BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G18110.1
Length=4421
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg318569 jgi|Araly1|318569|fgenesh1_pm.C_scaffold_3001585 6115 0.0
> Ahg318569 jgi|Araly1|318569|fgenesh1_pm.C_scaffold_3001585
Length=4290
Score = 6115 bits (3311), Expect = 0.0
Identities = 3636/3793 (96%), Gaps = 22/3793 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGGTTTCTGCAGGGGCTTTAGCTTTTCCTGCTTTATCCGTTCGCGCCACTCTTAAT 60
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGTTTCTGCAGGGGCTCTAGCTTTTCCTGCTTTATCCGTTCGCGCCACTCTTAAT 60
Query 61 CCTGAGATTAAAGATGAACAAGCGAACATCAGCAGCACTACTTCTTCTTCCCAGAAATTC 120
||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| | ||| |||||||||||
Sbjct 61 CCTGAGAATAAAGATGAACAAGGGAACGT---CAGCACTA--GC-TCTACCCAGAAATTC 114
Query 121 ACTTACAGTCGAGCTTCTCCCGCCGTCCGATGGCCACATTTGAATCTCCGTGAGA-TT-T 178
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 115 ACTTATAGTCGAGCTTCTCCCGCCGTCCGATGGCCACATTTGAATCTCCGTGAGACTTAT 174
Query 179 -A-T---GA--TTCCACACCTTCACAAACTCTTTCTTCTCCGGTTTCTCCCATCGCCGGT 231
| | || ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 175 GATTCCAGAGCTTCAACACCGTCACAACCTCTTTCTTCTCCGGTTTCTCCCA---CCGAT 231
Query 232 ACACCGGATTCAGGTG-ATGTCGTCGATTCAATTGCCTCCCGCGAGGAGCAAAAGACGAA 290
||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||
Sbjct 232 ACACCGGATTCAGCTGAAT-TCGTCGATTCAATTGGCTCCAGCGAGCATCAAAAGACGAA 290
Query 291 AGATGAAACCGCCGTGGCGACTCGGAGAAGGAGAGTGAAGAAGATGAATAAAGTGGCGTT 350
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 AGATGAAACCGCCGTGGCGAGTCGGAGAAGGAGAGTGAAGAAGATGAATAAAGTGGCGTT 350
Query 351 GATTAAGGCTAAAGACTGGAGAGAGAGAGTCAAATTTCTGACGGATAAGATTCTAAGCTT 410
||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 GATTAAGGCCAAGGATTGGAGAGAGCGAGTCAAATTTCTGACGGATAAGATTCTAAGCTT 410
Query 411 GAAATCTAATCAGTTCGTTGCTGATATTCTCGATGCTCGTCTTGTTCAGATGACTCCTAC 470
|||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 411 GAAACCTAATCAGTTCGTTGCGGATATCCTCGATGCTCGTCCTGTTCAGATGACTCCTAC 470
Query 471 TGATTACTGCTTCGTCGTGAAATCAGTTGGTCAAGAGAGTTGGCAACGAGCTCTTGAGGT 530
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 471 TGATTACTGCTTCGTCGTGAAATCGGTTGGTCAGGAGAATTGGCAACGAGCTCTTGAGGT 530
Query 531 TTTTGAGTGGCTCAATCTCCGTCATTGGCACTCTCCTAACGCTCGGATGGTGGCTGCTAT 590
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 531 TTTTGAGTGGCTCAATCTCCGTCATTGGCATTCACCTAATGCTCGGATGGTGGCTGCTAT 590
Query 591 ACTCGGTGTTTTGGGACGGTGGAATCAGGAATCCCTTGCGGTGGAGATTTTCACTAGGGC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 ACTCGGTGTTTTGGGACGGTGGAATCAGGAATCGCTTGCGGTGGAGATTTTCACTAGGGC 650
Query 651 TGAGCCAACCGTCGGAGATAGGGTTCAGGTGTACAACGCAATGATGGGGGTTTATTCACG 710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 TGAGCCAACCGTCGGAGATAGGGTTCAGGTGTACAACGCAATGATGGGGGTTTATTCACG 710
Query 711 TAGTGGTAAGTTTTCGAAAGCACAAGAGCTGGTCGATGCAATGCGTCAGAGAGGGTGTGT 770
|||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711 TAGTGGCAAGTTTTCAAAAGCACAAGAGCTGCTCGATGCAATGCGTCAGAGAGGGTGTGT 770
