BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G14040.1
Length=1690
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg478122 jgi|Araly1|478122|fgenesh2_kg.3__823__AT3G07850.1 2311 0.0
Ahg497387 jgi|Araly1|497387|fgenesh2_kg.286__2__AT3G07850.1 2307 0.0
Ahg318190 jgi|Araly1|318190|fgenesh1_pm.C_scaffold_3001206 2017 0.0
> Ahg478122 jgi|Araly1|478122|fgenesh2_kg.3__823__AT3G07850.1
Length=1675
Score = 2311 bits (1251), Expect = 0.0
Identities = 1514/1634 (93%), Gaps = 45/1634 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 35 aataaaca-aaagaagaaaaa-aaaagtattaaaacaaaatcaataaaaaga-gaataaa 91
|||||||| ||| || ||||| || || | | |||||||| || ||||| | ||||||
Sbjct 5 AATAAACACAAA-AACAAAAAGAAGAG-AAT-AAACAAAA-GAAAAAAAAAATCAATAAA 60
Query 92 aaatGGTGGGTTCTCACAA-AGCAAGCGGAGTGCTTCTTGTGCTACTAGTGGTTATGGCC 150
|||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 AAATGGTGGGTTTTC-GAAGAGCAAGCGGAGTGCTTCTAGTGCTTCTAGTGGTTATGGCC 119
Query 151 ACCACAATAGCAAACGGGACACCTGTTGTCGATACAGCAAAAAATGCAGCT-ACAGCAGT 209
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | | ||||
Sbjct 120 ACCACAATAGCAAACGGGACACCGGTTGTCGATAAAGCAAAAAATGCAGCTGA-ATCAGT 178
Query 210 TGAAGATACAG-CAAAAAATGCAGCTACAGCAGTTGGC------G-----G-TGCAGCTG 256
|| |||| || || || ||||||||| |||||||| | | ||||||||
Sbjct 179 TGGTGATAAAGTCAGTGAA-GCAGCTACAACAGTTGGCGATAAAGCAAAAGATGCAGCTG 237
Query 257 CATCAGTTGGTGCTAAAGTAACAGGTGCCAAACCAGGCGGTGCATCACTTGATGTTAAAG 316
|||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 CATCAGTTGGCGCTAAAGTACCAGGAGCCAAAGCAGGCGGTGCATCACTTGATGTTAAAG 297
Query 317 CATCAGGAGCCAAAGGAGACGGCAAAACTGATGATAGTGCGGCATTTGCGGCTGCATGGA 376
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 298 CATCAGGAGCCAAAGGAGATGGCAAAACTGATGACAGTGCGGCATTTATGGCTGCATGGA 357
Query 377 AAGAAGCTTGTGCAGCAGGGAGCACGATTACAGTGCCAAAAGGTGAGTATTTGGTAGAGA 436
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 AAGAAGCGTGTGCAGCAGGGAGCACGATTACAGTGCCCAAAGGTGAGTATTTGGTAGAGA 417
Query 437 GCCTAGAGTTCAAAGGTCCATGCAAAGGTCCAGTCACTTTGGAATTGAATGGCAATTTTA 496
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 418 GCCTAGAGTTTAAAGGTCCATGCAAAGGTCCAGTCACTTTGGAATTGAATGGCAATCTAA 477
Query 497 AGGCTCCGGCTACGGTCAAGACCACTAAGCCTCATGCCGGATGGATTGATTTCGAAAATC 556
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 AGGCTCCGGCTACGGTCAAGACCACTAAACCTCATGCCGGATGGATTGATTTCGAAAATC 537
Query 557 TCGCTGATTTCACTTTGAATGGAAACAAAGCTATTTTTGACGGTCAAGGGTCCCTCGCTT 616
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 TCGCTGATTTCACTTTGAATGGAAACAAAGCTATATTTGACGGTCAAGGGTCCCTCGCTT 597
Query 617 GGAAGGCCAATGACTGCGCCAAAACCGGCAAATGCAACTCTCTCCCTATCAACATCCGAT 676
||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 598 GGAAGGCCAATGATTGTGCCAAAACTGGCAAATGCAACTCTCTCCCCATCAACATCCGAT 657
