BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G13530.1
Length=4353
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg478740 jgi|Araly1|478740|fgenesh2_kg.3__1441__AT3G13530.1 6996 0.0
Ahg903697 jgi|Araly1|903697|Al_scaffold_0003_825 5048 0.0
> Ahg478740 jgi|Araly1|478740|fgenesh2_kg.3__1441__AT3G13530.1
Length=4296
Score = 6996 bits (3788), Expect = 0.0
Identities = 4159/4331 (96%), Gaps = 54/4331 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGCGGCAAATGACGTCATCTCAGTTTCACAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAT 60
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCGGCAAATGACGTCATCTCAGTTTCATAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAT 60
Query 61 ATGCTGGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGGTCGAGTTTATAAAGGATTAGACTTG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATGCTGGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGGTCGAGTTTATAAAGGATTAGACTTG 120
Query 121 GAGAATGGTGACTTTGTGGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAATATTGTTCAAGAGGAT 180
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 121 GAGAATGGAGACTTTGTGGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAACATTGTTCAAGAGGAT 180
Query 181 CTTAACACCATTATGCAAGAAATTGATCTTTTGAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTG 240
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTTAACACCATAATGCAAGAAATTGATCTTTTGAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTG 240
Query 241 AAGTATCTTGGGTCGTCGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTTTGGAGTACGTTGAG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAGTATCTTGGGTCGTCGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTTTGGAGTACGTTGAG 300
Query 301 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCAAATAAATTTGGACCTTTCCCAGAATCTTTG 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 301 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCAAATAAATTCGGACCTTTCCCAGAATCATTG 360
Query 361 GTGGCTGTTTACATTGCTCAGGTCTTGGAAGGTTTGGTATATCTGCATGAGCAGGGTGTT 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTGGCTGTTTACATTGCTCAGGTCTTGGAAGGTTTGGTATATCTGCATGAGCAGGGTGTC 420
Query 421 ATACACCGTGATATTAAGGGTGCAAATATTTTGACGACAAAGGAGGGTCTTGTGAAGCTT 480
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATACACCGTGATATCAAGGGTGCAAATATTTTGACGACAAAGGAGGGTCTTGTGAAGCTT 480
Query 481 GCTGACTTTGGAGTTGCCACTAAACTTAACGAGGCTGATGTTAATACTCACTCGGTGGTT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 481 GCTGACTTTGGAGTTGCCACTAAACTTAACGAGGCTGATGTTAATACTCACTCAGTGGTT 540
Query 541 GGAACTCCTTACTGGATGGCTCCTGAGGTTATTGAAATGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGAACTCCTTACTGGATGGCTCCTGAGGTTATTGAAATGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTCT 600
Query 601 GACATTTGGAGCGTTGGATGCACTGTTATCGAACTTCTGACATGTGTACCTCCTTACTAT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GACATTTGGAGCGTTGGATGCACTGTTATCGAACTTCTGACATGTGTACCTCCTTACTAT 660
Query 661 GATCTGCAACCCATGCCAGCCCTCTTTCGTATTGTTCAGGATGACAACCCTCCTATTCCT 720
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 661 GATCTGCAACCCATGCCAGCTCTCTTTCGTATTGTTCAGGATGATAACCCTCCTATTCCC 720
Query 721 GATAGTCTTTCTCCAGATATTACGGACTTTCTACGACAGTGCTTCAAGAAGGATTCCAGG 780
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GATAGTCTTTCTCCGGATATTACTGACTTTCTACGACAGTGCTTCAAGAAGGATTCCAGG 780
Query 781 CAGAGGCCTGATGCAAAGACACTGCTCTCTCACCCTTGGATACGAAACTCTAGACGAGCT 840
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 781 CAGAGGCCTGATGCAAAGACGCTACTCTCTCACCCTTGGATACGGAACTCTAGACGAGCA 840
Query 841 TTGCAGTCATCACTTCGGCATAGTGGCACCATCAAATATATGAAGGAAGCCACTGCAAGT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TTGCAGTCATCACTTCGGCATAGTGGCACCATCAAATATATGAAGGAAGCCACTGCAAGT 900
Query 901 TCAGAGAAGGATGATGAAGGTAGTCAAGATGCAGCAGAAAGCCTTTCAGGAGAAAATGTG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 901 TCAGAGAAGGATGATGAAGGTAGTCAAGATGCAGCTGAAAGCCTTTCAGCAGAAAATGTG 960