Query 771 TCCAGATCTTATTAGTTTCAATACTCTTATCAACGCTAGGCTTAAATCTGGTGGGTTGAC 830
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 771 TCCAGACCTTATTAGTTTCAATACTCTTATCAATGCTAGGCTTAAGTCTGGTGGGTTGAC 830
Query 831 TCCGAATTTGGCTGTTGAGTTATTAGATATGGTGAGGAATTCGGGTCTTAGGCCTGATGC 890
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 TCCGAATTTGGTTGTTGAATTATTAGATATGGTGAGGAATTCGGGTCTTAGGCCTGATGC 890
Query 891 TATCACTTACAACACTCTTCTTAGTGCCTGTTCGCGGGATTCGAATTTGGATGGTGCAGT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 891 TATCACTTACAACACTCTTCTTAGTGCCTGTTCGCGGGATTCGAACTTGGAGGGTGCAGT 950
Query 951 GAAGGTTTTTGAGGATATGGAAGCTCATCGGTGTCAGCCTGATTTGTGGACTTATAATGC 1010
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 951 GAAGGTTTTTGAGGATATGGAAGCTCATCGGTGTCAGCCTGACTTGTGGACTTATAATGC 1010
Query 1011 TATGATTTCTGTTTATGGAAGATGTGGGCTTGCTGCTGAAGCTGAGAGGCTCTTCATGGA 1070
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1011 TATGATTTCTGTTTATGGAAGATGTGGGCTTGCTGCTGAAGCTGAGAGGCTCTTCACAGA 1070
Query 1071 GCTGGAGCTTAAAGGTTTTTTCCCTGATGCAGTGACATACAACTCTTTGCTGTATGCGTT 1130
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1071 GTTGGAGCATAAAGGTTTTTTCCCTGATGCAGTGACATACAACTCTTTGCTCTATGCTTT 1130
Query 1131 TGCCAGAGAAAGAAATACGGAGAAGGTGAAGGAGGTGTACCAACAGATGCAGAAAATGGG 1190
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1131 TGCCAGAGAGAGAAATACGGAGAAGGTGAAGGAGGTGTACCAGCAGATGCAGAAAATGGG 1190
Query 1191 GTTTGGGAAAGATGAGATGACATACAACACGATCATTCACATGTATGGCAAGCAGGGACA 1250
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1191 GTTTGGGAAAGACGAGATGACTTACAACACGATCATTCACATGTATGGCAAGCAGGGGCA 1250
Query 1251 ACTTGATCTTGCGCTACAGCTTTATAAGGACATGAAAGGTTTGTCGGGTAGGAACCCTGA 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 ACTTGATCTTGCGCTACAGCTTTATAAGGACATGAAAGGTTTGTCGGGTAGGAACCCTGA 1310
Query 1311 TGCTATTACTTACACTGTTTTGATCGATTCTCTTGGAAAAGCAAACCGAACAGTGGAAGC 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 1311 TGCTATTACTTACACTGTTTTGATCGATTCTCTTGGAAAAGCAAATCGAAGTGTGGAAGC 1370
Query 1371 CGCAGCTTTAATGTCTGAGATGCTTGATGTTGGGATCAAACCAACTCTGCAGACATACAG 1430
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1371 CGCAGCTCTAATGTCTGAGATGCTTGATGTTGGGATCAAACCAACTCTGCAGACCTACAG 1430
Query 1431 TGCTCTTATCTGTGGTTATGCCAAGGCTGGAAAGCGAGAGGAGGCTGAGGATACTTTCAG 1490
|||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 TGCTCTCATCTGCGGTTATGCCAAGGCTGGGAAGCGAGAGGAGGCTGAGGATACTTTCAG 1490
Query 1491 TTGCATGTTGCGCTCAGGCACTAAACCTGATAATTTAGCGTATTCTGTAATGTTGGATGT 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1491 TTGCATGTTGCGCTCAGGCACTAAACCTGATAATTTAGCCTATTCTGTAATGTTGGATGT 1550
Query 1551 ATTACTAAGAGGCAACGAGACAAGAAAGGCCTGGGGTTTATACCGTGATATGATTTCTGA 1610
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1551 ATTACTAAGAGGCAACGAGACAAGAAAGGCGTGGGTTTTATATCGTGATATGATTTCTGA 1610
Query 1611 TGGTCATACACCGTCTTACACTCTGTATGAGTTGATGATACTTGGACTTATGAAGGAAAA 1670
||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 TGGCCATACACCGTCTCACAGTCTGTATGAGTTGATGATACTTGGACTTATGAAGGAAAA 1670
Query 1671 CAGGTCAGATGACATTCAGAAAACCATCAGAGACATGGAAGAATTGTGTGGCATGAACCC 1730
