BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G12915.1
Length=2628
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg318060 jgi|Araly1|318060|fgenesh1_pm.C_scaffold_3001076 3921 0.0
Ahg924144 jgi|Araly1|924144|scaffold_105425.1 2460 0.0
Ahg359025 jgi|Araly1|359025|fgenesh1_pg.C_scaffold_9000065 407 2e-112
> Ahg318060 jgi|Araly1|318060|fgenesh1_pm.C_scaffold_3001076
Length=2499
Score = 3921 bits (2123), Expect = 0.0
Identities = 2400/2529 (95%), Gaps = 37/2529 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 105 GGTGAAGTTTACAGTTGAAGAGCAACGGAAAATTACGGATCGTAAACACAACATCCGTAA 164
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 GGTGAAGTTCACAGTTGAAGAGCAACGGAAAATTATGGATCGTAAACACAACATCCGTAA 62
Query 165 CATGTCTGTCATCGCCCATGTCGATCATGGGAAATCTACACTTACGGATTCACTTGTTGC 224
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 63 CATGTCTGTTATTGCCCATGTCGATCATGGGAAATCTACTCTTACGGATTCACTTGTTGC 122
Query 225 TGCTGCTGGTATCATTGCTCAAGAAACTGCGGGTGATGTGCGTATGACTGATACTCGTGC 284
|||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 123 TGCTGCTGGTATTATTGCACAAGAATCTGCTGGTGATGTTCGTATGACTGATACGCGAGC 182
Query 285 TGATGAGGCAGAACGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGGTATCTCTCTCTACTATGAGAT 344
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 TGATGAAGCAGAACGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGGTATCTCTCTCTACTATGAGAT 242
Query 345 GACTGATGCGTCTCTGAAGAGTTTCACCGGAGCTAGAGATGGCAATGAGTACCTGATCAA 404
|||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 GACTGATGAGTCTTTGAAGAGTTTCACTGGAGCTAGAGATGGCAATGAGTACCTGATCAA 302
Query 405 CCTCATTGACTCTCCTGGACACGTTGACTTTTCTTCAGAGGTCACAGCTGCTCTCCGTAT 464
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 303 CCTCATTGACTCTCCTGGACACGTTGACTTTTCATCAGAAGTCACTGCTGCTCTCCGTAT 362
Query 465 CACTGATGGTGCTCTTGTGGTTGTTGACTGCATTGAAGGTGTTTGTGTGCAGACTGAGAC 524
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 363 TACTGATGGTGCTCTTGTGGTTGTTGACTGCATTGAAGGCGTTTGTGTGCAGACCGAGAC 422
Query 525 TGTGCTCAGGCAATCTCTTGGTGAAAGGATTAGGCCTGTTTTGACTGTCAACAAGATGGA 584
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 423 TGTGCTCAGGCAATCTCTTGGTGAAAGGATAAGGCCTGTTTTGACTGTCAACAAAATGGA 482
Query 585 CAGGTGTTTCCTTGAGCTTAAGGTTGATGGTGAGGAGGCGTATCAGAATTTCCAGAGGGT 644
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CAGGTGTTTCCTTGAGCTTAAGGTTGATGGTGAAGAGGCTTATCAGAATTTCCAGAGGGT 542
Query 645 CATTGAGAATGCTAATGTCATCATGGCCACGCATGAGGATCCTCTCCTCGGTGATGTTCA 704
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 543 CATTGAGAATGCTAATGTCATCATGGCGACGTATGAGGATCCTCTCCTTGGTGATGTTCA 602
Query 705 GGTTTACCCTGAAAAGGGGACAGTAGCTTTCTCTGCTGGTCTCCACGGATGGGCTTTCAC 764
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 GGTTTACCCTGAAAAGGGGACAGTGGCTTTCTCTGCTGGTCTCCACGGATGGGCTTTCAC 662
Query 765 TCTCACCAATTTTGCTAAGATGTATGCTTCCAAGTTTGGTGTCTCTGAATCTAAAATGAT 824
