BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G17360.1 Length=6462 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg929588 jgi|Araly1|929588|scaffold_302045.1 9832 0.0 Ahg929589 jgi|Araly1|929589|scaffold_302046.1 108 6e-22 > Ahg929588 jgi|Araly1|929588|scaffold_302045.1 Length=6215 Score = 9832 bits (5324), Expect = 0.0 Identities = 5937/6232 (95%), Gaps = 45/6232 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTCCCGAAACGTTCCGAGAATAGAGATGCCGGAATCGGAAGAAAACGAGTTCGCGAGC 60 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 21 ATGTCCCGAAACGTTCCGAGAATCGAGATGCCGGAATCAGAAGAAAACGAGTTCGCGAGC 80 Query 61 TTGTCTTTGTTTTCGCCTTCAAGACCTCCTCTGAATTCGATACCGGATCCAAGTCAAATT 120 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 81 TTGTCTTTGTTTTCGCCTTCAAGAGCTCCTCTGAATTCGATACCGGATCCAAGTCAAATT 140 Query 121 CAGAAGGCGAATCATCTACCCCATTTCGATTTGGTTCAGAAATTGGAAGGTACAAGAGCG 180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 141 CAGAAGGCGAATCATCTACCCGATTTCGATTTGGTTCAGAAATTGGAAGGTACAAGAGCG 200 Query 181 CAGCATCAACGAACACTTGGTCCAGAGAAGAAATTTGAAGTTTTGGAAGGTAGAGCTGGA 240 ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 201 CAGCATCAACGAACACTGGGTCCGGAGAAGAGACTCGAAGTTTTGGAAGGTAGAGCTGGA 260 Query 241 AATTCGAGTGATTCGAACCCTAAGATTGTTAATCGTAATGGAAAATCTCGGTCGGAGCCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 261 AATTCGAGTGATTCGAACCCTAAGATTGTTAATCGTAATGGAAAATCTCGGTCGGAGCCA 320 Query 301 AACTCTGCGCAGAGTACGCCCACTAGGAACGGTGCTAGGGTTTCTCTTGGTGGTGGTTGT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 321 AACTCTGCGCAGAGTACGCCCACTAGGAACGGTGCTAGGGTTTCTCTTGGAGGGGGTTGT 380 Query 361 GCTACCGGCGCAAGATTTCTTCAGTCTTTCGGTGGAAGAGGAAGGATTCCGA-GGGGAGT 419 ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | Sbjct 381 GCTACCGGCGCAAGAGTTGTTCAGTCTTTCGGTGGAAGAGGAAGGATTCCAAGGGGGA-T 439 Query 420 TTCTATTGCTGAGTCTGTTAGCTTCGCGGAAACAACTCCACATTTTGAACTCAATGAAGA 479 |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 440 TTCTATGGCGGAGTCTGTTAGCTTTGCGGAAACAACTCCACATTTTGAGCTCAATGAAGA 499 Query 480 TCATTCGTTTTGGAAAGACCACAATGTGCAGGTTTTGATAAGGCTGAGACCATTAGGCAC 539 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | || Sbjct 500 TCATTCGTTTTGGAAAGAGCACAATGTCCAGGTTTTGATAAGGCTGCGGCCATTAAGTAC 559 Query 540 AATGGAAAGGGCTAATCAAGGATATGGTAAGTGTTTAAAACAAGAGAGTCCACAAACATT 599 |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 560 AATGGAAAGGGCTAGTCAAGGACATGGTAGGTGTTTAAAACAGGAGAGTCCACAAACATT 619 Query 600 GGTCTGGTTAGGCCATCCAGAGGCCAGATTCACCTTTGACCACGTTGCCAGTGAGACAAT 659 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 620 GGTCTGGTTAGGCCATCCAGAGACCAGATTCACCTTTGACCATGTTGCCAGTGAGACAAT 679 Query 660 ATCTCAGGAAAAACTGTTTCGCGTTGCTGGACTGCCCATGGTGGAGAATTGCTTATCTGG 719 |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 680 