Query 961 GGAATATCAAAAACTGACTCGAAAAGCAAATTACCTCTGGTAGGGGTGTCGAGTTTTAGG 1020
||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 961 GGAATGTCAAAAAGTGACTCGAAAAGCAAATTACCTCTGCTAGGGGGGTCGAGTTTTAGG 1020
Query 1021 TCTGAGAAAGATCAGTCGACACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAACAGATAATTCAGAA 1080
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TCTGATAAAGATCAGTCTACACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAACAGATAATTCAGAA 1080
Query 1081 GATGATATTATGTCAGATCAAGTTCCTACACTGTCGATCCATGAGAAATCTTCGGATGCT 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GATGATATTATGTCAGATCAAGTTCCTACACTTTCGATCCATGAGAAATCTTCGGATGCG 1140
Query 1141 AAGGGGACACCTCAAGATGTATCAGACTTTCATGGGAAATCTGAACGTGGTGAAACACCT 1200
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1141 AAGGGGACACCTCAAGATGTATCAGAGTTTCATGGGAAATCTGAACGTGTTGAAACACCT 1200
Query 1201 GAAAATCTTGTAACGGAAACTTCTGAAGCTAGAAAAAATACTTCAGCAATAAAGCACGTT 1260
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1201 GAAAATCTTGAAACAGAAACTTCTGAAGCTAGAAAAAATACTTCAGCAAAAAAGCAGGTT 1260
Query 1261 GGCAAAGAATTATCCATCCCAGTGGACCAGACATCACATAGTTTTGGCCGCAAAGGTGAA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1261 GGCAAAGAATTATCCATCCCAGTGGACCAGACATCACATAGTTTTGGCCAAAAAGGTGAA 1320
Query 1321 GAACGTGGGATTCGAAAGGCTGTGAAGACTCCATCTAGTGTTAGTGGGAATGAACTGGCT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GAACGTGGGATTCGAAAGGCTGTGAAGACTCCATCTAGTGTTAGTGGGAATGAACTGGCT 1380
Query 1381 AGGTTTAGTGATCCTCCTGGGGATGCTTCTTTGCATGATTTATTTCACCCATTGGATAAA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1381 AGGTTTAGTGATCCTCCTGGGGATGCTTCTTTGCATGATTTGTTTCATCCATTGGATAAA 1440
Query 1441 GTGTCTGAGGGAAAACCAAATGAAGCCTCAACATCCATGCCTACGTCAAATGTCAACCAA 1500
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1441 GTTTCTGAGGGAAAACCAAATGAAGCCTCAACATCGATGCCTACATCAAATGTCAACCAA 1500
Query 1501 GGTGATTCTCCTGTTGCAGATGGTGGAAAGAATGATCTGGCTACAAAATTGAGGGCTACA 1560
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GGTGATTCTCCTGTCGCAGATGGTGGAAAGAATGATCTGGCTACAAAATTGAGGGCTACA 1560
Query 1561 ATTGCTCAGAAGCAAATGGAGGGGGAAACAGGGCACTCAAATGATGGTGGTGATCTTTTT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 ATTGCTCAGAAGCAAATGGAGGGGGAAACAGGGCACTCAAATGATGGTGGTGATCTTTTT 1620
Query 1621 CGCTTGATGATGGGTGTTTTGAAAGATGATGTTATTGACATTGATGGCTTGGTATTTGAT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 CGCTTGATGATGGGTGTTTTGAAAGATGATGTTATTGACATTGATGGCTTGGTATTTGAT 1680
Query 1681 GAAAAAGTGCCCGCGGAGAATCTTTTTCCTCTGCAGGCAGTCGAGTTCAGCAGACTGGTC 1740
||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 1681 GAAAAGGTGCCCGCGGAAAATCTTTTCCCTCTGCAGGCAGTTGAGTTCAGCAGATTGGTC 1740
Query 1741 AGCTCCTTGAGGCCAGATGAGTCAGAAGATGCAATAGTATCTTCTTGTCAGAAACTTGTT 1800
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 AGCTCCTTAAGGCCCGATGAGTCAGAAGATGCAATAGTATCTTCTTGTCAGAAACTTGTT 1800
Query 1801 GCCATGTTTCGTCAGAGACCTGAGCAGAAAGTAGTATTTGTGACACAGCATGGTTTCCTG 1860
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 GCCATGTTTCGTCAGAGACCTGAGCAGAAAGCAGTATTTGTGACACAGCATGGTTTCCTG 1860
Query 1861 CCTCTAATGGATCTACTCGATATTCCTAAATCTCGAGTAATATGTGCTGTGCTGCAGCTG 1920
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 1861 CCTCTTATGGATCTACTCGATATTCCTAAATCTCGAGTAATATGTACCGTGCTGCAGCTG 1920
Query 1921 ATAAACGAAATTATTAAAGATAACACTGACTTCCAGGAAAATGCTTGTCTTGTTGGCCTT 1980
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 ATAAACGAAATTATTAAAGATAATACTGACTTCCAGGAAAATGCTTGTCTTGTTGGCCTC 1980
Query 1981 ATTCCTGTTGTAATGAGTTTTGCTGGTCCTGAGAGGGATCGTTCTCGCGAAATTCGTAAA 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 ATTCCTGTTGTAATGAGTTTTGCTGGTCCTGAGAGGGATCGTTCTCGCGAAATTCGTAAA 2040
Query 2041 GAAGCAGCTTACTTCTTGCAGCAGCTTTGTCAGTCAAGCCCCTTGACGTTGCAAATGTTC 2100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2041 GAAGCAGCTTACTTCTTGCAGCAGCTTTGTCAGTCAAGAATTTTAACGTTGCAAATGTTC 2100
