BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G10370.1
Length=2267
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg478367 jgi|Araly1|478367|fgenesh2_kg.3__1068__AT3G10370.1 2639 0.0
Ahg497460 jgi|Araly1|497460|fgenesh2_kg.491__1__AT3G10370.1 1742 0.0
> Ahg478367 jgi|Araly1|478367|fgenesh2_kg.3__1068__AT3G10370.1
Length=2117
Score = 2639 bits (1429), Expect = 0.0
Identities = 1552/1609 (96%), Gaps = 18/1609 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 585 CTCATTGAGAATGCGCCACATCTCTGTCATGCTCTGCCCTGTATGACACCTTGTTTTGAT 644
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 CTCATCGAGAATGCGCCACATCTCTGCCATGCTCTGCCCTGTATGACACCTTGTTTTGAC 574
Query 645 TGGTTCGAAGTTATCTACTTCTGGATGGGGTTGAAGATGTATGACTTGGTTGCTGGACCA 704
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 575 TGGTTCGAAGTTATCTACTTCTGGATGGGTTTGAAAATGTATGATTTGGTCGCTGGACCA 634
Query 705 CGGTTATTGCATCTGTCCAGATATTACTCTGCAAAAGAGTCTATTGAGCTCTTCCCCACT 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 CGGTTATTGCATCTGTCCAGATATTACTCTGCAAAAGAGTCTATTGAGCTCTTCCCCACT 694
Query 765 CTTGCAAGGAAAGGGAAAGACAAGAATTTGAGGGGTACTGTTGTGTATTATGACGGGCAA 824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 695 CTTGCAAGGAAAGGGAAAGACAAGAATTTGAGGGGTACTGTTGTGTATTATGATGGGCAA 754
Query 825 ATGAACGATTCACGTCTGAATGTGGGTTTGGCATGTACTGCCGCGTTAGCTGGTGCGGCA 884
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 755 ATGAATGATTCACGTCTGAATGTGGGCTTGGCATGTACTGCCGCGTTAGCTGGTGCAGCC 814
Query 885 GTTCTCAACCATGCCGAGGTTGTCTCGCTTATTACTGATGATGCTACTAAGAGAATAATT 944
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 815 GTTCTCAACCATGCCGAGGTTGTCTCTCTTATTACAGATGATTCTACTAAGAGAATAATT 874
Query 945 GGTGCCCGAATTCGTAACAATCTCACAGGCCAAGAATTTAACAGCTATGCAAAAGTAGTT 1004
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 875 GGTGCCCGAGTTCGTAACAATCTCACAGGCCAAGAATTTAACACCTATGCAAAAGTAGTT 934
Query 1005 GTTAATGCGGCAGGACCGTTCTGTGATTCCATTAGGAAAATGATTGATGAAGATACAAAA 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 935 GTTAATGCGGCAGGACCGTTCTGTGATTCCATTAGAAAAATGATTGATAAAGATACAAAA 994
Query 1065 CCAATGATTTGTCCAAGCAGCGGTGTACACATCGTGCTGCCTGATTACTATTCTCCTGAA 1124
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 CCAATGATTTGTCCAAGCAGCGGTGTACACATTGTGCTGCCTGATTACTATTCTCCTGAA 1054
Query 1125 GGCATGGGGTTGATAGTCCCTAAAACTAAGGATGGCCGCGTTGTGTTTATGTTACCGTGG 1184
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1055 GGGATGGGGTTGATAGTCCCTAAAACTAAGGATGGTCGCGTTGTGTTTATGTTACCATGG 1114
Query 1185 TTGGGAAGAACAGTAGCAGGCACTACAGACTCTAATACTTCAATCACTTCACTTCCAGAA 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 TTGGGAAGAACAGTAGCAGGCACTACAGACTCTAACACTTCAATCACTTCACTTCCAGAA 1174
Query 1245 CCTCATGAAGATGAGATTCAATTTATACTGGACGCAATCAGCGACTATCTTAACATTAAG 1304
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 CCTCATGAAGATGAGATTCAATTTATACTGGATGCAATCAGCGACTATCTTAACATTAAG 1234
Query 1305 GTTCGACGTACTGATGTTCTTTCGGCTTGGAGTGGGATCCGTCCATTGGCCATGGATCCA 1364
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1235 GTTCGACGTACTGATGTTCTTTCGGCTTGGAGTGGTATCCGTCCGTTGGCCATGGATCCA 1294