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1671 CAGGTCAGATGACGTTCAGAAAACCATCAGAGACATGGAAGAATTGTGTGACATGAACCC 1730
Query 1731 ACTAGAGATTTCATCAGTGCTTGTTAAGGGCGAATGCTTTGATCTCGCTGCTAGACAGTT 1790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1731 ACTAGAGATTTCATCAGTGCTTGTTAAGGGCGAATGCTTTGATCTTGCTGCTAGACAGTT 1790
Query 1791 GAAAGTGGCTATCACCAATGGCTATGAATTGGAAAACGACACTCTATTGTCTATCCTGGG 1850
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 GAAAGTGGCTATCACCAATGGTTACGAATTGGAAAACGACACTCTATTGTCTATCCTGGG 1850
Query 1851 TTCCTATAGTTCATCAGGCAGGCATTCAGAAGCGTTTGAGTTACTTGAATTTTTGAAAGA 1910
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TTCCTATAGTTCATCAGGCAGACATTCAGAAGCGTTTGAGTTACTTGAATTTTTGAAAGA 1910
Query 1911 GCATGCCAGTGGATCTAAAAGACTTATAACTGAAGCTCTAATTGTTCTACATTGCAAGGT 1970
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1911 ACACGCCAGTGGATCTAAAAGACTTATAAATGAAGCACTAATTGTTCTACATTGCAAGGT 1970
Query 1971 GAACAACT-TAAGCGCTGCTCTAGATGAATATTTCGCTGACCCATGTGTTCATGGCTGGT 2029
||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 TAACAA-TATAGGCGCTGCTCTAGATGAATATCTCGCTGACCCATGTGTTCATGGCTGGT 2029
Query 2030 GTTTTGGCAGTTCCACCATGTATGAGACTCTATTACACTGCTGTGTAGCAAATGAACATT 2089
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2030 GTTTTGGCGGTTCCACCATGTATGAGACTCTATTACACTGCTGTGTAGCAAATGAACATT 2089
Query 2090 ATGCTGAAGCTTCTCAGGTTTTCTCTGACCTGAGACTATCTGGCTGCGAAGCTTCAGAAA 2149
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2090 ATGCTGAAGCTTCTCAAGTTTTCTCTGAACTGAGACTATCTGGCTGCGAACCTTCAGAAA 2149
Query 2150 GTGTTTGTAAAAGCATGGTTGTTGTGTATTGCAAGCTTGGCTTTCCAGAGACAGCTCATC 2209
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2150 GTGTTTGTAAAAGCATGGTTGTTGTGTATTGCAAGCTTGGCTTTCCAGAGACAGCTTATC 2209
Query 2210 AAGTGGTTAATCAGGCTGAGACAAAAGGCTTCCACTTTGCTTGTTCGCCTATGTATACTG 2269
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2210 AAGTGGTTAATCAAGCTGAGACAAAAGGCTTCCACTTTGCTTGTTCACCTATGTATACTG 2269
Query 2270 ATATCATTGAGGCTTATGGAAAACAAAAACTATGGCAGAAAGCGGAGAGTGTGGTTGGCA 2329
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 ATATCATTGAGGCTTATGGAAAACTAAAGCTATGGCAGAAAGCGGAGAGTGTGGTTGGCA 2329
Query 2330 ACCTAAGACAAAGTGGACGAACACCTGATCTGAAGACATGGAACAGCTTGATGTCGGCTT 2389
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2330 ACCTAAGACAAGGTGGACGAACACCTGATCTGAAGACATGGAACAGCTTGATGTCAGCTT 2389
Query 2390 ATGCTCAGTGTGGCTGTTACGAGCGGGCAAGGGCTATTTTTAACACTATGATGAGGGATG 2449
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2390 ATGCTGAGTGTGGCTGTTACGAGCGGGCAAGGGCTATTTTTAACACAATGATGAGGGATG 2449
Query 2450 GTCCGTCTCCTACTGTTGAATCCATCAATATTTTGTTGCATGCTTTGTGTGTTGATGGGA 2509
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2450 GTCCGTCTCCTACTGTTGAATCCATCAATAAGTTACTGCATGCTTTGTGTGTTGATGGGA 2509
Query 2510 GACTCGAGGAGCTCTACGTTGTTGTTGAAGAATTGCAAGATATGGGCTTTAAGATTAGCA 2569
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510 GACTTGAAGAGCTCTACGTTGTTGTTGAAGAATTGCAAGATATGGGCTTTAAGATTAGCA 2569
Query 2570 AAAGCTCCATTCTCTTGATGCTTGACGCATTTGCCCGAGCTGGAAATATCTTTGAGGTAA 2629
