BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G08943.1 Length=3167 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg478202 jgi|Araly1|478202|fgenesh2_kg.3__903__AT3G08947.1 4239 0.0 Ahg478201 jgi|Araly1|478201|fgenesh2_kg.3__902__AT3G08947.1 3066 0.0 > Ahg478202 jgi|Araly1|478202|fgenesh2_kg.3__903__AT3G08947.1 Length=2976 Score = 4239 bits (2295), Expect = 0.0 Identities = 2606/2753 (95%), Gaps = 33/2753 (1%) Strand=Plus/Plus Query 115 AGAAGCTTTTTCTCGATAGGCT-TTGCAGTGACAGGGACACAGG-GTTTGGATTGAAGCG 172 ||||||||||| | ||||| | || |||||| |||||| || |||| ||||||||| Sbjct 90 AGAAGCTTTTTGTGGATAGAATCTT-CAGTGAGAGGGAC-GTGGTGTTTAAATTGAAGCG 147 Query 173 AAAAACCCTAGCGTTTACGCGTCTTCTCAAGCGAAAAAATCCTTAATTTCCACAGAGAAG 232 ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||| Sbjct 148 AAAAACCCTAGCGTTTA--------CTCAAGC------A---TTGATTTCCATAGAGAAG 190 Query 233 AATGGCTATGGAGATCACACAGTTCCTTCTGGCTGCCCAGTCAGCCGATGCAAGAGTCCG 292 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 191 AATGGCTATGGAGATCACACAGTTCCTACTGGCTGCTCAGTCAGCTGATGCAAGAGTCCG 250 Query 293 TACTGAAGCAGAGGCTAGTCTCAGACAGTTCCAAGAACAAAACTTGCCGCTGTTCTTGTT 352 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 251 TACTGAAGCAGAGGCTAGTCTCAGGCAGTTCCAAGAACAAAACTTGCCACTGTTCTTATT 310 Query 353 ATCCTTGTCTTTTGAGCTTGAAAACAATGATAAACCTGCTGAATCCCGTCGACTAGCCGG 412 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 311 ATCCTTGTCTTTTGAGCTTGAGAACAATGATAAACCTGCTGAATCCCGTCGACTTGCTGG 370 Query 413 TATTCTGCTAAAGAATTCTCTGGACGCCAAAGATTCTGCCACAAAAGATCATCTGGTGAA 472 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 371 TATTCTGCTAAAGAATTCTCTTGACGCCAAAGATTCTGCCAGAAAAGATCATCTGGTGAA 430 Query 473 ACAATGGTTTGCAATTGATGTTGCTCTTAAATCCCAGATCAAGGATC-GCTTACTAAGAA 531 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||| Sbjct 431 ACAATGGTTTGCAATTGATGTTGCTCTTAAATCCCAGATCAAGGAACTG-TTAATGAGAA 489 Query 532 CTCTTGGTTCATCTGCCCTAGAGGCAAGGCATACTTCAGCTCAGGTTATTGCTAAGGTAG 591 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 490 CTCTTGGTTCTTCTGCCCTAGAGGCGAGGCATACTTCAGCTCAGGTTATTGCAAAGGTAG 549 Query 592 CCTCCATTGAAATTCCTCAGAAGCAGTGGCCTGAACTTGTTGGATCGCTGCTTAACAATA 651 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 550 CCTCCATTGAAATTCCTCAGAAGCAGTGGCCTGAACTTGTTGGATCGTTGCTTAACAATA 609 Query 652 TGACTCAGCAAGGCAGTCCCGCACACTTGAAGCAATCAACCTTGGAAACTCTAGGCTATG 711 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 610 TGACCCAGCAAGGCAGTCCCGCACACTTGAAGCAATCAACGTTAGAAACTCTAGGCTATG 669 Query 712 TCTGTGAAGAGATATCACACCATGATCTTGTGCAAGATGAAGTGAATTCTGTCCTCACAG 771 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 670 TCTGTGAAGAGATATCACACCATGATCTTGTGCAAAATGAAGTGAATTCCGTCCTCACAG 729 Query 772 CAGTTGTGCAGGGCATGAACCAGTCTGAAAATACTGCTGAAGTTCGTCTCGCAGCAACAA 831 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 730 CAGTTGTGCAGGGCATGAACCAGTCTGAAAATACTGCAGAAGTTCGTCTTGCAGCAACAA 789 Query 832 AGGCACTGTTAAATGCCTTGGATTTCTCTCAGACAAATTTTGAGAATGAAATGGAGAGGA 891 |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 790 AGGCACTGTTGAATGCCCTGGATTTCTCTCAGACAAACTTTGAGAATGAAATGGAGAGGA 849 Query 892 ATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCAGAGATCAGGCAAG 951 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 850 ATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCAGAGATCAGACAAG 909 Query 952 CTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCCATTGCATCCACATACTATGAGGTGCTGGAGCACTACA 1011 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 910 CTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCTATTGCGTCCACATACTACGAGGTGCTGGAGCAATACA 