BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G17740.1
Length=3719
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg479255 jgi|Araly1|479255|fgenesh2_kg.3__1956__AT3G17740.1 5611 0.0
> Ahg479255 jgi|Araly1|479255|fgenesh2_kg.3__1956__AT3G17740.1
Length=3732
Score = 5611 bits (3038), Expect = 0.0
Identities = 3527/3756 (94%), Gaps = 62/3756 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GTTTTGTTTTTTCCGGTGGATGTAATGTCGAATACACCAGAAGACGGCGACGGAGCA-CA 60
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1 GTTTT-TTTTTCCCGGTGGATGTAATGTCGAATACATCAGAGGACGGCGACGGAGCATC- 58
Query 61 GGTAACTACAGGCGGCTTGTTCCCCGTCTTCCCTACTTCGGCGAACTCCATCTCAGCTAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 59 GGTAACTACAGGCGGCTTGTTCCCCGTCTTCCCTACTTCGGCGAACTCCGTCTCAGCTTT 118
Query 121 TTC-GAATGCTCCTCAATGGCTTCGCAACGCTAGCTTCACTACGGATCTCTCTGTCATCA 179
||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 119 TTCTG-GTGCTCCTCAATGGCTTCGCAACGCCAGCTTCACGACGGATCTCTCCGTCATCA 177
Query 180 ACGCTGCCGCTTCGACGGCTCCTTCCTCATCCGAGGTCGAGGCTGGAGACGACGAAGATG 239
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 178 ACGCTGCCGCTTCGACGGCTCCTTCCTTATCCGAGGTCGAGGCTGGAGACGAAGAAGATG 237
Query 240 AAGAAGGAGGA-GCTGAT-GGAAATATCGGTTTAGCTAATCAGGCTAGGGTTTATAATTT 297
|| ||||| || || ||| || ||||| ||| |||||||||| |||| || || |||||
Sbjct 238 AAAAAGGA-GATGCCGATAGG-AATATTGGTGAAGCTAATCAGCCTAGAGTATACAATTT 295
Query 298 GGTTGAAGAAGAAGGGTCTTTGGAGTCTGATGACGACAAGGTAAAGAGGAAGCGAGAGAA 357
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||
Sbjct 296 GGTTGAAGAAGAAGAGTCTTTGGAGTCTGATGGCGACAAGGTAATGAGGAAGCGGGGGAA 355
Query 358 AAAGAAGAAACGGAAGAGTGATAATGCTTCGGATGAATCTCG-T--------T-CTC-G- 405
||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | | ||| |
Sbjct 356 AAAGAAGAAGCGGAAGAGTGGTAATTCTTCGGATGAATCTCGTTCAAGGAAATCCTCAGT 415
Query 406 TAA---ATCTGATGAATACTATTCGAAACCTGTGAAGGATTATTACTTGGACACTCGTCC 462
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 416 TAAGGCATCTGATGAATACTATTCGAAACCTGTGAAGGATTATTATTTGGATACTCGTCC 475
Query 463 TGATCCAGATAATCTGGCTTATGGCTCTATTTACAGGATGAATGTTCCTCGTTATAAACT 522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476 TGATCCAGATAATCTGGCTTATGGCTCTATTTACAGGATGAATGTTCCTCGTTATAAACT 535
Query 523 TGACAATTCTCAGAGAGTTCCAGGGTCAGGTTCTCTGAGGTTTTATTTGCGGAATCGACG 582
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 536 TGACAATTCTCAGAGAGTTCCTGGTTCAGGTTCTCTGAGGTATTATTTGCGGAATCGGCG 595
Query 583 TAGTTCTATGCTTGACACAGAGATTGATATTGATTCTTTGGAGGGGAGAGCAAAGTCTGA 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 TAGTTCTATGCTTGACACAGAGATTGATATTGATTCTTTGGAGGGGAGAGCAAAGTCTGA 655
Query 643 TACCCGATACTGGTATGCAAAACATGCTGCCATGGAACGCAACAAGAATTTCAAGCGTAT 702