Query 1365 ACAGCCAAGAGCACAGAGAGTATCTCCAGAGACCACGTTGTCTTCGAGGAAAATCCTGGT 1424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 ACAGCCAAGAGCACAGAGAGTATCTCCAGAGACCACGTTGTCTTCGAGGAAAATCCTGGT 1354
Query 1425 CTGGTTACAATCACGGGTGGAAAGTGGACAACTTATCGAAGCATGGCGGAAGATGCAGTT 1484
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 CTGGTTACAATCACGGGTGGAAAATGGACAACTTATCGAAGCATGGCGGAAGATGCAGTT 1414
Query 1485 GATGCAGCAATCAAATCGGGACAACTTAAG-CCAACCAATGAATGTGTAACGCAGAAACT 1543
||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 GATGCAGCAATCAAATCGGGAAAACTT-AGTCCAACCAATGAATGTGTAACGCAGAAACT 1473
Query 1544 ACAGCTTCTGGGTTCTTATGGATGGGAACCATCTTCCTTCACAACTCTTGCACAGCAATA 1603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 ACAGCTTCTGGGTTCTTATGGATGGGAACCATCTTCCTTCACAACTCTTGCACAGCAATA 1533
Query 1604 CGTGCGCATGAAGAAAACATACGGTGGTAAAGTGGTTCCTGGAGCAATGGACACAGCTGC 1663
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534 CGTGCGCATGAAGAAAACCTACGGTGGTAAAGTGGTTCCTGGAGCAATGGACACAGCTGC 1593
Query 1664 TGCAAAGCATTTGTCTCATGCCTATGGTTCAATGGCTGACCGAGTTGCCACCATAGCTCA 1723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1594 TGCAAAGCATTTGTCTCATGCCTATGGTTCAATGGCTGACCGAGTTGCCACCATAGCTCA 1653
Query 1724 GGAGGAGGGTTTGGGGAAACGGTTGGCGCATGGGCATCCGTTTTTGGAAGCTGAGGTTGC 1783
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1654 GGAGGAGGGTTTGGGGAAACGGTTGGCGCACGGGCATCCGTTTTTGGAAGCCGAGGTTGC 1713
Query 1784 TTACTGTGCAAGGCACGAGTACTGCGAATCAGCGGTTGATTTCATAGCAAGGAGATGTAG 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1714 TTACTGTGCAAGGCACGAGTACTGCGAATCAGCGGTTGATTTCATAGCAAGGAGATGTAG 1773
Query 1844 AATCGCGTTCTTGGACACTGATGCAGCGGCTCGGGCGTTGCAGCGTGTGGTGGAGATTCT 1903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 AATCGCGTTCTTGGACACTGATGCAGCGGCTCGGGCGTTACAGCGTGTGGTGGAGATTCT 1833
Query 1904 AGCAAGTGAACACAAATGGGACAAGTCGAGGCAGAAGCAAGAGTTGCAAAAGGCTAAAGA 1963
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834 AGCAAGTGAACACAAGTGGGACAAGTCGAGGCAGAAGCAAGAGTTGCAAAAGGCTAAAGA 1893
Query 1964 GTTTCTTGAAACTTTCAAGTCGTCCAAAAACGCACAGTTTAACGATGGCAAGCACAACTA 2023
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1894 GTTTCTTGAAACTTTCAAGTCTTCCAAAAACGCACAGTTTAACGATGGCAAGCACAACTA 1953
Query 2024 AAGCGGCCTCTCAGAGatttacttacactattttattattgaatttatt-atttcctatt 2082
||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1954 AAGCGGCCTCTCAGAAATTTACTTACACTACT--AT-ATTGAATTTATTTATTTC-TATT 2009
Query 2083 ttccaatttgttgaattttttgGGTAGC--T-A-C--T-AGCGAGAACGAATAATAA-AA 2134
||| ||||||||| |||||| ||||||| | | | | |||||||||||||||||| ||
Sbjct 2010 TTCAAATTTGTTGGATTTTT-GGGTAGCGATTAGCGATTAGCGAGAACGAATAATAATAA 2068
Query 2135 --CTGTACGGATGGAATAATAATACTGCGGCTACTCATGTTTCTCGGAT 2181
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 TACTGTACGGATGGAATAATAATACTGCGGCTACTCATGTTTCTCGGAT 2117
Score = 811 bits (439), Expect = 0.0
Identities = 491/516 (95%), Gaps = 4/516 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 41 TTCGCAATCATTTTCTTCTTCTTC-T-TTCCCATGATCGTCTCTCGCTTCCCAACGCAAT 98
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTCGCAATCATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCATGATCG-C-CTCGCTTCCCAACGCAAT 58
