 TGATGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTCTCTGTTCGTTCATTGCTTCC 2725
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2525 TGATGAATGCCCCGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTGTCTGTTCGTTCATTGCTTCC 2584
Query 2726 TGTTGAACCACTTGTCGAGGAATGTGAGAAGAGAAATCGACTCCGTCTCCTCACTCAGTT 2785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2585 TGTTGAACCACTTGTCGAGGAATGTGAGAAGAGAAATCGACTCCGTCTCCTCACTCAGTT 2644
Query 2786 CTTGGAGCATTTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCCATAATGCCTTGGGTAA 2845
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2645 CTTGGAGCATTTAGTTAGTGAGGGAAGCCAGGATGTGCATGTCCATAATGCCTTGGGTAA 2704
Query 2846 AATTATCATAGACAGTAACAACAACCCTGAGCATTTCCTGACCACCAACCCTTACTACGA 2905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2705 AATTATCATAGACAGTAACAACAACCCTGAGCATTTCCTGACCACCAACCCTTACTACGA 2764
Query 2906 CTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCTACCCTAGCAGTTGTGGCATA 2965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2765 CTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCTACCCTGGCGGTTGTGGCATA 2824
Query 2966 CAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACTAACAAAAACTCTTTGTTTAA 3025
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2825 CAGAAGAGGACAATGTGATGAGGAACTCATCAATGTCACTAACAAAAACTCTTTGTTCAA 2884
Query 3026 GTTACAAGCCAGGTATGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGATCTGTGGGATAAGGTTCTCGA 3085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2885 GTTACAAGCCAGGTATGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGATCTGTGGGATAAGGTTCTCGA 2944
Query 3086 TGAAAACAATGATTATAGAAGACAGCTTATTGACCAAGTTGTGTCTACTGCTTTACCTGA 3145
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2945 TGAAAACAATGATTATAGAAGACAGCTTATTGACCAAGTTGTTTCTACTGCTTTACCTGA 3004
Query 3146 AAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGACTGCTGATTTGCC 3205
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3005 AAGCAAGAGCCCGGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGACTGCTGATTTGCC 3064
Query 3206 GCACGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAGATTGTTCTACAAAATTCTGCCTTCAGTGGAAA 3265
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3065 GCACGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAGATTGTTCTTCAAAATTCTGCTTTCAGTGGAAA 3124
Query 3266 CTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATATTGACAGCTATTAAGGCAGATCCGTCTAGAGTTAT 3325
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3125 CTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATATTGACAGCTATTAAGGCAGATCCATCTAGAGTTAT 3184
Query 3326 GGATTACATCAACAGGCTGGACAACTTTGATGGACCTGCAGTTGGAGAAGTCGCAGTTGA 3385
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3185 GGATTACATTAACAGGCTGGACAACTTTGATGGACCTGCGGTTGGAGAAGTCGCAGTTGA 3244
Query 3386 AGCCCAATTATATGAGGAAGCATTTGCTATCTTCAAGAAGTTCAACTTAAATGTTCAGGC 3445
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3245 AGCCCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCTATCTTCAAGAAGTTCAACTTAAATGTTCAGGC 3304
Query 3446 TGTCAATGTATTGCTGGATAATGTCAGGAGCATTGAGCGTGCAGTTGAGTTTGCATTCCG 3505
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3305 TGTCAATGTATTGCTGGATAACGTCAGAAGCATTGAGCGTGCAGTTGAGTTTGCATTCCG 3364
Query 3506 GGTCGAAGAAGATTCTGTTTGGAGCCAAGTCGCTAAGGCGCAACTCAGGGAAGGACTAGT 3565
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 3365 GGTCGAAGAAGATTCTGTTTGGAGCCAAGTTGCTAAGGCGCAACTCAGAGAAGGATTAGT 3424
Query 3566 CAGTGATGCAATTGAGTCCTTTATCCGTGCTGATGATGCCACTCATTTCTTGGAGGTCAT 3625
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3425 CAGTGATGCAATTGAGTCCTTTATCCGTGCTGATGATGCCACTCATTTCTTGGAAGTCAT 3484
Query 3626 ACGTGTCTCTGAAGATACTGATGTCTATGATGACTTGGTCAAATACCTTCTGATGGTTAG 3685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3485 ACGTGTCTCTGAAGATACTGATGTCTATGATGACTTGGTCAAATACCTTCTGATGGTTAG 3544