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656 TACCCGATATTGGTATGCAAAACATGCTGCCTTGGAACGCAACAAGAATTTCAAGCGTAT 715
Query 703 TCGTTTATCTGCTGCAAGTGAAGCTGTGGATTCTTCCTTTGATAATTTCATTCCACTGGA 762
||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 716 TCGTTTATCTGCTTCAACTGAAGCTGTGGATTCGTCCTTTGATAATTTCATTCCACTGGA 775
Query 763 GGAAGACGTGACTGTTCC-AGAAAGTGACGAAGAAGATGTTTTATCAAAGGACTCAATGA 821
|||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 776 GGAAGATGAGACTG-TCCAAGAAAGTGACGAAGAAGATGTTTTATCAAAGGACTCAAAGA 834
Query 822 TTGGAGCATCATGGGAGGATGAAGTGCTGAATAAAACACGGGAGTTCAACAGAGTGACGA 881
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||
Sbjct 835 TGGGAGCATCATGGGAGGATGAAGTGCTGAATAAAACGCGAGAGTTCAACAAAGTGACGA 894
Query 882 GAGAACGTCCCCATGATGCAAAGGCATGGCTGGCATTTGCTGATTTTCAAGACAAGGTTT 941
| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 GGGAGCGTCCACATGATGAAAAGGCATGGCTGGCATTTGCTGATTTTCAAGACAAGGTTT 954
Query 942 CAAGTATGCAATCTCAGAAAGGAGTTCGCCTGCAGACTTTAGAGAAAAAGATTAGTATAC 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 CAAGTATGCAATCTCAGAAAGGAGTTCGCCTGCAGACTTTAGAGAAAAAGATTAGTATAC 1014
Query 1002 TTGAGAAGGCTTTTGAGCTGAACCCAGATAGCGAAGAACTGTTGCTTGCTCTGCTCAAGG 1061
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 TTGAGAAGGCTTTTGAACTGAACCCAGATAGCGAAGAACTGTTGCTTGCTCTGCTCAAGG 1074
Query 1062 CATACCGAAGCAGAGACAACGCTGATGTACTAATCAGTAGGTGGGAAAAGGCACTTATGC 1121
|||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 CATACCGACGCAGAGACAACGCGGAAGTACTAATCAGTAGGTGGGAAAAGGCACTTATGC 1134
Query 1122 AGAATTCCGCAAGCTACAAATTATGGAGGGAGTTTTTATGTGTTGTTCAAGGGGAGTTCT 1181
| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 AAAATTCCGCAAGCTACAAGTTATGGAGAGAGTTTCTATGTGTTGTTCAAGGGGAGTTCT 1194
Query 1182 CCAGATTCAAAGTATCAGAAGTGAGGAGGCTGTATTCTTATGCGATCCAGGCTCTTTCTT 1241
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 CCAGATTCAAAGTATCAGAAGTGAGGAAGCTGTATTCTTATGCGATCCAGGCTCTTTCTT 1254
Query 1242 CTGCTTGCAGCAAGCGACATAGGCAGGTGGATACAACATCTGAACCATTGGATTCTGCTG 1301
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1255 CTGCTTGCAGCAAGCGACATAGGCAGGTGGATACAACATCTGAACCGTTGGATTCTGCTG 1314
Query 1302 CCATCCAACAGGAACTCGTTCTAGTCGATATGCTAGTTAGCCTCTGCAGGTTTGAGTGGC 1361
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 CCATCCAGCAGGAACTCGTTCTAGTCGATATGCTTGTTAGCCTCTGCAGGTTTGAGTGGC 1374
Query 1362 AGGCTGGTTACCAGGAGCTGGCCACAGCGTTACTTCAAGCCGAAGTGGAATTTAGCATCT 1421
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1375 AGGCTGGTTACCAGGAGCTCGCCACAGCGTTACTTCAAGCTGAAGTGGAATTTAGCATCT 1434
Query 1422 TTTCTCCATCTTTGTTGCTAACTGAACAGAGTAAATTACGACTGTTTGAGCACTTTTGGA 1481
