BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G13530.1 Length=4353 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg478740 jgi|Araly1|478740|fgenesh2_kg.3__1441__AT3G13530.1 6996 0.0 Ahg903697 jgi|Araly1|903697|Al_scaffold_0003_825 5048 0.0 > Ahg478740 jgi|Araly1|478740|fgenesh2_kg.3__1441__AT3G13530.1 Length=4296 Score = 6996 bits (3788), Expect = 0.0 Identities = 4159/4331 (96%), Gaps = 54/4331 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCGCGGCAAATGACGTCATCTCAGTTTCACAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCGCGGCAAATGACGTCATCTCAGTTTCATAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAT 60 Query 61 ATGCTGGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGGTCGAGTTTATAAAGGATTAGACTTG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ATGCTGGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGGTCGAGTTTATAAAGGATTAGACTTG 120 Query 121 GAGAATGGTGACTTTGTGGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAATATTGTTCAAGAGGAT 180 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 121 GAGAATGGAGACTTTGTGGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAACATTGTTCAAGAGGAT 180 Query 181 CTTAACACCATTATGCAAGAAATTGATCTTTTGAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTG 240 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CTTAACACCATAATGCAAGAAATTGATCTTTTGAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTG 240 Query 241 AAGTATCTTGGGTCGTCGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTTTGGAGTACGTTGAG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AAGTATCTTGGGTCGTCGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTTTGGAGTACGTTGAG 300 Query 301 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCAAATAAATTTGGACCTTTCCCAGAATCTTTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 301 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCAAATAAATTCGGACCTTTCCCAGAATCATTG 360 Query 361 GTGGCTGTTTACATTGCTCAGGTCTTGGAAGGTTTGGTATATCTGCATGAGCAGGGTGTT 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GTGGCTGTTTACATTGCTCAGGTCTTGGAAGGTTTGGTATATCTGCATGAGCAGGGTGTC 420 Query 421 ATACACCGTGATATTAAGGGTGCAAATATTTTGACGACAAAGGAGGGTCTTGTGAAGCTT 480 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATACACCGTGATATCAAGGGTGCAAATATTTTGACGACAAAGGAGGGTCTTGTGAAGCTT 480 Query 481 GCTGACTTTGGAGTTGCCACTAAACTTAACGAGGCTGATGTTAATACTCACTCGGTGGTT 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 481 GCTGACTTTGGAGTTGCCACTAAACTTAACGAGGCTGATGTTAATACTCACTCAGTGGTT 540 Query 541 GGAACTCCTTACTGGATGGCTCCTGAGGTTATTGAAATGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GGAACTCCTTACTGGATGGCTCCTGAGGTTATTGAAATGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTCT 600 Query 601 GACATTTGGAGCGTTGGATGCACTGTTATCGAACTTCTGACATGTGTACCTCCTTACTAT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GACATTTGGAGCGTTGGATGCACTGTTATCGAACTTCTGACATGTGTACCTCCTTACTAT 660 Query 661 GATCTGCAACCCATGCCAGCCCTCTTTCGTATTGTTCAGGATGACAACCCTCCTATTCCT 720 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 661 GATCTGCAACCCATGCCAGCTCTCTTTCGTATTGTTCAGGATGATAACCCTCCTATTCCC 720 Query 721 GATAGTCTTTCTCCAGATATTACGGACTTTCTACGACAGTGCTTCAAGAAGGATTCCAGG 780 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GATAGTCTTTCTCCGGATATTACTGACTTTCTACGACAGTGCTTCAAGAAGGATTCCAGG 780 Query 781 CAGAGGCCTGATGCAAAGACACTGCTCTCTCACCCTTGGATACGAAACTCTAGACGAGCT 840 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 781 CAGAGGCCTGATGCAAAGACGCTACTCTCTCACCCTTGGATACGGAACTCTAGACGAGCA 840 Query 841 TTGCAGTCATCACTTCGGCATAGTGGCACCATCAAATATATGAAGGAAGCCACTGCAAGT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TTGCAGTCATCACTTCGGCATAGTGGCACCATCAAATATATGAAGGAAGCCACTGCAAGT 900 Query 901 TCAGAGAAGGATGATGAAGGTAGTCAAGATGCAGCAGAAAGCCTTTCAGGAGAAAATGTG 960 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 901 TCAGAGAAGGATGATGAAGGTAGTCAAGATGCAGCTGAAAGCCTTTCAGCAGAAAATGTG 960 Query 961 