Query 3686 ACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTTGATAGTGAGCTCATCTATGCATATGCAAAGATTGA 3745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3545 ACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTTGATAGTGAGCTCATCTATGCATATGCAAAGATTGA 3604
Query 3746 TCGGTTAGGTGAGATTGAAGAATTCATTCTGATGCCAAACGTTGCTAATCTACAACATGT 3805
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3605 TAGGTTAGGTGAGATTGAAGAATTCATTCTGATGCCAAACGTTGCTAATCTACAAAATGT 3664
Query 3806 TGGTGATCGTCTGTATGACGAAGCTCTCTATGAGGCTGCAAAAATAATCTATGCGTTCAT 3865
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3665 TGGTGATCGTCTGTATGACGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAAAAATAATCTATGCGTTCAT 3724
Query 3866 ATCAAACTGGGGCAAGTTAGCCGTCACACTTGTGAAGTTGCAACAGTTCCAAGGTGCTGT 3925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3725 ATCAAACTGGGGCAAGTTAGCCGTCACACTTGTGAAGTTGCAACAGTTCCAAGGTGCTGT 3784
Query 3926 TGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCTGCTTTGCTTGCGT 3985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3785 TGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCTGCTTTGCTTGCGT 3844
Query 3986 TGATGCTGAGGAATTCCGGTTGGCTCAAATATGTGGTCTTAACATTATCATTCAGGTGGA 4045
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3845 TGATGCAGAGGAATTCCGGTTGGCTCAAATATGTGGTCTTAACATTATCATTCAGGTGGA 3904
Query 4046 TGACCTGGAAGAAGTCAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGGTGCTTCAATGAATTAATCTC 4105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3905 TGACCTGGAAGAAGTCAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGGTGCTTCAATGAATTAATCTC 3964
Query 4106 ACTTATGGAGAGTGGACTTGGGCTTGAACGTGCTCACATGGGTATCTTCACCGAGTTGGG 4165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3965 ACTTATGGAGAGTGGACTTGGGCTTGAACGTGCTCACATGGGTATCTTCACCGAGTTGGG 4024
Query 4166 TGTACTCTATGCTAGATATCGTTATGAGAAACTTATGGAACACATCAAGTTATTTTCAAC 4225
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4025 TGTACTGTATGCTAGATATCGTTATGAGAAACTTATGGAACACATCAAGTTATTTTCAAC 4084
Query 4226 TCGCCTCAATATTCCCAAGCTTATACGGGCCTGTGATGAACAACAGCACTGGCAGGAACT 4285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4085 TCGCCTCAATATTCCCAAGCTTATACGGGCCTGTGATGAACAACAGCACTGGCAGGAACT 4144
Query 4286 TACCTATCTGTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCGACCACCGTCATGAACCA 4345
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4145 TACTTATCTGTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCGACCACCGTCATGAACCA 4204
Query 4346 TTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCAAGGTAGCGAATGT 4405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4205 TTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCAAGGTAGCGAATGT 4264
Query 4406 TGAACTGTACTACAAGGCTGTGCACTTCTACTTGCAAGAGCATCCGGATATAATCAACGA 4465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||
Sbjct 4265 TGAACTGTACTACAAGGCTGTGCACTTCTACTTGCAAGAGCATCCTGATCTAATCAATGA 4324
Query 4466 TCTTCTCAACGTACTTGCGTTGCGGTTAGACCATACTCGTGTTGTTGATATAATGCGGAA 4525
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4325 TCTTCTCAACGTGCTTGCGTTGCGGTTAGACCATACTCGTGTTGTTGATATAATGCGAAA 4384
Query 4526 GGCTGGTCACTTGCGTCTTATCAAGCCATACATGATTGCAGTTCAGAGCAACAATGTCTC 4585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4385 GGCTGGTCACTTGCGTCTTATCAAGCCATACATGATTGCAGTTCAGAGCAACAATGTCTC 4444
Query 4586 TGCTGTTAATGAGGCTCTGAATGAGATATACGTGGAAGAAGAAGACTACGATAGGTTGCG 4645
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4445 TGCTGTTAATGAGGCTCTGAATGAGATATACGTGGAAGAAGAAGACTATGATAGGTTGCG 4504
Query 4646 AGAGTCTATTGATTTACATGACAGCTTTGACCAGATTGGCCTCGCTCAGAAGATCGAGAA 4705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4505 AGAGTCTATTGATTTACATGACAGCTTTGACCAGATTGGCCTCGCTCAGAAGATCGAGAA 4564
Query 4706 ACACGAACTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATCTACAAGAAAGCGGGCAGATG 4765
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4565 ACACGAGCTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATCTACAAGAAAGCGGGCAGATG 4624
