BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G11130.1
Length=5785
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg478454 jgi|Araly1|478454|fgenesh2_kg.3__1155__AT3G11130.1 8813 0.0
Ahg928500 jgi|Araly1|928500|scaffold_300957.1 7295 0.0
Ahg338955 jgi|Araly1|338955|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001054 379 1e-103
> Ahg478454 jgi|Araly1|478454|fgenesh2_kg.3__1155__AT3G11130.1
Length=5388
Score = 8813 bits (4772), Expect = 0.0
Identities = 5025/5148 (98%), Gaps = 13/5148 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 215 TTCTCTCGCCGCGATCTGAGGTCAAACATGGCGGCTGCTAACGCGCCCATCATTATGAAG 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 147 TTCTCTCGCCGCGATCTGAGGTCAAACATGGCGGCGGCTAACGCGCCCATCATCATGAAG 206
Query 275 GAGGTCCTAACGCTTCCGAGCGTTGGGATCGGTCAACAGTTCATCACCTTTACAAATGTT 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 GAGGTCCTAACGCTTCCGAGCGTTGGGATCGGTCAACAGTTCATCACCTTTACAAATGTT 266
Query 335 ACTATGGAGTCTGATAAGTACATATGTGTACGAGAGACGGCACCGCAGAACAGTGTTGTA 394
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 267 ACTATGGAGTCTGATAAGTACATATGTGTACGAGAGACGGCACCACAAAACAGTGTTGTA 326
Query 395 ATTATCGATATGAATATGCCGATGCAGCCTTTAAGGAGGCCTATAACTGCTGATTCTGCT 454
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 327 ATTATCGATATGAATATGCCGATGCAGCCTCTAAGGAGACCTATAACTGCTGATTCTGCT 386
Query 455 CTTATGAACCCAAACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAG 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 387 CTTATGAACCCAAACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAG 446
Query 515 GATCATCTACAGATATTTAACATTGAAGCAAAGGCAAAGTTGAAGTCACATCAGATGCCT 574
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 GATCATCTACAGATATTTAACATCGAAGCAAAAGCAAAGTTGAAGTCACATCAGATGCCT 506
Query 575 GAGCAGGTTGCTTTTTGGAAGTGGATCACACCTAAGATGCTGGGACTGGTCACACAAACT 634
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 507 GAGCAGGTTGCTTTTTGGAAGTGGATCACACCAAAGATGCTGGGGCTGGTCACGCAAACT 566
Query 635 TCTGTGTATCATTGGTCAATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACG 694
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567 TCTGTGTATCATTGGTCGATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACG 626
Query 695 GCTAATTTGGCAAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTG 754
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 GCCAATTTGGCAAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTG 686
Query 755 GTCTTGATTGGAATTGCCCCTGGCTCTCCTGAGAGACCACAATTGGTGAAAGGAAATATG 814
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 687 GTCTTGATTGGAATTGCTCCTGGCTCTCCTGAGAGACCACAATTGGTAAAAGGAAATATG 746
Query 815 CAGCTTTTCTCTGTGGATCAACAGCGGAGCCAGGCCCTTGAAGCACATGCTGCATCTTTT 874
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||
Sbjct 747 CAGCTTTTCTCGGTGGATCAACAGCGGAGCCAGGCCCTTGAAGCGCATGCTGCGTCATTT 806
Query 875 GCTCAGTTTAAGGTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCGATTCTTATATCATTTGCAAGCAAG 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 807 GCTCAGTTTAAGGTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCCTTTGCAAGCAAG 866
Query 935 AGCTTTAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGCTGCATGTTATTGAACTTGGTGCCCAACCA 994
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 AGCTTTAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGTTGCACGTTATTGAACTTGGTGCCCAACC- 925
Query 995 GGG-AAACCATCATTTACAAAAAAGCAGGCAGATCTCTTTTTCCCCCCAGATTTTGCTGA 1053
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 926 GGGAAAACCATCATTTACAAAAAAGCAGGCAGATCTCTTTTTCCCCCCAGATTTTGCTGA 985
Query 1054 TGATTTTCCTGTGGCCATGCAGGTCTCTCACAAGTTTAACTTGATTTATGTCATCACCAA 1113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 986 TGATTTTCCTGTGGCCATGCAGGTCTCTCACAAGTTTAACTTGATTTATGTCATCACCAA 1045
Query 1114 GCTTGGCCTGCTGTTTGTATATGATCTAGAGACAGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGAT 1173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046 GCTTGGCCTGCTGTTTGTATATGATCTAGAGACAGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGAT 1105
Query 1174 AAGTCCGGACCCAATTTTCTTAACGTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCAT 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 AAGTCCGGACCCAATTTTCTTAACGTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCAT 1165
Query 1234 TAATAGGCGAGGACAAGTTCTTTTGGCAACAGTAAATGAGGCCACCATAATACCTTTTAT 1293
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 TAATAGGCGAGGACAAGTTCTTTTGGCAACCGTAAATGAGGCCACCATAATACCTTTTAT 1225
Query 1294 TAGTGGTCAATTGAACAATTTGGAACTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCC 1353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 TAGTGGTCAATTGAACAATTTGGAACTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCC 1285
Query 1354 TGGTGCAGAAAATCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAAGAGTTATTTGCTCAAACAAAGTACAA 1413
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286 TGGTGCAGAGAATCTGGTTGTCCAGAGGTTCCAAGAGTTATTTGCTCAAACAAAGTACAA 1345
Query 1414 GGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAGGGCATTCTACGGACACCTGATACGGT 1473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346 GGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAGGGCATTCTACGGACACCTGATACGGT 1405