GGAATATCAAAAACTGACTCGAAAAGCAAATTACCTCTGGTAGGGGTGTCGAGTTTTAGG 1020 ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct 961 GGAATGTCAAAAAGTGACTCGAAAAGCAAATTACCTCTGCTAGGGGGGTCGAGTTTTAGG 1020 Query 1021 TCTGAGAAAGATCAGTCGACACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAACAGATAATTCAGAA 1080 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 TCTGATAAAGATCAGTCTACACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAACAGATAATTCAGAA 1080 Query 1081 GATGATATTATGTCAGATCAAGTTCCTACACTGTCGATCCATGAGAAATCTTCGGATGCT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GATGATATTATGTCAGATCAAGTTCCTACACTTTCGATCCATGAGAAATCTTCGGATGCG 1140 Query 1141 AAGGGGACACCTCAAGATGTATCAGACTTTCATGGGAAATCTGAACGTGGTGAAACACCT 1200 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1141 AAGGGGACACCTCAAGATGTATCAGAGTTTCATGGGAAATCTGAACGTGTTGAAACACCT 1200 Query 1201 GAAAATCTTGTAACGGAAACTTCTGAAGCTAGAAAAAATACTTCAGCAATAAAGCACGTT 1260 |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct 1201 GAAAATCTTGAAACAGAAACTTCTGAAGCTAGAAAAAATACTTCAGCAAAAAAGCAGGTT 1260 Query 1261 GGCAAAGAATTATCCATCCCAGTGGACCAGACATCACATAGTTTTGGCCGCAAAGGTGAA 1320 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1261 GGCAAAGAATTATCCATCCCAGTGGACCAGACATCACATAGTTTTGGCCAAAAAGGTGAA 1320 Query 1321 GAACGTGGGATTCGAAAGGCTGTGAAGACTCCATCTAGTGTTAGTGGGAATGAACTGGCT 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 GAACGTGGGATTCGAAAGGCTGTGAAGACTCCATCTAGTGTTAGTGGGAATGAACTGGCT 1380 Query 1381 AGGTTTAGTGATCCTCCTGGGGATGCTTCTTTGCATGATTTATTTCACCCATTGGATAAA 1440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1381 AGGTTTAGTGATCCTCCTGGGGATGCTTCTTTGCATGATTTGTTTCATCCATTGGATAAA 1440 Query 1441 GTGTCTGAGGGAAAACCAAATGAAGCCTCAACATCCATGCCTACGTCAAATGTCAACCAA 1500 || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1441 GTTTCTGAGGGAAAACCAAATGAAGCCTCAACATCGATGCCTACATCAAATGTCAACCAA 1500 Query 1501 GGTGATTCTCCTGTTGCAGATGGTGGAAAGAATGATCTGGCTACAAAATTGAGGGCTACA 1560 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 GGTGATTCTCCTGTCGCAGATGGTGGAAAGAATGATCTGGCTACAAAATTGAGGGCTACA 1560 Query 1561 ATTGCTCAGAAGCAAATGGAGGGGGAAACAGGGCACTCAAATGATGGTGGTGATCTTTTT 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 ATTGCTCAGAAGCAAATGGAGGGGGAAACAGGGCACTCAAATGATGGTGGTGATCTTTTT 1620 Query 1621 CGCTTGATGATGGGTGTTTTGAAAGATGATGTTATTGACATTGATGGCTTGGTATTTGAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 CGCTTGATGATGGGTGTTTTGAAAGATGATGTTATTGACATTGATGGCTTGGTATTTGAT 1680 Query 1681 GAAAAAGTGCCCGCGGAGAATCTTTTTCCTCTGCAGGCAGTCGAGTTCAGCAGACTGGTC 1740 ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct 1681 GAAAAGGTGCCCGCGGAAAATCTTTTCCCTCTGCAGGCAGTTGAGTTCAGCAGATTGGTC 1740 Query 1741 AGCTCCTTGAGGCCAGATGAGTCAGAAGATGCAATAGTATCTTCTTGTCAGAAACTTGTT 1800 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 AGCTCCTTAAGGCCCGATGAGTCAGAAGATGCAATAGTATCTTCTTGTCAGAAACTTGTT 1800 Query 1801 GCCATGTTTCGTCAGAGACCTGAGCAGAAAGTAGTATTTGTGACACAGCATGGTTTCCTG 1860 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 GCCATGTTTCGTCAGAGACCTGAGCAGAAAGCAGTATTTGTGACACAGCATGGTTTCCTG 1860 Query 1861 CCTCTAATGGATCTACTCGATATTCCTAAATCTCGAGTAATATGTGCTGTGCTGCAGCTG 1920 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 1861 CCTCTTATGGATCTACTCGATATTCCTAAATCTCGAGTAATATGTACCGTGCTGCAGCTG 1920 Query 1921 ATAAACGAAATTATTAAAGATAACACTGACTTCCAGGAAAATGCTTGTCTTGTTGGCCTT 1980 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1921 ATAAACGAAATTATTAAAGATAATACTGACTTCCAGGAAAATGCTTGTCTTGTTGGCCTC 1980 Query 1981 ATTCCTGTTGTAATGAGTTTTGCTGGTCCTGAGAGGGATCGTTCTCGCGAAATTCGTAAA 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1981 ATTCCTGTTGTAATGAGTTTTGCTGGTCCTGAGAGGGATCGTTCTCGCGAAATTCGTAAA 2040 Query 2041 GAAGCAGCTTACTTCTTGCAGCAGCTTTGTCAGTCAAGCCCCTTGACGTTGCAAATGTTC 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 2041 GAAGCAGCTTACTTCTTGCAGCAGCTTTGTCAGTCAAGAATTTTAACGTTGCAAATGTTC 2100 Query 2101 