||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 663 TCTTACCAATTTTGCTAAGATGCATGCTTCCAAGTTTGGTGTTTCTGAATCTAAAATGAT 722
Query 825 GGAGAGGCTGTGGGGTGAGAACTTCTTTGATTCTGCAACCAGAAAATGGACGACCAAAA- 883
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 GGAGAGGCTGTGGGGTGAGAACTTCTTTGATCCTGCAACCAGAAAATGGACGACCAAAAA 782
Query 884 C--TGGCTCCCCGACCTGCAAGCGTGGGTTTGTTCAGTTCTGTTATGAACCCATTAAGAT 941
| ||||||| ||||||||||||||||| | | | | | || ||| | || | |
Sbjct 783 CACTGGCTCCGCGACCTGCAAGCGTGGGAT-G---A-T---G--ATCAACAC-TT--G-T 828
Query 942 AATGA-TCAACACTTGTATGAATGATCAGAAGGATAAGCTGTGGCCGATGTTAGAGAAGC 1000
| ||| | | | | | ||| ||| | | | | | || | |||||||| |||||||
Sbjct 829 A-TGAATGA-C-C----A-GAAGGAT-A-A-GC-T--G-TG-G-CCGATGTTGGAGAAGC 871
Query 1001 TTGGTATTCAGATGAAGCCCGATGAGAAAGAGTTGATGGGTAAACCTTTGATGAAGCGTG 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 872 TTGGTATTCAGATGAAGCCCGATGAGAAAGAGTTGATGGGTAAACCTTTGATGAAGCGTG 931
Query 1061 TCATGCAGGCATGGCTTCCTGCGAGTACCGCTCTTCTTGAAATGATGATCTTTCACTTAC 1120
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 932 TCATGCAGGCATGGCTCCCTGCGAGTACTGCTCTGCTTGAAATGATGATATTTCACTTAC 991
Query 1121 CATCACCCTACACTGCGCAGAGGTACCGTGTTGAGAACTTGTATGAAGGTCCCCTTGATG 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 CATCACCCTACACTGCGCAGAGGTACCGTGTTGAGAACTTGTATGAAGGTCCCCTTGATG 1051
Query 1181 ATAAGTATGCTGCAGCTATCAGAAACTGTGATCCAGACGGTCCTTTGATGCTCTACGTCT 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052 ATAAGTATGCTGCAGCTATCAGAAACTGTGATCCAGAAGGTCCTTTGATGCTCTACGTCT 1111
Query 1241 CTAAGATGATTCCCGCATCTGACAAGGGCAGGTTCTTTGCCTTCGGTCGTGTCTTTTCTG 1300
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1112 CTAAGATGATTCCTGCATCTGACAAGGGTAGGTTCTTTGCCTTGGGTCGTGTCTTTTCTG 1171
Query 1301 GTACGGTTTCTACTGGTATGAAAGTCAGGATCATGGGTCCTAACTATGTCCCTGGTGAAA 1360
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1172 GTACAGTTTCTACTGGTATGAAAGTCAGGATCATGGGTCCCAACTATGTCCCTGGTGAAA 1231
Query 1361 AGAAAGATCTGTATGTCAAAAGTGTGCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAAACAAG 1420
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1232 AGAAAGATCTGTATGTCAAGAGTGTGCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAAGCAAG 1291
Query 1421 AGACAGTGGAGGATGTTCCTTGTGGTAATACTGTTGCTATGGTTGGGCTGGATCAGTTCA 1480
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1292 AGACAGTGGAGGATGTTCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGGCTAGATCAGTTCA 1351
Query 1481 TCACCAAGAATGGTACCTTGACGAATGAGAAGGAAGTGGACGCACACCCGCTTCGTGCCA 1540
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352 TCACCAAGAACGCTACCTTGACGAATGAGAAGGAAGTGGACGCACACCCGCTTCGTGCCA 1411
Query 1541 TGAAGTTTTCTGTCTCTCCCGTTGTTCGTGTTGCTGTGAAATGCAAGCTAGCGTCTGACC 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412 TGAAGTTTTCTGTCTCTCCCGTTGTTCGTGTTGCTGTAAAATGCAAGCTAGCGTCTGACC 1471
