BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G14570.1
Length=5931
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg929239 jgi|Araly1|929239|scaffold_301696.1 5792 0.0
> Ahg929239 jgi|Araly1|929239|scaffold_301696.1
Length=5969
Score = 5792 bits (3136), Expect = 0.0
Identities = 3313/3401 (97%), Gaps = 1/3401 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2531 GCAGGGGGTCTGATGGCCAGAAAAATAGTATGGCCAAGTTTGTCTTGGTCTGGAACCAAG 2590
||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2549 GCA-GGGGTCAGACGGCCAGAAAAATAGTATGGCCAAGTTTGTCTTGGTCTGGAACCAAG 2607
Query 2591 TCATTAACAGTTTCAGAACAGAAGATCTGATAAGTAACAAGGAATTAGATTTGATGACGA 2650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2608 TCATTAACAGTTTCAGAACAGAAGATCTGATAAGTAACAAGGAATTAGATTTGATGACGA 2667
Query 2651 TGCCGCTGTCATCGGAGGTATTATCAGGAATCATCCGTTGGCCCATTTTCCTCCTTGCAA 2710
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2668 TGCCGATGTCATCGGAGGTATTATCAGGGATCATCCGTTGGCCCATTTTCCTCCTTGCAA 2727
Query 2711 ATAAGTTTTCAACAGCTCTGAGCATTGCAAAAGATTTTGTCGGGAAGGATGAGGTTCTCT 2770
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2728 ATAAGTTTTCAACAGCTCTGAGCATTGCAAAAGATTTTGTCGAGAAGGATGAGGTTCTTT 2787
Query 2771 ATCGAAGGATTCGGAAAGACGAGTACATGTACTACGCAGTAAAAGAGTGCTATGAATCTT 2830
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2788 ATCGAAGGATTCGGAAAGACGAGTACATGTACTACGCAGTAAAAGAATGCTATGAATCTT 2847
Query 2831 TGAAGTACATTCTTCAGATTCTTGTTGTTGGTGATCTTGAGAAAAAGATTATATCTGGTA 2890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2848 TGAAGTACATTCTTCAGATTCTTGTTGTTGGTGATCTTGAGAAAAAGATTATATCTGGTA 2907
Query 2891 TAATAAACGAGATAGAGGAAAGCATCAGACAGTCAAGTTTGCTTGAAGAATTTAAGATGG 2950
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2908 TAATAAACGAAATAGAGGAAAGCATCAGACAGTCAAGTTTGCTTGAAGAATTTAAGATGA 2967
Query 2951 CTGAGCTCCCAGCGTTGCATGACAAATGTATTGAGCTGGTTCAACTCCTGGTTGAGGGAA 3010
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2968 CTGAGCTCCCAGCATTGCATGAAAAATGTATTGAGCTGGTTCAACTCCTGGTTGAGGGAA 3027
Query 3011 GTGCCGAGCAACTCCAGGTTGAGAAAAGCGAAGAACTGCATGGTAAACTTGTAAAGGCTC 3070
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3028 GTGACGAGCAACTCCAGGAAGAGAAAAGCGAAGAACTGCATGGTAAACTTGTAAAGGCTC 3087
Query 3071 TTCAGGATATCTTTGAGCTAGTAACAAATGATATGATGGTACATGGTGACAGAATTCTGG 3130
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3088 TTCAGGACATATTTGAGCTAGTAACAAATGATATGATGGTACATGGTGACAGAGTTCTGG 3147
Query 3131 ATTTGCTCCAGTCTCGGGAGGGGTCAGGAGAAGACACAGGTATTTTTATGAGGGTTATAG 3190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3148 ATTTGCTCCAGTCTCGGGAGGGGTCAGGAGAAGACACAGGTATTTTTATGAGGGTTATAG 3207
