BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G17770.1
Length=2271
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg929642 jgi|Araly1|929642|scaffold_302099.1 2983 0.0
Ahg336963 jgi|Araly1|336963|fgenesh1_pg.C_scaffold_1003528 1840 0.0
> Ahg929642 jgi|Araly1|929642|scaffold_302099.1
Length=1828
Score = 2983 bits (1615), Expect = 0.0
Identities = 1757/1827 (96%), Gaps = 4/1827 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 165 GCTTAATACTCGCAATTATGGATTTCGCAGCCAAGAAATTCATCAACAACCCCAACGATG 224
|||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 GCTTCATACTCGCAATTATGGTTTTCGCGGCCAAGAAATTCATCAACAACCCCAACGATG 63
Query 225 TTGTAACTGAGTTCATAGAGGGTCTGGTAGAAACTTATCCTGGACTCCAGTATTTGGATG 284
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 TTGTAACTGAGTTCATAGAGGGTCTGGTCGAAACTTATCCTGGACTCCAGTATTTGGATG 123
Query 285 GTTTTCCTGAGGTTAAGGTGGTGCTACGAGCTGATGTCTCGGCTGCAAAATATGACAAGG 344
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 124 GCTTTCCTGAGGTTAAAGTGGTGCTACGAGCTGATGTTTCAGCTGCAAAATATGACAAGG 183
Query 345 TTGCCGTTATCTCAGGTGGAGGCAGTGGGCATGAGCCAGCACATGCTGGATACGTTGGAG 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 TTGCCGTTATCTCAGGTGGAGGCAGTGGGCATGAGCCTGCACATGCTGGATACGTTGGAG 243
Query 405 AAGGAATGCTAACAGCTGCTATTTGTGGAGATGTCTTTGCCTCCCCACCAGTTGATTCTA 464
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 AAGGAATGCTAACAGCTGCTATCTGTGGAGATGTCTTTGCCTCCCCACCAGTTGATTCTA 303
Query 465 TCCTTGCTGGAATTCGAGCTGTAACTGGTACTGAGGGATGTCTATTGATTGTCAAGAATT 524
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 TCCTTGCTGGAATCCGAGCTGTAACTGGTAGTGAGGGATGTCTATTGATTGTCAAGAATT 363
Query 525 ATACGGGTGATCGCTTGAACTTTGGTTTGGCTGCTGAACAAGCAAAATCTGAAGGTTACA 584
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 ATACTGGTGATCGCTTGAACTTTGGTTTGGCTGCTGAACAAGCAAAATCTGAAGGTTACA 423
Query 585 AAGTTGAGACTGTAATTGTTGGAGAGGATTGCGCTTTACCCCCGCCACGTGGCATCGCTG 644
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 424 AAGTTGAGACTGTAATTGTTGGAGAGGATTGCGCTTTACCCCCGCCACGTGGTATCGCTG 483
Query 645 GACGCAGAGGGTTAGCAGGAACAGTTCTTGTCCATAAGGTTGCGGGGGCAGCAGCAGCTG 704
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 484 GACGCAGAGGGTTAGCAGGAACAGTTCTCGTCCATAAGGTTGCAGGTGCAGCAGCAGCTG 543
Query 705 CTGGTCTTTCTCTAGAAAAAGTTGCTGCTGAGGCAAAATGTGCGTCAGAGATGGTTGGTA 764
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 CTGGTCTTTCTCTAGAAAAAGTTGCGGCTGAGGCAAAATGTGCGTCAGAGATGGTTGGTA 603
Query 765 CCATGGGTGTTGCATTATCCGTCTGTACACTTCCTGGACAGGTTACATCAGATCGTCTTG 824
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 604 CCATGGGTGTTGCATTATCCGTCTGTACACTTCCTGGACAGGTTACATCAGATCGTCTAG 663
Query 825 GCGCACAGAAGATGGAACTCGGGCTTGGAATTCATGGAGAACCTGGTGCTGCTGTGGTTG 884