Query 1601 TTCCCAAGCTTGTAGAAGGTCTTAAGAGGCTGGCCAAGTCTGACCCTATGGTTCTATGCA 1660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1472 TTCCCAAGCTTGTAGAAGGTCTTAAGAGGCTGGCCAAGTCTGACCCTATGGTTTTATGCA 1531
Query 1661 CAATGGAAGAGTCTGGTGAGCACATTGTTGCAGGTGCTGGAGAACTCCACATTGAAATTT 1720
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1532 CAATGGAAGAGTCTGGTGAGCACATTGGTGCAGGTGCTGGAGAACTCCACATTGAAATTT 1591
Query 1721 GTGTCAAGGATCTTCAAGATTTTATGGGTGGTGCGGATATCATAGTGTCAGATCCTGTTG 1780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592 GTGTCAAGGATCTTCAAGATTTTATGGGTGGTGCGGAGATCATAGTGTCAGATCCTGTTG 1651
Query 1781 TTTCGTTACGAGAGACAGTCTTTGAGAGGTCTTGCCGGACTGTGATGAGTAAGTCCCCAA 1840
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1652 TTTCGTTGCGAGAGACAGTCTTTGAGAGGTCTTGCCGCACTGTGATGAGTAAGTCCCCAA 1711
Query 1841 ACAAACACAACCGTCTTTACATGGAAGCCAGACCAATGGAGGATGGTCTAGCAGAGGCCA 1900
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1712 ACAAGCACAACCGTCTTTACATGGAAGCCAGACCAATGGAGGATGGTCTAGCAGAGGCTA 1771
Query 1901 TTGATGAAGGCCGCATCGGTCCATCTGATGACCCCAAGATCCGATCCAAGATTCTTGCAG 1960
|| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1772 TTAATGAAGGTCGCATCGGTCCATCTGATGATCCCAAGATCCGATCCAAGATCCTTGCAG 1831
Query 1961 AAGAGTTTGGGTGGGACAAGGATCTTGCCAAGAAAATCTGGGCGTTTGGACCTGACACCA 2020
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1832 AAGAGTTTGGATGGGACAAGGATCTTGCCAAGAAAATATGGGCATTTGGACCTGACACCA 1891
Query 2021 CAGGGCCCAACATGGTGGTTGACATGTGTAAGGGAGTGCAGTACTTGAATGAAATCAAGG 2080
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1892 CAGGGCCCAACATGGTGGTTGATATGTGTAAGGGAGTGCAGTACTTGAATGAAATCAAGG 1951
Query 2081 ACTCAGTGGTTGCTGGGTTCCAATGGGCTTCAAAGGAAGGTCCTTTAGCAGAGGAAAACA 2140
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1952 ACTCAGTGGTTGCTGGTTTCCAATGGGCTTCAAAGGAAGGCCCTTTAGCAGAAGAAAACA 2011
Query 2141 TGAGAGGGGTCTGTTATGAGGTGTGTGATGTTGTGCTCCATGCTGATGCAATCCACAGAG 2200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2012 TGAGAGGGGTCTGTTATGAGGTGTGTGATGTTGTGCTCCATGTTGATGCAATCCACAGAG 2071
Query 2201 GATGTGGTCAGATGATCTCAACAGCAAGAAGAGCCATCTATGCATCACAACTCACGGCCA 2260
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2072 GAGGTGGTCAGATGATTTCAACAGCAAGAAGAGCCATCTATGCATCACAGCTCACGGCCA 2131
Query 2261 AGCCTAGACTTCTTGAGCCGGTTTACATGGTCGAGATACAAGCACCTGAGGGAGCTTTAG 2320
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2132 AGCCAAGACTTCTTGAGCCGGTTTACATGGTCGAGATACAAGCACCTGAGGGAGCTTTGG 2191
Query 2321 GAGGAATCTACAGTGTGTTGAATCAGAAGCGTGGACATGTGTTTGAAGAAATGCAAAGGC 2380
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2192 GAGGAATCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACATGTGTTTGAAGAAATGCAAAGGC 2251
Query 2381 CAGGAACGCCTCTCTACAACATCAAAGCCTACCTTCCTGTGGTCGAGTCATTTGGTTTCT 2440
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 2252 CAGGAACACCTCTCTACAACATCAAAGCCTACCTTCCTGTGGTCGAGTCGTTTAATTTCT 2311