ATAGCTTGCCGTGGAATACCCGTTTTGGTGGGATTTCTTGAAGCAGATTATGCCAAATAC 2160 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2101 ATAGCTTGCCGTGGAATACCTGTTTTGGTGGGATTTCTTGAAGCAGATTATGCCAAATAC 2160 Query 2161 AGGGAGATGGTTCACTTGGCTATTGATGGGATGTGGCAGGTATTTAAACTCAAAAGATCC 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2161 AGGGAGATGGTTCACTTGGCTATTGATGGGATGTGGCAGGTATTTAAACTCAAAAGATCC 2220 Query 2221 ACCCCAAGAAATGATTTCTGCCGTATAGCTGCAAAGAATGGAATTCTTCTGAGGCTAATC 2280 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2221 ACCCCAAGAAATGATTTCTGCCGTATAGCAGCAAAGAATGGAATTCTTCTGAGGCTAATC 2280 Query 2281 AACACTCTTTATAGCTTGAATGAGGCAACCCGGCTGGCTTCTATATCAGGGGGC-C--T- 2336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 2281 AACACTCTTTATAGCTTGAATGAGGCAACCCGGCTGGCTTCTATATCAGGGGGCGCGATT 2340 Query 2337 G-G-ATGGTCAAGCTCCACGAGTGCGCTCTGGTCAACTTGACCCTAACAATCCTATTTTT 2394 | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2341 GTGGATGGTCAAGCTCCACGAGCGCGCTCTGGTCAACTTGACCCTAACAATCCTATTTTT 2400 Query 2395 GGTCAAAATGAGACTTCTTCACTCAGTATGATTGATCAGCCTGATGTATTGAAAACTAGG 2454 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2401 GGTCAAAATGAGACTTC---ACTCAGTATGATTGATCAGCCTGATGTATTGAAAACCAGG 2457 Query 2455 CATGGGGGTGGTGAAGAGCCTTCTCATGCTTCAACCTCAAATTCTCAAAGATCAGATGTC 2514 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2458 CATGGGGTTGGTGAAGAGCCTTCTCATGCTTCAACCTCAAATTCTCAAAGATCAGATGTC 2517 Query 2515 CATCAACCAGATGCTTTGCACCCAGATGGTGATAAGCCTAGAGTAAGCAGTGTTGCACCA 2574 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2518 CATCAACCAGATGCTTTGCACCCAGATGGTGATAGGCCTAGAGTAAGCAGTGTTGCACCA 2577 Query 2575 GATGCCTCAACCTCTGGCACAGAAGATGTTAGACAACAGCATCGAATATCTCTTTCCGCC 2634 ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2578 GATGCCTCAACGTCCGGCACAGAAGATATTAGACAACAGCATCGAATATCTCTCTCCGCC 2637 Query 2635 AATAGGACATCGACAGATAAGCTTCAGAAGCTGGCAGAGGGCGCCTCTAATGGTTTTCCT 2694 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2638 AATAGGACATCGACAGATAAGCTTCAGAAGCTGGCAGAGGGCGCCTCTAATGGTTTTCCT 2697 Query 2695 GTTACTCAGACAGAACAAGTTCGACCTTTGCTTAGCTTGTTGGATAAAGAACCCCCTTCA 2754 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2698 GTTACTCAGACAGAACAAGTTCGACCTTTGCTTAGCTTGTTGGAGAAAGAACCCCCTTCA 2757 Query 2755 AGACATTATTCTGGTCAACTGGATTATGTTAAGCATATCACTGGCATAGAGAGACATGAA 2814 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2758 AGACATTATTCTGGTCAACTGGATTATGTTAAGCATATTACTGGCATAGAGAGACATGAA 2817 Query 2815 AGTAGACTTCCTCTTTTGCATGGATCAAATGAAAAGAAAAACAACGGAGACCTAGATTTT 2874 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2818 AGTAGACTTCCTCTTTTGCATGGATCAAATGAAAAGAAAAACAACGGAGACCTAGATTTT 2877 Query 2875 CTGATGGCTGAATTTGCAGAGGTCTCTGGACGTGGAAAGGAAAATGGAAGTCTTGATACT 2934 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 2878 CTGATGGCTGAATTTGCAGAGGTCTCTGGACGTGGAAAGGAAAATGGAAATGTTGATACT 2937 Query 2935 ACGACTAGATATCCCAGTAAAACAATGACAAAGAAGGTTCTGGCTATTGAAGGAGTTGCT 2994 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2938 ACGACTAGATATCCCAGTAAAACAATGACAAAGAAGGTTCTGGCTATTGAAGGAGTTGCT 2997 Query 2995 TCAACATCTGGGATTGCATCTCAGACAGCATCTGGAGTACTGTCAGGTTCGGGTGTTCTA 3054 || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2998 TCTACGTCCGGGATTGCATCTCAGACAGCATCTGGAGTACTATCAGGTTCGGGTGTTCTA 3057 Query 3055 AACGCTAGACCTGGAAGTGCCACATCATCTGGTTTACTTGCCCATATGGTCTCTACGCTG 3114 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3058 AATGCTAGACCTGGAAGTGCCACATCATCTGGTTTACTTGCCCATATGGTCTCTACCCTG 3117 Query 3115 AGTGCAGATGTTGCAAGGGAATACTTGGAGAAAGTTGCTGACCTGCTTCTTGAATTTGCT 3174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3118 AGTGCAGATGTTGCAAGGGAATACTTGGAGAAAGTTGCTGACCTGCTTCTTGAATTTGCT 3177 Query 3175 CGAGCTGATACGACAGTAAAGTCATATATGTGCAGCCAAAGCTTACTCAGTCGTCTTTTT 3234 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3178 CGAGCTGATACGACAGTAAAGTCATATATGTGCAGCCAAAGCTTACTCAGTCGTCTTTTC 3237 Query 3235 CAGATGTTCAACCGTGTAGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAGTGCACAAATCAT 3294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3238 CAGATGTTCAACCGTGTAGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAGTGCACAAATCAT 3297 Query 3295 TTATCAACTGATCCAAATTGCTTGGAGAATCTGCAGCGTGCAGATGCAATTAAGCATTTG 3354 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3298 TTATCCACTGATCCAAATTGCTTGGAGAATCTGCAGCGTGCAGATGCAATTAAGCATTTG 3357 Query 3355 ATCCCCAACCTTGAGCTTAAGGATGGGCATCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTGCTT 3414 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3358 ATACCCAACCTTGAGCTTAAGGATGGGCACCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTGCTT 3417 Query 3415 AGTGCACTATTCAACCTGTGCAAGATAAACAAGAGGAGGCAGGAACAAGCGGCTGAAAAC 3474 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3418 AGTGCACTATTCAACCTGTGCAAGATAAACAAAAGGAGGCAGGAACAAGCGGCTGAAAAC 3477 Query 3475 GGAATCATTCCGCATCTGATGCTTTTCATTATGTCAGATTCTCCTCTGAAACAGTATGCA 3534 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3478 GGAATCATTCCGCATCTGATGCTTTTCATCATGTCAGATTCTCCTCTGAAACAGTATGCA 3537 Query 3535 TTGCCACTACTCTGCGATATGGCTCATGCATCTCGAAATTCAAGAGAACAGTTAAGGGCC 3594 ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3538 TTGCCACTATTATGTGATATGGCTCATGCATCTCGGAATTCAAGAGAGCAGTTAAGGGCC 3597 Query 3595 CACGGTGGTCTTGATGTTTACCTGAGTTTACTCGATGATGAATACTGGTCCGTGATAGCC 3654 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3598 CACGGGGGTCTGGATGTTTACCTGAGTTTACTCGATGATGAATATTGGTCCGTGATAGCC 3657 Query 3655 TTAGATTCAATCGCTGTTTGCTTGGCGCAAGACAATGACAACCGCAAGGTAGAGCAGGCA 3714 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3658 TTAGATTCTATCGCTGTTTGCTTGGCGCAAGACAATGACAACCGCAAGGTGGAGCAGGCC 3717 Query 3715 TTGCTCAAGCAAGATGCAATTCAGAAATTAGTTGACTTCTTCCAGAGCTGCCCAGAGAGA 3774 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3718 TTGCTCAAGCAAGATGCAATTCAGAAATTAGTTGACTTCTTCCAGAGCTGCCCAGAGAGA 3777 Query 3775 CACTTCGTGCACATATTGGAGCCATTCTT-AAAGATTATCACGAAATCATATCGGATCAA 3833 ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3778 CACTTTGTGCATATATTGGAGCCATTCTTGAAA-ATTATCACGAAATCATATCGGATCAA 3836 Query 3834 TAAGACATTAGCTGTAAATGGATTGACTCCACTGCTTATTTCAAGGCTAGACCATCAAGA 3893 |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3837 TAAGACATTAGCTGTAAATGGATTGACTCCTTTACTTATTTCAAGGCTAGACCATCAAGA 3896 Query 3894 TGCGATTGCTCGACTTAACCTCCTAAAACTCATCAAGGCTGTTTATGAACATCATCCACG 3953 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 3897 TGCGATTGCTAGACTCAACCTCCTAAAACTCATCAAGGCTGTTTACGAACATCATCCGCG 3956 Query 3954 GCCGAAACAGCTGATCGTAGAGAACGACCTTCCTCAAAAACTGCAGAATCTAATAGAAGA 4013 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 3957 GCCGAAACAGCTGATCGTAGAGAACGACCTCCCTCAGAAACTGCAGAATCTGATAGAAGA 4016 Query 4014 ACGACGAGATGGACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAACAAATGGCAACATCTCT 4073 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4017 ACGACGAGATGGACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAGCAAATGGCAACATCTCT 4076 Query 4074 CCTCAAAGCACTTCACATCAACACAATATTGTGAGTCCACCAAAACGATAATATCCCTTG 4133 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| | | Sbjct 4077 CCTCAAAGCACTTCACATTAACACAATATTGTGAGTCCA--AAACC-AG--TAT---T-G 4127 Query 4134 GGGGACTGTACATTTACTCCCATTTTTCCAAGAAGAAA-GTG-C-C-TGTTCTTCTTC-- 4187 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||| Sbjct 4128 GG--ACTGTACATTTTCTCCCATTTTTCCAAGAAGAAAAGTGTCTCATCTTCTTCTTCTT 4185 Query 4188 C--CT-T-CCATTTACAAAA-TGTGAAACTTAAAA-GATTTGTAATTGTTTAGTTGTGGC 4241 | || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | Sbjct 4186 CTTCTCTTCCATTTACAAAAATGTGAAACTTAAAAAGATTTGTAATTGTTT--TT-T--- 4239 Query 4242 TTCTCTTGTGTTTTTAGTCCCTCGAGAGATGCCAACACTTGTGGTTTTTGTAATATATAT 4301 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 4240 T--------------AGTCCCTCGAGAGATGCCAACACTTGTGGTTTTTGTAAAATTTAT 4285 Query 4302 ACTGCTCTTGC 4312 | ||||||||| Sbjct 4286 ATTGCTCTTGC 