BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G14460.1
Length=4275
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg478870 jgi|Araly1|478870|fgenesh2_kg.3__1571__AT3G14460.1 6789 0.0
> Ahg478870 jgi|Araly1|478870|fgenesh2_kg.3__1571__AT3G14460.1
Length=4290
Score = 6789 bits (3676), Expect = 0.0
Identities = 4100/4302 (95%), Gaps = 39/4302 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGAACTCCTATTTATCAAGTTGTGCAAACGTGATGGTTGAACGGATTAATACTTCT 60
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGAACTCCTATTTATCAAATTGTGCGAACGTGATGGTTGAACGGATTAATACTTCT 60
Query 61 CAAGAATTGGTCGAACTATGTAAAGGAAAGTCCTCCAGTGCATTGCTGAAGAGATTGAAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAAGAATTGGTCGAACTATGTAAAGGAAAGTCCTCCAGTGCATTGCTGAAGAGATTGAAG 120
Query 121 GTTGCTTTGGTGACTGCAAACCCGGTGCTTGCGGATGCTGATCAGAGAGCAGAACATGTT 180
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTTGCTTTGGTGACTGCGAACCCGGTGCTTGCGGATGCTGAGCAGAGAGCAGAACATGTT 180
Query 181 CGGGAAGTTAAACATTGGCTTACAGGAATCAAAGATGCTTTCTTCCAGGCAGAGGATATC 240
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 181 CGGGAAATAAAACATTGGCTTACAGGAATCAAAGATGCTTTCTTCCAGGCAGAGGATGTC 240
Query 241 CTTGATGAGTTGCAAACAGAAGCTTTGAGAAGAAGAGTAGTAGCTGAAGCAGGAGGCTTA 300
||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTTGATGAGTTGCTAACCGAAGCTTTGCGGAGAAGAGTAGTAGCTGAAGCAGGAGGCTTT 300
Query 301 GGAGGACTATTCCAGAATCTCATGGCTGGTCGAGAAGCCATTCAGAAAAAGATAGAACCA 360
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 301 GGAGGACTATTCCAGAATCTCAGGGCTGGTCGAGAAGCCATCCAGAAAAAGATAGAACCA 360
Query 361 AAGATGGAAAAAGTAGTTAGACTACTGGAACATCATGTGAAACACATTGAAGTTATTGGA 420
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AAGATGGAAAAAGTAGTTAGACTGCTGGAACATCATGTGAAACACATTGAAGTTATTGGA 420
Query 421 TTGAAAGAATATAGCGAGACTCGAGAACCACAATGGAGGCAAGCATCACGGTCAAGACCT 480
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTGAAAGAATATAGTGAGACTCGAGAACCACAATGGAGACAAGCATCACGGTCAAGACCT 480
Query 481 GATGATCTTCCACAAGGCAGATTGGTCGGGCGAGTGGAAGATAAGCTAGCGTTAGTCAAT 540
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GATGATCTTCCACAAGGTAGAGTGGTCGGGCGAGTGGAAGATAAGCTAGCGTTAGTCAAT 540
Query 541 TTGCTGCTTTCTGATGATGAAATAAGCATTGGGAAACCAGCTGTTATCTCCGTAGTTGGT 600
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 541 TTGCTGCTTTCTGATGATGAAATAAGCACTGGGAAACCAACTGTGATCTCCGTAGTTGGT 600
Query 601 ATGCCAGGGGTTGGAAAGACTACCTTGACAGAGATAGTTTTTAATGACTACAGGGTGACC 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 601 ATGCCAGGGGTTGGAAAGACTACCTTGACAGAGATAGTTTTTAATGACAACAGGGTGACC 660
Query 661 GAACATTTTGAGGTTAAAATGTGGATCTCTGCTGGGATAAACTTTAATGTCTTTACGGTT 720
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 661 GAACATTTTGATGTTAAAATGTGGATCTCTGCCGGGATAAACTTTAACGTCTTCACGGTT 720
Query 721 ACAAAAGCAGTTCTGCAGGATATCACTTCAAGTGCAGTTAATACTGAGGATCTACCTTCA 780
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ACAAAAGCCGTTCTGCAGGATATCACTTCAAGTGTAGTTAATACTGAGGATCTACCTTCA 780