Query 1474 GGCCAAATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCAGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTT 1533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 GGCCAAATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCAGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTT 1465
Query 1534 TGGGACCCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATTCATATGAGTCTTTGGAACTATCTCGGCT 1593
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 TGGGACCCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATACATATGAGTCTTTGGAACTATCTCGGCT 1525
Query 1594 TGTTGTGAATCAAAACAAAAAGAACCTCTTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAGTTAGA 1653
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1526 TGTTGTGAATCAAAACAAGAAGAACCTCTTGGAAAACTGGTTAGCCGAGGATAAGTTAGA 1585
Query 1654 ATGCAGTGAAGAACTCGGAGACCTTGTCAAAACTGTGGATAATGACCTTGCTCTAAAAAT 1713
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1586 ATGCAGTGAAGAACTCGGAGACCTTGTCAAGACTGTGGATAATGACCTTGCTCTAAAAAT 1645
Query 1714 ATACATCAAAGCTAGAGCTACTCCAAAAGTCGTTGCAGCTTTTGCAGAGCGAAGGGAGTT 1773
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1646 TTACATCAAAGCTAGAGCTACTCCAAAAGTCGTTGCAGCTTTTGCAGAGCGAAGGGAGTT 1705
Query 1774 TGACAAAATATTGATTTATTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACATGTTTCTTCT 1833
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1706 TGACAAAATACTGATTTATTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACATGTTTCTTCT 1765
Query 1834 GCAAACGATACTCCGTACGGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCTTTAATGATGTCCCA 1893
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 GCAAACGATACTTCGTACGGACCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCTTTAATGATGTCCCA 1825
Query 1894 AATGGAAGGAGGTTGTCCAGTTGACTACAACACTATCACTGATCTTTTCCTTCAGAGAAA 1953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1826 AATGGAAGGAGGTTGTCCAGTTGACTACAACACTATCACTGATCTTTTCCTTCAGAGAAA 1885
Query 1954 TCTGATCCGTGAAGCGACTGCTTTCCTTCTGGATGTTCTGAAGCCAAATTTACCCGAGCA 2013
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1886 TCTGATCCGTGAAGCCACTGCTTTCCTTCTGGATGTTCTGAAGCCAAACTTACCCGAGCA 1945
Query 2014 TGCTTTTCTGCAAACTAAGGTTTTGGAGATCAATTTGGTAACCTTTCCTAATGTGGCTGA 2073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1946 TGCTTTTCTGCAAACTAAGGTTTTGGAGATCAATTTGGTAACCTTTCCTAATGTGGCTGA 2005
Query 2074 TGCAATCTTAGCAAATGGGATGTTCAGCCATTATGACCGGCCTCGTGTTGCTCAGCTTTG 2133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2006 TGCAATCTTAGCAAATGGGATGTTCAGCCATTATGACAGGCCTCGTGTTGCTCAGCTTTG 2065
Query 2134 TGAAAAGGCTGGACTTTACATCCAATCTTTAAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATATCAA 2193
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066 TGAAAAGGCTGGACTTTACATCCAATCCTTAAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATATCAA 2125
Query 2194 ACGTGTAATTGTGAACACACATGCTATTGAGCCACAGGCTCTTGTCGAGTTTTTTGGTAC 2253
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2126 ACGTGTAATTGTTAACACACATGCTATTGAGCCACAGGCTCTTGTCGAGTTTTTCGGTAC 2185
Query 2254 TCTTTCTAGCGAGTGGGCAATGGAGTGCATGAAAGATCTCCTGTTGGTCAACCTGAGAGG 2313
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2186 TCTTTCTAGCGAGTGGGCTATGGAGTGCATGAAAGATCTCCTGTTGGTCAACCTGAGAGG 2245
Query 2314 CAACCTTCAGATAATCGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTGATGC 2373
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2246 CAACCTTCAGATAATCGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTCGATGC 2305
Query 2374 ATGCATTAAACTCTTTGAGCAATTCAAGTCGTACGAAGGGCTGTACTTTTTCCTAGGTTC 2433
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2306 ATGCATTAAACTCTTTGAGCAATTCAAGTCATACGAAGGGCTGTACTTTTTCCTAGGTTC 2365
Query 2434 ATACTTGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAGTACATCGAAGCAGCTGCCAA 2493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 ATACTTGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAGTACATCGAAGCAGCTGCCAA 2425
Query 2494 GACTGGTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTGACTAGAGAGTCTAACTTTTATGATGCGGA 2553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2426 GACTGGTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTGACTAGAGAGTCTAACTTTTATGATGCTGA 2485
Query 2554 AAAGACGAAGAACTTTTTAATGGAAGCTAAGCTTCCTGATGCCCGACCTTTGATTAATGT 2613
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2486 AAAGACGAAGAACTTTTTGATGGAAGCTAAGCTTCCTGATGCCCGACCTTTGATAAATGT 2545
Query 2614 CTGTGATCGTTTTGGCTTTGTACCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCT 2673
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2546 CTGCGATCGTTTTGGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCT 2605
Query 2674 GCGTTACATTGAAGGTTACGTTCAGAAGGTGAATCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTGGG 2733
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2606 GCGTTACATTGAAGGTTACGTTCAGAAGGTAAATCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTGGG 2665
Query 2734 GCAGTTGCTTGATGACGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTTTCTGTTCG 2793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2666 GCAGTTGCTTGATGACGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTTTCTGTTCG 2725