4296 > Ahg903697 jgi|Araly1|903697|Al_scaffold_0003_825 Length=4113 Score = 5048 bits (2733), Expect = 0.0 Identities = 3705/4164 (89%), Gaps = 108/4164 (3%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCGCGGCAAATGACGTCATCTCAGTTTCACAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAT 60 |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCGCGACAGATGACGTCATCTCAGTTTCATAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAT 60 Query 61 ATGCTGGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGGTCGAGTTTATAAAGGATTAGACTTG 120 ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || Sbjct 61 ATGCTTGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGCTCGGGTTTATATAGGATTAGACCTG 120 Query 121 GAGAATGGTGACTTTGTGGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAATATTGTTCAAGAGGAT 180 |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 121 GAGAATTGTGACTTTGTTGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAATATTGGTCAAGAGGAT 180 Query 181 CTTAACACCATTATGCAAGAAATTGATCTTTTGAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTG 240 ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CTTAACACCATCATGCAAGAAATCGATCTCCTAAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTC 240 Query 241 AAGTATCTTGGGTCGTCGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTTTGGAGTACGTTGAG 300 ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct 241 AAGTATCTTGGATCGTTGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTCTGGAGTATGTTGAG 300 Query 301 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCAAATAAATTTGGACCTTTCCCAGAATCTTTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| Sbjct 301 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCAAATAAATTTGGACCTTTCCCTGAGTCGTTG 360 Query 361 GTGGCTGTTTACATTGCTCAGGTCTTGGAAGGTTTGGTATATCTGCATGAGCAGGGTGTT 420 ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GTGACTGTTTACATTGCACAGGTCTTGGAAGGTTTAGTATATCTGCATGAGCAGGGTGTC 420 Query 421 ATACACCGTGATATTAAGGGTGCAAATATTTTGACGACAAAGGAGGGTCTTGTGAAGCTT 480 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| Sbjct 421 ATACATCGTGATATCAAGGGTGCAAATATTTTGACAACCAAGGAGGGCCTTGTTAAGCTT 480 Query 481 GCTGACTTTGGAGTTGCCACTAAACTTAACGAGGCTGATGTT-AATACTCACTCGGTGGT 539 ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| Sbjct 481 GCTGATTTTGGAGTTGCCACAAAACTCAACGAGGCTGAT-TTCAACACTCACTCAGTGGT 539 Query 540 TGGAACTCCTTACTGGATGGCTCCTGAGGTTATTGAAATGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTC 599 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 540 CGGAACTCCTTACTGGATGGCTCCGGAGGTTATTGAATTGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTC 599 Query 600 TGACATTTGGAGCGTTGGATGCACTGTTATCGAACTTCTGACATGTGTACCTCCTTACTA 659 |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct 600 TGACATTTGGAGTGTTGGGTGCACTATTATTGAACTTTTGACGTGTGTACCTCCTTACTA 659 Query 660 TGATCTGCAACCCATGCCAGCCCTCTTTCGTATTGTTCAGGATGACAACCCTCCTATTCC 719 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||| Sbjct 660 TGATCTGCAACCCATGCCAGCCCTCTATCGCATTGTTCAGGATGATACCCCTCCCATTCC 719 Query 720 TGATAGTCTTTCTCCAGATATTACGGACTTTCTACGACAGTGCTTCAAGAAGGATTCCAG 779 ||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 720 TGATAGTCTATCTCCCGATCTTACAGACTTCCTACGACTGTGCTTCAAGAAGGATTCCAG 779 Query 780 GCAGAGGCCTGATGCAAAGACACTGCTCTCTCACCCTTGGATACGAAACTCTAGACGAGC 839 |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | || ||| Sbjct 780 GCAGAGGCCTGATGCAAAGACACTTCTCTCACACCCTTGGATACGTAACTCAAAACAAGC 839 Query 840 TTTGCAGTCATCACTTCGGCATAGTGGCACCATCAAATATATGAAGGAAGCC-ACTGCAA 898 |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| Sbjct 840 ATTGCGGTCATCACTTCGGCATAGTGGAACCATCAGATATATGAAGGAACCCGA-TTCAA 898 Query 899 GTTCAGAGAAGGATGATGAAGGTAGTCAAGATGCAGCAGAAAGCCTTTCAGGAGAAAATG 958 ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||| | Sbjct 899 GTTCAGAGAAGGATGATGAAGGTAGTCAAGAAGTAGCTGAAAGCTTTTCAGCAGAAAAAG 958 Query 959 