Query 99 CTTCTTCACCCAATCTCTAAATCTCTCCTAAATTCCATGTCTCTCGCTTCCATTCGCCGT 158
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 59 CTTCTTCACCCAATCTCTGAATCTCTCCTCAATTCCATGTCTGTCGCTTCTATTCGCCGT 118
Query 159 TTAGCTGCCGGAGCTGCCGTAATTGCCGCTGCATCCGGTGGCGCTGTCTACCTGTCTCCG 218
||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 119 TTAGCCGCCGGAGCCGCTGTAATTGCCGCTGCATCCGGTGGCGCTGTCTATCTGTCTCCG 178
Query 219 TCGGTTGCCTCCAGCGACAAAGGAGGTGGTCCGATTCTAGATTCGTTGAGGCGTAGGCTT 278
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 179 TCGGTTGCCTCCAGCGACAAAGGAGGTGGTCCGATTCTAGATTCCTTGAGGCGTAGGATT 238
Query 279 GGTGATCCCACCGCTTCTGTACCGTCTCGATCTGCTCAAGAGTCTGCTCTGATTGCAGCC 338
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 239 GGTGATCCCACCGCTTCTGTGCCGTCTCGATCTGCTCAAGAGTCTTCTCTGATTGCAGCC 298
Query 339 ACCGCTTCTGATCCGCTCGATGTTCTCGTCATTGGCGGTGGAGCCACCGGTTCTGGAGTT 398
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 299 ACTGCTTCTGATCCGCTCGATGTTCTCGTCATTGGCGGTGGAGCCACTGGTTCTGGAGTC 358
Query 399 GCTCTTGACGCTGTTACACGTGGCCTCCGTGTTGGTTTGGTGGAGCGCGAGGATTTCTCC 458
||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 359 GCTCTCGACGCTGCTACACGTGGCCTCCGTGTTGGTTTGGTGGAGCGAGAGGATTTCTCC 418
Query 459 TCTGGGACTTCTTCGCGATCTACAAAGCTGATTCATGGAGGGGTTCGTTACTTGGAGAAA 518
|| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 TCCGGGACTTCTTCGCGATCAACGAAGCTGATTCATGGAGGGGTTCGTTACTTGGAGAAA 478
Query 519 GCTGTTTTCAATCTTGATTATGGACAGCTGAAGCTT 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 GCTGTTTTCAATCTTGATTATGGACAGCTGAAGCTT 514
> Ahg497460 jgi|Araly1|497460|fgenesh2_kg.491__1__AT3G10370.1
Length=2111
Score = 1742 bits (943), Expect = 0.0
Identities = 1028/1066 (96%), Gaps = 18/1066 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1128 ATGGGGTTGATAGTCCCTAAAACTAAGGATGGCCGCGTTGTGTTTATGTTACCGTGGTTG 1187
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1052 ATGGGGTTGATAGTTCCTAAAACTAAGGATGGTCGCGTTGTGTTTATGTTACCATGGTTG 1111
Query 1188 GGAAGAACAGTAGCAGGCACTACAGACTCTAATACTTCAATCACTTCACTTCCAGAACCT 1247
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 GGAAGAACAGTAGCAGGCACTACAGACTCTAACACTTCAATCACTTCACTTCCAGAACCT 1171
Query 1248 CATGAAGATGAGATTCAATTTATACTGGACGCAATCAGCGACTATCTTAACATTAAGGTT 1307
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172 CATGAAGATGAGATTCAATTTATACTGGATGCAATCAGCGACTATCTTAACATTAAGGTT 1231
Query 1308 CGACGTACTGATGTTCTTTCGGCTTGGAGTGGGATCCGTCCATTGGCCATGGATCCAACA 1367
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1232 CGACGTACTGATGTTCTTTCGGCTTGGAGTGGTATCCGTCCGTTGGCCATGGATCCAACA 1291
Query 1368 GCCAAGAGCACAGAGAGTATCTCCAGAGACCACGTTGTCTTCGAGGAAAATCCTGGTCTG 1427
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292 GCCAAGAGCACAGAGAGTATCTCCAGAGACCATGTTGTCTTCGAGGAAAATCCTGGTCTG 1351
Query 1428 GTTACAATCACGGGTGGAAAGTGGACAACTTATCGAAGCATGGCGGAAGATGCAGTTGAT 1487
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352 GTTACAATCACGGGTGGAAAATGGACAACTTATCGAAGCATGGCGGAAGATGCAGTTGAT 1411
Query 1488 GCAGCAATCAAATCGGGACAACTTAAG-CCAACCAATGAATGTGTAACGCAGAAACTACA 1546