Query 2794 TTCATTACTTCCTGTTGAACCCCTTGTTGCA-GAATGTGAAAAGAGAAATCGACTCCGTC 2852
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2726 TTCATTACTTCCTGTTGAACCCCTTGTTG-ATGAATGTGAAAAGAGAAATCGACTCCGTC 2784
Query 2853 TCCTCACTCAGTTCTTGGAGCATCTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCCATA 2912
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2785 TCCTTACTCAGTTCTTGGAGCATCTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCCATA 2844
Query 2913 ATGCCTTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCCGAGCATTTCCTGACCACCA 2972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2845 ATGCCTTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCCGAGCATTTCCTGACCACCA 2904
Query 2973 ATCCTTACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCCACTCTGG 3032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2905 ATCCTTACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCCACTCTGG 2964
Query 3033 CTGTTGTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACCAACAAGA 3092
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2965 CCGTCGTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACCAACAAGA 3024
Query 3093 ACTCTTTGTTCAAGTTACAAGCCAGGTACGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGACCTCTGGG 3152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3025 ACTCTTTGTTCAAGTTACAAGCCAGGTACGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGACCTCTGGG 3084
Query 3153 AGAAGGTTCTTACGGAAGAAAATGAATATAGGAGGCAACTTATAGACCAAGTTGTGTCTA 3212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3085 AGAAGGTTCTTACGGAAGAAAATGAATATAGGAGGCAACTTATCGACCAAGTTGTGTCTA 3144
Query 3213 CTGCTTTACCAGAAAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGA 3272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3145 CTGCTTTACCAGAAAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGA 3204
Query 3273 CTGCTGATTTGCCACATGAGCTAATTGAGCTTCTGGAAAAAATTGTGCTTCAAAATTCTG 3332
|||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3205 CTGCTGATCTGCCGCATGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAAATTGTGCTTCAAAATTCTG 3264
Query 3333 CCTTCAGTGGAAATTTCAATCTGCAAAATCTACTTATACTGACAGCTATTAAGGCAGATC 3392
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3265 CCTTCAGTGGAAATTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATACTGACAGCTATTAAGGCAGATC 3324
Query 3393 CGTCCAGAGTTATGGATTACATTAACAGGCTGGATAATTTCGATGGTCCAGCTGTTGGAG 3452
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 3325 CGTCTAGAGTTATGGATTACATTAACAGGCTGGATAATTTTGATGGTCCAGCGGTTGGAG 3384
Query 3453 AAGTGGCAGTGGATGCTCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCGATTTTCAAGAAGTTTAACT 3512
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3385 AAGTGGCGGTTGATGCTCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCGATTTTCAAGAAGTTTAACT 3444
Query 3513 TAAATGTTCAGGCTGTCAACGTATTGTTGGATAACGTCAGAAGCATTGAACGTGCTGTTG 3572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3445 TAAATGTTCAGGCTGTCAACGTATTGTTGGATAACGTCAGAAGCATTGAGCGTGCTGTTG 3504
Query 3573 AGTTTGCTTTCCGGGTCGAAGAAGATGCTGTTTGGAGTCAAGTCGCTAAGGCACAGCTCA 3632
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3505 AGTTTGCTTTCCGGGTCGAAGAAGATGCTGTTTGGAGTCAAGTCGCTAAGGCTCAGCTCA 3564
Query 3633 GGGAAGGACTAGTCAGTGATGCTATTGAGTCCTTTATCCGAGCTGATGACACCACTCAGT 3692
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3565 GGGACGGACTAGTCAGTGATGCTATTGAGTCCTTTATCCGAGCTGATGATGCCACTCAGT 3624
Query 3693 TCTTGGAGGTCATCCGAGCCTCTGAAGATACTAATGTCTATGATGACTTGGTCAGATACC 3752
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3625 TCCTGGAGGTCATCCGCGCCTCTGAAGATACTAATGTCTATGATGACTTGGTCAGATACC 3684
Query 3753 TTCTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTGGATAGTGAGCTCATCTATGCTT 3812
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3685 TTTTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTGGATAGTGAGCTCATCTATGCTT 3744
Query 3813 ATGCAAAGATTGAAAGGTTGGGTGAGATTGAAGAATTTATTCTGATGCCCAACGTTGCCA 3872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3745 ATGCAAAGATTGAAAGGTTGGGTGAGATTGAAGAATTTATTCTGATGCCCAACGTTGCCA 3804
Query 3873 ACCTTCAACATGTTGGTGACCGTTTGTACGATGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAAAGATAA 3932
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3805 ACCTTCAAAATGTTGGTGACCGTTTGTATGATGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAAAGATAA 3864
Query 3933 TATATGCATTCATATCGAATTGGGCCAAGTTAGCCGTCACCCTTGTGAAGTTGCAACAGT 3992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3865 TATATGCATTCATATCGAATTGGGCCAAGTTAGCCGTCACCCTTGTGAAGTTGCAACAGT 3924
Query 3993 TCCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCT 4052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3925 TCCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCT 3984
Query 4053 GCTTTGCTTGTGTTGATGCTGAGGAATTCCGACTGGCTCAAATCTGTGGACTTAACATTA 4112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3985 GCTTTGCTTGTGTTGATGCTGAGGAATTCCGACTGGCCCAAATCTGTGGACTTAACATTA 4044
Query 4113 TCATACAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTAAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGATGCTTCA 4172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4045 TCATACAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTAAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGATGCTTCA 4104