Query 3191 AACCACAGTTGTTTGAATCCTACGGAGAATGGAGATGCATTCATTTTCCGCTGCCAGATA 3250
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3208 AACCACAGTTGTTTGAATCTTATGGAGAATGGAGATGCATTCATTTTCCGCTGCCAGATA 3267
Query 3251 GTGCTTCATTGAGTGAACAGATCCAGCGTTTTCTGTTATTGTTAACTGTCAAAGATAGTG 3310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3268 GTGCTTCATTGAGTGAACAGATCCAGCGTTTTCTGTTATTGTTAACTGTCAAAGATAGTG 3327
Query 3311 CAATGGACATACCAGAGAACTTAGATGCTCGGCGGCGCCTATCTTTCTTTGCTACTTCGC 3370
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3328 CTATGGACATACCAGAGAACTTAGACGCTCGGCGGCGCCTATCTTTCTTTGCTACTTCGC 3387
Query 3371 TTTTCATGGATATGCCCGATGCTCCGAAAGTACGCAATATGATGTCATTCAGTGTTTTGA 3430
|||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3388 TTTTCATGGATATGCCTGACGCTCCGAAAGTACGCCATATGATGTCATTCAGTGTTTTGA 3447
Query 3431 CACCGCATTATCAGGAGGATATTAACTATTCAACGAACGAACTACATTCCACCAAGTCTA 3490
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 3448 CTCCGCATTATCAGGAGGATATTAACTTTTCAACGAAGGAACTACATTCCACCACGTCTA 3507
Query 3491 GTGTGTCAATCATCTTTTATATGCAGAAGATTTTTCCAGATGAGTGGAAAAACTTTCTTG 3550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3508 GTGTGTCAATCATCTTTTATATGCAGAAGATTTTTCCAGATGAGTGGAAAAACTTTCTTG 3567
Query 3551 AGCGAATGGGATGTGATAATTTAGACGCCTTAAAGAAAGAGGGTAAAGAAGAAGAGCTTC 3610
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3568 AGCGAATGGGATGTGATAATTTGGACGCCTTAAAGAAAGAGGGTAAAGAAGAAGAGCTTC 3627
Query 3611 GAAACTGGGCATCATTTCGTGGACAAACATTGAGTAGAACAGTTCGTGGTATGATGTATT 3670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3628 GAAACTGGGCATCATTTCGTGGACAAACATTGAGTAGAACAGTTCGTGGAATGATGTATT 3687
Query 3671 GCCGAGAAGCTCTGAAATTGCAAGCCTTCCTTGACATGGCAGATGACGAGGATATTCTTG 3730
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3688 GCCGTGAAGCTTTGAAATTGCAAGCCTTCCTTGACATGGCAGATGACGAGGATATTCTTG 3747
Query 3731 AAGGATACAAGGACGTGGAACGAAGTAACAGACCTTTAGCCGCACAACTTGATGCATTGG 3790
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3748 AAGGATACAAGGACGTGGAACGAAGTAACCGACCTTTAGCCGCACAACTTGATGCATTAG 3807
Query 3791 CAGATATGAAATTCACGTATGTTGTTTCTTGCCAAATGTTTGGAGCCCAAAAATCATCTG 3850
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3808 CAGATATGAAATTCACGTATGTTGTGTCTTGCCAAATGTTTGGAGCCCAAAAATCAGCTG 3867
Query 3851 GGGATCCTCACGCGCAGGATATACTTGACCTGATGATAAAGTATCCATCTCTCCGTGTTG 3910
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3868 GGGATCCCCACGCGCAGGATATACTTGACCTGATGATAAAGTACCCATCTCTCCGTGTTG 3927
Query 3911 CATACGTTGAGGAGAGGGAAGAAATCGTGTTGGATGTTCCAAAGAAGGTTTACTACTCTA 3970
