BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G11670.1
Length=2687
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg928882 jgi|Araly1|928882|scaffold_301339.1 3984 0.0
Ahg918607 jgi|Araly1|918607|Al_scaffold_0222_2 3112 0.0
> Ahg928882 jgi|Araly1|928882|scaffold_301339.1
Length=2470
Score = 3984 bits (2157), Expect = 0.0
Identities = 2363/2466 (96%), Gaps = 0/2466 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 44 GAAACGATAAACCCTAAGTCATGGTAAAGGAAACTCTAATTCCTCCGTCATCTACGTCAA 103
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1 GAAACGATAAACCCTAAATCATGGTAAAGGAAACTCTAATTCCTCCGTCTTCTACGTCAA 60
Query 104 TGACGACCGGAACATCTTCTTCTTCGTCTCTTTCAATGACGTTATCCTCAACAAACGCGT 163
|| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 61 TGGCGACCGGTACGGCGACGTCTTCGTCTCTTTCAATGACGTTGTCATCAACAAACGCGT 120
Query 164 TATCGTTTTTGTCGAAAGGATGGAGAGAGGTATGGGATTCAGCAGATGCGGATTTGCAGC 223
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TATCGTTTTTGTCGAAAGGTTGGAGAGAGGTATGGGATTCAGCAGATGCGGATTTGCAGT 180
Query 224 TGATGCGAGACAGAGCTAACTCTGTTAAGAATCTAGCATCAACGTTCGATAGAGAGATCG 283
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 181 TGATGCGAGACAGAGCTAACTCCGTTAAGAATCTAGCATCGACGTTCGACAGAGAGATCG 240
Query 284 AGAATTTCCTCAATAACTCGGCGAGGTCTGCGTTTCCCGTTGGTTCACCATCGGCGTCGT 343
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |
Sbjct 241 AGAATTTCCTCAATAATTCGGCCAGGTCTGCGTTTCCCGTCGGGTCACCATCGGCGTCTT 300
Query 344 CTTTCTCAAATGAAATTGGTATCATGAAGAAGCTTCAGCCGAAGATTTCGGAGTTTCGTA 403
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CTTTCTCAAGTGAAATTGGTATCATGAAGAAGCTTCAGCCGAAGATTTCGGAGTTTCGTA 360
Query 404 GGGTTTATTCGGCGCCGGAGATTAGTCGCAAGGTTATGGAGAGATGGGGACCTGCGAGAG 463
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 361 GGGTTTATTCGGCGCCGGAGATTAGTCGTAAGGTTATGGAGAGATGGGGACCAGCGAGAG 420
Query 464 CGAAGCTTGGAATGGATCTATCGGCGATTAAGAAGGCGATTGTGTCTGAGATGGAATTGG 523
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CGAAGCTGGGAATGGATCTATCGGCGATTAAGAAGGCGATTGTGTCTGAGATGGAATTGG 480
Query 524 ATGAGCGTCAGGGAGTTTTGGAGATGAGTAGATTGAGGAGACGGCGTAATAGTGATAGGG 583
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 481 ATGAGCGTCAGGGAGTTTTAGAGATGGGTAGATTGAGGAGACGGCGTAATAGTGACAGGG 540
Query 584 TTAGGTTTACGGAGTTTTTCGCGGAGGCTGAGAGAGATGGAGAAGCTTATTTCGGTGATT 643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 541 TTAGGTTTACGGAGTTTTTCGCGGAGGCTGAGAGAGATGGAGAAGGTAATTTCGGTGATT 600
Query 644 GGGAACCGATTAGGTCTTTGAAGAGTAGATTTAAAGAGTTTGAGAAACGAAGCTCGTTAG 703
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 601 GGGAACCGATTAGGTCTTTGAAGACTAGATTTAAAGAGTTTGAGAAACGAAACTCGTTAG 660
Query 704 AAATATTGAGTGGATTCAAGAACAGTGAATTTGTTGAGAAGCTCAAAACCAGCTTTAAAT 763
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AAATATTGAGTGGATTCAAGAACAGCGAATTTGTGGAGAAGCTCAAAACCAGCTTTAAAT 720
Query 764 CAATTTACAAAGAAACTGATGAGGCTAAGGATGTCCCTCCGTTGGATGTACCTGAACTGT 823
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 721 CAATTTACAAAGAAACTGATGAGGCTAAGGATGTCCCTCCATTGGATGTACCTGAACTTT 780
Query 824 TGGCATGTTTGGTTAGACAATCTGAACCTTTTCTTGATCAGATTGGTGTTAGAAAGGATA 883