Query 677 TCACTGGTCTAACAAACTC-AAAGATTAACAGTATTACATCAACAAACAGCAAGCTTTTC 735
|||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 658 TCACGGGTCTAACAAACTCGAAA-ATTAAGAGTATTACATCAACAAACAGCAAACTTTTC 716
Query 736 CACATGAACATCCTTAACTGCAAGAACATAACTCTT-ACGGATATCGGTATTGATGCACC 794
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||
Sbjct 717 CACATGAACATCCTTAACTGCAAAAACATAACTCTTGA-GGATATTGGTATTGATGCACC 775
Query 795 TCCGGAGAGTCTCAACACCGATGGTATCCACATCGGAAGGTCCAATGGAGTCAACTTAAT 854
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 776 TCCGGAGAGTCTCAACACCGATGGTATCCACATCGGAAGGTCCAATGGCGTCAACTTAAT 835
Query 855 TGGGGCAAAGATTAAAACCGGAGATGACTGCGTTTCCATTGGAGATGGTACCGAAAATCT 914
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 AGGGGCAAAGATTAAAACCGGAGATGACTGCGTTTCCATTGGAGATGGTACCGAAAATCT 895
Query 915 CATTGTTGAGAACGTAGAATGTGGACCAGGACACGGAATTTCCATTGGAAGTCTTGGAAG 974
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 896 CATTGTCGAGAACGTAGAATGTGGACCAGGACACGGAATTTCCATTGGAAGTCTTGGAAG 955
Query 975 ATACCCTAATGAACAACCAGTAAAAGGAGTCACCGTGAGGAAATGCCTCATCAAGAACAC 1034
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 ATACCCTAACGAGCAACCAGTAAAAGGAGTCACCGTGAGGAAATGCCTCATCAAGAACAC 1015
Query 1035 TGACAATGGTGTTCGCATCAAGACATGGCCAGGATCTCCCCCCGGTATCGCCTCCAACAT 1094
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016 TGATAATGGTGTTCGCATCAAGACATGGCCAGGATCTCCCCCCGGTATCGCCTCCAACAT 1075
Query 1095 TCTTTTCGAAGATATCACAATGGACAATGTTAGC-CTTCCCGTTCTCATCGACCAAGAGT 1153
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 TCTTTTCGAAGATATCACAATGGACAATGTTAGCACC-CCCGTTCTCATCGACCAAGAGT 1134
Query 1154 ACTGTCCTTATGGCCACTGCAAAGCTGGGGTACCATCGAAAGTGAAGTTGTCAGACGTGA 1213
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1135 ACTGTCCTTATGGCCACTGCAAAGCTGGGGTACCATCGAAAGTGAAGTTGTCGGACGTGA 1194
Query 1214 CTATCAAGAACATTAAGGGAACATCAGCAACAAAGGTAGCAGTGAAGCTAATGTGCAGCA 1273
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 1195 CTATCAAGAACATTAAGGGGACATCAGCAACAAAGGTGGCTGTGAAGCTAATGTGCAGCA 1254
Query 1274 AAGGCGTTCCTTGCACCAATATTGCTCTCTCTGACATCAACTTGGTCCACAACGGCAAAG 1333
|||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 AAGGAGTGCCTTGCACCAATATTGCTCTTTCTGACATCAACTTGGTCCACAACGGCAAAG 1314
Query 1334 AGGGACCAGCTGTCTCAGCATGTTCTAACATCAAGCCTATTCTCAGCGGAAAGTTGGTTC 1393
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 1315 AGGGACCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACATCAAGCCTATTCTCTCCGGCAAGTTGGTTC 1374
Query 1394 CAGCGGCTTGCACTGAAGTCGCTAAACCGGGTCCTTAAATTAAAGTTGCATGTCCACCAT 1453
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1375 CAGCAGCTTGCACTGAAGTCGCTAAACCGGGTCCTTAAATTAAAGTCGCTTGTCCACCAT 1434
Query 1454 AAATCCATCCAATCTGGTGAAGACGCTTTGATTAGGGTGCGATGAAAAA--TTTTGCAAT 1511