Query 2441 CAGGTCAGCTAAGGGCTGCAACCTCAGGACAAGCCTTTCCTCAGTGTGTGTTTGACCATT 2500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2312 CAGGTCAGCTAAGGGCTGCAACCTCAGGACAAGCCTTTCCTCAGTGTGTGTTTGACCATT 2371
Query 2501 GGGACATGATGTCTTCTGATCCGCTTGAGACTGGCTCACAGGCTGCGACATTGGTAGCTG 2560
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2372 GGGACATGATGTCTTCTGATCCGCTGGAGGCTGGCTCACAGGCTGCTACATTGGTAGCTG 2431
Query 2561 ATATCAGGAAGAGAAAAGGTTTGAAGCTACAAATGACTCCACTCTCTGATTAT-GAAGAC 2619
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 2432 ATATCAGGAAGAGAAAAGGTTTGAAGCTACAGATGACTCCACTCTCTGATT-TCGAAGAC 2490
Query 2620 AAATTGTAA 2628
|||||||||
Sbjct 2491 AAATTGTAA 2499
> Ahg924144 jgi|Araly1|924144|scaffold_105425.1
Length=2607
Score = 2460 bits (1332), Expect = 0.0
Identities = 2166/2562 (85%), Gaps = 84/2562 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 105 GGTGAAGTTTACAGTTGAAGAGCAACGGAA-AATTACGGATCGT--AAACACAACATCCG 161
|||||||||||||| ||| |||| | ||| |||| ||| | | ||||||||||||||
Sbjct 58 GGTGAAGTTTACAGCTGATGAGCTTC-GAAGGATTATGGA-C-TACAAACACAACATCCG 114
Query 162 TAACATGTCTGTCATCGCCCATGTCGATCATGGGAAATCTACACTTACGGATTCACTT-G 220
||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||| |
Sbjct 115 TAATATGTCCGTTATTGCCCATGTTGACCACGGGAAATCCACTCTCACTGATTC-CTTGG 173
Query 221 TTGCTGCTGCTGGTATCATTGCTCAAGAAACTGCGGGTGATGTGCGTATGACTGATACTC 280
|||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 174 TTGCTGCTGCGGGTATCATTGCCCAAGAGGTTGCTGGTGATGTTCGTATGACTGATAC-C 232
Query 281 -GTGCTGATGAGGCAGAACGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGGTATCTCTCTCTACTAT 339
| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 233 AGAGCTGATGAGGCTGAACGTGGTATTACTATCAAGTCCACTGGTATTTCTCTCTACTAC 292
Query 340 GAGATGACTGATGCGT-CTCTGAAGAGTTTCACCGGAGCTAGAGATGGCAATGAGTACCT 398
|||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||
Sbjct 293 GAGATGACGGATGCGTCCT-TGAAGAGTTTCACTGGAGCCAGAGATGGCAACGAATACCT 351
Query 399 GATCAACCTCATTGACTCTCCTGGACACGTTGACTTTTCTTCAGAGGTCACAGCTGCTCT 458
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||
Sbjct 352 TATCAACCTTATCGATTCTCCTGGGCACGTTGACTTTTCTTCTGAGGTTACTGCTGCTCT 411
Query 459 CCGTATCACTGATGGTGCTCTTGTGGTTGTTGACTGCATTGAAGGTGTTTGTGTGCAGAC 518
|||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||
Sbjct 412 CCGTATTACTGATGGTGCTCTTGTGGTGGTCGACTGTATTGAGGGTGTGTGTGTTCAGAC 471
Query 519 TGAGACTGTGCTCA-GGCAATCTCTTGGTGAAAGGATTAGGCCTGTTTTGACTGTCAACA 577
||||||||| || | | || |||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||
Sbjct 472 TGAGACTGTTCT-ACGTCAGGCTCTTGGTGAGAGGATTCGACCTGTCTTGACTGTTAACA 530
Query 578 AGATGGACAGGTGTTTCCTTGAGCTTAAGGTTGATGGTGAGGAGGCGTATCAGAATTTC- 636
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||
Sbjct 531 AGATGGACAGGTGTTTCCTTGAGCTTCAGGTTGATGGTGAGGAGGCTTACCAGACTTTCT 590
Query 637 CAGAGGGTCATTGAGAATGCTAATGTCATCATGGCCACGC-ATGAGGATCCTCTCCTCGG 695
| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | |||||||||||||||| ||