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TGGCCTGTTTGGTTAGACAGTCTGAACCTTTTCTTGATCAGATTGGTGTTAGAAAGGATA 840
Query 884 CATGTGACCGAATAGTAGAAAGCCTTTGCAAATGCAAGAGCCAACAACTTTGGCGTCTGC 943
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 841 TGTGCGACCGAATAGTAGAAAGCCTTTGCAAATGCAAGAGCCAACACCTTTGGCGTCTGC 900
Query 944 CATCTGCACAAGCATCCGATTTAATTGAAAATGATAACCATGGAGTTGATTTGGATATGA 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CATCTGCACAAGCATCCGATTTAATTGAAAATGATAATCATGGAGTTGATTTGGATATGA 960
Query 1004 GGATAGCCAGTGTTCTTCAAAGCACAGGACACCATTATGATGGTGGGTTTTGGACTGATT 1063
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 961 GGATAGCCAGTGTTCTTCAAAGCACAGGACACCATTATGATGGTGGCTTTTGGACTGATT 1020
Query 1064 TTGTGAAGCCTGAGACACCGGAAAACAAAAGGCATGTGGCAATTGTTACAACAGCTAGTC 1123
||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TTGTGAAGCCTGAGACATCAGAAAATAAAAGGCATGTGGCAATTGTTACAACAGCTAGTC 1080
Query 1124 TTCCTTGGATGACCGGAACAGCTGTAAATCCGCTATTCAGAGCGGCGTATTTGGCAAAAG 1183
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TCCCTTGGATGACCGGAACAGCTGTAAATCCACTATTCAGAGCGGCGTATTTGGCAAAAT 1140
Query 1184 CTGCAAAACAGAGTGTTACTCTCGTGGTTCCTTGGCTCTGCGAATCTGATCAAGAACTAG 1243
||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 CTGCAAAACAGAGTGTTACACTTGTAGTTCCTTGGCTCTGCGAATCTGATCAAGAACTAG 1200
Query 1244 TGTATCCAAACAATCTCACCTTCAGCTCACCTGAAGAACAAGAGAGTTATATACGTAAAT 1303
| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1201 TTTATCCAAACAATCTCACCTTTAGTTCACCTGAAGAACAAGAGAGCTATATACGTAAAT 1260
Query 1304 GGTTGGAGGAAAGGATTGGTTTCAAGGCTGATTTTAAAATCTCCTTTTACCCAGGAAAGT 1363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1261 GGTTGGAGGAAAGGATTGGTTTCAAGGCTGATTTTAAAATCTCTTTTTACCCAGGAAAGT 1320
Query 1364 TTTCAAAAGAAAGGCGCAGCATATTTCCTGCTGGTGACACTTCTCAATTTATATCGTCAA 1423
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TTTCAAAAGAAAGGCGTAGCATATTTCCTGCTGGTGACACTTCTCAATTTATATCGTCAA 1380
Query 1424 AAGATGCTGACATTGCTATACTTGAAGAACCTGAACATCTCAACTGGTATTATCACGGCA 1483
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1381 AAGATGCTGACATTGCTATACTTGAAGAACCTGAGCATCTCAACTGGTACCATCACGGCA 1440
Query 1484 AGCGTTGGACTGATAAATTCAACCATGTTGTTGGAATTGTCCACACAAACTACTTAGAGT 1543
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 AGCGTTGGACCGATAAATTCAACCATGTTGTTGGAATTGTCCACACAAACTACTTAGAGT 1500
Query 1544 ACATCAAGAGGGAGAAGAATGGAGCTCTTCAAGCATTTTTTGTGAACCATGTAAACAATT 1603
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1501 ACATCAAGAGGGAGAAGAATGGTGCTCTTCAAGCATTTTTTGTGAATCATGTAAACAATT 1560
Query 1604 GGGTCACACGAGCGTATTGTGACAAGGTTCTTCGCCTCTCTGCGGCAACACAAGATTTAC 1663
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1561 GGGTCACACGAGCATATTGTGACAAGGTTCTTCGTCTCTCTGGGGCAACACAAGATTTAC 1620
Query 1664 CAAAGTCTGTTGTATGCAATGTCCATGGTGTCAATCCCAAGTTCCTTATGATTGGGGAGA 1723
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1621 CAAAATCTGTTGTATGCAATGTCCACGGTGTCAATCCCAAGTTCCTTATGATTGGGGGGA 1680
Query 1724 AAATTGCTGAAGAGAGATCCCGTGGTGAACAAGCTTTCTCAAAAGGTGCATACTTCTTAG 1783
