BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G16340.1
Length=4405
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg318409 jgi|Araly1|318409|fgenesh1_pm.C_scaffold_3001425 6831 0.0
Ahg933502 jgi|Araly1|933502|scaffold_401490.1 239 1e-61
> Ahg318409 jgi|Araly1|318409|fgenesh1_pm.C_scaffold_3001425
Length=4263
Score = 6831 bits (3699), Expect = 0.0
Identities = 4083/4269 (96%), Gaps = 24/4269 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGACGTTATCGAGAAGCCTAAGTAAGAGCTTAGGAGAGTTGTTAGCGAGTAATAGT 60
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGACGTTATCGAGAAGCCTAAGTAGGAGCTTAGGAGAGTTGTTAGCGAGTAATAGT 60
Query 61 AATAACCATTTCTCAAGGAGAAGCGGTTCAACGATAGATGATCACGATGAGGAAGCTCTT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 AATAACCATTTCTCAAGGAGAAGCGGTTCAACGATCGATGATCACGACGAGGAAGCTCTT 120
Query 121 AAATGGGCTGCTCTCGAGAAACTTCCAACCTTTGCTCGTCTTCGTACCACTATCATTCAT 180
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAATGGGCTGCTCTCGAGAAACTTCCAACCTTCGCTCGTCTTCGTACCACTATCATTCAC 180
Query 181 CCTCACGAAGATCTCGTCGACGTTACCAAGCTCGGTGTTGATGATCGCCAGAAGTTCATC 240
||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 181 CCTAATGATGATCTCGTCGATGTTACCAAGCTCGGTGTCGATGATCGACAGAAGTTCATC 240
Query 241 GATTCTATCTTCAAAGTCACCGAGGAAGATAACGAGAAGTTCTTGAAAAAGTTTAGGAAT 300
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GATTCTATCTTTAAAGTCACGGAGGAAGATAATGAGAAATTCTTGAAAAAGTTTAGGAAT 300
Query 301 CGAATCGACAGGGTGCGGATAAAGCTACCGACAGTGGAAGTGAGATTCGAGAAAGTAACG 360
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CGAATCGACAGGGTGCGGATAAAGTTACCGACAGTGGAAGTGAGATTCGAGAAAGTAACG 360
Query 361 ATAGAGGCGAATTGTCACATAGGAAAAAGAGCTCTTCCCACATTACCCAACGCTGCTTTA 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 361 GTAGAGGCGAATTGTCACATAGGAAAAAGAGCTCTTCCCACATTACCTAACGCTGCTTTA 420
Query 421 AACATTGCAGAGAGAGGTCTTCGTTTGCTTGGTTTTAACTTTACAAAAACCACTAAAGTC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 421 AACATTGCAGAGAGAGGTCTTCGTTTGCTTGGTTTTAACTTTACAGAAACCACTAAAGTC 480
Query 481 ACTATTCTTAGAGACGTCTCCGGG-ATTATCAAACCTTCAAGAATGACACTTTTATTAGG 539
||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 481 ACTATCCTTAGAGACGTCT-CGGGTATTATCAAACCTTCACGAATGACACTTTTATTAGG 539
Query 540 TCCACCATCATCAGGGAAAACAACTCTTTTATTAGCGTTAGCTGGAAAACTAGACCAAAG 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 540 TCCACCATCATCAGGGAAAACAACTCTTTTATTAGCGTTAGCTGGAAAACTAGACCCAAG 599
Query 600 CTTAAAGGTGACAGGGAGAGTAACATACAATGGGCATGGATTGGAAGAGTTTGTGCCACA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 600 TTTAAAGGTGACAGGGAGAGTAACATACAATGGGCATGGATTAGAAGAGTTTGTGCCACA 659