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GCGCAGAGAAGATGGAACTCGGGCTTGGAATTCATGGAGAACCTGGTGCTGCTGTGGTTG 723
Query 885 ACGTTGAACCTGTGGATGTGGTGGTGTCCCATGTTCTTCAGCAAATACTTAGTCCTGAGA 944
||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 724 ACGTTCAACCTGTGGATTTGGTGGTTTCCCATGTTCTTCAGCAGATACTTAGTCCTGAGA 783
Query 945 CCAATTATGTTCCAATTACTCGTGGTAACAGAGTGGTTCTCATGGTCAATGGTTTGGGAG 1004
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 784 CCAATTATGTTCCAATTACACGTGGTAACAGAGTGGTTCTCATGGTTAATGGTTTGGGAG 843
Query 1005 GCACACCTTTAATGGAACTTATGATTGCTGCTGGAAAAGCAGTCCCTAAACTGCAGTTGG 1064
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 GCACCCCTTTAATGGAACTTATGATTGCTGCTGGAAAAGCAGTCCCTAAACTGCAGTTGG 903
Query 1065 AATTTGGACTTGCCGTTGATAGGGTGTATACAGGCTTTTTTATGACTTCTCTTGATATGG 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 904 AATTTGGACTTGCCGTTGATAGGGTGTATACAGGCTTTTTTATGACTTCTCTTGATATGG 963
Query 1125 CAGGATTCTCGATTTCAATCATGAAGGCTGACCATTCGATTTTAGACCGATTGGATGCTC 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 964 CAGGATTCTCGATTTCAATCATGAAGGCTGACCAGTCGATTTTAGACCGATTGGATGCTC 1023
Query 1185 CAACCAAGGCTCCAAATTGGCCAGTTGGCACTGATGGCAACCGGCCACCAGCGAAGATTC 1244
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024 CAACCAAGGCTCCAAATTGGCCTGTTGGCACTGATGGCAACCGGCCACCAGCGAAGATTC 1083
Query 1245 CTGTTCCTGTTCCTCCTTCTCGATCAATAAAAAGCATGGAGTCTCAAAGCCGACCTCTAG 1304
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1084 CTGTTCCTGTTCCTCCTTCTCGATCAATAAAAAGCACCGAGTCTCAAAGTCGACCTCTAG 1143
Query 1305 AGCTGAGTAAAGAAGGTCA-AGTTCTTGAGGCAGCTATTCAAGCAGCAGCAACTGTGATC 1363
||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144 AGCTGAGTAAAGAGGGTCAGA-TTCTTGAGGCAGCTATTCAAGCAGCAGCAACTGTGATC 1202
Query 1364 ATCAGCCTTAAGGATAGTTTGAATGAATGGGATGGAAAAGTAGGCGATGGTGATTGTGGG 1423
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1203 ATCAGCCTTAAGGATAGTTTGAACGAATGGGATGGAAAAGTGGGCGACGGTGATTGTGGG 1262
Query 1424 TCAACAATGTACAGAGGTGCAACAGCTATTCTGGAGGACATGAAAAACTATTATCCACTC 1483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 TCAACAATGTACAGAGGTGCAACAGCTATTCTGGAGGACTTGAAAAACTATTATCCACTC 1322
Query 1484 AATGATGCTGCGGAAACAGTGAATGAGATTGGT-CTATCAATCAAAAGAGCCATGGGGGG 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 AATGATGCTGCGGAAACAGTGAATGAGATTGGTTC-ATCAATCAAAAGAGCCATGGGGGG 1381
Query 1543 CACAAGCGGAATAATTTACCATCTCCTCTGCAAGGCAGCATACGCGGAGCTAAAAGCTAA 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 1382 CACAAGCGGAATAATTTACCATCTCCTCTGCAAGGCAGCATACGCGGAGTTAAAAGCAAA 1441
Query 1603 CGCTCAGTCAGAAGTCACTCCCAAAAATTGGTCTGAAGCACTCAAGTCATCAATCGCTTC 1662