TGGGA-AT-ATCAAAAACTGACTCGAAAAGCAAATTACCTCTGGTAGGGGTGTCGAGTTT 1016 | ||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||| Sbjct 959 T-GGAGGTGA-CAAAAACTAACTCGAAAAGCAAATTGCCTGTTATAGGTGTGGCGAGTTA 1016 Query 1017 TAGGTCTGAGAAAGATCAGTCGACACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAACAGATAATTC 1076 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || | Sbjct 1017 TAGGTCTGAGAAAGATCAGTCTTCACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAAC-G--GATGC 1073 Query 1077 AGAAGATGATATT-A-T--G-TC-AGAT-C-A-A--GT-T---C-C--T-A--C-ACT-G 1113 ||||||| || || | | | || || | | | | || | | | | | | || | Sbjct 1074 AGAAGATTATCTTAATTCAGTTCAAGGTCCTACATTGTCTACGCACGATCAGTCTTCTCG 1133 Query 1114 TCGATCC---A--TG-AG-AAATCTTCGGATGCTAAGGGGACACCTCAAGATGTATCAGA 1166 || |||| | || || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct 1134 TCAATCCGGTACTTGCAGTATTTCTTCGGATGCAAAGGGGACATCTCAAGATGTATTAGA 1193 Query 1167 CTTTCATGGGAAATCTGAACGTGGTGAAACACCTGAAAATCTTGTAACGGAAACTTCTGA 1226 |||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||| Sbjct 1194 GAACCATGAGACATCTGAACGTGATGAAATACCTGGAAATCTTGAAAAGGAAGCTTCTGA 1253 Query 1227 AGCTAGAAAAAATACTTCAGCAATAAAGCACGTTGGCAAAGAATTA-TCCATCCCA-GTG 1284 || ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| || || | ||| ||| Sbjct 1254 AGGTAGAAGGAATACTTTAGCAACAAAGCTGGTTGGAAAAGAA-TATTCTGT-CCAGGTG 1311 Query 1285 GAC-CAGACATCACATAGTTTTGGCCGCAAAGGTGAAGAACGTGGGATTCGAAAGGCTGT 1343 | | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 1312 G-CGCAGTCATCACATAGTTTTAGCCAAAAAGGTGAAG---TTGGGCTTCGAAAGGCTGT 1367 Query 1344 GAAGACTCCATCTAGTGTTAGTGGGAATGAACTGGCTAGGTTTAGTGATCCTCCTGGGGA 1403 |||||||||||||||| || |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| Sbjct 1368 GAAGACTCCATCTAGTTTTGGTGGGAATGAACTGACCAGATTCAGTGATCCTCCTGGGGA 1427 Query 1404 TGCTTCTTTGCATGATTTATTTCACCCATTGGATAAAGTGT-CTGAGGGAAAACCAAATG 1462 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 1428 TGCTTCTTTGCATGATTTGTTTCATCCATTGGATAAAGT-TCCTGAGGGAAAACCAAATG 1486 Query 1463 AAGCCTCAACATCCATGCCTACGT-CAAATGTCAACCAAGGTGATTCTCCTGTTGCAGAT 1521 ||||||||||||| | |||||| | ||||||| || || ||||||||||||| ||||||| Sbjct 1487 AAGCCTCAACATCGACGCCTAC-TACAAATGTAAATCAGGGTGATTCTCCTGCTGCAGAT 1545 Query 1522 GGTGGAAAGAATGATCTGGCTACAAAATTGAGGGCTACAATTGCTCAGAAGCAAATGGAG 1581 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1546 GGTGGAAAGAATGATCTGGCAACGAAATTGAGGGCTAGAATTGCTCAGAAGCAAATGGAG 1605 Query 1582 GGGGAAACAGGGCACTCA-AATGATGGTGGTGATCTTTTTCGCTTGATGATGGGTGTTTT 1640 || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 1606 GGTGAAACGGGGCACTCACAA-GATGGTGGTGATCTTTTCCGCTTAATGATGGGTGTTTT 1664 Query 1641 GAAAGATGATGTTATTGACATTGATGGCTTGGTATTTGATGAAAAAGTGCCCGCGGAGAA 1700 ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1665 GAAAGATGATGTTCTTAACATCGATGACTTGGTATTTGATGAAAAAGTGCCCCCGGAGAA 1724 Query 1701 TCTTTTTCCTCTGCAGGCAGTCGAGTTCAGCAGACTGGTCAGCTCCTTGAGGCCAGATGA 1760 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 1725 TCTTTTCCCTCTGCAGGCAGTCGAGTTCAGCAGATTGGTGAGCTCCTTAAGGCCAGATGA 1784 Query 1761 GTCAGAAGATGCAATAGTATCTTCTTGTCAGAAACTTGTTGCCATGTTTCGTCAGAGACC 1820 |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1785 ATCAGAAGATGCAATAGTAACTTCTTCTTTGAAACTTGTTGCCATGTTTCGTCAGAGACG 1844 Query 1821 TGAGCAGAAAGTAGTATTTGTGACACAGCATGGTTTCCTGCCTCTAATGGATCTACTCGA 1880 || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 1845 TGGGCAGAAAGCAGTATTTGTGACACAGCATGGTTTCCTCCCTCTAATGGATCTACTTGA 1904 Query 1881 TATTCCTAAATCTCGAGTAATATGTGCTGTGCTGCAGCTGATAAACGAAATTATTAAAGA 1940 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 1905 TATTCCTAAATCTCGAGTAATATGTGCCGTGCTGCAGCTGATAAACGAAATTGTAAAAGA 1964 Query 1941 TAACACTGACTTCCAGGAAAATGCTTGTCTTGTTGGCCTTATTCCTGTT-GTAATGAGTT 1999 ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| Sbjct 1965 TAATACCGACTTCCTGGAAAATGCTTGTCTCGTTGGTCTTATTCCT-TTGGTAATGAGTT 2023 Query 2000 