Query 660 GAAAACATCAGCATACATAAGCCAAAACGATGTTCATGTTGGAGTCATGACTGTCCAAGA 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 660 GAAAACATCAGCATACATAAGCCAAAACGATGTTCATGTTGGAGTCATGACTGTTCAAGA 719
Query 720 AACTCTTGATTTTTCTGCTAGATGTCAAGGAGTTGGCACTAGATATGATTTGTTAAGTGA 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 720 AACTCTTGATTTTTCTGCTAGATGTCAAGGAGTTGGCACTAGATACGATTTGTTAAGTGA 779
Query 780 GTTGGTGAGAAGAGAGAAGGACGCAGGGATCTTGCCGGAACCGGAAGTGGATCTCTTCAT 839
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GTTGGTGAGGAGAGAGAAGGACGCAGGGATCTTGCCGGAACCGGAAGTGGATCTCTTCAT 839
Query 840 GAAGTCCATTGCAGCTGGAAATGTCAAGAGCAGTCTCATCACAGACTATACTCTCAGAAT 899
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 840 GAAGTCCATCGCAGCTGGAAATGTCAAGAGCAGTCTCATCACAGACTACACTCTCAGAAT 899
Query 900 ATTAGGGCTTGACATATGCAAAGATACGGTGGTCGGAGATGAGATGATTCGAGGAATCTC 959
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 900 ATTAGGGCTTGACATATGCAAAGATACTGTGGTCGGAGATGAGATGATTAGAGGAATCTC 959
Query 960 GGGAGGTCAAAAGAAAAGAGTCACAACAGGAGAGATGATAGTAGGACCAACAAAGACATT 1019
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 960 GGGTGGTCAAAAGAAAAGAGTAACAACAGGAGAGATGATAGTGGGACCAACAAAGACATT 1019
Query 1020 GTTCATGGATGAGATATCGACAGGTCTAGACAGTTCAACAACGTACCAAATAGTGAAATG 1079
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1020 GTTCATGGACGAGATATCGACAGGTCTAGACAGTTCAACAACGTTCCAAATAGTGAAATG 1079
Query 1080 CCTTCAAGAGATTGTTCGGTTCACGGACGCAACGGTTCTCATGTCCTTATTACAACCAGC 1139
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 CCTTCAAGAGATTGTCCGGTTCACGGACGCAACGGTTCTCATGTCCTTATTACAACCAGC 1139
Query 1140 TCCTGAAACGTTCGAACTTTTCGATGACATCATTCTATTGTCTGAAGGACAGATCGTGTA 1199
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1140 TCCTGAAACGTTCGAACTTTTTGATGACATCATTCTATTGTCTGAAGGTCAAATCGTGTA 1199
Query 1200 CCAAGGTCCACGTGATCATGTTCTTACCTTCTTTGAAACTTGCGGTTTCAAGTGTCCCGA 1259
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 CCAAGGTCCACGGGATCTTGTTCTTACCTTCTTTGAAACTTGCGGTTTCAAGTGTCCCGA 1259
Query 1260 CCGCAAAGGCACCGCAGATTTCTTGCAAGAGGTAACTTCAAGGAAAGACCAAGAACAGTA 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CCGCAAAGGCACCGCAGATTTCTTGCAAGAGGTAACTTCAAGGAAAGACCAAGAACAGTA 1319
Query 1320 TTGGGCAGACTCaaaaaaaCCATACAGTTACATTTCTGTCTCTGAATTCTCCAAACGATT 1379
||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1320 TTGGGCAGAGACAACAAAACCATACAATTACATTTCTGTCTCCGAATTCTCCAAACGATT 1379
Query 1380 CAGAACCTTCCATGTCGGAGCCAATCTTGAAAAAGATCTATCAGTCCCTTACGACAGATT 1439
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CAGGACCTTCCATGTCGGAGCCAATCTTGAAAAAGATCTATCAGTCCCTTACGACAGATT 1439
Query 1440 CAAATCACACCCAGCTTCTCTCGTCTTCAAGAAACACTCTGTTCCGAAATCTCAACTCTT 1499