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1435 AAATCCATCCAATCTCGTGAAGACGCTTTGATTAGGGTGCGATAAAAAAAGTTTTGCAAT 1494
Query 1512 AttttttttGAGATATAAA-T-TAT--ATA---A-TAGATAAAACAGAGTCCATTCAGGG 1563
|||||||| || ||||||| | ||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 1495 ATTTTTTT-GACATATAAAATATATGGATATTTAGTAGATAAAACGGAGTCCCTTCAGGC 1553
Query 1564 TTGGAGTTTATCACCTGAAGAGTGACTTGTGTGATTGGGTAGTAAT-GTTATGTGATTCG 1622
||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||
Sbjct 1554 TTGGAGTTTATCACCTGAAGAGTGACTCGTG--ATTGGGTAGTAATCGTTGTGTGCTTCG 1611
Query 1623 CAATATGCGAGAGT 1636
||||||||||||||
Sbjct 1612 CAATATGCGAGAGT 1625
> Ahg497387 jgi|Araly1|497387|fgenesh2_kg.286__2__AT3G07850.1
Length=1551
Score = 2307 bits (1249), Expect = 0.0
Identities = 1457/1553 (94%), Gaps = 31/1553 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 CATCAATaaacacaaaaacaaaagaagaagagaataaacaaaagaagaaaaa-aaaagta 61
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||
Sbjct 1 CATCAATAAACACAAAAAC--AA-AAGAAGAGAATAAACAAAA-AA-AAAAATAAAA-TA 54
Query 62 ttaaaacaaaatcaataaaaagagaataa-aaaatGGTGGGTTCTCACAAAGCAAGCGGA 120
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||
Sbjct 55 --AAAACAAAATCAATAAAAGGAGAATAAGAAAATGGTGGGTTTTCGCAGAGCAAGCGGA 112
Query 121 GTGCTTCTTGTGCTACTAGTGGTTATGGCCACCACAATAGCAAACGGGACACCTGTTGTC 180
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 113 GTGCTTCTTGTGGTATTAGTGGTTATGGCCACCACAATAGTAAACGGGACACCGGTTGTC 172
Query 181 GATACAGCAAAAAATGCAGCTA-CAGCAGTTGAAGATACAG-CAAAAAATGCAGCTACAG 238
|||| ||||||| ||||||| | | |||||| |||| || || || |||||||||
Sbjct 173 GATAAAGCAAAAGATGCAGC-AGAATCAGTTGGTGATAAAGTCAGTGAA-GCAGCTACAA 230
Query 239 CAGTTGGCGGTGCAGCTGCATCAGTTGGTGCTAAAGTAACAGGTGCCAAACCAGGCGGTG 298
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||
Sbjct 231 CAGTTGGCGATGCAGCTGCATCAGTTGGTGTTAAAGTACCAGGAGCCAAAGCAGGCGGTG 290
Query 299 CATCACTTGATGTTAAAGCATCAGGAGCCAAAGGAGACGGCAAAACTGATGATAGTGCGG 358
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 291 CATCACTTGATGTTAAAGCATCCGGAGCTAAAGGAGATGGCAAAACTGATGACAGTGCGG 350
Query 359 CATTTGCGGCTGCATGGAAAGAAGCTTGTGCAGCAGGGAGCACGATTACAGTGCCAAAAG 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 351 CATTTGCGGCTGCATGGAAAGAAGCTTGTGCAGCAGGGAGCACGATTACAGTGCCCAAAG 410
Query 419 GTGAGTATTTGGTAGAGAGCCTAGAGTTCAAAGGTCCATGCAAAGGTCCAGTCACTTTGG 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 GTGAGTATTTGGTAGAGAGCCTAGAGTTCAAAGGTCCATGCAAAGGTCCAGTCACTTTGG 470
Query 479 AATTGAATGGCAATTTTAAGGCTCCGGCTACGGTCAAGACCACTAAGCCTCATGCCGGAT 538
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||
Sbjct 471 AATTGAATGGCAATCTTAAGGCTCCGGCTACGGTCAAGACCTCTAAACCTCATTCCGGAT 530
Query 539 GGATTGATTTCGAAAATC-TCGCTGATTTCACTTTGAATGGAAACAAAGCTATTTTTGAC 597