Query 4173 ATGAATTGATCTCCCTTATGGAGAGTGGACTTGGTCTGGAACGTGCTCACATGGGTATCT 4232
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4105 ATGAATTGATCTCACTTATGGAGAGTGGACTTGGTCTGGAACGTGCTCACATGGGGATCT 4164
Query 4233 TCACCGAGTTAGGAGTACTGTACGCCAGATATCGTTATGAGAAGCTTATGGAACACATCA 4292
|||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4165 TCACCGAGTTGGGTGTACTGTACGCTAGATATCGTTATGAGAAGCTTATGGAACACATCA 4224
Query 4293 AGTTGTTCTCTACTCGACTCAATATTCCCAAGCTTATCCGGGCCTGTGATGAACAACAGC 4352
|||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4225 AGTTGTTCTCGACGCGGCTCAATATTCCCAAGCTTATCCGGGCCTGTGATGAACAACAGC 4284
Query 4353 ATTGGCAGGAACTTACCTATCTTTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCAACCA 4412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4285 ATTGGCAGGAACTTACCTATCTTTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCAACCA 4344
Query 4413 CTGTTATGAATCATTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCA 4472
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4345 CTGTCATGAATCATTCTCCTGAAGCATGGGAACACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCA 4404
Query 4473 AGGTTGCGAATGTTGAGCTTTACTATAAGGCCGTTCACTTCTACTTGCAAGAGCACCCTG 4532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4405 AGGTTGCGAATGTTGAGCTTTACTATAAGGCCGTTCACTTCTACTTGCAAGAGCACCCTG 4464
Query 4533 ATATAATCAACGATCTTCTCAATGTGCTTGCTCTGCGGTTAGATCACACGCGTGTCGTTG 4592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4465 ATATAATCAACGATCTTCTCAATGTGCTTGCTCTGCGGTTAGATCACACTCGTGTCGTTG 4524
Query 4593 ATATTATGCGCAAGGCTGGTCACTTGCGCCTTATTAAGCCATATATGGTTGCAGTTCAGA 4652
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4525 ATATTATGCGCAAGGCTGGTCACTTGCGCCTTATCAAGCCATACATGGTTGCAGTTCAGA 4584
Query 4653 GCAATAATGTATCTGCTGTAAATGAAGCTCTGAATGAGATATATGCAGAAGAAGAAGACT 4712
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4585 GCAATAATGTCTCTGCTGTAAATGAAGCTCTGAATGAGATATATGTAGAAGAAGAAGACT 4644
Query 4713 ATGACAGGTTGCGCGAGTCTATTGATTTGCATGACAGTTTTGACCAGATAGGTCTCGCTC 4772
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4645 ATGACAGGTTGCGCGAGTCTATTGATTTGCATGACAGTTTTGACCAGATAGGTCTCGCCC 4704
Query 4773 AGAAGATTGAGAAACACGAGCTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATCTATAAGA 4832
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4705 AGAAGATTGAGAAACACGAGCTTGTTGAAATGAGGCGTGTGGCTGCTTATATCTACAAGA 4764
Query 4833 AAGCTGGTAGATGGAAGCAATCGATTGCTTTGTCAAAGAAAGATAACATGTACAAGGACT 4892
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4765 AAGCTGGTAGATGGAAGCAATCGATTGCTTTATCAAAGAAAGATAACATGTACAAGGACT 4824
Query 4893 GTATGGAAACTGCTTCGCAATCCGGCGACCATGATCTTGCAGAACAACTTCTCGTCTACT 4952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4825 GTATGGAAACTGCTTCGCAATCCGGCGACCATGATCTTGCAGAACAACTTCTCGTCTACT 4884
Query 4953 TCATTGAACAGGGGAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTCTGTTATGACTTAA 5012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4885 TCATTGAACAGGGGAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTCTGTTATGACTTAA 4944
Query 5013 TCCGACCAGACGTTGCTCTAGAACTTGCTTGGATCAACAATATGATCGACTTTGCCTTCC 5072
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4945 TCCGACCAGACGTTGCTCTAGAACTTGCTTGGATCAACAATATGATAGACTTTGCCTTCC 5004
Query 5073 CGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCCGGCAAAGTGGATGAGCTAATCAAGGACA 5132
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5005 CGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCTGGCAAAGTGGATGAGCTAATCAAGGACA 5064
Query 5133 AGCTGGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAACAGGAAGAGAAGGATGTCATGTCAC 5192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5065 AGCTGGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAACAGGAAGAGAAGGATGTCATGTCCC 5124
Query 5193 AACAGAACATGTACGCCCAATTATTACCACTGGCTCTACCCGCACCACCGATGCCAGGAA 5252
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||
Sbjct 5125 AACAGAACATGTACGCCCAATTATTGCCATTGGCTCTACCTGCCCCTCCGATGCCAGGAA 5184
Query 5253 TGGGAGGTGGCGGGTATGGTCCACCACCACAAATGGGTGGAATGCCAGGAATGTCAGGAA 5312
|||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 5185 TGGGAGGTGGTGGGTATGGTCCGCCACCACCAATGGGCGGAATGCCAGGAATG-C----- 5238
Query 5313 TGCCTCCAATGCCTCCATATGGAATGCCACCGATGGGCGGCTACTAAG 5360
| ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 5239 --C-TCCAATGCCACCGTATGGAATGCCTCCAATGGGCGGCTACTAAG 5283
Score = 241 bits (130), Expect = 5e-62
Identities = 150/159 (94%), Gaps = 4/159 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTCCTTATATTCGACGAGTGACTCCGATTGGATCGCTATTTCGTCATTTCTCACTTTC 60
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCCCCTTATATTCGACGAGTGACTCCGATTGGATCGCTGTTTCGTCATTTCTCACTTTC 60
Query 61 CaaaaagaaaaaaaCGAATCTCTCTCCACCATCATCACCTTTCTCCTTCACTTGCCTCAG 120
||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TAAA--GAAAAA--CGAATCTCTCTCCACCATCATTACCTTTCTCCTTCACTTGCCTCAG 116
Query 121 ATCTGGCTGCGATTTCAAATCTTCCTTAGTTTCTCTCGC 159
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 117 ATCTGGCTGCGATTTCAAATCTTCTTTAGTTTCTCTCGC 155
> Ahg928500 jgi|Araly1|928500|scaffold_300957.1
Length=5152