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 3928 CATACGTTGAGGAGAGGGAAGAAATCGTGTTGGATGTTCCAAAGAAAGTTTACTACTCAA 3987
Query 3971 TATTGGTAAAAGCTGTTAACGGTTTCGATCAGGAAATTTACCGTGTCAAACTTCCTGGAC 4030
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3988 TTTTGGTAAAAGCTGTCAACGGTTTCGATCAGGAAATTTACCGTGTCAAACTTCCTGGAC 4047
Query 4031 CACCTAACATTGGAGAGGGAAAGCCTGAGAATCAAAATCACGCCATAGTTTTCACTCGAG 4090
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4048 CACCTAACATTGGAGAGGGGAAGCCTGAGAATCAAAATCACGCCATAGTTTTCACTCGAG 4107
Query 4091 GTGAAGCACTTCAGACGATCGACATGAACCAAGATCACTACCTGGAAGAGGCTTTCAAAA 4150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4108 GTGAAGCACTTCAGACGATCGACATGAACCAAGATCACTACCTGGAAGAGGCTTTCAAAA 4167
Query 4151 TGAGAAATCTCCTTCAAGAATTTCTTCGAAACCGTGGAAGAAGACCTCCAACAATTCTTG 4210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4168 TGAGAAATCTCCTTCAAGAATTTCTTCGAAACCGTGGAAGAAGACCTCCAACAGTTCTTG 4227
Query 4211 GTTTAAGGGAACACATATTCACCGGAAGTGTTTCTTCTCTAGCATGGTTCATGTCATATC 4270
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4228 GGTTAAGGGAACACATATTCACCGGAAGTGTTTCTTCTCTAGCATGGTTCATGTCATATC 4287
Query 4271 AAGAAACCAGTTTTGTCACAATCGGTCAAAGGCTTCTTGCTAATCCTCTCAGAGTCCGGT 4330
|||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4288 AAGAAACCAGTTTTGTAACGATCGGTCAAAGGCTGCTTGATAATCCTCTCAGAGTCCGGT 4347
Query 4331 TTCACTATGGGCATCCAGATGTCTTCGACAGAATATTTCACATAACAAGGGGTGGCATCA 4390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4348 TTCACTATGGGCATCCAGATGTCTTCGACAGAATATTTCACATAACAAGGGGTGGCATCA 4407
Query 4391 GTAAATCATCGAGAACTATTAACTTAAGCGAGGACGTTTTCGCAGGTTATAATACTACCT 4450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 4408 GTAAATCATCGAGAACTATTAACTTAAGCGAGGACGTTTTCGCGGGTTATAATACCACCC 4467
Query 4451 TACGACGTGGATGCATAACCTACAATGAGTACCTCCAAGTTGGAAAAGGTCGTGATGTTG 4510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4468 TACGACGTGGATGCATAACCTACAATGAGTACCTCCAAGTTGGAAAAGGTCGTGATGTTG 4527
Query 4511 GCCTCAATCAAATCTCAAAGTTTGAGGCCAAGGTGGCTAACGGAAACAGTGAACAGACTA 4570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4528 GCCTCAATCAAATCTCAAAGTTTGAGGCCAAGGTGGCTAACGGAAACAGTGAACAGACTA 4587
Query 4571 TTAGCCGTGACATATACCGTTTAGGACAACGTTTTGATTTCTTCAGAATGTTGTCTTGTT 4630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4588 TTAGCCGTGACATATACCGTTTAGGACAACGTTTTGATTTCTTCAGAATGTTGTCTTGTT 4647
Query 4631 ATTTCACAACCATTGGATTCTACTTCAGTAGCTTGATTTCCGTGATCGGGATTTATATTT 4690
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4648 ATTTCACAACCATTGGATTCTACGTCAGTAGCTTGATTTCCGTGATCGGGATATATATTT 4707
Query 4691 ATCTCTATGGTCAACTCTACCTCGTACTCAGTGGGTTGCAGAAGACGCTTATTCTTGAGG 4750