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 AAAGCTCCATTCTTTTGATGCTTGACGCATTTGCCCGGGCTGGAAATATCTTTGAGGTAA 2629
Query 2630 AGAAGATATACAGTAGCATGAAAGCTGCTGGTTACTTACCCACAATCCGCCTTTATAGGA 2689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 2630 AGAAGATATACAGTAGCATGAAAGCTGCTGGTTACTTACCCACGATTCGCCTTTATAGGA 2689
Query 2690 TGATGATTGAGCTTCTCTGCAAAGGGAAACGAGTTAGAGATGCTGAAATTATGGTCTCTG 2749
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 TGATGATTGAGCTTCTCTGCAAAGGTAAACGAGTTAGAGATGCTGAAATTATGGTCTCTG 2749
Query 2750 AAATGGAAGAGGCCAATTTCAAGGTTGAGCTTGCTATATGGAATTCCATGCTGAAGATGT 2809
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2750 AAATGGAAGAGGCCAATTTCAAGGTTGAGCTTGCTATATGGAATTCAATGCTGAAGATGT 2809
Query 2810 ATACGGCTATCGAGGATTACAAGAAGACAGTTCAAGTATACCAGAGGATAAAAGAAACTG 2869
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2810 ATACGGTTATCGAGGATTACAAGAAGACAGTTCAAGTATACCAGAGGATAAAAGAAAGTG 2869
Query 2870 GACTGGAACCAGACGAGACCACTTACAATACTCTGATTATAATGTATTGTAGAGACAGAC 2929
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2870 GACTGGAACCAGATGAGACCACTTACAATACGCTGATTATAATGTATTGTAGAGACAGAC 2929
Query 2930 GACCAGAAGAAGGGTACTTGCTTATGCAGCAAATGAGAAATCTTGGTTTGGACCCAAAAC 2989
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2930 GACCAGAAGAAGGGTACTCACTTATGCAGCAAATGAGAAATCTTGGTTTGGACCCAAAAT 2989
Query 2990 TGGACACATACAAGAGCTTGATCTCTGCTTTTGGTAAGCAAAAATGCCTTGAACAAGCTG 3049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2990 TGGACACATACAAGAGCTTGATCTCTGCTTTTGGTAAGCAAAAATGCCTTGAACAAGCTG 3049
Query 3050 AACAACTGTTTGAAGAGCTTCTCTCAAAAGGTTTGAAACTAGACCGTTCATTTTACCACA 3109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3050 AACAACTGTTTGAAGAGCTTCTCTCAAAAGGTTTGAAACTAGACCGTTCATTTTACCACA 3109
Query 3110 CAATGATGAAAATATCCCGAGATTCTGGAAGCGACTCCAAGGCAGAGAAGTTATTGCAAA 3169
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 CGATGATGAAAATATCCCGAGATTCTGGAAGCGACTCTAAGGCAGAGAAGTTATTGCAAA 3169
Query 3170 TGATGAAGAATGCGGGAATAGAACCAACACTTGCTACAATGCATCTGCTTATGGTTTCAT 3229
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3170 TGATGAAGAATGCGGGAATAGAACCAACACTTGCTACAATGCATTTGCTTATGGTTTCAT 3229
Query 3230 ATAGTTCTTCAGGAAATCCCCAAGAAGCTGAAAAAGTTCTTAGTAACCTGAAAGACACAG 3289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3230 ATAGTTCTTCAGGAAATCCCCAAGAAGCTGAAAAAGTTCTTAGTAACCTGAAAGACACAG 3289
Query 3290 AAGTGGAACTAACAACTCTGCCTTATAGTTCAGTTATTGATGCTTACCTTCGGAGCAAAG 3349
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3290 AAATGGAACTAACAACTCTGCCTTATAGTTCAGTTATTGATGCTTACCTTAGGAGCAAAG 3349
Query 3350 ATTATAACAGTGGAATAGAAAGGCTTTTGGAAATGAAGAAAGAGGGCCTAGAGCCAGACC 3409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3350 ATTATAACAGTGGAATAGAAAGGCTTTTGGAAATGAAGAAAGAGGGCCTAGAGCCAGACC 3409
Query 3410 ACAGGATATGGACTTGCTTTGTTAGGGCGGCGAGTTTCTCCAAGGAAAAAATTGAAGTCA 3469
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3410 ACAGGATATGGACTTGCTTTGTAAGGGCGGCGAGTTTCTCCAAGGAAAAAAGCGAAGTCA 3469
Query 3470 TGTTGCTGCTTAAAGCTCTTGAAGATATTGGTTTTGATCTTCCTATCAGGCTTTTAGCTG 3529