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1681 AAATTGCTGAAGAGAGATCCCGTGGTGAACAAGCTTTCTCCAAAGGTGCATACTTCTTAG 1740
Query 1784 GAAAAATGGTGTGGGCTAAAGGATACAGAGAACTAATAGATCTGATGGCTAAACACAAAA 1843
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1741 GAAAAATGGTGTGGGCTAAAGGATACAGAGAACTAATAGATCTGATGGCTAAGCACAAAA 1800
Query 1844 GCGAACTTGGGAGCTTCAATCTAGATGTATATGGGAACGGTGAAGATGCAGTCGAGGTCC 1903
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1801 GCGAACTCGGGAGCTTCAATCTAGATGTCTATGGGAACGGTGAAGATGCAGTCGAAGTCC 1860
Query 1904 AACGTGCAGCAAAGAAACATGACTTGAATCTCAATTTCCTCAAAGGAAGGGACCACGCTG 1963
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1861 AACGTGCAGCAAAGAAACATGACTTAAATCTCAATTTCCTCAAAGGAAGGGACCACGCCG 1920
Query 1964 ACGATGCTCTTCACAAGTACAAAGTGTTCATAAACCCCAGCATCAGCGATGTTCTATGCA 2023
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 ACGATTCTCTTCACAAGTACAAAGTGTTCATAAACCCCAGCATCAGCGATGTTCTATGCA 1980
Query 2024 CAGCAACCGCAGAAGCACTAGCCATGGGGAAGTTTGTGGTGTGTGCAGATCACCCTTCAA 2083
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1981 CAGCAACCGCAGAAGCACTAGCCATGGGGAAGTTTGTGGTGTGTGCAGATCATCCTTCAA 2040
Query 2084 ACGAATTCTTTAGATCATTCCCGAACTGCTTAACTTACAAAACATCCGAAGACTTTGTGT 2143
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 ACGAATTCTTCAGATCATTCCCGAACTGCTTAACTTACAAAACATCCGAAGACTTTGTGT 2100
Query 2144 CCAAAGTGCAAGAAGCAATGACGAAAGAGCCACTACCTCTCACTCCTGAACAAATGTACA 2203
|||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2101 CCAAAGTGAAAGAAGCAATGACGAAGGAGCCATTACCTCTCACTCCAGAGCAAATGTACA 2160
Query 2204 ATCTCTCTTGGGAAGCAGCAACACAGAGGTTCATGGAGTATTCAGATCTCGATAAGATCT 2263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 ATCTCTCTTGGGAAGCAGCAACACAGAGGTTCATGGAGTATTCAGATCTCGATAAGATCT 2220
Query 2264 TAAACAATGGAGAGGGAGGAAGGAAGATGCGAAAATCAAGATCGGTTCCGAGCTTTAACG 2323
|||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2221 TAAATGATGGAGATGGAGGAAGGAGGATGCGAAAATCAAGATCAGTTCCGAGCTTTAACG 2280
Query 2324 AGGTGGTCGATGGAGGATTGGCATTCTCACACTATGTTCTAACAGGGAACGATTTCTTGA 2383
|| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 AGATGGTCGATGGAGGGTTAGCATTCACACACTATGTTCTAACAGGGAACGATTTCTTGA 2340
Query 2384 GACTATGCACTGGAGCAACACCAAGAACAAAAGACTATGATAATCAACATTGCAAGGATC 2443
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2341 GACTATGCACAGGAGCAACACCAAGAACAAAAGATTATGATAAGCAACATTGCAAGGATC 2400
Query 2444 TGAATCTCGTACCACCTCACGTTCACAAGCCAATCTTCGGCTGGTAGATATTTCCCCATA 2503
||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2401 TGAATCTTGTTCCGCCTCACGTTCACAAGCCAATCTTTGGCTGGTAGATATTTCCCCAGA 2460
Query 2504 GGCCAC 2509
||||||
Sbjct 2461 GGCCAC 2466
> Ahg918607 jgi|Araly1|918607|Al_scaffold_0222_2
Length=1920
Score = 3112 bits (1685), Expect = 0.0
Identities = 1841/1919 (96%), Gaps = 0/1919 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 64 ATGGTAAAGGAAACTCTAATTCCTCCGTCATCTACGTCAATGACGACCGGAACATCTTCT 123
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | |
Sbjct 1 ATGGTAAAAGAAACTCTAATTCCTCCGTCTTCTACGTCAATGGCGACCGGTACGGCGACG 60
Query 124 TCTTCGTCTCTTTCAATGACGTTATCCTCAACAAACGCGTTATCGTTTTTGTCGAAAGGA 183