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 531 GGATTGATTTCGAAAA-CATCGCTGATTTCACTTTGAATGGAAACGGAGCCATTTTTGAC 589
Query 598 GGTCAAGGGTCCCTCGCTTGGAAGGCCAATGACTGCGCCAAAACCGGCAAATGCAACTCT 657
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 GGTCAAGGTTCCCTCGCTTGGAAGGCCAATGACTGCGCCAAAACCGGCAAATGCAACTCT 649
Query 658 CTCCCTATCAACATCCGATTCACTGGTCTAACAAACTC-AAAGATTAACAGTATTACATC 716
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||
Sbjct 650 CTCCCCATCAACATCCGATTCACGGGTCTAACAAACTCGAAA-ATTAAGAGTATTACATC 708
Query 717 AACAAACAGCAAGCTTTTCCACATGAACATCCTTAACTGCAAGAACATAACTCTT-ACGG 775
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||
Sbjct 709 AACAAACAGCAAACTTTTCCACATGAACATCCTTAACTGCAAAAACATAACTCTTGA-GG 767
Query 776 ATATCGGTATTGATGCACCTCCGGAGAGTCTCAACACCGATGGTATCCACATCGGAAGGT 835
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 768 ATATTGGTATTGATGCACCTCCGGAGAGTCTCAACACCGATGGGATCCACATCGGAAGGT 827
Query 836 CCAATGGAGTCAACTTAATT-GGGGCAAAGATTAAAACCGGAGATGACTGCGTTTCCATT 894
||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 CCAATGGCGTCAACTT-ATTAGGGGCAAAGATTAAAACCGGAGATGACTGCGTTTCCATT 886
Query 895 GGAGATGGTACCGAAAATCTCATTGTTGAGAACGTAGAATGTGGACCAGGACACGGAATT 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 887 GGAGATGGTACCGAAAATCTCATTGTTGAGAACGTAGAATGTGGACCGGGACACGGAATT 946
Query 955 TCCATTGGAAGTCTTGGAAGATACCCTAATGAACAACCAGTAAAAGGAGTCACCGTGAGG 1014
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 947 TCCATTGGAAGTCTCGGAAGATACCCTAATGAGCAACCAGTAAAAGGAGTCACTGTGAGG 1006
Query 1015 AAATGCCTCATCAAGAACACTGACAATGGTGTTCGCATCAAGACATGGCCAGGATCTCCC 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 AAATGCCTCATCAAGAACACTGACAATGGTGTTCGCATCAAGACATGGCCAGGATCTCCC 1066
Query 1075 CCCGGTATCGCCTCCAACATTCTTTTCGAAGATATCACAATGGACAATGTTAGC-CTTCC 1133
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1067 CCCGGTATCGCCTCCAACATTCTTTTCGAAGATATCACAATGGACAATGTTAGCACC-CC 1125
Query 1134 CGTTCTCATCGACCAAGAGTACTGTCCTTATGGCCACTGCAAAGCTGGGGTACCATCGAA 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126 CGTTCTCATCGACCAAGAGTACTGTCCTTATGGCCACTGCAAAGCTGGGGTACCATCGAA 1185
Query 1194 AGTGAAGTTGTCAGACGTGACTATCAAGAACATTAAGGGAACATCAGCAACAAAGGTAGC 1253
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1186 AGTGAAGTTGTCGGACGTGACTATCAAGAACATTAAGGGTACATCAGCAACAAAGGTGGC 1245
Query 1254 AGTGAAGCTAATGTGCAGCAAAGGCGTTCCTTGCACCAATATTGCTCTCTCTGACATCAA 1313
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1246 TGTGAAGCTAATGTGCAGTAAAGGCGTTCCTTGCACCAATATTGCTCTCGCTGACATCAA 1305
Query 1314 CTTGGTCCACAACGGCAAAGAGGGACCAGCTGTCTCAGCATGTTCTAACATCAAGCCTAT 1373
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 CTTGGTCCACAACGGCAAAGAGGGACCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACATCAAGCCTAT 1365