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1442 AGCTCAGTCAGAAGTCACTCCCAAAAACTGGTCTGAAGCACTCAAGTCAGCAATCGCTTC 1501
Query 1663 AGTCAGCAAATATGGTGGAGCAACTGCGGGCTACAGAACGATGCTAGATGCGCTCATCCC 1722
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1502 AGTCAGCAAATATGGTGGAGCAAGTGCAGGCTACAGAACGATGCTAGATGCTCTCATCCC 1561
Query 1723 AGCTTCACAAGTTCTTGAGGAGAAACTGAGCGCTGGAGAGGATCCAATATCTGCTTTCAT 1782
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1562 AGCTTCACAAGTTCTTGAGGAGAAGTTGAGCGGTGGAGAGGATCCGATATCTGCTTTCAT 1621
Query 1783 TCTATCAGGCGAAGCGGCAACTGCCGGAGCGGAATCAACCATACAGATGCAAGCACAGGC 1842
||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1622 TCTGTCAGCCGAAGCAGCAACTGCAGGAGCGGAATCAACAATACAGATGCAAGCACAGGC 1681
Query 1843 TGGGAGATCAAGCTATGTATCTGCAGAGAATCTTGCAACGGTTCCAGATCCAGGTGCAAT 1902
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682 TGGGAGATCAAGCTATGTGTCTGCAGAGATTCTTGCAACGGTTCCAGATCCAGGTGCAAT 1741
Query 1903 GGCAGCAGCGGGATGGTACAATGCGGCAGCAAGAGCCGTAAAGGAGCAGTATGAGGGCTC 1962
||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | |||||||
Sbjct 1742 GGCAGCAGCAGGATGGTACAGCGCCGCAGCAAGAGCCGTGAAGGAGCAGTGTCAGGGCTC 1801
Query 1963 GTCATGATCCCTTCTCCGGAGTTTCTT 1989
||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 1802 ATCATGATCCCTTCCCCGGAGATTCTT 1828
> Ahg336963 jgi|Araly1|336963|fgenesh1_pg.C_scaffold_1003528
Length=1782
Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0
Identities = 1517/1771 (86%), Gaps = 25/1771 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 192 CAGCCAAGAAATTCATCAACAACCCCAACGATGTTGTAACTGAGTTCATAGAGGGTCTGG 251
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 11 CAGCTAAAAAATTCATCAACAACCCCAACGATGTTGTAACCGAGTTCATTGAGGGTCTCG 70
Query 252 TAGAAACTTATCCTGGACTCCAGTATTTGGATGGTTTTCCTGAGGTTAAGGTGGTGCTAC 311
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | || || || |||
Sbjct 71 TTGAAACTTATCCTGGACTTCAGTATTTGGATGGTCTTCCTGAGATCAAAGTTGTACTAA 130
Query 312 GAGCTGATGTCTCGGCTGCAAAATATGACAAGGTTGCCGTTATCTCAGGTGGAGGCAGTG 371
|||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 131 GAGCTGATATCTCAGCTGCAAATTATGACAAGGTTGCCGTTATATCAGGAGGAGGAAGTG 190
Query 372 GGCATGAGCCAGCACATGCTGGATACGTTGGAGAAGGAATGCTAACAGCTGCTATTTGTG 431
||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 191 GGCATGAACCAGCACAAGCTGGCTATGTTGGAGAAGGAATGCTCACAGCTGCTATTTGTG 250
Query 432 GAGATGTCTTTGCCTCCCCACCAGTTGATTCTATCCTTGCTGGAATTCGAGCTGTAACTG 491
||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 251 GAGATGTTTTTGCTTCGCCACCTGTTGATTCCATCCTAGCTGGGATTCGAGCTGTAACTG 310
Query 492 GTACTGAGGGATGTCTATTGATTGTCAAGAATTATACGGGTGATCGCTTGAACTTTGGTT 551
|| | | ||||| || ||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||