|||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412 GCAGCAATCAAATCGGGAAAACTT-AGTCCAACCAATGAATGTGTAACGCAGAAACTACA 1470
Query 1547 GCTTCTGGGTTCTTATGGATGGGAACCATCTTCCTTCACAACTCTTGCACAGCAATACGT 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 GCTTCTGGGTTCTTATGGATGGGAACCATCTTCCTTCACAACTCTTGCACAGCAATACGT 1530
Query 1607 GCGCATGAAGAAAACATACGGTGGTAAAGTGGTTCCTGGAGCAATGGACACAGCTGCTGC 1666
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531 GCGCATGAAGAAAACCTACGGTGGTAAAGTGGTTCCTGGAGCAATGGACACAGCTGCTGC 1590
Query 1667 AAAGCATTTGTCTCATGCCTATGGTTCAATGGCTGACCGAGTTGCCACCATAGCTCAGGA 1726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591 AAAGCATTTGTCTCATGCCTATGGTTCAATGGCTGACCGAGTTGCCACCATAGCTCAGGA 1650
Query 1727 GGAGGGTTTGGGGAAACGGTTGGCGCATGGGCATCCGTTTTTGGAAGCTGAGGTTGCTTA 1786
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1651 GGAGGGTTTGGGGAAACGGTTGGCGCACGGGCATCCGTTTTTGGAAGCCGAGGTTGCTTA 1710
Query 1787 CTGTGCAAGGCACGAGTACTGCGAATCAGCGGTTGATTTCATAGCAAGGAGATGTAGAAT 1846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711 CTGTGCAAGGCACGAGTACTGCGAATCAGCGGTTGATTTCATAGCAAGGAGATGTAGAAT 1770
Query 1847 CGCGTTCTTGGACACTGATGCAGCGGCTCGGGCGTTGCAGCGTGTGGTGGAGATTCTAGC 1906
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771 CGCGTTCTTGGACACTGATGCAGCGGCTCGGGCGTTACAGCGTGTGGTGGAGATTCTAGC 1830
Query 1907 AAGTGAACACAAATGGGACAAGTCGAGGCAGAAGCAAGAGTTGCAAAAGGCTAAAGAGTT 1966
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1831 AAGTGAACACAAGTGGGACAAGTCGAGGCAGAAGCAAGAGTTGCAAAAGGCTAAAGAGTT 1890
Query 1967 TCTTGAAACTTTCAAGTCGTCCAAAAACGCACAGTTTAACGATGGCAAGCACAACTAAAG 2026
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1891 TCTTGAAACTTTCAAGTCTTCCAAAAACGCACAGTTTAACGATGGCAAGCACAACTAAAG 1950
Query 2027 CGGCCTCTCAGAGatttacttacactattttattattgaatttatt-atttcctattttc 2085
|||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1951 CGGCCTCTCAGAAATTTACTTACACTACT--AT-ATTGAATTTATTTATTTC-TATTTTC 2006
Query 2086 caatttgttgaattttttgGGTAGC--T-A-C--T-AGCGAGAACGAATAATAA-AA--C 2135
||||||||| |||||| ||||||| | | | | |||||||||||||||||| || |
Sbjct 2007 AAATTTGTTGGATTTTT-GGGTAGCGATTAGCGATTAGCGAGAACGAATAATAATAATAC 2065
Query 2136 TGTACGGATGGAATAATAATACTGCGGCTACTCATGTTTCTCGGAT 2181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066 TGTACGGATGGAATAATAATACTGCGGCTACTCATGTTTCTCGGAT 2111
Score = 1683 bits (911), Expect = 0.0
Identities = 1006/1052 (96%), Gaps = 5/1052 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 41 TTCGCAATCATTTTCTTCTTCTTC-T-TTCCCATGATCGTCTCTCGCTTCCCAACGCAAT 98
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTCGCAATCATTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCATGATCG-C-CTCGCTTCCCAACGCAAT 58
Query 99 CTTCTTCACCCAATCTCTAAATCTCTCCTAAATTCCATGTCTCTCGCTTCCATTCGCCGT 158
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 59 CTTCTTCACCCAATCTCTGAATCTCTCCTCAATTCCATGTCTGTCGCTTCTATTCGCCGT 118
Query 159 TTAGCTGCCGGAGCTGCCGTAATTGCCGCTGCATCCGGTGGCGCTGTCTACCTGTCTCCG 218
||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 119 TTAGCCGCCGGAGCCGCTGTAATTGCCGCTGCATCCGGTGGCGCTGTCTATCTGTCTCCG 178
