BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G14270.1
Length=5987
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg478844 jgi|Araly1|478844|fgenesh2_kg.3__1545__AT3G14270.1 9407 0.0
Ahg491361 jgi|Araly1|491361|fgenesh2_kg.7__794__AT4G33240.2 52.8 3e-05
> Ahg478844 jgi|Araly1|478844|fgenesh2_kg.3__1545__AT3G14270.1
Length=5702
Score = 9407 bits (5094), Expect = 0.0
Identities = 5529/5735 (96%), Gaps = 45/5735 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAATTCGAGTATTGAAGAACGACGACGACGATCTTCTGGGTGACTCAAAGTGAGAGGTT 60
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 1 AAAATTCGAGTATTGAAG-ACGACGACGACGATCTTCTGGGTGAATCAGAGTGAGAGGTT 59
Query 61 AAGCTCAAGGTCTCTGGATTGCT-TTTGAATTTGCATGCTGTTGGA--GGATGATAGACC 117
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 60 AAGCTCAAGGTCTCTGGATTGCTCTTT-AATTTGCCTGCTATTGGAGGGGATGATAGACC 118
Query 118 ATCGGTATGTGCTTGAGTTTTCTCGAGGAAGGATGAACCGATACGAGCCGTCTTATTGAT 177
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 119 ATCGGTATGTGCTTGAGTTTTCTCCAGGAAGGATGAATCGATACGAGCCATCTTATTGA- 177
Query 178 TAATTATATATATGTAG-TGGAGTGCCTGAAGGAGatatatatatatataGTAGCAGTTG 236
| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 178 T--TTAT-TATATGTAGCT-GAGTGCCTGAAGGAG----ATATA-GTA-GGTAGCAGTTG 227
Query 237 GATATTAGGGTTTTCATTTGTTAGGTG-TGAGTTTCTTTTGTTGTTGTTAATTTGGATTC 295
||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||
Sbjct 228 GATATTAGGGTTTCCATTTGTTAGGTGTTGAG---C---T-TTGTTGTTCATTTGGATTC 280
Query 296 TAGACTTCCATGACCATCGTAGCATGATGGTTGGGAAGGTTTTAGATGGGTACAAGAGAT 355
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 281 TAGACTTCCATGACCATCGGAGCATGATGGTTTGGAAGATTTTAGATGGGTACAAGAGAT 340
Query 356 AGTAATAATAGGACATTCTCTGAGATTGTGGGTCTGATTAAATCCTGGCTCCCCTGGCGA 415
|| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 341 AG---TAATAGGACATTCTCTGAGATAGTGGGTCTGATTAAATCCTGGCTTCCCTGGCGA 397
Query 416 TCCGAGCCAGCTACTGTGTCCAGGGATTTTTGGATGCCTGATCAGAGCTGTCGTGTATGT 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 TCCGAGCCAGCTACTGTGTCCAGGGATTTTTGGATGCCTGATCAGAGCTGTCGTGTATGT 457
Query 476 TACGAGTGTGATTGTCAGTTTACCCTCATCAATCGTAGGCACCATTGTCGTCATTGTGGG 535
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 458 TACGAGTGTGATTGTCAGTTTACCCTCATCAATCGTAGGCACCATTGTCGTCTTTGTGGC 517
Query 536 AGAGTTTTCTGTGGCAAGTGTACTGCCAACTCTA-TTCCTTTTGCTCCCAGCGACTTGAG 594
||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 AGAGTTTTCTGCGGCAAGTGTACAGCCAACTC-AGTACCTTTTGCTCCCAGCGACTTGAG 576
Query 595 AACTCCTCGTGAAGACTGGGAGAGGATACGTGTTTGCAATTATTGTTTCAGGCAGTGGGA 654
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 AACTCCTCGTGAAGAGTGGGAGAGGATCCGTGTTTGCAATTATTGTTTCAGGCAGTGGGA 636
Query 655 GCAAGGTGATGGTGGCCCACACGTCTCAAATATCACGGAACTTAGTACTTCACCTTCAGA 714
||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 GCAAGGTGATGGTGGACCACATGTTTCAAATATCACGGAACTTAGTACTTCACCTTCAGA 696