Query 781 CTTCAAATTCAGCTGAAGAAAACACTCTCGGGGAAGAGATTTTTACTTGTTCTGGATGAT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CTTCAAATTCAGCTGAAGAAAACACTCTCGGGGAAGAGATTTTTACTTGTTCTGGATGAT 840
Query 841 TTTTGGTCTGAAAGTGATTCAGAATGGGAGAGTTTCCAGGTCGCCTTTACTGATGCAGAG 900
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TTTTGGTCTGAAAGTGATTCAGAATGGGAAAGTTTCCAGGTCGCCTTTACTGATGCAGAG 900
Query 901 GAAGGAAGCAAGATTGTTCTAACCACACGAAGTGAAATTGTCTCCACAGTAGCAAAGGCT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GAAGGAAGCAAGATTGTTCTAACCACACGAAGTGAAATTGTCTCCACAGTAGCAAAGGCT 960
Query 961 GAAAAAATCTACCAAATGAAGTTGATGACTAATGAAGAATGTTGGGAGCTGATCTCTAGA 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GAAAAAATCTACCAAATGAAGTTGATGACTAATGAAGAATGTTGGGAGCTGATCTCTAGA 1020
Query 1021 TTCGCTTTTGGAAATATATCAGTCGGTTCTATCAACCAAGAACTAGAAGGAATTGGCAAA 1080
|| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TTTGCATTTGGAAACATATCAGTCGGTTCTATCAACCAAGAACTAGAAGGAATTGGCAAA 1080
Query 1081 AGGATTGCAGAACAGTGCAAGGGCTTGCCATTAGCTGCACGAGCCATTGCATCTCATCTC 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 AGGATTGCAGAACAGTGCAAGGGCTTGCCATTAGCTGCACGAGCCATTGCATCTCATCTC 1140
Query 1141 CGTTCAAAGCCAAATCCTGACGACTGGTATGCTGTATCAAAGAATTTTTCAAGCTACACC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1141 CGTTCAAAGCCAAATCCTGACGACTGGTATGCTGTATCAAAGAATTTCTCAAGCTACACC 1200
Query 1201 AACAGTATCCTTCCAGTTCTTAAACTAAGCTATGACTCTCTTCCTCCTCAACTTAAGCGA 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1201 AACAGTATCCTTCCAGTTCTTAAACTAAGCTATGACTCTCTTCCTGCTCAACTTAAGCGA 1260
Query 1261 TGCTTTGCCCTCTGCTCGATATTCCCCAAGGGTCATGTTTTCGATAGGGAGGAATTAGTA 1320
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TGCTTTGCCCTCTGCTCAATATTCCCCAAGGGTCATATTTTCGATAGGGAGGAATTAGTA 1320
Query 1321 CTCCTATGGATGGCAATAGACCTCTTATACCAACCAAGGAGCAGCAGAAGATTGGAAGAT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 CTCCTATGGATGGCAATAGACCTCTTATACCAACCAAGGAGCAGCAGAAGATTGGAAGAT 1380
Query 1381 ATTGGAAATGATTACCTTGGTGATTTAGTTGCTCAATCtttttttCAGAGATTGGATATC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 ATTGGAAATGATTACCTTGGTGATTTAGTTGCTCAATCTTTTTTTCAGAGATTGGATATC 1440
Query 1441 ACCATGACGAGCTTTGTGATGCATGATCTTATGAATGATTTGGCAAAAGCTGTTTCAGGA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 ACCATGACGAGCTTTGTGATGCATGATCTTATGAATGATTTGGCAAAAGCTGTTTCAGGA 1500
Query 1501 GATTTTTGTTTCAGACTGGAAGATGACAACATTCCGGAGATACCAAGCACAACTCGACAT 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GATTTTTGTTTCAGACTGGAAGATGACAACATTCCGGAGATACCAAGCACAACTCGACAT 1560
Query 1561 TTTTCATTTTCTAGAAGCCAATGTGATGCTTCTGTGGCTTTTAGGTCCATCTGTGGAGCT 1620
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 1561 TTTTCTTTTTCTAGAAGCCAATGTGATGCTTCCGTGGCTTTCAGGTCCATCTCTGGAGCT 1620
Query 1621 GAGTTTCTGAGAACCATTCTTCCTTTCAACTCGCCAACAAGTCTTGAATCTCTCCAACTA 1680
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 GAGTTTCTGAGAACCATTCTTCCGTTCAACTCGCCAACAAGTCTTGAATCTCTCCAACTA 1680
Query 1681 ACAGAAAAAGTTTTGAATCCTTTGCTCAATGCATTGAGTGGCCTACGAATTCTTAGCTTG 1740
