BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G17205.1 Length=3717 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg479191 jgi|Araly1|479191|fgenesh2_kg.3__1892__AT3G17205.1 5686 0.0 Ahg359773 jgi|Araly1|359773|fgenesh1_pg.C_scaffold_947000001 843 0.0 > Ahg479191 jgi|Araly1|479191|fgenesh2_kg.3__1892__AT3G17205.1 Length=3655 Score = 5686 bits (3079), Expect = 0.0 Identities = 3506/3701 (95%), Gaps = 73/3701 (2%) Strand=Plus/Plus Query 7 CAGAAATTTTTGCTTCTGTTTGATTTTGTTTTTG----CCCCTTTGCACACATATCATCC 62 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| Sbjct 3 CAGAAATTTTAGCTTCTGTTTGATTTTGTTTTTGTTTTTTCCTTTGCACGCAAATCATCC 62 Query 63 AAATTCGTTATCATTTTTCACCTTTGAAAGAATCTATCTCCTTGCTCTGT-TATCTCCAG 121 |||||| | | |||||| |||| ||| | | | ||| | ||||||||| Sbjct 63 AAATTC--T-TGATTTTT---CTTT------ATC-A-C-CTTTGAAGAATCTATCTCCAG 107 Query 122 TTCTAGGGCAT-ACGCCGATCACATCCCTAGCTCCTTTTGGCTCTAAT---A----ATAC 173 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| Sbjct 108 TTCTAGGGCATAACGCCGATCACATCCCTAGCTTCTTTTGGCTCCAATCGCAGCGGATAC 167 Query 174 AGTAATCTTAGGTTTTCGGGGAGTGAATCGTGTATTGGTATTCTAGTTTTAGCTCAAGAA 233 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct 168 AGTAATCTTAGGTTTTCGGGCAGAGAATCGTGTATTGGTATTCTAGGTTTAGCTCAACAA 227 Query 234 CATGTTTTTCTCCGGCGATCCTTCGACTCGGAAGCGAGTTGATTTAGGTGGCCGGAGCAC 293 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 228 CATGTTTTTCTCCGGCGATCCGTCGACTCGGAAGCGAGTTGATTTAGGTGGCCGGAGCAC 287 Query 294 CAAGGAGAGAGATGCTCGGAAGCTTCTCGAGCAGACTAGAATGGAGCGTAATCGTCGGTT 353 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 288 CAAGGAAAGAGATGCTCGGAAGCTTCTGGAGCAGACTAGAATGGAGCGTAATCGTCGCTT 347 Query 354 ACTACAGAAGCAGCAGAACTCTGCTGCTCTCAAAATTCAGAAATTCTTTAGAGGTCGAAG 413 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 348 GCTACAGAAGCAGCAGAACTCTGCTGCTCTCAAAATTCAGAAATTCTTTAGAGGTCGAAG 407 Query 414 ATCAATGGCCATTGAGCGCTCGAAGGTGCGGCATGATTTCTGTGAAACCTATGGGAATAA 473 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 408 ATCAATGGCCAGTGAGCGCTCGAAGGTGCGGCATGATTTCTGTGAAACCTATGGGAATAA 467 Query 474 TTGCCAGAATGTTGATAGACATTGCTTTGAGCCAGGTTCAAGTTTCCTCCGGCAGTTTCT 533 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 468 TTGCCAGAATGTCGATAGACATTGCTTTGAGCCAGGCTCAAGTTTCCTCCGGCAGTTTCT 527 Query 534 GttttttttCAAGGCACAAAACTCGGGAGATTTTGTGATACTTGTGGAGACTTGTCGTCT 593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 528 GTTTTTTTTCAAGGCACAAAACTCGGGAGATTTTGTGATACTTGTGGAGACTTGTCGTCT 587 Query 594 ACTGCAGAGTTTCGTTGACAGCAGTGGTGACATTGTCAGCCTTTTTTCTGGCTTGGACTA 653 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 588 ACTGCAGAGTTTCGTTGACAGCAGTGGTGACATTGTCAGCCTTTTTTCTGGCTTGGACTA 647 Query 654 TTCTTCTGAGCATAATTTGGTGGATTTTAGAGTAAAGAAACTTGCATTTACCTGTATCGA 713 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 648 TTCCTCTGAGCATAATTTGGTGGATTTTAGAGTAAAGAAACTTGCATTTACCTGTATTGA 707 Query 714 GGCGATACACCAGAATAGGAACCGTTTAAGGGATCAGCTCTTAGTTACTCCTGAAGAAGC 773 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 708 