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4708 ATCTATATGGTCAACTCTACCTCGTGCTCAGTGGGTTGCAGAAGACGCTTATTCTTGAGG 4767
Query 4751 CCAAGGTGAAAAACATAAAATCATTGGAAACAGCCCTTGCCTCTCAATCATTTATCCAGC 4810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4768 CCAAGGTGAAAAACATAAAATCATTGGAAACAGCCCTTGCCTCTCAATCATTTATCCAGC 4827
Query 4811 TAGGTCTCTTGACCGGTCTACCAATGGTGATGGAGATTGGGTTGGAGAAAGGATTTCTTA 4870
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4828 TAGGTCTCTTGACTGGTCTACCAATGGTGATGGAGATTGGATTGGAGAAAGGATTTCTTA 4887
Query 4871 TAGCCTTTCAAGATTTCATACTCATGCAGCTACAGCTTGCTGCATTCTTCTTCACTTTCT 4930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4888 TAGCCTTTCAAGATTTCATACTCATGCAGCTACAGCTTGCTGCATTCTTCTTCACTTTCT 4947
Query 4931 CTCTAGGAACTAAAACGCATTACTTTGGCAGAACAATTCTCCATGGAGGTGCCAAATACA 4990
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4948 CTCTAGGAACTAAAACGCATTACTTCGGCAGAACAATTCTCCATGGAGGCGCCAAATACA 5007
Query 4991 GACCCACAGGGCGTAAAGTAGTGGTGTTCCATGCCAACTTCAGTGAAAATTACAGATTAT 5050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5008 GACCCACAGGGCGTAAAGTAGTGGTGTTCCATGCCAACTTCAGTGAAAATTACAGATTAT 5067
Query 5051 ATTCTCGAAGCCATTTCATCAAAGGTTTTGAGCTCATGATTCTTCTGGTCGTCTACGAGT 5110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5068 ATTCTCGAAGCCATTTCATCAAAGGTTTTGAGCTCATGATTCTTCTGGTCGTCTACGAGT 5127
Query 5111 TGTTCAAGCATACATCTCAAAGCAACATGGCTTACTCATTCATCACTTTCTCAGTGTGGT 5170
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5128 TGTTCAAGCATACATCTCAAAGCAACATGGCTTACTCATTTATCACTTTCTCAGTGTGGT 5187
Query 5171 TCATGTCTTTTACTTGGTTATGCGCCCCGTTTCTCTTCAACCCTTCAGGCTTTACCTGGG 5230
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5188 TCATGTCTTTTACATGGTTATGCGCCCCGTTTCTCTTTAACCCTTCAGGCTTTACCTGGG 5247
Query 5231 AAATAATAGTCGGTGACTGGAGAGACTGGAACAGGTGGATCAAAGAGCAAGGTGGAATAG 5290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5248 AAATAATAGTCGGTGACTGGAGAGACTGGAACAGGTGGATCAAAGAGCAAGGTGGGATAG 5307
Query 5291 GGATTCAGCAAGACAAGAGCTGGCAATCTTGGTGGAACGACGAGCAAGCCCATCTACGTG 5350
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5308 GGATTCAGCAAGACAAGAGTTGGCAATCTTGGTGGAATGACGAGCAAGCCCATCTACGTG 5367
Query 5351 GCTCTGGTGTTGGAGCTCGCTGTTTGGAGATAATTTTGTCCCTCAGGTTCTTTGTGTATC 5410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5368 GCTCTGGTGTTGGAGCTCGCTGTTTGGAGATAATTTTGTCCCTCAGGTTCTTTGTGTATC 5427
Query 5411 AGTATGGTTTGGTATATCACCTTGACATTACCCAAAGCAACACAAATATCATAGTCTACG 5470
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5428 AGTATGGGTTGGTATATCACCTTGACATTACCCAAAGCAACACAAATATCATAGTCTATG 5487