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 ACAGAAAAAGTTTTGAATCCTTTGCTCCATGCAGTGAGCGGCCTACGAATTCTTAGCTTG 1740
Query 1741 TCTCATTATCAGATAACCAACTTGCCTAAATCGTTAAAAGGTTTGAAGCTTTTACGGTAT 1800
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1741 TCTCATTATCAGATAACCAACTTGCCTAAATCATTAAAAGGTTTGAAGCTGTTACGGTAT 1800
Query 1801 CTAGATCTGTCAAGCACCAAAATAAAAGAGCTCCCAGAGTTTGTGTGTACTCTCTGTAAT 1860
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 CTAGATTTGTCAAGCACCAAAATAAAAGATCTCCCAGAGTTTGTGTGTACTCTCTGTAAT 1860
Query 1861 CTGCAGACACTATTGTTGTCAAATTGTCGTGACCTCACAAGCCTGCCAAAAAGCATTGCC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 CTGCAGACACTATTGTTGTCAAATTGTCGTGACCTCACAAGCCTGCCAAAAAGCATTGCC 1920
Query 1921 GAACTTATCAATTTGCGCCTCCTTGACCTCGTTGGCACTCCTTTAGTAGAGATGCCACCC 1980
||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1921 GAACTCATCCATTTGCGCTTCCTTGATCTCGTTGGCACTCCTTTGGTAGAGATGCCACCA 1980
Query 1981 GGAATAAAAAAGCTGCGAAGCTTGCAGAAGTTATCAAATTTTGTTATAGGAAGGCTGAGT 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1981 GGAATAAAAAAGCTGCGAAGCTTGCAGAAGTTATCAAATTTTGCTATAGGAAGGCTGAGT 2040
Query 2041 GGTGCCGGGCTGCATGAGCTCAAAGAACTTTCTCATCTCCGAGGGACACTTCGCATCTCT 2100
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GGTGCTGGGCTGCATGAGCTCAAAGAACTTTTTCATCTCCGAGGGACACTTCGCATCTCT 2100
Query 2101 GAGCTACAAAATGTGGCGTTTGCCTCAGAAGCAAAAGATGCTGGTTTGAAAAGAAAGCCA 2160
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 GAGCTACAAAATGTGGCTTTTGCCTCAGAAGCAAAAGACGCTGGTTTGAAAAGAAAGCCA 2160
Query 2161 TTCCTTGACGGGTTAATCCTGAAGTGGACTGTCAAAGGTTCTGGCTTCGTCCCTGGTAGT 2220
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 TTCCTTGACGAGTTAATCCTGAAGTGGACTGTCAAAGGTTCTGGCTTCGTCCCTGGTAGT 2220
Query 2221 TTTAATGCATTGGCATGTGACCAGAAAGAGGTCCTAAGGATGCTAGAACCCCATCCACAC 2280
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTTAATGCATTGGCCTGTGACCAGAAAGAGGTCCTAAGGATACTAGAACCCCATCCACAC 2280
Query 2281 TTGAAAACGTTCTGCATTGAATCTTATCAGGGTGGAGCATTTCCTAAGTGGTTGGGTGAT 2340
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2281 TTGAAAACGTTCTGCATTGAATCTTATCAGGGTGGAGCATTTCCGAAGTGGTTGGGTGAT 2340
Query 2341 TCTTCATTCTTCGGTATTACGTCCGTCACTCTCAGTAGCTGCAACCTCTGCATATCACTG 2400
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 TCTTCATTCTTCGGTATTGCGTCCGTCACTCTCAGTAGCTGCAACCTCTGCATATCACTG 2400
Query 2401 CCTCCAGTGGGGCAGTTGCCTTCACTCAAGTATCTCAGCATTGAAAAATTTAATATTCTG 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2401 CCTCCAGTGGGGCAGTTGCCTTCACTCAAGTATCTCAGCATTGAAAAATTTAACATTCTG 2460
Query 2461 CAGAAGGTTGGTCTAGACTTCTTCTTCGGTGAGAACAACTCT-AGAGGTGTACCGTTTCA 2519
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||
Sbjct 2461 CAGAAGGTTGGTATAGACTTCTTCTTCGGTGAGAACAAC-CTTAGCTGTGTACCGTTTCA 2519
Query 2520 ATCCTTGCAAATTCTAAAGTTCTATGGCATGCCAAGATGGGACGAATGGATTTGTCCGGA 2579
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2520 ATCCTTGCAAACTCTAAAGTTCTATGGCATGCCAAGATGGGAAGAATGGATTTGTCCGGA 2579
Query 2580 ACTAGAAGATGGGATCTTTCCTTGCCTCCAAAAACTCATAATACAAAGATGCCCCAGCTT 2639