ATCTCAGGAAAAGTTATTTCACGTTGCTGGACTCCCCATGGTGGAGAATTGCTTGTCTGG 739 Query 720 TTACAACAGCTGTGTGTTTGCCTACGGTCAGACTGGTAGTGGCAAGACTTATACTATGAT 779 |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 740 TTACAATAGTTGTGTGTTTGCCTATGGTCAGACTGGTAGTGGCAAGACTTATACTATGAT 799 Query 780 GGGAGAGATATCTGAGGCAGAGGGAAGCCTCGGTGAAGACTGCGGAGTTACTGCTCGTAT 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 800 GGGAGAGATATCTGAGGCAGAGGGAAGCCTCGGTGAAGACTGCGGAGTTACTGCTCGTAT 859 Query 840 TTTTGAGTATCTGTTCTCAAGAATTAAAATGGAAGAAGAGGAAAGGAGAGATGAAAATTT 899 |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | Sbjct 860 TTTTGAGTATCTATTCTCAAGAATTAAATTGGAAGAAGAGGGAAGGCGAGATGAAAAACT 919 Query 900 GAAGTTCAGTTGCAAATGTTCTTTTCTTGAGATATATAACGAGCAGATAACCGACCTCTT 959 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 920 GAAATTCAGTTGCAAATGTTCTTTTCTTGAGATATATAACGAACAGATAACTGACCTCTT 979 Query 960 GGAACCATCGTCAACCAATTTGCAACTTAGAGAAGACTTGGGGAAAGGAGTATATGTTGA 1019 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 980 GGAACCATCATCAACCAATTTGCAACTCAGAGAAGACTTGGGAAAAGGAGTATATGTTGA 1039 Query 1020 AAATCTTGTAGAACATAATGTGAGAACTGTTAGTGACGTTCTAAAGCTTCTACTACAGGG 1079 |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1040 AAATCTTGTAGAGCACAATGTGAGAACTGTTAATGATGTTCTAAAGCTTCTACTACAGGG 1099 Query 1080 AGCAACTAACCGGAAGATTGCTGCAACCCGTATGAACAGTGAAAGCAGCAGATCCCACAG 1139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1100 AGCAACTAACCGGAAGATTGCTGCAACCCGTATGAACAGTGAAAGCAGCAGATCCCACAG 1159 Query 1140 CGTTTTCACTTGTACAATTGAGAGTCTCTGGGAGAAAGATTCTCTAACTCGTTCAAGATT 1199 ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1160 CGTTTTCACATGTACAATCGAGAGCCTCTGGGAGACAGATTCTCTAACTCGTTCAAGATT 1219 Query 1200 TGCCAGACTAAACTTGGTCGATTTGGCTGGTTCTGAAAGGCAGAAAAGCTCAGGTGCGGA 1259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1220 TGCCAGACTAAACTTGGTCGATTTGGCTGGTTCTGAAAGGCAGAAAAGCTCAGGTGCGGA 1279 Query 1260 AGGGGATCGCCTAAAAGAAGCAGCAAACATTAACAAATCCTTATCAACTTTGGGCTTGGT 1319 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 1280 AGGGGATCGCCTAAAAGAAGCAGCAAACATTAACAAATCCTTATCCACTTTGGGCTTAGT 1339 Query 1320 GATAATGTCTCTGGTGGATTTGGCACATGGGAAACATAGACATGTTCCCTATAGAGATTC 1379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1340 GATAATGTCTCTGGTGGATTTGGCACATGGGAAACATAGACATGTTCCCTATAGAGATTC 1399 Query 1380 TCGACTTACCTTTTTACTGCAGGATTCTCTAGGGGGTAACTCCAAAACAATGATAATAGC 1439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1400 TCGACTTACCTTTTTACTGCAGGATTCTCTAGGGGGTAACTCCAAAACAATGATAATAGC 1459 Query 1440 TAATGTCAGCCCATCTCTTTGCTCTACAAACGAAACCCTCAGCACCCTGAAGTTCGCGCA 1499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1460 TAATGTCAGCCCATCTCTTTGCTCTACAAACGAAACCCTCAGCACCCTGAAGTTCGCGCA 1519 Query 1500 ACGGGCAAAACTAATCCAGAATAATGCTAAAGTAAATGAAGATGCCTCTGGGGATGTTAC 1559 