Query 5471 CGCTTTCTTGGGTCGTGATTCTCGCCACATTCTTCACAGTCAAGGCAGTAGACCTAGGAA 5530
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5488 CGCTTTCTTGGGTCGTGATTCTCGCCACATTCTTCACAGTCAAGGCCGTAGACCTAGGAA 5547
Query 5531 GACAACTCTTCAGCACAAGAAAGCATCTCGTGTTTCGGTTCTTCAAAGTCTTCGTCTTCG 5590
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5548 GACAACTCTTCAGCACAAGAAAGCATCTCGTATTTCGGTTCTTCAAAGTCTTCGTCTTCG 5607
Query 5591 TGAGCATACTTACAATCATAATCACTCTAGCAAACATCTGTCACCTCTCTGTCAAGGACC 5650
||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5608 TGAGCATTCTAACAGTCATTATCACTCTATCAAACATCTGTCACCTCTCTGTCAAGGACC 5667
Query 5651 TTCTAGTCTCTTGCTTAGCTTTCTTGCCCACTGGTTGGGGTCTGATTCTGATTGCACAAG 5710
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5668 TTCTAGTCTCTTGCTTAGCTTTCTTGCCCACCGGTTGGGGTCTGATTCTGATTGCACAAG 5727
Query 5711 CGGTTAGGCCAAAGATAGAAGGAACGAGCTTATGGGAGTTCACACAGGTTCTTGCTCGAG 5770
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5728 CGGTTAGGCCAAAGATAGAAGGGACGAGCTTGTGGGAGTTCACACAGGTTCTTGCCCGAG 5787
Query 5771 CTTATGATTATGGAATGGGCGTTGTTCTGTTTGCACCAATGGCTATCTTAGCATGGCTTC 5830
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5788 CTTATGATTATGGAATGGGAGTTGTTCTGTTTGCACCAATGGCTATCTTAGCTTGGCTTC 5847
Query 5831 CTATTATTTCTGCGTTTCAGACTCGTTTTCTATTCAACGAAGCTTTTAACAGAAGACTTC 5890
|||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5848 CTATCATTTCTGCGTTTCAGACACGCTTTCTCTTCAATGAAGCTTTTAACAGAAGGCTTC 5907
Query 5891 AAATTCAACCTATTCTTGCAGGGAAGAAGAAGAATCGATGA 5931
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5908 AAATTCAACCTATTCTTGCAGGGAAGAAGAAGAATCGATGA 5948
Score = 3642 bits (1972), Expect = 0.0
Identities = 2111/2180 (97%), Gaps = 2/2180 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 355 GATGAAGAGTTCACTGTGAGAAGAAGAAAGGAGAAGAGTGATGTTCGGGAACTCAAACGT 414
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 327 GATGAAGAGTTTACTGTGAGAAGAAGAAAGGAGAAGAGTGATGTTCGGGAGCTCAAACGT 386
Query 415 GTTTATCATGCTTACAAGGAATATATTATCAGACATGGTGCAGCTTTCAATTTGGATAAC 474
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 387 GTTTATCATGCTTACAAGGAATACATTATCAGACATGGTGCATCATTCAATTTGGATAAT 446
Query 475 AGTCAGCGAGAGAAGTTGATTAACGCACGCAGAATTGCTTCTGTTTTGTATGAAGTTCTC 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 AGTCAGCGAGAGAAGTTGATTAACGCACGCAGAATTGCTTCTGTTTTGTATGAAGTTCTC 506
Query 535 AAGACAGTCACAAGTGGCGCTGGCCCGCAGGCCATTGCGGATAGAGAAAGTATTCGAGCA 594
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 507 AAGACAGTCACAAGTGGCGCTGGCCCCCAGGCCATTGCGGATAGAGAAAGTATTCGGGCA 566
Query 595 AAATCTGAATTTTATGTGCCGTATAACATTCTTCCTCTCGATAAAGGAGGGGTACACCAA 654