Query 2101 ATAGCTTGCCGTGGAATACCCGTTTTGGTGGGATTTCTTGAAGCAGATTATGCCAAATAC 2160
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 ATAGCTTGCCGTGGAATACCTGTTTTGGTGGGATTTCTTGAAGCAGATTATGCCAAATAC 2160
Query 2161 AGGGAGATGGTTCACTTGGCTATTGATGGGATGTGGCAGGTATTTAAACTCAAAAGATCC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 AGGGAGATGGTTCACTTGGCTATTGATGGGATGTGGCAGGTATTTAAACTCAAAAGATCC 2220
Query 2221 ACCCCAAGAAATGATTTCTGCCGTATAGCTGCAAAGAATGGAATTCTTCTGAGGCTAATC 2280
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ACCCCAAGAAATGATTTCTGCCGTATAGCAGCAAAGAATGGAATTCTTCTGAGGCTAATC 2280
Query 2281 AACACTCTTTATAGCTTGAATGAGGCAACCCGGCTGGCTTCTATATCAGGGGGC-C--T- 2336
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 2281 AACACTCTTTATAGCTTGAATGAGGCAACCCGGCTGGCTTCTATATCAGGGGGCGCGATT 2340
Query 2337 G-G-ATGGTCAAGCTCCACGAGTGCGCTCTGGTCAACTTGACCCTAACAATCCTATTTTT 2394
| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 GTGGATGGTCAAGCTCCACGAGCGCGCTCTGGTCAACTTGACCCTAACAATCCTATTTTT 2400
Query 2395 GGTCAAAATGAGACTTCTTCACTCAGTATGATTGATCAGCCTGATGTATTGAAAACTAGG 2454
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2401 GGTCAAAATGAGACTTC---ACTCAGTATGATTGATCAGCCTGATGTATTGAAAACCAGG 2457
Query 2455 CATGGGGGTGGTGAAGAGCCTTCTCATGCTTCAACCTCAAATTCTCAAAGATCAGATGTC 2514
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 CATGGGGTTGGTGAAGAGCCTTCTCATGCTTCAACCTCAAATTCTCAAAGATCAGATGTC 2517
Query 2515 CATCAACCAGATGCTTTGCACCCAGATGGTGATAAGCCTAGAGTAAGCAGTGTTGCACCA 2574
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2518 CATCAACCAGATGCTTTGCACCCAGATGGTGATAGGCCTAGAGTAAGCAGTGTTGCACCA 2577
Query 2575 GATGCCTCAACCTCTGGCACAGAAGATGTTAGACAACAGCATCGAATATCTCTTTCCGCC 2634
||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2578 GATGCCTCAACGTCCGGCACAGAAGATATTAGACAACAGCATCGAATATCTCTCTCCGCC 2637
Query 2635 AATAGGACATCGACAGATAAGCTTCAGAAGCTGGCAGAGGGCGCCTCTAATGGTTTTCCT 2694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 AATAGGACATCGACAGATAAGCTTCAGAAGCTGGCAGAGGGCGCCTCTAATGGTTTTCCT 2697
Query 2695 GTTACTCAGACAGAACAAGTTCGACCTTTGCTTAGCTTGTTGGATAAAGAACCCCCTTCA 2754
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2698 GTTACTCAGACAGAACAAGTTCGACCTTTGCTTAGCTTGTTGGAGAAAGAACCCCCTTCA 2757
Query 2755 AGACATTATTCTGGTCAACTGGATTATGTTAAGCATATCACTGGCATAGAGAGACATGAA 2814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2758 AGACATTATTCTGGTCAACTGGATTATGTTAAGCATATTACTGGCATAGAGAGACATGAA 2817
Query 2815 AGTAGACTTCCTCTTTTGCATGGATCAAATGAAAAGAAAAACAACGGAGACCTAGATTTT 2874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2818 AGTAGACTTCCTCTTTTGCATGGATCAAATGAAAAGAAAAACAACGGAGACCTAGATTTT 2877
Query 2875 CTGATGGCTGAATTTGCAGAGGTCTCTGGACGTGGAAAGGAAAATGGAAGTCTTGATACT 2934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 2878 CTGATGGCTGAATTTGCAGAGGTCTCTGGACGTGGAAAGGAAAATGGAAATGTTGATACT 2937
Query 2935 ACGACTAGATATCCCAGTAAAACAATGACAAAGAAGGTTCTGGCTATTGAAGGAGTTGCT 2994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2938 ACGACTAGATATCCCAGTAAAACAATGACAAAGAAGGTTCTGGCTATTGAAGGAGTTGCT 2997
Query 2995 TCAACATCTGGGATTGCATCTCAGACAGCATCTGGAGTACTGTCAGGTTCGGGTGTTCTA 3054
|| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2998 TCTACGTCCGGGATTGCATCTCAGACAGCATCTGGAGTACTATCAGGTTCGGGTGTTCTA 3057
Query 3055 AACGCTAGACCTGGAAGTGCCACATCATCTGGTTTACTTGCCCATATGGTCTCTACGCTG 3114
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3058 AATGCTAGACCTGGAAGTGCCACATCATCTGGTTTACTTGCCCATATGGTCTCTACCCTG 3117
Query 3115 AGTGCAGATGTTGCAAGGGAATACTTGGAGAAAGTTGCTGACCTGCTTCTTGAATTTGCT 3174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3118 AGTGCAGATGTTGCAAGGGAATACTTGGAGAAAGTTGCTGACCTGCTTCTTGAATTTGCT 3177
Query 3175 CGAGCTGATACGACAGTAAAGTCATATATGTGCAGCCAAAGCTTACTCAGTCGTCTTTTT 3234