Query 715 GACAAGTCTTCTTAGCTCTAAGACCAGTACAACAGCCAATAGTAGTAGCTTCGCTCTTGG 774
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 GACAAGTCTTCTTAGCTCAAAGACCAGTACAACTGCCAATAGTAGTAGCTTCGCTCTTGG 756
Query 775 CTCCATGCCGGGACTGATTGGT-CTTAATCAAAGGGTTCATCATGGTTCTGATGTCAGCT 833
||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 CTCGATGCCAGGACTGATTGGTCCTT-GTCATAGGGTTCATCATGGTTCTGATGTCAGCT 815
Query 834 TGCACGGAGTATCTTCAATGGAGACAAGCGTAACCAAGCAAGGCAAAGAAACTTCAAGGA 893
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 816 TGCACGGAGTATCTTCAATGGAAACAAGCACAACCAGGCAAGGCAAAGAAACTTCGAGGA 875
Query 894 GGAGCAGCTTCATTGCCACAGACGTGGAAGATCCATCTCGCTTTGCTTTAAATAGCATCA 953
||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | || |
Sbjct 876 GGACCAGCTTCATTGCCACAGATGTGGAAGATCCATCTCGCTTTGCTTT--A-A--AT-A 929
Query 954 GGAGTGATGATGAGTACGACGAGTATGGTGCATACCAGACTGATATTGAGACGAGTCATT 1013
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 930 GGAGTGATGATGAGTACGACGAGTATGGTGTATACCAGACTGATATTGAGACGAGTCATT 989
Query 1014 CTCCTCGAGCTAATGAATATTATGGTCCAATGGAATACAATGGAATGGGCATTGATGATG 1073
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 990 CTCCTCGAGCTAATGAATATTATGGTCCCATGGAATACAATGGAATGAGCATTGATGATG 1049
Query 1074 TCCCCTGTAAGCATCTTG-GTGGAGAAACCGCGGACCAGAAAAGTTTAAGCGGCTCTCCA 1132
|||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1050 GCCCCTGTAAGCATC-TGAGTGGAGAAACCGCTGACCAGAAAAGTTTGAGCGGCTCTCCA 1108
Query 1133 CTCATTCATCAGTGCCTTGAATCTCTGATTCGGGAAGGATCAGAGCAGTTCCAGAAGAAA 1192
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1109 CTCATTCATCAGTGTCTTGAATCTCTGATTCGGGAAGGATCAGAGCAATTCCAGAAGAAA 1168
Query 1193 AGTGAGCATGATGGTCGTGACGAATGTGAAGCTTCTTCTCCAGCAGATATTTCAGATGAT 1252
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 GGTGAGCATGATGGTCGTGACGAATGTGAAGCTTCTTCTCCAGCAGATATTTCAGATGAT 1228
Query 1253 CAAGTGGTAGAACCTGTGGATTTCGAGAACAATGGACTTTTGTGGGTTCCACCTGAGCCA 1312
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1229 CAAGTGGTAGAACCAGTGGATTTCGAGAACAATGGACTTTTGTGGGTTCCACCTGATCCA 1288
Query 1313 GAAAATGAAGAAGACGAGAGAGAAAGTGCTTTGTTTGATGAGGAAGATAACGAGGGAGAT 1372
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289 GAAAATGAAGAAGACGAAAGAGAAAGTGCTTTGTTTGATGAGGAAGATAACGAGGGAGAT 1348
Query 1373 GCCTCAGGTGAGTGGGGATACTTACGACCTTCCACTAGCTTTGGAAGTGGAGAGTACCGT 1432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349 GCCTCAGGTGAGTGGGGATACTTACGACCTTCCACTAGCTTTGGAAGTGGAGAGTACCGT 1408
Query 1433 GGCGAGGATCGAACAACTGAAGAGCACAAGAAGGCTATGAAGAATGTGGTTGATGGGCAC 1492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409 GGCGAGGATCGAACAACTGAAGAGCACAAGAAGGCTATGAAGAATGTGGTTGATGGGCAC 1468
Query 1493 TTTAGGGCTTTGCTTGCACAACTGTTGCAAGTTGAGAACATCTCTGTGAGCGATGAAGAG 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469 TTTAGGGCTTTGCTTGCACAACTGTTGCAAGTTGAGAACATCTCTGTGAGCGATGAAGAG 1528
Query 1553 GGCAAAGAGAGCTGGTTAGAGATTATCACCTCTCTTTCTTGGGAGGCTGCTAACTTATTG 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529 GGCAAAGAGAGCTGGTTAGAGATTATCACCTCTCTTTCTTGGGAGGCTGCTAACTTATTG 1588