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 ACTAGAAGGTGGAATCTTTCCTTGCCTCCAAAAACTCATAATACAAAGATGCCCCAGCTT 2639
Query 2640 AAGAAAAAAGTTTCCAGAAGGACTCCCTTCATCCACTGAAGTCACCATCTCTGATTGTCC 2699
|| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 AACAAAAAAATTTCCAGAAGGACTCCCTTCTTCCACTGAAGTCACCATCTCTGATTGTCC 2699
Query 2700 CCTAAGAGCAGTTTCTGGAGGAGAAAATTCCTTCAGAAGGAGTCTGACAAATATTCCAGA 2759
||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 CCTAAGAGCAGTTGCTGGAGGAGAACATTCCTCCAGAAGGAGTCTGACAAATATTCCAGA 2759
Query 2760 AAGTCCAGCCAGCATTCCCTCTATGAGCAGAAGGGAACTGTCTTCCCCTACAGGGAATCC 2819
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2760 AAGTCCAACCAGCATTCCCTCTATGAGCAGAAGGGAACTGTCTTCCCCTACAGGGAATTC 2819
Query 2820 AAAATCAGATGCAAGTACCAGTGCTCAGCCAGGTTTTGCTTCAAGTAGTCAAAGTAATGA 2879
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 AAAATCTGATGCAAGTACCAGTGCTCAGCCAGGTTTTGCTTCAAGTAGTCAAAGTAATGA 2879
Query 2880 TGACAATGAAGTAACTTCAACATCAAGCTTGTCATCTTTACCAAAGGA-C--C----GTC 2932
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||
Sbjct 2880 TGACAATGAAGTAACTTCGACATCAAGCTTGTCATCTTTGCCAAAGGATCGTCCACTGTC 2939
Query 2933 A-AA-CAGAAGATTTCGACCAATATGAAACTCAACTTGGAAGCTTACCACAACAATTTGA 2990
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 2940 ACAAACAGAAGATTTCGACCAATATGAAACTCAACTTGGAAGCTTACCTCAGCATTTTGA 2999
Query 2991 AGAACCTGCTGTGATCTCGGCAAGATACTCAGGATATATCTCGGATATACCTAGCACGTT 3050
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3000 AGAACCTGCAGTGATCTCGGCAAGATACTCAGGATATATCTCGGATATACCTAGCTCGTT 3059
Query 3051 AAGTCCGTATATGTCAAGAACATCACTTGTTCCAGATCCCAAAAATGAAGGTTCTAT-TC 3109
|||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 3060 AAGTCCGTATATATCAAGAACATCACTTCTTCCCGATCCCAAAAATGAAGGTTC-AGGTC 3118
Query 3110 TTCCTGGAAGTAGTAG-CT-A-C--C-AGTACCATCAATATGGGATTAAGTCAT-CTGTT 3162
|||||||||||||||| || | | | ||||||| | |||||| | ||| | | |||||
Sbjct 3119 TTCCTGGAAGTAGTAGGCTTAGCTACCAGTACCAGCCATATGG-A--AAG-CTTTCTGTT 3174
Query 3163 CCGAGTCCACGGTCAAGTGA-AGCA-ATAA-A----GCCGTCACAATATGATGATGATGA 3215
| |||||||| |||||||| | || |||| | || ||||||||||||||||| |
Sbjct 3175 CGGAGTCCACCATCAAGTGATA-CAGATAACAAAAAGCTTTCACAATATGATGATGA--A 3231
Query 3216 AACAGACATGGAATATTTAAAAGTGACAGACATATCTCACCTCATGGAGCTTCCTCAGAA 3275
| ||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3232 A-CAGGCATGGACTATTTGAAAGTGACAGAGATCTCTCACCTCATGGAGCTTCCTCAAAA 3290
Query 3276 TCTGCAGTCACTCCACATCGACAGCTGCGACGGACTCACTTCCTTACCGGAGAACTTAAC 3335
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3291 TCTACAGTCACTCCACATCGACAGCTGCGATGGACTCACTTCCTTACCAGAGAACTTAAC 3350
Query 3336 AGAAAGCTATCCAAACCTCCATGAACT-ACTCATCATTGCTTGTCATTCTCTAGAATCTT 3394
||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||
Sbjct 3351 AGAAAGCAATCCAAATCTCCATGAACTGA-TCATCATTGCTTGTCACTCTCAAAAATCTT 3409
Query 3395 TCCCTGGAAGCCACCCTCCAACCACATTGAAAACCTTATACATAAGAGACTGCAAGAAAC 3454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3410 TCCCTGGAAGCCACCCTCCAACCACATTGAAAACCTTATACATAAGAGACTGCAAGAAAC 3469