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3178 CGAGCTGATACGACAGTAAAGTCATATATGTGCAGCCAAAGCTTACTCAGTCGTCTTTTC 3237
Query 3235 CAGATGTTCAACCGTGTAGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAGTGCACAAATCAT 3294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3238 CAGATGTTCAACCGTGTAGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAGTGCACAAATCAT 3297
Query 3295 TTATCAACTGATCCAAATTGCTTGGAGAATCTGCAGCGTGCAGATGCAATTAAGCATTTG 3354
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3298 TTATCCACTGATCCAAATTGCTTGGAGAATCTGCAGCGTGCAGATGCAATTAAGCATTTG 3357
Query 3355 ATCCCCAACCTTGAGCTTAAGGATGGGCATCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTGCTT 3414
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3358 ATACCCAACCTTGAGCTTAAGGATGGGCACCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTGCTT 3417
Query 3415 AGTGCACTATTCAACCTGTGCAAGATAAACAAGAGGAGGCAGGAACAAGCGGCTGAAAAC 3474
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3418 AGTGCACTATTCAACCTGTGCAAGATAAACAAAAGGAGGCAGGAACAAGCGGCTGAAAAC 3477
Query 3475 GGAATCATTCCGCATCTGATGCTTTTCATTATGTCAGATTCTCCTCTGAAACAGTATGCA 3534
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3478 GGAATCATTCCGCATCTGATGCTTTTCATCATGTCAGATTCTCCTCTGAAACAGTATGCA 3537
Query 3535 TTGCCACTACTCTGCGATATGGCTCATGCATCTCGAAATTCAAGAGAACAGTTAAGGGCC 3594
||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3538 TTGCCACTATTATGTGATATGGCTCATGCATCTCGGAATTCAAGAGAGCAGTTAAGGGCC 3597
Query 3595 CACGGTGGTCTTGATGTTTACCTGAGTTTACTCGATGATGAATACTGGTCCGTGATAGCC 3654
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3598 CACGGGGGTCTGGATGTTTACCTGAGTTTACTCGATGATGAATATTGGTCCGTGATAGCC 3657
Query 3655 TTAGATTCAATCGCTGTTTGCTTGGCGCAAGACAATGACAACCGCAAGGTAGAGCAGGCA 3714
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3658 TTAGATTCTATCGCTGTTTGCTTGGCGCAAGACAATGACAACCGCAAGGTGGAGCAGGCC 3717
Query 3715 TTGCTCAAGCAAGATGCAATTCAGAAATTAGTTGACTTCTTCCAGAGCTGCCCAGAGAGA 3774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3718 TTGCTCAAGCAAGATGCAATTCAGAAATTAGTTGACTTCTTCCAGAGCTGCCCAGAGAGA 3777
Query 3775 CACTTCGTGCACATATTGGAGCCATTCTT-AAAGATTATCACGAAATCATATCGGATCAA 3833
||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3778 CACTTTGTGCATATATTGGAGCCATTCTTGAAA-ATTATCACGAAATCATATCGGATCAA 3836
Query 3834 TAAGACATTAGCTGTAAATGGATTGACTCCACTGCTTATTTCAAGGCTAGACCATCAAGA 3893
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3837 TAAGACATTAGCTGTAAATGGATTGACTCCTTTACTTATTTCAAGGCTAGACCATCAAGA 3896
Query 3894 TGCGATTGCTCGACTTAACCTCCTAAAACTCATCAAGGCTGTTTATGAACATCATCCACG 3953
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 3897 TGCGATTGCTAGACTCAACCTCCTAAAACTCATCAAGGCTGTTTACGAACATCATCCGCG 3956
Query 3954 GCCGAAACAGCTGATCGTAGAGAACGACCTTCCTCAAAAACTGCAGAATCTAATAGAAGA 4013
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3957 GCCGAAACAGCTGATCGTAGAGAACGACCTCCCTCAGAAACTGCAGAATCTGATAGAAGA 4016
Query 4014 ACGACGAGATGGACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAACAAATGGCAACATCTCT 4073
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4017 ACGACGAGATGGACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAGCAAATGGCAACATCTCT 4076
Query 4074 CCTCAAAGCACTTCACATCAACACAATATTGTGAGTCCACCAAAACGATAATATCCCTTG 4133
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||| | |
Sbjct 4077 CCTCAAAGCACTTCACATTAACACAATATTGTGAGTCCA--AAACC-AG--TAT---T-G 4127
Query 4134 GGGGACTGTACATTTACTCCCATTTTTCCAAGAAGAAA-GTG-C-C-TGTTCTTCTTC-- 4187
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||
Sbjct 4128 GG--ACTGTACATTTTCTCCCATTTTTCCAAGAAGAAAAGTGTCTCATCTTCTTCTTCTT 4185
Query 4188 C--CT-T-CCATTTACAAAA-TGTGAAACTTAAAA-GATTTGTAATTGTTTAGTTGTGGC 4241
| || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |
Sbjct 4186 CTTCTCTTCCATTTACAAAAATGTGAAACTTAAAAAGATTTGTAATTGTTT--TT-T--- 4239
Query 4242 TTCTCTTGTGTTTTTAGTCCCTCGAGAGATGCCAACACTTGTGGTTTTTGTAATATATAT 4301