969 Query 1012 TACAAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAAGAGAGCGTTGCCC 1071 | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 970 TGCCAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAAGAGAGTGTTGCCC 1029 Query 1072 TCCAAGCAATTGAGTTCTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATCGACCGTCAAGAGTATG 1131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1030 TCCAAGCAATTGAGTTCTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATCGACCGTCAAGAGTATG 1089 Query 1132 ACAGTCCTGATAGTGGTGACTCATCCCCTCCCCACTCCTGTTTCATAGAGAAGGCTCTTC 1191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1090 ACAGTCCTGATAGTGGTGACTCATCCCCTCCCCACTCCTGTTTCATAGAGAAGGCTCTTC 1149 Query 1192 CCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAGGATCAGGACCATG 1251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1150 CCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAGGATCAGGACCATG 1209 Query 1252 ACGACGATGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGCCTGGTTGCTAGAA 1311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1210 ACGACGATGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGCCTGGTTGCCAGAA 1269 Query 1312 CGGTTGGAGATGGTGTAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGaaaaaaaCATAAGTTCGC 1371 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1270 CGGTTGGAGATGGTATAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGAAAAAAACATAAGTTCGC 1329 Query 1372 CAGATTGGCGAAGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATTTTGGAGGGCCCAA 1431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1330 CAGATTGGCGAAGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATTTTGGAGGGCCCAA 1389 Query 1432 CAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTAGCTGCTGGCTTGGAATTTCTCCTTAATGCAACCA 1491 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1390 CAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTTGCTGCTGGCTTGGAATTCCTCCTTAATGCAACCA 1449 Query 1492 AGGATCAGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGCCGTATCTTTGAAT 1551 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1450 AGGATGGGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGCCGTATCTTTGAAT 1509 Query 1552 TTTTGC-CATCCCCAGACAGTGGCTTCTCTGTTATATCACCCGAAAACCTCCCTAGAATT 1610 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1510 TTTTGCAC-TCCCCAGACAGTGGCTTCTCTGTTATATCACCCGAAAACCTCCCTAGAATT 1568 Query 1611 GTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAGAAGGTCTGTGGA 1670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1569 GTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAGAAGGTCTGCGGA 1628 Query 1671 GCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAA-GTTCCTCTCTTCTCTC 1729 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 1629 GCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAAAGT-CCTCTCTTCTCTC 1687 Query 1730 TCCTTATCTTACAGAGATCATCACACATCTCCTTGCAGCTGCTGAGCGTACAGATGGGGC 1789 ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1688 TCCTTATCTCACAGAAATCATCACACATCTGCTTGCAGCTGCTGAGCGTACAGATGGGGC 1747 Query 1790 AGAGTCTAAGCTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAACGAGGTTGTCCGGTGTTCAAA 1849 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1748 AGAGTCTAAACTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAATGAGGTTGTCCGGTGTTCAAA 1807 Query 1850 CCTTTCAGAGGCCTCAAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCATGAAAAAATTAGC 1909 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1808 CCTTTCAGAGGCCTCGAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCATGAAAAAATTAGC 1867 Query 1910 TGAGACAATGGACCTCCCTATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAGCAAGCGGAACTCCA 1969 ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| Sbjct 1868 TGAAACTATGGACCTCCCGATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAACAGGCAGAACTCCA 1927 Query 1970 GGCGTCTCTGTGCGGTGTTCTCCAAGTCATAATCCAGAAGCTGAGCAGCAGGGACGATAT 2029 ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct 1928 GGCTTCTCTGTGTGGTGTTCTCCAAGTCATAATCCAGAAGCTGAGTGGCAGGGAGGATAC 1987 Query 2030 GAAACCTATCATAGTGCAAAACGCAGATGACATCATGAGGTTATTCCTAAGAGTGTTTGG 2089 |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| Sbjct 1988 GAAACCCATCATAATGCAGAACGCAGATGACATCATGAGGCTGTTCTTAAGAGTGTTTGG 2047 Query 2090 TTGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGCTCTTGCCTATGC 2149 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2048 ATGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGCTCTTGCCTATGC 2107 Query 2150 GACTGGAACTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTTAAATATCTCCAGATGGGGCT 2209 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2108 AACTGGAGCTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTCAAATATCTCCAGATGGGGCT 2167 Query 2210 GCAGAATTTCGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACCGTAGGAGTGATTGGTGACATATG 2269 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2168 GCAGAATTTTGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACCGTAGGAGTGATTGGTGACATATG 2227 Query 2270 CCGTGCGCT-GGATGAAAAAATCCTACCCTTTTGCGATCAGATAATGGGTCTCCTTATCC 2328 |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2228 CCGTGC-CTTGGATGAAAAAATCCTACCTTTTTGCGATCAGATAATGGGTCTCCTTATCC 2286 Query 2329 AAAACCTTCAAAGTGGTGCACTCCACAGATCGGTGAAGCCTCCAATCTTCTCATGCTTTG 2388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2287 AAAACCTTCAAAGTGGTGCACTCCACAGATCGGTGAAGCCTCCAATGTTCTCATGCTTTG 2346 Query 2389 GAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGCTCATTTTGAAAGGTATGTAGCTCCAGCTGTTCAGA 2448 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 2347 GAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGCTCATTTCGAAAGGTATGTTGCTCCAGCCGTTCAGA 2406 Query 2449 TAATGCAAGGTGCTGCTCAGGTGTGTGCGCAGATGGACACCCTTGACGAGGAGCTTATGG 2508 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2407 TCATGCAAGGGGCTGCTCAGGTGTGTGCGCAGATGGACACCCTTGACGAGGAGCTTATGG 2466 Query 2509 ATTATGCAAACCAACTCCGGAGAAGCATCTTTGAAGCATACTCCGGGATACTGCAAGGGT 2568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| Sbjct 2467 ATTATGCAAACCAACTCCGGAGAAGCATCTTTGAAGCATACTCCGGAATACTACAGGGGT 2526 Query 2569 TCAAGGATGCAAAGGCTGAGCTCATGATGCCCTATGCTCAACATCTGTTGCAGTTTGTTG 2628 ||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2527 TCAAGGACACAAAAGCCGAGCTCATGATGCCCTACGCTCAACATCTACTGCAGTTTGTTG 2586 Query 2629 AACTAGTATCCAAAGATTCCCTGAGGGATGAGAGCGTGACAAAAGCCGCGGTTGCAGCAA 2688 | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2587 AGCTAGTATCCAAAGATCCCCTCAGGGATGAGAGTGTGACAAAAGCTGCGGTTGCAGCAA 2646 Query 2689 TGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGGGAGAACACGAAGCAGTTGTTCCAA-AACTTCACC 2747 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||||||| Sbjct 2647 TGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGAGAGAACACAAAGCAGGTGTTC-AACAACTTCACC 2705 Query 2748 TTCTGT-GATGAGTTCCTCAATGAGTGTCTCGAATCAGAGGATGAAGATCTCAAGGTCAC 2806 |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2706 TTCT-TCGGTGAGTTCCTCAATGAGTGTCTCGAATCAGAGGATGAAGATCTCAAGGTTAC 2764 Query 2807 TGCACGCTGGACTCAAGGAATGATCGCAAGACTCGTGCTCTAATCATAAATTT 2859 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| Sbjct 2765 