|||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1440 CAAATCACACCCTGCTTCTCTAGTCTTCAACAAACACTCTGTTCCAAAATCTCAACTCTT 1499
Query 1500 CAAGGTCTGTTGGGACAGAGAATTGCTTCTCATGAAACGTAACGCTTTCTTCTACATTAC 1559
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1500 CAAGGTCTGTTGGGACAGAGAGTTGCTTCTCATGAAACGTAACGCTTTCTTCTACGTTAC 1559
Query 1560 CAAAACAGTTCAAATTATCATTATGGCTTTGATTGCGTCGACCGTGTACCTGAGAACGGA 1619
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 CAAGACTGTTCAAATTATCATTATGGCTTTGATTGCGTCGACCGTGTACCTGAGAACGGA 1619
Query 1620 GATGGGAACAAAGAACGAGAGTGATGGAGCCGTCTACATCGGTGCGTTGATGTTCTCCAT 1679
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 GATGGGTACAAAGGACGAGAGTGATGGAGCCGTCTACATTGGTGCGTTGATGTTCTCCAT 1679
Query 1680 GATCGTTAACATGTTTAATGGATTTGCAGAGCTTGCTTTGATGATTCAGAGACTTCCCGT 1739
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GATCGTTAACATGTTTAATGGATTCGCGGAGCTTGCTTTGATGATTCAGAGACTTCCCGT 1739
Query 1740 GTTCTACAAGCAACGAGACCTTTTGTTTCATCCTCCTTGGACCTTCAGTCTTCCAACATT 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1740 GTTCTACAAGCAACGAGACCTTTTGTTTCATCCTCCTTGGACCTTCACTCTCCCAACATT 1799
Query 1800 TCT-CTTGGGTATTCCTATCTCCATCTTCGAATCTGTTGTTTGGGTCACCATTACTTATT 1858
||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1800 TCTTCT-GGGAATTCCTATCTCCATCTTCGAATCCGTTGTTTGGGTCAGCATTACTTATT 1858
Query 1859 ACATGATCGGATTTGCTCCAGAACTCAGCAGGTTCTTGAAGCATTTGTTGGTGATATTTC 1918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 ACATGATCGGATTTGCTCCAGAACTCAGCAGGTTCTTGAAGCATTTGTTGGTGATATTTC 1918
Query 1919 TGACACAGCAAATGGCTGGTGGTATATTTAGGTTCATCGCGGCAACTTGCAGATCGATGA 1978
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 TGACACAGCAAATGGCTGGTGGTATATTTCGATTCATTGCGGCAACTTGCAGATCGATGA 1978
Query 1979 TTCTTGCTAATACGGGAGGAGCTCTAGTTATCCTCCTCCTCTTCTTGCTTGGAGGGTTCA 2038
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 TTCTTGCTAATACGGGAGGATCTCTAGTTATCCTCCTCCTCTTCTTGCTTGGAGGGTTCA 2038
Query 2039 TTGTTCCTAGAGGTGAGATACCTAAATGGTGGAAATGGGCTTACTGGGTTTCACCAATGG 2098
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 TTGTTCCTAGAGGTGAGATTCCTAAATGGTGGAAATGGGCTTACTGGGTTTCACCAATGG 2098
Query 2099 CTTACACTTACGATGCTTTAACTGTCAATGAAATGCTTGCTCCTAGATGGATTAATCAAC 2158
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2099 CTTACACTTACGATGCTTTAACTGTCAATGAAATGCTTGCTCCTAGATGGATGAATCAAC 2158
Query 2159 CGTCTTCTGATAACTCCACGAG-CTTAGGGTTGGCTGTTCTTGAGATTTTCGATATTTTC 2217
||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 GGTCTTCTGATAACTCGACGAGGCT-AGGGTTGGCTGTTCTTGAGATTTTCGATATTTTC 2217
Query 2218 ACGGATCCAAACTGGTATTGGATCGGGGTAGGAGGCATTCTCGGGTTTACGGTTCTCTTT 2277