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 4240 T--------------AGTCCCTCGAGAGATGCCAACACTTGTGGTTTTTGTAAAATTTAT 4285
Query 4302 ACTGCTCTTGC 4312
| |||||||||
Sbjct 4286 ATTGCTCTTGC 4296
> Ahg903697 jgi|Araly1|903697|Al_scaffold_0003_825
Length=4113
Score = 5048 bits (2733), Expect = 0.0
Identities = 3705/4164 (89%), Gaps = 108/4164 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGCGGCAAATGACGTCATCTCAGTTTCACAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAT 60
|||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCGACAGATGACGTCATCTCAGTTTCATAAATCAAAGACTCTCGACAACAAATAT 60
Query 61 ATGCTGGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGGTCGAGTTTATAAAGGATTAGACTTG 120
||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||
Sbjct 61 ATGCTTGGAGATGAAATTGGTAAAGGAGCTTATGCTCGGGTTTATATAGGATTAGACCTG 120
Query 121 GAGAATGGTGACTTTGTGGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAATATTGTTCAAGAGGAT 180
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 121 GAGAATTGTGACTTTGTTGCCATTAAACAAGTCTCTTTGGAAAATATTGGTCAAGAGGAT 180
Query 181 CTTAACACCATTATGCAAGAAATTGATCTTTTGAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTG 240
||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTTAACACCATCATGCAAGAAATCGATCTCCTAAAGAACTTGAACCATAAAAACATTGTC 240
Query 241 AAGTATCTTGGGTCGTCGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTTTGGAGTACGTTGAG 300
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 241 AAGTATCTTGGATCGTTGAAGACAAAGACTCACCTTCACATTATTCTGGAGTATGTTGAG 300
Query 301 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCAAATAAATTTGGACCTTTCCCAGAATCTTTG 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||
Sbjct 301 AATGGCTCTCTTGCAAACATTATTAAACCAAATAAATTTGGACCTTTCCCTGAGTCGTTG 360
Query 361 GTGGCTGTTTACATTGCTCAGGTCTTGGAAGGTTTGGTATATCTGCATGAGCAGGGTGTT 420
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTGACTGTTTACATTGCACAGGTCTTGGAAGGTTTAGTATATCTGCATGAGCAGGGTGTC 420
Query 421 ATACACCGTGATATTAAGGGTGCAAATATTTTGACGACAAAGGAGGGTCTTGTGAAGCTT 480
||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||
Sbjct 421 ATACATCGTGATATCAAGGGTGCAAATATTTTGACAACCAAGGAGGGCCTTGTTAAGCTT 480
Query 481 GCTGACTTTGGAGTTGCCACTAAACTTAACGAGGCTGATGTT-AATACTCACTCGGTGGT 539
||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||
Sbjct 481 GCTGATTTTGGAGTTGCCACAAAACTCAACGAGGCTGAT-TTCAACACTCACTCAGTGGT 539
Query 540 TGGAACTCCTTACTGGATGGCTCCTGAGGTTATTGAAATGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTC 599
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CGGAACTCCTTACTGGATGGCTCCGGAGGTTATTGAATTGTCAGGAGTTTGTGCTGCTTC 599
Query 600 TGACATTTGGAGCGTTGGATGCACTGTTATCGAACTTCTGACATGTGTACCTCCTTACTA 659
|||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 600 TGACATTTGGAGTGTTGGGTGCACTATTATTGAACTTTTGACGTGTGTACCTCCTTACTA 659
Query 660 TGATCTGCAACCCATGCCAGCCCTCTTTCGTATTGTTCAGGATGACAACCCTCCTATTCC 719
|||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||
Sbjct 660 TGATCTGCAACCCATGCCAGCCCTCTATCGCATTGTTCAGGATGATACCCCTCCCATTCC 719
Query 720 TGATAGTCTTTCTCCAGATATTACGGACTTTCTACGACAGTGCTTCAAGAAGGATTCCAG 779
||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TGATAGTCTATCTCCCGATCTTACAGACTTCCTACGACTGTGCTTCAAGAAGGATTCCAG 779
Query 780 GCAGAGGCCTGATGCAAAGACACTGCTCTCTCACCCTTGGATACGAAACTCTAGACGAGC 839
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | || |||
Sbjct 780 GCAGAGGCCTGATGCAAAGACACTTCTCTCACACCCTTGGATACGTAACTCAAAACAAGC 839
Query 840 TTTGCAGTCATCACTTCGGCATAGTGGCACCATCAAATATATGAAGGAAGCC-ACTGCAA 898
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | | |||
Sbjct 840 ATTGCGGTCATCACTTCGGCATAGTGGAACCATCAGATATATGAAGGAACCCGA-TTCAA 898
Query 899 GTTCAGAGAAGGATGATGAAGGTAGTCAAGATGCAGCAGAAAGCCTTTCAGGAGAAAATG 958
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||| |
Sbjct 899 GTTCAGAGAAGGATGATGAAGGTAGTCAAGAAGTAGCTGAAAGCTTTTCAGCAGAAAAAG 958