Query 4766 GAAGCAATCAATTGCATTATCAAAGAAAGACAACATGTACAAGGACTGTATGGAAACGGC 4825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4625 GAAGCAATCAATTGCATTATCAAAGAAAGACAACATGTACAAGGACTGTATGGAAACTGC 4684
Query 4826 TTCACAATCAGGCGAACATGAACTTGCAGAACAACTACTGGTGTATTTCATTGAACAGGG 4885
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4685 TTCACAATCCGGTGAACATGAACTTGCAGAACAACTACTGGTGTACTTCATTGAACAGGG 4744
Query 4886 CAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTATGTTATGACTTAATCCGACCAGACGT 4945
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4745 CAAAAAGGAATGCTTTGCTACGTGTCTATTTGTATGTTATGACTTAATCCGACCAGACGT 4804
Query 4946 GGCTCTAGAACTTGCCTGGATCAACAATATGATGGACTTTGCCTTCCCGTATCTCCTCCA 5005
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4805 GGCTCTTGAACTTGCGTGGATCAACAATATGATGGACTTTGCCTTCCCGTATCTCCTCCA 4864
Query 5006 GTTTATCCGAGAGTACTCTGGCAAAGTGGATGAGCTAATAAAGGACAAGCTTGAGGCACA 5065
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4865 GTTTATCCGAGAATACTCTGGCAAAGTGGATGAGTTAATAAAGGACAAGCTGGAGGCACA 4924
Query 5066 AAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTCATATCCCAACAGAACATGTA 5125
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 4925 AAAAGAGGTGAAGGCTAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTTATGTCCCAACAGAACATGTA 4984
Query 5126 TGCCCAAATGTTGCCACTTGCTTTACCTGCACCACCGATGCCAGGAATGGGAGGTGGTGG 5185
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4985 CGCCCAACTATTGCCACTTGCTTTACCTGCACCACCGATGCCAGGAATGGGAGGTGGTGG 5044
Query 5186 TGGGTATGGTCCTCCACCACAAATGGGCGGTATGCCAGGAATGCCTCCCATGCCACCATA 5245
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5045 TGGGTATGGTCCGCCACCACAAATGGGCGGTATGCCAGGAATGCCTCCCATGCCACCATA 5104
Query 5246 TGGAATGCCACCGATGGGCGGCTACTAA 5273
|||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5105 TGGAATGCCACCGATGGGTGGCTACTAA 5132
> Ahg478454 jgi|Araly1|478454|fgenesh2_kg.3__1155__AT3G11130.1
Length=5388
Score = 7313 bits (3960), Expect = 0.0
Identities = 4761/5156 (92%), Gaps = 21/5156 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 133 TTTACTCTTGCTGTGATCTGAGGTCAAACATGGCGGCTGCCAACGCCCCCATCA-CGATG 191
||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||
Sbjct 146 TTT-CTCTCGCCGCGATCTGAGGTCAAACATGGCGGCGGCTAACGCGCCCATCATC-ATG 203
Query 192 AAGGAGGTCCTGACGCTTCCGAGCATCGGGATCAATCAGCAATTCATCACGTTTACAAAT 251
||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| || |||||||| |||||||||
Sbjct 204 AAGGAGGTCCTAACGCTTCCGAGCGTTGGGATCGGTCAACAGTTCATCACCTTTACAAAT 263
Query 252 GTTACTATGGAGTCTGACAAGTATATCTGTGTACGAGAGACGTCACCGCAAAACAGTGTT 311
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 264 GTTACTATGGAGTCTGATAAGTACATATGTGTACGAGAGACGGCACCACAAAACAGTGTT 323
Query 312 GTAATTATAGATATGAATATGCCGATGCAGCCTCTTAGGAGGCCTATTACTGCAGACTCT 371
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||
Sbjct 324 GTAATTATCGATATGAATATGCCGATGCAGCCTCTAAGGAGACCTATAACTGCTGATTCT 383
Query 372 GCTCTTATGAACCCAAACTCGAAGATCCTTGCCTTGAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACT 431
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 GCTCTTATGAACCCAAACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACT 443
Query 432 CAGGATCATCTACAGATATTTAACATTGAAGCCAAAGCAAAGTTGAAATCACATCAGATG 491
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 444 CAGGATCATCTACAGATATTTAACATCGAAGCAAAAGCAAAGTTGAAGTCACATCAGATG 503
Query 492 CCTGAGCAGGTTGTC-TTTTGGAAGTGGATTACACCAAAGATGTTGGGGCTGGTCACACA 550
||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 504 CCTGAGCAGGTTG-CTTTTTGGAAGTGGATCACACCAAAGATGCTGGGGCTGGTCACGCA 562
Query 551 GAA-TTCCGTCTATCATTGGTCAATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATA 609
|| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 563 -AACTTCTGTGTATCATTGGTCGATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATA 621
Query 610 GAACAGCCAATTTGGCCAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGT 669
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 GAACGGCCAATTTGGCAAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGT 681