Query 219 TCGGTTGCCTCCAGCGACAAAGGAGGTGGTCCGATTCTAGATTCGTTGAGGCGTAGGCTT 278
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 179 TCGGTTGCCTCCAGCGACAAAGGAGGTGGTCCGATTCTAGATTCCTTGAGGCGTAGGATT 238
Query 279 GGTGATCCCACCGCTTCTGTACCGTCTCGATCTGCTCAAGAGTCTGCTCTGATTGCAGCC 338
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 239 GGTGATCCCACCGCTTCTGTGCCGTCTCGATCTGCTCAAGAGTCTTCTCTGATTGCAGCC 298
Query 339 ACCGCTTCTGATCCGCTCGATGTTCTCGTCATTGGCGGTGGAGCCACCGGTTCTGGAGTT 398
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 299 ACTGCTTCTGATCCGCTCGATGTTCTCGTCATTGGCGGTGGAGCCACTGGTTCTGGAGTC 358
Query 399 GCTCTTGACGCTGTTACACGTGGCCTCCGTGTTGGTTTGGTGGAGCGCGAGGATTTCTCC 458
||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 359 GCTCTCGACGCTGCTACACGTGGCCTCCGTGTTGGTTTGGTGGAGCGAGAGGATTTCTCC 418
Query 459 TCTGGGACTTCTTCGCGATCTACAAAGCTGATTCATGGAGGGGTTCGTTACTTGGAGAAA 518
|| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 TCCGGGACTTCTTCGCGATCAACGAAGCTGATTCATGGAGGGGTTCGTTACTTGGAGAAA 478
Query 519 GCTGTTTTCAATCTTGATTATGGACAGCTGAAGCTTGTATTTCACGCTCTTGAGGAGCGT 578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 479 GCTGTTTTCAATCTTGATTATGGACAGCTGAAGCTTGTATTTCACGCGCTTGAGGAGCGT 538
Query 579 AAACAGCTCATTGAGAATGCGCCACATCTCTGTCATGCTCTGCCCTGTATGACACCTTGT 638
||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 AAACAGCTCATCGAGAATGCACCACATCTCTGCCATGCTCTGCCCTGTATGACACCTTGT 598
Query 639 TTTGATTGGTTCGAAGTTATCTACTTCTGGATGGGGTTGAAGATGTATGACTTGGTTGCT 698
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 599 TTTGACTGGTTCGAAGTTATCTACTTCTGGATGGGTTTGAAAATGTATGATTTGGTCGCT 658
Query 699 GGACCACGGTTATTGCATCTGTCCAGATATTACTCTGCAAAAGAGTCTATTGAGCTCTTC 758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GGACCACGGTTATTGCATCTGTCCAGATATTACTCTGCAAAAGAGTCTATTGAGCTCTTC 718
Query 759 CCCACTCTTGCAAGGAAAGGGAAAGACAAGAATTTGAGGGGTACTGTTGTGTATTATGAC 818
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 CCCACTCTTGCAAGGAAAGGGAAAGACAAGAATTTGAGGGGTACTGTTGTGTATTATGAT 778
Query 819 GGGCAAATGAACGATTCACGTCTGAATGTGGGTTTGGCATGTACTGCCGCGTTAGCTGGT 878
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 GGGCAAATGAATGATTCACGTCTGAATGTGGGCTTGGCATGTACTGCCGCGTTAGCTGGT 838
Query 879 GCGGCAGTTCTCAACCATGCCGAGGTTGTCTCGCTTATTACTGATGATGCTACTAAGAGA 938
|| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 839 GCAGCCGTTCTCAACCATGCCGAGGTTGTCTCTCTTATTACAGATGATTCTACTAAGAGA 898
Query 939 ATAATTGGTGCCCGAATTCGTAACAATCTCACAGGCCAAGAATTTAACAGCTATGCAAAA 998
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 899 ATAATTGGTGCCCGAGTTCGTAACAATCTCACAGGCCAAGAATTTAACACCTATGCAAAA 958
Query 999 GTAGTTGTTAATGCGGCAGGACCGTTCTGTGATTCCATTAGGAAAATGATTGATGAAGAT 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 959 GTAGTTGTTAATGCGGCAGGACCGTTCTGTGATTCCATTAGAAAAATGATTGATGAAGAT 1018
Query 1059 AC-AAAACCAATGATTTGTCCAAGCAGCGGTG 1089
|| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 ACCAAAACCAATGATTTGTCCAAGCAGCGGTG 1050
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 85360239045
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5