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2218 ACAGATCCAAACTGGTATTGGATCGGGATAGGAGGCATTCTCGGGTTTACCATTCTCTTC 2277
Query 2278 AACATCCTCGTTACCCTCGCTCTTACATTCCTAAACCCACTTGAGAAACAGCAAGCCGTT 2337
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 AACATCCTCGTTACCCTCGCTCTGACATTCCTAAACCCACTTGAGAAACAGCAAGCCGTT 2337
Query 2338 GTTTCAAAAGAAAATACAGAGGAAAACAGAGCAGAGAAC-G-GC------T--C--AAAG 2385
||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | || | | ||||
Sbjct 2338 GTTTCAAAAGAAAATGCAGAGGAAAACAGAGCAAAAAACAGAGCAGAGAATGGCTTAAAG 2397
Query 2386 AGTAAGAGCATT-GACGTGAAAAGAGGAATGGTTCTACCTTTTACTCCTCTCACAATGTC 2444
|||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2398 AGTAAGAGTATTAG-CGCGAAAAGAGGAATGGTTCTACCTTTTACACCTCTCACAATGTC 2456
Query 2445 CTTCGACAACGTAAACTACTACGTCGACATGCCTAAGGAAATGAAGGAACAAGGAGTTTC 2504
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2457 TTTTGACAATGTAAACTACTACGTCGACATGCCTAAGGAAATGAAGGAACAAGGAGTTTC 2516
Query 2505 CAAGGATAAGCTTCAGCTACTAAAGGAAGTGACAGGGGTCTTTAGGCCAGGGGTATTAAC 2564
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 2517 CAAGGATAAGCTTCAGCTGCTAAGGGAAGTGACAGGGGTCTTTAGGCCAGGTGTACTAAC 2576
Query 2565 AGCTTTGATGGGAGTTAGTGGAGCTGGTAAGACCACTTTAATGGATGTTTTAGCTGGTAG 2624
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2577 AGCTTTGATGGGAGTTAGTGGAGCTGGTAAGACCACTTTAATGGATGTTTTAGCGGGCAG 2636
Query 2625 AAAAACCGGTGGTTACATCGAAGGAGACATCAGAATCTCTGGTTTCCCTAAAAGACAAGA 2684
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2637 AAAAACCGGTGGATACATCGAAGGAGACATCAGAATCTCCGGTTTCCCTAAAAGACAAGA 2696
Query 2685 AACCTTTGCAAGAATCTCTGGTTATTGTGAACAGAACGATATCCACTCACCGCAAGTTAC 2744
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2697 AACCTTTGCAAGAATCTCTGGTTATTGTGAACAGAATGATATCCACTCACCGCAAGTCAC 2756
Query 2745 TGTCAAAGAGTCTCTCATCTACTCTGCTTTCCTTCGTCTCCCAAAAGAAGTCACTAAA-T 2803
| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2757 TATCAAAGAGTCTCTCATCTACTCTGCTTTCCTACGTCTCCCAAAAGAAGTCACTAAAGT 2816
Query 2804 ATGAGAAAATGAGATTTGTGGATGAAGTGATGGAGCTAGTAGAGCTAGAGAGTCTAAAAG 2863
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2817 -TGAGAAAATGAGATTTGTGGATGAAGTGATGGAGCTAGTAGAGCTAGAGAGTCTAAAAG 2875
Query 2864 ACGCGGTGGTGGGGCTTCCAGGTATCACAGGGTTATCAACAGAGCAGAGGAAGAGACTTA 2923
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2876 ATGCGGTGGTGGGGCTTCCAGGGATCACAGGGTTATCAACAGAACAGAGGAAGAGACTTA 2935
Query 2924 CAATTGCAGTGGAATTAGTGGCGAATCCATCTATAATCTTCATGGATGAGCCAACCTCTG 2983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2936 CAATTGCAGTGGAATTAGTGGCGAATCCATCTATAATCTTCATGGATGAGCCAACCTCTG 2995