Query 670 GGTTGGTTTTAATTGGAATTGCTCCTGGCTCTCCTGAGAGACAACAATTGGTAAAAGGAA 729
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 682 GGTTGGTCTTGATTGGAATTGCTCCTGGCTCTCCTGAGAGACCACAATTGGTAAAAGGAA 741
Query 730 ATATGCAGCTTTTCTCTGTGGATCAACAGCGGAGTCAGGCCCTTGAGGCACATGCTGCAT 789
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |
Sbjct 742 ATATGCAGCTTTTCTCGGTGGATCAACAGCGGAGCCAGGCCCTTGAAGCGCATGCTGCGT 801
Query 790 CGTTTGCGCAGTTTAAGGTTCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCATTTGCAA 849
| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 802 CATTTGCTCAGTTTAAGGTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCCTTTGCAA 861
Query 850 GCAAGAGCTTTAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGTTGCATGTCATTGAGCTTGGTGCCC 909
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct 862 GCAAGAGCTTTAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGTTGCACGTTATTGAACTTGGTGCCC 921
Query 910 AACCTGGAAAACCATCATTTACaaaaaaaCAAGCAGATCTCTTTTTTCCCCCTGATTTTG 969
|||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 922 AACCGGGAAAACCATCATTTACAAAAAAGCAGGCAGATCTCTTTTTCCCCCCAGATTTTG 981
Query 970 CTGATGATTTTCCTGTTGCCATGCAGGTCTCTCACAAATTTAACTTGATATATGTTATCA 1029
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 982 CTGATGATTTTCCTGTGGCCATGCAGGTCTCTCACAAGTTTAACTTGATTTATGTCATCA 1041
Query 1030 CCAAACTTGGCCTGTTGTTTGTGTACGATCTAGAGACTGCTTCTGCTATCTACAGAAATC 1089
|||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 CCAAGCTTGGCCTGCTGTTTGTATATGATCTAGAGACAGCTTCTGCTATCTACAGAAATC 1101
Query 1090 GGATTAGTCCAGACCCAATTTTCTTGACTTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATG 1149
|||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 GGATAAGTCCGGACCCAATTTTCTTAACGTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATG 1161
Query 1150 CCATTAATAGGCGAGGACAAGTTCTTTTGGCTACAGTAAACGAGGCTACCATTATACCTT 1209
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 1162 CCATTAATAGGCGAGGACAAGTTCTTTTGGCAACCGTAAATGAGGCCACCATAATACCTT 1221
Query 1210 TTATTAGTGGCCAATTGAACAATTTGGAGCTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACC 1269
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222 TTATTAGTGGTCAATTGAACAATTTGGAACTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACC 1281
Query 1270 TCCCAGGTGCAGAAAATCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAGGAGTTGTTCGCTCAAACAAAGT 1329
|||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 1282 TCCCTGGTGCAGAGAATCTGGTTGTCCAGAGGTTCCAAGAGTTATTTGCTCAAACAAAGT 1341
Query 1330 ACAAGGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAAGGAATTCTAAGGACACCTGATA 1389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||
Sbjct 1342 ACAAGGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAGGGCATTCTACGGACACCTGATA 1401
Query 1390 CAGTGGCCAAATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCTGGACAAACTCCTCCATTGTTACAGT 1449
| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402 CGGTGGCCAAATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCAGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGT 1461
Query 1450 ATTTTGGGACTCTTTTGACTAGAGGGAAACTCAATTCATATGAGTCACTGGAACTATCTC 1509
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1462 ATTTTGGGACCCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATACATATGAGTCTTTGGAACTATCTC 1521
Query 1510 GGCTGGTTGTGAACCAAAACAAGAAGAACCTCCTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAAC 1569
|||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1522 GGCTTGTTGTGAATCAAAACAAGAAGAACCTCTTGGAAAACTGGTTAGCCGAGGATAAGT 1581
Query 1570 TAGAATGCAGTGAAGAACTTGGAGACCTTGTGAAGACTGTGGATAATGATCTCGCTCTGA 1629
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 1582 TAGAATGCAGTGAAGAACTCGGAGACCTTGTCAAGACTGTGGATAATGACCTTGCTCTAA 1641
Query 1630 AAATATACATCAAAGCTCGGGCGACTCCAAAAGTTGTAGCAGCTTTTGCAGAAAGAAGGG 1689