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3470 TGTTGCTGCTTAAAGCTCTTCAAGATATTGGTTTTGATATTCCTATCAGGCTTTTAGCTG 3529
Query 3530 GAAGACCTGAGTTGCTAGTTTCTGAGGTGGATGGATGGTTCGAGAAACTGAAATCCATAG 3589
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3530 GAAGACCTGAGTTGCTAGTTTCTGAAGTGGATGGATGTTTCGAGAAACTGAAATCCATAG 3589
Query 3590 AGGACAATGCTGCTCTCAATTTTGTTAATGCTCTTTTGAATCTTCTCTGGGCGTTTGAAC 3649
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3590 AGGACAATGCTGCTCTCAATTTTGCGAATGCTCTTTTGAATCTTCTCTGGGCGTTTGAAC 3649
Query 3650 TCAGAGCTACTGCATCATGGGTTTTCCAATTGGGAATCAAAAGGGGTATCTTCAGTCTCG 3709
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3650 TCAGAGCTACTGCATCATGGGTTTTCCAATTGGCAATCAAAAGGGGTATCTTCAGTCTTG 3709
Query 3710 ATGTTTTTAGGGTGGCGGACAAGGACTGGGGTGCGGATTTCAGAAGGCTGTCTGGAGGTG 3769
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 3710 ATGTTTTTAGGGTGGCGGACAAGGACTGGGGTGCGGATTTCAGAAGATTGTCGGGAGGTG 3769
Query 3770 CAGCACTTGTTGC 3782
|||| |||| |||
Sbjct 3770 CAGCGCTTGATGC 3782
Score = 865 bits (468), Expect = 0.0
Identities = 499/514 (97%), Gaps = 2/514 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3811 GATGCATCACTGGAAGGCTACCCAGAGTCTCCAAAGTCAGTTGTCTTAATCACAGGGACC 3870
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3778 GATGCATCACTCGAAGGCTACCCAGAGTCTCCGAAGTCAGTTGTCTTAATCACAGGGACC 3837
Query 3871 GCAGAGTACAACGGTATATCCCTTGATAAAACGCTAAAGGCGTGTCTTTGGGAAATGGGT 3930
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3838 GCAGAGTACAACGGTGTATCCCTTGATAAAACGCTAAAGGCGTGTCTTTGGGAAATGGGT 3897
Query 3931 TCTCCATTTCTTCCCTGCAAGACGAGAACGGGACTGCTAGTGGCCAAAGCTCACTCTCTC 3990
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3898 TCTCCATTTCTCCCCTGCAAGACGAGAACGGGACTGCTAGTGGCCAAAGCTCACTCTCTC 3957
Query 3991 AGAATGTGGTTGAAGGACTCGCCGTTCTGCTTCGACTTGGAGCTAAAAGACTCGGTGTCT 4050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3958 AGAATGTGGTTGAAGGACTCGCCGTTCTGCTTCGACTTGGAGCTAAAAGACTCAGTGTCT 4017
Query 4051 TTACCAGAATCAAACTCGATGGACCTGATTGACGGGTGTTTCATAAGACGTGGACTTGTT 4110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4018 TTACCAGAATCAAACTCGATGGACCTGATTGACGGGTGTTTCATAAGACGTGGACTTGTA 4077
Query 4111 CCTGCGTTTAACCACATCAAAGAGAGACTTGGTGGATTTGTGTCACCAAAGAAGTTTTCG 4170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4078 CCTGCGTTTAACCACATCAAAGAGAGACTTGGTGGATTTGTGTCACCAAAGAAGTTTTCG 4137
Query 4171 AGACTGGCGTTGCTACCAGACGAGATGAGAGAGCGAGTGATAAAGACAGATATTGAAGGA 4230
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4138 AGACTGGCGTTGCTACCAGACGAGATGAGAGAACGAGTGATAAAGACAGATATAGAAGGA 4197
Query 4231 CATAGACAGAAGTTAGAGAAGATGAAGAAGAAGAA-AATGGGCAATGAAACGAATGGTAT 4289
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |
Sbjct 4198 CATAGACAGAAGTTAGAGAAGATGAAGAAGAAGAACAAAAGA-AATGAAACGAATGGTGT 4256
Query 4290 TAACACTCGAAGGAAGTTCGTCAGAAGCAAGTGA 4323
||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4257 TAACACTCGAAGGAAGTTCGTCAGAAGTAAGTGA 4290
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 167224975762
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5