Query 959 TGGGA-AT-ATCAAAAACTGACTCGAAAAGCAAATTACCTCTGGTAGGGGTGTCGAGTTT 1016
| ||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||
Sbjct 959 T-GGAGGTGA-CAAAAACTAACTCGAAAAGCAAATTGCCTGTTATAGGTGTGGCGAGTTA 1016
Query 1017 TAGGTCTGAGAAAGATCAGTCGACACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAACAGATAATTC 1076
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |
Sbjct 1017 TAGGTCTGAGAAAGATCAGTCTTCACCCAGTGATCTTGGTGAAGAAGGAAC-G--GATGC 1073
Query 1077 AGAAGATGATATT-A-T--G-TC-AGAT-C-A-A--GT-T---C-C--T-A--C-ACT-G 1113
||||||| || || | | | || || | | | | || | | | | | | || |
Sbjct 1074 AGAAGATTATCTTAATTCAGTTCAAGGTCCTACATTGTCTACGCACGATCAGTCTTCTCG 1133
Query 1114 TCGATCC---A--TG-AG-AAATCTTCGGATGCTAAGGGGACACCTCAAGATGTATCAGA 1166
|| |||| | || || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1134 TCAATCCGGTACTTGCAGTATTTCTTCGGATGCAAAGGGGACATCTCAAGATGTATTAGA 1193
Query 1167 CTTTCATGGGAAATCTGAACGTGGTGAAACACCTGAAAATCTTGTAACGGAAACTTCTGA 1226
|||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||
Sbjct 1194 GAACCATGAGACATCTGAACGTGATGAAATACCTGGAAATCTTGAAAAGGAAGCTTCTGA 1253
Query 1227 AGCTAGAAAAAATACTTCAGCAATAAAGCACGTTGGCAAAGAATTA-TCCATCCCA-GTG 1284
|| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| || || | ||| |||
Sbjct 1254 AGGTAGAAGGAATACTTTAGCAACAAAGCTGGTTGGAAAAGAA-TATTCTGT-CCAGGTG 1311
Query 1285 GAC-CAGACATCACATAGTTTTGGCCGCAAAGGTGAAGAACGTGGGATTCGAAAGGCTGT 1343
| | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 1312 G-CGCAGTCATCACATAGTTTTAGCCAAAAAGGTGAAG---TTGGGCTTCGAAAGGCTGT 1367
Query 1344 GAAGACTCCATCTAGTGTTAGTGGGAATGAACTGGCTAGGTTTAGTGATCCTCCTGGGGA 1403
|||||||||||||||| || |||||||||||||| | || || |||||||||||||||||
Sbjct 1368 GAAGACTCCATCTAGTTTTGGTGGGAATGAACTGACCAGATTCAGTGATCCTCCTGGGGA 1427
Query 1404 TGCTTCTTTGCATGATTTATTTCACCCATTGGATAAAGTGT-CTGAGGGAAAACCAAATG 1462
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 1428 TGCTTCTTTGCATGATTTGTTTCATCCATTGGATAAAGT-TCCTGAGGGAAAACCAAATG 1486
Query 1463 AAGCCTCAACATCCATGCCTACGT-CAAATGTCAACCAAGGTGATTCTCCTGTTGCAGAT 1521
||||||||||||| | |||||| | ||||||| || || ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1487 AAGCCTCAACATCGACGCCTAC-TACAAATGTAAATCAGGGTGATTCTCCTGCTGCAGAT 1545
Query 1522 GGTGGAAAGAATGATCTGGCTACAAAATTGAGGGCTACAATTGCTCAGAAGCAAATGGAG 1581
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 GGTGGAAAGAATGATCTGGCAACGAAATTGAGGGCTAGAATTGCTCAGAAGCAAATGGAG 1605
Query 1582 GGGGAAACAGGGCACTCA-AATGATGGTGGTGATCTTTTTCGCTTGATGATGGGTGTTTT 1640
|| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1606 GGTGAAACGGGGCACTCACAA-GATGGTGGTGATCTTTTCCGCTTAATGATGGGTGTTTT 1664
Query 1641 GAAAGATGATGTTATTGACATTGATGGCTTGGTATTTGATGAAAAAGTGCCCGCGGAGAA 1700
||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1665 GAAAGATGATGTTCTTAACATCGATGACTTGGTATTTGATGAAAAAGTGCCCCCGGAGAA 1724
Query 1701 TCTTTTTCCTCTGCAGGCAGTCGAGTTCAGCAGACTGGTCAGCTCCTTGAGGCCAGATGA 1760
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1725 TCTTTTCCCTCTGCAGGCAGTCGAGTTCAGCAGATTGGTGAGCTCCTTAAGGCCAGATGA 1784
Query 1761 GTCAGAAGATGCAATAGTATCTTCTTGTCAGAAACTTGTTGCCATGTTTCGTCAGAGACC 1820
|||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785 ATCAGAAGATGCAATAGTAACTTCTTCTTTGAAACTTGTTGCCATGTTTCGTCAGAGACG 1844
Query 1821 TGAGCAGAAAGTAGTATTTGTGACACAGCATGGTTTCCTGCCTCTAATGGATCTACTCGA 1880
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1845 TGGGCAGAAAGCAGTATTTGTGACACAGCATGGTTTCCTCCCTCTAATGGATCTACTTGA 1904
Query 1881 TATTCCTAAATCTCGAGTAATATGTGCTGTGCTGCAGCTGATAAACGAAATTATTAAAGA 1940
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 1905 TATTCCTAAATCTCGAGTAATATGTGCCGTGCTGCAGCTGATAAACGAAATTGTAAAAGA 1964
Query 1941 TAACACTGACTTCCAGGAAAATGCTTGTCTTGTTGGCCTTATTCCTGTT-GTAATGAGTT 1999
||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1965 TAATACCGACTTCCTGGAAAATGCTTGTCTCGTTGGTCTTATTCCT-TTGGTAATGAGTT 2023