Query 1613 AAGCCTGATATGAGCAAAAGTGGAGGAATGGATCCTGGTGGCTATGTCAAAGTAAAGTGC 1672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1589 AAGCCTGATATGAGCAAAAGTGGAGGAATGGATCCTGGTGGCTATGTCAAAGTAAAGTGC 1648
Query 1673 CTAGCTTCTGGATTCCGACATGATAGCATGGTGGTAAAGGGAGTTGTTTGCAAGAAAAAT 1732
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1649 CTAGCTTCTGGATTTCGACATGATAGCATGGTGGTGAAGGGAGTTGTTTGCAAGAAAAAT 1708
Query 1733 GTGGTTAATAGGAGAATGAGTACGAAGATTGAGAAAGCTCGACTATTGATTCTAGGCGGT 1792
|| | | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1709 GTTGCTCATAAGAAAATGAGTACGAAGATTGAGAAAGCTCGACTTTTGATTCTAGGCGGT 1768
Query 1793 GGACTTGAGTATCAAAGGGTCTCAAACCAGTTATCAAGTTTTGATACTTTGTTGCAACAG 1852
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1769 GGACTTGAGTATCAAAGGGTCTCAAATCAGTTATCAAGTTTTGATACATTGCTGCAACAG 1828
Query 1853 GAAAAGGATCATCTAAAGATGGCTGTTGCTAAGATTCACGCTGAACGTCCAAATATTCTA 1912
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1829 GAAAAGGATCATCTAAAGATGGCTGTTGCTAAGATTCATGCTGAACGTCCAAATATTCTA 1888
Query 1913 CTAGTCGAAAAATCAGTTTCTCGATTTGCGCAAGAGTATCTTCTAGCCAAAGACATATCT 1972
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1889 CTAGTCGAAAAATCAGTTTCTCGATTTGCGCAAGAATATCTTCTAGCCAAAGACATATCT 1948
Query 1973 CTTGTTCTAAACATCAAGAGGCCACTTTTAGACCGCATTGCTCGCTGCACTGGTGCTCAA 2032
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1949 GTTGTTCTAAACATCAAGAGGCCACTTCTAGACCGCATTGCTCGCTGCACTGGTGCTCAA 2008
Query 2033 ATAATTCCTTCAGTAGACCACCTCTCCTCTCAAAAGCTGGGTTACTGTGAGAATTTTCGG 2092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009 ATAATTCCTTCAGTAGACCACCTCTCCTCTCAAAAGCTGGGTTACTGTGAGAATTTTCGG 2068
Query 2093 GTGGATAGGTATCCTGAAGAACATGGTTCAACTGGTCAAGTTGGAAAGAAAGTGGTGAAG 2152
|||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2069 GTGGATAGGTTTTTTGAGGAACATGATTCAACTGGTCAAGTTGGAAAGAAAGTGGCGAAG 2128
Query 2153 ACGTTGATGTATTTTGAGCATTGTCCAAAGCCATTAGGCTTTACTATTTTGCTGAGGGGT 2212
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2129 ACGTTGATGTATTTTGAGCATTGTCCAAAACCATTAGGCTTTACAATTTTGCTTAGGGGT 2188
Query 2213 GCAAATGAAGATGAGTTGAAAAAAGTGAAGCATGTGGTCCAGTATGGAGTTTTTGCAGCT 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2189 GCAAATGAAGATGAGTTGAAAAAAGTGAAGCATGTGGTCCAATATGGAGTTTTTGCAGCT 2248
Query 2273 TATCATTTGGCACTCGAAACATCGTTTCTTGCTGATGAGGGAGCCTCACCAGAACTTCCT 2332
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2249 TATCATTTGGCACTCGAAACATCATTTCTTGCTGATGAGGGAGCCTCACCAGAACTTCCT 2308
Query 2333 TTGAATTCCCCGATTACGGTGGCACTTCCAGATAAATCTACGAGCATTGAACGTTCAATA 2392
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2309 TTGAATTCCCCGATTACGGTGGCACTTCCGGATAAATCTACGAGCATTGAACGTTCAATA 2368
Query 2393 TCTACTGTGCCAGGTTTCACGGTCTCAACATATGAAAAATCTCCGACAATGCTATCTTGT 2452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TCTACTGTGCCAGGTTTCACGGTCTCAACATATGAAAAATCTCCGACAATGCTATCTTGT 2428