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1520 ACGGGCAAAACTAATCCAGAATAATGCTAAAGTCAATGAAGATGCCTCTGGGGATGTTAC 1579 Query 1560 AGCACTCCAACAGGAAATAAGAAAGTTAAAGGTCCAACTGACTTCTCTTCTGAAGAACCA 1619 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 1580 AGCACTCCAACAGGAAATAAGAAACTTAAAGGTCCAACTGTCTTCTCTTTTGAAGAACCA 1639 Query 1620 TGACTCTTGTGGGGCTCTTTCAGACTGCATATCTTCTCTTGAAGAATCCAGATACTCTGG 1679 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1640 TGACTCTTGTGGGGCTCTTTCAGACTGCGTATCTTCTCATGAAGAATCCAGATACTCTGG 1699 Query 1680 TACATGTAAAGTAGCAGGAGAAACAAGACAAGACAAGTGTCACTGTCAGGTGAAAAATAT 1739 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1700 CACATGTAAAGTAGCAGGCGAAACAAGACAAGACAAATGTCACTGTCAGGTGAAAAATAT 1759 Query 1740 GAACGATAATATGATTGGTGCTCTCAGAAGGGAAAAGATTGCTGAATCTGCCCTTCAGAA 1799 ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1760 GAAAGATAATTTGATTGGTGCTCTCAGAAGGGAAAAGATTGCTGAAACTGCCCTTCAGAA 1819 Query 1800 GTCCGAGGCTGAGATTGAGCGTATAGATTGCTTGGTTAGAGACATGGAAGAAGATGCTAA 1859 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1820 GTCCGAGGCTGAGATTGAGCGTATAGACTGCTTGGTTAGAGACATGGAAGAAGATGCCAA 1879 Query 1860 GCGCATTAAAATAATGCTTAATCTTAGGGAAGAGAAAGTTGGAGAGATGGAATTCTGTAC 1919 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1880 GCGCATTAAAATAATGCTTAATCTTAGGGAGGAGAAAGTTGGAGAGATGGAATTCTGTAC 1939 Query 1920 GTCTGGTTCATTGATGACAAAAGAGTGTCTCATTGAAGAAAATAAAACTCTAAAAGGAGA 1979 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1940 GCCTGGTCCATTGATGACAAAAGAGTGTCTCATTGAAGAAAATAAAACTCTAAAAGGAGA 1999 Query 1980 GATCAAGCTTCTTCGCGACAGCATTGACAAGAATCCAGAGTTGACACGTTCAGCCTTGGA 2039 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2000 GATCAAGCTTCTTCGCGACAGCATTGACAAGAATCCAGAGTTGACACGTTCGGCCTTGGA 2059 Query 2040 GAACACCAAGCTCCGGGAGCAGCTACAACGATATCAGAAATTTTACGAGCATGGGGAACG 2099 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 2060 GAACACCAAGCTCTGGGAGCAGCTACAACGATATCAGAACTTTTATGAGCATGGGGAACG 2119 Query 2100 AGAGGCATTACTTGCTGAGGTGACAGGACTACGTGACCAGCTTCTTGATGTTCTTGAAGC 2159 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2120 AGAGGCATTGGTTGCTGAGGTGACAAGACTACGTGACCAGCTTCTTGATGTTCTTGAAGC 2179 Query 2160 AAAAGATGAATCCTTTTCTAAACACGTTATGAAGGAGAACGAAATGGAAAAGGAATTCGA 2219 ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2180 AAAAGATGAGTCCTTTCCTAAACACG--A-GAA------CGAAATGGAAAAGGAATTCGA 2230 Query 2220 AGACTGCAGAAACATGAACTCTAGTTTGATCAGAGAACTAGATGAAATACAAGCAGGACT 2279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2231 AGACTGCAGAAACATGAACTCTAGTTTGATCAGAGAACTAGATGAAATACAAGCAGGACT 2290 Query 2280 TGGAAGATACTTGAATTTCGATCAAATACAATCCAACGTTGTTGCATCTTCCACCAGAGG 2339 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || Sbjct 2291 TGGAAGACACTTGAATTTCGATCAAATACAATCCAACTTTGATGCATCTTCCACCAGTGG 2350 Query 2340 