|||| |||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1642 AAATTTACATCAAAGCTAGAGCTACTCCAAAAGTCGTTGCAGCTTTTGCAGAGCGAAGGG 1701
Query 1690 AGTTTGACAAAATACTGATTTACTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACCTGTTTC 1749
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1702 AGTTTGACAAAATACTGATTTATTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACATGTTTC 1761
Query 1750 TTCTGCAAACCATACTCCGTACAGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCATTAATGATGT 1809
|||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1762 TTCTGCAAACGATACTTCGTACGGACCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCTTTAATGATGT 1821
Query 1810 CTCAAATGGAAGGAGGTTCTCCAGTTGACTACAACACCATCACTGATCTTTTTCTTCAGA 1869
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1822 CCCAAATGGAAGGAGGTTGTCCAGTTGACTACAACACTATCACTGATCTTTTCCTTCAGA 1881
Query 1870 GAAATCTGATCCGTGAAGCGACTTCTTTCCTTCTGGATGTGCTAAAGCCAAATTTACCTG 1929
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |
Sbjct 1882 GAAATCTGATCCGTGAAGCCACTGCTTTCCTTCTGGATGTTCTGAAGCCAAACTTACCCG 1941
Query 1930 AGCATGCTTTTCTGCAAACTAAGGTTCTGGAGATAAATTTGGTAACTTTTCCTAATGTGG 1989
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1942 AGCATGCTTTTCTGCAAACTAAGGTTTTGGAGATCAATTTGGTAACCTTTCCTAATGTGG 2001
Query 1990 CTGATGCGGTATTAGCAAATGGGATGTTCACCCACTATGACCGGCCTCGCATTGCTCAAC 2049
||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| |
Sbjct 2002 CTGATGCAATCTTAGCAAATGGGATGTTCAGCCATTATGACAGGCCTCGTGTTGCTCAGC 2061
Query 2050 TTTGTGAAAAGGCTGGACTTTATATCCAATCCTTGAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATA 2109
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2062 TTTGTGAAAAGGCTGGACTTTACATCCAATCCTTAAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATA 2121
Query 2110 TAAAACGTGTAATTGTAAACACACATGCTATCGAGCCACAGGCTCTTGTTGAGTTTTTTG 2169
| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2122 TCAAACGTGTAATTGTTAACACACATGCTATTGAGCCACAGGCTCTTGTCGAGTTTTTCG 2181
Query 2170 GCACTCTTTCTAGCGAGTGGGCTATGGAGTGCATGAAGGATCTGTTGCTGGTCAACCTGA 2229
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 2182 GTACTCTTTCTAGCGAGTGGGCTATGGAGTGCATGAAAGATCTCCTGTTGGTCAACCTGA 2241
Query 2230 GAGGCAATCTGCAGATAATTGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTG 2289
||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2242 GAGGCAACCTTCAGATAATCGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTCG 2301
Query 2290 ATGCATGTATTAAGCTCTTTGAGCAGTTCAAGTCATATGAAGGGCTATACTTTTTCCTAG 2349
||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2302 ATGCATGCATTAAACTCTTTGAGCAATTCAAGTCATACGAAGGGCTGTACTTTTTCCTAG 2361
Query 2350 GTTCATATTTGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATCCATTTCAAGTACATTGAAGCAGCTG 2409
||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2362 GTTCATACTTGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAGTACATCGAAGCAGCTG 2421
Query 2410 CCAAGACTGGTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTAACTAGAGAGTCTAACTTCTATGATG 2469
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2422 CCAAGACTGGTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTGACTAGAGAGTCTAACTTTTATGATG 2481
Query 2470 CTGAAAAGACGAAGAACTTTTTGATGGAAGCTAAGCTGCCTGATGCACGACCTTTGATAA 2529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2482 CTGAAAAGACGAAGAACTTTTTGATGGAAGCTAAGCTTCCTGATGCCCGACCTTTGATAA 2541
Query 2530 ATGTCTGTGATCGTTTCAGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACA 2589
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2542 ATGTCTGCGATCGTTTTGGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACA 2601
Query 2590 TGCTTCGTTACATTGAAGGCTACGTGCAGAAGGTGAACCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTG 2649
|||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2602 TGCTGCGTTACATTGAAGGTTACGTTCAGAAGGTAAATCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTG 2661
Query 2650 TCGGGCAGTTGCTTGATGATGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTCTCTG 2709