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCTTCGTCTCTTTCAATGACGTTGTCATCAACAAACGCGTTATCGTTTTTGTCGAAAGGT 120
Query 184 TGGAGAGAGGTATGGGATTCAGCAGATGCGGATTTGCAGCTGATGCGAGACAGAGCTAAC 243
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TGGAGAGAGGTATGGGATTCAGCGGATACGGATTTGCAGTTGATGCGAGACAGAGCTAAC 180
Query 244 TCTGTTAAGAATCTAGCATCAACGTTCGATAGAGAGATCGAGAATTTCCTCAATAACTCG 303
|| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 181 TCCGTTAAGAATCTAGCATCGACGTTCGACAGAGAGATCGAGAATTTCCTCAATAATTCG 240
Query 304 GCGAGGTCTGCGTTTCCCGTTGGTTCACCATCGGCGTCGTCTTTCTCAAATGAAATTGGT 363
|| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 241 GCCAGGTCTGCGTTTCCCGTCGGGTCACCATCGGCGTCTTCTTTCTCAAGTGAAATTGGT 300
Query 364 ATCATGAAGAAGCTTCAGCCGAAGATTTCGGAGTTTCGTAGGGTTTATTCGGCGCCGGAG 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCATGAAGAAGCTTCAGCCGAAGATTTCGGAGTTTCGTAGGGTTTATTCGGCGCCGGAG 360
Query 424 ATTAGTCGCAAGGTTATGGAGAGATGGGGACCTGCGAGAGCGAAGCTTGGAATGGATCTA 483
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 361 ATTAGTCGTAAGGTTATGGAGAGATGGGGACCAGCGAGAGCGAAGCTGGGAATGGATCTA 420
Query 484 TCGGCGATTAAGAAGGCGATTGTGTCTGAGATGGAATTGGATGAGCGTCAGGGAGTTTTG 543
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TCGGCGATTAAGAAGGCGATTGTGTCTGAGATGGAATTGGATGAGCGTCAGGGAGTTTTA 480
Query 544 GAGATGAGTAGATTGAGGAGACGGCGTAATAGTGATAGGGTTAGGTTTACGGAGTTTTTC 603
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GAGATGGGTAGATTGAGGAGACGGCGTAATAGTGACAGGGTTAGGTTTACGGAGTTTTTC 540
Query 604 GCGGAGGCTGAGAGAGATGGAGAAGCTTATTTCGGTGATTGGGAACCGATTAGGTCTTTG 663
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCGGAGGCTGAGAGAGATGGAGAAGGTAATTTCGGTGATTGGGAACCGATTAGGTCTTTG 600
Query 664 AAGAGTAGATTTAAAGAGTTTGAGAAACGAAGCTCGTTAGAAATATTGAGTGGATTCAAG 723
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AAGACTAGATTTAAAGAGTTTGAGAAACGAAACTCGTTAGAAATATTGAGTGGATTCAAG 660
Query 724 AACAGTGAATTTGTTGAGAAGCTCAAAACCAGCTTTAAATCAATTTACAAAGAAACTGAT 783
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 661 AACAGCGAATTTGTGGAGAAGCTCAAAACCAGCTTTAAATCAAGTTACAAAGAAACTGAT 720
Query 784 GAGGCTAAGGATGTCCCTCCGTTGGATGTACCTGAACTGTTGGCATGTTTGGTTAGACAA 843
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 721 GAGGCTAAGGATGTCCCTCCATTGGATGTACCTGAACTTTTGGCCTGTTTGGTTAGACAG 780
Query 844 TCTGAACCTTTTCTTGATCAGATTGGTGTTAGAAAGGATACATGTGACCGAATAGTAGAA 903
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 781 TCTGAACCTTTTCTTGATCAGATTGGTGTTAGAAAGGATATGTGCGACCGAATAGTAGAA 840
Query 904 AGCCTTTGCAAATGCAAGAGCCAACAACTTTGGCGTCTGCCATCTGCACAAGCATCCGAT 963
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AGCCTTTGCAAATGCAAGAGCCAACACCTTTGGCGTCTGCCATCTGCACAAGCATCCGAT 900
Query 964 TTAATTGAAAATGATAACCATGGAGTTGATTTGGATATGAGGATAGCCAGTGTTCTTCAA 1023
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TTAATTGAAAATGATAATCATGGAGTTGATTTGGATATGAGGATAGCCAGTGTTCTTCAA 960
Query 1024 AGCACAGGACACCATTATGATGGTGGGTTTTGGACTGATTTTGTGAAGCCTGAGACACCG 1083
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 961 AGCACAGGACACCATTATGATGGTGGCTTTTGGACTGATTTTGTGAAGCCTGAGACATCA 1020
Query 1084 GAAAACAAAAGGCATGTGGCAATTGTTACAACAGCTAGTCTTCCTTGGATGACCGGAACA 1143