Score = 7295 bits (3950), Expect = 0.0
Identities = 4755/5150 (92%), Gaps = 30/5150 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 222 GCCGCGATCTGAGGTCAAACATGGCGGCTGCTAACGCGCCCATCATTATGAAGGAGGTCC 281
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 1 GCCGCGATCTGAGGTCAAACATGGCTGCTGCCAACGCCCCCATCACGATGAAGGAGGTCC 60
Query 282 TAACGCTTCCGAGCGTTGGGATCGGTCAACAGTTCATCACCTTTACAAATGTTACTATGG 341
| |||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 61 TGACGCTTCCGAGCGTCGGGATCAATCAGCAATTCATCACGTTTACAAATGTTACTATGG 120
Query 342 AGTCTGATAAGTACATATGTGTACGAGAGACGGCACCGCAGAACAGTGTTGTAATTATCG 401
||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 121 AGTCTGACAAGTACATCTGTGTACGAGAGACGTCACCGCAAAACAGTGTTGTAATTATAG 180
Query 402 ATATGAATATGCCGATGCAGCCTTTAAGGAGGCCTATAACTGCTGATTCTGCTCTTATGA 461
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 181 ATATGAATATGCCGATGCAGCCTCTAAGGAGACCTATTACTGCAGATTCTGCTCTTATGA 240
Query 462 ACCCAAACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAGGATCATC 521
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 241 ACCCAAACTCGAGGATCCTTGCCTTAAAAGCTCAAGTTCCAGGAACTACTCAAGATCATC 300
Query 522 TACAGATATTTAACATTGAAGCAAAGGCAAAGTTGAAGTCACATCAGATGCCTGAGCAGG 581
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 301 TACAGATATTTAACATTGAAGCAAAAGCAAAGTTGAAATCTCATCAGATGCCTGAGCAGG 360
Query 582 TTGCT-TTTTGGAAGTGGATCACACCTAAGATGCTGGGACTGGTCACACA-AACTTCTGT 639
||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||| ||
Sbjct 361 TTG-TCTTTTGGAAGTGGATTACACCAAAGATGTTGGGGCTGGTCACACAGAA-TTCCGT 418
Query 640 GTATCATTGGTCAATTGAAGGTGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACGGCTAA 699
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 419 CTATCATTGGTCAATTGAAGGCGATTCTGAGCCAGTTAAGATGTTTGATAGAACAGCCAA 478
Query 700 TTTGGCAAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTGGTCTT 759
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 479 TTTGACCAACAATCAAATTATAAACTATAAGTGCTCTCCTAATGAGAAGTGGTTGGTTTT 538
Query 760 GATTGGAATTGCCCCTGGCTCTCCTGAGAGACCACAATTGGTGAAAGGAAATATGCAGCT 819
||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 539 AATTGGAATTGCTCCTGGCTCCCCTGAGAGACAACAATTGGTTAAAGGAAATATGCAGCT 598
Query 820 TTTCTCTGTGGATCAACAGCGGAGCCAGGCCCTTGAAGCACATGCTGCATCTTTTGCTCA 879
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 599 TTTCTCTGTGGATCAACAGCGGAGTCAGGCCCTTGAGGCACATGCTGCATCGTTTGCGCA 658
Query 880 GTTTAAGGTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCGATTCTTATATCATTTGCAAGCAAGAGCTT 939
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GTTTAAGGTCCCTGGGAATGAGAATCCTTCTATTCTTATATCATTTGCAAGCAAGAGCTT 718
Query 940 TAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGCTGCATGTTATTGAACTTGGTGCCCAACCAGGGAA 999
||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 719 TAATGCTGGGCAGATAACATCAAAGTTGCATGTCATTGAGCTTGGTGCCCAACCTGGAAA 778
Query 1000 ACCATCATTTACAAAAAAGCAGGCAGATCTCTTTTTCCCCCCAGATTTTGCTGATGATTT 1059
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 779 ACCATCATTTACAAAAAAGCAAGCAGATCTCTTTTTCCCACCTGATTTTGCTGATGATTT 838
Query 1060 TCCTGTGGCCATGCAGGTCTCTCACAAGTTTAACTTGATTTATGTCATCACCAAGCTTGG 1119
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 839 TCCTGTTGCCATGCAGGTCTCTCACAAATTTAACTTGATATATGTTATCACCAAACTTGG 898
Query 1120 CCTGCTGTTTGTATATGATCTAGAGACAGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGATAAGTCC 1179
|||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 899 CCTGTTGTTTGTGTACGATCTAGAGACTGCTTCTGCTATCTACAGAAATCGGATTAGTCC 958
Query 1180 GGACCCAATTTTCTTAACGTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCATTAATAG 1239
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 AGACCCAATTTTCTTGACTTCTGAAGCTTCCTCAGTTGGGGGTTTCTATGCCATTAATAG 1018
Query 1240 GCGAGGACAAGTTCTTTTGGCAACAGTAAATGAGGCCACCATAATACCTTTTATTAGTGG 1299
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1019 GCGAGGACAAGTTCTTTTGGCTACAGTAAACGAGGCTACCATTATACCTTTTATTAGTGG 1078
Query 1300 TCAATTGAACAATTTGGAACTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCCTGGTGC 1359
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1079 CCAATTGAACAATTTGGAGCTTGCTGTCAATCTTGCTAAAAGAGGAAACCTCCCAGGTGC 1138
Query 1360 AGAAAATCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAAGAGTTATTTGCTCAAACAAAGTACAAGGAGGC 1419
||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 AGAAAATCTGGTTGTCCAGCGGTTCCAGGAGTTGTTCGCTCAAACAAAGTACAAGGAGGC 1198
Query 1420 TGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAGGGCATTCTACGGACACCTGATACGGTGGCCAA 1479
||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1199 TGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTCAAGGAATTCTAAGGACACCTGATACAGTGGCCAA 1258
Query 1480 ATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCAGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTTTGGGAC 1539
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCTGGGCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTTTGGGAC 1318
Query 1540 CCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATTCATATGAGTCTTTGGAACTATCTCGGCTTGTTGT 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 1319 TCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATTCATATGAGTCACTGGAACTATCTCGGCTGGTTGT 1378