Sbjct 591 C-CAGGGTCATTGAGAATGCCAACGTTATCATGGCTAC-CTATGAGGATCCTCTCCTTGG 648
Query 696 TGATGTTCAGGTTTACCCTGAAAAGGGGACAGTAGC-TTTCTCTGCTGGTCTCCACGGAT 754
|||||||||||| ||||| || ||||| || || || ||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 649 TGATGTTCAGGTATACCCAGAGAAGGGAACTGTGGCGTTT-TCTGCTGGTCTCCACGGTT 707
Query 755 GGGC-TTTCACTCTCACCAATTTTGCTAAGATGTATGCTTCCAAGTTTGGTGTCTCTGAA 813
|||| ||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 708 GGGCGTTT-ACACTGACCAACTTTGCCAAGATGTATGCTTCCAAGTTCGGTGTCGATGAA 766
Query 814 TCTAAAATGATGGAGAGGCTGTGGGGTGAGAACTTCTTTGATTCTGCAACCAGAAAATGG 873
|||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||
Sbjct 767 ACTAAGATGATGGAGAGGCTCTGGGGTGAGAATTTCTTTGACCCTGCCACCAGGAAATGG 826
Query 874 A-CGAC-CAAA-ACTGGCTCCCCGACCTGCAAGCGTGGGTTTGTTCAGTTCTGTTATGAA 930
| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 827 AGTGGCAAAAACACTGGTTCCCCGACCTGCAAGCGTGGGTTTGTCCAGTTCTGCTATGAA 886
Query 931 CCCATTAAG-ATAATGATCAAC-ACTTGTATGAATGATCAGAAGGATAAGCTGTGGCCGA 988
||||| ||| | ||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |
Sbjct 887 CCCATCAAGCA-AATCATC-GCTACTTGCATGAATGACCAGAAGGACAAGTTGTGGCCCA 944
Query 989 TGTTAG-AGAAGCTTGGTATTCA-GATGAAGCCCGATGAGAAAGAG-TTGATGGGTAAAC 1045
|||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 945 TGTT-GCAGAAGCTTGGT-GTCACAATGAAGAATGATGAGAAAGAGCTT-ATGGGTAAAC 1001
Query 1046 CTTTGATGAAGCGTGTCATGCAGGCATGGCTTCCTGCGAGTACCGCTCTTCTTGAAATGA 1105
|| | ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||
Sbjct 1002 CTCTAATGAAGCGTGTTATGCAGACTTGGCTCCCTGCAAGTACTGCACTACTTGAGATGA 1061
Query 1106 TGATCTTTCACTTACCATCACCCTACACTGCGCAGAGGTACCGTGTTGAGAACT-TGTAT 1164
|||||| ||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 1062 TGATCTATCATTTGCCATCTCCCCACACTGCCCAGAGGTACCGTGTTGAGAA-TCTGTAT 1120
Query 1165 GAAGGTCCCCTTGATGATAAGTATGCTGCA-GCTATCAGAAACTGTGA-TCCAGACGGTC 1222
|||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||| ||| | || |
Sbjct 1121 GAAGGTCCTCTTGATGATCAGTATGC-AAATGCCATCAGGAACTGTGACCCCA-ATGGAC 1178
Query 1223 CTTTGATGCTCTACGTCTCTAAGATGATTCCCGCATCTGACAAGGGCAGGTTCTTTGCCT 1282
|| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1179 CTCTCATGCTCTACGTATCTAAGATGATTCCAGCCTCTGACAAGGGTAGGTTCTTTGCCT 1238
Query 1283 TCGGTCGTGTCTTTTCTGGTACGGTTTCTACTGGTATGAAAGTCAGGATCATGGGTCCTA 1342
| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
Sbjct 1239 TTGGTCGTGTCTTTGCTGGTAAGGTTTCTACTGGTATGAAGGTCAGAATCATGGGTCCCA 1298
Query 1343 ACTATGTCCCTGGTGAAAAGAAAGATCTGTATGTC-AAAAGTGTGCAGAGGACTGTCATT 1401
|||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1299 ACTATGTCCCTGGTGAGAAGAAGGATCTGTAT-ACTAAGAGTGTTCAGAGGACTGTTATT 1357
Query 1402 TGGATGGGTAAGAAACAAGAGACAGTGGAGGATGTTCCTTGTGGTAATACTGTTGCTATG 1461
||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1358 TGGATGGGTAAGAGGCAAGAGACGGTGGAGGATGTCCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATG 1417