AGCTGAGCAGGCAGAAACAATGCCAACTATAAGTGAAATCCAAGAGGAGGTGGCTATTTC 2399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2351 AGCTGAGCAGGCAGAAACAATGCCAACTATAAGTGAAACCCAAGAGGAGGTGGCTATTTC 2410 Query 2400 ACATAGTAAAAACTATGATAGAGGTGCACTAGTGAAGACAGATGAGGGGATAGACCGGTC 2459 | | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2411 AGAGAGTAAAAACTATG---------CACTAGTGAAGACTGATGAGGGGATAGACCGGTC 2461 Query 2460 AATCCTGCAGTTCAAGTTAGGGAAGTTAATGAAGGACCTCGAGGAGGCCAGAACACTCAA 2519 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 2462 AATCCTGCAGTTCAAGTTAGGGAAACTAATGAAGGACCTTGAGGAGGCCAGAACACTTAA 2521 Query 2520 TTGTAAATATGAAAAAGATCATAAGTCGCAGTTATCTCAACAAGAAGACATTGAAGTAGT 2579 |||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2522 TTGTCAATATGAAAAGGAGCATATGTCGCAGTTATCTCAACAGGAAGACATTGAAGTAGT 2581 Query 2580 CCGTGAGCAAGTCGAGACAGAAACTGCTAGAACCATTCTTGAGTTGCAGGAAGAGGTGAT 2639 |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2582 CCGTGAGCAAGTTGAGACAGAAACTGCCAGAACCATTCTTGAGTTGCAGGAGGAGGTGAT 2641 Query 2640 TGCTCTCCAGTCTGAATTTCAAAGAAGAATCTGTAACTTGACCGAGGAAAATCAGTCGAT 2699 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2642 TGCTCTCCAGTCTGATTTTCAAAGAAGAATCTGTAACTTGACCGAGGAAAATCAATCGAT 2701 Query 2700 -AAAAGATACTATAACTGCTAGAGAGTCAGAAATAAGAGCACTTAACCAAGACTGGGAAA 2758 |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2702 GAAAA-ATACTATTACTGCTAGAGAGGCAGAAATAAGAGCACTTAACCAAGACTGGGAAA 2760 Query 2759 AGGCTACCTTAGAACTGACTAATTTCATCGTCGCTGGGTCCAAATCCATCAAAAATGCCT 2818 ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2761 AGGGTACCTTAGAACTGACAAATTTCATCGTCGATGGGTCTAAATCCATCAAAAATGCCT 2820 Query 2819 CTACACAGATTGAAAGTATCATCTGTTCATTTCCACAAGTGAATGCGTGGATAGGTGATT 2878 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2821 CTACACAGATTGAAAGTATAATCTGTTCATTTCCACAAGTGAATGCGTGGATAGGTGATT 2880 Query 2879 ATGTTGAGAAGGCTGCAAAAAATTGTATAAAAAAGGAAGAAACAATTTTACTTCTACAGA 2938 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2881 ATGTTGAGAAGGCTGCAAAAAATTGTATAAAAAAGGAAGAAACAATTTTGCTTCTACAGA 2940 Query 2939 AAAGCTTGGAAGATGCAAGGATATTAGTAGCAGAGATGAATTTGAAGCTGAATTCTTTAA 2998 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct 2941 AAAGCTTGGAAGATGCACGGATATTAGTAGCAGAGATGAATTTGAAGCTTAATTCCTTAA 3000 Query 2999 AGGGCGCAACAATTGCTCTCAACGAATTTCAACTGGGTGGCAATGCTGCAACGACTGAAG 3058 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3001 AGGGCGCAACAATTGCTCTCAACAAATTTCAACTGGGTGGCAATGCTGCAACCACTGAAG 3060 Query 3059 AGGCTTTCAACTTGAATAATGATGTAGACAGGATGAGCGATGAGGTAGACACGCTTGAGA 3118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3061 AGGCTTTCAACTTGAATAATGATGTAGACAGGATGAGCAATGAGGTAGACACGCTTGAGA 3120 Query 3119 GTAACTTTAAAGCAAATCAATATTCTATTCTGAAAACAGAACGACATGCCGAAGCTGCTT 3178 || |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3121 