Query 1600 GAATCAAAACAAAAAGAACCTCTTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAGTTAGAATGCAG 1659
||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1379 GAACCAAAACAAGAAGAACCTCCTGGAAAACTGGTTGGCAGAGGATAAGCTAGAATGCAG 1438
Query 1660 TGAAGAACTCGGAGACCTTGTCAAAACTGTGGATAATGACCTTGCTCTAAAAATATACAT 1719
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1439 TGAAGAACTTGGAGACCTTGTCAAGACTGTGGATAATGATCTTGCTCTGAAAATATACAT 1498
Query 1720 CAAAGCTA-GAGCTACTCCAAAAGTCGTTGCAGCTTTTGCAGAGCGAAGGGAGTTTGACA 1778
|||||| | | || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1499 CAAAGC-ACGGGCGACTCCAAAAGTTGTAGCAGCTTTTGCAGAAAGAAGGGAGTTTGACA 1557
Query 1779 AAATATTGATTTATTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACATGTTTCTTCTGCAAA 1838
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1558 AAATATTGATTTACTCAAAGCAGGTTGGGTACACACCTGATTACCTGTTTCTTCTGCAAA 1617
Query 1839 CGATACTCCGTACGGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCTTTAATGATGTCCCAAATGG 1898
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1618 CCATACTCCGTACAGATCCTCAGGGAGCAGTAAATTTTGCATTAATGATGTCTCAAATGG 1677
Query 1899 AAGGAGGTTGTCCAGTTGACTACAACACTATCACTGATCTTTTCCTTCAGAGAAATCTGA 1958
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1678 AAGGAGGTTCTCCAGTTGACTACAACACCATCACTGATCTTTTTCTTCAGAGAAATCTGA 1737
Query 1959 TCCGTGAAGCGACTGCTTTCCTTCTGGATGTTCTGAAGCCAAATTTACCCGAGCATGCTT 2018
| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1738 TTCGTGAAGCGACTTCTTTCCTTCTGGATGTGCTAAAGCCAAATTTACCTGAGCATGCTT 1797
Query 2019 TTCTGCAAACTAAGGTTTTGGAGATCAATTTGGTAACCTTTCCTAATGTGGCTGATGCAA 2078
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 TTCTGCAAACTAAGGTTCTGGAGATCAATTTGGTAACTTTTCCTAATGTGGCTGATGCGG 1857
Query 2079 TCTTAGCAAATGGGATGTTCAGCCATTATGACCGGCCTCGTGTTGCTCAGCTTTGTGAAA 2138
| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 1858 TATTAGCAAATGGGATGTTCACCCACTATGACCGGCCTCGCATTGCTCAACTTTGTGAAA 1917
Query 2139 AGGCTGGACTTTACATCCAATCTTTAAAGCATTACTCAGAGTTACCTGATATCAAACGTG 2198
||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1918 AGGCTGGACTTTATATCCAATCCTTGAAGCATTACTCAGAGTTGCCTGATATAAAACGTG 1977
Query 2199 TAATTGTGAACACACATGCTATTGAGCCACAGGCTCTTGTCGAGTTTTTTGGTACTCTTT 2258
| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1978 TGATTGTAAACACACATGCTATCGAGCCACAGGCTCTTGTTGAGTTTTTTGGCACTCTTT 2037
Query 2259 CTAGCGAGTGGGCAATGGAGTGCATGAAAGATCTCCTGTTGGTCAACCTGAGAGGCAACC 2318
||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |
Sbjct 2038 CTAGCGAGTGGGCTATGGAGTGCATGAAGGATCTGTTGCTGGTCAACCTGAGAGGCAATC 2097
Query 2319 TTCAGATAATCGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTGATGCATGCA 2378
| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2098 TGCAGATAATTGTTCAGGCTTGCAAGGAGTACTGTGAGCAACTTGGTGTTGATGCATGTA 2157
Query 2379 TTAAACTCTTTGAGCAATTCAAGTCGTACGAAGGGCTGTACTTTTTCCTAGGTTCATACT 2438
|||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2158 TTAAGCTCTTTGAGCAGTTCAAGTCATACGAAGGGCTATACTTTTTCCTAGGTTCATATT 2217
Query 2439 TGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAGTACATCGAAGCAGCTGCCAAGACTG 2498
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2218 TGAGTATGAGTGAGGATCCTGAGATTCACTTCAAATACATTGAAGCAGCTGCCAAGACTG 2277
Query 2499 GTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTGACTAGAGAGTCTAACTTTTATGATGCGGAAAAGA 2558
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2278 GTCAAATAAAGGAGGTTGAGCGTGTAACTAGAGAGTCTAACTTCTATGATGCTGAAAAGA 2337
Query 2559 CGAAGAACTTTTTAATGGAAGCTAAGCTTCCTGATGCCCGACCTTTGATTAATGTCTGTG 2618
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2338 CGAAGAACTTTTTGATGGAAGCTAAGCTGCCTGATGCACGACCTTTGATAAATGTCTGCG 2397
Query 2619 ATCGTTTTGGCTTTGTACCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCTGCGTT 2678
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2398 ATCGTTTTGGCTTTGTGCCTGATCTTACTCATTACCTCTACACAAACAACATGCTTCGTT 2457
Query 2679 ACATTGAAGGTTACGTTCAGAAGGTGAATCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTGGGGCAGT 2738
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2458 ACATTGAAGGTTACGTACAGAAGGTGAACCCTGGGAATGCTCCCTTAGTTGTCGGGCAGT 2517
Query 2739 TGCTTGATGACGAATGCCCTGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTTTCTGTTCGTTCAT 2798
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2518 TGCTTGATGATGAATGCCCCGAAGATTTTATAAAAGGCCTCATTCTGTCTGTTCGTTCAT 2577
Query 2799 TACTTCCTGTTGAACCCCTTGTTGCA-GAATGTGAAAAGAGAAATCGACTCCGTCTCCTC 2857
| |||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578 TGCTTCCTGTTGAACCACTTGTCG-AGGAATGTGAGAAGAGAAATCGACTCCGTCTCCTC 2636
Query 2858 ACTCAGTTCTTGGAGCATCTAGTTAGTGAGGGAAGCCAAGATGTGCATGTCCATAATGCC 2917
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2637 ACTCAGTTCTTGGAGCATTTAGTTAGTGAGGGAAGCCAGGATGTGCATGTCCATAATGCC 2696
Query 2918 TTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCCGAGCATTTCCTGACCACCAATCCT 2977
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2697 TTGGGTAAAATTATCATAGACAGTAACAACAACCCTGAGCATTTCCTGACCACCAACCCT 2756
Query 2978 TACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCCACTCTGGCTGTT 3037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 2757 TACTACGACTCTAAGGTTGTGGGTAAGTACTGCGAGAAACGTGATCCTACCCTGGCGGTT 2816