Query 1462 GTTGGGCTGGATCAGTTCATCACCAAGAATGGTACCTTGACGAATGAGAAGGAAGTGGAC 1521
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1418 GTTGGGCTGGATCAGTTCATCACCAAGAATGCTACATTGACTAATGAGAAGGAAGTTGAT 1477
Query 1522 GCACACCCGC-TTCGTGCCATGAAGTTTTCTGTCTCTCCCGTTGTTCGTGTTGCTGTGAA 1580
|| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 1478 GCTCACCC-CATTCGTGCCATGAAGTTTTCTGTGTCTCCTGTTGTTCGTGTTGCTGTTCA 1536
Query 1581 ATGCAAGCTAGCGTCTGACCTTCCCAAGCTTGTAGAAGGTCTTAAGAGGCTGGCCAAGTC 1640
|| ||| | || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1537 GTGTAAGGTTGCATCTGACCTTCCCAAGCTGGTTGAGGGTCTCAAGAGGCTGGCCAAGTC 1596
Query 1641 TGACCCTATGGTTCTATGCACAATGGAAGAGTCTGGTGAGCACATTGTTGCAGGTGCTGG 1700
||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1597 TGATCCTATGGTTGTGTGCACAATGGAAGAATCAGGTGAGCACATTGTTGCTGGTGCAGG 1656
Query 1701 AGAACTCCA-CATTGAAATTTGTGTCAAGGATCTTCAAGAT--TTT-ATGGGTGGTGCGG 1756
||| ||||| | |||| |||||| | |||||||| || ||| ||| ||||||||||| |
Sbjct 1657 AGAGCTCCATC-TTGAGATTTGTCTGAAGGATCTGCAGGATGATTTCATGGGTGGTGCTG 1715
Query 1757 ATATCAT-AGTGTCAGATCCTGTTGTTTCGTTACGAGAGACAGTCTT-TGAGAGGTCT-T 1813
| || || | |||||| ||||| || || || || |||||||| | ||| |||||| |
Sbjct 1716 AAATTATCAA-GTCAGACCCTGTGGTCTCCTTCCGTGAGACAGT-TAGTGATAGGTCTAT 1773
Query 1814 GCCGGACTGTGATGAGTAAGTCCCCAAACAAACACAACCGTCTTTACATGGAAGCCAGAC 1873
| | ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1774 TC-GCACTGTTATGAGTAAGTCTCCTAACAAGCATAACCGTCTCTACATGGAAGCAAGAC 1832
Query 1874 CAATGGAGGATGGTCTAGCAGAGGCCATTGATGAAGGCCGCATCGGTCCATCTGATGACC 1933
| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||| |||||||
Sbjct 1833 CCATGGAAGATGGTCTAGCTGAGGCGATTGATGATGGACGTATTGGCCCAAGGGATGACC 1892
Query 1934 CCAAGATCCGATCCAAGATTCTTG-CAGAAGAGTTTGGGTGGGACAAGGATCTTGCCAAG 1992
| |||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1893 CTAAGATCAGGTCCAAGAT-CTTGGCTGAGGAGTTTGGATGGGACAAGGATCTTGCAAAG 1951
Query 1993 AAAATCTGGGCGTTTGGACCTGACACCACAGGGCCCAACATGGTGGTTGACATGTGTAAG 2052
|| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1952 AAGATCTGGGCTTTTGGACCTGAAACCACAGGGCCTAACATGGTTGTTGATATGTGTAAA 2011
Query 2053 GGAGTGCAGTAC-TTGAATGAAATCAAGGACTCAGTGGTTGCTGGGTTCCAATGGGCTTC 2111
||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 2012 GGAGTTCAGTACCTT-AATGAAATCAAGGACTCAGTGGTGGCTGGTTTCCAGTGGGCGTC 2070
Query 2112 AAAGGAAGGTCCTTTA-GCAGAGGAAAACATGAGAGGGGTCTGTTAT-GAGGTGTGTGAT 2169
|||||||||||| || | || || ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||
Sbjct 2071 CAAGGAAGGTCCTCTATGT-GAAGAGAACATGAGAGGCATCTGTT-TCGAGGTTTGTGAT 2128
Query 2170 GTTGTGCTCCA-TGCTGATGCAATCCACAGAGGATGTGGTCAGATGATCTCAACAGCAAG 2228
|| ||||| || | ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||
Sbjct 2129 GTGGTGCTTCACT-CTGATGCCATCCACAGAGGAGGTGGTCAGGTTATCCCAACAGCCAG 2187
Query 2229 AAGAGCCATCTATGCAT-CACA-ACTCACGGCCAAGCCTAGACTTCTTG-AGCCGGTTTA 2285
||| | ||| || || | | || | |||| || ||||| || ||| ||| |||| |||||