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GAAAATAAAAGGCATGTGGCAATTGTTACAACAGCTAGTCTCCCTTGGATGACCGGAACA 1080
Query 1144 GCTGTAAATCCGCTATTCAGAGCGGCGTATTTGGCAAAAGCTGCAAAACAGAGTGTTACT 1203
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GCTGTAAATCCACTATTCAGAGCGGCGTATTTGGCAAAATCTGCAAAACAGAGTGTTACA 1140
Query 1204 CTCGTGGTTCCTTGGCTCTGCGAATCTGATCAAGAACTAGTGTATCCAAACAATCTCACC 1263
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1141 CTTGTAGTTCCTTGGCTCTGCGAATCTGATCAAGAACTAGTTTATCCAAACAATCTCACC 1200
Query 1264 TTCAGCTCACCTGAAGAACAAGAGAGTTATATACGTAAATGGTTGGAGGAAAGGATTGGT 1323
|| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TTTAGTTCACCTGAAGAACAAGAGAGCTATATACGTAAATGGTTGGAGGAAAGGATTGGT 1260
Query 1324 TTCAAGGCTGATTTTAAAATCTCCTTTTACCCAGGAAAGTTTTCAAAAGAAAGGCGCAGC 1383
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1261 TTCAAGGCTGATTTTAAAATCTCCTTTTACCCAGGAAAGTTTTCAAAAGAAAGGCGTAGC 1320
Query 1384 ATATTTCCTGCTGGTGACACTTCTCAATTTATATCGTCAAAAGATGCTGACATTGCTATA 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 ATATTTCCTGCTGGTGACACTTCTCAATTTATATCGTCAAAAGATGCTGACATTGCTATA 1380
Query 1444 CTTGAAGAACCTGAACATCTCAACTGGTATTATCACGGCAAGCGTTGGACTGATAAATTC 1503
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1381 CTTGAAGAACCTGAGCATCTCAACTGGTACCATCACGGCAAGCGTTGGACCGATAAATTC 1440
Query 1504 AACCATGTTGTTGGAATTGTCCACACAAACTACTTAGAGTACATCAAGAGGGAGAAGAAT 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 AACCATGTTGTTGGAATTGTCCACACAAACTACTTAGAGTACATCAAGAGGGAGAAGAAT 1500
Query 1564 GGAGCTCTTCAAGCATTTTTTGTGAACCATGTAAACAATTGGGTCACACGAGCGTATTGT 1623
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1501 GGAGCTCTTCAAGCATTTTTTGTGAATCATGTAAACAATTGGGTCACACGAGCATATTGT 1560
Query 1624 GACAAGGTTCTTCGCCTCTCTGCGGCAACACAAGATTTACCAAAGTCTGTTGTATGCAAT 1683
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1561 GACAAGGTTCTTCGTCTCTCTGGGGCAACACAAGATTTACCAAAATCTGTTGTATGCAAT 1620
Query 1684 GTCCATGGTGTCAATCCCAAGTTCCTTATGATTGGGGAGAAAATTGCTGAAGAGAGATCC 1743
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 GTCCACGGTGTCAATCCCAAGTTCCTTATGATTGGGGGGAAAATTGCTGAAGAGAGATCC 1680
Query 1744 CGTGGTGAACAAGCTTTCTCAAAAGGTGCATACTTCTTAGGAAAAATGGTGTGGGCTAAA 1803
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 CGTGGTGAACAAGCTTTCTCCAAAGGTGCATACTTCTTAGGAAAAATGGTGTGGGCTAAA 1740
Query 1804 GGATACAGAGAACTAATAGATCTGATGGCTAAACACAAAAGCGAACTTGGGAGCTTCAAT 1863
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GGATACAGAGAACTAATAGATCTGATGGCTAAGCACAAAAGCGAACTTGGGAGCTTCAAT 1800
Query 1864 CTAGATGTATATGGGAACGGTGAAGATGCAGTCGAGGTCCAACGTGCAGCAAAGAAACAT 1923
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 CTAGATGTCTATGGGAACGGTGAAGATGCAGTCGAAGTCCAACGTGCAGCAAAGAAACAT 1860
Query 1924 GACTTGAATCTCAATTTCCTCAAAGGAAGGGACCACGCTGACGATGCTCTTCACAAGTA 1982
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 GACTTAAATCTCAATTTCCTCAAAGGAAGGGACCACGCCGACGATGCTCTTCACAAGTA 1919
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 101358141945
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5