Query 2000 TTGCTGGTCCTGAGAGGGATCGTTCTCGCGAAATTCGTAAAGAAGCAGCTTACTTCTTGC 2059
|||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 2024 TTGCTGGTTTTGAGAGGGATCGATCTCGAGAAATTCGTAAGGAAGCAGCCTACTTCTTGC 2083
Query 2060 AGCAGCTTTGTCAGTCAAGCCCCTTGACGTTGCAAATGTTCATAGCTTGCCGTGGAATAC 2119
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2084 AGCAGATTTGTCAGTCAAGCCCCTTGACGTTGCAAATGTTCATAGCTTGCCGTGGAATAC 2143
Query 2120 CCGTTTTGGTGGGATTTCTTGAAGCAGATTATGCCAAATACAGGGAGATGGTTCACTTGG 2179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 CCGTTTTGGTGGGATTTCTTGAAGCAGATTATGCCAAACACAGGGAGATGGTTCACTTGG 2203
Query 2180 CTATTGATGGGATGTGGCAGGTATTTAAACTCAAAAGATCCACCCCAAGAAATGATTTCT 2239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 2204 CTATTGATGGGATGTGGCAGGTATTTAAACTCAAAAGATCCACCTCTAGAAATGATTTCT 2263
Query 2240 GCCGTATAGCTGCAAAGAATGGAATTCTTCTGAGGCTAATCAACACTCTTTATAGCTTGA 2299
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2264 GCCGTATTGCTGCAAAGAATGGAATTCTTCTTAGGCTAGTCAACACTCTTTATAGCTTGA 2323
Query 2300 ATGAGGCAACCCGGCTGGCTTCTATATCAGGGGGC-C-TGGAT---GG-T---CAAGCTC 2350
||||||||| || ||||||||||||||||||| | | | ||| || | ||| |||
Sbjct 2324 GTGAGGCAACTCGACTGGCTTCTATATCAGGGGACGCATTGATTTTGGATAGTCAAACTC 2383
Query 2351 CACGAGTGCGCTCTGGTCAACTTGACCCTAACAATCCTATTTTTGGTCAAAATGAGACTT 2410
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||
Sbjct 2384 CACGAGCACGCTCTGGTCAACTTGACCCTAACAATCCTATCTTTAGTCAGCGTGAGACTT 2443
Query 2411 CTTCACTCAGTATGATTGATCAGCCTGATGTATTGAAAACTAGGCATGGGGGTGGTGAAG 2470
| | || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2444 CA-C-CT-AGTGTGATTGATCATCCTGATGGGTTGAAAACTAGGAATGGGGGTGGTGAAG 2500
Query 2471 AGCCTTCTCATGCTTCAACCTCAAATTCTCAAAGATCAGATGTCCATCAACCAGATGCTT 2530
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2501 AGCCTTCTCATGCTTTAATTTCAAATTCTCAAAGATCAGATGTCCATCAACCCGATGCCT 2560
Query 2531 TGCACCCAGATGGTGATAAGCCTAGAGTAAGCAGTGTTGCACCAGATGCCTCAACCTCTG 2590
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2561 TGCACCCAGATGGTGATAGGCCTAGATTAAGCAGTGTTGCAGCAGATGCC---------G 2611
Query 2591 GCACAGAAGATGTTAGACAACAGCATCGAATATCTCTTTCCGCCAATAGGACATCGACAG 2650
|| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||
Sbjct 2612 -CA--GAAGATGTTATACAACAACATAGGATATCTCTTTCTGCCAATATAACATCAACAG 2668
Query 2651 ATAAGCTTCAGAAGCTGGCAGAGGGCGCCTCTAATGGTTTTCCTGTTACTCAGACAGAAC 2710
||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 2669 ATAAGCTTCAGAAACTGGCGGAGGGTGCGTCTAATGGTTTTCCTGTTACTCAGCCAGATC 2728
Query 2711 AAGTTCGACCTTTGCTTAGCTTGTTGGATAAAGAACCCCCTTCAAGACA-TTATTCTGGT 2769
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||
Sbjct 2729 AAGTTCGACCTTTGCTTAGCTTATTGGAGAAAGAGCCCCCTTCAAGAAAATT-TTCTGGT 2787
Query 2770 CAACTGGATTATGTTAAGCATATCACTGGCATAGAGAGACATGAAAGTAGACTTCCTCTT 2829
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2788 CAACTGGATTATGTGAAGCATATCACTGGCATAGAGAGACATGAAAGTAGACTTCCTCTT 2847
Query 2830 TTGCATGGATCAAATGAAAAGAAAAACAACGGAGACCTAGATTTTCTGATGGCTGAATTT 2889
||| ||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| |||||
Sbjct 2848 TTGTATGCATCAGACGAAAAGAAAACCAGTGGAGACCTAGAATTTATAATGGCCGAATTA 2907
Query 2890 GCAG-AGGTCTCTGGACGTGGAAAGGAAAATGGAAGTCTTGATACTACGAC-TAGATATC 2947
|||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | || |||||||
Sbjct 2908 GCAGGAG-TCTCTGGACGTGGAAAGGAAAACGGAAATCTCGATACTGC-ACCTAGATATT 2965
Query 2948 CCAGTAAAACAATGACAAAGAAGGTTCTGGCTATTGAAGGAGTTGCTTCAACATCTGGGA 3007
||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||| | | |||||
Sbjct 2966 CCAGTAAGACGATGACTAAGAAGGCTATGGCTATTGAAAGAGTCGCTTCTGCGTGTGGGA 3025
Query 3008 TTGCATCTCAGACAGCATCTGGAGTACTGTCAGGTTCGGGTGTTCTAAACGCTAGACCTG 3067
||||||||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||
Sbjct 3026 TTGCATCTCAGACAGTATCTAGTGTTCTGTCAGGTTCAGGTGTTTTAAATGCTAGAGCTG 3085