Query 2453 GCTGAACCACAACGAGCAAACAGTGTTCCAGTATCAGAGTTGCTCTCTACCACTACCAAT 2512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2429 GCTGAACCACAACGAGCAAACAGTGTTCCAGTATCAGAGTTGCTCTCGACCACTACCAAT 2488
Query 2513 CTATCCATCCAGAAGGAT--AT-CCCTCCTATACCCTATGGTTCAGGCTGGCAGGCTAGA 2569
|||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2489 CTATCCATCCAGAAGGATGCAAACCCTCTTATACCCAATGGTTCAGGCTGGCAGGCTAGA 2548
Query 2570 GAAATAAACCCGAGTTTCGTCTTTTCACGCCATAATATTTCATTGAATTTGCCTGACCGT 2629
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2549 GAAATAAACCCGAGTTTCATCTTTTCACGCCATAATGTTTCATTGAATTTGCCTGACCGT 2608
Query 2630 GTGATAGAGAGCAGAAACTCAGATTTGTCTGGAAGATCTGTACCGGTGGACACACCAGCT 2689
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2609 GTGATAGAGAGCAGAAACTCAGATTTGTCTGGAAGATCTGTACCGGTGGACACACCAGTT 2668
Query 2690 GACAAAAGCAATCCAATTGTTGTGGCAGATGAGACAACG-AACAATTCCTTACATTTATC 2748
||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||
Sbjct 2669 GACAAAACCAATCCAGTTGTTGCGGCAGATGACACATTGGAA-AATTCCTTACATTCATC 2727
Query 2749 AGGGCAAGGCTTTGTGCGAAAGAGTTCTCAAATTGGTACGAGCATTATGGTCGAAAACCA 2808
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2728 AGGGCAAGGCTTTGTGCGAAAGAGTTCTCAAAGTGGTACGAGCATTATGGTCGAAAACCA 2787
Query 2809 AGACAATGGTTCAGAGCTTACAATCGCCCAACAACAAAACAATGAGAAACCAAAGGAAAC 2868
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2788 AGACAATGGTTCAGAGCTTACAACCGTCCAACAACAAAACAATGAGAAACCAAAGGAAAC 2847
Query 2869 ACAATCCCAAAAAGAAGAATTTCCTCCGTCACCCTCTGACCACCAGAGCATTTTGGTTTC 2928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2848 ACAATCCCAAAAAGAAGAATTTCCTCCGTCACCCTCTGACCACCAGAGCATTTTGGTTTC 2907
Query 2929 TCTATCATCCCGATCAGTGTGGAAAGGAACTGTGTGTGAAAGGTCTCATCTCTTTCGGAT 2988
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2908 TCTATCTTCCCGATCAGTGTGGAAAGGAACTGTGTGTGAGAGGTCTCACCTCTTTCGGAT 2967
Query 2989 AAAATACTATGGTAGTTTTGATAAACCCTTGGGACGGTTCTTGAGAGATCATTTGTTCGA 3048
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2968 TAAATACTATGGTAGTTTTGATAAACCCTTGGGACGGTTCTTGAGAGATCATTTGTTCGA 3027
Query 3049 TCAGAGTTACAGGTGCCGGTCATGTGAGATGCCATCAGAAGCTCATGTTCACTGTTACAC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3028 TCAGAGTTACAGGTGCCGGTCATGTGAGATGCCATCAGAAGCTCATGTTCATTGTTACAC 3087
Query 3109 TCATCGACAAGGCAGCCTTACGATATCTGTCAAGAAACTTCAAGATTATCTCTTACCTGG 3168
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3088 TCATCGACAAGGCAGCCTTACTATATCTGTCAAGAAGCTCCAAGATTATCTCTTACCTGG 3147
Query 3169 TGAAAAGGAGGGGAAGATCTGGATGTGGCATAGATGCCTGAGATGCCCGCGACTTAACGG 3228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3148 TGAAAAGGAGGGGAAGATCTGGATGTGGCATAGATGCCTGAGATGCCCGCGACCTAACGG 3207
Query 3229 CTTCCCTCCAGCGACTCTACGAGTGGTTATGTCTGATGCTGCATGGGGATTATCGTTTGG 3288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3208 CTTCCCTCCAGCGACTCTACGAGTGGTTATGTCTGATGCTGCATGGGGATTATCGTTTGG 3267