AGCTATACACCAGAATAGGAACCGTTTAAGGGATCAGCTCTTAGTTACTCCTGAAGAAGC 767 Query 774 TAGCATTTCAACAGCTATCTTGATGGAGGCAGTTTCGTTGTTGCTAGATCCTAAGCTGCC 833 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 768 TAGCATTTCAACAGCTATCTTGATGGAGGCAGTGTCGTTGTTGCTAGATCCTAAGCTGCC 827 Query 834 TTGGGTCTGCAAAATAGTTAGTTATCTACAAAAAAGA-AAAGTATTCAAACTGGTCCGAG 892 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 828 TTGGGTCTGCAAAATAGTTAGTTATCTAC-ATAAAGAGAACGTATTCAAACTGGTCCGAG 886 Query 893 AAATGGTCACTACGGCTAAGGAAAGCCCAAGAGGTAAGACTATGACCGGCAACATCCTTT 952 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| Sbjct 887 AAATGGTCACTACGGCTAAGGAAAGCCCAAGAGGTCAGACAATGACCGGCAGCATCCTTT 946 Query 953 CACTAGAAAGAGTATTGATACTGATAGTACCACATATTGGCCGTGAGCCATGTTGCTGCA 1012 ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 947 CACTAGAAAGAGTCTTGACACTGATAGTACCACATATTGGCCGTGAGCCATGTTGCTGCC 1006 Query 1013 CTGTTGTTGATCCACGTTGGAGTTTCTCATCTATGATTCTTACAATACCTTTGATATGGA 1072 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1007 CTGTTGTTGATCCACGTTGTAGTTTCTCATCTATGATTCTTACAATACCTTTGATATGGA 1066 Query 1073 AGCTCTTCCCAAACTTGAAAGTGGTATTTGCCAACCCGAGTCTAAGTCAACACTACATTC 1132 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1067 AGCTCTTCCCAAATTTGAAAGTGGTCTTTGCCAACCCAAGTCTAAGTCAACACTACATTC 1126 Query 1133 ACCAGATGGCTTCCTGTATTCAAAAGGATACCTGTGTTCTCCCAATGGAAACAAGCCCAG 1192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1127 ACCAGATGGCTTCCTGTATTCAAAAGGATACCTGTGTTCTCCCAATGGAAACAAGCCCAG 1186 Query 1193 AATTCCCTGGTTATGCTTGCCTACTTGGTAACACGTTGGACACTGCAAACGTGGTGTTGT 1252 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1187 AATTCCCTGGTTATGCTTGCCTGCTTGGTAATACGTTGGACACTGCAAATGTGGTGTTGT 1246 Query 1253 CACAGCCTGAATGTTCATTGGACATGGCAATTGACATTGCATTAGTTGCAACTTTCTTTT 1312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1247 CACAGCCTGAATGTTCATTGGACATGGCAATTGACATTGCATTAGTTGCAACTTTCTTAT 1306 Query 1313 TGGAGACACTTCCTCCTGTGAAATCATCAGAAGGAGAAAGTAGACAAG-GCTCTTCTGAT 1371 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| Sbjct 1307 TGGAGACACTTCCTCCTGTGAAATCATCAGAAAGAGAAAGCAGAC-AGAGCTCTTCTGAT 1365 Query 1372 GAGGATGATATGTTGATTGACGATGTACCAGGATTAGTCTTGAATAAGGCTCTGGAGCAG 1431 |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||| Sbjct 1366 GAGGATGATATGCTAATTGACGATGTACCAGAATTAGTCTTGAATAGGGCACTTGAGCAG 1425 Query 1432 CAGATAACCAATGCTATAGACTCACGCTTTCTTCTGCAGTTAACAAATGTTTTGTTCCGT 1491 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1426 CAGATAACCAATGCTATAGACTCACGTTTTCTTCTGCAGTTAACAAATGTTTTGTTCCAT 1485 Query 1492 CAAGTTTCGCTTGGTATGCAGTCATATGACGAAGATAAAGAAGCATTAGCTATTGGCACA 1551 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1486 CAAGTTTCGCTTGGTACGCAGTCATATGACGAAGATAAAGAAGCATTAGCTATTGGCACA 1545 Query 1552 GCCAGTTCTTTTCTGTATGCAGCATTCAACACTCTCCCTCTTGAGCGGATCATGACAATT 1611 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1546 GCCAGTTCTTTTCTGTATGCAGCATTCAACACTCTCCCTCTTGAGCGGATCATGACAATT 1605 Query 1612 TTGGCTTATAGAACAGAGCTTGTAGCTGTGTTGTGGAATTATATGAAACGATGCCATGAG 1671 