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 567 AAATCTGAATTTTATGTGCCGTATAACATTCTTCCTCTTGATAAAGGAGGGGTACACCAA 626
Query 655 GCAATTATGCATCTGCCTGAGATTAAAGCTGCTGTTGCAATTGTACGTAACACTCGCGGG 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 GCAATTATGCATCTGCCTGAGATTAAAGCTGCTGTTGCAATTGTACGTAACACTCGCGGG 686
Query 715 TTGCCTCCTCCAGAGGAATTTCAGAGACACCAGCCTTTTCTGGATTTATTTGAATTTCTG 774
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 687 TTGCCTCCTCCAGAGGAGTTTCAGAGACACCAGCCTTTTCTGGATTTATTTGAATTTCTG 746
Query 775 CAGTATGCCTTTGGGTTCCAGAATGGAAATGTTGCCAATCAGAGAGAGCATCTGATTCTA 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 747 CAGTATGCCTTTGGGTTCCAGAATGGAAATGTTGCCAATCAGAGAGAGCATATGATCCTA 806
Query 835 CTACTCAGTAACACCATTATACGGCAACCACAGAAGCAGTCTTCAGCTCCAAAGTCTGGT 894
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 807 CTACTCAGTAACACCATTATACGGCAACCTCAGAAGCAGTCTTCAGCACCAAAGTCTGGT 866
Query 895 GATGAGGCAGTAGATGCATTGATGAAGAAGTTTTTTAAGAACTACACGAACTGGTGCAAA 954
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 867 GATGAGGCAGTAGATGCATTAATGAAGAAGTTTTTTAAGAACTACACAAACTGGTGCAAA 926
Query 955 TTTCTTGGGAGAAAAAATAACATTAGGTTGCCCTATGTGAAACAGGAAGCCCTACAATAT 1014
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 TTTCTTGGAAGAAAAAATAACATCAGGTTGCCCTATGTGAAACAGGAAGCCCTACAATAT 986
Query 1015 AAAACATTGTATATAGGACTCTACCTTCTCATATGGGGAGAGGCGTCGAACTTGAGGTTC 1074
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 987 AAAACACTGTATATAGGACTCTACCTTCTCATATGGGGAGAGGCGTCGAACTTGAGGTTC 1046
Query 1075 ATGCCAGAGTGCCTGTGTTATATTTTCCACCACATGGCATATGAATTGCATGGAGTTTTA 1134
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1047 ATGCCAGAGTGTCTGTGTTATATTTTCCACCACATGGCATATGAATTGCATGGAGTCTTA 1106
Query 1135 ACCGGTGCAGTTAGTATGATAACTGGGGAGAAGGTTGCTCCAGCATATGGTGGAGGACAC 1194
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 ACCAGTGCAGTTAGTATGATAACTGGGGAGAAGGTCGCGCCAGCATATGGTGGAGGACAC 1166
Query 1195 GAATCTTTCCTTGCGGATGTAGTTACTCCCATATACATGG-TTGTCCAAAAGGAAGCTGA 1253
||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||
Sbjct 1167 GAATCTTTCCTTGCGAATGTAGTTACCCCCATATATA-GGATTGTCGAAAAGGAAGCTGA 1225
Query 1254 GAAGAATAAGAATGGAACTGCTGATCATTCTATGTGGAGAAACTACGATGATCTGAACGA 1313
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1226 GAAGAACAAGAATGGAACTGCTGATCATTCTATGTGGAGAAATTACGATGATCTGAATGA 1285
Query 1314 GTTCTTCTGGTCTCTTGAATGCTTCGAAATAGGTTGGCCAATGCGTCCCGAGCACGATTT 1373
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1286 GTTCTTCTGGTCTCTTGAATGCTTCGAAATAGGTTGGCCAATGCGTCCGGAGCACGATTT 1345
Query 1374 TTTCTGTGTAGAATCATCAGAAACCAGTAAACCAGGGAGATGGCGAGGAATGCTTAGATT 1433