TGCACGCTGGACTCAAGGAATGATCGCAAGGCTCATGCACTCATCATAAATTT 2817 > Ahg478201 jgi|Araly1|478201|fgenesh2_kg.3__902__AT3G08947.1 Length=1870 Score = 3066 bits (1660), Expect = 0.0 Identities = 1802/1872 (96%), Gaps = 4/1872 (0%) Strand=Plus/Plus Query 882 ATGGAGAGGAATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCAGAG 941 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGAGAGGAATTACATCATGAAGATGGTATGCGAGACAGCATGTTCCAAGGAGGCAGAG 60 Query 942 ATCAGGCAAGCTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCCATTGCATCCACATACTATGAGGTGCTG 1001 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 61 ATCAGACAAGCTGCTTTCGAGTGCCTTGTGTCTATTGCGTCCACATACTACGAGGTGCTG 120 Query 1002 GAGCACTACATACAAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAAGAG 1061 ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GAGCAATACATGCCAACACTCTTTGAGCTCACATCGAATGCTGTAAAGGGAGATGAAGAG 180 Query 1062 AGCGTTGCCCTCCAAGCAATTGAGTTCTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATCGACCGT 1121 || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 181 AGTGTTGCCCTCCAAGCAATTGAGTTTTGGAGTTCCATCTGTGATGAAGAGATTGACCGT 240 Query 1122 CAAGAGTATGACAGTCCTGATAGTGGTGACTCATCCCCTCCCCACTCCTGTTTCATAGAG 1181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CAAGAGTATGACAGTCCTGATAGTGGTGACTCATCCCCTCCCCACTCCTGTTTCATAGAG 300 Query 1182 AAGGCTCTTCCCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAGGAT 1241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AAGGCTCTTCCCCATTTAGTTCAAATGTTGCTAGAAACTCTGCTGAAGCAGGAAGAGGAT 360 Query 1242 CAGGACCATGACGACGATGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGCCTG 1301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CAGGACCATGACGACGATGTCTGGAACATATCTATGGCTGGCGGGACATGCCTTGGCCTG 420 Query 1302 GTTGCTAGAACGGTTGGAGATGGTGTAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGaaaaaaaC 1361 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GTTGCCAGAACGGTTGGAGATGGTATAGTCCCTCTTGTGATGCCTTTTGTTGAAAAAAAC 480 Query 1362 ATAAGTTCGCCAGATTGGCGAAGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATTTTG 1421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ATAAGTTCGCCAGATTGGCGAAGCCGGGAGGCAGCCACTTATGCTTTTGGATCAATTTTG 540 Query 1422 GAGGGCCCAACAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTAGCTGCTGGCTTGGAATTTCTCCTT 1481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 541 GAGGGCCCAACAATTGATAAGCTTGCCCCGATGGTTGCTGCTGGCTTGGAATTCCTCCTT 600 Query 1482 AATGCAACCAAGGATCAGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGCCGT 1541 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 AATGCAACCAAGGATGGGAATAACCATGTCAGGGATACAACTGCTTGGACTCTGAGCCGT 660 Query 1542 ATCTTTGAATTTTTGC-CATCCCCAGACAGTGGCTTCTCTGTTATATCACCCGAAAACCT 1600 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ATCTTTGAATTTTTGCAC-TCCCCAGACAGTGGCTTCTCTGTTATATCACCCGAAAACCT 719 Query 1601 CCCTAGAATTGTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAGAA 1660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 CCCTAGAATTGTGAGTGTATTACTGGAATCAATTAAAGATGTGCCAAATGTTGCAGAGAA 779 Query 1661 GGTCTGTGGAGCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAAGTTCCTC 1720 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 780 GGTCTGCGGAGCAATATACAATCTTGCACAGGGATATGAAGACTCTGGAGCAAACTCCTC 839 Query 1721 TCTTCTCTCTCCTTATCTTACAGAGATCATCACACATCTCCTTGCAGCTGCTGAGCGTAC 1780 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 840 TCTTCTCTCTCCTTATCTCACAGAAATCATCACACATCTGCTTGCAGCTGCTGAGCGTAC 899 Query 1781 AGATGGGGCAGAGTCTAAGCTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAACGAGGTTGTCCG 1840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 900 AGATGGGGCAGAGTCTAAGCTAAGAGGTGCTGCGTATGAAACCTTGAATGAGGTTGTCCG 959 Query 1841 GTGTTCAAACCTTTCAGAGGCCTCAAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCATGAA 1900 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 GTGTTCAAACCTTTCAGAGGCCTCGAGCATCATAGCGCATCTCCTCCCTGCCATCATGAA 1019 Query 1901 AAAATTAGCTGAGACAATGGACCTCCCTATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAGCAAGC 1960 |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 1020 AAAATTAGCTGAAACTATGGACCTCCCGATAATATCAACTGATGACCGTGAGAAACAGGC 1079 Query 1961 GGAACTCCAGGCGTCTCTGTGCGGTGTTCTCCAAGTCATAATCCAGAAGCTGAGCAGCAG 2020 ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1080 AGAACTCCAGGCTTCTCTGTGTGGTGTTCTCCAAGTCATAATCCAGAAGCTGAGTGGCAG 1139 Query 2021 GGACGATATGAAACCTATCATAGTGCAAAACGCAGATGACATCATGAGGTTATTCCTAAG 2080 ||| |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| Sbjct 1140 GGAGGATACAAAACCCATCATAATGCAGAACGCAGATGACATCATGAGGCTGTTCTTAAG 1199 Query 2081 AGTGTTTGGTTGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGCTCT 2140 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1200 AGTGTTTGGATGCCATAGTTCAAGTGTCCACGAAGAAGCCATGCTTGCAATCGGTGCTCT 1259 Query 2141 TGCCTATGCGACTGGAACTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTTAAATATCTCCA 2200 ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1260 TGCCTATGCAACTGGAGCTGAGTTTGTGAAATACATGCCCGAGCTTTTCAAATATCTCCA 1319 Query 2201 GATGGGGCTGCAGAATTTCGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACCGTAGGAGTGATTGG 2260 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1320 GATGGGGCTGCAGAACTTCGAAGAATACCAAGTCTGCTCAATCACCGTAGGAGTGATTGG 1379 Query 2261 TGACATATGCCGTGCGCT-GGATGAAAAAATCCTACCCTTTTGCGATCAGATAATGGGTC 2319 ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1380 TGACATATGCCGTGC-CTTGGATGAAAAAATCCTACCTTTTTGCGATCAGATAATGGGTC 1438 Query 2320 TCCTTATCCAAAACCTTCAAAGTGGTGCACTCCACAGATCGGTGAAGCCTCCAATCTTCT 2379 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1439 TCCTTATCCAAAACCTTCAAAGTGGTGCACTCCACAGATCGGTGAAGCCTCCAATGTTCT 1498 Query 2380 CATGCTTTGGAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGCTCATTTTGAAAGGTATGTAGCTCCAG 2439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 1499 CATGCTTTGGAGACATTGCTCTGGCGATTGGTGCTCATTTCGAAAGGTATGTTGCTCCAG 1558 Query 2440 CTGTTCAGATAATGCAAGGTGCTGCTCAGGTGTGTGCGCAGATGGACACCCTTGACGAGG 2499 | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1559 CCGTTCAGATCATGCAAGGGGCTGCTCAGGTGTGTGCGCAGATGGACACCCTTGACGAGG 1618 Query 2500 AGCTTATGGATTATGCAAACCAACTCCGGAGAAGCATCTTTGAAGCATACTCCGGGATAC 2559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1619 AGCTTATGGATTATGCAAACCAACTCCGGAGAAGCATCTTTGAAGCATACTCCGGAATAC 1678 Query 2560 TGCAAGGGTTCAAGGATGCAAAGGCTGAGCTCATGATGCCCTATGCTCAACATCTGTTGC 2619 | || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 1679 TACAGGGGTTCAAGGATACAAAAGCCGAGCTCATGATGCCCTACGCTCAACATCTCTTGC 1738 Query 2620 AGTTTGTTGAACTAGTATCCAAAGATTCCCTGAGGGATGAGAGCGTGACAAAAGCCGCGG 2679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1739 AGTTTGTTGAACTAGTATCCAAAGATTCCCTGAGGGATGAGAGCGTGACAAAAGCCACGG 1798 Query 2680 TTGCAGCAATGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGGGAGAACACGAAGCAGTTGTTCCAAA 2739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1799 TTGCAGCAATGGGTGATCTTGCGGATGTTGTAGGGGAGAACACGAAGCAGCTGTTCAAAA 1858 Query 2740 ACTTCACCTTCT 2751 |||||||||||| Sbjct 1859 ACTTCACCTTCT 1870 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 119641459545 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5