GTGACTTAAAAGCAAAGCAGTATTCTATTCTGAAAACAGAACGACATGCTGAAGCTGCTT 3180 Query 3179 TAGCTGTTACAAAATGGCTTTCTGATTCTAGAGATCAACACCAAATGATGGAAAAAGTAC 3238 | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3181 TTGCTGTGAAAAAATGGCTTGCTGATTCTAGAAAGCAACACCAAATGCTGGAAAAAGTAC 3240 Query 3239 AAGATCAATCAGTTAAAGAATTTGGTACATTAAGTTCAATCTCTGCTTCTCTTAGTGCGG 3298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3241 AAGATCAATCAGTTAAAGAATTTGGTACATTAAGTTCAATCTCTGCTTCTCCTAGTGCGG 3300 Query 3299 AAGGGAATGCTGATATTAGTTTGTCAAGGGATGGACATCTAAGTGACGCAACATATCCAA 3358 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3301 AAGGGAATGCTGATATTAGTTTGTCAAAGGATGGATATCTAAGTGACGCAATATATCCAA 3360 Query 3359 AGGGTGATGAGCTTTCAACATCAAGCTCTGACTTTTCAAACTGTAGATGGCAACATGATT 3418 |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3361 AGGGTGATGAGCTTTCAACATCAATCTCTGAGTTTTCAAACAGTAGATGGCAACATGATT 3420 Query 3419 GTGCACTGAACGTAAAGTGTCAAGGAGTTTCAAGTTCTGAATCTGACGCTCAAGAAAGTA 3478 ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3421 GTGTACTCAACGTAAAATGTCAAGGAGTTTCAAGTTCTGAATCTGACGCTCAAGAAAGTA 3480 Query 3479 ATAACAAGATTACATCAGCAGCTTTAATTGCTAAGAATGGTTCTGCACATTCTGTTTACT 3538 ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| || Sbjct 3481 ATAACAAGACTACATCAGCAGCTTTGATTGCTAAGAATGGGTCTGCACATTGTGTTTTCT 3540 Query 3539 GTGGAGAGGGGAGGCAGTCAGTTGAGAAGCCATTGACCATTATGATGGGGAGAGAAGAAA 3598 |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct 3541 GTGGAGAGGGGAGGCAGTCAGTAGAAAAGCCATTGACTATTATGATGGGGAGAGCAGAAA 3600 Query 3599 CAGAATACAAATGCAGTAAACCGCTTTCTTCTGGGGTATATATGGGTCTTATGCAGAGAA 3658 ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3601 CAGAATACAAATGCAGTAATCCGCTTTCTTCTGAGGTATATATGGGTCTTATGCAGAGAA 3660 Query 3659 TGGATCCTGTTAGAACTTTCTTCGATCGATTTGAGGAAGTCAATGCTACCATGAAAGAAG 3718 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3661 TGGATCCTGTTAGAAGTTTCTTCGATCGATTTGAGGAAGTCAATGCTACCATGAAAGAAG 3720 Query 3719 CTGATCTCACAATATGTGAATTAGTAAAGGCCAATGAAAAATCAAATAGTGTTACTGAAA 3778 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct 3721 CTGATCTGACAATATGTGAATTAGTAAAGGCCAATGAGAAATCAAATAATGTTACTGAAA 3780 Query 3779 TGTGGCTTCAAACCCATGAAGAGTTAATAAGT-AAGGaaaaaaaTTTGATGGATGATCTT 3837 ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||| Sbjct 3781 TGTGGCTTCAAACCCATGAAGAGCTAATG-GTTAAGGAAAAGTATCTGATGGATGATCTT 3839 Query 3838 GAACAGGTCAAGTCTATACTATCTGCTTGTGAAGAAGAAAAACAAGTCTTGCTAAATCAA 3897 |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct 3840 GAACAGGTCAAGTCTACACTATCTGCATGTGAAGAAGAAAATCAAATCTTGCTAAATCAA 3899 Query 3898 ACACACACCACTTTGGCGGACATGGAAAATTCAGTGTCTTTGCTTGAAGAATATTTTCAG 3957 |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct 3900 ACACACTCCACTCTGGCTGACATGGAAAATTCAGTGTCTTTGCTTGAAGAATATATACAG 3959 Query 3958 