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346 CTTCTGTGTAGAATCATTAGACACCAGTAAACCAGGGAGATGGCGAGGAATGCTTAGATT 1405
Query 1434 TCGCAAGCAGACAAAGAAAACGGATGAAGAAATAGAGGATGACGAAGAACTTGGGGTTCT 1493
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 TCGCAAGCAGACAAAGAAAACGGATGAAGAAATGGAGGATGACGAAGAACTTGGGGTTCT 1465
Query 1494 CAGTGAGGAACAACCTAAACCAACCTCAAGATGGCTGGGGAAGACAAATTTTGTAGAGAC 1553
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 CAGTGAGGAACAAACTAAACCAACCTCAAGATGGCTGGGGAAGACAAATTTTGTAGAGAC 1525
Query 1554 TCGTTCCTTTTGGCAGATATTCCGGAGCTTTGACAGAATGTGGAGTTTCTTTGTTTTGTC 1613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 TCGTTCCTTTTGGCAGATATTCCGGAGCTTTGACAGAATGTGGAGTTTCTTTGTTTTGTC 1585
Query 1614 CCTACAGGCATTGATAATTATGGCTTGTCATGATGTGGGATCTCCACTCCAAGTGTTTAA 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 1586 TCTACAGGCATTGATAATTATGGCTTGTCATGATGTGGGATCTCCACTTCAAATGTTTAA 1645
Query 1674 TGCTAATATATTCGAAGACGTCATGAGCATTTTCATTACCTCAGCAATTCTAAAGCTTAT 1733
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1646 TGCCAATATATTTGAAGACGTCATGAGCATTTTCATTACCTCTGCAATTCTAAAGCTTAT 1705
Query 1734 AAAAGGTATTCTTGACATAATCTTCAAGTGGAAAGCAAGAAACACAATGCCGATCAATGA 1793
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1706 AAAAGGTATTCTTGACATAATCTTCAAGTGGAAAGCCAGAAACACAATGCCGATCAATGA 1765
Query 1794 AAAGAAGAAGCGGTTGGTGAAGTTGGGCTTTGCTGCGATGTGGACTATTATTCTACCAGT 1853
||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 AAAGAAGAAGCAGATGGTGAAGTTGGGGTTTGCTGCGATGTGGACTATTATTCTACCAGT 1825
Query 1854 GCTGTATTCTCATTCAAGAAGGAAATACATTTGTTATTTCACAAATTACAAAACCTGGCT 1913
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1826 GCTGTATTCTCATTCAAGAAGGAAATACATGTGTTATTTCACAGATTACAAAACCTGGCT 1885
Query 1914 TGGTGAATGGTGTTTTTCTCCATACATGGTGGCAGTCACGATATACCTGACAGGAAGTGC 1973
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1886 TGGTGAATGGTGTTTTTCTCCATACACGGTGGCAGTCACGATATACATGACAGGAAGTGC 1945
Query 1974 AATTGAGTTGGTCTTGTTTTTCGTTCCTGCCATCAGCAAATACATTGAGACCTCCAATCA 2033
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1946 GATTGAGTTGGTCTTGTTTTTCGTTCCTGCCATCAGCAAATACATTGAGACCTCCAATCA 2005
Query 2034 TGGCATCTTTAAAACTTTGTCTTGGTGGGGACAGCCTAGGTTATATGTTGGGCGAGGAAT 2093
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2006 TCGCATCTTCAAAACTTTGTCTTGGTGGGGACAGCCTAGGTTATATGTTGGGCGAGGAAT 2065
Query 2094 GCAAGAAACTCAGGTGTCACAATTCAAATACACTTTCTTCTGGATTCTGGTTCTCCTGAC 2153
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066 GCAAGAAACTCAGGTGTCACAATTCAAATACACCTTCTTCTGGATTCTGGTTCTCCTGAC 2125
Query 2154 CAAGTTTGCTTTCAGCTATGCATTTGAGATAAAGCCTCTAATAGAACCTACACGACTGAT 2213