Query 2984 GTCTTGACGCTAGGGCTGCAGCGATTGTGATGAGGACAGTGAGGAATACAGTTGACACAG 3043
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct 2996 GTCTTGACGCGAGGGCTGCAGCGATTGTGATGAGGACGGTGAGGAACACTGTTGACACAG 3055
Query 3044 GAAGAACTGTGGTCTGCACAATCCACCAACCTAGCATTGATATCTTTGAAGCTTTTGATG 3103
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3056 GAAGAACTGTTGTCTGCACAATCCACCAACCTAGCATTGATATCTTTGAAACTTTTGATG 3115
Query 3104 AACTTCTTCTTTTGAAGAGAGGAGGACAAGTGATTTATGCTGGTCCTTTAGGTCAAAACT 3163
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 3116 AACTTCTTCTTATGAAGAGAGGAGGACAAGTTATTTACGCTGGTCCTTTAGGTCGAAACT 3175
Query 3164 CTCACAAGATTATCGAATATTTCCAGGCGATTCATGGAGTTCCGAAGATTAAAGAGAAGT 3223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 3176 CTCACAAGATTATCGAATATTTCCAGGCGATTCATGGAGTTCCAAAAATTAAAGAGAAGT 3235
Query 3224 ATAATCCGGCGACATGGATGCTAGAAGTGAGCTCAATGGCTGCAGAAGCTAAGCTTGAGA 3283
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3236 ATAATCCGGCGACATGGATGTTAGAAGTGAGCTCAATGGCTGCAGAAGCCAAGCTTGAGA 3295
Query 3284 TAGATTTTGCTGAGCATTATAAAACATCATCCTTATATCAACAAAACAAGAATCTTGTAA 3343
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3296 TAGATTTTGCTGATCATTACAAAACATCATCCTTATATCAACAAAACAAGAATCTTGTTA 3355
Query 3344 AGGAACTAAGCACACCACCACAAGGAGCAAGCGATCTCTACTTCTCAACGCGGTTCTCAC 3403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3356 AGGAACTAAGCACACCACCACAAGGAGCAAGCGATCTCTACTTCTCAACGCGGTTCTCAC 3415
Query 3404 AATCATTGTTAGGACAATTCAAATCTTGTTTGTGGAAGCAGTGGATAACTTACTGGAGAA 3463
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3416 AATCATTGTTAGGACAATTCAAATCTTGTTTATGGAAGCAGTGGATAACTTACTGGAGAA 3475
Query 3464 CTCCTGACTACAATCTAGCAAGATTTTTCTTTACATTGGCTGCAGCTGTCATGCTCGGAT 3523
||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3476 CTCCTGACTACAATCTAGCCAGATTTTTCTTTACGTTAGCTGCAGCTGTCATGCTCGGAT 3535
Query 3524 CAATTTTCTGGAAAGTTGGCACAAAAAGGGAAAACGCTAATGATCTTACAAAGGTTATTG 3583
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3536 CAATTTTCTGGAAAGTTGGCACAAAAAGGGAAAGTGCTAATGATCTTACAAAGGTTATTG 3595
Query 3584 GAGCAATGTATGCTGCTGTTTTATTCGTGGGCGTAAACAACTCTTCATCTGTCCAACCGC 3643
|||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 3596 GAGCAATGTACGCTGCAGTTTTATTCGTGGGCATAAATAATTCCTCATCTGTCCAACCGC 3655
Query 3644 TAATAGCCGTGGAAAGATCTGTATTCTATAGAGAAAGAGCTGCTGAAATGTACTCTGCTT 3703
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3656 TAATAGCCGTGGAACGAACTGTATTCTATAGAGAAAGAGCTGCTGAAATGTACTCTGCTT 3715
Query 3704 TACCTTATGCCCTAGCACAGGTGGTATGCGAAATACCGTATGTGCTGATCCAAACTACAT 3763
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 3716 TACCTTATGCCCTAGCACAGGTGGTATGTGAAATACCGTATGTACTGATCCAGACGACAT 3775