GAAATGAAAAGAGGAGTAGAAGAAACAGTAGAGGCTTTGTTTTCCCATGCCCGT-TTAGC 4016 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||| Sbjct 3960 GAAATGAAAAGAGGAGTAGAAGAAACATTAGAGGCATTGTTTTCCCATGTCC-TCTTAGC 4018 Query 4017 TGGAAAAGAGCTTCTCCAATTGATTTCCAACTCAAGACCATCACTTGAACAGATTGCATC 4076 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4019 TGGAAAAGAGCTTCTCCAATTGATTTCCAACTCAAGACCATCACTTGAACAGATTGTATC 4078 Query 4077 TGAATTCATGGAGAGAGAGTTCACCATGTATGCAACATACCAATGCCACATTGGGAAACT 4136 |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4079 TGAAACCATGGAAAGAGAGTTCACCATGTATGCAACATACCAATGCCACATTGGGAAACT 4138 Query 4137 GATCGATCAAATTTTGGATCAGAGAAAACAGGTTATCACTCCCAACCTTTCAGGCCAAGA 4196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4139 GATCGATCAAATTTTGGATCAGAGAAAACAGGTTATCACTCCCAACCTTTCAGGCCAA-- 4196 Query 4197 AACCAATCAGTCAGTGAAGATTAATGCCATTGGGTATAATGCCGAAGATGAAGTCACTAA 4256 | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4197 --C-A----GTCAGTGAAAATTAATGCCATTGGGTATAATGCCGAAGATGAAGTCACTGG 4249 Query 4257 AAAGCAAAGCAGAGAAGAGATTGTCACAGGCTTAGAAAATGATGAAGTTGTTCAGTCACA 4316 |||||||| || || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4250 AAAGCAAAACACAGCAGAGATCGTCACAGGTTTAGAAAATGATGAAGTTGTTCAGTCACA 4309 Query 4317 TGAAAGCCTATTATATGAGAACTTGTATCTGAAAAAGGAGCTTGAGAGAAAAGAAGCTTT 4376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct 4310 TGAAAGCCTATTATATGAGAACTTGTATCTGAAAAAGGAGATTGAGAGAAAAGATGCTTT 4369 Query 4377 GTTTGAAGGCTTGCTTTTTGATTTTAGGCTACTTCAGGAATCAGCATCAAATAAAAGAGA 4436 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4370 GTTTGAAGGCTTGCTTTTTGATTTTAGGCTACTTCAGGAATCAGCATCAAATAAAAGAGA 4429 Query 4437 TATCAAGAATGAAATGGATGAGCTGTTTGACGCATTATGCAAAGTACAGCTAGAGCTGGA 4496 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4430 TATCAAGAATGAAATGGATGAGCTGTTTGACGCACTATGCAAAGTACAGCTAGAGCTGGA 4489 Query 4497 ACTGAAAGCAAGTCAAGTTCATGAGCTTTTTGTTCATAACGAGAATCTTGAAAATTGCTC 4556 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 4490 GCTGAAAGCAAGTCAAGTTCATGATCTTTTTGTTCATAATGAGAATCTTGAAAATTGCTC 4549 Query 4557 CATTGACTTGAAAACGGCGTTGTTCACGTCACAGTCAGATCTAGAGCAGGCTAAACAGAG 4616 ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct 4550 CATTGACTTAAAAACGGCTTTGTTCACGTCACAGTCAGATCTAGAGCAGGCCAAAGAGAG 4609 Query 4617 GATACAAATTCTTGCGGAGCAGAATGATGAGTTAAGGGCCCTTGTTAGTGATCTCTGTAA 4676 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct 4610 GATACAAATTCTTGTGCAGCAGAATGATGAGTTAAGGGTCCTTGTTAGTGATCTATGTAC 4669 Query 4677 GGAAAAGGCT-GCAGCTGAGGAGGGATTGGACGAACAAAGGGATCTTGTCAATAGGTTGG 4735 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 4670 GGAAAAG-CTTGCAGCTGAGGAGGGATTGGACGAACAAAAAGATCTTGTCAAAAGGTTGG 4728 Query 4736 AAAAAGAAATCCTTCACTTGACTACTACAGCAGAGAAGCAATTGCTTTCTGCGGTCAAGT 4795 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4729 