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 TTTCTCCATCTTTGTTGCTAACTGAACAGAGTAAATTAAGACTGTTTGAGCACTTTTGGA 1494
Query 1482 GCAGTAATGGTGCTAGAGTTGGAGAAGAAGGAGCTTTTGGATGGTTATTGTGGCTGGAGA 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 GCAGTAATGGTGCTAGAGTTGGAGAAGAAGGAGCTTTTGGATGGTTATTGTGGCTGGAGA 1554
Query 1542 AAGAGGAGGAAAACAGGCAGAAAATTTTGAAAGAAGAATCCTCTGATGACAATGAAGTAG 1601
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||
Sbjct 1555 AAGAGGAGGAAAACAGGCAGAAAATTTTGAAAGAAGTATTCTCTGATGACAATGAGGTAG 1614
Query 1602 GTGGTTGGACAGGTTGGACAGAACAGGTCTCAGGTAGAAATGGAGATGATATTGCTTCAG 1661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||
Sbjct 1615 GTGGTTGGACAGGTTGGACAGAACAGGTCTCAGGTAGAAATGGAGAT-AT-T-GCTTCAG 1671
Query 1662 CTAACACTGGAGAGGTCGATGTTGATCG-GAAGGGTCTGGATGAGGAAATGGAAGACGAG 1720
|||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672 CTAACACTGGAGAGGTCGATGTTGATCGTGA-GAGTCTGGATGAGGAAATGGAAGACGAG 1730
Query 1721 AATAGCAAACCTGAAGATGACACCGAAGCTATGCTGAAATTATTGGGCATTGATGTCAAT 1780
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 AATAGCAAACCGGAAGATGACACTGAAGCTATGCTGAAATTATTGGGCATTGATGTCAAT 1790
Query 1781 ACTGCGGCCAGTGATGAGGTTAAAGATACATCAACTTGGGTTAAATGGTTTGAAGAAGAG 1840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1791 GCTGCGGCCAGTGATGAGGTTAAAGATACATCAACTTGGGTAAAATGGTTTGAAGAAGAG 1850
Query 1841 GTTTCTCGAGATCACAGTCAATGGATGCCTACTCGGAAAGCTGGTGAATTCTCCAGTGTT 1900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1851 GTTTCTCGAGATCACAGTCAATGGATGCCTACTCGGAAAGCTGGTGGAGTCTCCAGTGTT 1910
Query 1901 GAGGGAATGGGTGAGGGAGAAGATGAAGAGCAACTCTCAAGTGTTGTACTATATGAAGAT 1960
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1911 GATGGAATAGGTGAGGGAGAAGATGAAGAGCAACTCTCAAGTGTTGTACTATATGAAGAT 1970
Query 1961 ATAAATGGATATCTATTTTCCTTACGTTCAAAGGAGGCCCGCTTATCTCTGGTATACCAG 2020
|||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 ATAAATGGATATCTATTTTCTTTATGTTCAAACGAGGCCCGCTTATCTCTGGTATACCAG 2030
Query 2021 TTCATTGATTTCTTCGGTGCACATATCTCCCCATGGACTTCCAGCAACAGTTTGTCGTGG 2080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 TTCATTGATTTCTTCGGTGCACATATCTCCCCATGGACTTCCAGCAACAGTTTGTCGTGG 2090
Query 2081 AGTGAGAAAATAAGTAGCCTTGAAACATTTTCAGATTCCATGTTAGAAAACTTGAGAAGT 2140
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 2091 AGTGAGAAAATAAGTAGCCTTGAAACATTGTCAGATTCTATGCTAGAAAACTTGAGAAGT 2150
Query 2141 GTTCATGAATGTTTGTCGAAATCAGATAGTGCCAACTGTTTCAGCTTGGGATCTCTTCTA 2200
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||
Sbjct 2151 GTTCATGAATGTCTGTCGAAATCAGATAGTGCCAACTGCTTCAGCTTGGTATCTCTTTTA 2210
Query 2201 GGTGGCAGCTGTGACTTATCTATGCGGACTGAGATGATGAAGTTTCTCCGCAATGCCATC 2260