Sbjct 311 GTCCAAAAGGATGCCTCTTGGTTGTCACGAATTACACTGGTGACCGCTTGAACTTTGGCC 370
Query 552 TGGCTGCTGAACAAGC-AAAATCTGAAGGTTAC-AAAGTTGAGACTGTAATTGTTGGAGA 609
|||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| | ||| | |||||||| |||||||||||
Sbjct 371 TGGCAGCTGAGCAAGCAAAAAT-TGAGGGTTTCGAAA-TAGAGACTGTGATTGTTGGAGA 428
Query 610 GGATTGCGCTTTACCCCCGCCACGTGGCATCGCTGGACGCAGAGGGTTAGCAGGAACAGT 669
||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |
Sbjct 429 CGATTGTGCTCTACCCCCGCCTCTTGGCATAGCTGGACGCAGAGGTTTAGCGGGAACAAT 488
Query 670 TCTTGTCCATAAGGTTGCGGGGGCAGCAGCAGCTGCTGGTCTTTCTCTAGAAAAAGTTGC 729
|||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 489 TCTTGTCCATAAGGTTGCTGGAGCAGCATCTGCTGCTGGTCTTTCTCTAGCAGAAGTTGC 548
Query 730 TGCTGAGGCAAAATGTGCGTCAGAGATGGTTGGTACCATGGGTGTTGCATTATCCGTCTG 789
|| || | |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||
Sbjct 549 AGCGGAAGTAAAACATGCATCTGAAATGGTTGGGACCATGGGTGTTGCACTATCTGTTTG 608
Query 790 TACACTTCCTGGACAGGTTACATCAGATCGTCTT-GG-CGCACAGAAGATGGAACTCGGG 847
| | ||||| ||||||||||||||||||||| || || | || |||| |||||||| |||
Sbjct 609 TGCGCTTCCAGGACAGGTTACATCAGATCGT-TTGGGTC-CAGAGAAAATGGAACTTGGG 666
Query 848 CTTGGAATTCATGGAGAACCTGGTGCTGCTGTGGTTGACGTTGAACCTGTGGATGTGGTG 907
|||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || ||
Sbjct 667 CTTGGAGTTCATGGGGAGCCTGGTGCTGCTGTGGTCGACATTCAACCTGTGGAAGTTGTA 726
Query 908 GTGTCCCATGTTCTTCAGCAAATACTTAGTCCTGAGACCAATTATGTTCCAATTACTCGT 967
||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 727 GTGTCCCATGTTCTTCAACAGATACTGAGTCCAGAGACCAATTATGTTCCAATTACACGT 786
Query 968 GGTAACAGAGTGGTTCTCATGGTCAATGGTTTGGGAGGCACACCTTTAATGGAACTTATG 1027
|||| ||| ||| |||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||||||
Sbjct 787 GGTAGCAGCGTGATTCTGATGGTTAATGGCTTAGGTGGTACACCTCTAATGGAACTTATG 846
Query 1028 ATTGCTGCTGGAAAAGCAGTCCCTAAACTGCAGTTGGAATTTGGACTTGCCGTTGATAGG 1087
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 847 ATTGCTGCTGGAAAAGCAGTCCCAAAACTACAGTTGGAATATGGGCTTGCCGTTGATAGG 906
Query 1088 GTGTATACAGGCTTTTTTATGACTTCTCTTGATATGGCAGGATTCTCGATTTCAATCATG 1147
|||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 907 GTGTATACTGGATCATTTATGACGTCTCTTGATATGGCAGGGTTCTCGATATCGATCATG 966
Query 1148 AAGGCTGACCATTCGATTTTAGACCGATTGGATGCTCCAACCAAGGCTCCAAATTGGCCA 1207
||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||
Sbjct 967 AAGGCTGACCAGTCAATTTTAGAGCGTTTGGATGCTCCGACCAAGGCTCCTAGTTGGCCA 1026
Query 1208 GTTGGCACTGATGGCAA-CCGGCCACCAGCGAAGATTCCTGTTCCTGTTCCTCCTTCTCG 1266
|||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||| || ||||| | || | ||| ||
Sbjct 1027 GTTGGCACAGATGG-AAGCCGCCCACCAGCAAAGATCCCCGTTCCACTGCC-C-TTC-CG 1082