Query 3764 ATTATACACTAATTATATACGCCATGATGTGTTTCGAATGGACATTGGCCAAATTCTTTT 3823
||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3776 ATTATACACTAATAATATACGCAATGCTCTGTTTCGAATGGACAGTGGCCAAATTCTTTT 3835
Query 3824 GGTTTTACTTCGTATCATTTATGTCCTTCCTCTACTTCACATACTATGGGATGATGACAG 3883
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3836 GGTTTTACTTCGTATCATTCGTCTCCTTCCTCTACTTCACATACTATGGGATGATGACAG 3895
Query 3884 TTGCCCTCACCCCAAATCAGCAAGTTGCAGCTGTTTTTGCCGGAGCTTTCTACGGACTTT 3943
||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3896 TTGCCCTCACCCCGAACCAGCAAGTCGCAGCCGTTTTTGCAGGAGCTTTCTACGGACTCT 3955
Query 3944 TCAACCTCTTTTCTGGTTTTGTCATTCCTAGACCGAGAATTCCGAAATGGTGGATATGGT 4003
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3956 TCAACCTCTTTTCTGGTTTTGTCATCCCTAGACCGAGAATTCCGAAATGGTGGATATGGT 4015
Query 4004 ATTACTGGATCTGTCCAGTGGCTTGGACTGTGTATGGATTGATTGTTTCGCAGTACGGTG 4063
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4016 ATTACTGGATCTGTCCGGTGGCTTGGACTGTGTACGGATTGATTGTTTCGCAGTACGGTG 4075
Query 4064 ACGTGGAGGATACGATTAAAGTTCCGGGTATGGCAAATGATCCGACGATAAAGTGGTACA 4123
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4076 ACGTGGAGGATACGATTAAAGTTCCGGGTATGGCAAGTGATCCGACGATAAAGTGGTACA 4135
Query 4124 TTGAAAACCACTATGGATACGACGCAGATTTTAT-GATACCGATTGCTACTGTGTTAGTG 4182
||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||
Sbjct 4136 TTGAAAACCACTATGGATACGACGCAGATTTCATCG-TCCCGATTGCTACCGTGTTAGTG 4194
Query 4183 GGCTTTACTCTCTTTTTTGCGTTTATGTTTGCTTTTGGCATAAGAACGCTCAACTTCCAA 4242
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4195 GGCTTTACTCTCTTTTTTGCTTTTATGTTTGCTTTCGGCATAAGAACGCTCAACTTCCAA 4254
Query 4243 CAACGATAG 4251
|||||||||
Sbjct 4255 CAACGATAG 4263
> Ahg933502 jgi|Araly1|933502|scaffold_401490.1
Length=261
Score = 239 bits (129), Expect = 1e-61
Identities = 153/165 (93%), Gaps = 0/165 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3022 GTGAGGAATACAGTTGACACAGGAAGAACTGTGGTCTGCACAATCCACCAACCTAGCATT 3081
|||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 GTGAAGAACACAATTGACACAAGAAGAACTGTTGTCTACACAATCCACCAACCTAGCATT 114
Query 3082 GATATCTTTGAAGCTTTTGATGAACTTCTTCTTTTGAAGAGAGGAGGACAAGTGATTTAT 3141
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 115 GATATCTTTGAAGCTTTTGATGAACTTCTTCTTATAAAGAGAGGAGGACAAGTGATTTAC 174
Query 3142 GCTGGTCCTTTAGGTCAAAACTCTCACAAGATTATCGAATATTTC 3186
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 175 ACTGGTCCTTTAGGTCGAAACTCTCACAAGATTATCGGATATTTC 219
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 166616054594
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5