|||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 GGTGGCAGCTATGACATATCTATGCGGGCTGAGATGATGAAGTTTCTCCGCAATGCCATC 2270
Query 2261 TTGCTTTGTCTAAATGTTTTCCCGCGAAATTACATTCTCGAAGAAGCTGTGCTTGTTGCA 2320
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2271 TTGCTTTGTCTAAATGTTTTTCCGCGAAACTACATTCTGGAAGAAGCTGTGCTTGTTGCA 2330
Query 2321 GAAGAACTATTTGTAACAAATATGAAAACATGTGAGGTAGCAACTATGCCATGCCAAGCT 2380
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2331 GAAGAGTTATATGTAACAAATATGAAAACATGTGAGGTAGCAACTACGCCATGCCAAGCT 2390
Query 2381 TTGGCCAAACGTCTCCTGAAAAGTGACCGGCAGGATCTACTACTTTGTGGAGTTTATGCA 2440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 TTGGCCAAACGTCTCCTGAAAAGTGACCGGCAGGATCTACTACTTTGTGGAGTTTATGCA 2450
Query 2441 CAGAGAGAAGCTGCTTCTGGAAATATGAAACATGCAAGGCGAGTCTTCGACATGGCACTG 2500
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 2451 CAGCGAGAAGCTGCTTCTGGAAATATGAAACATGCAAGACGAGTTTTCGACATGGCACTG 2510
Query 2501 ACTTCTATCTGTGGCCTCCCTAAGGAATTACAGTGTAACACTCCTTTGCTATGTTTATGG 2560
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2511 ACTTCTATCTGTGGCCTCCCTCAGGAATTACAGTGTAACGCTCCTTTGCTATGTTTATGG 2570
Query 2561 TATGCTGAATCGGAAGTAGCCAATAGTAGCGGCAGTGGTAGGGATACAGAATCATCATCT 2620
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2571 TATGCTGAATTGGAAGTAGCCAATAGTAACGGCAGTGGTAGGGATACAGAATCATCATCT 2630
Query 2621 CGTGCTATGCATATTCTGTGCTACCTGGGAAGTGGTCTAGCTTATAGTCCTTATACTTCC 2680
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2631 CGTGCCATACATATTCTGTGCTACCTGGGAAGTGGTCTAGCTTATATTCCTTATACTTCC 2690
Query 2681 CAGTCTTCAAGCATGCAAATTCTTAGAGCACGCCAGGGGTTCAGAGAGAAGCTTAAGAAG 2740
||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2691 CAGTCTTCAAGTATGCAAATCCTTAGAGCACGCCAAGGGTTCAGAGAGAAGCTTAAGAAG 2750
Query 2741 ATACAATCAACATGGTCTCATGGTGTCACAGATGATCAATCAGCAGCGCTTGTTTGTTCG 2800
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2751 ATACAATCAACCTGGTCTCATGGTGTCACAGATGATCAATCAGCAGCGCTTGTTTGTTCG 2810
Query 2801 GCAGCTCTATTTGAGGAGTTAACAAATGACCTTCCTGGTGCTCTTGAGATCTTAGAGCAC 2860
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||
Sbjct 2811 GCAGCTCTATTTGAGGAGTTAACAAATGACCTTCCTGGTGCTGTTGAAATCCTAGAGCAC 2870
Query 2861 ATGTTCAGTTCTGTTCTTCCAGGAAGAAAAAGTCAAAGTCATCAACTTGAACTCTTGTTC 2920
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 2871 ATGTTCAGTTCTGTTCTTCCAGGAAGAAAAAGTCAAAGTCGTCAGCTTGAACTCTTGTTC 2930
Query 2921 AATTATTATGTGAGAATGCTTCAGAGACACCAGGACGATCTAACTTTGTCACAACTTTGG 2980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2931 AATTATTATGTGAGAATGCTTCAGAGACACCAGGACGATTTAACTTTGTCACAACTTTGG 2990
Query 2981 AAGCCCATATCAGAGGGACTGCAACTGTATCCTCTCAATCC--TGAACTTTATCGAGCTT 3038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 2991 AAGCCCATATCAGAGGGACTGCAACTGTATCCTCTCAATCCCATG--CTTTATCGAGCTT 3048