AAAAAGAAATCCTTCACTTGACTACTACATCAGAGAAGCAATTGCTTTCTGCGGTCAAGT 4788 Query 4796 CCATTAAAGAAAATTTGAAAAAGACCAGCGATGAGAAAGATCAGATTGTTGACGAAATAT 4855 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4789 CCATTGAAGAAAATTTGAAAAAGACCAGCGATGAGAAAGATCAGCTTGTTGACGAAATAT 4848 Query 4856 GTTCGTTAAATAATAAGCTTGAGTTGGCCTATGCTATAGCTGATGAAAAAGAAGCAATTG 4915 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4849 GTTCGTTGAATAATAAGCTTGAGTTGGCCTATGCTATAGCTGATGAAAAAGAAGCAATTG 4908 Query 4916 CCGTAGAGGCTCATCAGGAATCTGAAGCAAGTAAAATATATGCTGAACAAAAGGAAGAGG 4975 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4909 CCGTAGAGGCTCGTCAGGAATCTGAAGCAAGTAAAATATATGCTGAACAAAAGGAAGAGG 4968 Query 4976 AGGTCAAGATTCTAGAAATTTCTGTTGAGGAACTTGAGCGTACGATAAATATATTAGAAA 5035 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4969 AGGTCAAGATTCTAGAAATTTCTGTTGAGGAACTTGAGCGTACGATAAATATATTAGAAA 5028 Query 5036 GACGGGTGTATGATATGGATGAAGAAGTAAAAAGGCATCGTACCACCCAAGATTCGTTAG 5095 |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5029 GACGGGTGTACGATATGGATGAGGAAGTTAAAAGGCATCGTACCACCCAAGATTCGTTAG 5088 Query 5096 AGACAGAGCTGCAAGCTCTCAGACAGAGATTGTTTCGATTTGAAAACTTCACTGGCACTA 5155 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct 5089 AGACAGAGCTGCAAGCTCTCAGACAGAGATTGTTTAGATTTGAAACCTTCACTGGCACTG 5148 Query 5156 TGGTCACAACCAATGAAAGCACAGAGGAATATAAGAGTCACATATCCAGGTCGACAGGGC 5215 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5149 TGGTCACAACCAATGAAAGCACAGAGGAATATAAGAGTCACATATCCAGGTCGACAGGGC 5208 Query 5216 TGCAAGGTGCGCATAGTCAGATACAAGTCCTACAGAAGGAAGTAGCAGAACAAACCAAAG 5275 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5209 TGCAAGGTGCGCATAGTCAAATACAAGTCCTCCAGAAGGAAGTAGCAGAACAAACCAAAG 5268 Query 5276 AGATTAAACAGCTAAAAGAGTACATCTCCGAGATCTTACTGCATTCTGAGGCCCAATCAT 5335 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 5269 AGATTAAACAGCTAAAAGAGTACATCTCCGAAATCTTACTGCATTCTGAGGCCCAAGCAT 5328 Query 5336 CTGCTTACCAAGAGAAGTATAAGACTCTGGAGGTCATGATTCGAGACTTCAAACTAGAGG 5395 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 5329 CTGCTTACCAAGAGAAGTATAAAACTCTGGAGGTCATGATACGAGACTTCAAACTAGAAG 5388 Query 5396 ATTCAAGTTCGTCAGCTGCAGAGACCATATCACATAAAACTGAAAAAAGCTCAACAAGGA 5455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | Sbjct 5389 ACTCAAGTTCGTCAGCTGCAGAGACCATATCACATAAAACTGAGAGAAGCTCAATAAGAA 5448 Query 5456 GTAGAGGTTCAAGTTCACCCTT-CAGATGTATAGTTGGGTTGGTACAACAGATGAAACTG 5514 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5449 GTAGAGGTTCAAGTTCACCCTTTC-GATGTATAGTTGGGTTGGTACAACAGATGAAACTG 5507 Query 5515 GAGAAGGATCAGGAATTGACAATGGCAAGGGTTCGTGTTGAAGAATTGGAGTCATTGCTA 5574 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 5508 GAGAAGGATCAGGAATTGACCATGGCAAGGGTTCGTGTTGAAGAATTGGAGTCACTGCTA 5567 Query 5575 