Query 3289 GAAGTTTCTGGAGCTCAGTTTCTCAAATCACGCAGCTGCTAGTAGAGTAGCTTGTTGTGG 3348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3268 GAAGTTTCTGGAGCTCAGTTTCTCAAATCACGCAGCTGCTAGTAGAGTAGCTTGTTGTGG 3327
Query 3349 CCATTCTCTGCATAGAGATTGTCTTCGCTTCTATGGATTTGGGAACATGGTTGCTTGCTT 3408
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3328 CCATTCTCTGCATAGAGATTGTCTTCGCTTCTATGGCTTTGGGAACATGGTTGCTTGCTT 3387
Query 3409 CCGGTACGCTACTATAGATGTTCATTCGGTCTACCTTCCACCATCAATTCTTAGTTTCAA 3468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3388 CCGGTACGCTACTATAGATGTTCATTCGGTCTACCTTCCACCATCAATTCTTAGTTTCAA 3447
Query 3469 CTACGAGAATCAGGATTGGATACagagagagacagacgaggtgatagagagagcagagCT 3528
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3448 CTATGAGAATCAGGACTGGATACAGAGAGAGACAGATGAGGTGATAGAGAGAGCAGAGCT 3507
Query 3529 TCTGTTTTCTGAAGTATTAAATGCTATTAGTCAAATTGCAGAGAAAGGTTTCAGGCGACG 3588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3508 TCTGTTTTCTGAAGTATTAAATGCTATTAGTCAAATTGCAGAGAAAGGTTTTAGGCGTCG 3567
Query 3589 AATTGGTGAACTCGAAGAAGTGCTGCAAAAAGAGAAAGCGGAATTTGAGGAGAATATGCA 3648
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3568 AATTGGTGAACTCGAAGAAGTGCTGCAAAGAGAGAAATCAGAATTTGAGGAAAATATGCA 3627
Query 3649 AAAGATTTTGCACAGGGAGGTGAACGAAGGCCAACCTCTCGTGGACATTCTTGAGCTATA 3708
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3628 AAAGATGTTGCACAGGGAGGTGAACGAAGGCCAACCTCTCGTGGACATTCTTGAGCTATA 3687
Query 3709 TCGGATTCACAGACAACTTCTTTTTCAGTCATACATGTGGGATCACCGCTTAATTAATGC 3768
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3688 TCGGATTCGCAGACAACTGCTTTTTCAGTCATACATGTGGGATCACCGCTTGATTAATGC 3747
Query 3769 ATCTACTTTACATAAGCTTGAGAATAGTGATGACACAAAGAGAGAAGAGAACGAGAAACC 3828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3748 ATCTACTTTACATAAGCTTGAGAATAGTGATGACACAAAGAGAGAAGAGAACGAGAAACC 3807
Query 3829 TCCCTTGGCTAAGAGCCAGACGCTCCCGGAGATGAATGCTGGGACCAACTCTCTTCTTAC 3888
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3808 TCCCTTGGCTAAGAGCCAGACGCTCCCCGAGATGAATGCTGGGACCAACTCTCTTCTTAC 3867
Query 3889 TGGCTCTGAGGTTAATCTGAATCCTGATGGTGATTCTACTGGTGACACTGGCTCCTTAAA 3948
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3868 TGGCTCAGAAGTTAATCTGAATCCTGATGGTGATTCTACTGGTGACACTGGCTCCTTAAA 3927
Query 3949 TAATGTTCAGAAAGAAGCGGATACGAATTCAGATTTGTATCAGGAAAAGGATGATGGGGG 4008
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3928 TAATGTTCAGAAGGAAGCGGATACAAATTCAGATTTGAATCAGGAAAAGAATGATGGGGG 3987
Query 4009 AGAAGTTTCTCCCAGCAAGACCTTACCAGATACATCTTATCCTCTGGAAAATAAAGTCGA 4068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3988 AGAAGTTTCTCCCAGCAAGACCTTACCAGATACATCTTATCCTCTGGAAAATAAAGTCGA 4047
Query 4069 TGTTCGTAGAACACAGTCTGATGGCCAGATAGTTATGAAAAATCTATCAGCCACTCTTGA 4128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4048 TGTTCGTAGAACACAGTCTGATGGCCAGATAGTTATGAAAAATCTATCAGCCACTCTTGA 4107
Query 4129 TGCAGCATGGATAGGTGAACGTCAAACATCTGTGGAGATTCCAACCAACAATAAGGTCTC 4188