Query 3039 TGGTGGACATTTGTAATCACCGGATGACATCCCATAAACTGAGAATGATGTTCGATGACT 3098
|||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3049 TGGTGGACATCTGTAACCACCGTATGACATCCCATAGACTGAGAATGATGTTTGATGACT 3108
Query 3099 ACTCCCGCAAGAATTCGTCTGTCGTTGTTTGGCTATTTGCACTTTCTTATGAATTGAGTA 3158
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 3109 ACTCCCGCAAGAATTCATCTGTCGTTGTTTGGCTGTTTGCACTTTGTTATGAGTTGAGTA 3168
Query 3159 AAGGAGGCTCA-TCACACAGAATCCGCGGATTGTTTGAAAGGGCATTGGCACAAGATACA 3217
|||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3169 AAGGAGGCTCCCT-ACACAGAATCCGTGGATTGTTTGAAAGGGCATTGGCCCAAGATACA 3227
Query 3218 CAAAACAACTCAGTTATTCTATGGCGTTGCTACATAGCATATGAGATCGACATCGCGGAC 3277
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3228 CAAAACAACTCGGTTATTCTATGGCGTTGCTACATTGCATATGAGATCGACATCGCGCAC 3287
Query 3278 AATCCATCAGCAGCTAGAAGGATTTATTTCCGAGCTATAAATGCATGCCCATGGTCGAAG 3337
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3288 AATCCATCAGCAGCTAGAAGGATTTACTTCCGAGCTATAAATGCATGCCCATGGTCAAAA 3347
Query 3338 AAACTATGGCTCGATGGGTTTGGGAAGCTGGGATCAGTCTTGACGGCAAAAGAGATGTCA 3397
||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||
Sbjct 3348 AAACTATGGCTGGATGGGTATGGGAAGCTGAGCTCAGTCCTGACGGCAAAGGAGTTGTCA 3407
Query 3398 GATTTACAAGAAGTGATGCGGGACAAGGAACTGAACATTAGGACAGATATCTACGAGATT 3457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3408 GATTTACAAGAAGTGATGCGGGACAAGGAACTGAACATTAGGACAGATATCTACGAGATT 3467
Query 3458 CTGCTTATGCAGGGATGAGATCATTTA-AGTGTCA-ACTAACAAATATTGT-T-GTAAT- 3512
|| |||||||||||||||||||||| | | ||| | | || |||||||||| | || ||
Sbjct 3468 CTTCTTATGCAGGGATGAGATCATTGAGA-TGT-ATATTATCAAATATTGTATAGTTATG 3525
Query 3513 ATGGAA-ACGTGATTTTCTATAAATA-AT-CAAGTATAAGTTCA-TTTAAGTATTTATGA 3568
|| || | | ||||| |||| | || || | || ||| | ||| | ||||||||
Sbjct 3526 ATATAAGA--T-ATTTTATATATTTGTATTCA--TCTA-GTTTAGTTTGCG-ATTTATGA 3578
Query 3569 GTGTGCGTCTCACTCGAT-AAGTTCATTGACTCCCCAAAATTGGCCAATGTTGGCAGGTT 3627
|||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||
Sbjct 3579 GTGTGCGTCTCACTCGTTTAAGTTCATTGATTCCCTGGA-TTGGCCAATGCTGGCAGGTT 3637
Query 3628 TAAGTGAATATGTTTCCTTGAACGGAAATTTGTATTGGACTGCTTACAA----GAGACTC 3683
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 3638 TAGGTGAATATGTTTCCTTGAACGGAAATTTGTATTGGACTTCTTACAATAAAGAGACTC 3697
Query 3684 GTGAGTATTTTTCTCGGAAGCTTTGATTCCTCCACG 3719
|||||| |||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3698 GTGAGTGTTTT-CTCGGAAGCTTTGATTTCTCCACG 3732
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 140508559516
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5