Sbjct 2188 AAGGGTCATATACGC-TGCCCAGA-TCACAGCTAAGCCCAGGCTT-TTGGAGCCAGTTTA 2244
Query 2286 CATGGTCGAGATACAAGCACCTGAGGGAGCT-TTAGGAGGAATCTACAGTGTGTTGAATC 2344
|||||| ||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2245 CATGGTTGAGATCCAGGCACCAGAGGGAGCTCTT-GGAGGAATCTACAGTGTGCTGAATC 2303
Query 2345 AGAAGCGTGGACATGTGTTTGAAGAAATGCAAAGGCCAGGAACGCCTCTCTACAACATCA 2404
||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||
Sbjct 2304 AGAAGCGTGGACACGTCTTCGAGGAGATGCAGAGGCCAGGAACTCCGCTGTACAACATCA 2363
Query 2405 AAGCCTACCTTCCTGTGGTCGAGTCATTT-GGTTTCTC-AGGTCAGCTAAGGGCTGCAAC 2462
| || ||||| ||||| || ||||| ||| || ||||| || |||||| ||||| |||||
Sbjct 2364 AGGCATACCTGCCTGTTGTGGAGTC-TTTCGGATTCTCGAG-TCAGCTTAGGGCAGCAAC 2421
Query 2463 CTCAGGACAAGCCTTTCCT-CAGTGTGTGTTTGACCATTGGGACATGATGTCTTCTGATC 2521
||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2422 CTCAGGACAGGC-TTTCCCACAGTGTGTGTTTGATCATTGGGAAATGATGTCTTCTGACC 2480
Query 2522 CGCTTGAGACTGGCT-CACAGGCTGCGACAT-TGGTAGCTGATATCAGGAAGAGAAAAGG 2579
| |||||| | || | | |||||| | | | |||| ||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2481 CTCTTGAGCCAGG-TACTCAGGCTTC-AGTTCTGGTGGCTGATATCAGGAAGAGGAAGGG 2538
Query 2580 TTTGAAGCTACAAATGACTCCACTCTCTGATTATGAAGACAA 2621
|||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 2539 ATTGAAGGAACAGATGACTCCACTATCTGATTTTGAAGACAA 2580
> Ahg359025 jgi|Araly1|359025|fgenesh1_pg.C_scaffold_9000065
Length=1179
Score = 407 bits (220), Expect = 2e-112
Identities = 288/322 (89%), Gaps = 0/322 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1266 GGGCAGGTTCTTTGCCTTCGGTCGTGTCTTTTCTGGTACGGTTTCTACTGGTATGAAAGT 1325
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||
Sbjct 567 GGGCAGGTTCTTTGCCTTTGGTCGTGTCTTCTCTGGAAAGGTGGCTACTGGTATGAAAGT 626
Query 1326 CAGGATCATGGGTCCTAACTATGTCCCTGGTGAAAAGAAAGATCTGTATGTCAAAAGTGT 1385
||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||
Sbjct 627 CAGGATCATGGGTCCCAACTTTGTCCCTGGTGAGAAGAAGGATTTATATGTCAAGAGTGT 686
Query 1386 GCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAAACAAGAGACAGTGGAGGATGTTCCTTGTGG 1445
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 687 GCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAAACATGAGACAGTGGAAGATGTTCCGTGTGG 746
Query 1446 TAATACTGTTGCTATGGTTGGGCTGGATCAGTTCATCACCAAGAATGGTACCTTGACGAA 1505
|||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 747 TAATACAGTTGCTATGGTTGGGCTAGACCAGTTCATCACCAAGAATGCTACCTTGACGAA 806
Query 1506 TGAGAAGGAAGTGGACGCACACCCGCTTCGTGCCATGAAGTTTTCTGTCTCTCCCGTTGT 1565
||| |||||||| | || |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 807 TGAAAAGGAAGTCAAAGCCCACCCGATCCGTGCCATGAGGTTTTCTGTCTCTCCTGTTGT 866
Query 1566 TCGTGTTGCTGTGAAATGCAAG 1587
|| |||||||| | ||||||
Sbjct 867 CCGAGTTGCTGTTCAGTGCAAG 888
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 99110817490
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5