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4108 TGCAGCATGGATAGGTGAACGTCAAACATCTGTGGAGATTCCAACCAACAATAAGGTCTT 4167
Query 4189 GCTTCCTCCTTCCACCATGTCAAACTCTTCAACTTTTCCTCCAATCTCAGAGGGGCTAAT 4248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4168 GCTTCCTCCTTCCACCATGTCAAACTCTTCAACTTTTCCTCCAATCTCAGAGGGGCTAAT 4227
Query 4249 GCCTATAGATCTCCCAGAACAGCAAAATGAGTTCAAGGTGGCCTATCCTGTTTCCCCAGC 4308
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4228 GCCTATAGATCTCCCAGAACAGCAAAATGAATTCAAGGTGGCCTATCCTGTTTCCCCAGC 4287
Query 4309 ATTACCGAGTAAGAATTATGAGAATTCAGAAGACTCTGTCAGCTGGCTAAGTGTGCCATT 4368
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4288 ATTACCAAGTAAGAATTATGAGAATTCAGAAGACTCTGTCAGCTGGTTAAGTGTGCCATT 4347
Query 4369 CCTCAACTTCTACCGTTCCATTAACAAGAATTTCCTGCTTAGCTCTCAGAAGCTTGATAC 4428
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4348 CCTCAACTTTTACCGTTCCATTAACAAGAATTTCCTGCTTAGCTCTCAGAAGCTTGATAC 4407
Query 4429 ATTTGGCGAGCATAGCCCTATCTATATTTCATCTTTTAGAGAGGCAGAGCTTCAAGGTGG 4488
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4408 ATTTGGCGAGCATAGCCCTATCTATATTTCATCTTTTAGAGAGGCAGAACTTCAAGGTGG 4467
Query 4489 ACCAAGGCTACTTCTGCCCGTAGGCTTAAATGATATTGTTGTTCCGGTTTATGATGATGA 4548
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4468 ACCAAGGCTACTTCTGCCCGTAGGCTTAAATGATATTGTTGTTCCGGTATATGATGATGA 4527
Query 4549 ACCTACTAGTATGATCGCATATGCCTTAATGTCACCAGAATATCAACGCCAAACTTCTGC 4608
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4528 ACCCACTAGTATGATCGCATATGCCTTGATGTCACCGGAATATCAACGCCAAACTTCTGT 4587
Query 4609 TGAAGGGGAATCTCTAGTTTCATATCCTTCTGAACTCAATATCCCTCGCCCAGTTGATGA 4668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4588 TGAAGGGGAATCTCTAGTTTCATATCCTTCTGAACTCAATATCCCTCGCCCAGTTGATGA 4647
Query 4669 TACCATTTTTGACCCTAGCAGAAGCAATGGTTCAGTCGACGAGAGCATACTTTCAATATC 4728
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4648 CACCATTTTTGACCCTAGCAGAAGCAATGGTTCAGTCGACGAGAGCATACTTTCAATATC 4707
Query 4729 CTCATCTCGCAGTACCTCACTTCTGGACCCACTATCATATACAAAAGCTTTACATGCTCG 4788
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4708 CTCATCTCGCAGTAGCTCACTTTTGGACCCACTATCATATACAAAAGCTTTACATGCTCG 4767
Query 4789 AGTCTCATATGGAGAGGACGGTACGCTTGGAAAAGTGAAGTACACTGTTACTTGTTACTA 4848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4768 AGTCTCATATGGAGAGGACGGTACGCTTGGAAAAGTGAAGTACACTGTTACTTGTTACTA 4827
Query 4849 TGCAAAGCGGTTTGAGGCGCTACGGGGTATATGTCTCCCTTCGGAACTTGAGTATATACG 4908
|||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 4828 TGCAAAACGATTTGAGGCGCTGCGGGGTATATGTCTCCCTTCGGAACTTGAGTTTATAAG 4887
Query 4909 GTCTCTTAGCCGGTGTAAAAAATGGGGAGCTCAAGGTGGCAAGAGCAATGTCTTCTTTGC 4968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4888 GTCTCTTAGCCGGTGTAAAAAATGGGGAGCTCAAGGTGGCAAGAGCAATGTCTTCTTTGC 4947
Query 4969 TAAAACCCTGGACGATCGATTTATCATCAAGCAAGTCACCAAGACAGAGTTGGAATCATT 5028
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4948 TAAAACCCTGGATGATCGATTTATCATCAAGCAAGTCACCAAGACAGAGTTGGAATCATT 5007