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2662 TGGGGCAGTTGCTTGATGACGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTTTCTG 2721
Query 2710 TTCGTTCATTGCTTCCTGTTGAACCACTTGTCGAGGAATGTGAGAAGAGAAATCGACTCC 2769
|||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2722 TTCGTTCATTACTTCCTGTTGAACCCCTTGTTGATGAATGTGAAAAGAGAAATCGACTCC 2781
Query 2770 GTCTCCTCACTCAGTTCTTGGAGCATTTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCC 2829
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2782 GTCTCCTTACTCAGTTCTTGGAGCATCTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCC 2841
Query 2830 ATAATGCCTTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCTGAGCATTTCCTGACCA 2889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2842 ATAATGCCTTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCCGAGCATTTCCTGACCA 2901
Query 2890 CCAACCCTTACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCTACCC 2949
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2902 CCAATCCTTACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCCACTC 2961
Query 2950 TAGCAGTTGTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACTAACA 3009
| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2962 TGGCCGTCGTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACCAACA 3021
Query 3010 AAAACTCTTTGTTTAAGTTACAAGCCAGGTATGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGATCTGT 3069
| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 3022 AGAACTCTTTGTTCAAGTTACAAGCCAGGTACGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGACCTCT 3081
Query 3070 GGGATAAGGTTC-T-CGATGAA-AACAATGATTATAGAAGACAGCTTATTGACCAAGTTG 3126
|||| ||||||| | || ||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||
Sbjct 3082 GGGAGAAGGTTCTTACG--GAAGAA-AATGAATATAGGAGGCAACTTATCGACCAAGTTG 3138
Query 3127 TGTCTACTGCTTTACCTGAAAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCAT 3186
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3139 TGTCTACTGCTTTACCAGAAAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCAT 3198
Query 3187 TCATGACTGCTGATTTGCCGCACGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAGATTGTTCTACAAA 3246
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||
Sbjct 3199 TCATGACTGCTGATCTGCCGCATGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAAATTGTGCTTCAAA 3258
Query 3247 ATTCTGCCTTCAGTGGAAACTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATATTGACAGCTATTAAGG 3306
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3259 ATTCTGCCTTCAGTGGAAATTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATACTGACAGCTATTAAGG 3318
Query 3307 CAGATCCGTCTAGAGTTATGGATTACATCAACAGGCTGGACAACTTTGATGGACCTGCAG 3366
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |
Sbjct 3319 CAGATCCGTCTAGAGTTATGGATTACATTAACAGGCTGGATAATTTTGATGGTCCAGCGG 3378
Query 3367 TTGGAGAAGTCGCAGTTGAAGCCCAATTATATGAGGAAGCATTTGCTATCTTCAAGAAGT 3426
|||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3379 TTGGAGAAGTGGCGGTTGATGCTCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCGATTTTCAAGAAGT 3438
Query 3427 TCAACTTAAATGTTCAGGCTGTCAATGTATTGCTGGATAATGTCAGGAGCATTGAGCGTG 3486
| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 3439 TTAACTTAAATGTTCAGGCTGTCAACGTATTGTTGGATAACGTCAGAAGCATTGAGCGTG 3498
Query 3487 CAGTTGAGTTTGCATTCCGGGTCGAAGAAGATTCTGTTTGGAGCCAAGTCGCTAAGGCGC 3546
| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 3499 CTGTTGAGTTTGCTTTCCGGGTCGAAGAAGATGCTGTTTGGAGTCAAGTCGCTAAGGCTC 3558
Query 3547 AACTCAGGGAAGGACTAGTCAGTGATGCAATTGAGTCCTTTATCCGTGCTGATGATGCCA 3606
| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3559 AGCTCAGGGACGGACTAGTCAGTGATGCTATTGAGTCCTTTATCCGAGCTGATGATGCCA 3618
Query 3607 CTCATTTCTTGGAGGTCATACGTGTCTCTGAAGATACTGATGTCTATGATGACTTGGTCA 3666
|||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3619 CTCAGTTCCTGGAGGTCATCCGCGCCTCTGAAGATACTAATGTCTATGATGACTTGGTCA 3678
Query 3667 AATACCTTCTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTTGATAGTGAGCTCATCT 3726
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3679 GATACCTTTTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTGGATAGTGAGCTCATCT 3738
Query 3727 ATGCATATGCAAAGATTGATCGGTTAGGTGAGATTGAAGAATTCATTCTGATGCCAAACG 3786
|||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 3739 ATGCTTATGCAAAGATTGAAAGGTTGGGTGAGATTGAAGAATTTATTCTGATGCCCAACG 3798
Query 3787 TTGCTAATCTACAACATGTTGGTGATCGTCTGTATGACGAAGCTCTCTATGAGGCTGCAA 3846
|||| || || ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 3799 TTGCCAACCTTCAAAATGTTGGTGACCGTTTGTATGATGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAA 3858
Query 3847 AAATAATCTATGCGTTCATATCAAACTGGGGCAAGTTAGCCGTCACACTTGTGAAGTTGC 3906
| ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3859 AGATAATATATGCATTCATATCGAATTGGGCCAAGTTAGCCGTCACCCTTGTGAAGTTGC 3918
Query 3907 AACAGTTCCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGG 3966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3919 AACAGTTCCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGG 3978
Query 3967 AAGTCTGCTTTGCTTGCGTTGATGCTGAGGAATTCCGGTTGGCTCAAATATGTGGTCTTA 4026
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 3979 AAGTCTGCTTTGCTTGTGTTGATGCTGAGGAATTCCGACTGGCCCAAATCTGTGGACTTA 4038
Query 4027 ACATTATCATTCAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTCAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGGT 4086
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4039 ACATTATCATACAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTAAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGAT 4098
Query 4087 GCTTCAATGAATTAATCTCACTTATGGAGAGTGGACTTGGGCTTGAACGTGCTCACATGG 4146
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4099 GCTTCAATGAATTGATCTCACTTATGGAGAGTGGACTTGGTCTGGAACGTGCTCACATGG 4158
Query 4147 GTATCTTCACCGAGTTGGGTGTACTCTATGCTAGATATCGTTATGAGAAACTTATGGAAC 4206
| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4159 GGATCTTCACCGAGTTGGGTGTACTGTACGCTAGATATCGTTATGAGAAGCTTATGGAAC 4218
Query 4207 ACATCAAGTTATTTTCAACTCGCCTCAATATTCCCAAGCTTATACGGGCCTGTGATGAAC 4266
|||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4219 ACATCAAGTTGTTCTCGACGCGGCTCAATATTCCCAAGCTTATCCGGGCCTGTGATGAAC 4278
Query 4267 AACAGCACTGGCAGGAACTTACCTATCTGTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTG 4326
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4279 AACAGCATTGGCAGGAACTTACCTATCTTTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTG 4338
Query 4327 CGACCACCGTCATGAACCATTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTG 4386
| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4339 CAACCACTGTCATGAATCATTCTCCTGAAGCATGGGAACACATGCAATTCAAAGACATTG 4398
Query 4387 TTGCCAAGGTAGCGAATGTTGAACTGTACTACAAGGCTGTGCACTTCTACTTGCAAGAGC 4446
|||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 4399 TTGCCAAGGTTGCGAATGTTGAGCTTTACTATAAGGCCGTTCACTTCTACTTGCAAGAGC 4458
Query 4447 ATCCGGATATAATCAACGATCTTCTCAACGTACTTGCGT-TGCGGTTAGACCATACTCGT 4505
| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| || ||||||
Sbjct 4459 ACCCTGATATAATCAACGATCTTCTCAATGTGCTTGC-TCTGCGGTTAGATCACACTCGT 4517
Query 4506 GTTGTTGATATAATGCGGAAGGCTGGTCACTTGCGTCTTATCAAGCCATACATGATTGCA 4565
|| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4518 GTCGTTGATATTATGCGCAAGGCTGGTCACTTGCGCCTTATCAAGCCATACATGGTTGCA 4577
Query 4566 GTTCAGAGCAACAATGTCTCTGCTGTTAATGAGGCTCTGAATGAGATATACGTGGAAGAA 4625
||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 4578 GTTCAGAGCAATAATGTCTCTGCTGTAAATGAAGCTCTGAATGAGATATATGTAGAAGAA 4637
Query 4626 GAAGACTACGATAGGTTGCGAGAGTCTATTGATTTACATGACAGCTTTGACCAGATTGGC 4685
|||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 4638 GAAGACTATGACAGGTTGCGCGAGTCTATTGATTTGCATGACAGTTTTGACCAGATAGGT 4697
Query 4686 CTCGCTCAGAAGATCGAGAAACACGAACTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATC 4745
||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4698 CTCGCCCAGAAGATTGAGAAACACGAGCTTGTTGAAATGAGGCGTGTGGCTGCTTATATC 4757