TTGCTGGTCCTGAGAGGGATCGTTCTCGCGAAATTCGTAAAGAAGCAGCTTACTTCTTGC 2059 |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 2024 TTGCTGGTTTTGAGAGGGATCGATCTCGAGAAATTCGTAAGGAAGCAGCCTACTTCTTGC 2083 Query 2060 AGCAGCTTTGTCAGTCAAGCCCCTTGACGTTGCAAATGTTCATAGCTTGCCGTGGAATAC 2119 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2084 AGCAGATTTGTCAGTCAAGCCCCTTGACGTTGCAAATGTTCATAGCTTGCCGTGGAATAC 2143 Query 2120 CCGTTTTGGTGGGATTTCTTGAAGCAGATTATGCCAAATACAGGGAGATGGTTCACTTGG 2179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2144 CCGTTTTGGTGGGATTTCTTGAAGCAGATTATGCCAAACACAGGGAGATGGTTCACTTGG 2203 Query 2180 CTATTGATGGGATGTGGCAGGTATTTAAACTCAAAAGATCCACCCCAAGAAATGATTTCT 2239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 2204 CTATTGATGGGATGTGGCAGGTATTTAAACTCAAAAGATCCACCTCTAGAAATGATTTCT 2263 Query 2240 GCCGTATAGCTGCAAAGAATGGAATTCTTCTGAGGCTAATCAACACTCTTTATAGCTTGA 2299 ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2264 GCCGTATTGCTGCAAAGAATGGAATTCTTCTTAGGCTAGTCAACACTCTTTATAGCTTGA 2323 Query 2300 ATGAGGCAACCCGGCTGGCTTCTATATCAGGGGGC-C-TGGAT---GG-T---CAAGCTC 2350 ||||||||| || ||||||||||||||||||| | | | ||| || | ||| ||| Sbjct 2324 GTGAGGCAACTCGACTGGCTTCTATATCAGGGGACGCATTGATTTTGGATAGTCAAACTC 2383 Query 2351 CACGAGTGCGCTCTGGTCAACTTGACCCTAACAATCCTATTTTTGGTCAAAATGAGACTT 2410 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| Sbjct 2384 CACGAGCACGCTCTGGTCAACTTGACCCTAACAATCCTATCTTTAGTCAGCGTGAGACTT 2443 Query 2411 CTTCACTCAGTATGATTGATCAGCCTGATGTATTGAAAACTAGGCATGGGGGTGGTGAAG 2470 | | || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2444 CA-C-CT-AGTGTGATTGATCATCCTGATGGGTTGAAAACTAGGAATGGGGGTGGTGAAG 2500 Query 2471 AGCCTTCTCATGCTTCAACCTCAAATTCTCAAAGATCAGATGTCCATCAACCAGATGCTT 2530 ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 2501 AGCCTTCTCATGCTTTAATTTCAAATTCTCAAAGATCAGATGTCCATCAACCCGATGCCT 2560 Query 2531 TGCACCCAGATGGTGATAAGCCTAGAGTAAGCAGTGTTGCACCAGATGCCTCAACCTCTG 2590 |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | Sbjct 2561 TGCACCCAGATGGTGATAGGCCTAGATTAAGCAGTGTTGCAGCAGATGCC---------G 2611 Query 2591 GCACAGAAGATGTTAGACAACAGCATCGAATATCTCTTTCCGCCAATAGGACATCGACAG 2650 || |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||| |||| Sbjct 2612 -CA--GAAGATGTTATACAACAACATAGGATATCTCTTTCTGCCAATATAACATCAACAG 2668 Query 2651 ATAAGCTTCAGAAGCTGGCAGAGGGCGCCTCTAATGGTTTTCCTGTTACTCAGACAGAAC 2710 ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 2669 ATAAGCTTCAGAAACTGGCGGAGGGTGCGTCTAATGGTTTTCCTGTTACTCAGCCAGATC 2728 Query 2711 AAGTTCGACCTTTGCTTAGCTTGTTGGATAAAGAACCCCCTTCAAGACA-TTATTCTGGT 2769 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||| Sbjct 2729 AAGTTCGACCTTTGCTTAGCTTATTGGAGAAAGAGCCCCCTTCAAGAAAATT-TTCTGGT 2787 Query 2770 CAACTGGATTATGTTAAGCATATCACTGGCATAGAGAGACATGAAAGTAGACTTCCTCTT 2829 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2788 CAACTGGATTATGTGAAGCATATCACTGGCATAGAGAGACATGAAAGTAGACTTCCTCTT 2847 Query 2830 TTGCATGGATCAAATGAAAAGAAAAACAACGGAGACCTAGATTTTCTGATGGCTGAATTT 2889 ||| ||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| Sbjct 2848 TTGTATGCATCAGACGAAAAGAAAACCAGTGGAGACCTAGAATTTATAATGGCCGAATTA 2907 Query 2890 GCAG-AGGTCTCTGGACGTGGAAAGGAAAATGGAAGTCTTGATACTACGAC-TAGATATC 2947 |||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | || ||||||| Sbjct 2908 GCAGGAG-TCTCTGGACGTGGAAAGGAAAACGGAAATCTCGATACTGC-ACCTAGATATT 2965 Query 2948 CCAGTAAAACAATGACAAAGAAGGTTCTGGCTATTGAAGGAGTTGCTTCAACATCTGGGA 3007 ||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||| | | ||||| Sbjct 2966 CCAGTAAGACGATGACTAAGAAGGCTATGGCTATTGAAAGAGTCGCTTCTGCGTGTGGGA 3025 Query 3008 TTGCATCTCAGACAGCATCTGGAGTACTGTCAGGTTCGGGTGTTCTAAACGCTAGACCTG 3067 ||||||||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| Sbjct 3026 TTGCATCTCAGACAGTATCTAGTGTTCTGTCAGGTTCAGGTGTTTTAAATGCTAGAGCTG 3085 Query 3068 GAAGTGCCACATCATCTGGTTTACTTGCCCATATGGTCTCTACGCTGAGTGCAGATGT-T 3126 ||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | Sbjct 3086 GAAGTACTACATCATCTGGTTTACTTGCCCAT--G--C-----GCTGAGTGCAGATGTCT 3136 Query 3127 GCAAGGGAATACTTGGAGAAAGTTGCTGACCTGCTTCTTGAATTTGCTCGAGCTGATACG 3186 ||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| Sbjct 3137 -CAATGGATTACTTGGAGAAAGTGGCTGATCTGCTTCTCGAATTTGCCCGAGCTGAAACG 3195 Query 3187 ACAGTAAAGTCATATATGTGCAGCCAAAGCTTACTCAGTCGTCTTTTTCAGATGTTCAAC 3246 |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3196 ACAGTAAAATCATACATGTGCAGCCAGAGCTTACTCAGTCGTCTTTTCCAGATGTTCAAC 3255 Query 3247 CGTGTAGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAGTGCACAAATCATTTATCAACTGAT 3306 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| Sbjct 3256 CGTGTGGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAATGCACCAATCATTTATCCACGGAT 3315 Query 3307 CCAAATTGCTTGGAGAATCTGCAGCGTGCAGATGCAATTAAGCATTTGATCCCCAACCTT 3366 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3316 CCAAATTGCTTGGAAAATCTTCAGCGTGCAGATGCAATTAAGCAATTGATCCCCAACCTT 3375 Query 3367 GAGCTTAAGGATGGGCATCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTGCTTAGTGCACTATTC 3426 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3376 GAACTTAAGGAAGGGCATCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTACTTAGTGCACTATTC 3435 Query 3427 AACCTGTGCAAGATAAACAAGAGGAGGCAGGAACAAGCGGCTGAAAACGGAATCATTCCG 3486 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3436 AACCTCTGCAAGATAAACAAGAGGAGGCAGGAACAAGCGGCTGAAAATGGAATCATTCCG 3495 Query 3487 CATCTGATGCTTTTCATTATGTCAGATTCTCCTCTGAAACAGTATGCATTGCCACTACTC 3546 || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3496 CACCTGATGCTTTTCGTCATGTCGGATTCTCCTCTGAAACAATATGCATTGCCACTACTA 3555 Query 3547 TGCGATATGGCTCATGCATCTCGAAATTCAAGAGAACAGTTAAGGGCCCACGGTGGTCTT 3606 || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3556 TGTGATATGGCTCATGCATCTCGGAATTCAAGAGAGCAGTTAAGGGCCCACGGCGGTCTG 3615 Query 3607 GATGTTTACCTGAGTTTACTCGATGATGAATACTGGTCCGTGATAGCCTTAGATTCAATC 3666 ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3616 GATGTTTACCTAAGTTTACTCGATGATGAATATTGGTCCGTGATAGCCTTGGATTCAATT 3675 Query 3667 GCTGTTTGCTTGGCGCAAGACAATGACAACCGCAAGGTAGAGCAGGCATTGCTCAAGCAA 3726 |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||| || Sbjct 3676 GCTGTTTGCTTGGCGCAAGACATTGACCAC---AAGGTTGAGCAGGCATTTCTCAAGAAA 3732 Query 3727 GATGCAATTCAGAAATTAGTTGACTTCTTCCAGAGCTGCCCAGAGAGACACTTCGTGCAC 3786 ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| Sbjct 3733 GATGCAATTCAGAAATTAGTTAACTTCTTCCAGAACTGTCCAGAAAGACATTTTGTGCAC 3792 Query 3787 ATATTGGAGCCATTCTTAAAGATTATCACGAAATCATAT-CGGATCAATAAGACATTAGC 3845 || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | || |||||||||||||| Sbjct 3793 ATTTTGGAGCCATTCTTGAAGATCATCACGAAATCATCTTCA-ATTAATAAGACATTAGC 3851 Query 3846 -TGTAAATGGATTGACTCCACTGCTTATTTCAAGGCTAGACCATCAAGATGCGATTGCTC 3904 | |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3852 AT-TAAATGGATTGACTCCGCTACTTATTTCAAGACTAGACCACCAAGATGCGATTGCTC 3910 Query 3905 GACTTAACCTCCTAAAACTCATCAAGGCTGTTTATGA-ACATCATCCACGGCCGAAACAG 3963 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||| ||| |||||| Sbjct 3911 GACTTAACCTCCTGAAACTCATTAAGGCTGTTTACGAGA-AGCATCCAAAGCCAAAACAG 3969 Query 3964 CTGATCGTAGAGAACGACCTTCCTCAAAAACTGCAGAATCTAATAGAAGAACGACGAGAT 4023 ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | | Sbjct 3970 CTGATCGTAGAGAACAATCTTCCTCAGAAACTGCAGAATCTGATTGAAGAACGACGTGGT 4029 Query 4024 GGACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAACAAATGGCAACATCTCTCCTCAAAGCA 4083 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4030 GGACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAGCAAATGGCAACATCTCTCCTCAAAGCA 4089 Query 4084 CTTCACATCAACACAATATTGTGA 4107 |||||||||||||| | |||||| Sbjct 4090 CTTCACATCAACACCGTCTTGTGA 4113 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 164637060798 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5