Query 1374 TCTCAGCGGAAAGTTGGTTCCAGCGGCTTGCACTGAAGTCGCTAAACCGGGTCCTTAAAT 1433
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1366 TCTCTCCGGAAAGTTGGTTCCAGCGGCTTGCACTGAAGTCGCTAAAACGGGTCCTTAAAT 1425
Query 1434 TAAAGTTGCAT----GTCCACCATAAATCCATCCAATCTGGTGAAGACGCTTTGATTAGG 1489
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 TAAAGGCGCATATATGTCCACCATAAATCCATCCAATCTGGTGAAGACGCTTTGATTAGG 1485
Query 1490 GTGCGATGAAAAA-TTTTGCAATAttttttttGAGATATAAATTATAT-AATA 1540
||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||
Sbjct 1486 GTGCGATGATAAAGTTTTGCAATATTTTTTT-GACATAAAAATTATATGAATA 1537
> Ahg318190 jgi|Araly1|318190|fgenesh1_pm.C_scaffold_3001206
Length=1350
Score = 2017 bits (1092), Expect = 0.0
Identities = 1273/1357 (94%), Gaps = 26/1357 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 94 atGGTGGGTTCTCACAAAGCAAGCGGAGTGCTTCTTGTGCTACTAGTGGTTATGGCCACC 153
|||||||||| || || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTGGGTTTTCGCAGAGCAAGCGGAGTGCTTCTTGTGGTATTAGTGGTTATGGCCACC 60
Query 154 ACAATAGCAAACGGGACACCTGTTGTCGATACAGCAAAAAATGCAGCT-ACAGCAGTTGA 212
||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||
Sbjct 61 ACAATAGTAAACGGGACACCGGTTGTCGATAAAGCAAAAGATGCAGCTGA-ATCAGTTGG 119
Query 213 AGATACAG-CAAAAAATGCAGCTACAGCAGTTGGCG-----G-------TGCAGCTGCAT 259
|||| || || || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||
Sbjct 120 CGATAAAGTCAGTGAA-GCAGCTACAACAGTTGGCGATAAAGCAAAAAATGCAGCTGCAT 178
Query 260 CAGTTGGTGCTAAAGTAACAGGTGCCAAACCAGGCGGTGCATCACTTGATGTTAAAGCAT 319
||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 179 CAGTTGGTGTTAAAGTACCAGGAGCCAAAGCAGGCGGTGCATCACTTGATATTAAAGCAT 238
Query 320 CAGGAGCCAAAGGAGACGGCAAAACTGATGATAGTGCGGCATTTGCGGCTGCATGGAAAG 379
||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 CAGGAGCTAAAGGAGATGGTAAAACTGATGACAGTGCGGCATTTGCGGCTGCATGGAAAG 298
Query 380 AAGCTTGTGCAGCAGGGAGCACGATTACAGTGCCAAAAGGTGAGTATTTGGTAGAGAGCC 439
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 AAGCATGTGCAGCAGGGAGCACGATTACAGTGCCAAAAGGTGAGTATTTGGTAGAGAGCC 358
Query 440 TAGAGTTCAAAGGTCCATGCAAAGGTCCAGTCACTTTGGAATTGAATGGCAATTTTAAGG 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 359 TAGAGTTCAAAGGTCCATGCAAAGGTCCAGTCACTTTGGAATTGAATGGCAATCTTAAGG 418
Query 500 CTCCGGCTACGGTCAAGACCACTAAGCCTCATGCCGGATGGATTGATTTCGAAAATC-TC 558
|||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 419 CTCCGGCTACGGTCAAGACCTCTAAACCTCATTCCGGATGGATTGATTTCGAAAA-CATC 477
Query 559 GCTGATTTCACTTTGAATGGAAACAAAGCTATTTTTGACGGTCAAGGGTCCCTCGCTTGG 618
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 478 GCTGATTTCACTTTGAATGGAAACGGAGCCATTTTTGACGGTCAAGGTTCCCTCGCTTGG 537
Query 619 AAGGCCAATGACTGCGCCAAAACCGGCAAATGCAACTCTCTCCCTATCAACATCCGATTC 678