Query 3038 GTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGACGAGGAACTCATCAATGTCACCAACAAGAACTCT 3097
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2817 GTGGCATACAGAAGAGGACAATGTGATGAGGAACTCATCAATGTCACTAACAAAAACTCT 2876
Query 3098 TTGTTCAAGTTACAAGCCAGGTACGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGACCTCTGGGAGAAG 3157
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 2877 TTGTTCAAGTTACAAGCCAGGTATGTAGTGGAGAGGATGGATGGTGATCTGTGGGATAAG 2936
Query 3158 GTTCTTACG--GAAGAA-AATGAATATAGGAGGCAACTTATAGACCAAGTTGTGTCTACT 3214
|||| | || ||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2937 GTTC-T-CGATGAA-AACAATGATTATAGAAGACAGCTTATTGACCAAGTTGTTTCTACT 2993
Query 3215 GCTTTACCAGAAAGCAAGAGCCCAGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGACT 3274
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2994 GCTTTACCTGAAAGCAAGAGCCCGGAGCAAGTTTCTGCAGCTGTTAAAGCATTCATGACT 3053
Query 3275 GCTGATTTGCCACATGAGCTAATTGAGCTTCTGGAAAAAATTGTGCTTCAAAATTCTGCC 3334
||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3054 GCTGATTTGCCGCACGAGCTTATTGAGCTTCTTGAAAAGATTGTTCTTCAAAATTCTGCT 3113
Query 3335 TTCAGTGGAAATTTCAATCTGCAAAATCTACTTATACTGACAGCTATTAAGGCAGATCCG 3394
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3114 TTCAGTGGAAACTTCAATCTGCAAAATCTGCTTATATTGACAGCTATTAAGGCAGATCCA 3173
Query 3395 TCCAGAGTTATGGATTACATTAACAGGCTGGATAA-TTTCGATGGTCCAGCTGTTGGAGA 3453
|| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || || ||||||||
Sbjct 3174 TCTAGAGTTATGGATTACATTAACAGGCTGGACAACTTT-GATGGACCTGCGGTTGGAGA 3232
Query 3454 AGTGGCAGTGGATGCTCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCGATTTTCAAGAAGTTTAACTT 3513
||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||
Sbjct 3233 AGTCGCAGTTGAAGCCCAATTGTATGAGGAAGCATTTGCTATCTTCAAGAAGTTCAACTT 3292
Query 3514 AAATGTTCAGGCTGTCAACGTATTGTTGGATAACGTCAGAAGCATTGAACGTGCTGTTGA 3573
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3293 AAATGTTCAGGCTGTCAATGTATTGCTGGATAACGTCAGAAGCATTGAGCGTGCAGTTGA 3352
Query 3574 GTTTGCTTTCCGGGTCGAAGAAGATGCTGTTTGGAGTCAAGTCGCTAAGGCACAGCTCAG 3633
|||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||
Sbjct 3353 GTTTGCATTCCGGGTCGAAGAAGATTCTGTTTGGAGCCAAGTTGCTAAGGCGCAACTCAG 3412
Query 3634 GGAAGGACTAGTCAGTGATGCTATTGAGTCCTTTATCCGAGCTGATGACACCACTCAGTT 3693
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||
Sbjct 3413 AGAAGGATTAGTCAGTGATGCAATTGAGTCCTTTATCCGTGCTGATGATGCCACTCATTT 3472
Query 3694 CTTGGAGGTCATCCGAGCCTCTGAAGATACTAATGTCTATGATGACTTGGTCAGATACCT 3753
|||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3473 CTTGGAAGTCATACGTGTCTCTGAAGATACTGATGTCTATGATGACTTGGTCAAATACCT 3532
Query 3754 TCTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTGGATAGTGAGCTCATCTATGCTTA 3813
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3533 TCTGATGGTTAGACAGAAGGTGAAGGAACCCAAGGTTGATAGTGAGCTCATCTATGCATA 3592
Query 3814 TGCAAAGATTGAAAGGTTGGGTGAGATTGAAGAATTTATTCTGATGCCCAACGTTGCCAA 3873
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 3593 TGCAAAGATTGATAGGTTAGGTGAGATTGAAGAATTCATTCTGATGCCAAACGTTGCTAA 3652
Query 3874 CCTTCAACATGTTGGTGACCGTTTGTACGATGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAAAGATAAT 3933
|| ||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3653 TCTACAAAATGTTGGTGATCGTCTGTATGACGAAGCTCTGTATGAGGCTGCAAAAATAAT 3712
Query 3934 ATATGCATTCATATCGAATTGGGCCAAGTTAGCCGTCACCCTTGTGAAGTTGCAACAGTT 3993
||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3713 CTATGCGTTCATATCAAACTGGGGCAAGTTAGCCGTCACACTTGTGAAGTTGCAACAGTT 3772
Query 3994 CCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCTG 4053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3773 CCAAGGTGCTGTTGATGCTGCAAGGAAAGCAAACAGTGCAAAGACATGGAAGGAAGTCTG 3832
Query 4054 CTTTGCTTGTGTTGATGCTGAGGAATTCCGACTGGCTCAAATCTGTGGACTTAACATTAT 4113
||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3833 CTTTGCTTGCGTTGATGCAGAGGAATTCCGGTTGGCTCAAATATGTGGTCTTAACATTAT 3892
Query 4114 CATACAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTAAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGATGCTTCAA 4173
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3893 CATTCAGGTGGATGACCTGGAAGAAGTCAGCGAGTACTACCAGAACAGAGGGTGCTTCAA 3952
Query 4174 TGAATTGATCTCCCTTATGGAGAGTGGACTTGGTCTGGAACGTGCTCACATGGGTATCTT 4233
|||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3953 TGAATTAATCTCACTTATGGAGAGTGGACTTGGGCTTGAACGTGCTCACATGGGTATCTT 4012
Query 4234 CACCGAGTTAGGAGTACTGTACGCCAGATATCGTTATGAGAAGCTTATGGAACACATCAA 4293
||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4013 CACCGAGTTGGGTGTACTGTATGCTAGATATCGTTATGAGAAACTTATGGAACACATCAA 4072
Query 4294 GTTGTTCTCTACTCGACTCAATATTCCCAAGCTTATCCGGGCCTGTGATGAACAACAGCA 4353
||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4073 GTTATTTTCAACTCGCCTCAATATTCCCAAGCTTATACGGGCCTGTGATGAACAACAGCA 4132
Query 4354 TTGGCAGGAACTTACCTATCTTTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCAACCAC 4413
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4133 CTGGCAGGAACTTACTTATCTGTACATTCAATATGATGAGTTTGATAATGCTGCGACCAC 4192