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1606 TTGGCTTATAGGACCGAGCTTGTAGCTGTGTTGTGGAATTATATGAAACGATGCCATGAG 1665 Query 1672 AACCAGAAGTGGTCATCCATGCCTAAACTCCTAGCTTACCTTCCAGGGGATGCTCCCGGT 1731 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1666 AACCAGAAGTGGTCATCCATGCCTAAACTCCTAGCTTACCTTCCAGGGGATGCTCCGGGT 1725 Query 1732 TGGCTGTTACCTCTGGTTGTTTTTTGTCCTGTTTATAAGCATATGCTTATGATAGTCGAC 1791 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1726 TGGCTATTACCTCTGGTTGTTTTTTGTCCTGTTTATAAGCATATGCTTATGATAGTCGAC 1785 Query 1792 AATGAGGAGTTTTATGAAAGAGAGAAGCCATTATCGCTACAAGATATCAGGTTGCTCATC 1851 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1786 AATGAGGAGTTTTATGAACGAGAGAAGCCATTATCGCTACAAGATATCAGGTTGCTCATC 1845 Query 1852 ATTATCCTTAAGCAGGCTTTATGGCAGTTACTGTGGGTGAATCCACTTACGCAACCTAAC 1911 ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1846 ATTATTCTTAAGCAAGCTTTATGGCAGTTACTATGGGTAAATCCACTTACGCAACCTAAC 1905 Query 1912 ACTGGGAAATCTGTCTCCAATGACCTCTCGAAGAAGAACCCTATTGAACTGATTCAGAAC 1971 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 1906 ACTGGGAAATCTGTCTCCAATGACCTCTCGAAGAAGAACCCTGTTGAATTGATTCAGAAC 1965 Query 1972 A-GGATGGGGATTGTAGTCTCTGAGTTACTTTCACAGTTGCAAGATTGGAACAACCGGAA 2030 | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 1966 AGGGTTGGGG-TTGTAGTCTCTGAGTTACTTTCACAGCTGCAAGATTGGAACAACCGGCA 2024 Query 2031 ACAATTCACTTCCTCAAGTGACTTCCAAGCAGATTCAGTCAATGAATATTTCATCTCTCA 2090 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2025 ACAATTCACTTCCTCGAGTGACTTCCAAGCTGATACAGTCAATGAATATTTCATCTCTCA 2084 Query 2091 GGCCATAATGGAAGGAACGAGAGCCAACTACATACTGATGCAAGCTCCGTTCTTGATTCC 2150 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2085 GGCCATAGTGGAAGGAACGAGAGCCAACTACATACTGATGCAAGCTCCGTTCTTGATTCC 2144 Query 2151 GTTTACAAGCAGAGTCAAAATATTCACAACACAATTAGCAACGGCAAGGCAGAGTCATGG 2210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2145 GTTTACAAGCAGAGTCAAAATATTCACAACACAATTAGCAACGGCAAGGCAGAGTCATGG 2204 Query 2211 ATCGCAAGGAATTTTTGCTCGAAATCGGTTCAGAATACGAAGAGATCATATCTTGGAAGA 2270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2205 ATCGCAAGGAATTTTTGCTCGAAATCGGTTCAGAATACGAAGAGATCATATCTTGGAAGA 2264 Query 2271 TGCTTACAATCAAATGAGTGCGTTATCAGAGGATGATCTACGGAGCTCGATTCGTGTGAC 2330 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| Sbjct 2265 TGCTTACAATCAAATGAGTGCGTTGTCAGAGGATGATCTCCGGGGGTCGATTCGCGTGAC 2324 Query 2331 ATTTGTGAATGAACTCGGAGTTGAGGAAGCTGGTATTGATGGTGGTGGCATTTTCAAAGA 2390 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2325 ATTTGTCAATGAACTCGGAGTTGAGGAAGCTGGTATTGATGGTGGTGGCATTTTCAAAGA 2384 Query 2391 CTTCATGGAGAAAATTACCCGAGCAGCCTTTGATGTGCAATACGGGTTGTTTAAGGAGAC 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2385 CTTCATGGAGAAAATTACCCGAGCAGCCTTTGATGTGCAATACGGGTTGTTTAAGGAGAC 2444 Query 2451 CGCTGATCACATGCTTTATCCTAATCCTGGATCAGGAATGATACATGAACAGCATCTCCA 2510 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2445 GGCTGATCACATGCTTTATCCTAATCCTGGGTCAGGAATGATACATGACCAGCATCTCCA 2504 Query 2511 