Query 5029 CATCAAATTTGCACCTGCTTACTTTAAATACTTGTCTGAGTCTATCAGCACGAAAAGCCC 5088
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5008 CATCAAATTTGCACCTGCTTACTTCAAATACTTATCTGAGTCTATCAGCACGAAAAGCCC 5067
Query 5089 AACCTGCCTGGCAAAAATCTTGGGAATCTATCAGGTCGCAACAAAGCAACTTAAGAGCGG 5148
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5068 AACCTGCCTGGCAAAAATATTGGGAATCTATCAGGTCGCAACAAAGCAACTTAAGAGCGG 5127
Query 5149 GAAAGAAACAAAGATGGATGTTCTGATTATGGAGAATCTTCTGTTTGGAAGAACTGTGAA 5208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5128 GAAAGAAACAAAGATGGATGTTCTGATTATGGAGAATCTTCTGTTTGGAAGAACTGTGAA 5187
Query 5209 ACGGCTTTATGACCTTAAAGGATCTTCGCGGGCGCGCTACAATCCTGACTCTAGTGGGAG 5268
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5188 ACGGCTATATGACCTTAAAGGATCTTCCCGGGCGCGCTACAATCCTGACTCCAGTGGGAG 5247
Query 5269 CAACAAAGTCTTGTTGGATCAAAACTTGATTGAAGCAATGCCAACTTCTCCCATTTTCGT 5328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5248 CAACAAAGTCTTGTTGGATCAAAACTTGATTGAAGCAATGCCAACTTCTCCCATTTTCGT 5307
Query 5329 CGGTAACAAAGCAAAACGATTGTTGGAAAGAGCTGTCTGGAACGATACTGCTTTTCTTGC 5388
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5308 CGGTAACAAAGCAAAACGATTGTTGGAAAGAGCCGTCTGGAACGATACTGCTTTTCTTGC 5367
Query 5389 ATTGGGTGATGTGATGGATTATTCATTGCTAGTAGGCGTGGATGAAGAAAAGAACGAGCT 5448
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5368 ATTGGGTGATGTGATGGATTATTCGTTGCTAGTAGGCGTGGATGAAGAAAAGAACGAGCT 5427
Query 5449 AGTTCTCGGGATTATCGACTTCTTGAGGCAGTACACATGGGACAAGCATCTAGAGTCTTG 5508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5428 AGTTCTCGGGATTATCGACTTCTTGAGGCAGTACACATGGGACAAGCATCTAGAGTCTTG 5487
Query 5509 GGTGAAATTTACAGGAATCTTAGGAGGACCAAAGAATGAAGCACCAACAGTAATCTCTCC 5568
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5488 GGTGAAATTTACAGGAATCTTAGGAGGACCAAAGAATGAAGCACCAACAGTAATATCTCC 5547
Query 5569 AAAGCAATATAAGAGAAGATTCAGAAAAGCAATGACAACTTACTTCCTCATGGTCCCTGA 5628
||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5548 AAAGCAATACAAGAGAAGATTCAGAAAGGCGATGACAACTTACTTCCTTATGGTCCCTGA 5607
Query 5629 TCAATGGTCTCCGCCTAATGTTGTTGCAAATAACTCCAAGTCTGATCAACCTGAAGAAAC 5688
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5608 TCAATGGTCTCCGCCTAATGTCGTTGCGAATAACTCCAGGTCTGATCAACCTGAAGAAAC 5667
Query 5689 CTCTCAAGCCGGTACACAAGCAGAGTGATACAAGA 5723
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5668 CTCTCAAGCCGGTACACAAGCAGAGTGATACAAGA 5702
> Ahg491361 jgi|Araly1|491361|fgenesh2_kg.7__794__AT4G33240.2
Length=5668
Score = 52.8 bits (28), Expect = 3e-05
Identities = 28/28 (100%), Gaps = 0/28 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4121 ACTCTTGATGCAGCATGGATAGGTGAAC 4148
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3881 ACTCTTGATGCAGCATGGATAGGTGAAC 3908
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 226823135080
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5