Query 3068 GAAGTGCCACATCATCTGGTTTACTTGCCCATATGGTCTCTACGCTGAGTGCAGATGT-T 3126
||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |
Sbjct 3086 GAAGTACTACATCATCTGGTTTACTTGCCCAT--G--C-----GCTGAGTGCAGATGTCT 3136
Query 3127 GCAAGGGAATACTTGGAGAAAGTTGCTGACCTGCTTCTTGAATTTGCTCGAGCTGATACG 3186
||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||
Sbjct 3137 -CAATGGATTACTTGGAGAAAGTGGCTGATCTGCTTCTCGAATTTGCCCGAGCTGAAACG 3195
Query 3187 ACAGTAAAGTCATATATGTGCAGCCAAAGCTTACTCAGTCGTCTTTTTCAGATGTTCAAC 3246
|||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3196 ACAGTAAAATCATACATGTGCAGCCAGAGCTTACTCAGTCGTCTTTTCCAGATGTTCAAC 3255
Query 3247 CGTGTAGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAGTGCACAAATCATTTATCAACTGAT 3306
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 3256 CGTGTGGAACCTCCTATTCTGTTAAAGATACTGGAATGCACCAATCATTTATCCACGGAT 3315
Query 3307 CCAAATTGCTTGGAGAATCTGCAGCGTGCAGATGCAATTAAGCATTTGATCCCCAACCTT 3366
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3316 CCAAATTGCTTGGAAAATCTTCAGCGTGCAGATGCAATTAAGCAATTGATCCCCAACCTT 3375
Query 3367 GAGCTTAAGGATGGGCATCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTGCTTAGTGCACTATTC 3426
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3376 GAACTTAAGGAAGGGCATCTTGTTTATCAGATCCATCATGAGGTACTTAGTGCACTATTC 3435
Query 3427 AACCTGTGCAAGATAAACAAGAGGAGGCAGGAACAAGCGGCTGAAAACGGAATCATTCCG 3486
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3436 AACCTCTGCAAGATAAACAAGAGGAGGCAGGAACAAGCGGCTGAAAATGGAATCATTCCG 3495
Query 3487 CATCTGATGCTTTTCATTATGTCAGATTCTCCTCTGAAACAGTATGCATTGCCACTACTC 3546
|| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3496 CACCTGATGCTTTTCGTCATGTCGGATTCTCCTCTGAAACAATATGCATTGCCACTACTA 3555
Query 3547 TGCGATATGGCTCATGCATCTCGAAATTCAAGAGAACAGTTAAGGGCCCACGGTGGTCTT 3606
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3556 TGTGATATGGCTCATGCATCTCGGAATTCAAGAGAGCAGTTAAGGGCCCACGGCGGTCTG 3615
Query 3607 GATGTTTACCTGAGTTTACTCGATGATGAATACTGGTCCGTGATAGCCTTAGATTCAATC 3666
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3616 GATGTTTACCTAAGTTTACTCGATGATGAATATTGGTCCGTGATAGCCTTGGATTCAATT 3675
Query 3667 GCTGTTTGCTTGGCGCAAGACAATGACAACCGCAAGGTAGAGCAGGCATTGCTCAAGCAA 3726
|||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||
Sbjct 3676 GCTGTTTGCTTGGCGCAAGACATTGACCAC---AAGGTTGAGCAGGCATTTCTCAAGAAA 3732
Query 3727 GATGCAATTCAGAAATTAGTTGACTTCTTCCAGAGCTGCCCAGAGAGACACTTCGTGCAC 3786
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||
Sbjct 3733 GATGCAATTCAGAAATTAGTTAACTTCTTCCAGAACTGTCCAGAAAGACATTTTGTGCAC 3792
Query 3787 ATATTGGAGCCATTCTTAAAGATTATCACGAAATCATAT-CGGATCAATAAGACATTAGC 3845
|| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||||
Sbjct 3793 ATTTTGGAGCCATTCTTGAAGATCATCACGAAATCATCTTCA-ATTAATAAGACATTAGC 3851
Query 3846 -TGTAAATGGATTGACTCCACTGCTTATTTCAAGGCTAGACCATCAAGATGCGATTGCTC 3904
| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3852 AT-TAAATGGATTGACTCCGCTACTTATTTCAAGACTAGACCACCAAGATGCGATTGCTC 3910
Query 3905 GACTTAACCTCCTAAAACTCATCAAGGCTGTTTATGA-ACATCATCCACGGCCGAAACAG 3963
||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||| ||| ||||||
Sbjct 3911 GACTTAACCTCCTGAAACTCATTAAGGCTGTTTACGAGA-AGCATCCAAAGCCAAAACAG 3969
Query 3964 CTGATCGTAGAGAACGACCTTCCTCAAAAACTGCAGAATCTAATAGAAGAACGACGAGAT 4023
||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |
Sbjct 3970 CTGATCGTAGAGAACAATCTTCCTCAGAAACTGCAGAATCTGATTGAAGAACGACGTGGT 4029
Query 4024 GGACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAACAAATGGCAACATCTCTCCTCAAAGCA 4083
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4030 GGACAACGTTCAGGAGGCCAAGTTCTGGTGAAGCAAATGGCAACATCTCTCCTCAAAGCA 4089
Query 4084 CTTCACATCAACACAATATTGTGA 4107
|||||||||||||| | ||||||
Sbjct 4090 CTTCACATCAACACCGTCTTGTGA 4113
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 164637060798
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5