GTTCTTTCATTTTCTCGGCAGTCTCCTCGCAAAAGCTATGTTTGAAGGGATTCTTGTTGA 2570 |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2505 GTTCTTTCATTTTCTCGGCAGTCTTCTTGCAAAAGCAATGTTTGAAGGGATTCTAGTTGA 2564 Query 2571 TATACCATTTGCAACGTTTTTCCTCAGCAAACTGAAACAAAAGTACAACTATTTGAACGA 2630 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2565 TATACCATTTGCAACGTTTTTCCTCAGCAAACTGAAACAAAAGTACAACTATTTGAACGA 2624 Query 2631 TTTGCCTTCTCTGGATCCTGAGTTGTATAGGCACCTTATATTTCTGAAGCGTTATAAGGG 2690 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2625 TTTGCCTTCTCTGGATCCTGAGTTGTATAGGCACCTTATATTTCTGAAGCGTTATAAGGG 2684 Query 2691 TGATATCTCAGACTTGGAGCTTTACTTTGTTATTTTGAATAATGAATATGGAGAGAGGAC 2750 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2685 TGATATCTCAGATTTGGAGCTTTACTTTGTTATTTTGAATAATGAATATGGAGAGAGGAC 2744 Query 2751 AGAGGAAGAGCTACTTCCAGGGGGCCAAGACATGCGAGTTACAAATGAGAATGTTATAAC 2810 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2745 AGAGGAAGAGCTACTTCCAGGGGGACAAGACATGCGAGTTACAAATGAGAATGTTATAAC 2804 Query 2811 TTTCATTCATCTGGTTTCCAATCATCGGTTAAATTTTCAGATACGCCAGCAGAGTTCTCA 2870 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2805 TTTCATTCATCTGGTTTCCAATCATCGGTTAAATTTTCAGATACGCCAGCAGAGTTCTCA 2864 Query 2871 TTTCTTGAGGGGGTTTCAGCAACTCATTCCGAAAG-AATGGATCGACATGTTCAATGAAC 2929 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct 2865 TTTCTTGAGGGGGTTTCAGCAACTCATTCC-AAAGGAATGGATCGACATGTTCAATGAGC 2923 Query 2930 ATGAGCTTCAGGTTCTCATATCTGGTTCAGTTGATAGTTTGGATATAGACGACTTGCGAA 2989 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2924 ATGAGCTTCAGGTTCTCATATCTGGTTCAGTTGACAGTTTGGATATTGACGACTTGCGAA 2983 Query 2990 ACAACACTAATTATGCTGGAGGCTACCACGCGGGACATTATGTGATCGATATGTTCTGGG 3049 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2984 ACAACACTAATTATGCTGGAGGCTACCACGCGGGACATTATGTGATCGATATGTTCTGGG 3043 Query 3050 AAGTTATGAAAAGCTTCTCAACTGAAAACCAGAAGAAGTTCTTAAAGTTTGTGACAGGCT 3109 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3044 AAGTTATGAAAAGCTTCTCAACTGAAAACCAGAAGAAGTTCTTAAAGTTTGTGACGGGCT 3103 Query 3110 GCTCACGAGGACCACTGCTGGGTTTCAAATACTTGGAACCTGCATTCTGCATACAGAGGG 3169 | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3104 GTTCTCGAGGACCACTGCTCGGTTTCAAATACTTGGAACCTGCATTCTGCATACAGAGGG 3163 Query 3170 CTGCCGGTAGTGCGAGTAATGAATCAGTTGATAGACTACCGACATCAGCCACTTGTATGA 3229 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3164 CTGCCGGTAGTGCGAGTAATGAATCAGTTGATAGACTACCGACATCAGCCACTTGTATGA 3223 Query 3230 ATCTTCTTAAGCTTCCGCCCTATCAAAGCAAAGAGCTACTTGAGACCAAATTGATGTACG 3289 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3224 ATCTTCTTAAGCTTCCGCCTTATCAAAGCAAAGAGCTACTTGAGACGAAATTGATGTACG 3283 Query 3290 CCATAAGCGCAGAAGCGGGTTTTGATCTGAGCTGATGGAATAGCTTCCTGCCTTAAACAC 3349 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | | ||| || Sbjct 3284 CCATAAGCGCAGAAGCGGGTTTTGATCTGAGCTGA-G------C--C-T---TAAAAGAC 3330 Query 3350 AGACTT-CAATGGCCCCAAATTGACACCCTTTTTTCTAGCATTCCTCG-TTATGGTATAA 3407 |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| Sbjct 3331 