Query 3455 TAAATTTCACAGAGAGTTTGCAACCAACACGAAGTTACTCACAGCTCGAGTACCTTTTCA 3514
|| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 3470 TAGATTTCGCAGAGAGTTTGCAGCCAACACGAAGTTACTCACAGCTCGAATACCTGTTCA 3529
Query 3515 TCGGAAGTAGCTGCAGCAATCTCGTCAATTTCCCTCTATCATTGTTTCCGAAGCTGAGAA 3574
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||
Sbjct 3530 TCGGAAGTAGCTGCAGCAATCTCGTCAACTTCCCTCTATCCTTATTTCCGAAGCTCAAAA 3589
Query 3575 GCCTCTCAATTAGGGATTGTGAAAGCTTCAAAACTTTCTCGATTCACGCAGGACTCGGAG 3634
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3590 GCCTCTCGATTAGGGATTGTGAAAGCTTCAAAACTTTCTCAATTCACGCAGGACTTGGAG 3649
Query 3635 ACGATCGTATCGCACTCGAGTCTCTTGAGATTAGGGATTGCCCAAATCTGGAAACTTTCC 3694
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 3650 ACGATCGTATCGCTCTCGAGTCTCTTGAAATTAGGGATTGTCCAAATCTGGTAACTTTCC 3709
Query 3695 CACAAGGAGGCCTTCCAACACCGAAACTTTCTTCAATGTTACTCTCAAACTGCAAAAAGC 3754
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3710 CACAAGGAGGACTTCCAACACCGAAACTCTCTTCAATGTTACTCTCTAACTGCAAAAAGC 3769
Query 3755 TTCAAGCTTTACCTGAGAAATTGTTTGGACTCACTTCTCTCTTGTCACTGTTTATAATCA 3814
| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3770 TCCGAGCTTTACCGGAGAAATTGTTCGGACTCACTTCTCTCTTGTCACTGTTTATAATCA 3829
Query 3815 AATGCCCAGAAATCGAGACGATTCCTGGTGGAGGGTTCCCAAGTAATCTTCGAACACTTT 3874
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||
Sbjct 3830 AATGCCCAGAAATCGAGACGATCCCAGGTGGAGGGTTTCCGAGTAATCTCCGAACACTTT 3889
Query 3875 GCATCAGCCTTTGCGACAAGCTTACACCGAGAATCGAATGGGGATTGAGAGATTTGGAGA 3934
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3890 GCATCAGCCTTTGCGACAAGCTTACACCGAGAATCGAATGGGGATTGAGAGATTTGGAAA 3949
Query 3935 ATCTTCGAAATCTCGAGATTGATGGAGGAAACGAAGACATTGAATCGTTTCCTGAGGAAG 3994
||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 3950 ATCTTCGAAATCTTGAGATTGAAGGAGGTAACGAAGACATTGAATCGTTTCCAGATGAAG 4009
Query 3995 GGTTATTGCCAAAAAGTGTTT-TTTCTCTGCGGATTAGTCGTTTCGAGAACCTCAAGACT 4053
|||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4010 GGTTATTGCCAAAAGG-GATTATTTCTCTGAGGATTAGTCGTTTCGAGAACCTCAAGACT 4068
Query 4054 CTGAATCGAAAAGGGTTTCATGATACAAAAGCTATTGAGACGATGGAGATCAGCGGCTGT 4113
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4069 CTGAATCGAAAAGGGTTTCAAGATACAAAAGCTATTGAGACGATGGAGATCAACGGCTGT 4128
Query 4114 GATAAGCTACAGATATCGATAGATGAAGATCTTCCTCCTTTGTCTTGTCTGAGAATAAGC 4173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4129 GATAAGCTACAGATATCGATAGATGAAGATCTTCCTCCTTTGTCTTGTCTGAGAATAAGC 4188
Query 4174 TCATGTTCTTTGTTGACTGAGACTTTTGCTGAAGTGGAAACAGAGTTCTTCAAGGTTTTG 4233
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4189 TCATGTTCATTGTTGACTGAGAGTTTTGCTGAAGCAGAAACAGAGTTCTTCAAGGTTTTG 4248
Query 4234 AACATTCCATACGTGGAAATCGATGGCGAGATCTTCTCTTGA 4275
||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 4249 AACATTCCACATGTGGAAATTGACGGCGAGATCTTCTCTTGA 4290
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 161668570104
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5