Query 4746 TACAAGAAAGCGGGCAGATGGAAGCAATCAATTGCATTATCAAAGAAAGACAACATGTAC 4805
||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4758 TACAAGAAAGCTGGTAGATGGAAGCAATCGATTGCTTTATCAAAGAAAGATAACATGTAC 4817
Query 4806 AAGGACTGTATGGAAACGGCTTCACAATCAGGCGAACATGAACTTGCAGAACAACTACTG 4865
||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 4818 AAGGACTGTATGGAAACTGCTTCGCAATCCGGCGACCATGATCTTGCAGAACAACTTCTC 4877
Query 4866 GTGTATTTCATTGAACAGGGCAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTATGTTAT 4925
|| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4878 GTCTACTTCATTGAACAGGGGAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTCTGTTAT 4937
Query 4926 GACTTAATCCGACCAGACGTGGCTCTAGAACTTGCCTGGATCAACAATATGATGGACTTT 4985
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4938 GACTTAATCCGACCAGACGTTGCTCTAGAACTTGCTTGGATCAACAATATGATAGACTTT 4997
Query 4986 GCCTTCCCGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAGTACTCTGGCAAAGTGGATGAGCTAATA 5045
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4998 GCCTTCCCGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCTGGCAAAGTGGATGAGCTAATC 5057
Query 5046 AAGGACAAGCTTGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTC 5105
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5058 AAGGACAAGCTGGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAACAGGAAGAGAAGGATGTC 5117
Query 5106 ATATCCCAACAGAACATGTATGCCCAAATGTTGCCACTTG-CTTTACCTGCACCACCGAT 5164
|| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| || ||||||| || |||||
Sbjct 5118 ATGTCCCAACAGAACATGTACGCCCAATTATTGCCA-TTGGCTCTACCTGCCCCTCCGAT 5176
Query 5165 GCCAGGAATGGGAGGTGGTGGTGGGTATGGTCCTCCACCACAAATGGGCGGTATGCCAGG 5224
||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 5177 GCCAGGAATGGGAGGTGGTGG-G--TATGGTCCGCCACCACCAATGGGCGGAATGCCAGG 5233
Query 5225 AATGCCTCCCATGCCACCATATGGAATGCCACCGATGGGCGGCTACTAAAG-CAGA 5279
||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||
Sbjct 5234 AATGCCTCCAATGCCACCGTATGGAATGCCTCCAATGGGCGGCTACTAAGGTCAGA 5289
> Ahg338955 jgi|Araly1|338955|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001054
Length=993
Score = 379 bits (205), Expect = 1e-103
Identities = 310/361 (86%), Gaps = 6/361 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1306 AGGAGTTGTTCGCTCAAACAAAGTACAAGGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTC 1365
||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 74 AGGAGTTATTTGCTCAAACCAAGTACAAGGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGACTCTCCTC 133
Query 1366 AAGGAATTCTAAGGACACCTGATACAGTGGCCAAATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCTG 1425
||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| | || ||||| |||||||||||
Sbjct 134 GAGGCATTCTCCGGACACCTGATACAATTGCCAAATTTCGGAATGTTCATGTACAAGCTG 193
Query 1426 GACAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTTTGGGACTCTTTTGACTAGAGGGAAA-CTCAAT 1484
|||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||| ||| ||||||
Sbjct 194 GACAAAATCATCCATTGTTACAATATTTTGCGACTCTATTGACAAAAGG-AAAGCTCAAT 252
Query 1485 TCATATGAGTCACTGGAACTATCT-CGGCTGGTTGTGAACCAAAACAAGAAGAACCTCCT 1543
||| ||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| |
Sbjct 253 GCATTTGAATCATTGGAACTATCTTCG-CTTGTTGTGAATCAAGGCAAGAAGAACCTCTT 311
Query 1544 GGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAACTAGAATGCAGTGAAGAACTTGGAGACCTTGTGAA 1603
||||||||||||||| || || || | ||||| | |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 312 GGAAAACTGGTTGGCGGATGACAAGTTGGAATGTACCGAAGAACTTGGAGACCTTGTTAA 371
Query 1604 GACTGTGGATAATGATCTCGCTCTGAAAATATACA-TCAAAGCTCGGGCGACTCCAAAAG 1662
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| | || |||||||
Sbjct 372 GACTGTGGATAATGATCTTGCTCTTAAAATATACACT-AAAGCTCGGACCACCCCAAAAG 430
Query 1663 T 1663
|
Sbjct 431 T 431
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 213541042103
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5