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 538 AAGGCCAATGACTGCGCCAAAACCGGCAAATGCAACTCTCTCCCCATCAACATCCGATTC 597
Query 679 ACTGGTCTAACAAACTC-AAAGATTAACAGTATTACATCAACAAACAGCAAGCTTTTCCA 737
|| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 598 ACGGGTCTAACAAACTCGAAA-ATTAAGAGTATTACATCAACAAACAGCAAACTTTTCCA 656
Query 738 CATGAACATCCTTAACTGCAAGAACATAACTCTT-ACGGATATCGGTATTGATGCACCTC 796
||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 657 CATGAACATCCTTAACTGCAAAAACATAACTCTTGA-GGATATTGGTATTGATGCACCTC 715
Query 797 CGGAGAGTCTCAACACCGATGGTATCCACATCGGAAGGTCCAATGGAGTCAACTTAATT- 855
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 716 CGGAGAGTCTCAACACCGATGGGATCCACATCGGAAGGTCCAATGGCGTCAACTT-ATTA 774
Query 856 GGGGCAAAGATTAAAACCGGAGATGACTGCGTTTCCATTGGAGATGGTACCGAAAATCTC 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GGGGCAAAGATTAAAACCGGAGATGACTGCGTTTCCATTGGAGATGGTACCGAAAATCTC 834
Query 916 ATTGTTGAGAACGTAGAATGTGGACCAGGACACGGAATTTCCATTGGAAGTCTTGGAAGA 975
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 835 ATTGTTGAGAACGTAGAATGTGGACCGGGACACGGAATTTCCATTGGAAGTCTCGGAAGA 894
Query 976 TACCCTAATGAACAACCAGTAAAAGGAGTCACCGTGAGGAAATGCCTCATCAAGAACACT 1035
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 TACCCTAATGAGCAACCAGTAAAAGGAGTCACTGTGAGGAAATGCCTCATCAAGAACACT 954
Query 1036 GACAATGGTGTTCGCATCAAGACATGGCCAGGATCTCCCCCCGGTATCGCCTCCAACATT 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GACAATGGTGTTCGCATCAAGACATGGCCAGGATCTCCCCCCGGTATCGCCTCCAACATT 1014
Query 1096 CTTTTCGAAGATATCACAATGGACAATGTTAGC-CTTCCCGTTCTCATCGACCAAGAGTA 1154
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 CTTTTCGAAGATATCACAATGGACAATGTTAGCACC-CCCGTTCTCATCGACCAAGAGTA 1073
Query 1155 CTGTCCTTATGGCCACTGCAAAGCTGGGGTACCATCGAAAGTGAAGTTGTCAGACGTGAC 1214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1074 CTGTCCTTATGGCCACTGCAAAGCTGGGGTACCATCGAAAGTGAAGTTGTCGGACGTGAC 1133
Query 1215 TATCAAGAACATTAAGGGAACATCAGCAACAAAGGTAGCAGTGAAGCTAATGTGCAGCAA 1274
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1134 TATCAAGAACATTAAGGGTACATCAGCAACAAAGGTGGCTGTGAAGCTAATGTGCAGTAA 1193
Query 1275 AGGCGTTCCTTGCACCAATATTGCTCTCTCTGACATCAACTTGGTCCACAACGGCAAAGA 1334
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 AGGCGTTCCTTGCACCAATATTGCTCTCGCTGACATCAACTTGGTCCACAACGGCAAAGA 1253
Query 1335 GGGACCAGCTGTCTCAGCATGTTCTAACATCAAGCCTATTCTCAGCGGAAAGTTGGTTCC 1394
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1254 GGGACCAGCTGTCTCGGCATGTTCTAACATCAAGCCTATTCTCTCCGGAAAGTTGGTTCC 1313
Query 1395 AGCGGCTTGCACTGAAGTCGCTAAACCGGGTCCTTAA 1431
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1314 AGCGGCTTGCACTGAAGTCGCTAAAACGGGTCCTTAA 1350
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 63382167680
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5