Query 4414 TGTTATGAATCATTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCAA 4473
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4193 CGTCATGAACCATTCTCCTGAAGCATGGGAGCACATGCAATTCAAAGACATTGTTGCCAA 4252
Query 4474 GGTTGCGAATGTTGAGCTTTACTATAAGGCCGTTCACTTCTACTTGCAAGAGCACCCTGA 4533
||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4253 GGTAGCGAATGTTGAACTGTACTACAAGGCTGTGCACTTCTACTTGCAAGAGCATCCTGA 4312
Query 4534 TATAATCAACGATCTTCTCAATGTGCTTGC-TCTGCGGTTAGATCACACGCGTGTCGTTG 4592
| ||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||| || || ||||| ||||
Sbjct 4313 TCTAATCAATGATCTTCTCAACGTGCTTGCGT-TGCGGTTAGACCATACTCGTGTTGTTG 4371
Query 4593 ATATTATGCGCAAGGCTGGTCACTTGCGCCTTATTAAGCCATATATGGTTGCAGTTCAGA 4652
|||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 4372 ATATAATGCGAAAGGCTGGTCACTTGCGTCTTATCAAGCCATACATGATTGCAGTTCAGA 4431
Query 4653 GCAATAATGTATCTGCTGTAAATGAAGCTCTGAATGAGATATATGCAGAAGAAGAAGACT 4712
|||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 4432 GCAACAATGTCTCTGCTGTTAATGAGGCTCTGAATGAGATATACGTGGAAGAAGAAGACT 4491
Query 4713 ATGACAGGTTGCGCGAGTCTATTGATTTGCATGACAGTTTTGACCAGATAGGTCTCGCTC 4772
|||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||
Sbjct 4492 ATGATAGGTTGCGAGAGTCTATTGATTTACATGACAGCTTTGACCAGATTGGCCTCGCTC 4551
Query 4773 AGAAGATTGAGAAACACGAGCTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATCTATAAGA 4832
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4552 AGAAGATCGAGAAACACGAGCTTGTTGAAATGAGACGTGTGGCTGCTTATATCTACAAGA 4611
Query 4833 AAGCTGGTAGATGGAAGCAATCGATTGCTTTGTCAAAGAAAGATAACATGTACAAGGACT 4892
|||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4612 AAGCGGGCAGATGGAAGCAATCAATTGCATTATCAAAGAAAGACAACATGTACAAGGACT 4671
Query 4893 GTATGGAAACTGCTTCGCAATCCGGCGACCATGATCTTGCAGAACAACTTCTCGTCTACT 4952
|||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||
Sbjct 4672 GTATGGAAACTGCTTCACAATCCGGTGAACATGAACTTGCAGAACAACTACTGGTGTACT 4731
Query 4953 TCATTGAACAGGGGAAAAAGGAATGCTTTGCTACATGTCTCTTTGTCTGTTATGACTTAA 5012
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 4732 TCATTGAACAGGGCAAAAAGGAATGCTTTGCTACGTGTCTATTTGTATGTTATGACTTAA 4791
Query 5013 TCCGACCAGACGTTGCTCTAGAACTTGCTTGGATCAACAATATGATCGACTTTGCCTTCC 5072
||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4792 TCCGACCAGACGTGGCTCTTGAACTTGCGTGGATCAACAATATGATGGACTTTGCCTTCC 4851
Query 5073 CGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCCGGCAAAGTGGATGAGCTAATCAAGGACA 5132
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 4852 CGTATCTCCTCCAGTTTATCCGAGAATACTCTGGCAAAGTGGATGAGTTAATAAAGGACA 4911
Query 5133 AGCTGGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCCAAAGAACAGGAAGAGAAGGATGTCATGTCAC 5192
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 4912 AGCTGGAGGCACAAAAAGAGGTGAAGGCTAAAGAGCAGGAAGAGAAGGATGTTATGTCCC 4971
Query 5193 AACAGAACATGTACGCCCAATTATTACCACTGGCTCTACCCGCACCACCGATGCCAGGAA 5252
|||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4972 AACAGAACATGTACGCCCAACTATTGCCACTTGCTTTACCTGCACCACCGATGCCAGGAA 5031
Query 5253 TGGGAGGTGGCGG-G--TATGGTCCACCACCACAAATGGGTGGAATGCCAGGAATGTCAG 5309
|||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |
Sbjct 5032 TGGGAGGTGGTGGTGGGTATGGTCCGCCACCACAAATGGGCGGTATGCCAGGAATGCC-- 5089
Query 5310 GAATGCCTCCAATGCCTCCATATGGAATGCCACCGATGGGCGGCTACTAA 5359
| || | | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5090 ---T-CC-C-A-TGCCACCATATGGAATGCCACCGATGGGTGGCTACTAA 5132
> Ahg338955 jgi|Araly1|338955|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001054
Length=993
Score = 379 bits (205), Expect = 1e-103
Identities = 313/365 (86%), Gaps = 8/365 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1388 GAGTTATTTGCTCAAACAAAGTACAAGGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGAATCTCCTC-A 1446
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 76 GAGTTATTTGCTCAAACCAAGTACAAGGAGGCTGCTGAGCTTGCTGCTGACTCTCCTCGA 135
Query 1447 GGGCATTCTACGGACACCTGATACGGTGGCCAAATTCCAGAGTGTTCCTGTACAAGCAGG 1506
|| |||||| |||||||||||||| | |||||||| | || ||||| ||||||||| ||
Sbjct 136 GG-CATTCTCCGGACACCTGATACAATTGCCAAATTTCGGAATGTTCATGTACAAGCTGG 194
Query 1507 GCAAACTCCTCCATTGTTACAGTATTTTGGGACCCTTTTGACTAGAGGGAAGCTCAATTC 1566
|||| || |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| | ||| ||||||||| |
Sbjct 195 ACAAAATCATCCATTGTTACAATATTTTGCGACTCTATTGACAAAAGGAAAGCTCAATGC 254
Query 1567 ATATGAGTCTTTGGAACTATCT-CGGCTTGTTGTGAATCAAAACAAAAAGAACCTCTTGG 1625
|| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 255 ATTTGAATCATTGGAACTATCTTCG-CTTGTTGTGAATCAAGGCAAGAAGAACCTCTTGG 313
Query 1626 AAAACTGGTTGGCAGAGGATAAGTTAGAATGCAGTGAAGAACTCGGAGACCTTGTCAAAA 1685
||||||||||||| || || ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||| || |
Sbjct 314 AAAACTGGTTGGCGGATGACAAGTTGGAATGTACCGAAGAACTTGGAGACCTTGTTAAGA 373
Query 1686 CTGTGGATAATGACCTTGCTCTAAAAATATACA-TCAAAGCTAG-AGCTACTCCAAAAGT 1743
||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||| | | | || ||||||||
Sbjct 374 CTGTGGATAATGATCTTGCTCTTAAAATATACACT-AAAGCTCGGACC-ACCCCAAAAGT 431
Query 1744 CGTTG 1748
| |||
Sbjct 432 CATTG 436
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 219135505334
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5