GCTGTTAAACAGAAAGAGATTTGCACATTGAACACGAGGATAGCTGCAGCTGATAGCATG 5634 |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5568 GCTGTTAAACAGAAAGAGGTTTGCACATTGAGCACGAGGATAGCTGCAGCTGATAGCATG 5627 Query 5635 ACTCATGATGTGATTCGGGATTTACTTGGTGTGAAAATGGATATAACCAGCTATGCTGAG 5694 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5628 ACTCATGATGTAATTCGGGATTTACTTGGTGTGAAAATGGATATAACCAGCTATGCTGAG 5687 Query 5695 TTGATTGACCAGCACCAGGTCCAAAGAGTGGTTGAAAAGGCTCAGCAACATGCTGAAGAG 5754 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| Sbjct 5688 TTGATTGACCAGCACCAGGTCCAAAGATTGGTTGAAGAGACTCAGCAACACGCTGAAGAG 5747 Query 5755 ATCCTGTCCAAGGAGCAAGAAGTCATGAACCTGAAGAGACATATTGATTATCTAT-TTAA 5813 ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| Sbjct 5748 ATCCTGTCCAAGGAGCACGAAATCATCAACCTGAAGAGACATATTGATTGTCT-TGTTAA 5806 Query 5814 GGATAGAGAGAGTTGCATGTCAGAGTTGAACAAGAAAGATACAGATGTTCTTGCGACACA 5873 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5807 GGAAAGAGAGAGTTGCATGTCAGAGTTGAACAAGAAAGATACAGATGTTCTTGCGACACA 5866 Query 5874 GATATCATTAGACCAACTACAAGAGCGAGTTCAGTTGCTTTCTATGCAAAACGAAATGCT 5933 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5867 GATATCTTTGGACCAACTACAAGAGCGAGTTCAGTTGCTTTCTATGCAAAACGAAATGCT 5926 Query 5934 TAAGAATGACAAGAGCAATTTGCTGAGGAAGTTAGCTGAACTTGATCGAACAGTCCACAA 5993 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 5927 TAAGAATGACAAGAGCAATTTGCTGAGGAAGTTAGCTGAACTTGATCGAACAGTCCACGA 5986 Query 5994 TGCACAGGCCAGTAACCATCGTG-TTCCACAGACAACAAAGGATACAGCGTCATTTAAAC 6052 ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5987 TGCACGGGCCAGTAACCATCGTGCTTC-ACAGACAACAAAGGATACAGTGTCATTTAAAC 6045 Query 6053 TTGCTGATACTGATTATACCAAGAGACTGGAAAACGCTCAGAAGCTTCTTTCCCATGCTA 6112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6046 TTGCTGATACTGATTATACCAAGAGACTGGAAAACGCTCAGAAGCTTCTTTCCCATGCTA 6105 Query 6113 ATAACGAATTGGCAAAGTATCGCAAAACGAGCAATAACCATCCATCTACAAGAACTCAAG 6172 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6106 ATAACGAATTGGCAAAGTATCGCAAAACGAGCAATAACCATCCATCTACAAGAACTCAAG 6165 Query 6173 GACAGAGCTCTGGTACAAGATATCGGTAAAGAGttttttttttAAAGCTTCT 6224 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct 6166 AACAGAGCTCTGGTACAAGATATCGGTAA-GAGTTTTTTTTT-AAAGCTTCT 6215 > Ahg929589 jgi|Araly1|929589|scaffold_302046.1 Length=346 Score = 108 bits (58), Expect = 6e-22 Identities = 73/79 (92%), Gaps = 6/79 (8%) Strand=Plus/Minus Query 6384 TGGTTAACTTTTTGTGTGTGAGTGTCTTAAATTGGAATTGTTGTGTATAAGAATGCATAT 6443 |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 346 TGGTTAAC-TTTT-TGTGT--GTG--TTAAATTGGAATTGTTGTGTATAAGAATGCATAT 293 Query 6444 AACATGTTGCTGCAATTGG 6462 ||||||||||||||||||| Sbjct 292 AACATGTTGCTGCAATTGG 274 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 244900482255 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5