AGACTTGCA-TGGCCCCAAATTGACACCCTTTTATCTAGCGTTCCTTGGTTATGGTATAA 3389 Query 3408 ACCGGGTAACCTGTAGACTGAGGCAGGCTTGTTGGCTCTAAGCATCTAAGAGACGGATCT 3467 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3390 ACCGGTTA-CCTGTAGACTGAGGCAGGCTTGTTGGCTCTAAGCATCTAAGAGACGGATCT 3448 Query 3468 AGAAGGAGAACATGTAGTAGAGATTACTTGACTAATGGGTTTCATTTGCAGCTCT-CGGG 3526 |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct 3449 AGAAGGGGAACATGTACTAGAGATTACTTAACTAATGGGTTTCATTTGCAGC-CTACGGG 3507 Query 3527 TATTCGCTTTCAAAAAGTGTGAC-aaaa-aaa-aaaaaGTGATTACAGGGAAGTCTTTAT 3583 |||||||||| ||||| |||| | |||| ||| ||||| | | |||| | || | Sbjct 3508 TATTCGCTTTAAAAAA-TGTGTCCAAAACAAAGAAAAA---A--A-AGGGT-GA-TT-AC 3557 Query 3584 TTGGAAGCTCCTGAGAGTTAGTCTTGGGTTAAAAATTCAATAAAAGAAATGGTAAATAAG 3643 ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3558 GGGGAAG-TCTT-AGAGTTAGTATTGGGTTAAAAATTCAATAAAATAAATGGTAAATAAG 3615 Query 3644 ACTGGTCTCAAGA--GGAACTTAAATGCTGTAAATTATTTT 3682 || ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 3616 ACAGGTCTCAAGTTTGGAACTCAAATGCTGTAAATT-TTTT 3655 > Ahg359773 jgi|Araly1|359773|fgenesh1_pg.C_scaffold_947000001 Length=495 Score = 843 bits (456), Expect = 0.0 Identities = 484/497 (97%), Gaps = 4/497 (1%) Strand=Plus/Plus Query 418 ATGGCCATTGAGCGCTCGAAGGTGCGGCATGATTTCTGTGAAACCTATGGGAATAATTGC 477 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCCATTGAGCGCTCGAAGGTGCGGCATGATTTCTGTGAAACCTATGGGAATAATTGC 60 Query 478 CAGAATGTTGATAGACATTGCTTTGAGCCAGGTTCAAGTTTCCTCCGGCAGTTTCTGttt 537 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CAGAATGTCGATAGACATTGCTTTGAGCCAGGCTCAAGTTTCCTCCGGCAGTTTCTGTTT 120 Query 538 tttttCAAGGCACAAAACTCGGGAGATTTTGTGATACTTGTGGAGACTTGTCGTCTACTG 597 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TTTTTCAAGGCACAAAACTCGGGAGATTTTTTGATACTTGTGGAGACTTGTCGTCTACTG 180 Query 598 CAGAGTTTCGTTGACAGCAGTGGTGACATTGTCAGCCTTTTTTCTGGCTTGGACTATT-C 656 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 181 CAGAGTTTCGTTGACAGCAGTGGTGACATTGTCAGCCTTTTTTCTGGCTTGGACTATTCC 240 Query 657 TTCTGAGCATAATTTGGTGGATTTTAGAGTAAAGAAACTTGCATTTACCTGTATCGAGGC 716 || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 241 TT-TAAGCATAATTTGGTGGATTTTAGAGTAAAGAAACTTGCATTTACCTGTATCGAAGC 299 Query 717 GATACACCAGAATAGGAACCGTTTAAGGGATCAGCTCTTAGTTACTCCTGAAGAAGCTAG 776 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 TATACACCAGAATAGGAACCGTTTAAGGGATCAGCTCTTAGTTACTCCTGAAGAAGCTAG 359 Query 777 CATTTCAACAGCTATCTTGATGGAGGCAGTTTCGTTGTTGCTAGATCCTAAGCTGCCTTG 836 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 CATTTCAACAGCTATCTTGATGGAGGCAGTGTCGTTGTTGCTAGATCCTAAGCTGCCTTG 419 Query 837 GGTCTGCAAAATAGTTAGTTATCTACAAAAA-AGAAAAGTATTCAAACTGGTCCGAGAAA 895 ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 420 GGTCTGCAAAATAGTTAGTTATCTACATAAAGAGAAC-GTATTCAAACTGGTCCGAGAAA 478 Query 896 TGGTCACTACGGCTAAG 912 ||||||||||||||||| Sbjct 479 TGGTCACTACGGCTAAG 495 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 140432444370 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5