Query 1267 ATCAATAAAAAGCATGGAGTCTCAAAGCCGACCTCTAGAGCTGAGTAAAGAAGGTCAAGT 1326
||||| ||||| || |||| || | ||||||||| |||||| ||| | |||| |||
Sbjct 1083 ATCAACAAAAAACAAAGAGTTTCTATGCCGACCTCAAGAGCTTAGTCATCAAGGG-AAGA 1141
Query 1327 TC-TTGAGGCAGCTATTCAAGCAGCAGCAACTGT-GATCATCAGCCTTAAGGATAGTTTG 1384
|| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |||| | || ||||||||||||
Sbjct 1142 TCCTTGAGGCTGCTATTGAAGCAGCAGTAACTGTAG-TCATAAATCTAAAGGATAGTTTG 1200
Query 1385 AATGAATGGGATGGAAAAGTAGGCGATGGTGATTGTGGGTCAACAATGTACAGAGGTGCA 1444
||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||
Sbjct 1201 AATGAATGGGATGGAAAAGTAGGTGATGGGGACTGTGGATCAACAATGTGTAGAGGCGCA 1260
Query 1445 ACAGCTATTCTGGAGGACATGAAAAACTATTATCCACTCAATGATGCTGCGGAAACAGTG 1504
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||
Sbjct 1261 ACAGCTATTCTAGAGGACATGAAGAAGTATTATCCACTCAACGATGCCGCTGAAACAGTG 1320
Query 1505 AATGAGATTGGT-CTATCAATCAAAAGAGCCATGGGGGGCACAAGCGGAATAATTTACCA 1563
| |||||||||| | ||| || | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |
Sbjct 1321 AGTGAGATTGGTTC-ATCTATTAGAAGAGTCATGGGGGGGACAAGTGGAATAATTTACAA 1379
Query 1564 TCTCCTCTGCAAGGCAGCATACGCGGAGCTAAAAGCTAACGCTCAGTCAGAAGTCACTCC 1623
||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 1380 TCTCCTCTGTAAGGCAGCATATGCGGAGTTAAAAGCTAACGTTCAGTCAGAAACCACTCC 1439
Query 1624 CAAAA-ATTGGTCTGAAGCACTCAAGTCATCAATCGCTTCAGTCAGCAAATATGGTGGAG 1682
|||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||
Sbjct 1440 -AAAACACTGGTCTGAAGCACTCAAGTCATCAATCTCTGCTGTCAGTAAATATGGTGGAG 1498
Query 1683 CAACTGCGGGCTACAGAACGATGCTAGATGCGCTCATCCCAGCTTCACAAGTTCTTGAGG 1742
||||| | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 1499 CAACTTCCGGTTATAGAACGATGTTAGATGCGCTCATCCCAGCTTCAAAAGTCCTTGAGG 1558
Query 1743 AGAAACTGAGCGCTGGAGAGGATCCAATAT-CTGCTTTCATTCTATCAGGC-GAAGCGGC 1800
|||| |||| ||||| ||||| || || | ||||||| |||| || | | ||||| ||
Sbjct 1559 AGAAGTTGAGTGCTGGGGAGGACCCTAT-TGCTGCTTTTGTTCTGTCTG-CTGAAGCTGC 1616
Query 1801 AACTGCCGGAGCGGAATCAACCATACAGATGCAAGCACAGGCTGGGAGATCAAGCTATGT 1860
||| || ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1617 AACCGCAGGAGCTGAATCTACCATTCATATGAAAGCACAGGCCGGGAGATCAAGCTATGT 1676
Query 1861 ATCTGCAGAGAATCTTGCAACGGTTCCAGATCCAGGTGCAATGGCAGCAGCGGGATGGTA 1920
||| || |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1677 ATCAGCTGAGATTCTTGCATCAATTCCTGATCCAGGTGCAATGGCTGCAGCGGCATGGTA 1736
Query 1921 CAATGCGGCAGCAAGAGCCGTAAAGGAGCAG 1951
|| || || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1737 CAGCGCCGCTGCAAGAGCCGTGAAGGAGCAG 1767
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 85512600025
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5