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2126 TAAGTTTTTTTTCAGCTATGCATTTGAGATAAAGCCTCTAATAGAACCTACACGACTGAT 2185
Query 2214 AATGAAAGTTGGTGTGCGGAATTATGAATGGCATGAAATTTTCCCAGAAGTGAAGAGTAA 2273
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2186 AATGAAAGTTGGCGTGCGGAATTATGAATGGCATGAAATTTTCCCAGAAGTGAAGAGTAA 2245
Query 2274 TGCTGCTGCAATTGTTGCAGTATGGGCGCCAATAATGGTGGTCTATTTCATGGATACACA 2333
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2246 TGCTGCTGCAATTGTCGCAGTATGGGCGCCAATAATGGTGGTCTATTTCATGGATACACA 2305
Query 2334 AATATGGTATTCAGTTTACTGTACGATCTTTGGTGGACTGTATGGTGTTCTGCACCACCT 2393
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2306 AATATGGTATTCAGTTTACTGTACGATCTTTGGTGGGCTGTATGGAGTTCTGCATCACCT 2365
Query 2394 TGGTGAGATTCGAACTTTAGGCATGTTGAGAGGCCGGTTTCATACTTTACCTTCAGCTTT 2453
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2366 TGGTGAGATTCGAACTTTAGGCATGTTGAGAGGCCGGTTTCATACTTTACCTTCTGCTTT 2425
Query 2454 CAATGCATCCCTTATTCCACACTCAACAAAAGATGAGAAAAGGAGAAAACAAAGAGGTTT 2513
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2426 CAATGCATCCCTTATTCCACACTCAGTAAAAGATGAGAAAAGGAGAAAACAAAGAGGCTT 2485
Query 2514 TTTCCCCTTCAATTTAGGCA 2533
||||||||||||||||||||
Sbjct 2486 TTTCCCCTTCAATTTAGGCA 2505
Score = 429 bits (232), Expect = 1e-118
Identities = 287/313 (92%), Gaps = 6/313 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCTCACGAAATCGTCCCCGTTGATCCCATTGATGTTCCTAGCACGAGTTACTCACGG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 21 ATGTCTCACGAAATCGTCCCCGTTGATCCCATTGATGTCCCGAGCACGAGTTACTCACGG 80
Query 61 CCAATTCTGGGTCCTCGTGAAGATTCGCCGGAACGTGCTACCGAGTTCACGAGATCCCTA 120
|| | ||||| |||||| || |||||||| || || | | ||||||||||||||||
Sbjct 81 CCGAGTCTGGCTCCTCGGGATGATTCGCC--AA-TTGGT--C-AGTTCACGAGATCCCTT 134
Query 121 ACTTTTCGGGAACATGTGTCGTCGGAGCCTTTTGATAGCGAGAGGCTTCCAGCGACATTA 180
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 135 ACTTTTCGGGAACATGTTTCGTCGGAGCCATTTGATAGCGAGAGGCTTCCGGCGACATTA 194
Query 181 GCTTCCGAGATTCAGAGGTTTCTTCGTATTGCTAACTTGGTTGAGTCTGAGGAACCTCGA 240
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 GCTTCTGAGATTCAGAGGTTTCTTCGTATAGCTAACTTGGTTGAGTCTGAGGAACCTCGA 254
Query 241 ATTGCTTATCTATGCCGATTTCATGCTTTCGAGATAGCCCACCACATGGATAGAAACTCT 300
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||
Sbjct 255 ATTGCTTATCTATGCCGTTTTCATGCTTTCGAGATAGCTCATCATATGGACAGAAACTCT 314
Query 301 ACCGGAAGAGGTG 313
|||||||||||||
Sbjct 315 ACCGGAAGAGGTG 327
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 224691910992
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5